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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-01-21
Single-cell transcriptomic datasets of the amphibious plant Water wisteria
2025-Nov-29, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了水蓑衣在陆生和水生环境中的叶片细胞,以探索异叶性的分子机制 首次对水蓑衣这一新兴异叶性模型植物进行单细胞转录组测序,为在单细胞水平解析植物环境适应机制提供了基础数据 未明确提及实验样本量或技术重复次数,可能影响统计可靠性 探索异叶性(植物根据环境改变叶片形态的适应策略)的分子机制 水蓑衣(Hygrophila difformis)在陆生和水生环境中的叶片原生质体 植物生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
42 2026-01-21
LMNA-PRKDC axis enhances DNA repair and promotes chemoresistance in glioblastoma
2025-Nov-21, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了胶质母细胞瘤中LMNA-PRKDC轴通过增强DNA修复能力驱动替莫唑胺耐药的新机制 首次发现LMNA-PRKDC轴通过形成DNA修复复合物增强胶质母细胞瘤的DNA修复能力,并鉴定PRKDC抑制剂可作为逆转耐药的新策略 研究主要基于患者来源的异种移植模型和单细胞测序数据,临床转化效果仍需进一步验证 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺产生耐药性的分子机制,并寻找逆转耐药的潜在治疗靶点 胶质母细胞瘤患者来源的肿瘤组织、异种移植模型以及原发和复发肿瘤标本 肿瘤生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、免疫共沉淀 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 患者来源的异种移植模型和原发/复发胶质母细胞瘤标本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
43 2026-01-20
Epithelial pyroptosis-induced TREM1+ macrophages activate Th17 cells to accelerate oral mucosal inflammation
2025-Nov-29, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组等技术,揭示了口腔黏膜慢性炎症中上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞通过激活Th17细胞加速炎症的机制 首次发现上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞在口腔慢性炎症中的关键作用,并建立了ORGUAMIA在线数据库整合多组学数据 NA 探究口腔慢性炎症的发病机制 口腔扁平苔藓等口腔慢性炎症性疾病 数字病理学 口腔黏膜疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量RNA测序, 多重免疫组化 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据, 临床随访数据 大型临床随访队列 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
44 2026-01-20
Androgen Signaling in ILC2s Drives Sex Differences in Helicobacter-induced Gastric Inflammation and Atrophy
2025-Nov-29, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了雄激素通过调节ILC2活性,在幽门螺杆菌诱导的胃部炎症中发挥保护作用,并解释了胃癌发病率的性别差异 首次发现雄激素信号通过调控ILC2s活性来影响幽门螺杆菌诱导的胃部炎症和萎缩,揭示了ILC2s作为幽门螺杆菌驱动胃部炎症的主要调节因子及其在性别差异中的作用 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;雄激素信号的具体分子机制尚未完全阐明 探究雄激素如何影响幽门螺杆菌感染后的胃部炎症反应,并解释胃癌前病变进展中的性别差异 雄性及雌性小鼠(幽门螺杆菌感染模型)、ILC2s(2型先天淋巴样细胞) 单细胞组学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 雄性及雌性小鼠(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
45 2026-01-20
CHD7 regulates cardiac neural crest cell differentiation through SOX5-mediated self-activation
2025-Nov-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控心脏神经嵴细胞分化,为CHARGE综合征相关心脏缺陷提供了新见解 首次发现CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控其自身表达,并证明SOX5过表达可恢复CHD7单倍体不足细胞中的基因表达和心肌细胞分化能力 研究主要基于体外细胞培养模型,体内验证和临床转化潜力仍需进一步探索 探究CHD7在心脏神经嵴细胞分化中的作用机制及其与CHARGE综合征心脏缺陷的关联 心脏神经嵴细胞 发育生物学 先天性心脏病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
46 2026-01-20
HNRNPA2B1 confers immune escape of non-small cell lung cancer through targeting lactate/ferroptosis
2025-Nov-21, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了m6A阅读蛋白HNRNPA2B1通过调控LDHA mRNA稳定性和乳酸积累,促进非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗的机制 首次揭示了HNRNPA2B1作为m6A阅读器,通过靶向LDHA mRNA的m6A修饰位点增强其稳定性,进而通过乳酸积累和干扰素-γ分泌抑制,介导非小细胞肺癌的免疫逃逸和铁死亡抵抗 研究主要在体外共培养体系中进行,体内模型验证相对有限;机制研究聚焦于LDHA通路,可能存在其他下游靶点 探究HNRNPA2B1在非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗中的作用及分子机制 非小细胞肺癌细胞、活化的CD8 T细胞 肿瘤生物学 肺癌 单细胞转录组测序、体外共培养实验 NA 基因表达数据、单细胞测序数据 非小细胞肺癌临床样本及单细胞测序数据(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
47 2026-01-20
The Spatial Atlas of Human Anatomy (SAHA): A Multimodal Subcellular-Resolution Reference Across Human Organs
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了空间人体解剖学图谱(SAHA),这是一个跨多器官系统的健康成人组织的多模态亚细胞分辨率参考图谱 首次创建了跨多器官系统的多模态亚细胞分辨率健康成人组织参考图谱,整合了空间转录组学、蛋白质组学和组织学特征 NA 构建一个全面的健康人体组织图谱,以支持空间诊断和下一代精准医学的发展 健康成人组织,包括胃肠道和免疫组织,以及结直肠癌和炎症性肠病的比较分析 数字病理学 结直肠癌, 炎症性肠病 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单核RNA-seq NA 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 组织学图像 超过100名捐赠者的超过1500万个细胞 10x Genomics, NanoString 空间转录组学, 单细胞RNA-seq CosMx SMI, 10x Xenium, RNAscope, GeoMx DSP CosMx SMI, 10x Xenium, RNAscope, GeoMx DSP, 单核RNA-seq
48 2026-01-20
A New Model of Gastric Pre-neoplasia Induced by Aberrant ADAR1-mediated Double-stranded RNA Signaling
2025-Nov-04, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过在小鼠胃壁细胞中特异性删除ADAR1基因,建立了一种新的胃前瘤变模型,揭示了内源性双链RNA信号在胃上皮损伤和癌前病变中的作用 首次建立了由ADAR1介导的双链RNA信号失调驱动的胃前瘤变遗传模型,并发现线粒体双链RNA在胃上皮中的富集是病变的关键因素 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证;模型依赖于特定的基因删除,可能无法完全反映自然发生的胃前瘤变过程 明确双链RNA反应失调在胃上皮中对胃前瘤变的影响 ADAR1基因特异性删除的小鼠胃壁细胞及其引发的胃前瘤变 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、双链RNA免疫沉淀、免疫电子显微镜 遗传小鼠模型(Adar1ΔPC) 组织学、转录组、免疫学数据 Adar1ΔPC小鼠及年龄匹配的对照组小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
49 2026-01-20
Integrated single-cell transcriptomics and spatial metabolomics unveil cellular differentiation and ginsenosides biosynthesis in Panax root tips
2025-Nov, Horticulture research IF:7.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序和空间代谢组学分析,揭示了人参属植物根尖的细胞分化轨迹和人参皂苷生物合成的细胞异质性 首次在人参属植物根尖中整合单细胞转录组和空间代谢组学,识别了新的转录因子并验证了其在内皮层木栓化和人参皂苷生物合成中的调控作用 研究仅聚焦于三种人参属物种,可能无法完全代表该属的多样性,且功能验证实验范围有限 探究人参属植物根尖早期发育过程中的细胞命运转变及人参皂苷生物合成的细胞异质性 三种人参属植物(Panax ginseng、Panax quinquefolius和Panax notoginseng)的根尖组织 植物生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间代谢组学、LC-MS/MS、RNA原位杂交、双荧光素酶报告基因检测(dual-LUC)、电泳迁移率变动分析(EMSA) NA 转录组数据、代谢组数据、图像数据 三种人参属物种的根尖样本 NA 单细胞RNA-seq、空间代谢组学 NA NA
50 2026-01-19
Acute Phase Response-driven Hepatic Niche Remodeling Promotes Fibrosis Resolution After Alcohol Cessation
2025-Nov-29, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术探索酒精戒断后酒精相关肝病(ALD)的纤维化消退机制,发现急性期反应驱动的肝内细胞间通讯变化促进纤维化消退 首次通过空间转录组学识别了酒精戒断后肝脏中独特的纤维溶解性微环境,并揭示了血清淀粉样蛋白A(SAA)通过HDL介导的机制促进纤维化消退的新作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且机制细节如KDM5B和C/EBPβ的具体调控途径需进一步探索 探究酒精戒断后酒精相关肝病纤维化消退的分子机制 小鼠肝脏组织及人类肝脏样本 空间转录组学 酒精相关肝病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 小鼠模型(具体数量未明确)及人类肝脏样本 Nanostrings 空间转录组学 CosMx 1000-plex CosMx空间转录组学检测
51 2026-01-18
Loss of Intestinal Endosome-associated Protein Sorting Nexin 27 Disrupts Epithelial Barrier and Promotes Inflammation
2025-Nov-17, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了SNX27在肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的未知作用 首次揭示了SNX27在肠道中的关键功能,包括维持上皮屏障和防止炎症,并建立了肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠模型 研究主要基于小鼠模型,人类数据来自公共数据库,需要进一步验证SNX27在人类IBD中的具体机制 确定SNX27在调节肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的作用 人类炎症性肠病(IBD)患者数据和肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠 NA 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2026-01-17
Metastasis-Initiating Osteosarcoma Subpopulations Establish Paracrine Interactions with Lung and Tumor Cells to Create a Metastatic Niche
2025-Nov-14, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过多种模型揭示了骨肉瘤中一个低增殖亚群通过响应肺上皮细胞来源的IL1α,维持促转移细胞因子如IL6和CXCL8的产生,从而启动肺转移,并表明破坏IL1信号可显著减少转移进展 识别了骨肉瘤中启动转移的低增殖细胞亚群及其与肺上皮细胞的旁分泌相互作用机制,首次将IL1α-IL6/CXCL8轴确定为转移的关键驱动因素 研究主要基于体外模型和动物实验,人类临床样本的直接验证有限,且未全面探讨其他潜在转移机制 揭示骨肉瘤肺转移的细胞和分子机制,以开发针对转移的靶向疗法 骨肉瘤细胞亚群、肺上皮细胞、小鼠模型和人类异种移植模型 肿瘤生物学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、体外器官型转移模型、基因组和药理学干扰 NA 基因表达数据、细胞培养数据、动物模型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2026-01-17
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis to reveal characterization of mechanical stimulus-related genes and prognostic signatures in breast cancer
2025-Nov-13, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 本研究整合了bulk和单细胞RNA测序分析,揭示了乳腺癌中机械刺激相关基因的特征,并构建了一个用于预测患者预后的评分模型 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据,构建了一个基于机械刺激相关基因的乳腺癌预后评分模型,并在单细胞分辨率上揭示了机械刺激对肿瘤免疫微环境的影响 NA 识别基于机械刺激相关基因的分子亚型并建立预后评分模型,以预测乳腺癌患者预后并理解机械刺激在肿瘤微环境中的作用 乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 LASSO-Cox回归模型 RNA测序数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
54 2026-01-17
Tool Comparison for Detecting Tumour Cells in Endometrial Cancer via Single-Cell Copy Number Variations Analysis
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究比较了四种基于单细胞转录组数据推断拷贝数变异以预测子宫内膜癌细胞的主要工具(SCEVAN、CopyKAT、InferCNV和sciCNV)的可靠性 首次系统评估了多种单细胞CNV推断工具在子宫内膜癌中的性能,并提出了通过选择富含上皮细胞的亚克隆来减少假阳性的策略 InferCNV和sciCNV工具不直接预测肿瘤细胞,其CNV评分分布曲线未能清晰区分恶性和非恶性细胞群体,因此无法评估其性能 评估单细胞CNV分析工具在检测子宫内膜癌细胞中的可靠性,并为研究人员提供改进预测准确性的建议 子宫内膜癌细胞 数字病理学 子宫内膜癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 使用公开可用的scRNA-seq数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
55 2026-01-17
Identification of Disulfidptosis-Associated Hub Genes in Psoriasis via Integrated Transcriptomic and Experimental Validation Approaches
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法,识别了与银屑病相关的二硫化物死亡相关枢纽基因,并探讨了其在疾病发病机制中的作用 首次将新发现的细胞死亡途径——二硫化物死亡与银屑病联系起来,并利用整合的转录组学和单细胞RNA测序数据结合机器学习方法识别了相关的枢纽基因 研究主要基于生物信息学分析和小鼠模型验证,需要在人类临床样本中进行进一步的功能验证 探究二硫化物死亡相关基因在银屑病发病机制中的作用,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 银屑病皮损和非皮损皮肤组织,以及咪喹莫特诱导的银屑病样小鼠模型 生物信息学 银屑病 转录组学分析,单细胞RNA测序,Western blotting LASSO回归,随机森林 转录组数据,单细胞RNA测序数据 多个数据集(GSE106992,GSE11239,GSE162183)和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
56 2026-01-16
MUSE: A Multi-slice Joint Analysis Method for Spatial Transcriptomics Experiments
2025-Nov, Proceedings of the ... ACM International Conference on Information & Knowledge Management. ACM International Conference on Information and Knowledge Management
研究论文 本文介绍了一种名为MUSE的计算框架,用于处理大规模多切片空间转录组数据的联合嵌入、空间域识别和基因表达插补 开发了首个专门针对多切片空间转录组数据的联合分析框架,采用双模块架构(对齐模块和优化模块)结合最优传输和虚拟邻居生成技术,有效解决了跨切片不一致性和数据质量差异问题 方法性能在模拟和真实数据集上得到验证,但未提及对超大规模切片数量(如数百个切片)的扩展性测试 开发一个能够有效整合多切片空间转录组数据的计算框架,以提高跨切片一致性、空间域识别和基因表达插补的准确性 空间转录组数据,特别是来自同一组织或实验的多个连续或相关切片 空间转录组学 NA 空间转录组学 图模型,最优传输,联合嵌入框架 空间转录组数据(基因表达矩阵与空间坐标) 12个真实数据集和48个模拟数据集 NA 空间转录组学 NA NA
57 2026-01-15
Engineering CCR2/IFN-γ overexpression in enucleated mesenchymal stem cells enhances therapy for rheumatoid arthritis
2025-Nov-27, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过工程化改造过表达CCR2和IFN-γ的去核人间充质干细胞,增强其对类风湿关节炎的治疗效果 首次生成并应用过表达CCR2和IFN-γ的去核人间充质干细胞,以解决传统MSCs治疗中肺部滞留和安全性问题,同时增强归巢能力和治疗效果 研究仅在雄性大鼠模型中进行,未涉及雌性动物或更复杂的临床前模型,且长期安全性和免疫原性需进一步评估 开发一种更安全有效的基于间充质干细胞的类风湿关节炎治疗方法 人间充质干细胞(特别是脐带来源)及其去核改造版本,以及类风湿关节炎雄性大鼠模型 细胞治疗与再生医学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2026-01-15
Systematic evaluation of tools used for single-cell m6A identification
2025-Nov-23, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究系统评估了四种单细胞m6A测序和预测方法,并开发了一个在线可访问的单细胞m6A数据库,用于人类和小鼠物种的修饰定位和水平分析 开发了首个单细胞m6A数据库,整合了多种方法的数据,并展示了在癌症单细胞转录组和空间转录组数据中预测和可视化m6A修饰的独特优越性能 评估的方法数量有限(仅四种),且存在操作复杂性、灵敏度、分辨率和不同技术间一致性等挑战 系统评估单细胞m6A识别工具,并开发相关数据库以促进表观遗传修饰研究 单细胞m6A修饰在人类和小鼠物种中的定位和修饰水平 表观遗传学 癌症(包括UCEC) 单细胞m6A测序和预测方法 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
59 2026-01-15
The ANTsX ecosystem for mapping the mouse brain
2025-Nov-22, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了使用ANTsX生态系统开发的小鼠大脑映射流程,用于将多种空间转录组学和形态学数据对齐到共享坐标框架中 提出了两种新方法:基于速度场的发育时间点连续插值方法和使用最小标注公开数据的深度学习自动脑区划分框架 NA 解决小鼠大脑图谱构建中多样化数据集到共享坐标框架的映射挑战 小鼠大脑 数字病理学 NA MERFISH空间转录组学,fMOST高分辨率形态学,发育MRI,LSFM 深度学习 图像,空间转录组数据 NA NA 空间转录组学,单细胞多组学 NA NA
60 2026-01-14
From Single-Cell Atlas to Functional Validation: Critical Next Steps for Understanding Tip Cell-Mediated Communication in the Injured Spinal Cord
2025-Nov, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
评论 本文对Zeng等人(2025年)利用单细胞RNA测序研究脊髓损伤中内皮尖端细胞与星形胶质细胞和巨噬细胞通讯作用的发现进行了前瞻性展望和批判性审视 强调了对计算预测的旁分泌网络(如Angptl4-Sdc4轴)进行体内功能验证的必要性,并探讨了靶向尖端细胞在治疗中的平衡困境 当前数据缺乏时间和空间分辨率,无法解析相互作用的动态过程,且预测的通讯网络需要因果性验证 推动脊髓损伤中内皮尖端细胞介导的通讯机制从描述性见解向机制理解和治疗策略转化 脊髓损伤中的内皮尖端细胞、星形胶质细胞和巨噬细胞 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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