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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-05-02
Whole-cortex in situ sequencing reveals input-dependent area identity
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 使用BARseq高通量原位测序技术,对小鼠大脑皮层1030万个细胞进行基因表达分析,揭示皮层区域身份与转录组特征的关系 首次利用大规模原位测序技术BARseq在单细胞分辨率下揭示皮层区域身份与转录组类型组成高度相关,并发现外周输入可调控区域内转录组身份 仅检测了104个细胞类型标记基因,未覆盖全转录组;研究仅针对小鼠模型,需进一步验证在其他物种中的适用性 探究大脑皮层空间组织是否反映在神经元转录组特征中,以及这些特征在发育中如何建立 小鼠大脑皮层九个半球中的4194658个皮层神经元 数字病理学 NA 原位测序 NA 基因表达数据 1030万个细胞,包含9个小鼠前脑半球 NA 单细胞RNA测序 BARseq BARseq高通量原位测序技术
22 2026-05-01
White and brown adipose tissue share a convergent fibro-adipogenic progenitor population
2025-Nov, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序对培养的原代白色和棕色前脂肪细胞进行分析,发现两者共享一种共同的纤维脂肪祖细胞亚群 首次在棕色脂肪组织中发现纤维脂肪祖细胞样细胞,并揭示白色和棕色脂肪组织祖细胞亚群存在保守性特征 研究主要基于体外培养系统,体内验证需进一步扩展;未深入探讨FAPL在病理条件下的功能差异 探究体外培养条件对白色和棕色脂肪组织祖细胞异质性的影响及其生理相关性 原代白色和棕色前脂肪细胞 机器学习和单细胞生物学 代谢性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
23 2026-04-30
Monocyte/macrophage-derived NLRP3 Promotes the Onset and Progression of Ankylosing Spondylitis Via the NOD-like Receptor Pathway
2025-Nov-26, Journal of clinical immunology IF:7.2Q1
research paper 本研究通过单细胞测序和转录组分析揭示了单核细胞/巨噬细胞衍生的NLRP3通过NOD样受体通路促进强直性脊柱炎的发病和进展 首次通过单细胞测序分析强直性脊柱炎患者骨髓样本,明确单核细胞-巨噬细胞-炎症性巨噬细胞分化轨迹,并识别NLRP3的核心作用及上游调控因子 未提及具体局限性 阐明强直性脊柱炎的致病通路并探索潜在治疗策略 从强直性脊柱炎患者和骨折对照患者收集的骨髓样本 machine learning 强直性脊柱炎 单细胞测序, 转录组分析 NA 单细胞数据, 转录组数据 强直性脊柱炎患者与骨折对照患者的骨髓样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA-seq NA NA
24 2026-04-29
Multi-omics reveals changes in astrocyte fatty acid metabolism during early stages of Alzheimer's disease
2025-11, Neurochemistry international IF:4.4Q1
研究论文 通过多组学分析揭示阿尔茨海默病早期星形胶质细胞脂肪酸代谢的变化 首次通过多组学(转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学)联合分析,系统描述了阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的动态变化,并利用人类单细胞RNA测序数据验证了这些变化的临床相关性 尚未说明具体局限性 探究阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的分子动态变化及其与疾病进展的关系 阿尔茨海默病模型APP/PS1小鼠和野生型小鼠的星形胶质细胞,以及人脑样本中的星形胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 多组学(转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学)、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢物空间分布数据、单细胞转录组数据 APP/PS1和WT小鼠在5个时间点(2、4、6、9、12月龄)的星形胶质细胞样本;人脑单细胞核RNA测序样本 NA 单细胞RNA测序、空间代谢组学 NA NA
25 2026-04-29
Dynamic interaction of oligodendrocyte precursor cells with other cell types in the central nervous system
2025-11, Neurochemistry international IF:4.4Q1
综述 系统梳理少突胶质前体细胞与中枢神经系统中其他细胞类型的动态相互作用机制 利用单细胞测序和体内成像等新技术,揭示了OPC在神经发育、组织稳态维持和病理微环境重塑中与多种CNS细胞群进行广泛动态相互作用的功能可塑性 NA 综合OPC多模式功能的现有证据,评估非成髓鞘贡献,并探讨神经再生医学的有前景治疗靶点 少突胶质前体细胞(OPCs)及其与神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞和血管内皮细胞的相互作用 数字病理学 多发性硬化症、脑缺血 单细胞测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-04-28
A novel zinc finger protein gene signature for prognostic prediction, tumor microenvironment characterization, and therapeutic response in uterine corpus endometrial carcinoma
2025-Nov-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 利用锌指蛋白基因构建风险评分模型,用于子宫内膜癌的预后预测、肿瘤微环境表征及治疗反应评估 首次系统利用锌指蛋白基因确定子宫内膜癌患者的预后结局,并建立风险评分模型 基于公开数据库分析,缺乏独立外部验证队列及前瞻性临床验证 开发基于锌指蛋白基因的预后预测模型,评估其在子宫内膜癌中的临床应用价值 子宫内膜癌患者 生物信息学 子宫内膜癌 转录组测序、单细胞RNA测序、数据非依赖采集定量蛋白质组学分析 LASSO回归、Cox比例风险回归模型 转录组数据、单细胞测序数据、临床数据 未明确说明具体样本数量(来自TCGA和GEO数据库的子宫内膜癌样本) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
27 2026-04-28
Lactylation-related gene signatures define immune heterogeneity and provide diagnostic biomarkers for periodontitis
2025-Nov-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过系统分析牙周炎患者与健康对照的基因表达数据集和单细胞RNA测序数据,鉴定乳酸化相关基因特征,揭示免疫异质性并建立诊断标志物 首次系统性地将蛋白质乳酸化修饰与牙周炎的免疫微环境联系起来,通过多级整合分析(包括批量基因表达、单细胞RNA测序和机器学习)识别核心诊断标志物EAF1、NEFL和VIM,并揭示乳酸化相关基因在免疫重塑中的作用 数据来源于公开数据集,可能受限于样本大小和异质性;需要更大规模的临床验证来确认诊断标志物的普适性;乳酸化修饰的具体分子机制尚未完全阐明 探究乳酸化相关基因在牙周炎免疫异质性中的作用及其作为诊断标志物的潜力 牙周炎患者与健康对照者的牙龈组织和外周血单核细胞 机器学习 牙周炎 基因表达微阵列、单细胞RNA测序、免疫组织化学 LASSO回归、随机森林、极限梯度提升 基因表达数据、单细胞转录组数据 GSE10334和GSE16134两个基因表达数据集,以及来自牙周炎患者和健康对照的外周血单核细胞单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
28 2026-04-28
Cross-species identification of conserved cell-type specific mechanisms during early placenta development in ruminants
2025-Nov-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 整合绵羊和牛早期胎盘发育的单细胞RNA测序数据,跨物种鉴定保守的细胞类型特异性机制 首次通过跨物种单细胞转录组分析,揭示反刍动物早期胎盘中上皮-间充质转化作为保守关键过程,并发现牛特有的两种滋养层细胞亚群 仅依赖已发表的scRNA-seq数据,可能缺少动态时间点或空间信息;未对EMT进行功能验证实验 阐明反刍动物早期胎盘发育中保守的细胞类型特异性机制 绵羊和牛的早期胎盘组织 数字病理学 妊娠失败 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 整合绵羊和牛的scRNA-seq数据,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
29 2026-04-28
Single-cell RNA sequencing revealed the association between proximal tubular epithelial cells and renal interstitial cells in chronic kidney disease progression
2025-Nov-24, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示近端肾小管上皮细胞与肾间质细胞在慢性肾病进展中的关联 首次鉴定出位于S1节段的受损近端肾小管上皮细胞亚群PT_5,并阐明其通过多种配体-受体对与巨噬细胞、成纤维细胞及免疫细胞协同作用,驱动慢性肾病进展的新机制 尚需进一步验证PT_5在人体组织中的存在及其与特定间质细胞协调促进疾病进展的分子机制 研究受损近端肾小管上皮细胞在慢性肾病发生中的特征及其与间质细胞的协同机制 通过腺嘌呤饮食诱导的慢性肾病小鼠模型 机器学习 慢性肾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 共使用0.2%腺嘌呤饮食喂养2周、4周和8周的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2026-04-28
Senescence-related gene signatures in Crohn's disease: integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Nov-24, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究整合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析,识别与克罗恩病相关的衰老基因特征 首次系统性地结合批量与单细胞RNA测序技术,揭示五个衰老相关枢纽基因(STAT1、S100A11、FILIP1L、F3和HPS5)在克罗恩病中的潜在作用及其与免疫浸润的关联 未详细说明样本量大小及独立外部数据集的具体来源,可能限制结果的普适性 探讨衰老相关基因在克罗恩病中的具体作用及其对预后的影响 克罗恩病患者肠道组织样本及小鼠模型 计算生物学 克罗恩病 RNA-seq 机器学习算法 转录组数据 NA NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-04-28
LRP12 promotes gastric cancer progression through AKT/mTOR signaling and M2 macrophage-mediated immunosuppression
2025-Nov-23, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 LRP12通过AKT/mTOR信号通路和M2巨噬细胞介导的免疫抑制促进胃癌进展 首次鉴定LRP12为炎症相关预后标志物,并揭示其通过激活AKT/mTOR通路和诱导M2巨噬细胞极化参与胃癌免疫抑制微环境调控 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏大规模临床验证及体内免疫微环境动态分析 鉴定胃癌中与炎症反应相关的预后生物标志物并阐明其调节肿瘤免疫微环境的机制 胃癌细胞系及患者组织样本 机器学习 胃癌 单细胞转录组测序、多重免疫荧光、免疫组化、Western blot、异种移植模型 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织图像 公共数据集及内部队列样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-04-28
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Neutrophil Clusters Associated with Autoimmune Neuroinflammation
2025-Nov-19, Research square
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示与自身免疫性神经炎症相关的中性粒细胞亚群 首次通过单细胞RNA测序技术,在实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中揭示了中性粒细胞的异质性及其在脑靶向自身免疫炎症中的致病性,并发现Saa3/SAA1作为潜在的生物标志物和治疗靶点 研究基于小鼠模型,其向人类多发性硬化症的转化应用需要进一步验证 阐明中性粒细胞在自身免疫性神经炎症中的致病机制及寻找潜在生物标志物和治疗靶点 中性粒细胞,特别是髓系细胞和中性粒细胞中SOCS3缺陷的小鼠模型 免疫学与神经科学 多发性硬化症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 小鼠小脑和脊髓的中性粒细胞,包括初始状态和实验性自身免疫性脑脊髓炎模型,以及人类多发性硬化症患者血浆样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
33 2026-04-28
Human heart-macrophage assembloids mimic immune-cardiac interactions and enable arrhythmia disease modeling
2025-Nov-06, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 通过将人类多能干细胞衍生的胚胎单核细胞整合到心脏类器官中,构建出人心脏-巨噬细胞组装体模型,用于模拟免疫-心脏相互作用和心律失常疾病建模 首次利用自体人类多能干细胞衍生的胚胎单核细胞与心脏类器官整合,生成具有生理相关性的胚胎组织驻留巨噬细胞,并长期维持以促进心脏发生 未明确提及 研究心脏组织驻留巨噬细胞在心脏发育和心律失常疾病中的功能及机制 人类心脏-巨噬细胞组装体模型及心脏驻留巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 类器官模型 单细胞转录组数据、活体成像数据、蛋白质组数据 未明确提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2026-04-28
Microvascular Endothelial Cells License APS Vasculopathy Through YAP1- and CCN2-Mediated Signaling
2025-Nov-04, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究揭示了抗磷脂综合征(APS)中微血管内皮细胞通过YAP1和CCN2介导的信号通路促进血管病变的机制 首次通过单细胞RNA测序鉴定出APS患者皮肤微血管内皮细胞中CCN1和CCN2表达增高,并阐明YAP1-CCN2信号轴在介导内皮细胞与血管平滑肌细胞间的促增殖通讯中的关键作用 未能在摘要中明确指出研究局限性 阐明APS血管病变的细胞和分子机制,寻找潜在治疗靶点 抗磷脂综合征(APS)患者及其微血管内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、免疫荧光显微镜、ELISA、定量PCR、免疫印迹 NA 图像、文本 APS患者的皮肤活检样本、肾脏活检样本以及血浆样本;健康人真皮微血管内皮细胞培养;小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
35 2026-04-27
SPP1 + macrophage and Treg interaction mediates immunosuppression and adverse survival in HER2 + breast cancer
2025-Nov-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 利用单细胞转录组数据和空间转录组学揭示SPP1+巨噬细胞与Treg细胞相互作用如何介导HER2+乳腺癌免疫抑制和不良预后 首次在HER2+乳腺癌中鉴定出SPP1+巨噬细胞通过CD86-CTLA4轴增强Treg免疫抑制功能,并利用空间转录组学验证其促肿瘤机制 NA 阐明SPP1+巨噬细胞在HER2+乳腺癌中的促肿瘤能力及其分子机制,寻找新的治疗靶点 健康乳腺组织和HER2+乳腺癌组织中的细胞亚群 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据、空间转录组数据 包含健康乳腺组织和新辅助治疗前后HER2+乳腺癌样本的批量转录组数据集及独立内部患者队列 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
36 2026-04-25
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated With Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Nov, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1
研究论文 通过深度学习从H&E染色组织图像推断虚拟RNA表达,揭示结直肠癌转移相关通路 首次在大规模结直肠癌空间转录组数据集上训练虚拟RNA推断模型,利用多种先进深度学习架构实现从常规H&E图像推断近细胞分辨率的空间基因表达,无需进行昂贵的空间转录组实验 某些肿瘤相关通路无法完全通过组织学图像捕获,模型对‘组织学相关’通路的推断效果较好但对其他通路覆盖有限 开发并验证一种从常规H&E染色图像推断空间转录组水平分子信息的方法,用于大规模流行病学研究中肿瘤微环境表征和预后评估 结直肠癌患者的原发肿瘤组织样本及其对应H&E染色图像和空间转录组数据 数字病理学 结直肠癌 HE染色成像,空间转录组测序,虚拟RNA推断 UNI,ResNet-50,视觉Transformer,Vision Mamba 组织图像,基因表达数据 45名结直肠癌患者的超过30万个Visium斑点 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
37 2026-04-25
Deciphering genetic associations with blood pressure in peripheral blood mononuclear cells through single-cell transcriptomic profiling
2025-11, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension IF:4.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析,解析外周血单核细胞中与血压相关的遗传关联 利用单细胞转录组测序结合全基因组关联研究和孟德尔随机化方法,在免疫细胞亚型中识别与血压相关的候选基因,并发现ERAP2在CD8+ T细胞和自然杀伤细胞中的显著失调 样本量较小(10个个体用于测序,8个个体用于验证),可能限制结果的泛化性 鉴定与血压相关的免疫细胞特异性功能基因 外周血单核细胞中的免疫细胞亚型 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 10个个体(111,694个细胞)用于测序,8个个体(28,919个细胞)用于验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
38 2026-04-25
Myocardial reprogramming by HMGN1 underlies heart defects in trisomy 21
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文鉴定出HMGN1基因是21三体综合征(唐氏综合症)相关先天性心脏缺陷的关键驱动因子 首次将HMGN1鉴定为21号染色体上影响房室管发育的剂量敏感基因,并通过单细胞转录组学、CRISPR激活筛选和动物模型验证其致病机制 研究主要依赖人诱导多能干细胞和转基因小鼠模型,可能需要更多临床样本验证结果 阐明21三体综合征中先天性心脏缺陷的遗传机制 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞、唐氏综合症转基因小鼠模型 数字病理学、机器学习 唐氏综合症、先天性心脏缺陷 单细胞转录组学、CRISPR激活筛选、CROP-seq 单细胞RNA测序、CRISPR激活筛选 基因表达数据 人诱导多能干细胞系、小鼠胚胎心脏样本(具体数量未在摘要中明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' RNA测序、CROP-seq筛选
39 2026-04-23
Role of long-chain acyl-CoA synthetases in MASH-driven hepatocellular carcinoma and ferroptosis
2025-Nov-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
研究论文 本研究通过整合多种组学技术,揭示了长链酰基辅酶A合成酶(ACSLs)在MASH驱动的肝细胞癌(MASH-HCC)脂质代谢重编程和铁死亡敏感性中的关键作用 首次在MASH-HCC中系统描绘了脂质代谢全景图,并在单细胞水平上揭示了ACSL4在肿瘤组织和免疫微环境中的特异性表达模式及其与铁死亡敏感性的关联 研究主要基于观察性数据,ACSLs在MASH-HCC中的具体功能机制和作为治疗靶点的潜力仍需进一步实验验证 探究MASH-HCC中脂质代谢重编程的特征及其与铁死亡敏感性的关系,以寻找新的治疗靶点 人类MASH-HCC组织样本、人类HCC细胞系、饮食诱导的小鼠MASH-HCC模型 数字病理学 肝细胞癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 人类MASH和MASH-HCC肝脏样本(具体数量未明确说明),人类HCC细胞系,小鼠MASH-HCC模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
40 2026-04-21
Tracking clonal evolution during treatment in ovarian cancer using cell-free DNA
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究开发了CloneSeq-SV方法,结合单细胞全基因组测序和靶向深度测序,利用克隆特异性结构变异追踪卵巢癌治疗过程中的克隆演化 利用肿瘤克隆特异性结构变异作为高灵敏内源性cfDNA标志物,实现治疗过程中共存克隆群体的相对丰度测量和进化分析 研究样本量有限(18例患者),且主要针对高级别浆液性卵巢癌,可能不适用于其他癌症类型 研究高级别浆液性卵巢癌治疗过程中耐药性的克隆演化机制 高级别浆液性卵巢癌患者 基因组学 卵巢癌 单细胞全基因组测序,靶向深度测序,单细胞RNA测序 NA 基因组DNA,细胞游离DNA,RNA 18例患者 NA 单细胞全基因组测序,靶向深度测序,单细胞RNA测序 NA NA
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