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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-11-21 |
The cervicovaginal microbiome associates with spatially restricted host transcriptional signatures throughout the human ectocervical epithelium and submucosa
2025-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013677
PMID:41218071
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示宫颈阴道微生物组与人类宫颈上皮及黏膜下组织转录特征的空间关联 | 首次发现微生物组定植虽局限于腔面,但其转录影响贯穿整个黏膜层,在基底膜两侧最为显著 | 样本量较小(n=21),仅针对肯尼亚女性性工作者群体 | 探究宫颈阴道微生物组对宫颈转录景观的影响及其与HIV易感性的关联 | 肯尼亚女性性工作者的宫颈组织样本 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学 | 加权基因共表达分析 | 空间转录组数据 | 21例宫颈组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 622 | 2025-11-21 |
Comparative genomics, integrated with single-cell sequencing and genetic analyses, reveal roles of transcription factor AP2-M2 in asexual replication of Babesia parasite
2025-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013699
PMID:41231960
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研究论文 | 本研究通过比较基因组学、单细胞测序和遗传分析揭示了转录因子AP2-M2在巴贝斯虫无性繁殖阶段的关键调控作用 | 首次构建了新疆巴贝斯虫染色体级别参考基因组,结合单细胞RNA测序揭示了寄生虫无性发育阶段的转录异质性和BxAP2-M2的持续表达特征 | 研究主要聚焦于单一巴贝斯虫物种,调控机制的具体分子通路仍需进一步验证 | 探索巴贝斯虫无性繁殖阶段的分子调控机制 | 新疆巴贝斯虫及其无性发育阶段 | 基因组学 | 巴贝斯虫病 | 单细胞RNA测序, 比较基因组学, 遗传分析 | 伪时间分析 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 623 | 2025-11-21 |
Library size-stabilized metacells construction enhances co-expression network analysis in single-cell data
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013697
PMID:41231963
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研究论文 | 提出一种通过稳定文库大小构建元细胞的计算框架LSMetacell,用于改善单细胞数据中共表达网络分析的准确性 | 首次在元细胞构建过程中显式稳定文库大小,有效减少组成性噪声同时保持细胞异质性 | 仅通过数学建模和模拟验证,需要在更多实际数据集上进一步验证 | 解决单细胞RNA测序数据中的组成性偏差问题,提高共表达网络分析的可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LSMetacell框架 | 基因表达数据 | 死后阿尔茨海默病大脑单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2025-11-21 |
Single-Cell RNA Seq in Sydenham Chorea Shows B Cell HLA-DR/DQ Upregulation and Plasma Cell Proteasomal Activation
2025-Nov, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70179
PMID:40859454
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析Sydenham舞蹈症患者外周免疫细胞,发现B细胞HLA-DR/DQ上调和浆细胞蛋白酶体通路激活 | 首次在Sydenham舞蹈症中应用单细胞RNA测序技术揭示B细胞和浆细胞的特定分子通路异常 | 样本量较小(仅1例患者和2例对照),需要更大规模研究验证 | 探究Sydenham舞蹈症的免疫病理机制 | Sydenham舞蹈症患者和性别匹配对照的外周免疫细胞 | 单细胞组学 | 神经系统自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30,794个外周免疫细胞(来自1例患者和2例对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2025-11-20 |
[Single cell sequencing technology for analyzing the interaction between type 3 innate lymphoid cells and regulatory T cells in patients with fibrostenotic Crohn's disease]
2025-Nov-25, Zhonghua yi xue za zhi
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析纤维狭窄型克罗恩病患者中3型先天淋巴细胞与调节性T细胞的相互作用 | 首次在纤维狭窄型克罗恩病患者中利用单细胞测序技术系统分析ILC3与Treg细胞的相互作用及其对肠道免疫微环境的影响 | 样本量较小(共7例患者),且为回顾性研究设计 | 研究纤维狭窄型克罗恩病患者中ILC3与Treg细胞的相互作用机制 | 纤维狭窄型克罗恩病患者的肠道纤维化组织和非纤维化组织样本 | 单细胞生物学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7例纤维狭窄型克罗恩病患者(温州组1例,瑞金组6例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 626 | 2025-11-20 |
BM-MSC-derived migrasomes reverse stroke-induced thymic atrophy and immunosuppression via Pin1 delivery to thymic epithelial cells
2025-Nov-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03604-2
PMID:41241718
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研究论文 | 本研究揭示骨髓间充质干细胞通过分泌迁移体递送Pin1蛋白,逆转中风诱导的胸腺萎缩和免疫抑制 | 首次发现BM-MSC来源的迁移体能够穿越血胸屏障,通过递送细胞周期调节蛋白Pin1特异性促进胸腺上皮细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 解决中风后神经保护与免疫抑制之间的临床困境 | 骨髓间充质干细胞、迁移体、胸腺上皮细胞、T细胞 | 细胞生物学 | 中风 | 单细胞RNA测序、液相色谱-串联质谱、体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 中风模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 627 | 2025-11-20 |
Inferring pathway activity from single-cell and spatial transcriptomics data with PaaSc
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013666
PMID:41212919
|
研究论文 | 开发了一种名为PaaSc的计算方法,用于从单细胞和空间转录组数据推断通路活性 | 使用多重对应分析将细胞和基因同时投影到共同潜在空间,并通过线性回归选择通路相关维度来推断通路活性得分 | NA | 将高维单细胞和空间转录组数据转化为功能性通路见解 | 单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,scATAC-seq | 多重对应分析,线性回归 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,scATAC-seq | NA | NA |
| 628 | 2025-11-20 |
Enhancing Spatial Transcriptomics via Spatially Constrained Matrix Decomposition with EDGES
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508346
PMID:40842021
|
研究论文 | 本文开发了一种名为EDGES的空间约束矩阵分解框架,用于增强空间转录组数据的基因表达预测和去噪 | 通过图拉普拉斯正则化整合空间信息,同时协同整合细胞表示和基因特异性表示,确保预测基因表达与真实ST分布紧密对齐 | NA | 解决成像基空间转录组技术在基因检测能力和表达谱测量准确性方面的局限性 | 空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 非负矩阵分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 629 | 2025-11-20 |
stTrace: detecting spatial-temporal domains from spatial transcriptome to trace developmental path
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf606
PMID:41241818
|
研究论文 | 提出一种从空间转录组数据中检测时空域以追踪发育路径的算法stTrace | 整合细胞发育程度、基因表达和空间位置信息识别时空域,并揭示其层次发育关系 | NA | 开发从空间转录组数据追踪发育路径的算法 | 小鼠胚胎和人类乳腺癌数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | stTrace算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 630 | 2025-11-20 |
Characterization of tertiary lymphoid structure identifies competitive binding of CD40 and STING with TRAF2 driving IRF4-mediated B cell activation in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Nov, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00944-2
PMID:40855365
|
研究论文 | 本研究通过分析食管鳞状细胞癌中三级淋巴结构的特征,揭示了CD40和STING与TRAF2竞争性结合通过非经典NF-κB信号通路驱动IRF4介导的B细胞激活机制 | 首次发现CD40和STING与TRAF2的竞争性结合关系,阐明其通过调节IRF4表达促进B细胞激活的新机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌中的临床意义及其抗肿瘤作用的生物学机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本和体外培养的B细胞 | 癌症免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,体外实验 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 631 | 2025-11-19 |
Dihydroartemisinin inhibits histone lactylation through YAP1 to act as a 'hot' switch for 'cold' tumor in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157307
PMID:41016295
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研究论文 | 本研究揭示双氢青蒿素通过抑制YAP1降低组蛋白乳酸化,将肝细胞癌的肿瘤微环境从免疫冷状态转变为免疫热状态 | 首次发现双氢青蒿素通过YAP1抑制组蛋白乳酸化的新机制,并证实其与抗PD-1疗法的协同作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索双氢青蒿素改变肝细胞癌免疫抑制微环境的具体机制 | 肝细胞癌小鼠模型、免疫细胞、YAP1信号通路 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化,Western blot,免疫荧光,代谢流分析,免疫共沉淀,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞表型数据 | 多种基因工程小鼠模型(NCG小鼠、BALB/c裸鼠、CD8+T细胞缺失小鼠、肝脏特异性Yap1敲除小鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 632 | 2025-11-19 |
Astragaloside VI attenuates mechanical stress-induced cardiac remodeling through piezo1-VDAC1 dependent endoplasmic reticulum unfolded protein response
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157288
PMID:41027153
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研究论文 | 本研究探讨黄芪甲苷VI通过Piezo1-VDAC1依赖的内质网未折叠蛋白反应缓解机械应力诱导的心脏重塑的机制 | 首次揭示Piezo1-VDAC1相互作用通过调节内质网未折叠蛋白反应介导机械应力诱导心脏重塑的病理机制,并发现黄芪甲苷VI的治疗潜力 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床试验验证 | 探索Piezo1对心肌细胞缺氧应激后内质网未折叠蛋白反应的影响及其在心脏重塑治疗中的潜力 | 心肌细胞、Piezo1/VDAC1转基因小鼠和野生型小鼠 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,网络药理学,宏基因组学,激光共聚焦显微镜,免疫荧光 | 动物模型 | 基因组数据,蛋白质数据,图像数据 | 转基因小鼠和野生型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2025-11-19 |
Crocin inhibits neutrophil migration and activation to treat hypoxic pulmonary hypertension through targeting HCK
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157334
PMID:41043333
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研究论文 | 本研究揭示藏红花素通过靶向HCK抑制中性粒细胞迁移和活化,从而治疗缺氧性肺动脉高压 | 首次发现藏红花素直接靶向HCK蛋白,阐明其通过抑制中性粒细胞迁移和活化来改善肺动脉高压的新机制 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验,尚未进行人体临床试验验证 | 探究藏红花素治疗缺氧性肺动脉高压的药理机制 | 缺氧性肺动脉高压大鼠模型、中性粒细胞、肺动脉平滑肌细胞 | 单细胞测序 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,分子对接,细胞热位移分析,药物亲和响应靶点稳定性 | 动物疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 缺氧性肺动脉高压大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2025-11-19 |
Targeting ICAM1/ITGB2 with plumbagin preserves intercellular adhesion and attenuates gastric precancerous lesions
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157449
PMID:41175578
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研究论文 | 本研究探讨了白花丹素通过靶向ICAM1/ITGB2相互作用维持细胞间粘附并减轻胃癌前病变的机制 | 首次发现白花丹素直接结合ICAM1蛋白的THR-85位点,阻断ICAM1/ITGB2相互作用,从而恢复细胞间粘附 | NA | 研究白花丹素对胃癌前病变的治疗效果及其分子机制 | 临床样本、人源胃类器官、胃癌前细胞(MC细胞)、ICAM1⁻/⁻细胞、GPL小鼠模型 | 分子生物学 | 胃癌前病变 | 单细胞测序、免疫荧光、Western blotting、MST、CETSA、DARTs、Co-IP | NA | 分子相互作用数据、基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 635 | 2025-11-19 |
Hydroxylsafflower yellow A modulates tumor vascularization in liver cancer through intercellular communication and extracellular matrix-receptor interactions
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157455
PMID:41197344
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研究论文 | 本研究探讨羟基红花黄色素A通过调控细胞间通讯和细胞外基质-受体相互作用对肝癌血管化的影响 | 首次揭示HSYA通过上调miR-29a-3p表达,抑制Col-IV/ITGB1/FAK和PI3K/AKT信号通路,从而调节肿瘤血管生成的新机制 | 研究主要关注miR-29a-3p通路,可能还存在其他未被发现的调控机制 | 研究HSYA在纤维化相关肝癌中的作用机制 | 肝星状细胞、肝癌细胞、纤维化相关肝癌小鼠模型 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,分子生物学技术,共培养实验,组织染色,免疫组化,蛋白质印迹,RT-qPCR,扫描电镜,荧光原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据,分子生物学数据,组织学图像 | 肝癌患者样本和纤维化相关肝癌小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 636 | 2025-11-19 |
Astragaloside IV reduces hepatitis B surface antigen level via monocyte/macrophages in chronic HBV infection mice
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157308
PMID:41046687
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研究论文 | 本研究开发了黄芪甲苷IV纳米制剂并验证其通过单核/巨噬细胞降低慢性HBV感染小鼠HBsAg水平的疗效 | 首次开发Pluronic® F-127包封的黄芪甲苷IV纳米制剂解决其低水溶性问题,并揭示其通过单核/巨噬细胞依赖机制降低HBsAg | 研究仅使用AAV-HBV小鼠模型,未在人类临床试验中验证 | 开发黄芪甲苷IV纳米制剂并研究其对慢性HBV感染的治疗效果及机制 | 慢性AAV-HBV感染小鼠模型 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 马尔文激光粒度分析, 透射电子显微镜, 红外光谱 | AAV-HBV小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 637 | 2025-11-19 |
Spermidine enhances macrophages anti-inflammatory and regenerative functions by improving mitochondrial fitness
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157349
PMID:41067199
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研究论文 | 本研究探讨精胺通过改善线粒体功能增强巨噬细胞抗炎和再生能力及其在肝纤维化治疗中的潜力 | 首次揭示精胺通过PGC1α介导的线粒体适应性重塑巨噬细胞表型,并发现硬脂酰辅酶A去饱和酶1产生的油酸在这一过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 研究精胺对巨噬细胞功能的调控机制及其在肝纤维化治疗中的应用价值 | 肝巨噬细胞、CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型、巨噬细胞特异性PGC1α敲除小鼠 | 细胞代谢研究 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、细胞过继转移、基因敲除技术 | 动物模型 | 基因表达数据、代谢数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 638 | 2025-11-19 |
Fufang Danshen Pill improves mitochondrial homeostasis by regulating the S100a9/TLR4 axis to alleviate myocardial ischemia-reperfusion injury
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157433
PMID:41166904
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研究论文 | 本研究探讨复方丹参片通过调控S100a9/TLR4轴改善线粒体稳态缓解心肌缺血再灌注损伤的机制 | 首次结合单细胞转录组和空间转录组技术揭示巨噬细胞特异性S100a9在心肌缺血再灌注损伤中的线粒体调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明复方丹参片通过调控S100a9/TLR4轴改善心肌缺血再灌注损伤的治疗机制 | 小鼠心肌缺血再灌注损伤模型及心肌组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组,腺相关病毒介导的基因过表达 | NA | 转录组数据,空间基因表达数据 | 假手术组、缺血再灌注组和复方丹参片治疗组的小鼠心肌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 639 | 2025-11-19 |
Inhibiting KDM6A Phosphorylation Suppresses Glycolysis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov-18, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70142
PMID:41251278
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研究论文 | 本研究揭示了KDM6A-pSer829磷酸化通过FBXW7介导的泛素化降解调控口腔鳞状细胞癌糖酵解代谢和细胞增殖的新机制 | 首次发现KDM6A-pSer829是FBXW7的识别位点,并证明该磷酸化修饰在OSCC糖酵解代谢中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证不足 | 探究KDM6A特定翻译后修饰在口腔鳞状细胞癌代谢调控中的作用机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞和小鼠模型 | 癌症代谢研究 | 口腔鳞状细胞癌 | Co-IP、免疫印迹、单细胞RNA测序、免疫荧光成像 | 条件性基因敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据 | Kdm6aS829A条件敲入小鼠舌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 640 | 2025-11-19 |
ZEB1 promotes chemoimmunotherapy resistance in pancreatic cancer models by downregulating chromatin acetylation of CXCL16
2025-Nov-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195970
PMID:40924501
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研究论文 | 本研究揭示转录因子ZEB1通过下调CXCL16染色质乙酰化驱动胰腺癌化疗免疫治疗耐药的新机制 | 首次发现ZEB1通过表观遗传调控CXCL16表达和SPP1分泌,同时影响肿瘤焦亡和CD8+ T细胞耗竭的双重耐药机制 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究胰腺癌化疗免疫治疗耐药的分子机制并开发新的治疗策略 | 胰腺癌模型(包括患者来源类器官、异种移植和原位模型) | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、表观遗传分析 | 患者来源类器官、异种移植模型、原位模型 | 转录组数据、表观遗传数据、临床数据 | 胰腺癌患者样本和多种临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |