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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2025-12-06
BMP4 cocktail promotes utricular progenitor reprogramming and vestibular functional recovery in adult mice
2025-Nov-29, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了BMP4在小鼠前庭毛细胞再生中的作用,通过激活c-Fos促进非毛细胞重编程,并联合Notch抑制和Wnt激活恢复前庭功能 首次揭示BMP4通过c-Fos激活增强前庭非毛细胞重编程,并联合靶向Notch和Wnt通路的小分子组合促进成年小鼠前庭功能恢复 研究主要基于小鼠模型,临床转化潜力需进一步验证;长期安全性和疗效评估不足 探究BMP4在耳毒性损伤后前庭毛细胞再生中的作用机制 成年C57BL/6J背景小鼠(包括多种转基因品系)的前庭毛细胞和非毛细胞 分子生物学与再生医学 前庭功能障碍 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、CUT&Tag测序、免疫荧光染色、Western blot分析 NA 转录组数据、表观基因组数据、图像数据 P30成年小鼠及P2小鼠球体/外植体组织 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, CUT&Tag NA NA
382 2025-12-06
UGP2 is a potential target for breast cancer, based on bioinformatics analysis and in vitro experiments
2025-Nov-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析和体外实验,系统探讨了UGP2在乳腺癌进展中的临床相关性及功能机制 首次系统性地将UGP2表达与乳腺癌(尤其是TNBC亚型)的临床病理特征、预后及肿瘤微环境中的空间分布联系起来,并通过功能实验验证了其促癌作用 研究主要基于公共数据库分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 探究UGP2在乳腺癌发生发展中的临床意义和生物学功能 乳腺癌患者样本(来自TCGA等数据库及118例临床标本)及乳腺癌细胞系 生物信息学 乳腺癌 生物信息学多组学分析、免疫组化、单细胞RNA测序、siRNA敲低实验 NA 基因表达数据、临床病理数据、单细胞RNA测序数据、体外细胞功能数据 TCGA等公共数据库样本及118例临床乳腺癌标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
383 2025-12-06
SPINK1-driven cellular heterogeneity and interaction networks in intrahepatic cholangiocarcinoma revealed by integrated multi-omics analysis
2025-Nov-17, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析揭示了SPINK1驱动的细胞异质性及相互作用网络在肝内胆管癌中的作用 发现了SPINK1-CCL20-LAMs轴,该轴协调免疫细胞招募和代谢重编程,揭示了SPINK1通过LAMs建立富含谷氨酰胺的微环境促进肿瘤生长的新机制 NA 剖析肝内胆管癌的细胞异质性和细胞间相互作用,特别关注SPINK1过表达的上皮亚群 人类肝内胆管癌肿瘤及邻近正常组织 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 整合蛋白质组学分析, Transwell实验, 共培养系统, 功能扰动实验 NA 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
384 2025-12-06
Association of neuronal autoantibodies with overall survival in gastric cancer patients
2025-Nov-13, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了胃癌患者中神经元自身抗体的存在及其与总体生存期的关联 首次在无副肿瘤性神经系统综合征的胃癌患者中检测神经元自身抗体,并揭示其与生存期缩短和肿瘤微环境免疫抑制特征的关联 单中心队列研究,样本量有限,需要进一步机制研究验证 评估胃癌患者神经元自身抗体的临床预后意义 胃癌患者血清样本和肿瘤组织 NA 胃癌 免疫荧光、细胞基础检测、单细胞测序 NA 血清样本、肿瘤组织、单细胞测序数据 323例胃癌患者(144例TBA阳性,179例TBA阴性) NA 单细胞RNA-seq NA NA
385 2025-12-06
Clinical and translational study of ivosidenib plus nivolumab in advanced solid tumors harboring IDH1 mutations
2025-Nov-11, The oncologist
研究论文 本研究评估了ivosidenib联合nivolumab在携带IDH1突变的晚期实体瘤患者中的初步活性和安全性 首次在临床试验中探索IDH1抑制剂与抗PD1抗体联合治疗IDH1突变实体瘤的疗效,并结合空间转录组学等先进技术进行转化分析 样本量较小(仅15例患者),临床获益有限,需要更大规模研究验证 评估ivosidenib联合nivolumab在IDH1突变晚期实体瘤中的治疗效果和免疫调节作用 携带IDH1突变的晚期或难治性实体瘤患者 数字病理学 实体瘤 空间转录组学,蛋白质组学,药效动力学分析 NA 临床数据,蛋白质组数据,空间转录组数据 15例患者 NA 空间转录组学 NA NA
386 2025-12-06
Base editing and nanoparticle transfection of airway cell types essential for treatment of cystic fibrosis
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用碱基编辑技术和聚合物纳米颗粒转染,纠正了囊性纤维化(CF)患者气道细胞中的致病性剪接位点变异,并实现了CFTR功能的临床意义水平恢复 首次将碱基编辑器RNA与聚合物纳米颗粒(PNPs)非病毒递送平台结合,在CF原代气道细胞中纠正常见致病剪接变异,并通过单细胞RNA测序揭示了编辑后细胞类型特异性转录变化 研究未详细探讨PNPs在体内递送的长期安全性和效率,且对基底细胞亚型编辑后比例下降的机制解释有限 开发一种可扩展的非病毒治疗平台,用于纠正囊性纤维化及其他呼吸系统疾病中呼吸上皮细胞的功能障碍 囊性纤维化患者的气道上皮细胞,包括离子细胞、分泌性杯状细胞和基底祖细胞亚型 基因编辑与细胞治疗 囊性纤维化 碱基编辑,单细胞RNA测序(scRNA-seq),聚合物纳米颗粒(PNPs)转染 NA 单细胞RNA测序数据,功能测定数据 原代CF气道细胞和永生化气道细胞,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
387 2025-12-06
Integrating bulk and single-cell transcriptome to identify novel gene markers for germinal center B cells (GCB) subtype of diffuse large B-cell lymphoma
2025-Nov, Annals of hematology IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞转录组数据,开发了一个基于19个基因对的定性特征(19-GPS),用于区分弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的生发中心B细胞(GCB)亚型与非GCB亚型 利用基因的相对表达顺序(REO)模式,开发了高度稳定、抗批次效应和样本质量变化的定性特征,提高了DLBCL亚型分类的临床适用性和预后分层性能 未明确提及样本来源的多样性或外部验证的广泛性,可能影响模型的泛化能力 开发一个稳定的定性特征,以区分DLBCL的GCB亚型与非GCB亚型,并评估其预后和治疗指导价值 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者样本,包括GCB和非GCB亚型 生物信息学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 bulk转录组测序,单细胞转录组测序 基于基因对相对表达顺序(REO)的定性特征模型 基因表达数据 四个独立数据集,具体样本数量未明确说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
388 2025-12-05
The PIK3C3/MAPK14 axis drives M1 polarization via autophagy Inhibition to exacerbate Sepsis-Induced acute lung injury
2025-Nov-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究揭示了PIK3C3/MAPK14信号轴通过抑制自噬驱动巨噬细胞M1极化,从而加剧脓毒症诱导的急性肺损伤的机制 首次通过机器学习转录组分析和多组学整合,鉴定出MAPK14是ALI的核心基因,并揭示了PIK3C3与MAPK14之间的高亲和力相互作用及其通过调控自噬影响巨噬细胞极化的新机制 研究主要基于体外实验和计算模拟,缺乏体内动物模型的直接验证,且临床样本量有限 阐明脓毒症诱导的急性肺损伤中巨噬细胞自噬失调的分子机制 巨噬细胞、急性肺损伤组织 机器学习 急性肺损伤 机器学习转录组分析、单细胞测序、多组学整合、分子对接、动力学模拟、Western Blot、RT-qPCR、流式细胞术、ELISA、RNA pull-down 机器学习模型(具体类型未指定) 转录组数据、单细胞测序数据、多组学数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
389 2025-12-05
Intraductal Papillary Mucinous Neoplasm Cellular Plasticity is Linked with Repeat Element Dysregulation
2025-Nov-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,结合定制重复元件探针,探讨了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)的组织学亚型、重复元件失调与不同细胞群分子谱之间的关系 首次在IPMN中应用单细胞空间分子成像技术,揭示了从胃型向肠型和胰胆型分支的细胞状态可塑性连续体,并发现重复元件表达与高级别异型增生相关 样本量相对较小(18例患者),且仅针对手术切除的IPMN病变进行分析,可能无法完全代表所有临床情况 探究IPMN组织学亚型、重复元件失调与分子特征之间的关联,以理解其进展机制 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)的52个病变样本 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学,单细胞空间分子成像,重复元件表达分析 NA 空间转录组数据,单细胞成像数据 52个病变样本来自18例患者 NA 空间转录组学,单细胞空间分子成像 GeoMx, CosMx GeoMx用于全转录组空间分析,CosMx用于单细胞空间分子成像,均使用LINE1、HSATII、HERVK和HERVH重复元件探针
390 2025-12-05
Genetic dissection of microglia cannibalism reveals an IL10 signaling axis controls microglia lifespan
2025-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过大规模CRISPR筛选揭示了IL10信号轴如何通过调控溶酶体酸化来控制小胶质细胞的寿命和同类相食行为 首次在小胶质细胞中鉴定出IL10信号通路通过溶酶体酸化调控细胞寿命的机制,并提出了坏死性凋亡-同类相食过程作为小胶质细胞更新的质量控制机制 研究主要基于斑马鱼模型,虽然在小鼠中进行了验证,但人类小胶质细胞中的机制仍需进一步探索 探究小胶质细胞在清除细胞碎片后命运调控的遗传机制 斑马鱼和小鼠的小胶质细胞 神经免疫学 NA CRISPR筛选、单细胞RNA测序、机器人共聚焦显微镜 NA 基因表达数据、显微镜图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
391 2025-12-05
CDH3 as a Novel Therapeutic Target in Basal-like Double-Negative Prostate Cancer
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了CDH3在基底样前列腺癌中的作用,并评估了针对CDH3的抗体药物偶联物和CAR T细胞治疗策略 首次将CDH3识别为基底样前列腺癌的关键标志物和功能驱动因子,并开发了针对CDH3的ADC和CAR T细胞疗法,展示了在临床前模型中的显著疗效 研究主要基于小鼠模型和临床前实验,尚未在人类临床试验中验证,且样本量有限 阐明CDH3在基底样前列腺癌中的作用,并评估CDH3靶向治疗策略的潜力 基底样(双阴性)前列腺癌 癌症研究 前列腺癌 单细胞RNA测序、转录组分析、抗体药物偶联物和CAR T细胞技术 基因工程小鼠模型、异种移植模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 小鼠前列腺癌模型和人类前列腺癌数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
392 2025-12-05
Multiscale Cell-Cell Interactive Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种多尺度细胞-细胞交互空间转录组学分析方法,用于整合基因表达谱与空间位置信息 首次在空间转录组学分析中系统性地整合了多尺度细胞-细胞相互作用,并结合了多尺度拓扑表示与前沿空间深度学习技术 NA 开发一种能够捕捉多尺度细胞-细胞相互作用的空间转录组学分析方法 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 空间深度学习技术 空间转录组学数据 37个基准空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
393 2025-12-05
Adenylate Uridylate- (AU-) Rich Element Gene-Based Prognostic Signature and Molecular Subtypes of Prostate Adenocarcinoma: Implications for Prognosis and Immune Microenvironment
2025-Nov, Archivos espanoles de urologia IF:0.6Q4
研究论文 本研究基于腺苷酸尿苷酸富集元件基因构建了一个前列腺腺癌的预后特征和分子亚型,用于预测预后和反映免疫微环境特征 首次利用AREGs基因(ACSM3、ACTG2、DES)构建前列腺腺癌的预后模型,并关联免疫微环境分析 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,实验验证仅限于qRT-PCR,缺乏更深入的体内外功能验证 开发前列腺腺癌的预后预测模型并探索其与免疫微环境的关系 前列腺腺癌患者 生物信息学 前列腺癌 加权基因共表达网络分析、Cox回归、LASSO正则化、CIBERSORT免疫浸润分析、单细胞转录组学、qRT-PCR 预后风险模型 基因表达数据 基于公共PRAD数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞转录组学 NA NA
394 2025-12-04
Single-cell multiomics reveals macrophage-derived IL-23 and CXCL9/10 drive pathogenic IFNG+IL17+ T cells in immunotherapy-related colitis
2025-Nov-29, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学分析揭示了巨噬细胞来源的IL-23和CXCL9/10驱动IFNG+IL17+ T细胞在免疫治疗相关结肠炎中的致病作用 首次在免疫治疗相关结肠炎中鉴定出具有双重Th1/Th17特征的致病性IFNG+IL17+CD4+ T细胞亚群,并阐明其由组织驻留记忆T细胞分化而来,同时揭示了巨噬细胞通过IL-23和CXCL9/10信号通路驱动该过程的机制 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的人类队列验证;机制研究虽深入但部分信号通路的具体调控细节仍需进一步探索 阐明免疫检查点阻断治疗相关结肠炎的免疫病理机制,并寻找不影响抗肿瘤疗效的治疗靶点 免疫治疗相关结肠炎患者和小鼠模型中的免疫细胞,特别是IFNG+IL17+CD4+ T细胞和肠道巨噬细胞 数字病理学 结肠炎 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学, 流式细胞术, qPCR, 体内中和抗体阻断, 巨噬细胞耗竭 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, T细胞受体序列数据, 流式细胞术数据, qPCR数据 人类irColitis病变样本和小鼠模型样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
395 2025-12-04
Neutrophil extracellular traps-STC1 positive feedback loop promotes immune evasion and metastasis in bladder cancer
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了膀胱癌中中性粒细胞胞外陷阱(NETs)与抗吞噬检查点STC1之间的正反馈环路在促进免疫逃逸和转移中的关键作用 首次发现NETs通过TLR2-MAPK-FosL1轴上调STC1,形成NETs-STC1自增强反馈环路,并阐明STC1通过隔离钙网蛋白抑制抗原呈递及分泌形式增强NET形成的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床验证仍需进一步开展;反馈环路在其他癌症类型中的普适性未明确 探究膀胱癌免疫治疗耐药机制及NETs在其中的作用 膀胱癌患者临床队列、小鼠肺转移模型、肿瘤细胞与中性粒细胞共培养体系 肿瘤免疫学 膀胱癌 免疫荧光染色、扫描电镜、蛋白质组学、单细胞转录组学 小鼠肺转移模型 临床队列数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据、影像数据 多个接受免疫检查点抑制剂治疗的临床队列(具体样本量未明确) NA 单细胞转录组学 NA NA
396 2025-12-04
Cellular dynamics in cerebrospinal fluid unveils the key regulators of intracranial response to immune checkpoint inhibitors in NSCLC brain metastases
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非小细胞肺癌脑转移患者在接受免疫检查点抑制剂治疗期间,脑脊液和脑转移瘤中的细胞动态变化,并识别出CD4+PDCD1+CXCR6+ T细胞作为颅内治疗反应的关键预测因子 首次在脑脊液中利用单细胞RNA测序构建了高分辨率的细胞动态图谱,并鉴定出CD4+PDCD1+CXCR6+ T细胞这一新型免疫细胞亚群作为免疫检查点抑制剂颅内疗效的阳性预测标志物 样本量相对较小(脑脊液样本n=20),且依赖于外部数据库数据进行整合分析,可能需要更大规模的前瞻性队列验证 探索非小细胞肺癌脑转移患者对免疫检查点抑制剂治疗的颅内反应机制,并寻找预测性生物标志物 非小细胞肺癌伴脑转移的患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 蛋白质组学分析, 多重免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质组数据, 免疫组织化学图像 脑脊液样本20例, 外部数据库样本20例, 流式细胞验证队列8例, 蛋白质组学验证队列31例, 多重免疫组化验证队列25例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
397 2025-12-04
Blocking PCSK9 suppresses hepatocellular carcinoma immune escape by decreasing FLI1-mediated SPP1 and PD-L1 expression
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了PCSK9通过NOTCH3/FLI1信号通路上调SPP1和PD-L1表达,从而促进肝细胞癌免疫逃逸的机制,并探索了基于CRISPR碱基编辑和小分子抑制剂的干预策略 首次发现PCSK9通过NOTCH3/FLI1通路调控SPP1和PD-L1表达,介导肝细胞癌免疫逃逸,并开发了新型ABE碱基编辑器和小分子抑制剂parecoxib作为治疗策略 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体临床试验中验证,且PCSK9抑制剂parecoxib的具体作用机制和长期安全性需进一步研究 揭示PCSK9促进肝细胞癌免疫逃逸的分子机制,并探索靶向PCSK9的治疗策略 肝细胞癌细胞系(Hepa1-6、H22、HepG2)、小鼠肝细胞癌模型、CD8+ T细胞 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、CRISPR腺嘌呤碱基编辑、共培养实验 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据 多种肝细胞癌细胞系及小鼠模型,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
398 2025-12-04
Selective modification of glycoprotein substrates by GnT-V in mouse kidney
2025-Nov-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了小鼠肾脏中N-乙酰葡糖胺转移酶-V(GnT-V)对蛋白质底物选择性的机制 通过凝集素辅助蛋白质组学鉴定出ANPEP和MEP1A为GnT-V的主要底物,并揭示了修饰位点的结构特征和极化亚细胞运输在选择性修饰中的作用 研究仅基于小鼠肾脏模型,未在其他组织或物种中验证,且机制细节仍需进一步探索 探究GnT-V在蛋白质选择性糖基化中的机制 小鼠肾脏中的糖蛋白底物,特别是ANPEP和MEP1A 糖生物学 NA 凝集素辅助蛋白质组学、单细胞转录组学 NA 蛋白质组数据、转录组数据 NA NA NA NA NA
399 2025-12-04
Niclosamide suppresses gastric cancer progression through YTHDF2 inhibition-affected lactate metabolic reprogramming
2025-Nov-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了胃癌的代谢重编程特征,并发现药物氯硝柳胺通过抑制m6A甲基化调控蛋白YTHDF2来影响代谢基因,从而抑制胃癌进展 首次将氯硝柳胺的抗癌作用与m6A甲基化调控蛋白YTHDF2联系起来,并系统阐明了其在调节乳酸代谢重编程和肿瘤微环境乳酸穿梭中的作用机制 NA 探究胃癌代谢重编程的分子机制,并评估氯硝柳胺通过靶向YTHDF2抑制胃癌进展的治疗潜力 胃癌患者样本、胃癌细胞系 肿瘤代谢 胃癌 非靶向代谢组学、转录组学、单细胞RNA-seq NA 代谢组数据、转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
400 2025-12-04
stTransfer enables transfer of single-cell annotations to spatial transcriptomics with single-cell resolution
2025-Nov-17, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文提出了一种名为stTransfer的方法,通过整合单细胞RNA测序数据和空间转录组数据,利用图自编码器和迁移学习实现单细胞级别的细胞类型注释 stTransfer方法通过图自编码器和迁移学习最小化scRNA-seq与ST数据集间的信息传递损失,在准确性和鲁棒性上优于现有方法 未在摘要中明确说明 解决空间转录组技术中因检测灵敏度和基因覆盖度限制导致的单细胞级别细胞类型注释难题 斑胸草雀视顶盖的高精度Stereo-seq数据集中的神经元群体 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 图自编码器, 迁移学习 基因表达数据 未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Stereo-seq 高精度Stereo-seq
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