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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-01-23 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the heterogeneity and functional characteristics of macrophage subpopulations in colon cancer
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04002-z
PMID:41276730
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了结肠癌中巨噬细胞亚群的异质性和功能特征,并重点探讨了SPP1在巨噬细胞亚型中的作用 | 首次在结肠癌中利用单细胞RNA测序技术系统鉴定出五个巨噬细胞亚型,并发现Macrophages_SPP1亚型在肿瘤中显著富集,具有独特的代谢和免疫抑制功能,同时通过计算机模拟SPP1敲除揭示了其在免疫抑制肿瘤微环境形成中的关键作用 | 研究仅基于三名结肠癌患者的样本,样本量较小,且为观察性研究,缺乏体内实验验证 | 探究结肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其功能特征,特别是SPP1在巨噬细胞亚型中的作用 | 结肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三名结肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 322 | 2026-01-23 |
Single-cell transcriptome atlas of adult male and female human hookworm Ancylostoma ceylanicum
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113846
PMID:41362773
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研究论文 | 本研究构建了成年雄性和雌性锡兰钩虫的单细胞转录组图谱,揭示了性别特异性基因表达和细胞多样性 | 首次提供了锡兰钩虫的全面单细胞转录组图谱,揭示了性别间细胞类型差异和新的分子标记 | 未提及样本数量或技术重复的详细信息,可能限制统计分析的稳健性 | 推进对钩虫生物学的基本理解,为开发新的治疗或疫苗靶点提供基础 | 成年雄性和雌性锡兰钩虫(Ancylostoma ceylanicum) | 单细胞组学 | 钩虫病 | 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,RNA荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2026-01-22 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,识别出一种新型的OLR1+ SLC7A7+肝脏富集转移亚群(LEMS),并揭示了其在胰腺癌肝转移中的免疫代谢重编程机制 | 首次识别并验证了LEMS这一终末分化的恶性细胞亚群,其特征为代谢重编程和免疫抑制通路超活化,并发现其与SPP1+巨噬细胞通过配体-受体网络相互作用,驱动侵袭和免疫逃逸 | 需要扩大临床队列和体内模型来全面阐明LEMS与巨噬细胞之间的具体机制性相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群,阐明其与转移微环境的相互作用,并定义肝脏定植的潜在机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的原发肿瘤(PT)和肝转移(LM)样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 来自PDAC PT和LM患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 324 | 2026-01-22 |
Integration of Transcriptome Profiling and Single-Cell Sequencing Analysis to Establish a CD8+ T Cell-Related Prognostic Model for Patients With NSCLC: From Assessment to Therapy
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71337
PMID:41223031
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研究论文 | 本研究通过整合转录组分析和单细胞测序,构建了一个基于CD8+ T细胞的预后模型,用于非小细胞肺癌患者的精准预后评估和免疫治疗决策 | 首次结合加权基因共表达网络分析和单细胞测序技术,识别出CD52、CD69和PLIN2作为生物标志物,构建了高精度的CD8+ T细胞相关风险模型,并开发了临床预后列线图 | 研究依赖于公共数据集(TCGA-NSCLC、GSE183219、GSE42127),可能受到样本异质性和数据质量的限制,且模型需要在独立的前瞻性队列中进行进一步验证 | 开发一个CD8+ T细胞相关的预后模型,以改善非小细胞肺癌患者的预后评估和免疫治疗临床决策 | 非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析,单细胞测序 | LASSO回归,Cox回归,列线图 | 基因表达数据,单细胞数据 | 三个公共数据集(TCGA-NSCLC、GSE183219、GSE42127)中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2026-01-21 |
Single-cell transcriptomic datasets of the amphibious plant Water wisteria
2025-Nov-29, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-06341-6
PMID:41318588
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了水蓑衣在陆生和水生环境中的叶片细胞,以探索异叶性的分子机制 | 首次对水蓑衣这一新兴异叶性模型植物进行单细胞转录组测序,为在单细胞水平解析植物环境适应机制提供了基础数据 | 未明确提及实验样本量或技术重复次数,可能影响统计可靠性 | 探索异叶性(植物根据环境改变叶片形态的适应策略)的分子机制 | 水蓑衣(Hygrophila difformis)在陆生和水生环境中的叶片原生质体 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 326 | 2026-01-21 |
LMNA-PRKDC axis enhances DNA repair and promotes chemoresistance in glioblastoma
2025-Nov-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08226-3
PMID:41271669
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中LMNA-PRKDC轴通过增强DNA修复能力驱动替莫唑胺耐药的新机制 | 首次发现LMNA-PRKDC轴通过形成DNA修复复合物增强胶质母细胞瘤的DNA修复能力,并鉴定PRKDC抑制剂可作为逆转耐药的新策略 | 研究主要基于患者来源的异种移植模型和单细胞测序数据,临床转化效果仍需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺产生耐药性的分子机制,并寻找逆转耐药的潜在治疗靶点 | 胶质母细胞瘤患者来源的肿瘤组织、异种移植模型以及原发和复发肿瘤标本 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 患者来源的异种移植模型和原发/复发胶质母细胞瘤标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 327 | 2026-01-20 |
CHD7 regulates cardiac neural crest cell differentiation through SOX5-mediated self-activation
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113726
PMID:41210995
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控心脏神经嵴细胞分化,为CHARGE综合征相关心脏缺陷提供了新见解 | 首次发现CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控其自身表达,并证明SOX5过表达可恢复CHD7单倍体不足细胞中的基因表达和心肌细胞分化能力 | 研究主要基于体外细胞培养模型,体内验证和临床转化潜力仍需进一步探索 | 探究CHD7在心脏神经嵴细胞分化中的作用机制及其与CHARGE综合征心脏缺陷的关联 | 心脏神经嵴细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 328 | 2026-01-20 |
HNRNPA2B1 confers immune escape of non-small cell lung cancer through targeting lactate/ferroptosis
2025-Nov-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08232-5
PMID:41271615
|
研究论文 | 本研究探讨了m6A阅读蛋白HNRNPA2B1通过调控LDHA mRNA稳定性和乳酸积累,促进非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗的机制 | 首次揭示了HNRNPA2B1作为m6A阅读器,通过靶向LDHA mRNA的m6A修饰位点增强其稳定性,进而通过乳酸积累和干扰素-γ分泌抑制,介导非小细胞肺癌的免疫逃逸和铁死亡抵抗 | 研究主要在体外共培养体系中进行,体内模型验证相对有限;机制研究聚焦于LDHA通路,可能存在其他下游靶点 | 探究HNRNPA2B1在非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗中的作用及分子机制 | 非小细胞肺癌细胞、活化的CD8 T细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序、体外共培养实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 非小细胞肺癌临床样本及单细胞测序数据(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 329 | 2026-01-20 |
Integrated single-cell transcriptomics and spatial metabolomics unveil cellular differentiation and ginsenosides biosynthesis in Panax root tips
2025-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf202
PMID:41180020
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和空间代谢组学分析,揭示了人参属植物根尖的细胞分化轨迹和人参皂苷生物合成的细胞异质性 | 首次在人参属植物根尖中整合单细胞转录组和空间代谢组学,识别了新的转录因子并验证了其在内皮层木栓化和人参皂苷生物合成中的调控作用 | 研究仅聚焦于三种人参属物种,可能无法完全代表该属的多样性,且功能验证实验范围有限 | 探究人参属植物根尖早期发育过程中的细胞命运转变及人参皂苷生物合成的细胞异质性 | 三种人参属植物(Panax ginseng、Panax quinquefolius和Panax notoginseng)的根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间代谢组学、LC-MS/MS、RNA原位杂交、双荧光素酶报告基因检测(dual-LUC)、电泳迁移率变动分析(EMSA) | NA | 转录组数据、代谢组数据、图像数据 | 三种人参属物种的根尖样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间代谢组学 | NA | NA |
| 330 | 2026-01-17 |
Tool Comparison for Detecting Tumour Cells in Endometrial Cancer via Single-Cell Copy Number Variations Analysis
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70932
PMID:41160707
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研究论文 | 本研究比较了四种基于单细胞转录组数据推断拷贝数变异以预测子宫内膜癌细胞的主要工具(SCEVAN、CopyKAT、InferCNV和sciCNV)的可靠性 | 首次系统评估了多种单细胞CNV推断工具在子宫内膜癌中的性能,并提出了通过选择富含上皮细胞的亚克隆来减少假阳性的策略 | InferCNV和sciCNV工具不直接预测肿瘤细胞,其CNV评分分布曲线未能清晰区分恶性和非恶性细胞群体,因此无法评估其性能 | 评估单细胞CNV分析工具在检测子宫内膜癌细胞中的可靠性,并为研究人员提供改进预测准确性的建议 | 子宫内膜癌细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用公开可用的scRNA-seq数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 331 | 2026-01-17 |
Identification of Disulfidptosis-Associated Hub Genes in Psoriasis via Integrated Transcriptomic and Experimental Validation Approaches
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70945
PMID:41224720
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法,识别了与银屑病相关的二硫化物死亡相关枢纽基因,并探讨了其在疾病发病机制中的作用 | 首次将新发现的细胞死亡途径——二硫化物死亡与银屑病联系起来,并利用整合的转录组学和单细胞RNA测序数据结合机器学习方法识别了相关的枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析和小鼠模型验证,需要在人类临床样本中进行进一步的功能验证 | 探究二硫化物死亡相关基因在银屑病发病机制中的作用,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 银屑病皮损和非皮损皮肤组织,以及咪喹莫特诱导的银屑病样小鼠模型 | 生物信息学 | 银屑病 | 转录组学分析,单细胞RNA测序,Western blotting | LASSO回归,随机森林 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 多个数据集(GSE106992,GSE11239,GSE162183)和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 332 | 2026-01-15 |
Engineering CCR2/IFN-γ overexpression in enucleated mesenchymal stem cells enhances therapy for rheumatoid arthritis
2025-Nov-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09248-5
PMID:41310172
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研究论文 | 本研究通过工程化改造过表达CCR2和IFN-γ的去核人间充质干细胞,增强其对类风湿关节炎的治疗效果 | 首次生成并应用过表达CCR2和IFN-γ的去核人间充质干细胞,以解决传统MSCs治疗中肺部滞留和安全性问题,同时增强归巢能力和治疗效果 | 研究仅在雄性大鼠模型中进行,未涉及雌性动物或更复杂的临床前模型,且长期安全性和免疫原性需进一步评估 | 开发一种更安全有效的基于间充质干细胞的类风湿关节炎治疗方法 | 人间充质干细胞(特别是脐带来源)及其去核改造版本,以及类风湿关节炎雄性大鼠模型 | 细胞治疗与再生医学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2026-01-15 |
Systematic evaluation of tools used for single-cell m6A identification
2025-Nov-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09246-7
PMID:41275001
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研究论文 | 本研究系统评估了四种单细胞m6A测序和预测方法,并开发了一个在线可访问的单细胞m6A数据库,用于人类和小鼠物种的修饰定位和水平分析 | 开发了首个单细胞m6A数据库,整合了多种方法的数据,并展示了在癌症单细胞转录组和空间转录组数据中预测和可视化m6A修饰的独特优越性能 | 评估的方法数量有限(仅四种),且存在操作复杂性、灵敏度、分辨率和不同技术间一致性等挑战 | 系统评估单细胞m6A识别工具,并开发相关数据库以促进表观遗传修饰研究 | 单细胞m6A修饰在人类和小鼠物种中的定位和修饰水平 | 表观遗传学 | 癌症(包括UCEC) | 单细胞m6A测序和预测方法 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 334 | 2026-01-15 |
The ANTsX ecosystem for mapping the mouse brain
2025-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66741-5
PMID:41274934
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研究论文 | 本文介绍了使用ANTsX生态系统开发的小鼠大脑映射流程,用于将多种空间转录组学和形态学数据对齐到共享坐标框架中 | 提出了两种新方法:基于速度场的发育时间点连续插值方法和使用最小标注公开数据的深度学习自动脑区划分框架 | NA | 解决小鼠大脑图谱构建中多样化数据集到共享坐标框架的映射挑战 | 小鼠大脑 | 数字病理学 | NA | MERFISH空间转录组学,fMOST高分辨率形态学,发育MRI,LSFM | 深度学习 | 图像,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 335 | 2026-01-10 |
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's disease (AD)
2025-Nov-29, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00875-x
PMID:41318546
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研究论文 | 本研究通过多区域空间转录组学分析,揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异 | 首次在AD中结合多区域空间转录组学和Aβ免疫荧光染色,系统比较了不同皮质区域的细胞类型比例、基因表达和细胞间通讯差异 | 样本量较小(仅2名Braak III和Thal 4期AD患者),且未包括早期AD阶段或健康对照样本 | 探究AD中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异及其分子机制 | 阿尔茨海默病患者的内嗅皮质、枕颞皮质、背外侧前额叶皮质和纹状皮质 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学,免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据,免疫荧光图像 | 2名Braak III和Thal 4期AD患者的四个脑区样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 336 | 2026-01-09 |
uPAR expression in M-MDSCs under high LDHA activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Nov-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29823-4
PMID:41320682
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺导管腺癌中高LDHA活性通过调节乳酸代谢影响M-MDSCs上uPAR表达,从而促进免疫抑制肿瘤微环境的机制 | 首次揭示了LDHA驱动的乳酸代谢通过胆固醇代谢途径调控M-MDSCs中uPAR表达的具体机制,并建立了LDHA活性与uPAR阳性M-MDSCs在人类PDAC样本中的临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的临床验证;机制研究尚未完全阐明uPAR信号传导的具体下游通路 | 阐明高LDHA肿瘤微环境中乳酸代谢如何调节免疫细胞(特别是MDSCs)并促进胰腺癌免疫抑制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的髓源性抑制细胞(MDSCs),特别是单核细胞性MDSCs(M-MDSCs) | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色,基因集富集分析 | 小鼠Ldha敲低(shLdha)PDAC模型 | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 小鼠PDAC模型和人类PDAC样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 337 | 2026-01-09 |
Genomic heterogeneity drives distinct infiltration patterns in glioblastoma
2025-Nov-29, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02106-9
PMID:41316429
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研究论文 | 本研究利用高维空间转录组学技术,分析了胶质母细胞瘤中浸润性肿瘤细胞的基因表达谱和细胞状态,揭示了基因组异质性如何驱动不同的浸润模式 | 首次使用CosMx空间分子成像仪在单细胞分辨率下对胶质母细胞瘤的肿瘤核心和浸润边缘进行空间转录组分析,识别出一种新的胶质祖细胞样状态,并发现其在经典亚型中富集且与EGFR扩增或突变相关 | 样本量较小(仅8名患者),且研究基于福尔马林固定石蜡包埋样本,可能影响RNA质量,空间分析仅限于靶向1000个基因的panel | 表征胶质母细胞瘤中浸润性肿瘤细胞的基因表达谱和细胞状态,以理解肿瘤异质性对疾病进展的影响 | 胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织,包括肿瘤核心和浸润边缘 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 8名胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪,使用靶向1000个基因的panel进行单细胞分辨率空间转录组分析 |
| 338 | 2026-01-09 |
Identification and validation of SUN modification-related anti-PD-1 immunotherapy-resistance signatures to predict prognosis and immune microenvironment status in glioblastoma
2025-Nov-29, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15345-9
PMID:41318472
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别并验证了与泛素化、SUMO化和neddylation(统称SUN修饰)及抗PD-1免疫治疗耐药相关的关键基因,构建了一个用于预测胶质母细胞瘤预后和免疫微环境状态的六基因风险模型 | 首次整合SUN修饰与抗PD-1耐药性,识别出六个关键预后基因(PLK2、CDC73、PSMC2、SOCS3、ETV4、LMO7),并构建了具有优异预测性能(AUC>0.9)的预后风险模型,同时结合单细胞RNA测序和空间转录组分析揭示了SOCS3在单核细胞/巨噬细胞中的特异性表达及其潜在功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞系验证,缺乏大规模临床队列的独立验证和体内实验证据 | 探究SUN修饰相关基因在胶质母细胞瘤中的预后意义及其与抗PD-1免疫治疗耐药性的关联 | 胶质母细胞瘤(GBM)细胞系及相关的公共基因组学数据 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习算法、RT-qPCR、Western blotting、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组分析 | 机器学习算法(文中未指定具体模型类型) | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 339 | 2026-01-09 |
Single-cell transcriptome analysis defines novel molecular subtypes and reveals therapeutic implications of T/myeloid mixed-phenotype acute leukemia
2025-Nov-29, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01585-8
PMID:41318446
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析定义了T/髓系混合表型急性白血病(T/My MPAL)的新型分子亚型,并揭示了其治疗意义 | 首次构建了T/My MPAL的单细胞转录组图谱,定义了三种恶性细胞亚群(AML样、T-ALL样和独特亚群),并发现了传统流式细胞术分类的局限性 | 研究样本量相对有限,且部分发现需进一步临床验证 | 识别T/My MPAL的分子亚型并开发亚型特异性治疗策略,以改善预后和实现个性化治疗 | T/髓系混合表型急性白血病(T/My MPAL)、急性髓系白血病(AML)、T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)患者及正常供体的细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 近275,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 340 | 2026-01-09 |
CD74+CCL5+ effector CD8+ T cells drive mucosal inflammation and predict biologics response in inflammatory bowel disease
2025-Nov-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07509-9
PMID:41318676
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、GWAS孟德尔随机化及肠道微生物组分析,识别出CCL5+效应CD8+ T细胞是驱动炎症性肠病黏膜炎症的关键免疫细胞亚群,并开发了一个六基因模型用于预测疾病诊断和英夫利西单抗治疗反应 | 首次系统性地整合多组学数据,识别出CCL5+效应CD8+ T细胞作为IBD黏膜炎症的核心驱动者,并构建了一个基于六个因果关联基因的预测模型,用于疾病分层和治疗反应预测 | 样本量相对有限(如免疫组化验证仅涉及12名IBD患者和10名健康对照),外周血中CCL5+CD8+ T细胞的变化趋势不如组织明显,且研究结果需要进一步的功能和临床验证 | 识别驱动炎症性肠病发病机制的免疫细胞亚群和分子程序,并开发预测生物制剂治疗反应的生物标志物 | 炎症性肠病患者(包括克罗恩病和溃疡性结肠炎)的结肠组织、外周血样本以及肠道微生物组 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 批量转录组去卷积, GWAS孟德尔随机化, 肠道微生物组分析, 免疫组化, 流式细胞术 | 六基因预测模型 | 单细胞RNA-seq数据, 批量转录组数据, 基因组数据, 微生物组数据, 图像数据(免疫组化), 流式细胞数据 | 多个IBD队列(具体总数未明确说明),免疫组化涉及12名IBD患者和10名健康对照,流式细胞术涉及7名IBD患者和12名健康个体 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学(未明确指定,但涉及组织分析) | NA | NA |