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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-04-19
A parabrachial hub for need-state control of enduring pain
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学、神经操控、活动记录和计算建模,揭示了表达神经肽Y受体Y1的臂旁核神经元在长期持续性疼痛中的关键作用,并发现饥饿、口渴或捕食者信号能通过释放NPY抑制这些神经元,从而缓解疼痛 首次识别出臂旁核中表达Y1受体的神经元作为内源性镇痛枢纽,并证明其活动能预测功能应对行为,且多种生理需求状态(如饥饿、口渴)能通过NPY释放抑制这些神经元以缓解持续性疼痛 NA 探究慢性疼痛条件下持续性疼痛的中枢机制,特别是组织愈合后疼痛信号的调控 表达神经肽Y受体Y1的臂旁核神经元及其在疼痛和生理需求状态下的活动 神经科学 慢性疼痛 空间转录组学、神经操控、活动记录、计算建模 NA 转录组数据、神经活动数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
42 2026-04-17
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序数据,识别骨关节炎相关基因并预测潜在治疗药物 结合hdWGCNA、随机森林和PPI网络分析识别OA关键基因,并利用孟德尔随机化和斑马鱼实验验证药物作用 研究主要基于生物信息学预测和斑马鱼模型,需进一步在哺乳动物或临床样本中验证 寻找骨关节炎的预防和治疗药物 骨关节炎相关基因和候选药物 生物信息学 骨关节炎 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR 随机森林, 网络分析 基因表达数据 从GEO数据库获取的scRNA-seq和bulk-RNA seq数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
43 2026-04-15
Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke
2025-Nov, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 本文通过全基因组测序发现PPM1D基因的功能获得性突变可减轻缺血性脑卒中损伤,并揭示了其通过PPARα通路影响内皮细胞脂肪酸代谢的机制,同时鉴定出小分子稳定剂T2755作为潜在疗法 首次在缺血性脑卒中患者中鉴定出PPM1D基因的功能获得性突变具有保护作用,并发现小分子化合物T2755可通过稳定PPM1D蛋白减轻脑损伤 研究样本中PPM1D突变携带者仅8例,样本量较小;机制研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接验证有限 探究PPM1D基因在缺血性脑卒中中的作用机制并寻找潜在治疗策略 缺血性脑卒中患者(人类)和Ppm1d基因缺陷小鼠(动物模型) 基因组学与分子机制研究 缺血性脑卒中 全基因组测序,空间转录组学,蛋白质组学分析 NA 基因组测序数据,转录组数据,蛋白质组数据 10,241名缺血性脑卒中患者(其中8例携带PPM1D突变)及Ppm1d缺陷小鼠模型 NA 全基因组测序,空间转录组学 NA NA
44 2026-04-15
Mechanical confinement governs phenotypic plasticity in melanoma
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过斑马鱼模型和人类样本,揭示了机械限制通过染色质重塑介导黑色素瘤细胞表型可塑性转换的机制 首次证明机械限制通过HMGB2蛋白介导的染色质重塑驱动黑色素瘤细胞在增殖与侵袭状态间的可逆转换 研究主要基于斑马鱼模型,人类样本验证相对有限,且机械限制的具体物理参数尚未完全量化 探究黑色素瘤细胞表型可塑性转换的外部触发机制 黑色素瘤细胞(斑马鱼模型及人类样本) 癌症生物学 黑色素瘤 空间转录组学、单细胞转录组学、形态学分析、定量建模 NA 转录组数据、形态学图像 斑马鱼黑色素瘤模型及人类肿瘤样本(具体数量未明确) NA 空间转录组学, 单细胞转录组学 NA NA
45 2026-04-12
Dual-modality Molecular Cartography: Integrating Multiplex mRNA Detection with Protein Imaging Mass Cytometry
2025-11-14, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种整合多重mRNA检测与蛋白质成像质谱流式技术的双模态分子图谱方法,用于同时分析组织切片中的蛋白质和mRNA 创新性地将蛋白质成像质谱流式技术与mRNA原位杂交结合,利用金属探针系统避免了荧光光谱溢出和组织自发荧光问题 NA 开发一种能够同时检测蛋白质和mRNA的空间解析技术,以更好地理解细胞在微环境中的通讯机制 组织切片中的蛋白质和mRNA分子 数字病理学 NA mRNA原位杂交,蛋白质成像质谱流式技术 NA 图像,分子表达数据 NA NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA 基于金属探针的检测系统
46 2026-04-12
Microfluidics-based High-throughput Circulating Tumor Cell Sorting and Single-cell Sequencing Technology
2025-11-14, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种集成了微流控技术的高通量循环肿瘤细胞分选与单细胞测序平台 提出了一种集CTC富集、纯化和单细胞测序于一体的统一微流控工作流程,采用动态控制磁捕获、涡旋混合和基于流阻差异的高精度单细胞捕获芯片,克服了传统方法回收率低、工作流程繁琐和污染风险高的问题 未在摘要中明确提及具体局限性 开发一种高效、高通量的循环肿瘤细胞分选与单细胞测序技术,以克服现有方法的不足 循环肿瘤细胞 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
47 2026-04-12
Mapping CMV-related immune signatures in blood, aorta and perivascular mediastinal adipose tissue
2025-Nov-06, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
研究论文 本研究通过免疫分析探索了巨细胞病毒(CMV)感染如何影响血液、主动脉和血管周围纵隔脂肪组织的免疫特征,并初步揭示了其与心血管疾病的潜在关联 首次在心脏手术患者中同时分析血液、主动脉和血管周围脂肪组织的CMV相关免疫特征,并发现CMV阳性患者主动脉中干扰素-α信号通路受抑制而TNF-α信号通路增强 样本量较小(n=11),仅为初步研究,需要更大规模的研究来确认CMV驱动的免疫重塑如何具体导致心血管疾病 探究CMV感染是否驱动全身性和组织特异性免疫变化,从而可能促进心血管疾病的发展 心脏手术患者的血液、胸主动脉和血管周围纵隔脂肪组织 数字病理学 心血管疾病 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 11名心脏手术患者(4名CMV阴性,7名CMV阳性) NA 单细胞RNA-seq NA NA
48 2026-04-10
Antiviral Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2025-Nov-14, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过比较血浆蛋白质组学和单细胞转录组学,描述了HIV-1治疗停止后病毒反弹前的免疫反应特征 发现病毒反弹前CD16++单核细胞显著增加并具有增强的抗病毒基因表达,以及血浆中炎症蛋白在可检测反弹后出现 研究样本可能有限,且未详细探讨长期临床影响或治疗策略的具体验证 识别治疗停止后病毒反弹前的早期信号,以延长病毒反弹时间并治愈HIV-1 外周血单个核细胞和血浆样本 单细胞转录组学 HIV-1感染 单细胞转录组学, 血浆蛋白质组学 NA 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
49 2026-04-04
Altered Epithelial-Mesenchymal Progenitor States Lead to Matrix Deposition, Tissue Inflammation, and Transitional Epithelial State in Congenital Diaphragmatic Hernia
2025 Nov-Dec, Fetal and pediatric pathology IF:0.7Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了先天性膈疝肺中上皮-间质祖细胞状态的改变,导致基质沉积、组织炎症和上皮细胞过渡状态 首次在先天性膈疝模型中利用单细胞RNA测序技术系统性地分析了间质祖细胞的异常状态及其对上皮-间质转化动态的破坏作用 研究仅基于大鼠模型,尚未在人类样本中验证,且样本量相对有限 探究先天性膈疝肺发育异常的分子机制,特别是上皮-间质祖细胞状态改变对肺发育的影响 正常和先天性膈疝胎鼠肺组织(E17、E19、E21时间点) 单细胞组学 先天性膈疝 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 正常和CDH胎鼠肺组织(E17、E19、E21三个发育阶段) NA 单细胞RNA-seq NA NA
50 2026-04-04
Single-Cell Analysis of L-Myc Expressing Neural Stem Cells and Their Extracellular Vesicles Revealed Distinct Progenitor Populations With Neurogenic Potential
2025-Nov, Journal of extracellular biology
研究论文 本研究通过单细胞分析,表征了表达L-MYC基因的人类胎儿神经干细胞系及其细胞外囊泡,揭示了它们具有神经保护潜力,并探讨了在化疗诱导的神经毒性模型中的应用 首次对表达L-MYC的神经干细胞系及其细胞外囊泡进行单细胞转录组和蛋白质组学表征,揭示了它们在神经保护方面的差异和潜力 研究未能成功挽救少突胶质祖细胞,表明需要重复或补充性干预来恢复少突胶质细胞群 表征治疗相关的人类胎儿神经干细胞系及其细胞外囊泡,以促进脑修复和对抗化疗诱导的神经毒性 人类胎儿神经干细胞系LMNSC01和LMNSC02,以及它们释放的细胞外囊泡 单细胞分析 神经毒性 单细胞RNA测序,单细胞外囊泡纳米显微镜技术,蛋白质组学分析 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,显微镜图像 两个人类胎儿神经干细胞系(LMNSC01和LMNSC02)及其细胞外囊泡 NA 单细胞RNA-seq NA NA
51 2026-04-02
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2025-Nov-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文系统性地比较了三种商业成像空间转录组学平台在FFPE组织中的性能 首次在包含多种肿瘤和正常组织的组织微阵列上,对10X Xenium、Vizgen MERSCOPE和Nanostring CosMx三种iST平台进行综合技术性能与生物性能基准测试 研究仅基于组织微阵列的连续切片,可能未完全反映实际临床应用中的组织异质性,且平台比较受限于匹配基因集 评估和比较不同成像空间转录组学平台在FFPE组织中的性能,为研究者在珍贵样本研究中提供方法选择指导 包含17种肿瘤和16种正常组织类型的组织微阵列的连续切片 空间转录组学 多种肿瘤 成像空间转录组学 NA 空间转录组数据 组织微阵列包含33种组织类型(17种肿瘤和16种正常) 10X Genomics, Vizgen, Nanostring 成像空间转录组学 10X Xenium, Vizgen MERSCOPE, Nanostring CosMx 商业成像空间转录组学平台应用于FFPE组织切片
52 2026-04-01
Pancreatic hypersecretion of amyloid-forming human amylin dysregulates the neuro-immune axis and B cell development in a model of type-2 diabetes
2025-11, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究探讨了2型糖尿病中胰腺过度分泌的人胰淀素如何通过影响外周和神经免疫反应,特别是B细胞发育,导致免疫失调和神经退行性变化 首次揭示了人胰淀素在2型糖尿病中通过下调脑血管ICAM-1和上调B细胞CXCR4表达,导致免疫细胞迁移减少和B细胞发育缺陷,并发现CXCL12/CXCR4信号轴作为潜在治疗靶点 研究主要基于转基因动物模型,人类数据仅通过单细胞测序初步验证,慢性暴露机制和临床转化需进一步探索 探究2型糖尿病中胰腺人胰淀素积累如何影响外周和神经免疫反应,特别是与认知衰退和神经退行性变相关的机制 转基因大鼠和小鼠模型,以及2型糖尿病患者的单细胞测序数据 免疫学与神经科学交叉研究 2型糖尿病 单细胞测序,转基因动物模型,免疫细胞分析 转基因动物模型(大鼠和小鼠) 基因表达数据,免疫细胞计数数据 转基因大鼠和小鼠模型,以及2型糖尿病患者单细胞测序样本(具体数量未明确) NA 单细胞测序 NA NA
53 2026-03-29
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
综述 本文综述了结直肠癌共识分子分型(CMS)的分类、预后预测作用、识别方法及其在指导个体化治疗中的应用与挑战 系统总结了基于基因表达谱、免疫组化(IHC)和基于深度学习的图像分类器(imCMS)等多种CMS识别方法,并探讨了利用单细胞RNA测序解决肿瘤内异质性(ITH)等新兴策略 肿瘤内异质性(ITH)和技术障碍阻碍了CMS分类在临床中的广泛采用 回顾CMS分类在结直肠癌中的预后和预测作用,评估其指导个体化治疗的潜力,并探讨临床应用的障碍与解决方案 结直肠癌(CRC)及其共识分子亚型(CMS1-4) 数字病理学 结直肠癌 基因表达谱分析,免疫组化(IHC),单细胞RNA测序,基于计算模型的图像分类(如深度学习) 深度学习 基因表达数据,组织图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
54 2026-03-29
Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma
2025-11, Nature reviews. Urology
综述 本文总结了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌研究中的应用和发现 首次系统回顾了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌中的研究,揭示了肿瘤微环境的空间异性和相互作用 目前仅针对透明细胞肾细胞癌这一亚型,且技术应用尚处于早期阶段 探讨空间转录组学在肾细胞癌研究中的潜力和应用价值 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境 数字病理学 肾细胞癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
55 2026-03-28
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Develops a Glutamine Metabolism-Based Prognostic Model and Identifies MSMO1 as a Therapeutic Target in Osteosarcoma
2025-11-28, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量队列数据,开发了一个基于谷氨酰胺代谢的骨肉瘤预后模型,并鉴定出MSMO1作为潜在治疗靶点 首次在骨肉瘤中建立了基于谷氨酰胺代谢的患者分层框架,通过单细胞数据揭示了肿瘤内异质性,并采用多算法整合和机器学习方法构建了可外部验证的预后模型 模型在独立队列中的区分能力仅为中等水平,需要进一步的机制研究和体内实验验证 开发骨肉瘤的预后模型并识别治疗靶点 骨肉瘤患者样本和U2OS细胞系 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序,机器学习 Step-Cox [forward] + Ridge回归 基因表达数据 未明确具体样本数量,但包含多个独立队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2026-03-28
Rewriting the Fate of Cancer: Epigenetic and Epitranscriptomic Regulators in the Metastatic Cascade
2025-11-10, Biomolecules IF:4.8Q1
综述 本文综述了表观遗传和表观转录组调控因子在癌症转移级联中的作用,重点关注甲基化修饰 整合了DNA甲基化、RNA修饰和非编码RNA在转移中的相互作用,提出了控制转移的连贯框架 NA 阐明表观遗传和表观转录组机制如何调控癌症转移过程 癌症转移过程中的恶性细胞 NA 癌症 多组学方法、空间转录组学 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
57 2026-03-25
Gene regulatory network determinants of rapid recall in human memory CD4+ T cells
2025-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单核多组学测序技术,探索了人类记忆CD4+ T细胞中快速回忆反应的基因调控网络机制 首次结合单核多组学测序(snRNA-seq和snATAC-seq)与ChIP-seq验证,识别了记忆相关转录因子(如MAF、PRDM1、RUNX2、SMAD3、KLF6)在调控快速回忆反应中的核心作用,并将这些机制与免疫介导疾病的遗传风险关联 研究主要聚焦于CD4+ T细胞亚群,可能未涵盖其他免疫细胞类型;单核测序技术可能无法完全反映细胞在体状态 揭示记忆CD4+ T细胞快速回忆反应的基因调控网络机制,并探索其与免疫疾病遗传风险的关联 人类记忆CD4+ T细胞及其亚群 单细胞组学 免疫介导疾病 单核多组学测序(snRNA-seq和snATAC-seq)、ChIP-seq、GWAS 基因调控网络重建 单细胞RNA-seq数据、单细胞ATAC-seq数据、ChIP-seq数据、GWAS数据 未明确指定样本数量,但涉及人类CD4+ T细胞亚群 NA 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
58 2026-03-25
Transcriptomic profiling of individual bacteria by MATQ-seq
2025-11, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文介绍了一种基于MATQ-seq的细菌单细胞转录组学协议,用于高效分析单个细菌的基因表达谱 该方法整合了索引分选、随机引物和rRNA去除,实现了高达95%的细胞保留率,显著优于现有协议 NA 开发一种适用于细菌单细胞转录组学的高效、可靠方法,以研究细菌群体内的细胞间变异 单个细菌,如鼠伤寒沙门氏菌等模型生物 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 基于MATQ-seq的细菌scRNA-seq协议,包括荧光激活细胞分选和机器人液体处理
59 2026-03-25
Long-read RNA sequencing of transposable elements from single cells using CELLO-seq
2025-11, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CELLO-seq的单细胞长读长RNA测序协议,用于将转座元件(TE)表达数据精确映射到独特的基因组位点 通过整合长50核苷酸独特分子标识符和高PCR重复数,实现了对长读长的错误校正,从而能够高保真地映射到序列高度相似的年轻TE以及基因和TE亚型 协议需要用户具备分子生物学和转录组分析经验,且从细胞分离到定量完成需一周时间 开发一种单细胞长读长RNA测序方法,以解决短读长测序在转座元件表达分析中的模糊映射问题 哺乳动物细胞中的转座元件(TE) 单细胞测序技术 NA 长读长RNA测序,单细胞测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
60 2026-03-24
Integrated bulk and single-cell RNA profiling implicates MFAP5+ CAFs in potential role in peritoneal metastasis of gastric cancer
2025-11-28, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术,揭示了表达MFAP5的癌症相关成纤维细胞在胃癌腹膜转移中的关键作用 首次在单细胞水平上系统描绘了胃癌腹膜转移的基质微环境,并鉴定出MFAP5+ CAFs这一特异性富集于腹膜转移组织、具有促转移表型的终末亚群 研究主要基于转录组数据,功能验证多在体外进行,缺乏体内动物模型验证MFAP5+ CAFs的具体作用机制 探究胃癌腹膜转移的基质微环境特征及其驱动机制 配对的胃癌原发灶和腹膜转移组织样本 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多重免疫组化, 常规免疫组化 NA RNA测序数据, 免疫组化图像 配对的胃癌原发灶和腹膜转移组织样本队列 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
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