单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1144 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-11-29 |
Multiplexed Transcriptomics for Screening Drug Combinations and Defining the Mechanism of Action of HCC Therapeutics at Single-Cell Resolution
2025-Nov-27, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70148
PMID:41308634
|
研究论文 | 本研究利用高通量单核测序平台筛选肝癌治疗药物组合，并通过单细胞转录组学分析揭示HY组合通过诱导铁死亡抑制肿瘤细胞增殖的机制 | 首次将高通量单细胞筛选与机制解析相结合，在单细胞分辨率下系统评估药物组合对肝癌细胞的影响并发现JUN是关键调控因子 | 研究主要聚焦于HY药物组合，其他潜在有效组合可能需要进一步探索 | 筛选抗肝癌药物组合并阐明其作用机制 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单核测序，单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | snHH-seq | 高通量高灵敏度单核测序平台 |
| 342 | 2025-11-29 |
Construction of a Multitissue Cell Atlas Reveals Cell-Type-Specific Regulation of Molecular and Complex Phenotypes in Pigs
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504961
PMID:41309493
|
研究论文 | 构建了猪多组织细胞图谱，揭示细胞类型特异性调控对分子和复杂表型的影响 | 首次在猪中构建大规模单细胞转录组图谱，发现细胞类型特异性eQTL与复杂性状的关联，并揭示猪人类同源基因对人类复杂表型的遗传力富集 | 仅基于19个组织的样本，可能未覆盖所有猪组织类型；样本数量相对有限 | 系统解析猪组织细胞异质性和细胞类型特异性调控机制 | 猪多组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA-seq数据 | 229,268个高质量细胞核来自19个组织，3,921个批量RNA-seq样本来自17个匹配组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 343 | 2025-11-29 |
scPER: A Rigorous Computational Approach to Determine Cellular Subtypes in Tumors Aligned With Cancer Phenotypes From Total RNA Sequencing
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514502
PMID:41309494
|
研究论文 | 开发了一种名为scPER的计算方法，通过整合单细胞RNA测序数据来估计肿瘤微环境细胞组成并识别与表型相关的细胞亚群 | 结合对抗自编码器和极端梯度提升技术，能够从混杂因素中分离真实信号，在细胞比例估计方面优于现有多种方法 | NA | 开发一种严谨的计算方法来确定与癌症表型一致的肿瘤细胞亚型 | 肿瘤微环境中的细胞组成和表型相关细胞亚群 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，总RNA测序 | 对抗自编码器，极端梯度提升 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 344 | 2025-11-29 |
Lifting regenerative barriers promotes epithelial cell fate plasticity supporting lineage conversion
2025-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66446-9
PMID:41309646
|
研究论文 | 本研究揭示了调控成年上皮细胞命运可塑性的再生屏障机制 | 发现HIF1a-SOX9轴作为上皮细胞命运可塑性的关键调节因子，揭示了限制细胞身份转换的谱系转换屏障 | 食管细胞向皮肤谱系转换过程效率极低，表明存在尚未完全解析的调控机制 | 探究限制成年细胞命运可塑性的调控机制 | 成年上皮细胞，特别是食管细胞和皮肤细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序，谱系追踪，3D再生培养系统 | NA | 基因表达数据，组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 345 | 2025-11-29 |
A novel zinc finger protein gene signature for prognostic prediction, tumor microenvironment characterization, and therapeutic response in uterine corpus endometrial carcinoma
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28415-6
PMID:41309884
|
研究论文 | 本研究首次利用锌指蛋白基因开发了子宫体子宫内膜癌预后预测模型，并分析了其与肿瘤微环境、免疫治疗反应的关系 | 首次系统研究锌指蛋白家族基因在子宫体子宫内膜癌中的作用，建立了基于8个预后相关ZNF基因的风险评分系统 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索锌指蛋白基因在子宫体子宫内膜癌中的预后价值及治疗指导意义 | 子宫体子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 转录组分析，单细胞RNA测序，免疫组织化学，定量蛋白质组学 | COX回归，LASSO回归，风险评分模型 | 转录组数据，临床数据，单细胞RNA测序数据，蛋白质组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的子宫内膜癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2025-11-29 |
Dissecting neuroblastoma heterogeneity through single-cell multi-omics: insights into development, immunity, and therapeutic resistance
2025-Nov-27, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03635-2
PMID:41309932
|
综述 | 通过单细胞多组学技术解析神经母细胞瘤异质性，揭示其发育起源、免疫微环境和治疗耐药机制 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间分析技术，首次系统描绘神经母细胞瘤的肾上腺素-间充质连续谱系状态和肿瘤可塑性机制 | NA | 解析神经母细胞瘤异质性并探索治疗耐药机制 | 神经母细胞瘤肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞多组学技术，包括单细胞转录组学、表观基因组学、空间分析 | NA | 单细胞多组学数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 347 | 2025-11-29 |
Lactylation-related gene signatures define immune heterogeneity and provide diagnostic biomarkers for periodontitis
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30213-z
PMID:41310117
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示乳酰化相关基因在牙周炎免疫调控中的关键作用，并建立诊断标志物 | 首次系统研究乳酰化相关基因在牙周炎中的作用，通过整合机器学习算法和单细胞测序技术识别核心诊断标志物 | 研究样本量有限，主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证机制 | 探索乳酰化相关基因在牙周炎免疫调控中的作用并开发诊断生物标志物 | 牙周炎患者和健康对照者的牙龈组织及外周血单核细胞 | 生物信息学 | 牙周炎 | 微阵列基因表达分析, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | LASSO回归, 随机森林, XGBoost, 非负矩阵分解 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 来自GSE10334和GSE16134队列的牙龈组织样本及外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列基因表达分析 | NA | NA |
| 348 | 2025-11-29 |
Engineering CCR2/IFN-γ overexpression in enucleated mesenchymal stem cells enhances therapy for rheumatoid arthritis
2025-Nov-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09248-5
PMID:41310172
|
研究论文 | 本研究开发了过表达CCR2和IFN-γ的去核人间充质干细胞，用于增强类风湿性关节炎治疗 | 首次创建了保留关键细胞器并具有免疫调节、旁分泌和归巢能力的去核人间充质干细胞 | 研究仅在雄性大鼠模型中进行验证，缺乏人类临床试验数据 | 开发更安全有效的类风湿性关节炎细胞治疗方法 | 人间充质干细胞和去核人间充质干细胞 | 细胞治疗 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 349 | 2025-11-29 |
A deep learning-based multiscale integration of spatial omics with tumor morphology
2025-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66691-y
PMID:41310346
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习的多尺度整合方法，将空间转录组学与肿瘤形态学相结合 | 开发了能够从常规H&E染色切片预测空间转录组数据的深度学习模型MISO，实现接近单细胞分辨率的空间基因表达预测 | NA | 整合空间转录组学与常规病理切片，实现从H&E图像预测基因表达 | 肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学，深度学习 | 深度学习模型 | 图像，基因表达数据 | 72个10X Genomics Visium样本 + 348个MOSAIC联盟样本 | 10X Genomics | 空间转录组学 | 10X Visium | 10X Genomics Visium空间转录组平台 |
| 350 | 2025-11-29 |
p75NTR alleviates diabetic periodontitis in mice by inhibiting inflammatory macrophage recruitment
2025-Nov-27, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-025-07220-7
PMID:41310587
|
研究论文 | 本研究探讨p75NTR通过抑制炎症巨噬细胞募集缓解糖尿病牙周炎的作用机制 | 首次揭示p75NTR缺失通过调节巨噬细胞异质性和炎症因子分泌缓解糖尿病牙周炎 | 研究仅使用小鼠模型，样本量较小（每组6只），缺乏临床验证 | 探究p75NTR在糖尿病牙周炎中对巨噬细胞的影响及作用机制 | p75NTR野生型和基因敲除小鼠模型 | 免疫学 | 糖尿病牙周炎 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，Micro-CT，组织学染色 | NA | 基因表达数据，影像数据，组织学数据 | 24只健康雄性小鼠（WT和KO各12只），分为4组每组6只 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 351 | 2025-11-29 |
Location and aetiology are determinants of fibroblast activation and heterogeneity in the failing human heart
2025-Nov-27, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01580-z
PMID:41310709
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序分析人类左心室组织，揭示了心力衰竭中成纤维细胞的异质性和空间分布特征 | 首次在人类衰竭心脏中系统描绘了成纤维细胞亚群的异质性、空间分布及其在不同病因（缺血性和扩张型心肌病）中的特异性激活模式 | 样本量相对有限（共20例），且仅分析了终末期心力衰竭患者，未涵盖疾病早期阶段 | 探究人类衰竭心脏中成纤维细胞的异质性和空间分布特征，及其在不同病因和纤维化类型中的作用机制 | 人类左心室组织样本，包括非衰竭心脏、扩张型心肌病心脏、缺血性心肌病心脏及梗死瘢痕区域 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序，空间转录组学，生物信息学分析 | 聚类分析，差异表达分析，配体-受体推断，伪时间轨迹映射 | RNA测序数据，空间转录组数据 | 20例人类左心室组织样本（非衰竭4例，扩张型心肌病6例，缺血性心肌病5例，梗死瘢痕5例） | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 352 | 2025-11-29 |
In vitro models to mimic tumor endothelial cell-mediated immune cell reprogramming in lung adenocarcinoma
2025-Nov-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03576-4
PMID:41310721
|
研究论文 | 本研究通过体外模型探究非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞对免疫细胞的重编程作用 | 首次使用2D和3D共培养模型系统研究TEC介导的免疫调控，并通过单细胞RNA测序发现TEC新亚群和血管周M2样巨噬细胞亚群 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 阐明非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞调控免疫细胞群的分子机制 | 非小细胞肺癌细胞、正常内皮细胞、免疫细胞（T细胞、巨噬细胞） | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、激酶组学分析 | 2D和3D共培养模型、多细胞肿瘤球体模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 353 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07491-2
PMID:41310748
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2025-11-29 |
A fibroblast-specific gene signature as a therapeutic target for glioblastoma developed based on the characteristics of tumor microenvironment
2025-Nov-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03528-w
PMID:41310846
|
研究论文 | 基于胶质母细胞瘤肿瘤微环境中成纤维细胞特征开发风险评分模型用于预后预测和治疗指导 | 首次基于单细胞RNA测序识别成纤维细胞特异性基因构建6基因风险评分模型，并验证VWA1基因在胶质母细胞瘤中的功能 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发胶质母细胞瘤预后预测模型并识别潜在治疗靶点 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，qPCR，CCK-8，伤口愈合实验，Transwell实验 | 风险评分模型，Lasso Cox回归 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | GSE273274队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 355 | 2025-11-29 |
CRATER tumor niches facilitate CD8+ T cell engagement and correspond with immunotherapy success
2025-Nov-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.09.021
PMID:41109214
|
研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学技术鉴定出促进免疫治疗反应的肿瘤微环境结构CRATER | 首次在斑马鱼和人类黑色素瘤中发现CRATER结构，揭示其作为CD8+T细胞与肿瘤细胞相互作用的关键区域 | 研究主要聚焦于黑色素瘤，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索免疫治疗中T细胞与肿瘤细胞相互作用的时空动态机制 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | NA | 图像、空间转录组数据 | 斑马鱼和人类黑色素瘤样本（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 356 | 2025-11-29 |
Gut microbiota L-ornithine promotes resistance to obesity through metabolites mediated immunosuppressive macrophages
2025-Nov-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05882-8
PMID:41291317
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物L-鸟氨酸通过调控巨噬细胞功能抵抗肥胖的新机制 | 首次发现L-鸟氨酸通过下游代谢物精胺和亚精胺调控巨噬细胞向免疫抑制表型极化，从而抵抗肥胖 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肠道微生物代谢物在肥胖发病机制中的保护作用 | 小鼠模型和肥胖人群 | 代谢疾病研究 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和肥胖人群样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2025-11-29 |
MHC-II-restricted neoantigen vaccine reverses immune microenvironment and overcomes resistance to immune-checkpoint inhibitors in cold tumors
2025-Nov-26, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2025.100936
PMID:41308654
|
研究论文 | 本研究探讨了MHC-II限制性新抗原疫苗如何重塑冷肿瘤的免疫微环境并与TIGIT阻断剂协同克服免疫检查点抑制剂耐药性 | 首次证明MHC-II限制性新抗原疫苗可逆转冷肿瘤的免疫抑制微环境，并通过NicheNet分析发现PVR-TIGIT轴作为联合治疗靶点 | 研究仅使用B16F10小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 开发克服冷肿瘤对免疫检查点抑制剂耐药性的联合治疗策略 | B16F10小鼠肿瘤模型 | 免疫肿瘤学 | 肿瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,NicheNet分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 358 | 2025-11-29 |
Impact of single-cell cell cycle regulation of intercellular communication on the prognosis of hepatocellular carcinoma in the tumor microenvironment
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01963-x
PMID:41286375
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯对肿瘤进展和患者预后的影响 | 首次在单细胞水平系统分析肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯网络的相互作用及其临床意义 | 样本量相对有限，仅分析了两个单细胞RNA测序数据集 | 探究肝癌肿瘤微环境中细胞周期调控与细胞间通讯对患者预后的影响机制 | 肝癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞转录组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NMF聚类，CellChat，Monocle，SCENIC | 单细胞RNA测序数据 | 24,637个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 359 | 2025-11-29 |
Decoding colorectal cancer chemotherapy and immunotherapy resistance: revealing the role of NOL3 using single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01913-7
PMID:41286470
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习揭示了NOL3在结直肠癌化疗和免疫治疗耐药中的关键作用 | 首次系统探索缺氧与18种程序性细胞死亡特征之间的关联，并识别NOL3作为结直肠癌预后关键标志物 | 研究基于回顾性多中心队列，需要进一步的前瞻性验证 | 探索结直肠癌化疗和免疫治疗耐药的分子机制 | 结直肠癌患者和癌细胞系 | 机器学习,数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,机器学习,MTT测定,Western blot | XGBoost,RR,RF | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 4个多中心队列共1294例样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 360 | 2025-11-29 |
Lineage plasticity and signal dysregulation define the cellular trajectory of osteoarthritis progression
2025-Nov-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01947-x
PMID:41286526
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索骨关节炎进展过程中细胞谱系的可塑性变化及其与信号通路失调的关系 | 首次系统揭示骨关节炎中PreFC细胞向FC和preHTC细胞转化的轨迹，并鉴定HIF1A和ANGPTL4为关键分子调控因子 | NA | 探索骨关节炎进展的细胞轨迹和分子机制，为精准治疗提供新靶点 | 骨关节炎患者的关节软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，KEGG和GO富集分析，伪时间轨迹分析，体外实验验证 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |