单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 925 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-11-30 |
Monocyte-derived cells promote transient insult-induced brain injury by enhancing CD8+ T cell response
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116528
PMID:41205172
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现单核来源细胞通过增强CD8+ T细胞反应促进短暂损伤诱导的脑损伤 | 首次揭示单核来源的cDC2样细胞在脑损伤中通过CD28-CD80/CD86共刺激信号调控CD8+ T细胞反应的新机制 | 研究主要基于辐射诱导脑损伤模型，其他类型脑损伤的普适性需要进一步验证 | 探究短暂损伤诱导脑损伤中免疫细胞的调控机制 | 辐射诱导脑损伤患者和实验性脑卒中模型 | 单细胞测序分析 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 辐射诱导脑损伤患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 462 | 2025-11-30 |
Multi-omics analyses reveal DjTcf4 critical for proper timing of differentiation in planarian regeneration
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116551
PMID:41231672
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示DjTcf4在涡虫再生过程中对细胞分化时机的关键调控作用 | 构建了首个涡虫基因组重注释、3D空间转录组、单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序的多组学图谱，发现DjTcf4在再生过程中具有非经典功能 | 研究局限于日本三角涡虫模型，未在其他再生生物中进行验证 | 阐明涡虫再生过程中芽基细胞组成和转录景观的动态变化机制 | 日本三角涡虫(Dugesia japonica)的再生过程 | 发育生物学,再生医学 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,空间转录组,基因组重注释 | NA | 基因组数据,转录组数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,空间转录组 | NA | NA |
| 463 | 2025-11-30 |
Intermediate filaments promote glioblastoma cell invasion by controlling nuclear deformations and mechanosensitive expression of MMP14
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116553
PMID:41241939
|
研究论文 | 本研究揭示中间丝通过调控核变形和机械敏感性MMP14表达促进胶质母细胞瘤细胞侵袭的机制 | 发现中间丝在降低细胞变形性的同时反而促进3D侵袭，并阐明其通过缓冲核变形和上调MMP14表达的机械敏感机制 | NA | 探究中间丝在胶质母细胞瘤细胞侵袭中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 464 | 2025-11-30 |
Epigenetic and transcriptional programming of murine eosinophils in the esophagus
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65440-5
PMID:41290588
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序、表观基因组图谱和流式细胞术分析小鼠食管嗜酸性粒细胞在过敏性炎症中的表观遗传和转录编程 | 首次揭示食管嗜酸性粒细胞的组织特异性是通过局部环境信号诱导全基因组表观遗传重编程实现的，并建立了小鼠组织嗜酸性粒细胞的公开表观遗传数据库 | 研究主要基于小鼠模型，虽然显示与人类存在保守性，但需要进一步的人类样本验证 | 探究食管嗜酸性粒细胞在过敏性炎症中的表观遗传和转录调控机制 | 小鼠食管嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 过敏性疾病 | 单细胞测序,表观基因组图谱,流式细胞术,基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,表观基因组学 | NA | NA |
| 465 | 2025-11-30 |
The AML cellular state space unveils NPM1 immune evasion subtypes with distinct clinical outcomes
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66546-6
PMID:41290664
|
研究论文 | 通过基因组和转录组分析揭示急性髓系白血病的细胞状态空间，发现NPM1突变亚型具有不同的免疫逃逸机制和临床结局 | 首次在单细胞水平将NPM1突变AML分为两个具有不同免疫特征和临床预后的亚型 | 样本量相对有限(120例AML)，需要更大规模验证 | 解析急性髓系白血病的细胞异质性并完善其分类系统 | 120例急性髓系白血病患者样本 | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,基因组分析,转录组分析 | 聚类分析 | 单细胞RNA测序数据,基因组数据,转录组数据 | 120例AML患者，包含超过90,000个未成熟AML细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 466 | 2025-11-30 |
Pharmacological induction of acetyl-CoA carboxylase 1 autophagic degradation attenuates lipid accumulation and cholangiocarcinoma progression
2025-Nov-25, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03564-8
PMID:41291880
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高通量筛选发现Withaferin A可通过诱导ACC1自噬降解抑制脂质积累和胆管癌进展 | 首次揭示Withaferin A通过抑制ACC1活性并诱导其自噬降解来阻断脂质合成的分子机制 | 临床前研究阶段，尚未进行人体临床试验 | 探索靶向脂质代谢的胆管癌治疗新策略 | 胆管癌细胞系和动物模型 | 癌症代谢研究 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序, 高通量筛选, 液相色谱-串联质谱 | NA | 基因表达数据, 代谢组学数据 | 994种生物活性化合物筛选 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 467 | 2025-11-30 |
Biphasic inflammation control by fibroblasts enables spinal cord regeneration in zebrafish
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116469
PMID:41134665
|
研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼成纤维细胞通过双相炎症控制促进脊髓再生的机制 | 首次发现成纤维细胞具有诱导和消退炎症的双重功能，并鉴定出瞬时cthrc1a成纤维细胞状态 | 研究仅限于斑马鱼模型，未在哺乳动物中验证 | 探究中枢神经系统再生过程中成纤维细胞与免疫细胞的相互作用机制 | 斑马鱼脊髓损伤模型 | 发育生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 468 | 2025-11-30 |
Oncogenic Ras activation in permissive somatic cells triggers rapid-onset phenotypic plasticity and elicits a tumor-promoting neutrophil response
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116478
PMID:41138187
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型揭示了致癌Ras激活在24小时内诱导表型可塑性并触发促肿瘤中性粒细胞反应的机制 | 首次在单细胞水平实时观察致癌Ras激活后24小时内的细胞内在反应和先天免疫响应，揭示了表型可塑性与促肿瘤炎症之间的早期关联 | 研究基于斑马鱼模型，在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 探究致癌突变如何触发表型可塑性和肿瘤促进性炎症的早期机制 | 斑马鱼模型中的基底角质形成细胞和中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序, 活体实时成像 | 斑马鱼HRAS介导的皮肤肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据, 活体成像数据 | 斑马鱼模型中的基底角质形成细胞亚群 | NA | 单细胞RNA-seq, 活体成像 | NA | NA |
| 469 | 2025-11-30 |
Exploring the role of β2-microglobulin in the relationship between physical activity and DNAm-predicted PhenoAge: Evidence from a population-based and mice single-cell RNA-sequencing study
2025-Nov-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.047
PMID:41285310
|
研究论文 | 本研究通过人群数据和单细胞测序探索β2-微球蛋白在体力活动与表观遗传年龄关系中的中介作用 | 首次结合人群流行病学研究和动物单细胞测序揭示β2M在体力活动延缓衰老中的分子机制 | 观察性研究设计无法确定因果关系，样本量相对有限 | 探究体力活动通过β2M影响表观遗传衰老的分子机制 | 936名美国人群和运动干预的小鼠 | 表观遗传学 | 衰老相关疾病 | DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序 | 加权多元回归, 中介效应模型 | 血液样本, 表观遗传数据, 单细胞转录组数据 | 936名人群参与者+小鼠外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 470 | 2025-11-30 |
Applications of Genome-wide Screening of CRISPR/Cas9 Knockout Library in Identifying Novel Molecular Targets for Xenobiotics
2025-Nov-21, Environment & health (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/envhealth.5c00072
PMID:41306301
|
综述 | 本文综述了全基因组CRISPR/Cas9敲除库筛选在识别外源性物质新型分子靶点中的应用 | 系统总结了CRISPR/Cas9文库筛选技术在外源性致病因子机制研究中的创新应用，包括与单细胞测序和类器官技术的结合 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 探讨全基因组CRISPR/Cas9敲除库筛选在识别外源性物质分子靶点中的应用价值 | 外源性致病因子（环境致癌物、病原体、化学污染物） | 基因组编辑技术 | 肿瘤、感染性疾病、中毒性疾病 | CRISPR/Cas9基因组编辑、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 全基因组筛选、单细胞测序 | NA | NA |
| 471 | 2025-11-30 |
TGFB2/IGFBP5 activated by transcription factors STAT2 and SMAD3 initiate granulosa cell degeneration and cause follicular atresia in chickens
2025-Nov, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105747
PMID:40902342
|
研究论文 | 本研究通过鉴定TGFB2和IGFBP5的启动子区域，结合DNA pull-down和单细胞RNA测序数据分析，揭示了STAT2和SMAD3转录因子在鸡卵泡闭锁过程中调控颗粒细胞退化的分子机制 | 首次发现STAT2是TGFB2和IGFBP5的共同转录因子，并揭示了JAK/STAT与TGF-β/SMAD信号通路在卵泡闭锁中的协同调控作用 | NA | 阐明鸡卵泡闭锁过程中颗粒细胞退化的分子调控机制 | 鸡颗粒细胞和卵泡闭锁过程 | 分子生物学 | 生殖系统疾病 | DNA pull-down, 质谱分析, 单细胞RNA测序, SCENIC分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 472 | 2025-11-30 |
Construction and differential analysis of testicular atlas between 10-week-old and 23-week-old ducks using single-cell RNA sequencing
2025-Nov, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105715
PMID:40884870
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了10周龄和23周龄鸭睾丸细胞图谱并进行差异分析 | 首次建立了禽类精子发生的高分辨率细胞图谱，发现了新的分子标记物和调控网络 | 仅研究了两个发育阶段，未涵盖完整的发育过程 | 探索鸭睾丸发育和精子发生的分子机制 | 10周龄和23周龄鸭睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 54,702个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 473 | 2025-11-29 |
Integrated Aerobic Exercise and Multisensory Environment Training for Age-related Cognitive Decline via Hippocampal-prefrontal Neural Circuit Modulation
2025-Nov-28, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05302-9
PMID:41313574
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合有氧运动和多感官环境训练的新型干预方法，通过调节海马-前额叶神经回路改善年龄相关认知衰退 | 首次将有氧运动与多感官环境训练相结合，并揭示了海马-前额叶神经回路在此过程中的关键作用机制 | 研究仅使用老年小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探索联合训练改善年龄相关认知衰退的神经机制 | 老年小鼠 | 神经科学 | 老年性疾病 | 神经回路追踪、化学遗传学、单细胞测序 | 动物模型 | 神经活动数据、基因表达数据 | 老年小鼠群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 474 | 2025-11-29 |
Gut microbiota L-ornithine promotes resistance to obesity through metabolites mediated immunosuppressive macrophages
2025-Nov-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05882-8
PMID:41291317
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物L-鸟氨酸通过调控巨噬细胞功能抵抗肥胖的新机制 | 首次发现L-鸟氨酸通过下游代谢物精胺和亚精胺调控巨噬细胞向免疫抑制表型极化，从而抵抗肥胖 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肠道微生物代谢物在肥胖发病机制中的保护作用 | 小鼠模型和肥胖人群 | 代谢疾病研究 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和肥胖人群样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 475 | 2025-11-29 |
Impact of single-cell cell cycle regulation of intercellular communication on the prognosis of hepatocellular carcinoma in the tumor microenvironment
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01963-x
PMID:41286375
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯对肿瘤进展和患者预后的影响 | 首次在单细胞水平系统分析肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯网络的相互作用及其临床意义 | 样本量相对有限，仅分析了两个单细胞RNA测序数据集 | 探究肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯对患者预后的影响机制 | 肝癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞转录组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NMF聚类，CellChat，Monocle，SCENIC | 单细胞RNA测序数据 | 24,637个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 476 | 2025-11-29 |
Decoding colorectal cancer chemotherapy and immunotherapy resistance: revealing the role of NOL3 using single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01913-7
PMID:41286470
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习揭示了NOL3在结直肠癌化疗和免疫治疗耐药中的关键作用 | 首次系统探索缺氧与18种程序性细胞死亡特征之间的关联，并识别NOL3作为结直肠癌预后关键标志物 | 研究基于回顾性多中心队列，需要进一步的前瞻性验证 | 探索结直肠癌化疗和免疫治疗耐药的分子机制 | 结直肠癌患者和癌细胞系 | 机器学习,数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,机器学习,MTT测定,Western blot | XGBoost,RR,RF | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 4个多中心队列共1294例样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 477 | 2025-11-29 |
Lineage plasticity and signal dysregulation define the cellular trajectory of osteoarthritis progression
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01947-x
PMID:41286526
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索骨关节炎进展过程中细胞谱系的可塑性变化及其与信号通路失调的关系 | 首次系统揭示骨关节炎中PreFC细胞向FC和preHTC细胞转化的轨迹，并鉴定HIF1A和ANGPTL4为关键分子调控因子 | NA | 探索骨关节炎进展的细胞轨迹和分子机制，为精准治疗提供新靶点 | 骨关节炎患者的关节软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，KEGG和GO富集分析，伪时间轨迹分析，体外实验验证 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 478 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics implicate a prognostic function of tertiary lymphoid structures in gastric cancer
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65421-8
PMID:41290589
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析揭示三级淋巴结构在胃癌中的预后功能 | 首次整合单细胞和空间转录组学分析不同空间定位模式的三级淋巴结构，发现iTLS富集肿瘤中特定免疫细胞亚群，并揭示HEV通过VCAM1/ICAM1-CXCL13-ACKR1通路促进TLS形成的新机制 | 样本量相对有限（30例胃癌标本），需要在更大队列中验证发现 | 探究三级淋巴结构在胃癌中的预后功能和免疫治疗预测价值 | 30例按TLS空间定位模式分层的胃癌标本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 30例胃癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 479 | 2025-11-29 |
Machine learning driven multiomics analysis identifies disulfidptosis associated molecular subtypes in ovarian cancer
2025-Nov-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26157-z
PMID:41290867
|
研究论文 | 本研究通过机器学习驱动的多组学分析，在卵巢癌中鉴定出与双硫死亡相关的分子亚型 | 首次将双硫死亡机制纳入卵巢癌分类系统，并构建了10基因预测模型 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 建立卵巢癌双硫死亡相关分子亚型分类系统 | 卵巢癌患者样本 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞测序，空间转录组学，免疫组化 | CNN+GRU, LASSO回归，随机森林 | 基因表达数据，单细胞数据，空间转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 480 | 2025-11-29 |
Immune cell-resolved transcriptomics provides insights into the basis for variations of fish genetic resistance to viral disease
2025-Nov-25, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02452-z
PMID:41291655
|
研究论文 | 通过整合批量组织RNA-seq和单细胞RNA-seq技术，揭示虹鳟鱼对病毒性出血性败血症病毒遗传抗性的免疫细胞特异性转录组基础 | 首次在鱼类中结合批量组织和单细胞分辨率转录组学，解析不同遗传抗性品系免疫细胞对病毒感染的异质性响应 | 研究仅针对两个极端抗性品系，可能无法完全代表自然种群中的遗传多样性 | 探究鱼类对病毒感染的遗传抗性机制 | 虹鳟鱼（抗性和易感性等基因系） | 转录组学 | 病毒性出血性败血症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 两个虹鳟鱼等基因系的前肾组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |