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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-11-22 |
Nitidine chloride inhibits colorectal cancer by targeting BUB1: mechanistic insights from molecular dynamics simulation, spatial transcriptomics, and single-cell RNA sequencing
2025-Nov-19, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-04423-8
PMID:41257608
|
研究论文 | 研究白屈菜红碱通过靶向BUB1抑制结直肠癌的作用机制 | 结合分子动力学模拟、空间转录组学和单细胞RNA测序多组学技术揭示NC-BUB1-RAD21轴在结直肠癌中的调控机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限 | 探究白屈菜红碱在结直肠癌中的抗肿瘤作用机制 | 结直肠癌细胞系HCT116和异种移植小鼠模型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子动力学模拟,RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,单细胞测序数据 | 1293个结直肠癌样本与2299个对照样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 642 | 2025-11-20 |
Single-cell transcriptomics uncovering a critical AKT-LONP1-STAR axis in ovarian hyperandrogenism of PCOS
2025-Nov-19, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01837-6
PMID:41257877
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 643 | 2025-11-22 |
Decoding intratumoral cyclooxygenase-2 signaling through multi-omics: insights from esophageal cancer and beyond
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01919-1
PMID:41249574
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研究论文 | 通过多组学方法研究环氧合酶-2在食管癌等肿瘤中的信号传导机制及其治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质对接分析和实验验证,系统揭示COX-2在肿瘤微环境中的调控作用 | NA | 探究COX-2在癌症进展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 食管癌及其他多种癌症类型 | 多组学分析 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质对接分析, 功能验证实验 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 644 | 2025-11-22 |
Single-cell transcriptomics identifies SOCS3+ exhausted T cells as a biomarker facilitating clear cell renal cell carcinoma progression
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01894-7
PMID:41249578
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析鉴定SOCS3+耗竭T细胞作为促进透明细胞肾细胞癌进展的生物标志物 | 首次发现SOCS3+耗竭T细胞在ccRCC中的关键作用,并构建了包含SOCS3和N4BP1的预后预测模型 | 基于现有数据集的重新分析,需要进一步实验验证 | 研究耗竭T细胞如何驱动透明细胞肾细胞癌进展 | 透明细胞肾细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析, Kaplan-Meier生存分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 645 | 2025-11-22 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomic profiling reveals NECTIN-TIGIT interaction underlies T cell exhaustion in papillary thyroid carcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01937-z
PMID:41249602
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞转录组数据,揭示NECTIN-TIGIT相互作用是甲状腺乳头状癌中T细胞耗竭的潜在驱动机制 | 首次在甲状腺乳头状癌中系统阐明NECTIN-TIGIT轴通过抑制CD226共刺激信号促进T细胞耗竭的免疫调控机制 | 需要未来湿实验室验证和临床研究来确认该轴在甲状腺癌管理中的转化相关性 | 阐明甲状腺乳头状癌中T细胞耗竭的免疫学机制 | 甲状腺乳头状癌肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 差异基因表达分析,细胞类型注释,配体-受体相互作用分析 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的公共数据集 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 646 | 2025-11-22 |
Comprehensive analysis reveals prognostic gene set that could impacts the response to chemotherapy and immunotherapy outcomes in malignant pleural mesothelioma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01949-9
PMID:41249691
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据开发了一个恶性胸膜间皮瘤的预后基因集模型,用于预测患者生存和治疗反应 | 首次整合转录组、DNA甲基化和SNP数据构建MPM预后模型,并验证其在化疗、放疗和免疫治疗反应预测中的价值 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发可靠的恶性胸膜间皮瘤预后评估工具,改善临床治疗效果 | 恶性胸膜间皮瘤患者 | 生物信息学 | 恶性胸膜间皮瘤 | 多组学整合分析,LASSO-Cox回归,单细胞RNA-seq | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据,DNA甲基化数据,SNP数据,单细胞RNA-seq数据 | TCGA和GEO数据库中的恶性胸膜间皮瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 647 | 2025-11-22 |
CDKN1A and cellular senescence are associated with immune resistance in advanced lung adenocarcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01926-2
PMID:41249682
|
研究论文 | 本研究探讨CDKN1A和细胞衰老在晚期肺腺癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 首次在晚期肺腺癌中系统揭示CDKN1A通过促进细胞衰老和免疫抑制微环境导致免疫治疗耐药的机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探究CDKN1A在晚期肺腺癌免疫治疗疗效中的影响和作用机制 | 晚期肺腺癌患者和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | 多变量Cox回归模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA和SU2C-MARK队列的晚期肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE148071数据集 |
| 648 | 2025-11-22 |
Integrated machine learning and single-cell analysis identify chromatin-remodeling gene signature for diagnosis and prognosis in nasopharyngeal carcinoma
2025-Nov-18, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01953-z
PMID:41249704
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析,识别染色质重塑基因特征用于鼻咽癌的诊断和预后 | 首次整合机器学习与单细胞RNA测序分析染色质重塑基因在鼻咽癌中的作用,并开发了六基因诊断预后特征 | 研究依赖于公共数据集,需要进一步实验验证和临床前瞻性研究 | 探索染色质重塑基因在鼻咽癌中的诊断和预后价值 | 鼻咽癌患者基因表达数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,差异表达分析,加权基因共表达网络分析,功能富集分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 多个数据集(GSE12452, GSE53819, GSE61218, GSE102349)的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 649 | 2025-11-22 |
Adenylosuccinate lyase (ADSL) is a pan-cancer prognostic and immune biomarker with distinct roles in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03749-9
PMID:41251948
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析探讨ADSL基因作为预后和免疫生物标志物的潜力,特别聚焦于肝细胞癌 | 首次全面揭示ADSL在多种癌症中的过表达特征及其与预后的关联,并在单细胞水平分析ADSL高表达对细胞通讯网络的影响 | 需要进一步研究验证这些发现并阐明ADSL影响癌症发展的具体机制 | 探索ADSL基因在恶性肿瘤中的生物学作用及其作为广谱预测标志物的可行性 | 多种癌症类型,特别关注肝细胞癌(HCC) | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组分析,甲基化评估,免疫浸润评估,细胞通讯分析,诺莫图建模 | 诺莫图模型 | 转录组数据,甲基化数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 650 | 2025-11-22 |
Utilizing a novel mitochondrial-related gene signature for predicting the prognosis and immunological impact in bladder cancer
2025-Nov-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03927-9
PMID:41252049
|
研究论文 | 本研究构建并验证了一个基于线粒体相关基因的膀胱癌预后特征模型 | 首次将线粒体相关基因特征与膀胱癌预后和免疫治疗疗效进行系统性关联分析 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证 | 探索线粒体相关基因在膀胱癌中的作用并构建预后预测模型 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO回归,Cox回归,非负矩阵分解 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA-BLCA队列和GEO数据集的多中心膀胱癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 651 | 2025-11-22 |
Transcription factor 4 regulates the interhemispheric midline remodeling through neuron-astroglia communications during corpus callosum formation
2025-Nov-18, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03696-7
PMID:41253748
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子TCF4通过神经元-星形胶质细胞通讯调控大脑半球间中线重塑及胼胝体形成的关键机制 | 首次发现TCF4介导的神经元-星形胶质细胞通讯对胼胝体形成的调控作用,并鉴定Sema7a为关键介质 | NA | 探究TCF4在胼胝体形成过程中的分子机制 | 小鼠大脑半球间中线组织 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,体外移植实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 652 | 2025-11-22 |
UHRF1 restricts HCoV-229E infection through epigenetic silencing of the viral receptor APN
2025-Nov-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64977-9
PMID:41253770
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研究论文 | 本研究通过全基因组CRISPR筛选发现UHRF1通过表观遗传沉默病毒受体APN抑制HCoV-229E感染 | 首次揭示UHRF1通过启动子超甲基化下调APN表达限制冠状病毒感染的年龄相关宿主防御机制 | 研究主要聚焦HCoV-229E,未验证其他冠状病毒的普适性 | 探索冠状病毒与宿主相互作用机制及年龄相关易感性因素 | HCoV-229E冠状病毒及其宿主细胞 | 病毒学 | 冠状病毒感染 | 全基因组CRISPR敲除筛选,CRISPR激活筛选,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 来自年轻和老年个体的原代肺泡巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 653 | 2025-11-22 |
Multidimensional tumor-blood profiling uncovers systemic lymphocyte-monocyte imbalance in pituitary neuroendocrine tumors
2025-Nov-18, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02489-0
PMID:41253784
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研究论文 | 通过多维肿瘤-血液分析揭示垂体神经内分泌肿瘤中系统性淋巴细胞-单核细胞失衡 | 首次系统揭示垂体神经内分泌肿瘤通过激素分泌活性导致外周免疫系统失衡的机制 | 样本来源主要为回顾性数据,需要更多前瞻性研究验证 | 探究垂体神经内分泌肿瘤对外周免疫网络的调控作用 | 垂体神经内分泌肿瘤患者、外周血单个核细胞、正常垂体组织 | 生物信息学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 随机森林分类器 | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | 883个肿瘤样本, 283个PBMC样本(108患者+175对照), 69个单细胞样本, 600个验证样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 654 | 2025-11-22 |
Single-cell integration analysis reveals molecular signatures of the tumor microenvironment in early-onset colorectal cancer
2025-Nov-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01129-8
PMID:41254101
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研究论文 | 通过单细胞整合分析揭示早发性结直肠癌肿瘤微环境的分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序系统比较早发性与标准发病结直肠癌的分子和免疫特征差异 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探究早发性结直肠癌的分子和免疫特征差异 | 168名22-91岁结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 168名结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 655 | 2025-11-22 |
Metabolomic and transcriptomic profiling of HNSCC identifies AMIGO2 as a therapeutic target modulating tumor microenvironment
2025-Nov-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01132-z
PMID:41254143
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研究论文 | 通过多组学分析揭示头颈鳞状细胞癌中AMIGO2作为调控肿瘤微环境的治疗靶点 | 首次整合空间代谢组学/转录组学、单细胞转录组学和批量多组学数据,发现AMIGO2通过调节嘌呤代谢影响肿瘤微环境 | NA | 探索头颈鳞状细胞癌代谢重编程与肿瘤微环境的相互作用机制 | 头颈鳞状细胞癌及癌前病变患者 | 多组学分析 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 单细胞转录组学, 批量多组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据 | 头颈鳞状细胞癌和癌前病变临床队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 656 | 2025-11-22 |
Progression-free survival for unresectable non-metastatic locally advanced pancreatic cancer after surgical microwave ablation plus durvalumab and tremelimumab: phase-2 non-randomized prospective clinical trial
2025-Nov-18, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-01186-x
PMID:41254229
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研究论文 | 评估微波消融联合免疫检查点抑制剂治疗不可切除局部晚期胰腺癌的疗效及免疫机制 | 首次将微波消融与双免疫检查点抑制剂联合用于胰腺癌治疗,并通过单细胞技术分析免疫微环境变化 | 样本量较小(12例患者),T细胞受体指标与无进展生存期无显著统计学关联 | 评估联合疗法对胰腺癌无进展生存期的影响及免疫机制 | 12例不可切除非转移性局部晚期胰腺导管腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序,T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据,临床数据 | 12例患者(其中6例进行单细胞分析,3例有配对样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 657 | 2025-11-22 |
Rethinking p16, p53, and HPV in HNCSCC through lessons from glioblastoma subclonal evolution toward patient-centric N-of-1 single-cell RNA sequencing paradigm
2025-Nov-16, World journal of clinical cases
IF:1.0Q3
DOI:10.12998/wjcc.v13.i32.104208
PMID:41256339
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综述 | 重新评估头颈部皮肤鳞状细胞癌中p16、p53和HPV的作用,借鉴胶质母细胞瘤亚克隆进化研究,提出以患者为中心的单细胞RNA测序新范式 | 提出将头颈部皮肤鳞状细胞癌与胶质母细胞瘤的亚克隆进化机制相类比,倡导从静态生物标志物转向动态N-of-1单细胞研究范式 | 基于文献综述而非原始研究,需要多方法和分子验证来证实理论框架 | 重新评估HNCSCC中p16、p53和HPV的生物标志物作用,建立更精准的个体化癌症诊疗框架 | 头颈部皮肤鳞状细胞癌和胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌, 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学整合 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组, 肿瘤微环境数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 658 | 2025-11-22 |
Antiviral Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2025-Nov-14, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf367
PMID:40628395
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研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断前后血浆蛋白质组和单细胞转录组,揭示了病毒反弹前的免疫反应特征 | 首次发现CD16++单核细胞在可检测病毒反弹前显著增加并表现抗病毒基因表达特征 | 研究样本量有限,且仅关注外周血单核细胞 | 识别治疗中断后病毒反弹的早期信号,为延长HIV-1缓解期提供策略 | HIV-1感染者的外周血单核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 治疗中断前后多个时间点的系列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 血浆蛋白质组学 | NA | NA |
| 659 | 2025-11-22 |
Endothelial circadian rhythm genes as prognostic modulators of tumor progression and immune interactions: insights from pan-cancer single-cell rna sequencing
2025-Nov-06, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003848
PMID:41202314
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研究论文 | 通过泛癌单细胞RNA测序分析内皮细胞昼夜节律基因在肿瘤进展和免疫相互作用中的预后调控作用 | 首次系统研究内皮细胞昼夜节律基因在肿瘤微环境中的失调及其临床意义,建立了基于昼夜节律相关基因的预后风险模型 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证来确认机制 | 探究内皮细胞昼夜节律基因在多种癌症中的失调及其临床意义 | 15个独立数据集的单细胞RNA测序数据,涵盖多种癌症类型的内皮细胞 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序,LASSO回归,Kaplan-Meier生存分析 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 15个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 660 | 2025-11-22 |
Single-cell profiling unveils the immuno-favorable tumor microenvironment remodeling after successful neoadjuvant therapy for advanced gallbladder cancer
2025-Nov-06, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003883
PMID:41202319
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示新辅助治疗对晚期胆囊癌肿瘤微环境的免疫有利重塑 | 首次在晚期胆囊癌中系统揭示新辅助 chemo-immunotherapy 治疗后肿瘤微环境的单细胞水平重塑特征,特别是发现滤泡辅助T细胞扩增和三级淋巴结构形成等关键免疫变化 | 样本量有限,仅分析了成功降期患者的肿瘤微环境,缺乏治疗无效患者的对照分析 | 评估新辅助 chemo-immunotherapy 在晚期胆囊癌中的治疗效果并研究相关肿瘤微环境改变 | 晚期胆囊癌患者 | 单细胞分析 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 成功降期的晚期胆囊癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录omics | NA | NA |