单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1142 篇文献,本页显示第 561 - 580 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
561 2025-11-24
Single-cell RNA sequencing reveals age-related heterogeneity in the tumor microenvironment of breast cancer patients
2025-Nov-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示乳腺癌肿瘤微环境中与年龄相关的异质性 首次在单细胞水平系统比较年轻与老年乳腺癌患者肿瘤微环境的差异,发现干扰素刺激基因在年轻患者肿瘤发生中的关键作用 样本量有限(仅10例患者) 研究年龄对乳腺癌肿瘤微环境组成和功能的影响 乳腺癌患者的肿瘤组织 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序,免疫组化染色,伪时间轨迹分析 inferCNV 单细胞转录组数据,临床生存数据,蛋白质表达数据 10例乳腺癌患者(5例≤40岁,5例≥70岁),包含33,664个高质量细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
562 2025-11-24
Integrative analysis reveals prognostic value of cuproptosis and copper hemostasis related genes in immunotherapy for non-small cell lung cancer
2025-Nov-20, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合分析五个NSCLC免疫治疗队列的RNA测序数据,开发了基于铜死亡和铜稳态相关基因的预后模型 首次发现铜依赖性增殖亚型与不良预后和免疫抑制肿瘤微环境相关,并构建了结合101种算法模型的机器学习流程进行风险分层 研究基于回顾性队列数据,需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 探索铜死亡和铜稳态相关基因在非小细胞肺癌免疫治疗中的预后价值 非小细胞肺癌患者和临床标本 生物信息学 肺癌 RNA测序, 单细胞测序, 蛋白质印迹, 免疫组织化学 机器学习集成模型 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 五个NSCLC免疫治疗队列 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
563 2025-11-24
Characterization of the bone marrow architecture of multiple myeloma using spatial transcriptomics
2025-Nov-20, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术表征多发性骨髓瘤骨髓结构的空间特征 开发了整合空间和单细胞转录组数据的定制分析框架,首次实现了矿化长骨组织中细胞组成和相互作用的原位映射 Visium技术在表征空间调控机制方面存在能力限制 研究多发性骨髓瘤骨髓结构的空间特征及其在疾病进展中的作用 健康和多发性骨髓瘤小鼠模型的骨髓样本,以及多发性骨髓瘤患者样本 空间转录组学 多发性骨髓瘤 空间转录组学,单细胞转录组学 定制分析框架 空间基因表达数据,单细胞转录组数据 健康和多发性骨髓瘤小鼠模型,多发性骨髓瘤患者活检样本 10x Genomics 空间转录组学 Visium Spatial Gene Expression Visium Spatial Gene Expression平台用于福尔马林固定石蜡包埋骨髓切片
564 2025-11-24
TPM2 regulates contractility and biomechanical properties in trabecular meshwork cells
2025-Nov-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨TPM2在小梁网细胞中对收缩相关分子表达和生物力学特性的调控作用 首次揭示TPM2通过调节小梁网细胞收缩性、改变细胞骨架结构和诱导生物力学特性变化来调控房水流出 分子调控机制尚未完全阐明 研究TPM2对小梁网细胞收缩性和生物力学特性的影响 人小梁网细胞(HTMCs) 细胞生物学 原发性开角型青光眼(POAG) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
565 2025-11-24
Benchmarking deep learning methods for biologically conserved single-cell integration
2025-Nov-20, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 评估深度学习单细胞数据整合方法并改进基准测试框架 提出基于相关性的损失函数和增强的基准测试指标scIB-E,更好地保留生物信号 现有单细胞整合基准指数在保留细胞类型内信息方面存在局限 系统评估单细胞数据整合方法并改进基准测试策略 单细胞RNA测序数据 机器学习 肺癌, 乳腺癌 单细胞RNA测序 变分自编码器 基因表达数据 数百万细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
566 2025-11-24
Machine learning-powered discovery of a novel berberine derivative inducing SCD-dependent ferroptosis in osteosarcoma
2025-Nov-20, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过机器学习引导发现了一种新型小檗碱衍生物B1,可诱导骨肉瘤发生SCD依赖性铁死亡 首次将机器学习整合到蛋白质组学发现流程中,鉴定出SCD为关键靶点,并发现B1作为分子胶诱导SCD泛素化降解的新机制 研究主要基于体外细胞系和动物模型,尚未进行临床试验验证 开发针对耐药骨肉瘤的新型治疗策略 骨肉瘤细胞系(143B、U2OS、HOS)和BALB/c裸鼠模型 机器学习 骨肉瘤 蛋白质组测序、单细胞RNA测序、分子对接、热位移分析、表面等离子共振、免疫共沉淀、泛素化分析、脂质组学 LASSO、Ridge、Elastic Net、mRMR 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、分子相互作用数据 多种骨肉瘤细胞系和动物模型 NA 单细胞RNA测序、蛋白质组测序 NA NA
567 2025-11-24
Genome doubling as a dynamic driver of ovarian cancer evolution: insights from single-cell sequencing
2025-Nov-19, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
综述 本文通过单细胞测序技术探讨全基因组加倍作为卵巢癌进化动态驱动因子的作用机制 重新定义全基因组加倍在肿瘤进化中的核心驱动作用,揭示其通过抑制先天免疫通路导致免疫抑制表型的新机制 NA 探讨全基因组加倍在高级别浆液性卵巢癌进化过程中的动态驱动作用及临床意义 高级别浆液性卵巢癌 基因组学 卵巢癌 单细胞测序 NA 基因组数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
568 2025-11-24
Precise combination therapy of radiotherapy and immunotherapy guided by joint PD-L1 imaging and T-cell imaging
2025-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究开发了一种通过联合PD-L1成像和T细胞成像指导放疗与免疫治疗精准联合治疗的新策略 首次提出联合使用PD-L1表达动态成像和肿瘤浸润T细胞成像来指导和预测放疗与免疫检查点抑制剂联合治疗的时机与疗效 研究仅在动物模型中进行验证,尚未在临床患者中证实其有效性 提高放疗与PD-1/PD-L1阻断疗法联合治疗的有效性和安全性 免疫热肿瘤和冷肿瘤模型 分子影像学 癌症 SPECT/CT成像,单细胞RNA测序 NA 影像数据,基因表达数据 动物肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序,分子影像 NA 使用PD-L1靶向探针(99mTc-MY1523)和T细胞靶向探针(99mTc-sum IL-2)进行SPECT/CT成像
569 2025-11-24
Oligoclonal tumor-specific CD8 T-cell revival and IRE1α/XBP1-GDF15-mediated immunosuppressive niches determine neoadjuvant chemoimmunotherapy efficacy in cervical cancer
2025-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞测序和空间转录组学技术,揭示了宫颈癌新辅助化疗免疫治疗疗效差异的免疫学机制 发现内质网应激信号IRE1α/XBP1轴通过诱导GDF15产生促进免疫抑制微环境形成,并鉴定出寡克隆肿瘤特异性CD8 T细胞复活与治疗反应的关系 样本量相对有限(单细胞测序n=10,验证队列n=23),需要更大规模研究验证 探究局部晚期宫颈癌新辅助化疗免疫治疗疗效差异的分子机制 局部晚期宫颈癌患者样本和小鼠模型 单细胞生物学 宫颈癌 单细胞RNA测序,单细胞VDJ测序,空间转录组学,多重免疫组化 小鼠模型 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组化数据 单细胞测序10例患者(5对治疗前后配对样本),验证队列23例患者,6例手术标本mIHC分析 NA 单细胞RNA测序,单细胞VDJ测序,空间转录组学 NA NA
570 2025-11-24
From sample to clinical insight: a review of exome sequencing in disease diagnostics
2025-Nov-19, Methods (San Diego, Calif.)
综述 本文全面回顾了外显子组测序在疾病诊断中的方法学、数据分析流程、临床应用及伦理考量 系统评估了新兴长读长测序系统与多组学整合框架,强调了机器学习在变异优先排序中的未来方向 作为综述文章未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳分析 探讨外显子组测序在疾病诊断和精准医疗中的临床应用与发展前景 外显子组测序技术及其在人类疾病诊断中的应用 基因组学 多种疾病 外显子组测序 机器学习 基因组数据 NA NA 外显子组测序, 单细胞测序 NA NA
571 2025-11-24
Toward a ToxAtlas of Carbon-Based Nanomaterials: Single-Cell RNA Sequencing Reveals Initiating Cell Circuits in Pulmonary Inflammation
2025-Nov-18, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示碳基纳米材料引发肺部炎症的起始细胞回路 首次在单细胞分辨率下系统比较不同碳基纳米材料引发的特异性分子起始事件,并开发了ToxAtlas网络工具 仅关注急性炎症反应(12小时),未研究长期慢性炎症发展过程 理解纳米材料特性如何驱动急性肺部炎症反应 小鼠肺部细胞 单细胞组学 肺部炎症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠肺部细胞(鉴定出41种细胞状态) NA 单细胞RNA-seq NA NA
572 2025-11-24
Oncolytic virus-induced IL-1β+ monocyte-IL-6+ CAF axis suppresses dendritic cell-mediated antitumor immunity in pancreatic cancer
2025-Nov-18, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了胰腺癌中溶瘤病毒诱导的单核细胞-CAF-DC免疫抑制轴机制 首次发现溶瘤病毒通过诱导单核细胞产生IL-1β进而激活CAF产生IL-6,从而抑制树突状细胞功能的免疫抑制新通路 研究主要基于小鼠和患者来源的肿瘤模型,临床转化效果需进一步验证 探究胰腺癌微环境中基质成分如何调节溶瘤病毒疗效的机制 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境 肿瘤免疫学 胰腺癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,基因工程病毒构建 NA 基因表达数据,细胞表型数据 小鼠模型和患者来源肿瘤模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
573 2025-11-24
scMFF: a machine learning framework with multiple feature fusion strategies for cell type identification
2025-Nov-18, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 提出一种用于单细胞RNA测序数据细胞类型识别的多特征融合机器学习框架 整合四种特征表示并探索六种融合策略,克服单一特征局限性,提升细胞分类性能 NA 开发更准确稳定的单细胞RNA测序细胞类型分类方法 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 机器学习 COVID-19 单细胞RNA测序 机器学习框架 单细胞RNA测序数据 42个疾病相关数据集和1个外部COVID-19数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
574 2025-11-24
ELF3-regulated PES1 targets VEGFR2 to mediate angiogenesis and retinal inner barrier injury in diabetic retinopathy
2025-Nov-18, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析,揭示了ELF3/PES1/VEGFR2信号通路在糖尿病视网膜病变中调控血管生成和血视网膜屏障功能的关键作用 首次发现PES1在糖尿病视网膜病变中的关键作用,并阐明ELF3通过结合PES1启动子调控其表达,进而影响VEGFR2介导的血管生成和屏障功能损伤的新机制 研究主要基于体外实验和动物模型,临床验证仍需进一步开展 探讨PES1在糖尿病视网膜病变血管生成和血视网膜屏障功能中的作用及调控机制 糖尿病视网膜病变中的血管内皮细胞 生物医学研究 糖尿病视网膜病变 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, Western blot, 划痕实验, 管形成实验, Transwell, EdU增殖实验, 免疫荧光, Evans Blue实验, PAS染色, H&E染色 NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
575 2025-11-24
HLA-A drives diabetic retinopathy pathogenesis: multi-omics integration reveals resveratrol's therapeutic potential via immunomodulation
2025-Nov-18, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过多组学整合分析发现HLA-A是糖尿病视网膜病变的致病因子,并揭示白藜芦醇通过免疫调节具有治疗潜力 首次通过双向孟德尔随机化和单细胞RNA测序确定HLA-A在糖尿病视网膜病变中的因果作用,并发现白藜芦醇可调节HLA-A表达 样本量相对有限(n=81),且主要基于中国人群队列 识别糖尿病视网膜病变的新型生物标志物和治疗靶点 糖尿病视网膜病变患者外周血样本和THP-1细胞系 生物信息学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序, 双向孟德尔随机化, 分子对接, 细胞实验 NA 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 临床数据 81例中国人群外周血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
576 2025-11-24
Intercellular signaling and synaptic deconstruction uncovered by single-cell and spatial transcriptomics in an AD tauopathy model
2025-Nov-17, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 通过单细胞多组学和空间转录组学技术研究AD tau蛋白病变模型中的细胞间信号传导和突触解构 首次在人类样tau蛋白病变转基因大鼠模型中结合单细胞多组学和空间转录组学分析,揭示了tau过度磷酸化和衰老对细胞通讯的影响 研究基于转基因动物模型,可能与人类AD病理存在差异 探索阿尔茨海默病发病机制中tau蛋白病变对细胞通讯和突触功能的影响 转基因tau蛋白病变大鼠模型的大脑组织 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞多组学测序, 空间转录组学 转基因动物模型 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
577 2025-11-24
Protocol for decoding immune predictors of response to immunotherapy through pan-cancer multiomics analysis
2025-Nov-03, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文提出了一种通过单细胞多组学分析解码免疫检查点阻断治疗反应预测因子的实验方案 整合单细胞RNA测序、单细胞免疫分析和质谱流式技术,结合基因调控网络和细胞间相互作用分析,实现跨癌种的免疫预测因子识别 NA 开发识别免疫检查点阻断治疗反应相关T细胞亚群和预测性生物标志物的分析方法 多种癌症类型中的T细胞动态 生物信息学 多种癌症 单细胞RNA测序, 单细胞免疫分析, 质谱流式技术 NA 单细胞转录组数据, 免疫表型数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
578 2025-11-24
FatePredictor: Cell fate decision-making prediction with an ensemble deep learning model
2025-Nov-03, Innovation (Cambridge (Mass.))
研究论文 开发了一种基于集成深度学习模型的细胞命运决策预测计算框架FatePredictor 结合分岔理论和最优输运理论,利用动态非平衡最优输运方法重建细胞轨迹,并采用集成深度学习模型预测细胞命运分岔类型 NA 预测细胞命运决策过程中的分岔现象和揭示复杂细胞轨迹 细胞分化过程中的命运决策机制 机器学习 NA 单细胞RNA测序 集成深度学习模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
579 2025-11-24
Molecular and cellular morphology of placenta unveils new mechanisms of reproductive immunology
2025-Nov, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和多色免疫组化等技术,揭示了胎盘分子细胞形态特征及其在生殖免疫中的新机制 发现胚胎滋养层细胞在植入前就表达免疫检查点蛋白,揭示了母胎界面免疫平衡的胎儿驱动机制 研究样本包含正常和异位妊娠及动物模型,但具体样本数量未明确说明 探究人类生殖过程中胎盘在早期和晚期的细胞分子特征及免疫调节机制 正常妊娠、异位妊娠胎盘组织及动物模型 生殖免疫学 妊娠相关疾病 空间转录组学,多重免疫组织化学,免疫组化-荧光原位杂交双标记 NA 空间转录组数据,组织图像,蛋白质表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
580 2025-11-24
NF-κB p65 mediated lnc-Traf3ip2 exacerbates renal fibrosis in diabetic kidney disease
2025-Nov, Acta diabetologica IF:3.1Q2
研究论文 本研究探讨了NF-κB p65介导的长链非编码RNA lnc-Traf3ip2在糖尿病肾病肾纤维化中的作用机制 首次发现lnc-Traf3ip2在肾小球系膜细胞中高表达并通过NF-κB p65转录调控参与糖尿病肾病纤维化过程 样本量相对有限(小鼠n=35,患者n=40),且主要聚焦于系膜细胞的纤维化机制 探究lnc-Traf3ip2在糖尿病肾病肾纤维化中的作用及分子机制 糖尿病肾病小鼠模型、db/db小鼠、人血浆样本、肾小球系膜细胞 分子生物学 糖尿病肾病 scRNA-seq, RNA-seq, qRT-PCR, western blot, 免疫荧光, 双荧光素酶报告基因检测, ChIP NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 小鼠共38只(db/db 3只+对照3只+DKD小鼠35只),DKD患者40例 NA 单细胞RNA测序, RNA测序 NA NA
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