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当前共找到 925 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-12-22 |
Insights into the relevance of targeting fibroblasts to control cancer
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102395
PMID:41187743
|
综述 | 本文总结并讨论了以癌症相关成纤维细胞为靶点控制癌症的新进展，并探讨了其异质性对未来治疗策略的影响 | 探讨了利用单细胞RNA测序等高通量技术结合AI平台解析CAF异质性，并前瞻性地讨论了针对CAF复杂起源的个性化治疗需求 | NA | 探讨靶向肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞以控制癌症的潜力和策略 | 癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 282 | 2025-12-22 |
Virus envelope glycoprotein targeting bispecific T cell engager protects mice from lethal severe fever with thrombocytopenia virus infection
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102458
PMID:41260206
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术数据，揭示了T细胞缺陷与功能障碍在严重发热伴血小板减少综合征（SFTS）致死病例中的关键作用，并设计了一种靶向病毒包膜糖蛋白的双特异性T细胞衔接器（BiTE）抗体，在小鼠模型中有效治疗了致命的SFTSV感染 | 首次利用单细胞RNA测序和流式细胞术数据，系统分析了SFTS患者中T细胞（特别是CD4 T细胞）的细胞毒性受损和耗竭状态与致死后果的关联，并创新性地设计了靶向SFTSV包膜糖蛋白Gn的BiTE抗体，成功在小鼠模型中实现了对致命感染的救援 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行临床试验，且BiTE抗体的长期安全性和有效性需进一步评估 | 开发针对SFTSV的有效治疗干预措施，通过增强T细胞介导的免疫反应来消除病毒感染细胞 | SFTS患者和小鼠模型中的T细胞（特别是CD4和CD8 T细胞）以及SFTSV感染的细胞 | 免疫学与传染病学 | 严重发热伴血小板减少综合征（SFTS） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2025-12-22 |
CD301b lectin expression in the breast tumor microenvironment augments tumor growth
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.13.584829
PMID:41332518
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研究论文 | 本文研究了CD301b凝集素在乳腺癌微环境中的表达如何通过髓系细胞-肿瘤相互作用促进肿瘤生长 | 首次将肿瘤糖基化（Tn糖抗原）与CD301b凝集素信号传导联系起来，揭示了CD301b在调节乳腺癌免疫微环境中的关键作用，并指出其作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自单细胞RNA测序分析，缺乏直接的功能验证；未探讨CD301b在其他癌症类型中的普适性 | 探究糖基化-凝集素相互作用在乳腺癌进展中的具体机制，并识别潜在的免疫治疗靶点 | 小鼠三阴性乳腺癌模型和人类乳腺癌样本中的免疫细胞（特别是CD301b/CLEC10A表达的髓系细胞） | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，表型分析 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 284 | 2025-12-22 |
Genetic Convergence Analysis of CRISPR Perturbations Deciphers Gene Functional Similarity
2025-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.13.688060
PMID:41292726
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研究论文 | 本文介绍了一种名为XConTest的两步交叉验证方法，用于评估CRISPR扰动之间的遗传收敛性，以量化基因功能相似性 | 提出了一种统计方法来量化CRISPR扰动之间的相似性，解决了现有方法大多启发式的问题，通过近似标准正态的检验统计量评估扰动对细胞表达谱的正交影响 | 未明确提及具体样本量或实验平台细节，可能依赖于现有数据集 | 开发统计方法以量化CRISPR扰动之间的遗传收敛性，从而解读基因功能相似性 | CRISPR扰动、基因功能相似性、下游基因表达 | 机器学习 | 自闭症、免疫相关疾病 | CRISPR筛选、单细胞RNA测序（Perturb-seq） | 统计检验方法（XConTest） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 285 | 2025-12-22 |
Heimdall: A Modular Framework for Tokenization in Single-Cell Foundation Models
2025-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.09.687403
PMID:41292913
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研究论文 | 本文介绍了Heimdall，一个用于系统评估单细胞基础模型中标记化策略的模块化框架和开源工具包 | 提出首个全面框架，将单细胞基础模型分解为模块化组件，实现标记化策略的细粒度控制和归因，并系统评估其在跨分布转移场景下的影响 | 未明确说明样本量或具体数据集细节，可能限制了结果的普适性验证 | 系统评估单细胞基础模型中标记化策略对模型性能的影响，特别是在分布转移场景下 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 286 | 2025-12-22 |
D-dimer drives immune dysregulation in COVID-19 via chemokine modulation and inflammatory signaling
2025-Nov, Virus research
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.virusres.2025.199641
PMID:41083108
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研究论文 | 本研究探讨了D-二聚体在COVID-19中通过调节趋化因子和炎症信号通路驱动免疫失调的作用 | 揭示了D-二聚体作为血栓炎症反应的潜在驱动因子，不仅作为临床生物标志物，还通过上调趋化因子（如CXCL5、CXCL6）和富集IL-17、PI3K-Akt等炎症通路来调节免疫微环境 | 体外实验使用THP-1细胞系，可能无法完全模拟体内复杂免疫环境；样本来自上海地区，可能存在地域局限性 | 探究D-二聚体在COVID-19免疫调节中的作用机制 | COVID-19患者（轻症和重症）及SARS-CoV-2阴性对照参与者 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组分析、体外细胞刺激实验 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 356名参与者（包括轻症和重症COVID-19患者及阴性对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 287 | 2025-12-22 |
Age-Related Changes in Myeloid Cells and Their Impact on Subcutaneous Melanoma Growth in Mice
2025-Nov, Aging and cancer
DOI:10.1002/aac2.70006
PMID:41409350
|
研究论文 | 本研究探讨了衰老如何通过改变Gr-1+髓系细胞的功能来影响小鼠皮下黑色素瘤的生长及免疫治疗反应 | 揭示了衰老背景下Gr-1+髓系细胞功能增强（如CD8+ T细胞抑制、活性氧产生和胞外陷阱形成）与黑色素瘤生长加速及免疫治疗反应差异之间的关联，并首次证明髓过氧化物酶（MPO）在此过程中的关键驱动作用 | 研究主要在YUMM1.7黑色素瘤细胞系和小鼠模型中进行，结论可能不适用于所有黑色素瘤亚型或人类情况；研究聚焦于Gr-1+髓系细胞，其他免疫细胞类型的影响未全面探讨 | 表征衰老如何改变Gr-1+髓系细胞功能及其对黑色素瘤生长和免疫治疗反应的影响 | 2月、6月和12月龄的野生型小鼠及同基因型髓过氧化物酶缺陷小鼠，以及多种YUMM黑色素瘤细胞系（特别是YUMM1.7） | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞功能分析（CD8+ T细胞抑制、活性氧检测、胞外陷阱形成评估） | 小鼠皮下黑色素瘤模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、肿瘤生长测量数据 | 多个年龄组（2、6、12月龄）的野生型和MPO缺陷型小鼠，使用多种YUMM黑色素瘤细胞系进行肿瘤生长评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 288 | 2025-12-21 |
Immune-modulating effects on tumor-draining lymph nodes of neoadjuvant chemoradiotherapy combined with dual immunotherapy in patients with T3-4N0-2 NSCLC
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013237
PMID:41314982
|
研究论文 | 本研究探讨了在T3-4N0-2非小细胞肺癌患者中，新辅助放化疗联合双重免疫疗法对肿瘤引流淋巴结的免疫调节作用 | 结合空间转录组学和免疫组织化学分析，首次系统研究了新辅助放化疗联合双重免疫疗法对肿瘤引流淋巴结的免疫调节效应，特别是在不同辐射剂量下的影响 | 研究为观察性队列设计，样本量有限（每组25例），且仅针对特定亚型的非小细胞肺癌患者，结果可能无法推广到其他癌症类型或治疗组合 | 评估新辅助放化疗联合双重免疫疗法对肿瘤引流淋巴结免疫功能的调节作用 | T3-4N0-2非小细胞肺癌患者的肿瘤引流淋巴结 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据, 免疫组织化学图像 | 50例患者（INCREASE试验组25例，匹配对照组25例） | NA | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组学分析平台，用于CD8/Ki67+T细胞热点区域的转录组分析 |
| 289 | 2025-12-21 |
Spatially organized cellular communities shape functional tissue architecture in the pancreas
2025-Nov-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx5791
PMID:41223257
|
研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术，绘制了小鼠胰腺从胚胎发育到成年稳态的细胞群体空间时间图谱 | 首次结合单细胞和空间转录组学解析胰腺细胞类型的空间异质性，并发现上皮-间充质单元作为基本组织微环境 | 研究主要基于小鼠模型，人类模型验证有限 | 揭示胰腺细胞如何通过空间组织形成功能性组织结构 | 小鼠和人类胰腺组织 | 空间转录组学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 290 | 2025-12-21 |
scHLens: a web server for hierarchically and interactively exploring single cell RNA-seq data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf675
PMID:41403052
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为scHLens的交互式网络服务器，用于分层探索单细胞RNA测序数据 | 开发了支持用户自定义分析流程和分层探索模式的交互式网络服务器，解决了现有方法在界面友好性、流程灵活性和细胞亚型识别方面的不足 | 未在摘要中明确说明 | 降低单细胞RNA测序数据分析的技术门槛，提高细胞异质性识别的灵活性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 291 | 2025-12-20 |
Enhancing RNA Capture Efficiency in Spatial Transcriptomics: A Review of Innovative Technologies and Strategies
2025-Nov-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211076
PMID:41303559
|
综述 | 本文系统综述了近年来提升空间转录组学中RNA捕获效率的创新技术与策略 | 重点比较了Decoder-seq、Stereo-seq V2、MAGIC-seq和MSN-seq等前沿技术，并强调了针对FFPE临床样本的优化方法以及整合人工智能的计算预测方法 | 作为一篇综述文章，未提出新的实验数据或模型，主要依赖现有文献进行总结分析 | 提升空间转录组学中RNA捕获效率，并促进该技术在基础研究和临床应用中的效用 | 空间转录组学技术及其相关的RNA捕获策略 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 292 | 2025-12-20 |
COL8A1 regulates endothelial phenotype in inflammatory endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Nov-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00339.2025
PMID:41042748
|
研究论文 | 本研究探讨了胶原蛋白VIII α1链（COL8A1）在炎症诱导的内皮-间质转化（EndMT）中对内皮细胞表型的调控作用 | 首次揭示了COL8A1在炎症性EndMT中的双相调控作用，并阐明其通过NF-κB/Snail信号通路影响内皮稳定性的机制 | 研究主要基于体外细胞模型（HAECs），体内功能验证和临床相关性需要进一步研究 | 探究COL8A1在炎症性内皮-间质转化中的作用机制 | 小鼠和人类内皮细胞，特别是人主动脉内皮细胞（HAECs） | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光分析，基因过表达与敲低 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠和人类内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 293 | 2025-12-19 |
Preoperative pembrolizumab (anti-PD-1 antibody) combined with chemoradiotherapy for esophageal squamous cell carcinoma: a phase 1/2 trial (PALACE-2)
2025-Nov-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02477-4
PMID:41309527
|
研究论文 | 本研究是一项评估术前帕博利珠单抗联合放化疗治疗局部晚期可切除食管鳞状细胞癌的疗效和安全性的1/2期临床试验 | 首次大规模、多中心1/2期试验报告了帕博利珠单抗联合放化疗用于局部晚期可切除食管鳞癌的短期结果，并通过单细胞RNA测序和细胞因子分析发现高IL-6水平可作为治疗反应的预测因子 | 短期疗效未优于新辅助放化疗，且随访时间较短（中位17.4个月），需要更长期的生存数据 | 评估术前帕博利珠单抗联合放化疗治疗局部晚期可切除食管鳞状细胞癌的疗效和安全性，并探索肿瘤微环境的动态特征 | 局部晚期、可手术切除的食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，细胞因子分析，皮下肿瘤小鼠模型 | NA | 肿瘤标本，血液样本，小鼠模型数据 | 143名入组患者（140名接受新辅助治疗，125名接受手术） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 294 | 2025-12-19 |
Reflecting on 30 years of miRNA biology in malignant hematology: current challenges and future directions
2025-Nov-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015611
PMID:40845247
|
观点文章 | 本文回顾了microRNA（miRNA）在恶性血液学中30年的研究历程，讨论了当前挑战和未来方向 | 强调了miRNA-mRNA相互作用的上下文依赖性、isomiRs的影响以及RNA结合蛋白和表观转录组修饰对miRNA活性的作用，并倡导使用更生理相关的系统如造血类器官、单细胞和空间转录组学 | 指出常用批量测序和简化模型存在局限性，方法学不一致、解释过于简化以及模型限制阻碍了临床转化进展 | 探讨miRNA在恶性血液学中的生物学作用、当前研究挑战及未来发展方向 | microRNA（miRNA）在造血过程和血液恶性肿瘤（如急性髓系白血病）中的调控机制 | NA | 血液恶性肿瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学、CRISPR功能分析、脂质纳米颗粒递送、抗miRs | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 295 | 2025-12-19 |
Nivolumab plus ipilimumab induce hyper-progression in renal medullary carcinoma: results of a phase II trial and preclinical evidence
2025-Nov-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65462-z
PMID:41290625
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研究论文 | 本文报告了一项针对肾髓样癌（RMC）患者的II期临床试验结果，评估了nivolumab联合ipilimumab的疗效，并通过单细胞RNA测序和临床前实验揭示了免疫检查点疗法（ICT）诱导的耐药机制 | 首次在RMC中通过临床试验和单细胞RNA测序揭示了ICT诱导的“髓系拟态”程序，并发现p300抑制可恢复ICT敏感性 | 临床试验样本量较小（仅10名患者），且为单臂研究，缺乏对照组 | 评估nivolumab联合ipilimumab在肾髓样癌（RMC）中的疗效，并探究ICT诱导的耐药机制 | 肾髓样癌（RMC）患者及免疫活性体细胞嵌合基因工程小鼠模型 | NA | 肾髓样癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 10名RMC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 296 | 2025-12-19 |
Brain-wide Genome Editing via STEP-RNPs for Treatment of Angelman Syndrome
2025-Nov-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.13.684643
PMID:41292800
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为STEP的非病毒、非纳米颗粒、基于化学修饰的脑部全基因组编辑方法，用于治疗Angelman综合征 | 开发了STEP-RNPs平台，实现高效、无痕的脑部全基因组编辑，无需病毒或纳米颗粒载体 | 研究基于小鼠模型和体外人类神经元，尚未进行人体临床试验 | 开发一种治疗神经遗传疾病的新型基因组编辑方法 | Angelman综合征小鼠模型、人类神经元和源自患者iPSCs的皮质脑类器官 | 基因编辑与神经科学 | Angelman综合征 | 基因组编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、行为数据 | Angelman综合征小鼠模型和人类神经元/脑类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 297 | 2025-12-19 |
FADVI: disentangled representation learning for robust integration of single-cell and spatial omics data
2025-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.683998
PMID:41278629
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研究论文 | 本文提出了一种名为FADVI的变分自编码器框架，用于解决单细胞和空间组学数据整合中的批次效应问题 | FADVI通过将潜在空间划分为批次特定、标签相关和残差子空间，结合监督分类、对抗训练和交叉协方差惩罚，实现了技术变异与真实生物信号的解耦 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种能够稳健整合单细胞和空间组学数据的方法，以克服跨实验和平台的批次效应 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和高分辨率空间转录组学数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | 变分自编码器 | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 298 | 2025-12-19 |
MERFISH+, a large-scale, multi-omics spatial technology resolves the molecular holograms of the 3D human developing heart
2025-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.02.686137
PMID:41279640
|
研究论文 | 本文介绍了一种增强型空间转录组学技术MERFISH+，用于解析人类发育心脏的三维分子全息图 | MERFISH+通过整合化学探针锚定、保护性水凝胶、高通量微流体和显微镜技术，实现了大规模、多组学的空间分析，支持在厘米级组织样本上进行稳健的重复杂交循环 | NA | 开发一种高分辨率、大规模的空间多组学技术，以解析复杂组织（如人类发育心脏）的三维细胞和亚细胞组织 | 人类发育心脏组织 | 空间转录组学 | NA | MERFISH+（增强型多重误差稳健荧光原位杂交） | Spateo-VI（生成式整合框架） | 空间转录组数据、染色质数据 | 310万个细胞，涵盖34个不同细胞群体 | NA | 空间转录组学、空间多组学 | MERFISH+ | 整合化学探针锚定在保护性水凝胶中，结合高通量微流体和显微镜技术 |
| 299 | 2025-12-19 |
Benchmarking large language models for cell typing in single-cell RNA-Seq
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf677
PMID:41396814
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研究论文 | 本文系统性地评估了七种领先的大型语言模型和三种传统生物信息学工具在34个不同的人类和小鼠单细胞RNA测序数据集上的细胞类型注释性能 | 首次为LLMs在scRNA-seq细胞类型注释中的应用提供了系统性框架和全面的性能比较，并开发了集成策略和开源工具DeepCellSeek | NA | 评估和比较大型语言模型在单细胞RNA测序数据细胞类型注释中的性能 | 人类和小鼠的单细胞RNA测序数据集 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型 | 基因表达数据 | 34个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 300 | 2025-12-19 |
Ursolic acid ameliorates ocular surface dysfunction in dry eye via targeting EGFR/RAS/RAF/MAP2K1/MAPK1 pathway
2025-Nov, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2025.101294
PMID:41399414
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研究论文 | 本研究评估了熊果酸（UA）对干眼症（DE）相关眼表功能障碍的治疗效果及其机制，通过细胞和动物模型验证了UA滴眼液通过调节EGFR/RAS/RAF/MAP2K1/MAPK1信号通路改善症状 | 首次将熊果酸应用于干眼症治疗，并通过网络药理学、单细胞测序和分子对接技术系统揭示了其通过EGFR/RAS/RAF/MAP2K1/MAPK1通路发挥作用的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型和动物模型，尚未进行临床试验验证UA滴眼液在人体中的安全性和有效性 | 探究熊果酸对干眼症眼表功能障碍的治疗效果及作用机制 | 人角膜上皮细胞（HCEs）和干眼症小鼠模型 | 数字病理学 | 干眼症 | 单细胞测序、RNA测序、分子对接、网络药理学分析 | NA | 单细胞测序数据、RNA测序数据、分子对接模拟数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |