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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-11-30 |
Monocyte-derived cells promote transient insult-induced brain injury by enhancing CD8+ T cell response
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116528
PMID:41205172
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现单核来源细胞通过增强CD8+ T细胞反应促进短暂损伤诱导的脑损伤 | 首次揭示单核来源的cDC2样细胞在脑损伤中通过CD28-CD80/CD86共刺激信号调控CD8+ T细胞反应的新机制 | 研究主要基于辐射诱导脑损伤模型,其他类型脑损伤的普适性需要进一步验证 | 探究短暂损伤诱导脑损伤中免疫细胞的调控机制 | 辐射诱导脑损伤患者和实验性脑卒中模型 | 单细胞测序分析 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 辐射诱导脑损伤患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 322 | 2025-11-30 |
Multi-omics analyses reveal DjTcf4 critical for proper timing of differentiation in planarian regeneration
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116551
PMID:41231672
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研究论文 | 通过多组学分析揭示DjTcf4在涡虫再生过程中对细胞分化时机的关键调控作用 | 构建了首个涡虫基因组重注释、3D空间转录组、单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序的多组学图谱,发现DjTcf4在再生过程中具有非经典功能 | 研究局限于日本三角涡虫模型,未在其他再生生物中进行验证 | 阐明涡虫再生过程中芽基细胞组成和转录景观的动态变化机制 | 日本三角涡虫(Dugesia japonica)的再生过程 | 发育生物学,再生医学 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,空间转录组,基因组重注释 | NA | 基因组数据,转录组数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,空间转录组 | NA | NA |
| 323 | 2025-11-30 |
Intermediate filaments promote glioblastoma cell invasion by controlling nuclear deformations and mechanosensitive expression of MMP14
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116553
PMID:41241939
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研究论文 | 本研究揭示中间丝通过调控核变形和机械敏感性MMP14表达促进胶质母细胞瘤细胞侵袭的机制 | 发现中间丝在降低细胞变形性的同时反而促进3D侵袭,并阐明其通过缓冲核变形和上调MMP14表达的机械敏感机制 | NA | 探究中间丝在胶质母细胞瘤细胞侵袭中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 324 | 2025-11-30 |
Epigenetic and transcriptional programming of murine eosinophils in the esophagus
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65440-5
PMID:41290588
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序、表观基因组图谱和流式细胞术分析小鼠食管嗜酸性粒细胞在过敏性炎症中的表观遗传和转录编程 | 首次揭示食管嗜酸性粒细胞的组织特异性是通过局部环境信号诱导全基因组表观遗传重编程实现的,并建立了小鼠组织嗜酸性粒细胞的公开表观遗传数据库 | 研究主要基于小鼠模型,虽然显示与人类存在保守性,但需要进一步的人类样本验证 | 探究食管嗜酸性粒细胞在过敏性炎症中的表观遗传和转录调控机制 | 小鼠食管嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 过敏性疾病 | 单细胞测序,表观基因组图谱,流式细胞术,基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,表观基因组学 | NA | NA |
| 325 | 2025-11-30 |
Nivolumab plus ipilimumab induce hyper-progression in renal medullary carcinoma: results of a phase II trial and preclinical evidence
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65462-z
PMID:41290625
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研究论文 | 报告纳武利尤单抗联合伊匹木单抗在肾髓样癌患者中引发超进展的II期临床试验结果及临床前证据 | 首次发现免疫检查点疗法通过CEBPB/p300轴触发肿瘤细胞'髓系拟态'程序导致超进展,并通过p300抑制剂恢复治疗敏感性 | 样本量较小(仅10例患者),需更大规模研究验证 | 评估纳武利尤单抗联合伊匹木单抗治疗肾髓样癌的疗效并探索耐药机制 | 肾髓样癌患者和免疫活性体细胞嵌合基因工程小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肾髓样癌 | 单细胞RNA测序,基因工程小鼠模型 | 免疫活性体细胞嵌合基因工程小鼠模型 | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 10例患者,临床前小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 326 | 2025-11-30 |
The AML cellular state space unveils NPM1 immune evasion subtypes with distinct clinical outcomes
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66546-6
PMID:41290664
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研究论文 | 通过基因组和转录组分析揭示急性髓系白血病的细胞状态空间,发现NPM1突变亚型具有不同的免疫逃逸机制和临床结局 | 首次在单细胞水平将NPM1突变AML分为两个具有不同免疫特征和临床预后的亚型 | 样本量相对有限(120例AML),需要更大规模验证 | 解析急性髓系白血病的细胞异质性并完善其分类系统 | 120例急性髓系白血病患者样本 | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,基因组分析,转录组分析 | 聚类分析 | 单细胞RNA测序数据,基因组数据,转录组数据 | 120例AML患者,包含超过90,000个未成熟AML细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 327 | 2025-11-30 |
Pharmacological induction of acetyl-CoA carboxylase 1 autophagic degradation attenuates lipid accumulation and cholangiocarcinoma progression
2025-Nov-25, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03564-8
PMID:41291880
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高通量筛选发现Withaferin A可通过诱导ACC1自噬降解抑制脂质积累和胆管癌进展 | 首次揭示Withaferin A通过抑制ACC1活性并诱导其自噬降解来阻断脂质合成的分子机制 | 临床前研究阶段,尚未进行人体临床试验 | 探索靶向脂质代谢的胆管癌治疗新策略 | 胆管癌细胞系和动物模型 | 癌症代谢研究 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序, 高通量筛选, 液相色谱-串联质谱 | NA | 基因表达数据, 代谢组学数据 | 994种生物活性化合物筛选 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 328 | 2025-11-30 |
Single-cell dissection of CD8+ T cell-driven immune dysregulation in type 1 diabetes mellitus: Mechanistic links to diabetic foot pathogenesis
2025-Nov-25, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110646
PMID:41308942
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示1型糖尿病中CD8+ T细胞驱动的免疫失调机制及其与糖尿病足发病的潜在联系 | 首次在T1DM中发现耗竭性CD4+ T细胞亚群,揭示GALECTIN-CD44信号轴在免疫细胞间通讯中的关键作用 | 样本量相对有限(77例),仅分析外周血单核细胞而未涉及组织特异性免疫反应 | 解析1型糖尿病的免疫失调机制及其与糖尿病并发症的关联 | 46名3期1型糖尿病患者和31名匹配对照的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 87,542个细胞(来自77名受试者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 329 | 2025-11-30 |
Biphasic inflammation control by fibroblasts enables spinal cord regeneration in zebrafish
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116469
PMID:41134665
|
研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼成纤维细胞通过双相炎症控制促进脊髓再生的机制 | 首次发现成纤维细胞具有诱导和消退炎症的双重功能,并鉴定出瞬时cthrc1a成纤维细胞状态 | 研究仅限于斑马鱼模型,未在哺乳动物中验证 | 探究中枢神经系统再生过程中成纤维细胞与免疫细胞的相互作用机制 | 斑马鱼脊髓损伤模型 | 发育生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2025-11-30 |
Oncogenic Ras activation in permissive somatic cells triggers rapid-onset phenotypic plasticity and elicits a tumor-promoting neutrophil response
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116478
PMID:41138187
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型揭示了致癌Ras激活在24小时内诱导表型可塑性并触发促肿瘤中性粒细胞反应的机制 | 首次在单细胞水平实时观察致癌Ras激活后24小时内的细胞内在反应和先天免疫响应,揭示了表型可塑性与促肿瘤炎症之间的早期关联 | 研究基于斑马鱼模型,在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 探究致癌突变如何触发表型可塑性和肿瘤促进性炎症的早期机制 | 斑马鱼模型中的基底角质形成细胞和中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序, 活体实时成像 | 斑马鱼HRAS介导的皮肤肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据, 活体成像数据 | 斑马鱼模型中的基底角质形成细胞亚群 | NA | 单细胞RNA-seq, 活体成像 | NA | NA |
| 331 | 2025-11-30 |
Exploring the role of β2-microglobulin in the relationship between physical activity and DNAm-predicted PhenoAge: Evidence from a population-based and mice single-cell RNA-sequencing study
2025-Nov-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.047
PMID:41285310
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研究论文 | 本研究通过人群数据和单细胞测序探索β2-微球蛋白在体力活动与表观遗传年龄关系中的中介作用 | 首次结合人群流行病学研究和动物单细胞测序揭示β2M在体力活动延缓衰老中的分子机制 | 观察性研究设计无法确定因果关系,样本量相对有限 | 探究体力活动通过β2M影响表观遗传衰老的分子机制 | 936名美国人群和运动干预的小鼠 | 表观遗传学 | 衰老相关疾病 | DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序 | 加权多元回归, 中介效应模型 | 血液样本, 表观遗传数据, 单细胞转录组数据 | 936名人群参与者+小鼠外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 332 | 2025-11-30 |
Applications of Genome-wide Screening of CRISPR/Cas9 Knockout Library in Identifying Novel Molecular Targets for Xenobiotics
2025-Nov-21, Environment & health (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/envhealth.5c00072
PMID:41306301
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综述 | 本文综述了全基因组CRISPR/Cas9敲除库筛选在识别外源性物质新型分子靶点中的应用 | 系统总结了CRISPR/Cas9文库筛选技术在外源性致病因子机制研究中的创新应用,包括与单细胞测序和类器官技术的结合 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 探讨全基因组CRISPR/Cas9敲除库筛选在识别外源性物质分子靶点中的应用价值 | 外源性致病因子(环境致癌物、病原体、化学污染物) | 基因组编辑技术 | 肿瘤、感染性疾病、中毒性疾病 | CRISPR/Cas9基因组编辑、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 全基因组筛选、单细胞测序 | NA | NA |
| 333 | 2025-11-30 |
TGFB2/IGFBP5 activated by transcription factors STAT2 and SMAD3 initiate granulosa cell degeneration and cause follicular atresia in chickens
2025-Nov, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105747
PMID:40902342
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研究论文 | 本研究通过鉴定TGFB2和IGFBP5的启动子区域,结合DNA pull-down和单细胞RNA测序数据分析,揭示了STAT2和SMAD3转录因子在鸡卵泡闭锁过程中调控颗粒细胞退化的分子机制 | 首次发现STAT2是TGFB2和IGFBP5的共同转录因子,并揭示了JAK/STAT与TGF-β/SMAD信号通路在卵泡闭锁中的协同调控作用 | NA | 阐明鸡卵泡闭锁过程中颗粒细胞退化的分子调控机制 | 鸡颗粒细胞和卵泡闭锁过程 | 分子生物学 | 生殖系统疾病 | DNA pull-down, 质谱分析, 单细胞RNA测序, SCENIC分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 334 | 2025-11-30 |
Construction and differential analysis of testicular atlas between 10-week-old and 23-week-old ducks using single-cell RNA sequencing
2025-Nov, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105715
PMID:40884870
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了10周龄和23周龄鸭睾丸细胞图谱并进行差异分析 | 首次建立了禽类精子发生的高分辨率细胞图谱,发现了新的分子标记物和调控网络 | 仅研究了两个发育阶段,未涵盖完整的发育过程 | 探索鸭睾丸发育和精子发生的分子机制 | 10周龄和23周龄鸭睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 54,702个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 335 | 2025-11-30 |
Cleanet: Robust Doublet Detection in Cytometry Data Based on Protein Expression Patterns
2025-Nov, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24961
PMID:41065042
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研究论文 | 提出了一种基于蛋白质表达模式的自动化双联体检测方法Cleanet,用于流式细胞术和质谱流式细胞术数据 | 首次将单细胞转录组学中的双联体模拟方法应用于细胞术领域,能够自动检测同型和异型双联体并进行分类 | NA | 开发自动化双联体检测方法以改进细胞术数据分析 | 流式细胞术和质谱流式细胞术数据中的双联体事件 | 生物信息学 | 免疫学相关疾病 | 质谱流式细胞术,流式细胞术,成像流式细胞术 | 基于蛋白质表达模式的相似性检测算法 | 蛋白质表达数据,细胞图像数据 | NA | Luminex, Millipore Sigma | 质谱流式细胞术,流式细胞术,成像流式细胞术 | ImageStream, Discover A8 | 成像流式细胞术平台 |
| 336 | 2025-11-29 |
Molecular landscape of the mouse adrenal gland and adjacent adipose tissue by spatial transcriptomics
2025-Nov-28, Folia histochemica et cytobiologica
IF:1.7Q4
DOI:10.5603/fhc.108988
PMID:41311243
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术构建了成年雄性小鼠肾上腺及其周围脂肪组织的高分辨率分子图谱 | 首次提供了成年雄性小鼠肾上腺的空间分辨转录组参考图谱,揭示了肾上腺分区、更新和区室间相互作用的细胞和分子框架 | 研究仅使用CD1 IGS雄性小鼠,未涉及其他品系或雌性动物 | 解析肾上腺分区和皮质更新的分子机制 | 成年CD1 IGS雄性小鼠的肾上腺及周围脂肪组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 无监督聚类、差异基因表达分析、细胞类型反卷积、伪时间轨迹推断 | 空间转录组数据 | 成年CD1 IGS雄性小鼠肾上腺组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium CytAssist平台 |
| 337 | 2025-11-29 |
Antibody Generation Using Cancer-Derived Small Extracellular Vesicles (sEVs): A Platform for Targeted Cancer Therapy and Potential Personalized Applications
2025-Nov-28, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506918
PMID:41311345
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研究论文 | 开发了一种利用癌症来源的小细胞外囊泡生成肿瘤靶向单克隆抗体的新方法,并验证其在靶向癌症治疗中的效果 | 首次使用癌症来源的小细胞外囊泡作为免疫原生成肿瘤靶向抗体,并将这些抗体修饰到载药T细胞囊泡上实现靶向治疗 | 研究仅使用卵巢癌细胞系OVCAR-8,尚未在其他癌症类型中验证 | 开发更有效的肿瘤靶向配体以提高实体瘤药物递送效率 | 人卵巢癌细胞系OVCAR-8、小鼠模型 | 靶向治疗 | 卵巢癌 | 杂交瘤技术、RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、成像数据 | OVCAR-8肿瘤荷瘤小鼠 | NA | 空间转录组学,RNA测序 | NA | NA |
| 338 | 2025-11-29 |
Multi-omics approaches including single-cell analysis and machine learning were used to identify the roles of telomere-related genes in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Nov-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04047-0
PMID:41313509
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研究论文 | 通过多组学方法和机器学习识别端粒相关基因在食管鳞状细胞癌中的预后价值 | 首次系统分析端粒相关基因在ESCC中的表达模式,结合单细胞分析和三种机器学习算法构建预后风险模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证 | 开发食管鳞状细胞癌的预后预测模型并探索肿瘤免疫微环境异质性 | 食管鳞状细胞癌患者 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,机器学习,定量实时PCR | LASSO回归,支持向量机,随机森林 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的ESCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 339 | 2025-11-29 |
Decoding epithelial-T cell interactions in colorectal cancer through single-cell and spatial transcriptomics
2025-Nov-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04083-w
PMID:41313518
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据,揭示结直肠癌中上皮细胞与T细胞相互作用的时空特征 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学系统解析结直肠癌上皮-T细胞相互作用的时空架构 | 样本量相对有限(36例患者),需更大队列验证发现 | 解析结直肠癌肿瘤微环境中上皮细胞与T细胞的相互作用机制 | 36例结直肠癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Seurat, Harmony, CytoTRACE, Slingshot, CellChat, CellTrek | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 36例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 340 | 2025-11-29 |
Integrated Aerobic Exercise and Multisensory Environment Training for Age-related Cognitive Decline via Hippocampal-prefrontal Neural Circuit Modulation
2025-Nov-28, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05302-9
PMID:41313574
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研究论文 | 本研究开发了一种结合有氧运动和多感官环境训练的新型干预方法,通过调节海马-前额叶神经回路改善年龄相关认知衰退 | 首次将有氧运动与多感官环境训练相结合,并揭示了海马-前额叶神经回路在此过程中的关键作用机制 | 研究仅使用老年小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索联合训练改善年龄相关认知衰退的神经机制 | 老年小鼠 | 神经科学 | 老年性疾病 | 神经回路追踪、化学遗传学、单细胞测序 | 动物模型 | 神经活动数据、基因表达数据 | 老年小鼠群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |