单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202511-202511] [清除筛选条件]
当前共找到 1144 篇文献,本页显示第 401 - 420 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
401 2025-11-28
Dose-dependent effects of wheat germ oil and vitamin E on apoptosis and gene expression in breast and cervical cancer cell lines with single-cell RNA-seq profiling
2025-Nov-24, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨小麦胚芽油和维生素E对乳腺癌和宫颈癌细胞凋亡及基因表达的剂量依赖性影响 首次结合单细胞RNA测序技术系统评估小麦胚芽油和维生素E在乳腺癌和宫颈癌细胞中的剂量依赖性抗肿瘤效应 仅使用MCF-7和HeLa两种细胞系,缺乏体内实验验证 探究天然代谢物在癌症治疗中的潜在应用价值 MCF-7乳腺癌细胞系和HeLa宫颈癌细胞系 单细胞组学 乳腺癌,宫颈癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,实时荧光定量PCR NA 单细胞转录组数据,基因表达数据 两种癌细胞系(MCF-7和HeLa) NA 单细胞RNA测序 NA NA
402 2025-11-28
Integrated scRNA-seq and transcriptome analyses uncover the effects of UBE2H on the immune microenvironment regulation in pancreatic cancer
2025-Nov-24, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了UBE2H在胰腺癌免疫微环境调控中的作用 首次在胰腺导管细胞生态位中发现UBE2H+细胞群体,并系统阐明UBE2H通过抑制T细胞功能、损害抗原呈递和激活中性粒细胞胞外诱捕网等方式调控免疫微环境的机制 NA 探索胰腺癌'冷'肿瘤形成的关键调控分子及其功能机制 胰腺癌样本中的细胞群体,特别是胰腺导管细胞生态位 单细胞分析 胰腺癌 单细胞RNA测序, 转录组分析, inferCNV分析, 体内实验 15基因模型 单细胞测序数据, 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
403 2025-11-28
Intratumour Ploidy Heterogeneity and Clonal Evolution in Hepatocellular Carcinoma
2025-Nov-24, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 开发了一种新的高通量原位定量数字病理学方法评估肝细胞癌倍性,揭示了倍性异质性与克隆演化的关系 创建了首个基于全玻片成像的高通量定量数字病理学方法,能够原位评估HCC倍性并空间重建超倍体核的分布 样本量相对有限(111例),主要基于回顾性分析 研究肝细胞癌中肿瘤内倍性异质性和克隆演化机制 111例人类肝细胞癌样本 数字病理学 肝细胞癌 定量数字病理学,全外显子组测序,bulk RNA测序,3' mRNA测序,空间转录组学 NA 病理图像,基因组测序数据,转录组数据,空间转录组数据 111例人类肝细胞癌 NA 全外显子组测序,bulk RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
404 2025-11-28
Dynamic tumor microenvironment remodeling from laryngeal leukoplakia to carcinoma revealed by single-cell transcriptomics
2025-Nov-23, Gene IF:2.6Q2
研究论文 通过单细胞转录组学揭示喉白斑向癌变过程中肿瘤微环境的动态重塑过程 建立了首个喉白斑恶性进展的单细胞图谱,识别了两个关键上皮亚群及其与肿瘤微环境的相互作用机制 样本量较小(仅10例临床标本),需要更大规模验证 解析喉白斑向癌变转化的细胞和分子机制 喉白斑病变、早期癌变组织和正常对照组织 单细胞组学 喉癌 单细胞RNA测序 计算分析 单细胞转录组数据 10例临床标本(5例不同病理分期喉白斑、4例早期癌、1例对照) NA 单细胞RNA-seq NA NA
405 2025-11-28
A clinically relevant pan-cancer prognostic signature derived from T-cell activation immune genes: Experimental validation across malignancies with emphasis on breast cancer
2025-Nov-20, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 本研究开发了一个基于T细胞活化免疫基因的泛癌预后特征,并通过实验验证其在多种恶性肿瘤中的预后价值,特别关注乳腺癌 首次系统构建基于T细胞活化相关免疫应答基因的泛癌预后模型,发现PTGER4在免疫检查点阻断治疗中的关键作用 研究主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证;动物模型结果需进一步临床转化验证 系统评估T细胞活化相关免疫基因在多种癌症中的预后价值及其免疫治疗意义 多种恶性肿瘤患者数据,特别关注乳腺癌;小鼠模型用于机制验证 生物信息学 多种癌症 转录组分析,单细胞RNA测序,LASSO Cox回归 预后特征模型,Cox回归模型 转录组数据,单细胞RNA测序数据 UCSC Xena数据库中的泛癌转录组数据 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
406 2025-11-28
Early female germline development in Xenopus laevis: Stem cells, nurse cells, and germline cysts
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和高分辨率成像技术重建了非洲爪蟾早期雌性生殖系发育过程,揭示了生殖细胞囊肿的极性和功能 首次在非哺乳类脊椎动物中识别出具有神经元特异性和转座子沉默基因表达的生殖干细胞群体,并发现由稳定微管组成的不对称fusome样结构 研究仅限于非洲爪蟾模型,结果在哺乳动物中的普适性需要进一步验证 探究非哺乳类脊椎动物卵巢中生殖细胞囊肿的极性和功能 非洲爪蟾的雌性生殖系发育过程,包括生殖干细胞、保育细胞和生殖细胞囊肿 发育生物学 NA 单细胞RNA测序, 高分辨率成像 NA 基因表达数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
407 2025-11-28
The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 regulates macrophage inflammation in intestinal injury via the CACNA1D-mediated MAPK pathway
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了DPF2通过调控CACNA1D表达和MAPK通路在巨噬细胞炎症极化及肠道损伤修复中的关键作用 首次发现DPF2通过调节CACNA1D介导的钙信号和MAPK通路调控巨噬细胞炎症极化的新机制 NA 探究DPF2在肠道损伤中调控巨噬细胞炎症反应的分子机制 巨噬细胞、肠道组织、临床炎症性肠病患者样本 单细胞生物学 炎症性肠病 单细胞RNA测序,空间转录组学,小鼠遗传学,类器官培养 NA 基因表达数据,表观遗传数据,临床样本数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
408 2025-11-28
Transcriptomic profiling confirms microRNA-140 is more functional in joint development than in disease
2025-Nov-14, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1
研究论文 本研究通过转录组分析确认microRNA-140在关节发育中比在骨关节炎疾病中具有更强的功能作用 首次通过空间转录组学揭示miR-140-5p在静止软骨细胞和软骨膜中的特异性功能,并系统比较其在发育与疾病中的不同作用 研究仅使用小鼠模型,结果向人类转化需谨慎;骨关节炎模型仅采用创伤后模型 探究miR-140在骨骼发育和骨关节炎中的不同作用,并识别新的miR-140-5p靶标 Mir140基因敲除小鼠模型,包括骨骼发育和骨关节炎诱导模型 转录组学 骨关节炎 CRISPR-Cas9基因编辑,RNA测序,空间转录组学,组织学分析 基因敲除小鼠模型 转录组数据,空间基因表达数据,组织学图像 7日龄小鼠的肋软骨细胞和下肢生长板组织 NA RNA测序,空间转录组学 NA NA
409 2025-11-28
Matrix metalloproteinases are hallmark early biomarkers and therapeutic targets in FSHD
2025-Nov-10, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了基质金属蛋白酶(MMPs)在面肩肱型肌营养不良症(FSHD)中作为早期生物标志物和治疗靶点的重要作用 首次通过单细胞RNA测序确定FAPs和巨噬细胞是肌营养不良肌肉中MMPs的主要来源,并证明泛MMP抑制剂batimastat可改善肌肉病变 研究主要基于动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 探究MMPs在FSHD疾病进展中的作用机制及治疗潜力 面肩肱型肌营养不良症(FSHD)患者活检样本和iDUX4pA FSHD小鼠模型 生物医学研究 肌营养不良症 RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq NA 基因表达数据 NA NA RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
410 2025-11-28
Platelets impair the resolution of inflammation in atherosclerotic plaques in insulin-resistant mice after lipid lowering
2025-Nov-10, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨胰岛素抵抗状态下血小板如何阻碍降脂治疗期间动脉粥样硬化斑块的炎症消退 首次揭示血小板通过抑制Fcgr4+巨噬细胞亚群扩增阻碍斑块炎症消退的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床数据有限 探究血小板在胰岛素抵抗个体降脂治疗中影响动脉粥样硬化斑块炎症消退的作用机制 肥胖胰岛素抵抗小鼠模型及人类临床数据 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,临床数据 小鼠模型及患者队列(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
411 2025-11-28
Key Considerations on CITE-Seq for Single-Cell Multiomics
2025-Nov, Proteomics IF:3.4Q2
综述 本文聚焦CITE-Seq单细胞多组学技术的工作流程,以微孔板单细胞分析系统为例,提供抗体衍生标签染色、文库制备、测序和数据分析的关键注意事项 系统梳理CITE-Seq技术实施要点,首次以微孔板单细胞分析系统为范例提供全流程实用指南 NA 为研究人员提供执行CITE-Seq完整工作流程的实用指导 单细胞多组学分析技术 单细胞多组学 NA CITE-Seq, 单细胞mRNA测序, 抗体衍生标签 NA 基因表达数据, 蛋白质丰度数据 NA NA 单细胞多组学, CITE-Seq NA 微孔板单细胞分析系统
412 2025-11-28
Splicing-aware scRNA-Seq resolution reveals execution-ready programs in effector Tregs
2025-Nov, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 开发了一种名为SANSARA的剪接感知单细胞RNA测序分析方法,用于识别效应Treg细胞中的执行就绪程序 首次在单细胞RNA测序降维分析中区分剪接和未剪接mRNA,揭示了传统方法无法检测的细胞功能状态 方法验证主要限于外周血调节性T细胞,在其他细胞类型和组织中的普适性需要进一步验证 开发剪接感知的单细胞RNA测序分析方法,以更精确地解析细胞功能状态 外周血调节性T细胞(Treg)亚群,包括Th1和细胞毒性CD4+ T细胞亚群 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
413 2025-11-28
Altered Epithelial-Mesenchymal Progenitor States Lead to Matrix Deposition, Tissue Inflammation, and Transitional Epithelial State in Congenital Diaphragmatic Hernia
2025 Nov-Dec, Fetal and pediatric pathology IF:0.7Q4
研究论文 通过单细胞RNA测序研究先天性膈疝肺组织中上皮-间质祖细胞状态改变及其对细胞外基质沉积和组织炎症的影响 首次在先天性膈疝模型中揭示间质祖细胞过早获得间质样特征及远端上皮细胞进入过渡状态 研究仅使用大鼠模型,样本量有限,需要进一步验证 探究先天性膈疝肺发育异常的分子机制 正常和先天性膈疝胎鼠肺组织 单细胞生物学 先天性膈疝 单细胞RNA测序,免疫染色 Seurat 单细胞转录组数据,图像数据 正常和CDH胎鼠肺组织在E17、E19和E21时间点 NA 单细胞RNA测序 NA NA
414 2025-11-28
Single-cell omics arena: evaluation of large language models for automatic cell-type annotations on single-cell omics data via RNA-seq bridging
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文评估大型语言模型在单细胞组学数据中自动细胞类型注释的能力,并提出了跨模态翻译方法 首次系统评估8种大型语言模型在1226个细胞类型注释任务中的表现,并提出基于VAE的跨模态翻译模块处理非可解释特征 仅评估了11个公开可用的单细胞RNA测序数据集,模型性能可能受限于数据集规模和多样性 评估大型语言模型在单细胞组学数据中自动细胞类型注释的能力 单细胞组学数据中的细胞类型注释 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 大型语言模型(LLM), VAE 基因表达数据, 表观遗传标记 11个公开单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
415 2025-11-28
PTGER4 Governs Immune Evasion and Therapy Resistance in Kidney Cancer via Ribosome Biogenesis Dysregulation
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过多组学数据分析揭示了PTGER4通过调控核糖体生物合成影响肾癌免疫逃逸和治疗抵抗的机制 首次发现PTGER4作为肾癌中的关键抑癌基因,通过调控核糖体生物合成影响免疫应答和治疗反应 NA 探究核糖体生物合成异常在肾透明细胞癌进展和免疫治疗反应中的作用机制 肾透明细胞癌(KIRC)患者肿瘤样本 机器学习 肾癌 单细胞RNA测序,基因网络分析(hdWGCNA),机器学习 NA 多组学数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
416 2025-11-28
Development of a PANoptosis-Related Pathomics Prognostic Model in Ovarian Cancer: A Multi-Omics Study
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究开发了一个基于PANoptosis相关病理组学的卵巢癌预后模型,通过多组学分析揭示了STAT4 T细胞通过特定通路激活上皮细胞PANoptosis的机制 首次将PANoptosis这一综合细胞死亡机制引入卵巢癌预后研究,并开发了基于深度学习的病理组学预后模型 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 阐明PANoptosis在卵巢癌预后中的作用并开发预后模型 卵巢癌患者数据 数字病理 卵巢癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,深度学习 ResNet-50,深度学习模型 基因表达数据,空间数据,病理图像 TCGA、GTEx和GEO数据库的卵巢癌数据 10x Genomics 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
417 2025-11-28
Scalable inference and identifiability of kinetic parameters for transcriptional bursting from single cell data
2025-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 开发了一种基于化学主方程模型参考库的计算流程,用于从单细胞RNA测序数据推断转录爆发动力学参数 提出了可扩展的动力学参数推断和可识别性分析方法,能够区分实验噪声与模型结构特性对参数不确定性的贡献 研究发现对于电报模型,大部分参数空间从单细胞RNA测序数据中实际上不可识别,低实验捕获率会恶化可识别性 从单细胞数据推断转录爆发的动力学参数并分析参数可识别性 基因表达动力学参数和单细胞RNA测序数据 计算生物学 NA 单细胞RNA测序 化学主方程模型,随机电报模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
418 2025-11-27
Unraveling the Role of PTGIR in Atrial Fibrillation: Insights From Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization
2025-Nov-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法揭示了PTGIR基因在心房颤动发病机制中的关键作用 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,系统识别心房颤动相关的关键基因和信号通路 样本量相对有限,仅包含47,565个细胞,需要在更大规模研究中验证 探究心房颤动的分子机制,特别是与心房纤维化的关联 心房颤动患者和对照样本中的细胞,以及大鼠模型 单细胞基因组学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 蛋白验证分析 NA 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 47,565个细胞(来自AF和对照样本) NA 单细胞RNA测序 NA NA
419 2025-11-27
Investigating the impact of MCTP2 on immune suppression and drug resistance in glioblastoma
2025-Nov-26, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究探讨MCTP2在胶质母细胞瘤复发中的关键作用及其对免疫抑制和耐药性的影响机制 首次揭示MCTP2作为胶质母细胞瘤免疫逃逸和耐药性的新型促进因子,并发现其与免疫检查点标志物PD-L1和CTLA-4的关联 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏大规模临床验证 探索MCTP2在胶质母细胞瘤复发和耐药性中的作用机制 胶质母细胞瘤样本和患者来源的类器官模型 癌症生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学,Western blotting,集落形成实验 患者来源类器官模型 转录组数据,蛋白质表达数据 来自TCGA和CGGA数据库的原发性和复发性胶质母细胞瘤样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
420 2025-11-27
Circadian Control of Neutrophils Drives Collateral Perfusion and Stroke Outcome
2025-Nov-26, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究揭示了昼夜节律通过调控中性粒细胞功能和NETs形成影响侧支灌注和卒中结局的机制 首次阐明昼夜节律通过调控中性粒细胞功能和NETs形成影响卒中侧支灌注的具体机制 动物模型与人类研究存在物种差异,临床样本量有限 探究昼夜节律调控中性粒细胞功能对卒中侧支灌注和预后的影响 小鼠模型和540例缺血性卒中患者 神经科学 缺血性卒中 流式细胞术,单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,激光散斑成像 NA 基因表达数据,影像数据,临床数据 小鼠模型和540例患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部