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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-11-27 |
Dominant intragraft plasma cells targeting bilirubin implicate local heme catabolism in human cardiac allograft vasculopathy
2025-Nov-25, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194138
PMID:41289018
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现心脏移植物血管病变中浸润的浆细胞主要靶向胆红素,揭示了局部血红素代谢在疾病发展中的作用 | 首次发现心脏移植物血管病变中优势浆细胞克隆特异性靶向胆红素,揭示了局部血红素代谢产物作为自身抗原的新机制 | 样本量有限,需要更大规模研究验证;机制研究尚未完全阐明胆红素特异性抗体在疾病发生中的具体作用 | 探究心脏移植物血管病变中移植物浸润浆细胞的抗原特异性及其在疾病发病机制中的作用 | 心脏移植患者的移植物组织和外周血浆细胞 | 单细胞测序 | 心脏移植物血管病变 | 单细胞RNA测序,免疫球蛋白基因分析,重组单克隆抗体生成,组织化学分析 | NA | 单细胞转录组数据,免疫球蛋白序列数据,组织影像数据 | 从移植物浆细胞克隆生成37个重组单克隆抗体,从外周血浆细胞生成24个对照抗体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 442 | 2025-11-27 |
Function and Development of Deep-sea Mussel Bacteriocytes Revealed by SnRNA-seq and Spatial Transcriptomics
2025-Nov-25, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf109
PMID:41289084
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示深海贻贝细菌细胞的功能与发育机制 | 首次结合原位去定植实验、单核转录组和空间转录组技术系统解析深海共生体系中细菌细胞的功能与发育轨迹 | NA | 探究深海贻贝与化学合成微生物共生体系中细菌细胞的功能特性和发育过程 | 深海贻贝的细菌细胞(宿主细胞内共生菌) | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 原位去定植实验, 多组学分析, 3D重建 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 443 | 2025-11-27 |
scDBImpute: Dual-branch Imputation for Single-cell RNA-seq Data Dropouts
2025-Nov-25, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3636928
PMID:41289139
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据中丢失值填补的双分支插补方法 | 结合线性和非线性关联进行丢失值填补,不同于先前假设预定义结构的方法 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的丢失值问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双分支模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 444 | 2025-11-27 |
Construction of the cancer cell continuum reveals hybrid EMT state driving lung adenocarcinoma aggression
2025-Nov-25, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00991-9
PMID:41290994
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和细胞轨迹推断技术,重建肺腺癌中的上皮-间质转化(EMT)谱系,识别关键调控因子并开发预后风险分层模型 | 首次在肺腺癌中系统构建EMT连续谱,发现混合E/M状态具有最高转移潜能,并识别关键转录因子调控网络 | 样本量相对有限(10例患者),需要更大队列验证发现 | 阐明肺腺癌中EMT连续谱的调控机制及其与肿瘤侵袭性的关系 | 肺腺癌患者的恶性上皮细胞 | 单细胞基因组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,细胞轨迹推断 | 风险分层模型,调控网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | 10例肺腺癌患者的16,310个恶性上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 445 | 2025-11-27 |
Modelling the effects of human SUR1 R1420H variation on insulin secretory function using isogenic iPSC-derived pancreatic islets
2025-Nov-25, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06605-1
PMID:41291239
|
研究论文 | 利用等基因iPSC衍生的胰腺胰岛模型研究人类SUR1 R1420H变异对胰岛素分泌功能的影响 | 首次建立等基因iPSC衍生的胰腺胰岛平台,系统研究SUR1 R1420H变异在不同发育阶段对胰岛素分泌的时序性影响 | 研究仅基于两个亲本印第安美洲iPSC系,样本量有限 | 探究SUR1 R1420H变异是否导致KATP通道功能丧失及其对胰岛素分泌的发育阶段特异性影响 | 等基因iPSC衍生的胰腺胰岛(SC-islets) | 干细胞生物学 | 2型糖尿病 | CRISPR-Cas9基因编辑,单细胞RNA测序 | iPSC衍生胰腺胰岛模型 | 基因表达数据,胰岛素分泌数据 | 两个亲本iPSC系(IS1和IS2)衍生的三种基因型(1420RR,1420RH,1420HH)SC-islets | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 446 | 2025-11-27 |
Mapping cellular interactions and communication landscapes in cervical cancer via single-cell transcriptomics
2025-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04040-7
PMID:41291352
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学方法系统解析宫颈癌肿瘤微环境中的细胞多样性及细胞间通讯网络 | 首次在宫颈癌中系统绘制细胞间通讯图谱并识别MIF通路在癌症相关成纤维细胞中的关键作用 | 样本量相对有限(20例患者),且主要基于公共数据库的再分析 | 阐明宫颈癌肿瘤微环境中的细胞多样性、细胞间信号网络及分子机制 | 宫颈癌组织及癌旁正常组织 | 单细胞转录组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, ELISA | UMAP, t-SNE, 时序轨迹建模 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 20例患者的配对肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2025-11-27 |
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01379-z
PMID:41291434
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据识别骨关节炎相关基因并筛选潜在治疗药物 | 结合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据,通过多算法整合分析鉴定OA关键基因,并利用斑马鱼模型验证药物作用机制 | 研究样本来源未明确说明,药物预测需进一步临床验证 | 发现骨关节炎治疗新靶点和潜在药物 | 骨关节炎相关基因和药物靶点 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | 随机森林, 高维加权基因共表达网络分析, 蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 448 | 2025-11-27 |
Non-invasive assessment of activated renal macrophages by imaging of colony-stimulating factor 1 receptor in mouse model with ischemic acute kidney injury
2025-Nov-25, Journal of inflammation (London, England)
DOI:10.1186/s12950-025-00482-6
PMID:41291764
|
研究论文 | 本研究通过CSF1R-PET成像技术无创评估小鼠缺血性急性肾损伤模型中活化的肾脏巨噬细胞 | 首次证明11C-CPPC-PET可作为临床可用工具无创检测活化的肾脏巨噬细胞,主要针对M2表型 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 开发无创评估肾脏炎症的方法 | 小鼠缺血性急性肾损伤模型和肾脏/肾周脓肿模型 | 医学影像 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,PET成像,体外放射自显影,免疫组织化学分析 | NA | 基因表达数据,影像数据,组织学数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,PET成像 | NA | NA |
| 449 | 2025-11-27 |
Cigarette smoke-mediated YTHDC2 suppression drives macrophage senescence and a tumor-promoting microenvironment in lung cancer
2025-Nov-25, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70068
PMID:41292214
|
研究论文 | 本研究揭示了香烟烟雾通过抑制YTHDC2表达诱导巨噬细胞衰老,从而促进肺癌肿瘤微环境形成的机制 | 首次发现YTHDC2在香烟烟雾诱导的巨噬细胞衰老和肿瘤促进微环境形成中的关键调控作用 | NA | 探究香烟烟雾对m6A阅读器YTHDC2的影响及其在肺癌免疫微环境重塑中的作用 | 肺癌组织、巨噬细胞、香烟烟雾暴露的肺癌模型 | 单细胞测序分析 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 吸烟者与非吸烟者的肺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 450 | 2025-11-27 |
CD8+ T cell depletion promotes human Tph/Tfh cell proliferation and Sjögren syndrome-like symptoms in PBMC-based humanized mice
2025-Nov-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191700
PMID:41277554
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过CD8+ T细胞耗竭促进人Tph/Tfh和B细胞增殖的方法,并建立了干燥综合征样症状的人源化小鼠模型 | 首次发现CD8+ T细胞耗竭可促进人Tph/Tfh细胞在体增殖,并建立了可模拟干燥综合征症状的PBMC人源化小鼠模型 | 研究基于人源化小鼠模型,与真实人体环境存在差异 | 研究人Tph/Tfh细胞分化机制及干燥综合征发病机理 | 人外周血单个核细胞、人源化小鼠模型、Tph/Tfh细胞、B细胞、CD8+ T细胞 | 免疫学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 多色流式细胞术 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 人PBMC移植的免疫缺陷小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 451 | 2025-11-27 |
Dicer is essential for proper maturation, composition, and function in the postnatal retina
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113794
PMID:41244583
|
研究论文 | 本研究探讨了Dicer/miRNAs在出生后视网膜发育中的关键作用 | 首次揭示了Dicer在出生后视网膜祖细胞/前体细胞中对视网膜成熟和功能的必要性 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 评估Dicer缺失对出生后视网膜发育和功能的影响 | 小鼠视网膜祖细胞/前体细胞和成年视网膜 | 发育生物学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序,光学相干断层扫描,视网膜电图,组织学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据,图像数据,电生理数据 | 一周龄和成年小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 452 | 2025-11-27 |
Fibrinogen triggers perivascular fibroblast activation in a mouse model of cortical ischemic stroke
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113834
PMID:41280671
|
研究论文 | 本研究揭示了纤维蛋白原是皮质缺血性中风小鼠模型中血管周围成纤维细胞活化的关键触发因子 | 首次证明血液来源的纤维蛋白原通过β1整合素信号通路诱导血管周围成纤维细胞活化,并揭示其通过髓系细胞间接促进纤维化瘢痕形成的机制 | 研究仅限于小鼠光血栓形成模型,人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究缺血性中风后纤维化瘢痕形成的分子机制 | 小鼠皮质缺血性中风模型中的血管周围成纤维细胞 | 神经科学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序,遗传学方法,药理学干预 | NA | 基因表达数据,细胞行为观察数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 453 | 2025-11-27 |
Multi-cellular phenotypic dynamics during the progression of an immunocompetent breast cancer model
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113808
PMID:41280683
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析免疫活性乳腺癌模型中肿瘤微环境的多细胞表型动态变化 | 首次在小鼠乳腺癌同种移植模型中系统描绘肿瘤微环境的多细胞表型时间动态模式 | 使用小鼠模型而非人类样本,可能无法完全反映人类乳腺癌的复杂性 | 揭示乳腺癌肿瘤微环境中细胞组成和表型的时间动态变化规律 | 小鼠乳腺癌同种移植模型中的肿瘤微环境细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同时间点的小鼠乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 454 | 2025-11-27 |
Innovative insights and future research directions in gastric cancer through single-cell RNA sequencing
2025-Nov-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i11.103808
PMID:41281499
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序分析胃癌,解读研究发现并提出未来研究方向 | 提出整合多组学方法、空间转录组学、人工智能临床应用和新型免疫治疗策略等创新研究方向 | NA | 改善胃癌治疗结果,推动个性化医疗和早期检测 | 胃癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 455 | 2025-11-27 |
Genetic Convergence Analysis of CRISPR Perturbations Deciphers Gene Functional Similarity
2025-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.13.688060
PMID:41292726
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研究论文 | 开发了一种名为XConTest的统计方法来量化CRISPR扰动之间的功能相似性 | 提出了首个交叉验证的统计检验方法来解决遗传趋同问题,相比现有启发式方法更具统计严谨性 | 方法依赖于单细胞RNA测序数据的质量,且假设扰动对细胞表达谱的影响是正交的 | 开发统计方法来评估CRISPR扰动之间的功能相似性 | CRISPR基因扰动 | 生物信息学 | 自闭症,免疫疾病 | CRISPR筛选,单细胞RNA测序 | 统计检验 | 单细胞基因表达数据 | 两个研究的数据集(具体样本数未提供) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 456 | 2025-11-27 |
S3R: Modeling spatially varying associations with Spatially Smooth Sparse Regression
2025-Nov-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.06.674629
PMID:40964272
|
研究论文 | 提出一种名为S3R的空间平滑稀疏回归框架,用于建模空间转录组数据中分子和细胞特征之间的空间变化关联 | 结合结构化稀疏性和最小生成树引导的平滑惩罚,能够在邻域内保持系数连贯性同时允许锐利边界 | NA | 开发能够处理空间转录组数据中噪声、共线性、细胞混合和高维预测因子的统计模型 | 空间转录组数据中的分子和细胞特征关联 | 空间转录组学 | 乳腺癌,胰腺导管腺癌,皮肤感染,神经退行性疾病 | 空间转录组学 | 稀疏回归 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Xenium | Visium空间转录组平台, Xenium原位分析平台 |
| 457 | 2025-11-27 |
Brain-wide Genome Editing via STEP-RNPs for Treatment of Angelman Syndrome
2025-Nov-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.13.684643
PMID:41292800
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研究论文 | 开发了一种基于化学修饰的非病毒基因编辑方法STEP-RNPs,用于治疗Angelman综合征 | 首次实现基于非病毒、非纳米颗粒的化学修饰方法,在全脑范围内高效编辑神经元基因组 | 目前仅在动物模型和体外人类神经元中验证,尚未进行人体临床试验 | 开发治疗神经遗传疾病的脑部基因编辑技术 | 小鼠模型、人类神经元、AS患者来源的iPSCs分化的皮质脑类器官 | 基因编辑 | Angelman综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类神经元样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 458 | 2025-11-27 |
YAP1 Depletion Enhances TAZ and its Complexation with TEAD4 and AP-1 Heterodimer C-JUN/FOSB to Promote Gastric Cancer Progression and Metastases
2025-Nov-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.13.683933
PMID:41292957
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了YAP1缺失通过增强TAZ与TEAD4/AP-1异源二聚体的复合物形成促进胃癌腹膜转移的机制 | 首次在胃癌腹膜转移中发现YAP1抑制会代偿性上调TAZ,并揭示TAZ与TEAD4/AP-1异源二聚体形成新型转录复合物的机制 | 研究主要聚焦于胃癌腹膜转移,其他转移类型的适用性需进一步验证 | 评估YAP1和TAZ双重靶向在胃癌腹膜转移治疗中的协同抗肿瘤效果 | 胃癌腹膜转移组织、患者来源异种移植模型和KPLuc2同系模型 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 共免疫荧光染色, 基因敲除, 反义寡核苷酸抑制, 共免疫沉淀, 荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 体内外功能验证数据 | 胃癌腹膜转移组织样本和多个体内模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2025-11-27 |
A vascular origin for pulmonary smooth muscle in the avian lung
2025-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.07.13.499952
PMID:41292748
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研究论文 | 本研究通过比较单细胞测序和成像技术揭示了鸟类肺平滑肌的血管起源 | 首次发现鸟类肺平滑肌来源于血管平滑肌而非内脏平滑肌,并鉴定出关键调控因子 | 研究仅针对鸡胚胎,未验证其他鸟类物种 | 探究鸟类肺平滑肌发育延迟的发育基础 | 小鼠、安乐蜥和鸡胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 成像技术 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 图像数据 | 三种物种的胚胎样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | NA |
| 460 | 2025-11-27 |
Enrichment of a CD4 - CD8 - NK-like cytotoxic Vδ1/3 T cell subset in tuberculosis disease
2025-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.12.688134
PMID:41292844
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了结核病患者外周血中CD4-CD8-γδ T细胞的独特特征 | 首次发现结核病中富集的具有NK样细胞毒性的Vδ1/3 T细胞亚群及其独特的Vδ3 TCR基因使用模式 | 样本量相对有限,且主要关注外周血中的γδ T细胞 | 研究结核病患者与健康个体γδ T细胞的数量和质量差异 | 健康未致敏个体、健康致敏个体和结核病治疗前后患者的外周血CD4-CD8-γδ T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个队列的健康个体和结核病患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |