单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 925 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-11-27 |
Single-cell landscape of the tumour immune microenvironment in human gynaecologic malignancies
2025-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70538
PMID:41275425
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研究论文 | 通过整合公开单细胞RNA测序数据系统分析三种妇科恶性肿瘤的肿瘤免疫微环境特征 | 首次系统描绘三种主要妇科恶性肿瘤的免疫微环境单细胞图谱，发现与临床预后相关的促血管生成巨噬细胞亚群和干扰素启动巨噬细胞亚群 | 基于公开数据集的回顾性分析，样本来源可能存在异质性 | 系统研究妇科恶性肿瘤肿瘤免疫微环境的细胞组成和功能特征 | 272,389个CD45+免疫细胞，来自111个肿瘤和非恶性组织样本 | 单细胞组学 | 妇科恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序，多色免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，免疫组化数据 | 272,389个细胞，111个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 522 | 2025-11-27 |
Artificial Intelligence-driven spatial transcriptomics in OSCC: Mapping the tumor microenvironment and personalizing therapy
2025 Nov-Dec, Journal of oral biology and craniofacial research
DOI:10.1016/j.jobcr.2025.10.015
PMID:41282271
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综述 | 本文探讨人工智能驱动的空间转录组学在口腔鳞状细胞癌研究中的应用及其临床转化潜力 | 整合空间转录组学与人工智能技术，实现肿瘤微环境空间异质性解析和个性化治疗策略开发 | 计算需求高、新鲜冷冻组织获取受限、平台特异性偏差 | 通过空间转录组学技术解析口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境并推动精准医疗 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 机器学习 | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics, NanoString, BGI | 空间转录组学 | 10x Visium, GeoMx DSP, Stereo-seq | 10x Genomics Visium, NanoString GeoMx DSP, BGI Stereo-seq |
| 523 | 2025-11-27 |
iPSC-derived macrophages: An in vitro model to study human disease-relevant macrophage biology
2025-Nov-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf184
PMID:40795241
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研究论文 | 本研究探索使用诱导多能干细胞衍生的巨噬细胞作为研究人类疾病相关巨噬细胞生物学的体外模型 | 建立了基于iPSC的巨噬细胞模型，克服了传统单核细胞来源巨噬细胞的局限性，能够更好地模拟体内疾病相关表型 | 研究主要基于体外实验，需要进一步验证与体内真实情况的对应关系 | 开发更优的人类巨噬细胞体外研究模型 | 诱导多能干细胞衍生的巨噬细胞、脐带血来源巨噬细胞、骨髓来源巨噬细胞和单核细胞来源巨噬细胞 | 细胞生物学 | 炎症性疾病 | RNA测序、细胞表型分析 | 体外细胞模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多种来源的巨噬细胞比较研究 | NA | RNA测序 | NA | NA |
| 524 | 2025-11-27 |
Optimized detection and inference of immune cell type names in single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf183
PMID:40839860
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研究论文 | 开发了一种名为scODIN的计算方法，用于优化单细胞RNA测序数据中免疫细胞类型的检测和推断 | 采用结合专家知识与机器学习的整体两步法，能够检测传统分析中常被忽视的双重和过渡表型 | 未在摘要中明确说明具体局限性 | 提高单细胞RNA测序数据中免疫细胞亚群识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的免疫细胞 | 生物信息学 | 自身免疫疾病、感染性疾病、癌症 | 单细胞RNA测序 | k-近邻算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 525 | 2025-11-27 |
Isolation and Flow Cytometric Analysis of Natural Killer Cells from Human Glioblastoma Multiforme (GBM) Tissues
2025-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70259
PMID:41288119
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研究方法论文 | 本文提出了一种从人胶质母细胞瘤组织中分离和分析自然杀伤细胞的可重复流程 | 开发了专门针对胶质母细胞瘤组织的自然杀伤细胞分离和分析标准化流程，包括酶解和机械分离两种方法 | NA | 建立胶质母细胞瘤组织中自然杀伤细胞的分离和分析方法 | 人胶质母细胞瘤组织中的自然杀伤细胞 | 细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞悬浮液，流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 526 | 2025-11-27 |
Identity, Functions, and the Spatiotemporal Maturation of Type 1 Conventional Dendritic Cells
2025-Nov, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.70079
PMID:41290543
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综述 | 本文综述了1型常规树突状细胞的身份、功能及时空成熟过程 | 揭示了树突状细胞在免疫原性和耐受性成熟过程中均经历广泛且趋同的重编程过程 | NA | 阐明树突状细胞特别是cDC1亚群的异质性、功能特性和成熟机制 | 1型常规树突状细胞(cDC1s) | 免疫学 | 癌症、传染病、自身免疫性疾病 | 单细胞转录组学、本体遗传学研究 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 527 | 2025-11-26 |
PPARα Activation-Mediated Testosterone Reduction as the Key Adverse Outcome Pathway for Cd-Induced Male Infertility: A Novel Integrated Approach
2025-Nov-25, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c09190
PMID:41231235
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研究论文 | 本研究通过整合多种方法识别了镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 首次系统构建了镉诱导男性不育的AOP网络，并确定PPARα激活介导的睾酮减少是关键通路 | NA | 识别镉诱导男性不育的关键不良结局通路 | 镉暴露的男性不育机制 | 环境毒理学 | 男性不育 | 网络毒理学,单细胞测序,NHANES研究,动物实验,分子建模 | NA | 基因表达数据,流行病学数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 528 | 2025-11-26 |
Decoding crops one cell at a time: from cell atlases to single-cell genetics
2025-Nov-25, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf516
PMID:41287580
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在作物研究中的应用及其潜力 | 将哺乳动物细胞单细胞筛选的经验应用于植物研究，提出整合单细胞技术与性状相关位点的策略 | 存在技术和生物学障碍需要克服 | 加速作物改良关键遗传变异的鉴定 | 作物细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 529 | 2025-11-26 |
Spanve: A Statistical Method for Downstream-friendly Spatially Variable Genes in Large-scale Data
2025-Nov-24, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf111
PMID:41284930
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研究论文 | 开发了一种用于大规模空间转录组数据中空间可变基因检测的非参数统计方法 | 通过量化每个点或细胞与其局部邻居之间的表达差异来识别空间依赖性，无需分布假设，假阳性较少 | NA | 改进空间转录组学分析中空间可变基因的识别准确性 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 非参数统计方法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 530 | 2025-11-26 |
Selective AMPKβ1 activation induces fetal hemoglobin in human erythroid cells and sickle cell mice via the noncanonical NRF2 pathway
2025-Nov-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx1144
PMID:41259521
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研究论文 | 本研究通过选择性激活AMPKβ1诱导镰状细胞病中的胎儿血红蛋白表达 | 首次发现AMPKβ1亚型在红细胞谱系中占主导地位，并通过非经典NRF2通路诱导胎儿血红蛋白 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，尚未进行人体临床试验 | 开发通过AMPKβ1激活诱导胎儿血红蛋白的新型治疗方法 | 镰状细胞病患者来源的红细胞和Townes镰状细胞病小鼠模型 | 分子生物学 | 镰状细胞病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 镰状细胞病患者来源的红细胞和Townes小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 531 | 2025-11-26 |
Single-cell sequencing reveals a senescent immune landscape in bone marrow lesions inducing articular cartilage damage in osteoarthritis
2025-Nov-21, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00467-4
PMID:41272390
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示骨关节炎中骨髓病变区域存在衰老免疫景观，并通过细胞间通讯促进关节软骨损伤 | 首次在单细胞水平揭示骨髓病变区域的免疫细胞衰老特征及其通过TNF信号介导的骨髓-软骨串扰机制 | 研究样本量有限，机制验证主要在OA小鼠模型中进行 | 探索骨关节炎中骨髓病变诱导关节软骨损伤的细胞分子机制 | 骨髓组织和关节软骨组织 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非BML区域和BML区域的骨髓组织，完整和损伤区域的关节软骨组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 532 | 2025-11-26 |
Piscis: A loss estimator of the F1 score enables accurate spot detection in fluorescence microscopy images via deep learning
2025-Nov-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101448
PMID:41265398
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研究论文 | 提出一种名为Piscis的深度学习算法，用于荧光显微镜图像中的斑点检测 | 开发了SmoothF1损失函数，可近似F1分数并直接惩罚假阳性和假阴性，同时保持可微分性用于深度学习训练 | NA | 开发自动化的斑点检测算法以改进空间转录组学图像分析 | 荧光显微镜图像中的RNA转录本斑点 | 计算机视觉 | NA | RNA荧光原位杂交 | 深度学习 | 图像 | 358张手动标注的实验RNA FISH图像和240张合成图像 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 533 | 2025-11-26 |
[Neural regulation mechanism in bone regeneration]
2025-Nov-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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综述 | 本文系统阐述了神经系统在骨再生过程中的调控机制，重点关注神经肽在骨组织中的核心作用 | 提出'神经-骨骼'调控轴概念，系统梳理交感与副交感神经系统在骨再生中的相反调控作用 | 神经肽之间的相互作用网络尚未完全阐明，需要更先进的模型和技术进行深入研究 | 探讨骨再生过程中的神经调控机制 | 骨骼系统与神经系统的相互作用，特别是神经肽在骨再生中的功能 | 骨再生医学 | 退行性骨病，创伤性骨损伤 | 单细胞测序，三维生物打印骨模型，类器官技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2025-11-26 |
Depletion of microenvironmental syndecan-2 impairs hematopoietic stem cell self-renewal and cytokine responses
2025-Nov-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.07.687077
PMID:41279398
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研究论文 | 本研究探讨骨髓微环境中syndecan-2对造血干细胞自我更新能力的调控作用 | 首次揭示间充质基质细胞表达的syndecan-2通过细胞外在机制支持造血干细胞自我更新 | 研究主要聚焦小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明骨髓微环境表达的syndecan-2在造血和造血干细胞自我更新中的功能 | 小鼠骨髓造血干细胞、间充质基质细胞和内皮细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序、竞争性移植实验、共培养实验 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、转录组数据 | 转基因小鼠模型和细胞系共培养系统 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2025-11-26 |
Epigenetic repression of hepatocyte FoxO1 disrupts local immune homeostasis and promotes liver inflammation
2025-Nov-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001590
PMID:41190981
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞FoxO1通过JMJD1C维持的表观遗传调控在肝脏免疫稳态中的关键作用 | 首次发现JMJD1C通过调控Foxo1启动子区H3K9二甲基化抑制其转录，从而破坏局部免疫稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明肝细胞FoxO1在肝脏免疫稳态和炎症中的作用机制 | 人类肝脏样本、肝细胞特异性Foxo1敲除小鼠、酒精性肝炎和血吸虫病肝病小鼠模型 | 分子生物学 | 肝脏炎症疾病 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag分析、转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 多种肝脏疾病患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 536 | 2025-11-26 |
Distinct Sarcoma Microenvironments Predict Benefit from Addition of Pembrolizumab to Preoperative Radiotherapy and Surgery in SU2C-SARC032
2025-Nov-04, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.11.01.25339299
PMID:41282894
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研究论文 | 本研究通过多组学分析识别了两种不同的肉瘤微环境，揭示了帕博利珠单抗联合术前放疗对不同微环境亚型患者的疗效机制 | 首次构建了UPS和LPS的单细胞RNA-seq图谱，发现两种相反的肿瘤微环境均能从帕博利珠单抗治疗中获益，并阐明了不同的免疫应答机制 | 研究样本量有限，仅针对特定肉瘤亚型，需要更大规模的验证研究 | 精确识别能从帕博利珠单抗联合术前放疗中获益的肉瘤患者 | III期未分化多形性肉瘤和去分化/多形性脂肪肉瘤患者 | 数字病理学 | 肉瘤 | bulk RNA-seq, 流式细胞术, 飞行时间细胞术, 单细胞RNA-seq, 数字细胞术 | NA | RNA测序数据, 细胞计数数据 | 65,786个细胞来自UPS和LPS肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 537 | 2025-11-26 |
Endocrine disruptors and male infertility: multi-omics identification of key genes in non-obstructive azoospermia
2025-Nov, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03664-6
PMID:40956397
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研究论文 | 通过多组学方法识别环境内分泌干扰物与男性非梗阻性无精子症相关的关键基因 | 整合转录组学、毒理基因组学和孟德尔随机化分析，首次系统识别EDC相关基因在NOA中的因果作用 | 研究主要基于公共数据库和生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索环境内分泌干扰物导致男性不育的基因机制 | 非梗阻性无精子症患者及相关基因 | 生物信息学 | 男性不育症 | 转录组分析,孟德尔随机化,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,基因组数据 | GEO数据库数据集及单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组分析 | NA | NA |
| 538 | 2025-11-26 |
Monod: model-based discovery and integration through fitting stochastic transcriptional dynamics to single-cell sequencing data
2025-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02832-x
PMID:41203866
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研究论文 | 提出一种基于物理模型的方法Monod，通过拟合随机转录动力学来分析单细胞RNA测序数据 | 利用单细胞数据中的新生和成熟RNA计数，在生物物理转录模型下进行有意义的整合，揭示传统方法无法识别的转录调控 | NA | 开发新方法以区分单细胞RNA测序数据的生物学和技术层面，同时揭示基础调控过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机转录动力学模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 539 | 2025-11-26 |
Comment on "Melanoma microsatellites exhibit a metastatic signature by spatial transcriptomics and overexpress mediators of immune evasion"
2025-Nov, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04305-0
PMID:41091168
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 540 | 2025-11-25 |
Azvudine remodels the local immunosuppressive microenvironment and exhibits sustained anti-tumor effects in combination with anti-PD-1 therapies
2025-Nov-24, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-025-1164-0
PMID:41284146
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研究论文 | 本研究探讨阿兹夫定单用或联合抗PD-1疗法对肿瘤微环境的免疫调节作用及抗肿瘤效果 | 首次揭示阿兹夫定通过诱导免疫原性细胞死亡和重塑免疫抑制微环境增强抗PD-1疗法的协同抗肿瘤作用 | 研究基于小鼠同系肿瘤模型，需进一步临床验证在不同肿瘤类型中的转化潜力 | 评估阿兹夫定在肿瘤免疫治疗中的免疫调节机制和联合治疗潜力 | 免疫健全小鼠建立的同系肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫学检测 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 免疫健全小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |