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当前共找到 923 篇文献,本页显示第 261 - 280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
261 2026-03-25
Long-read RNA sequencing of transposable elements from single cells using CELLO-seq
2025-11, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CELLO-seq的单细胞长读长RNA测序协议,用于将转座元件(TE)表达数据精确映射到独特的基因组位点 通过整合长50核苷酸独特分子标识符和高PCR重复数,实现了对长读长的错误校正,从而能够高保真地映射到序列高度相似的年轻TE以及基因和TE亚型 协议需要用户具备分子生物学和转录组分析经验,且从细胞分离到定量完成需一周时间 开发一种单细胞长读长RNA测序方法,以解决短读长测序在转座元件表达分析中的模糊映射问题 哺乳动物细胞中的转座元件(TE) 单细胞测序技术 NA 长读长RNA测序,单细胞测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
262 2026-03-24
Integrated bulk and single-cell RNA profiling implicates MFAP5+ CAFs in potential role in peritoneal metastasis of gastric cancer
2025-11-28, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术,揭示了表达MFAP5的癌症相关成纤维细胞在胃癌腹膜转移中的关键作用 首次在单细胞水平上系统描绘了胃癌腹膜转移的基质微环境,并鉴定出MFAP5+ CAFs这一特异性富集于腹膜转移组织、具有促转移表型的终末亚群 研究主要基于转录组数据,功能验证多在体外进行,缺乏体内动物模型验证MFAP5+ CAFs的具体作用机制 探究胃癌腹膜转移的基质微环境特征及其驱动机制 配对的胃癌原发灶和腹膜转移组织样本 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多重免疫组化, 常规免疫组化 NA RNA测序数据, 免疫组化图像 配对的胃癌原发灶和腹膜转移组织样本队列 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
263 2026-03-24
Dexamethasone-induced immunosuppression in Pneumocystis pneumonia reprograms neutrophil metabolism and impairs antimicrobial function
2025-11-28, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等方法,揭示了地塞米松在肺孢子菌肺炎中通过重编程中性粒细胞代谢,特别是抑制脂肪酸氧化,从而损害其抗菌功能的免疫抑制机制 首次在单细胞水平上揭示了地塞米松诱导的免疫抑制如何通过代谢重编程(特别是脂肪酸氧化抑制)特异性损害中性粒细胞功能 研究主要基于小鼠模型,人体内的直接相关性尚需进一步验证 探究地塞米松在肺孢子菌肺炎中改变肺部免疫的免疫学和代谢机制 肺孢子菌肺炎模型小鼠的肺组织细胞,特别是中性粒细胞 单细胞组学 肺孢子菌肺炎 单细胞RNA测序,流式细胞术,RT-qPCR,bulk RNA-seq,代谢组学 NA 单细胞转录组数据,bulk RNA-seq数据,代谢组数据 对照和地塞米松诱导的免疫缺陷小鼠肺组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
264 2026-03-24
Differential expression of viral entry protein neuropilin 1 (NRP1) and neuropilin 2 (NRP2) in fatal COVID-19
2025-11-25, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过免疫组化、空间多重免疫荧光和单细胞RNA测序技术,分析了致命性COVID-19病例中心脏、肺和血液淋巴器官中神经纤毛蛋白NRP1和NRP2的表达差异及其与SARS-CoV-2刺突蛋白片段的结合特性 首次详细揭示了NRP1和NRP2在致命性COVID-19组织中的表达模式及其与SARS-CoV-2刺突蛋白片段的差异结合特性,为理解病毒系统性传播机制提供了新见解 样本量较小(n=20),且主要基于尸检组织,可能无法完全反映疾病早期或轻症病例的情况 探究神经纤毛蛋白NRP1和NRP2作为SARS-CoV-2共受体在COVID-19病理机制中的作用 致命性COVID-19患者的尸检组织(心脏、肺、血液淋巴器官)及公共单细胞RNA测序数据 数字病理学 COVID-19 免疫组化、空间多重免疫荧光(CODEX)、单细胞RNA测序、免疫荧光显微镜 NA 图像、单细胞RNA测序数据 20例尸检组织样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
265 2026-03-24
Loss of Actrt1 in non-hematopoietic stroma suppresses pathological angiogenesis and tumor progression
2025-11-19, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究揭示了Actrt1在非造血基质细胞中通过促进肿瘤血管生成和成熟来驱动肿瘤进展的新机制 首次发现Actrt1在肿瘤微环境非造血细胞(尤其是内皮细胞)中调控病理性血管生成的作用,并证明其不影响发育性血管生成 研究主要使用小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证;具体分子机制有待深入阐明 探究Actrt1在肿瘤微环境中对血管生成和肿瘤进展的调控作用 B16F1和MC38肿瘤小鼠模型、骨髓嵌合体、主动脉环、后肢缺血模型 肿瘤生物学 肿瘤 单细胞RNA测序、免疫荧光、骨髓移植、组织学分析 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织图像数据 Actrt1敲除小鼠及对照小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
266 2026-03-24
A novel information-theoretic approach reveals loss of effective biomolecular communication in aging muscle cells
2025-11-06, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
研究论文 本研究利用信息论方法分析骨骼肌单细胞RNA-seq数据,量化了衰老过程中转录因子与靶基因之间生物分子通信效率的下降 首次将信息论中的互信息概念应用于衰老研究,从通信效率角度量化生物分子网络的退化 研究仅基于单细胞RNA-seq数据,未考虑蛋白质水平或其他调控层面的通信变化 探究衰老过程中生物分子通信效率的变化规律 年轻、中年和老年动物的骨骼肌细胞 生物信息学 老年疾病 单细胞RNA-seq 信息论模型(互信息分析) 单细胞转录组数据 多年龄段动物骨骼肌单细胞数据(具体数量未说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
267 2026-03-24
Piezo1-Mediated Calcium Flux Transfers Mechanosignal to Yes-Associated Protein to Stimulate Matrix Production in Keloid
2025-Nov, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了Piezo1介导的钙流通过Yes相关蛋白(YAP)刺激瘢痕疙瘩基质产生的机制,并验证了Piezo1和YAP作为治疗靶点的潜力 首次在瘢痕疙瘩成纤维细胞中发现Piezo1与YAP的关联,并证实Piezo1/钙流/YAP信号轴在机械力诱导的促粘连信号通路中的关键作用 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,缺乏直接的人体临床试验验证 探究机械力在瘢痕疙瘩形成中的作用机制,并寻找潜在的治疗靶点 人类瘢痕疙瘩成纤维细胞、正常皮肤成纤维细胞及患者来源的瘢痕疙瘩异种移植模型 细胞生物学与生物力学 瘢痕疙瘩 单细胞转录组分析、原子力显微镜、钙离子荧光指示剂、免疫荧光染色、转录组学 NA 转录组数据、生物力学数据、荧光成像数据 人类瘢痕疙瘩与正常皮肤成纤维细胞样本及异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
268 2026-03-23
Single-cell RNA sequencing highlights the role of epithelial-immune dual features of proximal tubule cells in BK polyomavirus nephropathy
2025-11-25, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了BK多瘤病毒肾病微环境中近端小管细胞的一个具有上皮-免疫双重特征的新亚群(IGKC+ PT),该亚群可能通过T细胞耗竭促进疾病进展,并可作为非侵入性诊断标志物 首次在BK多瘤病毒肾病中鉴定出具有上皮-免疫双重特征的近端小管细胞新亚群(IGKC+ PT),并阐明其通过诱导T细胞耗竭促进疾病进展的潜在机制 研究样本量有限,且主要基于观察性数据,需要进一步的功能性实验验证IGKC+ PT亚群的具体作用机制 探究BK多瘤病毒肾病的微环境特征,寻找新的治疗靶点和诊断标志物 BK多瘤病毒肾病患者的肾移植样本和尿液样本 单细胞组学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 BK多瘤病毒肾病样本和稳定移植肾样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
269 2026-03-23
Multi-omics Mendelian randomization and single-cell analysis identify novel therapeutic targets for osteosarcopenia
2025-11-06, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
研究论文 本研究通过多组学孟德尔随机化和单细胞分析,识别了骨肌减少症的潜在治疗靶点 整合了转录组、蛋白质组孟德尔随机化、SMR和共定位分析,结合单细胞RNA测序数据,首次系统性地识别了骨肌减少症的因果相关基因和蛋白质靶点 需要进一步在特定组织和细胞环境中验证这些靶点的功能和作用机制 识别骨肌减少症的潜在治疗靶点 骨肌减少症(骨质疏松和肌肉减少症共存) 生物信息学 老年疾病 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 孟德尔随机化模型 基因组关联研究数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 大规模GWAS数据集(包括eQTLgen, deCODE, Fenland) NA 单细胞RNA-seq NA NA
270 2026-03-21
Genome doubling as a dynamic driver of ovarian cancer evolution: insights from single-cell sequencing
2025-Nov-19, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
综述 本文综述了全基因组加倍(WGD)作为卵巢癌进化动态驱动因子的最新见解,特别是通过单细胞测序技术揭示其在高级别浆液性卵巢癌中的作用 重新定义了WGD的角色,从基因组不稳定的结果转变为肿瘤进化的核心动态驱动因子,并解决了WGD驱动的染色体不稳定性与免疫抑制表型相关的生物学悖论 NA 探讨全基因组加倍在卵巢癌,特别是高级别浆液性卵巢癌进化中的动态驱动作用及其临床意义 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC) 基因组学 卵巢癌 单细胞测序 NA 基因组数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
271 2026-03-21
Bile acids engage the SIPR-STAT3 signaling axis to modulate regulatory T cell responses in fibrosing cholangiopathies
2025-Nov, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究探讨了胆汁酸通过S1PR-STAT3信号轴调节调节性T细胞(Treg)在纤维化胆管病中的应答,揭示了其抑制Treg功能并促进Th17样表型的机制 首次在单细胞水平上揭示了胆汁酸通过S1PR-STAT3信号轴抑制Treg功能并促进其向Th17样表型极化的机制,并提出了通过IBAT抑制剂恢复Treg功能的新治疗策略 研究主要基于小鼠模型,虽然验证了部分人类样本,但临床转化仍需进一步临床试验验证 阐明胆汁酸在纤维化胆管病中如何调节调节性T细胞(Treg)的应答机制 小鼠模型(包括硬化性胆管炎模型和Abcb4-/-模型)以及130例胆道闭锁婴儿的肝组织样本 单细胞组学 纤维化胆管病(包括胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎) 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq),功能验证实验 NA 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据,临床肝组织样本数据 多个小鼠模型及130例胆道闭锁婴儿肝组织样本 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
272 2026-03-21
Single-cell transcriptional landscape of liver transplant rejection reveals tissue persistence of clonally expanded, treatment-resistant T cells
2025-Nov, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组库分析,揭示了肝移植排斥中克隆扩增、治疗抵抗性T细胞的转录景观及其在组织中的持久性 首次在儿科肝移植排斥中,利用单细胞技术全面描绘了CD8 T细胞的克隆扩增、基因表达、空间定位及其在组织中的持久性,并揭示了库普弗细胞与CD8 T细胞间的差异互作机制 样本量相对较小(30例冷冻肝活检),且仅针对儿科患者,可能限制了结果的普遍性 探究肝移植后T细胞介导的排斥反应中CD8 T细胞的克隆扩增、持久性及分子机制 儿科肝移植患者的冷冻肝活检样本(包括排斥和非排斥状态) 数字病理学 肝移植排斥 单细胞RNA测序,免疫组库分析 MultiNicheNet分析 单细胞转录组数据,免疫组库数据 30例冷冻肝活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
273 2026-03-19
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data to dissect genetic links between periodontitis and obstructive sleep apnea
2025-11-17, Sleep & breathing = Schlaf & Atmung
研究论文 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,结合机器学习方法,探索了牙周炎与阻塞性睡眠呼吸暂停之间的遗传联系,并鉴定了关键hub基因作为诊断和治疗靶点 首次整合bulk和单细胞RNA-seq数据,结合多种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、Boruta)筛选hub基因,并利用虚拟基因敲除和药物预测揭示疾病间的遗传互作机制 研究基于公共数据库(GEO)的回顾性数据,样本来源和实验条件可能存在异质性;虚拟基因敲除为计算模拟,需实验验证;药物预测为数据库挖掘,临床有效性待确认 探索牙周炎与阻塞性睡眠呼吸暂停之间的遗传联系和共享病理机制 牙周炎和阻塞性睡眠呼吸暂停患者的基因表达数据 生物信息学 牙周炎, 阻塞性睡眠呼吸暂停 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO, SVM-RFE, Boruta 基因表达数据 未明确具体样本数量,数据来源于GEO数据库 NA 单细胞RNA-seq NA NA
274 2026-03-19
Advancing Precision Medicine in Inflammatory Skin Disease
2025-Nov, American journal of clinical dermatology IF:8.6Q1
评论 本文探讨了精准医学在慢性炎症性皮肤病治疗中的应用,强调通过分子和细胞特征定制诊断和治疗策略 提出了精准医学在皮肤病中的关键临床应用场景,并突出了单细胞RNA测序和空间转录组学等先进技术对疾病分类和药物反应预测的改进 技术应用面临生物标志物验证有限、成本高和研究队列广度不足等挑战 推动精准医学在皮肤病学中的整合,以优化治疗选择和改善患者预后 慢性炎症性皮肤病患者 数字病理学 炎症性皮肤病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 分子和细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
275 2026-03-14
Inference of Tumor Progression Patterns in Colon Cancer Using Optimal Cell Order Analysis in Single Cell Resolution
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本研究提出了一种基于单细胞RNA-Seq数据的计算方法,用于推断结肠癌中细胞群体的进展模式 开发了一种基于排序的方法,利用最优重排序层次结构推断进展模式,并提供了先进的三维可视化工具和新评估指标 方法主要基于单细胞RNA-Seq数据,可能未考虑其他组学层面或更大样本量的验证 推断结肠癌中细胞群体的动态进展模式,如分化、信号传导或肿瘤进化轨迹 人类结肠样本的单细胞转录组数据 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA-Seq 基于排序的算法,主曲线可视化 单细胞RNA-Seq数据 未明确指定,但涉及真实人类结肠样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
276 2026-03-13
Multimodal Integration of Genomic Data Reveals Regulatory Mechanisms at the Polycystic Ovary Syndrome (PCOS)-Associated 12q13.2 Locus
2025-Nov-19, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合多种基因组数据,揭示了多囊卵巢综合征相关12q13.2基因座的调控机制 首次整合全外显子组测序、STARR-seq增强子活性和单细胞RNA测序数据,系统解析了PCOS相关基因座的功能机制 研究主要聚焦于12q13.2基因座,可能未涵盖PCOS的其他遗传因素;样本来源相对有限 阐明多囊卵巢综合征相关12q13.2基因座的遗传变异功能机制 多囊卵巢综合征患者和正常对照的卵泡膜细胞 基因组学 多囊卵巢综合征 全外显子组测序, STARR-seq, 单细胞RNA测序, 全基因组测序, eQTL共定位分析 NA 基因组变异数据, 增强子活性数据, 单细胞表达数据 PCOS患者和正常对照的卵泡膜细胞样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序, 全基因组测序 NA NA
277 2026-03-10
Pharmacological Inhibition of Ferroptosis Attenuates Experimental Abdominal Aortic Aneurysm Formation
2025-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨了铁死亡在腹主动脉瘤形成中的作用,并通过药理学抑制铁死亡来减轻实验性腹主动脉瘤的形成 首次在腹主动脉瘤形成中揭示了铁死亡的作用,并展示了使用liproxstatin-1抑制铁死亡可减轻主动脉炎症和重塑 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且仅使用了一种铁死亡抑制剂 探究铁死亡在腹主动脉瘤形成中的机制及药理学抑制的潜在治疗效果 人类腹主动脉瘤组织、C57BL/6小鼠(雄性和雌性)的主动脉组织、巨噬细胞和平滑肌细胞 单细胞组学 腹主动脉瘤 单细胞RNA测序、质谱分析、组织学分析、体外细胞培养 NA 单细胞RNA测序数据、质谱数据、组织图像、体外实验数据 人类AAA组织数据库、使用弹性蛋白酶或弹性蛋白酶+β-氨基丙腈诱导的C57BL/6小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
278 2026-03-08
In vivo differentiation of embryonic cells devoid of key reprogramming factors
2025-Nov-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq分析斑马鱼胚胎中NPS突变细胞在野生型胚胎中的命运,探讨了NPS在发育重编程和分化中的作用 揭示了NPS在协调核与细胞质重编程、防止谱系特异性分化程序过早激活中的关键作用,并发现部分细胞可绕过短暂全能性达到类似野生型的中间发育状态 研究基于斑马鱼模型,结果可能不直接适用于其他物种;单细胞RNA-seq技术可能无法完全捕捉所有转录动态 探究NPS(Nanog、Pou5f3、Sox19b)在胚胎细胞发育重编程和分化中的功能 斑马鱼胚胎中的NPS突变细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 未明确指定样本数量,涉及斑马鱼胚胎细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
279 2026-03-06
Mitochondrial iron transport via MFRN1 is required for erythroid cell cycle progression
2025-Nov-25, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究开发了体内方法,探讨铁如何调节红细胞生成,并报告了通过mitoferrin-1(MFRN1)的线粒体铁运输对红细胞细胞周期进程至关重要 揭示了MFRN1介导的线粒体铁运输在红细胞细胞周期G2/M期进展中的关键作用,并通过铁补充实验验证了其机制 研究主要基于斑马鱼胚胎模型,可能需要在其他生物系统中进一步验证 探究铁代谢如何调节红细胞生成过程,特别是细胞周期和分化 斑马鱼胚胎中的红细胞(erythroid cells) NA NA 单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing),荧光激活流式分选(fluorescence-activated flow sorting) NA RNA测序数据,流式细胞术数据 斑马鱼胚胎(包括野生型和mfrn1突变体),具体样本数量未明确说明 NA single-cell RNA-seq NA NA
280 2026-03-06
TransST: transfer learning embedded spatial factor modeling of spatial transcriptomics data
2025-Nov-06, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文提出了一种名为TransST的新型迁移学习框架,用于从空间转录组学数据中推断细胞水平的异质性 TransST通过自适应地利用外部来源的细胞标记信息,提高了空间转录组学数据中细胞亚群识别和生物标志物检测的准确性和鲁棒性 NA 开发一种迁移学习框架,以克服空间转录组学技术中分辨率和测序深度的限制,从而更可靠地提取生物信号 空间转录组学数据,特别是乳腺癌研究中的细胞亚群 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 迁移学习框架 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
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