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当前共找到 923 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-09-20 |
Uncovering the role of RNA binding proteins in colorectal cancer through single-cell transcriptomic analysis
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29678-9
PMID:41309865
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研究论文 | 通过批量转录组和单细胞转录组分析，结合qRT-PCR验证，揭示RNA结合蛋白在结直肠癌发生发展中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 整合TCGA批量转录组数据和单细胞RNA测序数据，系统鉴定了结直肠癌相关的RNA结合蛋白，并揭示了其在正常组织、腺瘤和癌组织不同细胞类型中的特异性表达模式 | 单细胞RNA测序数据仅来自4位患者，样本量较小；验证实验仅纳入15对配对组织样本，仍需更大规模的队列研究加以验证 | 探索RNA结合蛋白在结直肠癌进展中的作用，评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌患者组织样本（正常组织、腺瘤组织和癌组织），以及TCGA-COAD和TCGA-READ队列数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR | 单因素Cox回归分析 | 转录组数据, 图像, 文本 | 4位患者的单细胞RNA测序数据（正常、腺瘤和癌组织），15对配对结直肠癌肿瘤及癌旁正常组织样本，以及TCGA批量转录组和临床数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-09-20 |
Monocyte/macrophage-derived NLRP3 Promotes the Onset and Progression of Ankylosing Spondylitis Via the NOD-like Receptor Pathway
2025-Nov-26, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01961-4
PMID:41291215
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研究论文 | 本研究通过血液检测、GEO转录组数据和单细胞测序，揭示单核/巨噬细胞来源的NLRP3通过NOD样受体信号通路促进强直性脊柱炎的发病和进展 | 首次鉴定出强直性脊柱炎中经典单核细胞-巨噬细胞-炎性巨噬细胞分化轨迹，并发现NLRP3通过NOD样受体信号通路驱动疾病进展，同时识别了多个调控因子和潜在治疗药物 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明强直性脊柱炎的致病通路并探索潜在治疗策略 | 强直性脊柱炎患者和骨折对照患者的血液及骨髓样本 | 单细胞转录组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 文本, 基因表达数据 | 强直性脊柱炎患者和骨折对照患者的血液样本用于血常规检测，骨髓样本用于单细胞测序（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-09-20 |
Differential regulation of 5-lipoxygenase and leukotriene-C4-synthase expression by IFNγ, IL-4 and IL-13 in human monocytes and macrophages from patients with atopic dermatitis
2025-Nov-26, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02108-2
PMID:41296013
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研究论文 | 该研究通过重新分析特应性皮炎皮损的单细胞RNA测序数据，并结合体外实验，探究了IFNγ、IL-4和IL-13对人类单核细胞和巨噬细胞中5-脂氧合酶和白细胞三烯C4合酶表达的差异调控作用 | 在单细胞水平上分析了特应性皮炎皮损中5-LO/ALOX5和LTC4S的表达，并首次系统比较了Th1细胞因子IFNγ与Th2细胞因子IL-4、IL-13对特应性皮炎患者单核细胞和巨噬细胞中5-LO/ALOX5和LTC4S表达的差异调控作用 | 体外实验使用GM-CSF或M-CSF诱导的巨噬细胞可能不能完全模拟体内特应性皮炎皮损中巨噬细胞的真实状态，且单核细胞来源的巨噬细胞与组织驻留巨噬细胞可能存在差异 | 研究特应性皮炎皮损中5-LO/ALOX5和LTC4S在单细胞水平的表达，以及Th1和Th2细胞因子对特应性皮炎患者和健康志愿者单核细胞及巨噬细胞中这两种酶表达的调控作用 | 特应性皮炎患者皮损组织、特应性皮炎患者外周血单核细胞、健康志愿者外周血单核细胞及匿名供者外周血单核细胞 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序, q-PCR, 免疫细胞化学 | NA | 图像, 文本 | 特应性皮炎皮损活检组织的单细胞RNA测序数据（来自已发表研究），以及特应性皮炎患者、健康志愿者和匿名供者的外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-09-20 |
Cross-species identification of conserved cell-type specific mechanisms during early placenta development in ruminants
2025-Nov-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29895-2
PMID:41298965
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研究论文 | 本研究整合了绵羊和牛早期胎盘发育过程中的单细胞RNA测序数据，跨物种鉴定了保守的细胞类型特异性机制 | 首次跨物种整合绵羊和牛早期胎盘发育的单细胞RNA测序数据，发现了两个牛特有的滋养层细胞簇，并揭示了EMT在反刍动物早期胎盘形成中的潜在关键作用 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 在细胞类型水平上理解正常胎盘发育，揭示反刍动物早期胎盘发育中保守的细胞类型特异性机制 | 绵羊和牛的早期胎盘组织 | 单细胞组学 | 妊娠丢失 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-09-20 |
Mapping cellular interactions and communication landscapes in cervical cancer via single-cell transcriptomics
2025-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04040-7
PMID:41291352
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研究论文 | 该研究通过重新分析宫颈癌单细胞RNA测序数据，并结合qPCR和ELISA验证，全面刻画了宫颈癌肿瘤微环境中的细胞多样性、细胞间通讯网络及分子特征 | 整合了单细胞转录组学、细胞间通讯映射、MIF通路分析、时间轨迹建模和通路富集分析，并结合20对肿瘤与癌旁组织的qPCR和ELISA实验验证，系统揭示了宫颈癌微环境中以癌相关成纤维细胞为核心的MIF信号网络及ISG15等关键调控因子 | 研究主要基于公共数据库GSE236738的二次分析，样本来源有限；验证实验仅纳入20例患者，样本量较小；缺乏功能实验验证关键基因的生物学机制 | 阐明宫颈癌组织的细胞多样性、细胞间信号网络及潜在分子过程 | 宫颈癌组织及配对癌旁非肿瘤宫颈组织的单细胞转录组数据及临床样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、qPCR、ELISA | UMAP、t-SNE、时间轨迹建模 | 单细胞转录组数据、图像、文本 | 公共数据集GSE236738的单细胞RNA测序数据，以及20例患者的配对肿瘤与癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-09-20 |
Vascular dementia increases levels of methylenetetrahydrofolate reductase and cystathionine β-synthase in female patients and changes gene expression of acetylcholine and glutamate clathrin-sculpted transport vesicles
2025-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.689865
PMID:41394563
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研究论文 | 本研究通过分析血管性痴呆患者死后脑组织，检测一碳代谢相关酶和神经递质标志物的水平，并进行空间转录组学分析，揭示血管性痴呆的分子机制。 | 首次在血管性痴呆患者中结合性别因素详细分析一碳代谢酶的表达，并利用空间转录组学揭示了谷氨酸和乙酰胆碱包涵素 sculpted 运输囊泡基因表达的变化。 | 样本量较小，特别是空间转录组学仅分析了4个样本；仅分析了皮质组织，可能无法全面反映血管性痴呆的病理变化。 | 旨在提供血管性痴呆背景下的一碳代谢的详细分子画像，揭示潜在的分子机制。 | 女性及男性血管性痴呆患者和对照组的死后皮质组织。 | 数字病理学 | 血管性痴呆 | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 未明确说明总样本量，但空间转录组学分析了4个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2026-09-20 |
Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb
2025-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.23.689776
PMID:41394637
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研究论文 | 该研究通过高通量测序方法定义了小鼠前肢起始的四个发育阶段，并利用单细胞RNA测序鉴定了前肢起始时体侧板中胚层的转录谱及TBX5候选靶基因 | 首次利用多种高通量测序技术（RNA-seq、scRNA-seq、ChIP-seq、Ribo-ITP）系统定义了前肢起始的四个不同阶段，并鉴定了新生前肢的特异性基因特征，发现这些基因高度富集TBX5结合位点，提出了TBX5驱动肢体起始的新机制模型 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 定义前肢起始的时间阶段，并确定体侧板中胚层中前肢特异性转录的起始及其调控机制 | 小鼠胚胎体侧板中胚层及前肢芽 | 发育生物学、基因组学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP | NA | 转录组数据、表观遗传数据、翻译谱数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP | NA | NA |
| 28 | 2026-09-20 |
Mapping embryonic mouse lung development using enhanced spatial transcriptomics
2025-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.22.688293
PMID:41394655
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研究论文 | 该研究优化了基于微流控的确定性条形码测序（DBiT-seq）工作流程，对早期胚胎小鼠肺组织切片进行高灵敏度空间转录组映射，揭示了上皮祖细胞的空间分布变化及一个促进胚胎肺神经支配的间充质细胞簇 | 优化了DBiT-seq工作流程以实现早期胚胎小鼠肺组织的高灵敏度空间映射；发现了上皮祖细胞在早期阶段分布于整个上皮树、随后才局限于远端末端；识别出一个此前未被认识的间充质细胞簇，该细胞簇高表达细胞外基质蛋白并似乎促进胚胎肺神经支配 | NA | 研究成熟哺乳动物肺中约50种不同细胞类型的空间模式在发育过程中如何逐步建立 | 早期胚胎小鼠肺组织 | 空间转录组学 | NA | DBiT-seq（确定性条形码测序） | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | DBiT-seq | 基于微流控的确定性条形码测序（DBiT-seq）工作流程，优化后用于早期胚胎小鼠肺组织切片的高灵敏度空间映射 |
| 29 | 2026-09-20 |
The prognostic value and functional role of CPSF3 in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29527-9
PMID:41286303
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研究论文 | 该研究通过多组学分析和实验验证系统评估了CPSF3在肝细胞癌中的表达、临床意义和功能机制 | 首次系统揭示CPSF3在肝细胞癌中的诊断和预后价值，并通过单细胞测序阐明其在恶性细胞和增殖T细胞中的表达特征及与免疫浸润的关联 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 评估CPSF3在肝细胞癌中的表达、临床意义和功能作用，探索其作为诊断和预后生物标志物及治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌组织样本和细胞系 | 多组学分析 | 肝癌 | 多组学分析、单细胞测序、功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-09-20 |
Single-cell RNA sequencing revealed the association between proximal tubular epithelial cells and renal interstitial cells in chronic kidney disease progression
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28988-2
PMID:41286490
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性肾脏病进展中近端肾小管上皮细胞与肾间质细胞的关联 | 识别了一个特定的损伤近端肾小管上皮细胞亚群PT_5，该亚群位于S1段，在CKD进展中逐渐扩张，并通过配体-受体对与巨噬细胞、成纤维细胞、T细胞和NK细胞协调间质重塑 | 研究基于小鼠模型，结果需在人类CKD中进一步验证 | 阐明慢性肾脏病发病过程中损伤近端肾小管上皮细胞的特征及其与特定间质细胞协调促进疾病进展的机制 | 慢性肾脏病小鼠模型 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-09-20 |
Senescence-related gene signatures in Crohn's disease: integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29727-3
PMID:41286494
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，识别了克罗恩病中与衰老相关的基因特征，并构建了诊断模型 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序分析克罗恩病中的衰老相关基因，鉴定了五个枢纽基因并揭示了单细胞水平的衰老异质性 | 未明确说明 | 识别克罗恩病中衰老相关基因及其对预后和疾病进展的影响 | 克罗恩病患者（包括肠道组织和临床样本）及小鼠模型 | 机器学习 | 克罗恩病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法（未具体指定，如随机森林、SVM等） | 基因表达数据（RNA测序） | 未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-09-20 |
Deciphering HTLV-1-associated Lung Pathology through Integrated in vitro and Multi-cohort Multi-omics Analysis: Inflammation, Monocyte Recruitment and Differentiation Triggered by HTLV-1-exposed Alveolar Epithelial Cells
2025-Nov-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8051355/v1
PMID:41356367
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研究论文 | 本研究通过体外共培养模型和多队列多组学分析，揭示了HTLV-1暴露的肺泡上皮细胞通过RELA/NF-κB依赖途径释放炎症因子，触发单核细胞募集与分化，从而导致HTLV-1相关肺部炎症的机制 | 首次建立HTLV-1感染的体外共培养模型（A549上皮细胞与HTLV-1感染的MT-2细胞共培养），重现HTLV-1触发的肺部炎症；利用CRISPR/Cas9 RELA敲除证明CSF-1表达与NF-κB信号通路的机制关联；整合批量与单细胞转录组学、病毒相互作用组学和多祖先GWAS验证体外模型的体内相关性 | 研究主要基于A549细胞系和THP-1细胞的体外模型，可能无法完全反映体内复杂微环境；未涉及HTLV-1感染患者的直接临床样本验证；摘要中未提供具体样本量信息 | 评估HTLV-1感染对肺部炎症的影响，阐明HTLV-1暴露的肺泡上皮细胞触发单核细胞募集和分化的分子机制，并通过多组学分析验证体外模型的体内相关性 | A549肺泡上皮细胞、HTLV-1感染的MT-2细胞、THP-1单核细胞、原代单核细胞，以及多队列多组学数据 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌, 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 病毒相互作用组学, 多祖先GWAS, RT-qPCR, CRISPR/Cas9 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-09-20 |
Identification of Distinct Topological Structures From High-Dimensional Data
2025-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672446
PMID:41394587
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研究论文 | 该文章提出了一种名为ID的方法，通过构建高维数据的低维参数化并施加有限扰动来识别基因集，从而解卷积单细胞RNA测序数据中重叠的生物学过程 | 提出ID方法，通过构建替代低维参数化并施加有限扰动来识别响应相似的基因，能够发现传统方法遗漏的数据结构 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别调控细胞分化、细胞周期等重叠生物学过程的基因集，以解卷积高维单细胞RNA测序数据中的复杂生物学过程 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达谱和细胞状态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-09-20 |
LRP12 promotes gastric cancer progression through AKT/mTOR signaling and M2 macrophage-mediated immunosuppression
2025-Nov-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28503-7
PMID:41276539
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研究论文 | 该研究通过整合公共数据集和内部队列，构建了基于炎症反应相关基因的免疫相关预后模型，并鉴定出LRP12作为胃癌预后标志物，通过AKT/mTOR信号通路和M2巨噬细胞介导的免疫抑制促进胃癌进展 | 首次将LRP12鉴定为炎症反应相关基因相关的胃癌预后标志物，并揭示其通过AKT/mTOR信号通路促进肿瘤增殖侵袭以及通过M2巨噬细胞介导免疫抑制的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别能够预测预后并调节肿瘤免疫微环境的炎症相关生物标志物，重点关注LDL受体相关蛋白12（LRP12）在胃癌中的作用 | 胃癌患者样本及胃癌细胞系 | 数字病理学、机器学习 | 胃癌 | 单细胞转录组学、多重免疫荧光、免疫组化、Western blotting | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-09-20 |
Determining gene specificity from multivariate single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.689845
PMID:41332587
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研究论文 | 该论文提出了一种基于熵的基因特异性度量方法 ember，用于分析单细胞RNA测序数据中的基因特异性，并在小鼠组织和人类PBMC数据集中进行了应用 | 提出了满足四个关键属性公理化要求的唯一特异性度量方法 ember，并开发了全面的特异性数据库、网页界面和API | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 识别对生物类别或实验条件具有特异性的基因，并建立基因特异性度量标准 | 八种组织（来自八种近交系小鼠品系）以及来自255名多样化个体的人类PBMC数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督学习 | 文本 | 八种小鼠组织（来自八种近交系小鼠品系）以及来自255名多样化个体的人类PBMC数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-09-20 |
Orchestrating Spatial Transcriptomics Analysis with Bioconductor
2025-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.20.688607
PMID:41332620
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研究论文 | 本文介绍了使用Bioconductor进行空间转录组学分析的开放获取在线书籍，包含可重复的代码示例、数据集和讨论 | 提供了一个免费、开源、持续更新和测试的在线书籍，涵盖空间组学数据分析工作流，并包括与Python的互操作性 | 未明确提及 | 为空间转录组学数据分析提供多步骤工作流和资源，使用Bioconductor在R中实现 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2026-09-20 |
Single Cell and Spatial Transcriptomics Identify Novel Immune-Stromal Interactions in Cardiac Allograft Vasculopathy
2025-Nov-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7812112/v1
PMID:41333445
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，表征人类冠状动脉的心脏移植血管病变（CAV），揭示其独特的细胞和转录景观及免疫-基质相互作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学详细描述CAV的独特细胞和转录景观，发现调节性血管平滑肌细胞和巨噬细胞亚群主导CAV新生内膜，并揭示1型干扰素介导的炎症传播机制 | 研究主要基于人类样本的转录组学描述和小鼠模型的验证，但样本量有限，且未涉及其他潜在信号通路或长期临床结局的全面评估 | 表征CAV的细胞和转录景观，识别驱动疾病发病机制的分子信号，并探索潜在治疗靶点 | 人类冠状动脉组织（包括CAV、动脉粥样硬化冠状动脉疾病和非疾病对照）以及小鼠CAV模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 人类冠状动脉组织样本（具体数量未指定）和小鼠CAV模型 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2026-09-20 |
Lymphotoxin-driven cancer cell eradication by tumoricidal CD8+ TIL
2025-Nov-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.19.689204
PMID:41332750
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研究论文 | 本文通过患者来源的TIL-黑色素瘤共培养、全基因组CRISPR筛选、单细胞RNA测序和单细胞TCR测序，鉴定了一类新的CD8+ TIL亚群，其通过淋巴毒素β受体和干扰素感知通路以不依赖I类HLA的方式裂解癌细胞 | 发现了一类新的CD8+ TIL亚群，能够以不依赖I类HLA的方式裂解癌细胞；通过全基因组功能缺失CRISPR筛选提名LTβR和IFN感知通路为关键决定因素；证实LTβR和IFN感知双重信号是癌细胞裂解的必要充分条件；利用配对scRNA-seq和scTCR-seq数据证实LTB+ T细胞富集与TIL临床反应相关，且LTB+ TIL来源于切除肿瘤中推定的新抗原反应性CD8+ T细胞 | 摘要未明确提及研究的局限性 | 研究TIL中负责肿瘤根除的关键亚群，鉴定介导癌细胞杀伤的分子通路，并阐明其与临床反应的关系 | 患者来源的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）和黑色素瘤细胞，以及切除肿瘤组织中的CD8+ T细胞 | 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 | 黑色素瘤 | 全基因组CRISPR功能缺失筛选, 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 细胞共培养 | NA | 图像, 文本 | 患者来源的TIL-黑色素瘤共培养样本、切除肿瘤组织（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞转录组和TCR测序 |
| 39 | 2026-09-20 |
Serum Procalcitonin: A Novel Tumor Biomarker for Diagnosis and Follow-Up in Fibrolamellar Hepatocellular Carcinoma
2025-Nov-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.11.18.25340286
PMID:41332840
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研究论文 | 本研究探讨血清降钙素原（PCT）作为纤维板层型肝细胞癌（FLC）诊断和随访的新型肿瘤生物标志物的价值，通过测量血清PCT水平、RNA测序分析CALCA表达、空间转录组学和免疫组化验证，发现PCT在FLC中敏感且特异 | 首次发现并验证血清PCT是FLC敏感且特异的生物标志物，并在肿瘤组织水平证实CALCA过表达和PCT过表达，且PCT水平变化与治疗反应相关 | 样本量较小（18例FLC患者），为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性研究进一步验证 | 探究PCT作为FLC诊断和随访生物标志物的潜力 | FLC患者、HCC患者、CCA患者、肝硬化患者、肝母细胞瘤、肝细胞腺瘤及非肿瘤肝组织样本 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、空间转录组学、免疫组化 | NA | 血清生化数据、基因表达数据、空间转录组数据、图像 | 血清样本：18例FLC患者34份样本、64例HCC、24例CCA、20例肝硬化；RNA测序：27例FLC肿瘤、331例HCC肿瘤、39例CCA肿瘤、71例肝母细胞瘤、34例肝细胞腺瘤、55例非肿瘤肝样本；空间转录组学：3例FLC；免疫组化：13例FLC和34例其他原发或继发性肝癌 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2026-09-20 |
A Multimodal Atlas Reveals the Anatomical Distribution of Medium Spiny Neuron Subtypes and a Novel RGS6+ Population in the Primate Striatum
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.16.688724
PMID:41332519
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研究论文 | 结合单核多组学测序和高通量空间转录组学，构建了猕猴纹状体中中型棘神经元（MSN）的综合图谱，揭示了新的RGS6+群体及其与疾病的关联 | 发现了两个先前未记录的腹侧纹状体亚型D1-VS-RGS6和D2-VS-RGS6，揭示了基质区室细胞类型沿吻尾轴的梯度变化，并将MSN亚型特异性转录组和ATAC-seq调控注释与人类GWAS数据整合，证明了帕金森病、物质使用障碍及精神疾病的多基因风险在细胞类型特异性上的富集 | 研究基于猕猴模型，结果向人类的转化需谨慎验证；空间转录组数据虽覆盖广泛但可能受限于探针检测灵敏度；未进行功能实验验证新发现的MSN亚型 | 构建灵长类纹状体MSN的全面图谱，解析MSN的分子多样性、解剖分布及其与疾病遗传风险的关联 | 猕猴纹状体中的中型棘神经元（MSN） | 空间转录组学, 单细胞多组学 | 帕金森病, 物质使用障碍, 精神分裂症, 双相情感障碍 | 单核多组学测序, 高通量空间转录组学, ATAC-seq | NA | 图像, 文本 | 约540万个空间分辨细胞，覆盖纹状体吻尾和背腹全范围；多组学测序覆盖四个解剖和功能定义的区域 | 10x Genomics | 单细胞多组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞多组学方案（可能为Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression），10x Visium空间转录组学 |