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当前共找到 929 篇文献,本页显示第 561 - 580 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
561 2025-11-24
Intercellular signaling and synaptic deconstruction uncovered by single-cell and spatial transcriptomics in an AD tauopathy model
2025-Nov-17, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 通过单细胞多组学和空间转录组学技术研究AD tau蛋白病变模型中的细胞间信号传导和突触解构 首次在人类样tau蛋白病变转基因大鼠模型中结合单细胞多组学和空间转录组学分析,揭示了tau过度磷酸化和衰老对细胞通讯的影响 研究基于转基因动物模型,可能与人类AD病理存在差异 探索阿尔茨海默病发病机制中tau蛋白病变对细胞通讯和突触功能的影响 转基因tau蛋白病变大鼠模型的大脑组织 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞多组学测序, 空间转录组学 转基因动物模型 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
562 2025-11-24
FatePredictor: Cell fate decision-making prediction with an ensemble deep learning model
2025-Nov-03, Innovation (Cambridge (Mass.))
研究论文 开发了一种基于集成深度学习模型的细胞命运决策预测计算框架FatePredictor 结合分岔理论和最优输运理论,利用动态非平衡最优输运方法重建细胞轨迹,并采用集成深度学习模型预测细胞命运分岔类型 NA 预测细胞命运决策过程中的分岔现象和揭示复杂细胞轨迹 细胞分化过程中的命运决策机制 机器学习 NA 单细胞RNA测序 集成深度学习模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
563 2025-11-24
Molecular and cellular morphology of placenta unveils new mechanisms of reproductive immunology
2025-Nov, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和多色免疫组化等技术,揭示了胎盘分子细胞形态特征及其在生殖免疫中的新机制 发现胚胎滋养层细胞在植入前就表达免疫检查点蛋白,揭示了母胎界面免疫平衡的胎儿驱动机制 研究样本包含正常和异位妊娠及动物模型,但具体样本数量未明确说明 探究人类生殖过程中胎盘在早期和晚期的细胞分子特征及免疫调节机制 正常妊娠、异位妊娠胎盘组织及动物模型 生殖免疫学 妊娠相关疾病 空间转录组学,多重免疫组织化学,免疫组化-荧光原位杂交双标记 NA 空间转录组数据,组织图像,蛋白质表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
564 2025-11-24
NF-κB p65 mediated lnc-Traf3ip2 exacerbates renal fibrosis in diabetic kidney disease
2025-Nov, Acta diabetologica IF:3.1Q2
研究论文 本研究探讨了NF-κB p65介导的长链非编码RNA lnc-Traf3ip2在糖尿病肾病肾纤维化中的作用机制 首次发现lnc-Traf3ip2在肾小球系膜细胞中高表达并通过NF-κB p65转录调控参与糖尿病肾病纤维化过程 样本量相对有限(小鼠n=35,患者n=40),且主要聚焦于系膜细胞的纤维化机制 探究lnc-Traf3ip2在糖尿病肾病肾纤维化中的作用及分子机制 糖尿病肾病小鼠模型、db/db小鼠、人血浆样本、肾小球系膜细胞 分子生物学 糖尿病肾病 scRNA-seq, RNA-seq, qRT-PCR, western blot, 免疫荧光, 双荧光素酶报告基因检测, ChIP NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 小鼠共38只(db/db 3只+对照3只+DKD小鼠35只),DKD患者40例 NA 单细胞RNA测序, RNA测序 NA NA
565 2025-11-24
SemiLT: A Multianchor Transfer Learning Method for Cross-Modality Cell Label Annotation from scRNA-seq to scATAC-seq
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 提出一种多锚点迁移学习方法SemiLT,用于从scRNA-seq到scATAC-seq的跨模态细胞标签注释 首次考虑scRNA-seq和scATAC-seq之间的时序差异,通过多锚点迁移学习方法解决模态间批次效应问题 NA 提高从scRNA-seq到scATAC-seq的细胞类型注释准确性 单细胞测序数据,包括人类骨髓造血数据集和外周血单个核细胞(PBMC)数据集 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞ATAC测序(scATAC-seq) 迁移学习, 多锚点学习 单细胞测序数据 多个数据集(包括人类骨髓造血数据集和PBMC数据集) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
566 2025-11-19
Single-cell transcriptomics reveal circulating skin-homing CLA+ CTSW+ cytotoxic CD4+ T cells contribute to relapse of psoriasis
2025-Nov, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
567 2025-11-24
Spatiotemporal mapping reveals Ccl8hi macrophages as key drivers of testicular inflammaging
2025-Nov, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过时空多组学方法揭示了Ccl8hi巨噬细胞是睾丸炎性衰老的关键驱动因子 首次通过空间转录组学和FACS富集的单细胞RNA测序系统解析睾丸巨噬细胞在衰老过程中的异质性,并鉴定出CCL8作为保守的治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探究睾丸巨噬细胞在睾丸衰老过程中的异质性及其在炎性衰老中的作用机制 小鼠和人类睾丸组织中的巨噬细胞 空间转录组学 男性生殖系统衰老 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光分析,器官型培养 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,图像数据 3月龄小鼠及老年小鼠睾丸组织,包含人类睾丸样本验证 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
568 2025-11-24
NK Cell-Derived Small Extracellular Vesicles Armed With CLDN4-Targeting Peptides Potentiate Radiotherapy in Gastric Cancer
2025-Nov, Journal of extracellular vesicles IF:15.5Q1
研究论文 本研究开发了一种靶向CLDN4的NK细胞来源小细胞外囊泡纳米治疗平台,可增强胃癌放疗效果 首次将NK细胞来源的小细胞外囊泡与CLDN4靶向肽结合,创建具有放射增敏作用的新型纳米治疗平台 研究主要基于患者来源类器官模型,尚未进行大规模临床验证 开发针对胃癌的靶向治疗系统以增强放疗效果 胃癌细胞、患者来源类器官模型和类器官来源异种移植模型 癌症治疗 胃癌 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、多模态成像 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据、影像数据 多个单细胞RNA测序数据集和患者来源类器官模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
569 2025-11-24
SURF: A Self-Supervised Deep Learning Method for Reference-Free Deconvolution in Spatial Transcriptomics
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 提出一种名为SURF的无参考解卷积工具,通过自监督深度学习整合高维基因数据分析,用于空间转录组学的细胞类型解析 首次将自监督深度学习与高维基因数据分析相结合,无需匹配单细胞参考数据即可有效建模非线性基因相互作用和利用spot关系 未明确说明计算资源需求和运行时间,也未讨论对极稀疏数据的处理能力 开发无需参考数据的空间转录组解卷积方法,实现细胞水平的组织微环境分析 空间转录组数据,包括合成数据集、真实数据集以及人类结直肠肝转移瘤数据 空间转录组学 结直肠癌肝转移 空间转录组学,自监督深度学习 深度学习 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
570 2025-11-24
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals That Hmga2 Regulates Neuroinflammation and Retinal Function by Modulating Müller Cell Autophagy Through PI3K/AKT Signaling Following MCAO-Induced Retinal Ischemia
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了Hmga2通过PI3K/AKT信号通路调节Müller细胞自噬在视网膜缺血中的神经炎症和视网膜功能调控机制 发现了一个新的表达Hmga2的Müller细胞亚群,并开发了基于Müller细胞膜和脂质体的混合纳米颗粒递送系统siRNA-Hmga2@LMM MCAO诱导的视网膜缺血模型中Müller细胞的具体作用机制仍不完全清楚 探究视网膜缺血中Müller细胞的作用机制及治疗靶点 视网膜细胞,特别是Müller细胞 单细胞组学 视网膜缺血 单细胞核RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
571 2025-11-24
BACE2-Induced Aberrant Lymphatic Network Aggravates the Local Inflammation in Arteriovenous Fistulas With Hyperphosphatemia
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了高磷血症通过BACE2介导的VEGFR3裂解破坏动静脉瘘淋巴网络,从而加剧局部炎症的机制 首次发现动静脉瘘中存在由Pi16Vegfc纤维祖细胞促进的淋巴网络作为炎症外排通道,并阐明高磷血症通过SP1/BACE2/VEGFR3裂解途径破坏该网络的分子机制 研究主要基于小鼠模型,在人类患者中的验证仍需进一步研究 探究慢性肾脏病条件下动静脉瘘局部炎症加剧的机制 人类和小鼠的动静脉瘘组织 空间转录组学 慢性肾脏病 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 5/6肾切除C57BL/6小鼠模型 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
572 2025-11-24
Succinic Acid-Induced Macrophage Endocytosis Promotes Extracellular Vesicle-Based Integrin Beta1 Transfer Accelerating Fibroblast Activation and Sepsis-Associated Pulmonary Fibrosis
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了琥珀酸通过促进巨噬细胞内吞作用释放促纤维化细胞外囊泡,并通过转移整合素β1激活成纤维细胞,从而加速脓毒症相关肺纤维化的新机制 首次发现琥珀酸诱导的巨噬细胞内吞作用促进细胞外囊泡介导的整合素β1转移,揭示了巨噬细胞-成纤维细胞通讯的新机制 NA 探究脓毒症相关肺纤维化的发病机制 巨噬细胞和成纤维细胞 细胞生物学 肺纤维化 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫荧光, 电子显微镜 NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
573 2025-11-24
SciSt: single-cell reference-informed spatial gene expression prediction from pathological images
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 开发了一种从病理图像预测空间基因表达的深度学习框架SciSt 通过整合病理特征与生物学信息初始基因表达,采用结合细胞分割和单细胞参考数据的加权策略 NA 从组织病理图像预测空间基因表达,实现形态学与基因表达的跨模态转换 临床H&E染色图像和空间转录组数据 数字病理学 乳腺癌,肝癌 深度学习 深度学习框架 图像,基因表达数据 三个基准数据集和TCGA-BRCA、TCGA-LIHC队列 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
574 2025-11-23
Deciphering the role of RGS1-overexpressing CD8+T cells in immune evasion of bone metastatic cancer in the urinary system via single-cell sequencing analysis
2025-Nov-19, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞测序分析揭示RGS1过表达的CD8+T细胞在泌尿系统骨转移癌免疫逃逸中的作用机制 首次阐明RGS1在骨转移癌免疫微环境中对CD8+T细胞功能的调控作用,并发现其与T细胞耗竭表型的关联 样本量相对有限(17例患者),需要在更大队列中验证研究结果 阐明RGS1在肿瘤骨转移免疫微环境中的调控机制及CD8+T细胞功能 肾细胞癌和前列腺癌患者的骨转移病灶组织及小鼠骨转移模型 单细胞测序分析 肾细胞癌,前列腺癌 单细胞RNA测序 小鼠骨转移模型 单细胞RNA测序数据 8例肾细胞癌患者和9例前列腺癌患者的骨转移病灶,共215,864个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
575 2025-11-23
scCausalVI disentangles single-cell perturbation responses with causality-aware generative model
2025-Nov-19, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 提出了一种因果关系感知的生成模型scCausalVI,用于解耦单细胞RNA测序数据中的内在细胞状态和外部刺激效应 通过深度结构因果网络显式建模细胞状态特异性对外部扰动的响应机制,整合结构因果建模与跨条件计算机预测 NA 区分单细胞数据中固有细胞变异与外部刺激诱导的外在效应 单细胞RNA测序数据 机器学习 COVID-19 单细胞RNA测序 生成模型, 深度结构因果网络 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
576 2025-11-23
Non-visual photoreceptive brain specification in sea urchin larvae
2025-Nov-19, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究在海胆幼虫中发现了一个对光敏感的神经元簇,这些神经元表达紫外线敏感蛋白Opsin5及多个保守的调控基因 首次在海胆幼虫中鉴定出具有非视觉光感受功能的神经中枢,揭示了其与脊椎动物脑区共享的分子特征 需要进一步研究以完全建立神经回路与行为之间的完整关系 探索后口动物中枢神经系统的进化起源 海胆幼虫 神经科学 NA 单细胞RNA测序,原位杂交,基因敲低 NA 基因表达数据,行为数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
577 2025-11-23
Comprehensive profiling of migratory primordial germ cells reveals niche-specific differences in non-canonical Wnt and Nodal-Lefty signaling in anterior vs posterior migrants
2025-Nov-19, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析小鼠迁移原始生殖细胞及其周围体细胞,揭示前后位置差异对细胞信号通路的影响 首次系统比较前后位置迁移原始生殖细胞的转录组差异,发现非经典Wnt信号和Nodal-Lefty信号通路的区域特异性表达模式 研究仅基于小鼠模型,人类数据为重新分析已发表数据集,需要进一步实验验证 阐明原始生殖细胞迁移过程中与不同体细胞微环境相互作用的分子机制 小鼠原始生殖细胞和周围体细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,全胚胎免疫荧光染色 轨迹推断方法 单细胞转录组数据,图像数据 13,262个小鼠原始生殖细胞和7,868个周围体细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
578 2025-11-23
Inference of cell-type composition and single-cell spatial maps from spatial transcriptomics data with SWOT
2025-Nov-19, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 提出一种名为SWOT的空间加权最优传输方法,可从基于spot的空间转录组数据推断细胞类型组成和单细胞空间图谱 首次通过细胞到spot的映射方法同时推断细胞类型比例和单细胞空间位置,能够重建单细胞空间图谱 方法依赖于spot分辨率的空间转录组数据,在单细胞定位精度方面可能存在限制 开发从空间转录组数据重建单细胞分辨率空间图谱的计算方法 空间转录组数据中的细胞类型和空间位置 空间转录组学 NA 空间转录组学,最优传输算法 空间加权最优传输模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA 基于spot的空间转录组数据
579 2025-11-23
Spatial multi-omics guides ASCT2-targeted delivery of glycolysis inhibitor for cervical cancer suppression and chemoresistance reversal
2025-Nov-16, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过空间多组学分析识别宫颈癌糖酵解重编程特征,并开发靶向ASCT2的纳米平台递送糖酵解抑制剂用于肿瘤抑制和化疗增敏 首次通过空间多组学技术验证宫颈癌糖酵解脆弱性,并基于ASCT2过表达设计谷氨酰胺功能化脂质体实现肿瘤选择性药物递送 未明确说明样本规模和研究人群特征,临床前研究需进一步验证 建立宫颈癌糖酵解重编程的空间验证并开发靶向纳米递送系统 宫颈癌临床标本、小鼠模型和多种宫颈癌细胞系 空间多组学 宫颈癌 空间代谢组学, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq 纳米递送系统 空间多组学数据, 基因组数据, 实验数据 包含TCGA队列、配对患者标本、匹配小鼠样本和多种细胞系 NA 空间代谢组学, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
580 2025-11-23
Single-cell RNA sequencing in osteosarcoma: applications in diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Nov-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
综述 本文通过文献综述探讨单细胞RNA测序技术在骨肉瘤诊断、预后和治疗中的应用 系统评估单细胞RNA测序在揭示骨肉瘤肿瘤微环境异质性、识别治疗靶点和发现新型治疗策略方面的创新贡献 存在单细胞方案的技术偏倚和非英语文献排除的问题,可能影响结果的普适性 评估单细胞RNA测序对骨肉瘤发生发展的贡献 骨肉瘤肿瘤微环境中的细胞亚群 单细胞测序 骨肉瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 基于107项研究的分析 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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