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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-11-25 |
Integrated analysis reveals survival-related genes promoting cholangiocarcinoma progression via G2/M cell cycle, with validation of cyclin B1 in tumor proliferation
2025-Nov-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-25299-4
PMID:41272097
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研究论文 | 通过整合分析发现促进胆管癌进展的生存相关基因及其在G2/M细胞周期中的作用,并验证了cyclin B1在肿瘤增殖中的功能 | 首次定义了促进胆管癌进展的G2/M期基因模块并绘制了其单细胞动态图谱,揭示了CCNB1作为治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于细胞系模型 | 识别驱动胆管癌进展的生存相关基因并解析其调控网络 | 胆管癌患者样本和HuCCT1/RBE细胞系 | 生物信息学 | 胆管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲低 | limma, WGCNA, PPI分析 | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA-CHOL和GEO队列的批量转录组数据,GSE138709单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 522 | 2025-11-25 |
Towards the Generation of a Laser Capture Microdissection-Based Human Hair Follicle Transcriptome Atlas
2025-Nov-21, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.006
PMID:41275906
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研究论文 | 本研究利用激光捕获显微切割结合RNA测序技术,构建了人类生长期毛囊八个不同区域的转录组图谱 | 首次系统性地揭示了人类生长期毛囊各区域的转录组特征,发现了新的区域特异性标志物,并构建了目前尚不可用的毛囊转录组图谱 | 研究仅针对生长期VI毛囊,未涵盖其他毛囊周期阶段 | 构建人类毛囊不同区域的转录组图谱,为毛囊疾病治疗提供基础 | 人类生长期VI毛囊的八个特定区域 | 转录组学 | 毛囊疾病 | 激光捕获显微切割, RNA测序, 原位杂交 | PCA, CellChat分析 | 转录组数据 | 人类毛囊八个区域的组织样本 | NA | RNA测序 | NA | NA |
| 523 | 2025-11-25 |
Epigenetic conservation infers that colorectal cancer progenitors retain the phenotypic plasticity of normal colon
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24703-3
PMID:41266495
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和DNA甲基化分析探讨结直肠癌前体细胞是否保留正常结肠的表型可塑性 | 提出定量可塑性信号框架,将表观遗传变异性与基因表达变异性相关联 | 仅分析两个结直肠癌样本,样本量有限 | 研究结直肠癌进展过程中是否保留正常结肠的表型可塑性 | 结直肠癌组织和正常结肠组织 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, DNA甲基化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 2个结直肠癌样本和多个外部单细胞RNA-Seq数据集 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2025-11-25 |
Machine learning-enhanced discovery of a basement membrane-related gene signature in glioblastoma via single-cell and Spatial transcriptomics
2025-Nov-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06918-0
PMID:41267067
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学结合机器学习方法,构建了胶质母细胞瘤中基底膜相关基因特征的风险模型 | 首次通过机器学习组合方法构建基底膜相关基因特征风险模型,并利用单细胞和空间转录组学验证其在胶质母细胞瘤中的表达特征 | 研究样本数量有限,仅包含四个队列的胶质母细胞瘤患者数据 | 探索胶质母细胞瘤与基底膜之间的分子关联,建立预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者样本 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 二元分类机器学习 | 基因表达数据 | 四个患者队列,包含来自17名患者的42个独立验证样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 525 | 2025-11-25 |
Immune cell-specific gene expression and its causal role in osteoporosis and bone mineral density: Insights from single-cell eQTL and GWAS data integration
2025-Nov-14, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045869
PMID:41239652
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研究论文 | 通过整合单细胞eQTL和GWAS数据,系统研究免疫细胞特异性基因表达与骨质疏松症风险的因果关系 | 首次在免疫细胞亚型水平上探索基因表达与骨质疏松症的因果关联,识别出7个关键基因 | 研究结果需要进一步实验验证,样本量可能限制统计功效 | 探究免疫细胞特异性基因表达在骨质疏松症发病机制中的因果作用 | 骨质疏松症患者和骨矿物质密度相关数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 孟德尔随机化 | 孟德尔随机化模型, Steiger方向性检验, 共定位分析 | 基因组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 526 | 2025-11-25 |
Disease duration impacts intestinal gene expression profiles in Crohn's disease but not in ulcerative colitis
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf179
PMID:41063393
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研究论文 | 本研究探讨疾病持续时间对克罗恩病和溃疡性结肠炎患者肠道基因表达谱的影响差异 | 首次系统比较疾病持续时间对两种主要炎症性肠病肠道转录组的不同影响,并识别出与疾病持续时间相关的共享基因特征和通路 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证机制 | 理解克罗恩病和溃疡性结肠炎中疾病持续时间相关的肠道转录组变化 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎患者的肠道组织 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | RNA测序,单细胞RNA测序,差异表达分析,通路分析 | NA | 基因表达数据 | MSCCR队列:498例CD患者和421例UC患者;SPARC IBD队列:777例CD患者和440例UC患者;单细胞RNA测序:18例CD患者 | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 527 | 2025-11-25 |
Lateral plate mesoderm directs human amnion and ventral skin organoid formation
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.05.685987
PMID:41278640
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研究论文 | 本研究通过调控细胞组成和信号环境,成功构建了模拟腹侧皮肤和人类羊膜组织的类器官模型 | 首次利用侧板中胚层祖细胞生成腹侧皮肤类器官,并通过信号调控将其重编程为羊膜样组织 | NA | 研究人类胚胎-胚外界面发育过程,为先天性皮肤和羊膜疾病提供新见解 | 人类皮肤类器官和羊膜样组织 | 发育生物学 | 先天性皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 528 | 2025-11-25 |
CD73 inhibitor AB680 suppresses glioblastoma in mice by inhibiting purine metabolism and promoting P2RY12+ microglia transformation
2025-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01585-9
PMID:40500344
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研究论文 | 本研究探讨CD73抑制剂AB680通过抑制嘌呤代谢和促进P2RY12+小胶质细胞转化来抑制小鼠胶质母细胞瘤的机制 | 首次揭示AB680通过改变GBM微环境中嘌呤代谢促进P2RY12+小胶质细胞向M1样抗肿瘤表型转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床疗效仍需进一步验证 | 研究AB680在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤作用及其分子机制 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和人类GBM样本 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢组学分析,单细胞RNA测序,核RNA测序 | NA | 代谢组数据,基因表达数据 | G422-GBM荷瘤小鼠模型和人类GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序,核RNA测序 | NA | NA |
| 529 | 2025-11-25 |
New advances on the interaction between internal and external factors in the tumor microenvironment of solid tumors
2025-Nov, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2585349
PMID:41177968
|
综述 | 本文综述了实体瘤肿瘤微环境中内外因素相互作用的最新研究进展 | 整合单细胞测序和空间组学技术揭示肿瘤微环境中细胞间相互作用的复杂细节 | NA | 寻求突破实体瘤免疫治疗瓶颈的联合免疫治疗方案 | 实体瘤肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 实体瘤 | 单细胞测序, 空间组学技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 530 | 2025-11-25 |
Cell2Spatial is a computational framework that maps single cells to spatial transcriptomic spots to reconstruct tissue architecture
2025-Nov, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003477
PMID:41248160
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研究论文 | 开发了一种计算框架Cell2Spatial,可将单细胞数据映射到空间转录组spots以重建组织架构 | 开发了首个能够在不完全匹配的单细胞和空间转录组数据集上实现单细胞分辨率空间映射的计算框架 | NA | 解决单细胞测序缺乏空间信息和空间转录组分辨率有限的挑战 | 小鼠大脑、人类胸腺、小鼠肾脏和人类背外侧前额叶皮层组织 | 计算生物学 | NA | 信息论基因选择、空间加权似然建模、空间热点检测、神经网络引导聚类 | 神经网络、成本最小化分配算法 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 多个组织类型(包括4种不同组织) | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium, Xenium In Situ, Visium HD, Slide-seqV2 | 10x Visium空间转录组平台 |
| 531 | 2025-11-25 |
White and brown adipose tissue share a convergent fibro-adipogenic progenitor population
2025-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00591-6
PMID:41062857
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现白色和棕色脂肪组织共享一种趋同的纤维-脂肪生成祖细胞群 | 首次在棕色脂肪组织中鉴定出纤维-脂肪生成祖细胞样细胞,扩展了该组织中已知祖细胞群的范围 | 体外培养条件可能影响祖细胞特性,研究结果需在体内进一步验证 | 研究体外培养条件对白色和棕色脂肪祖细胞特性的影响 | 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 532 | 2025-11-25 |
Single-Cell Transcriptomics Uncovers Cellular Heterogeneity, Mechanisms, and Therapeutic Targets for Ferroptosis-Related Genes in Parkinson's Disease
2025-Nov, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.70339
PMID:41276944
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了帕金森病中铁死亡相关基因的细胞异质性、作用机制和治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统分析帕金森病中铁死亡相关基因的细胞特异性表达模式,并鉴定出内皮细胞为关键细胞类型 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索铁死亡相关基因在帕金森病中的调控机制和潜在治疗靶点 | 帕金森病患者和健康对照的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的帕金森病相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 533 | 2025-11-25 |
Multi-Omics and Molecular Dynamics Analysis for Biomarker Discovery in Chronic Rhinosinusitis With Nasal Polyps
2025-Nov, Chemical biology & drug design
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/cbdd.70202
PMID:41277316
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和分子动力学模拟探索慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的生物标志物 | 首次结合多组学数据、分子对接和动力学模拟鉴定PRKCZ基因作为CRSwNP的潜在治疗靶点 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,需要进一步临床验证 | 发现慢性鼻窦炎伴鼻息肉的生物标志物和治疗靶点 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者相关基因和信号通路 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 多组学分析,分子对接,分子动力学模拟,单细胞测序,qRT-PCR,Western blot,免疫组化,荧光检测 | NA | 基因表达数据,蛋白质结构数据 | 来自GEO数据库的差异表达基因数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 534 | 2025-11-24 |
Multidimensional single-cell analysis reveals immune dysfunction and inflammatory response in Lymphatic malformations
2025-Nov-22, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf103
PMID:41273773
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研究论文 | 本研究通过多维单细胞分析揭示了淋巴管畸形中的免疫功能障碍和炎症反应机制 | 首次整合单细胞RNA、T细胞受体和B细胞受体测序技术,系统描绘淋巴管畸形患者的免疫图谱,发现促炎性单核细胞扩增和S100A8作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限,主要关注外周血和胸腔积液,未深入探究其他组织部位的免疫变化 | 阐明淋巴管畸形患者的免疫表型和分子机制 | 淋巴管畸形患者的外周血和胸腔积液样本 | 单细胞组学 | 淋巴管畸形 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq), 单细胞B细胞受体测序(scBCR-seq) | NA | 单细胞转录组数据, 免疫受体序列数据 | 淋巴管畸形患者的外周血和胸腔积液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 单细胞B细胞受体测序 | NA | NA |
| 535 | 2025-11-24 |
ASAH1-mediated sphingolipid metabolic reprogramming in venetoclax resistance of AML: beyond the monocytic phenotypes
2025-Nov-22, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15272-9
PMID:41275169
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了ASAH1介导的鞘脂代谢重编程在急性髓系白血病 Venetoclax耐药机制中的关键作用 | 首次发现单核细胞AML中鞘脂代谢异常与Venetoclax耐药相关,并证明ASAH1基因敲除可增强药物敏感性而不影响单核细胞表型标记 | 研究主要基于体外细胞系和动物模型,需要进一步临床验证 | 探索急性髓系白血病对Venetoclax耐药的分子机制 | 急性髓系白血病患者骨髓样本、患者来源异种移植模型和诱导耐药细胞系 | 生物医学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,脂质组学测序,基因敲除 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据,脂质组学数据 | AML患者骨髓样本、PDX模型和耐药细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,脂质组学测序 | NA | NA |
| 536 | 2025-11-24 |
AI-driven discovery of dual antiaging and anti-AD therapeutics via PROTAC target deconvolution of a super-enhancer-regulated axis
2025-Nov-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz9283
PMID:41259504
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研究论文 | 通过人工智能驱动的PROTAC靶点解析方法发现褪黑素作为兼具抗衰老和抗阿尔茨海默病双重作用的候选治疗药物 | 结合人工智能筛选、PROTAC靶点解析和超级增强子机制研究,建立了从AI发现到临床应用的创新药物研发范式 | 研究样本量相对有限,需要更大规模的临床验证 | 开发同时针对生物衰老和阿尔茨海默病的双重作用治疗药物 | 褪黑素及其作用机制 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,PROTAC化学蛋白质组学 | AI驱动筛选模型 | 血清蛋白质组数据,转录组数据,表观遗传数据 | 161名人类个体 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 537 | 2025-11-24 |
Unveiling the role of gastric cancer-associated mesenchymal stem cells and neutrophil extracellular traps through multi-omics analysis
2025-Nov-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04768-7
PMID:41261408
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研究论文 | 通过多组学分析揭示胃癌相关间充质干细胞和中性粒细胞胞外诱捕网在肿瘤微环境中的作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和功能富集分析系统解析GC-MSCs与NETs在胃癌微环境重塑中的相互作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探究胃癌微环境中GC-MSCs和NETs的分子机制及治疗靶点 | 胃癌肿瘤微环境中的细胞组成和分子网络 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 功能富集分析 | NA | 转录组数据 | TCGA和GEO公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 538 | 2025-11-24 |
MRAP mediated adipocyte differentiation by thymic mesenchymal stromal cells contributes to thymic involution
2025-Nov-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64973-z
PMID:41266306
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研究论文 | 本研究揭示了胸腺间充质基质细胞通过MRAP介导的脂肪细胞分化在年龄相关性胸腺退化中的作用机制 | 首次发现MRAP是胸腺间充质基质细胞脂肪生成的关键驱动因子,并阐明胸腺素-α1通过FoxO1信号通路促进MRAP表达的机制 | NA | 探究年龄相关性胸腺退化中脂肪沉积的细胞和分子机制 | 胸腺间充质基质细胞、小鼠和人类胸腺组织 | 细胞生物学 | 年龄相关性胸腺退化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和年老小鼠及人类胸腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 539 | 2025-11-24 |
Macrophage mitophagy-related genes predict prognosis and therapeutic response in lung adenocarcinoma
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24769-z
PMID:41266404
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和机器学习算法,开发了基于巨噬细胞线粒体自噬相关基因的肺腺癌预后模型 | 首次将巨噬细胞线粒体自噬相关基因与肺腺癌预后关联,并鉴定出TUBB6和CAT作为核心预后基因 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 识别关键的巨噬细胞线粒体自噬相关基因并建立肺腺癌预后模型 | 肺腺癌患者和巨噬细胞 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | LASSO, SVM, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 540 | 2025-11-24 |
Integrative analysis identifies STX16 as a prognostic and immune-associated biomarker in ccRCC
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24921-9
PMID:41266441
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,系统探讨了STX16在肾透明细胞癌中的表达模式、预后价值和免疫功能 | 首次系统揭示STX16在ccRCC中的预后价值和免疫调节功能,并通过单细胞测序解析其在肿瘤微环境中的异质性表达 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多体内实验和临床样本验证 | 探究STX16在肾透明细胞癌中的表达特征、临床意义和生物学功能 | 肾透明细胞癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 生物信息学分析,Western blot,免疫组化,siRNA敲低,单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据,临床数据,蛋白质数据 | TCGA等公共数据库中的ccRCC样本,实验室细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |