单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1144 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-12-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Neutrophil Clusters Associated with Autoimmune Neuroinflammation
2025-Nov-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8012709/v1
PMID:41333423
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了与自身免疫性神经炎症相关的嗜中性粒细胞簇，并发现Saa3/SAA1作为潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次在EAE模型中利用scRNA-Seq揭示嗜中性粒细胞在CNS炎症中的异质性，并识别出Saa3/SAA1作为MS的潜在生物标志物 | 研究基于小鼠EAE模型，结果在人类MS中的直接适用性需进一步验证 | 探究嗜中性粒细胞在自身免疫性神经炎症（如多发性硬化症）中的具体作用和异质性 | 小鼠EAE模型中的嗜中性粒细胞，以及多发性硬化症患者的血浆样本 | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠小脑和脊髓的嗜中性粒细胞，以及MS患者和健康对照的血浆样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2025-12-05 |
CD301b lectin expression in the breast tumor microenvironment augments tumor growth
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.13.584829
PMID:41332518
|
研究论文 | 本文探讨了CD301b凝集素在乳腺癌微环境中的表达如何促进肿瘤生长 | 首次将肿瘤糖基化与CD301b⁺髓系细胞的凝集素信号传导联系起来，揭示其在调节免疫活性和促进肿瘤进展中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据有限，且机制细节需进一步验证 | 研究肿瘤糖基化与凝集素相互作用对乳腺癌进展的影响 | 小鼠三阴性乳腺癌模型及人类乳腺癌样本 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2025-12-05 |
Comparative Single-Cell Transcriptomics Uncovers Shared and Distinct Molecular Signatures in Cystic Fibrosis and Primary Ciliary Dyskinesia
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.17.688876
PMID:41332697
|
研究论文 | 本研究通过比较单细胞转录组学分析，揭示了囊性纤维化（CF）和原发性纤毛运动障碍（PCD）之间的共享和独特分子特征 | 利用预训练的transformer模型（scGPT）进行微调，并通过差异注意力分析识别两种疾病之间注意力分数改变的基因和通路，首次在单细胞水平上比较CF和PCD的分子机制 | 研究依赖于公开可用的测序数据，可能受数据质量和样本来源的限制，未涉及长期临床结果验证 | 比较CF和PCD的细胞异质性、分子通路和基因网络差异，以揭示其不同的分子机制 | 囊性纤维化（CF）和原发性纤毛运动障碍（PCD）患者的呼吸道细胞 | 自然语言处理 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA-seq | transformer（scGPT） | 文本（基因表达数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-12-05 |
Analysis of clinical, single cell, and spatial data from the Human Tumor Atlas Network (HTAN) with massively distributed cloud-based queries
2025-Nov-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7769205/v1
PMID:41333415
|
研究论文 | 本文介绍了人类肿瘤图谱网络（HTAN）开发的基于云的基础设施，用于整合和分析大规模、多模态的癌症数据集 | 引入了两个关键创新：1）基于来源的HTAN ID表，简化了队列构建和跨检测整合；2）新颖地适配了BigQuery的地理空间功能用于空间生物学，实现了肿瘤微环境的邻域和相关性分析 | 未明确提及具体的技术或计算限制 | 开发一个云基础设施，以降低整合、探索和分析大规模多模态癌症数据集的技术和计算障碍 | 人类肿瘤图谱网络（HTAN）生成的数据集，包括单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像数据以及临床数据 | 空间生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像 | NA | 单细胞数据、空间数据、临床数据、元数据 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | Google BigQuery | 基于Google BigQuery的云基础设施，托管于系统生物学研究所癌症云网关（ISB-CGC） | |
| 185 | 2025-12-05 |
Multiscale Cell-Cell Interactive Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508358
PMID:40948400
|
研究论文 | 本文提出了一种多尺度细胞-细胞交互空间转录组学分析方法，用于整合基因表达谱与空间位置信息 | 首次在空间转录组学分析中系统性地整合了多尺度细胞-细胞相互作用，并结合了多尺度拓扑表示与前沿空间深度学习技术 | NA | 开发一种能够捕捉多尺度细胞-细胞相互作用的空间转录组学分析方法 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 空间深度学习技术 | 空间转录组学数据 | 37个基准空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 186 | 2025-12-05 |
Decipherment of disulfidptosis-related mutation profile, chemosensitivity, and prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025-Nov, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-025-02571-8
PMID:40824493
|
研究论文 | 本研究通过分析弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）及其他多种肿瘤的转录组、体细胞突变和单细胞RNA测序数据，探索了二硫键死亡相关基因（DRGs）的表达谱、突变特征及其与预后和化疗敏感性的关联，并构建了一个新的DRGs风险评分模型 | 首次在DLBCL中系统研究了二硫键死亡相关基因（DRGs）的表达、突变及其临床意义，并构建了一个新的DRGs风险评分模型，该模型在DLBCL及泛癌分析中显示出良好的预后预测和化疗敏感性评估价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证DRGs评分模型的临床应用价值 | 探索二硫键死亡相关基因（DRGs）在弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）中的表达、突变特征及其与患者预后、化疗敏感性的关系 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者及其他30种肿瘤类型的转录组、体细胞突变和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 转录组测序，单细胞RNA测序（scRNA-seq），体细胞突变分析，分子对接分析 | 风险评分模型 | 转录组数据，突变数据，单细胞RNA测序数据 | 涉及DLBCL患者及30种肿瘤类型的转录组和突变数据，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 187 | 2025-12-05 |
Adenylate Uridylate- (AU-) Rich Element Gene-Based Prognostic Signature and Molecular Subtypes of Prostate Adenocarcinoma: Implications for Prognosis and Immune Microenvironment
2025-Nov, Archivos espanoles de urologia
IF:0.6Q4
|
研究论文 | 本研究基于腺苷酸尿苷酸富集元件基因构建了一个前列腺腺癌的预后特征和分子亚型，用于预测预后和反映免疫微环境特征 | 首次利用AREGs基因（ACSM3、ACTG2、DES）构建前列腺腺癌的预后模型，并关联免疫微环境分析 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析，实验验证仅限于qRT-PCR，缺乏更深入的体内外功能验证 | 开发前列腺腺癌的预后预测模型并探索其与免疫微环境的关系 | 前列腺腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 加权基因共表达网络分析、Cox回归、LASSO正则化、CIBERSORT免疫浸润分析、单细胞转录组学、qRT-PCR | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 基于公共PRAD数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 188 | 2025-12-04 |
Characterize Oral-to-Blood Microbial DNA Translocation in Individuals with Cocaine Use Disorder
2025-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.686400
PMID:41280052
|
研究论文 | 本研究首次证明通过吸烟或鼻吸方式摄入可卡因的个体，其口腔微生物群失调，并存在选择性的口腔至血液微生物易位 | 首次在人体中证实可卡因使用障碍（COC）个体存在口腔微生物群失调及选择性的口腔至血液微生物易位，并揭示了其与先天免疫激活的关联 | 样本量较小（10名COC患者，24名对照），为横断面研究，无法确定因果关系 | 探究可卡因使用障碍个体口腔是否为循环微生物DNA易位的来源，及其对免疫系统的影响 | 当前患有可卡因使用障碍的个体（通过吸烟或电子烟方式摄入）及人口统计学匹配的非药物使用对照者 | 微生物组学，免疫学 | 物质使用障碍（可卡因使用障碍） | 微生物16S rRNA V4区测序，单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | DNA序列数据，单细胞基因表达数据 | 34名参与者（10名可卡因使用障碍患者，24名对照） | NA | 16S rRNA基因测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2025-12-04 |
Single-cell multiomics reveals macrophage-derived IL-23 and CXCL9/10 drive pathogenic IFNG+IL17+ T cells in immunotherapy-related colitis
2025-Nov-29, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011959
PMID:41320225
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了巨噬细胞来源的IL-23和CXCL9/10驱动IFNG+IL17+ T细胞在免疫治疗相关结肠炎中的致病作用 | 首次在免疫治疗相关结肠炎中鉴定出具有双重Th1/Th17特征的致病性IFNG+IL17+CD4+ T细胞亚群，并阐明其由组织驻留记忆T细胞分化而来，同时揭示了巨噬细胞通过IL-23和CXCL9/10信号通路驱动该过程的机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要更大规模的人类队列验证；机制研究虽深入但部分信号通路的具体调控细节仍需进一步探索 | 阐明免疫检查点阻断治疗相关结肠炎的免疫病理机制，并寻找不影响抗肿瘤疗效的治疗靶点 | 免疫治疗相关结肠炎患者和小鼠模型中的免疫细胞，特别是IFNG+IL17+CD4+ T细胞和肠道巨噬细胞 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学, 流式细胞术, qPCR, 体内中和抗体阻断, 巨噬细胞耗竭 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, T细胞受体序列数据, 流式细胞术数据, qPCR数据 | 人类irColitis病变样本和小鼠模型样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 190 | 2025-12-04 |
Neutrophil extracellular traps-STC1 positive feedback loop promotes immune evasion and metastasis in bladder cancer
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012736
PMID:41314976
|
研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌中中性粒细胞胞外陷阱（NETs）与抗吞噬检查点STC1之间的正反馈环路在促进免疫逃逸和转移中的关键作用 | 首次发现NETs通过TLR2-MAPK-FosL1轴上调STC1，形成NETs-STC1自增强反馈环路，并阐明STC1通过隔离钙网蛋白抑制抗原呈递及分泌形式增强NET形成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床验证仍需进一步开展；反馈环路在其他癌症类型中的普适性未明确 | 探究膀胱癌免疫治疗耐药机制及NETs在其中的作用 | 膀胱癌患者临床队列、小鼠肺转移模型、肿瘤细胞与中性粒细胞共培养体系 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 免疫荧光染色、扫描电镜、蛋白质组学、单细胞转录组学 | 小鼠肺转移模型 | 临床队列数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据、影像数据 | 多个接受免疫检查点抑制剂治疗的临床队列（具体样本量未明确） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 191 | 2025-12-04 |
Cellular dynamics in cerebrospinal fluid unveils the key regulators of intracranial response to immune checkpoint inhibitors in NSCLC brain metastases
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012071
PMID:41314983
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非小细胞肺癌脑转移患者在接受免疫检查点抑制剂治疗期间，脑脊液和脑转移瘤中的细胞动态变化，并识别出CD4+PDCD1+CXCR6+ T细胞作为颅内治疗反应的关键预测因子 | 首次在脑脊液中利用单细胞RNA测序构建了高分辨率的细胞动态图谱，并鉴定出CD4+PDCD1+CXCR6+ T细胞这一新型免疫细胞亚群作为免疫检查点抑制剂颅内疗效的阳性预测标志物 | 样本量相对较小（脑脊液样本n=20），且依赖于外部数据库数据进行整合分析，可能需要更大规模的前瞻性队列验证 | 探索非小细胞肺癌脑转移患者对免疫检查点抑制剂治疗的颅内反应机制，并寻找预测性生物标志物 | 非小细胞肺癌伴脑转移的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 蛋白质组学分析, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质组数据, 免疫组织化学图像 | 脑脊液样本20例, 外部数据库样本20例, 流式细胞验证队列8例, 蛋白质组学验证队列31例, 多重免疫组化验证队列25例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-12-04 |
Blocking PCSK9 suppresses hepatocellular carcinoma immune escape by decreasing FLI1-mediated SPP1 and PD-L1 expression
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012586
PMID:41314977
|
研究论文 | 本研究揭示了PCSK9通过NOTCH3/FLI1信号通路上调SPP1和PD-L1表达，从而促进肝细胞癌免疫逃逸的机制，并探索了基于CRISPR碱基编辑和小分子抑制剂的干预策略 | 首次发现PCSK9通过NOTCH3/FLI1通路调控SPP1和PD-L1表达，介导肝细胞癌免疫逃逸，并开发了新型ABE碱基编辑器和小分子抑制剂parecoxib作为治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，尚未在人体临床试验中验证，且PCSK9抑制剂parecoxib的具体作用机制和长期安全性需进一步研究 | 揭示PCSK9促进肝细胞癌免疫逃逸的分子机制，并探索靶向PCSK9的治疗策略 | 肝细胞癌细胞系（Hepa1-6、H22、HepG2）、小鼠肝细胞癌模型、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、CRISPR腺嘌呤碱基编辑、共培养实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 多种肝细胞癌细胞系及小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-12-04 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomic analysis uncovers cellular and molecular alterations in the hypertensive brain
2025-Nov-24, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124107
PMID:41297664
|
研究论文 | 本研究通过整合空间和单细胞转录组分析，揭示了高血压大脑中的细胞和分子改变 | 首次结合空间转录组测序和单细胞RNA测序，识别了高血压大鼠下丘脑和延髓中先前未知的脑区及特定神经元亚群，并发现Eno1的上调在神经调控血压中的作用 | 研究主要基于大鼠模型，人类样本验证有限，且样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 旨在表征高血压相关中枢神经系统区域的空间和单细胞转录组特征，以揭示神经源性高血压的分子机制 | 自发性高血压大鼠和正常血压Wistar-Kyoto对照大鼠的下丘脑和延髓组织，以及人类脑组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序, 组织学分析 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 大鼠样本（自发性高血压大鼠和Wistar-Kyoto对照，4周和10周龄），人类脑组织样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2025-12-04 |
Determining gene specificity from multivariate single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.689845
PMID:41332587
|
研究论文 | 本文提出了一种基于熵度量的基因特异性测量方法ember，用于从多变量单细胞RNA测序数据中识别基因特异性，并应用于小鼠和人类数据集 | 通过公理化方法定义了基因特异性测量应满足的四个关键属性，并证明ember是唯一满足这些属性的方法，从而提供了一种更可靠和直观的基因特异性分析工具 | 未明确讨论ember方法在计算效率或大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一种基于公理化属性的基因特异性测量方法，以更准确地识别单细胞RNA测序数据中与生物类别或实验条件相关的特异性基因 | 小鼠八个组织的单细胞RNA测序数据以及来自255个不同个体的人类PBMC单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠八个组织的样本以及255个人类个体的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2025-12-04 |
Selective modification of glycoprotein substrates by GnT-V in mouse kidney
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113894
PMID:41323266
|
研究论文 | 本研究探讨了小鼠肾脏中N-乙酰葡糖胺转移酶-V（GnT-V）对蛋白质底物选择性的机制 | 通过凝集素辅助蛋白质组学鉴定出ANPEP和MEP1A为GnT-V的主要底物，并揭示了修饰位点的结构特征和极化亚细胞运输在选择性修饰中的作用 | 研究仅基于小鼠肾脏模型，未在其他组织或物种中验证，且机制细节仍需进一步探索 | 探究GnT-V在蛋白质选择性糖基化中的机制 | 小鼠肾脏中的糖蛋白底物，特别是ANPEP和MEP1A | 糖生物学 | NA | 凝集素辅助蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2025-12-04 |
Niclosamide suppresses gastric cancer progression through YTHDF2 inhibition-affected lactate metabolic reprogramming
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113868
PMID:41323282
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了胃癌的代谢重编程特征，并发现药物氯硝柳胺通过抑制m6A甲基化调控蛋白YTHDF2来影响代谢基因，从而抑制胃癌进展 | 首次将氯硝柳胺的抗癌作用与m6A甲基化调控蛋白YTHDF2联系起来，并系统阐明了其在调节乳酸代谢重编程和肿瘤微环境乳酸穿梭中的作用机制 | NA | 探究胃癌代谢重编程的分子机制，并评估氯硝柳胺通过靶向YTHDF2抑制胃癌进展的治疗潜力 | 胃癌患者样本、胃癌细胞系 | 肿瘤代谢 | 胃癌 | 非靶向代谢组学、转录组学、单细胞RNA-seq | NA | 代谢组数据、转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-12-04 |
stTransfer enables transfer of single-cell annotations to spatial transcriptomics with single-cell resolution
2025-Nov-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101205
PMID:41101315
|
研究论文 | 本文提出了一种名为stTransfer的方法，通过整合单细胞RNA测序数据和空间转录组数据，利用图自编码器和迁移学习实现单细胞级别的细胞类型注释 | stTransfer方法通过图自编码器和迁移学习最小化scRNA-seq与ST数据集间的信息传递损失，在准确性和鲁棒性上优于现有方法 | 未在摘要中明确说明 | 解决空间转录组技术中因检测灵敏度和基因覆盖度限制导致的单细胞级别细胞类型注释难题 | 斑胸草雀视顶盖的高精度Stereo-seq数据集中的神经元群体 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图自编码器, 迁移学习 | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Stereo-seq | 高精度Stereo-seq |
| 198 | 2025-12-04 |
GPR15 and CD38 define a subset of peripheral blood pathogenic effector Th2 cells associated with active eosinophilic esophagitis
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.16.688265
PMID:41332632
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，识别了外周血中GPR15+ CD38+致病性效应Th2细胞亚群与活动性嗜酸性食管炎的关联 | 首次将外周血GPR15+致病性效应Th2细胞与食管组织中的对应细胞直接关联，并发现CD38表达上调可作为活动性疾病的标志，为非侵入性诊断提供了新靶点 | 样本量相对有限（外周血74例，活检17例；单细胞测序外周血27例，活检10例），且机制研究如环境暴露的具体因素需进一步探索 | 评估GPR15+致病性效应Th2细胞在嗜酸性食管炎发病机制中的作用及其作为疾病状态生物标志物的潜力 | 嗜酸性食管炎患者及对照者的外周血和食管活检样本 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 流式细胞术：74例外周血样本和17例活检样本；单细胞RNA测序：27例外周血样本和10例活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2025-12-04 |
Integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data reveals age-related immune cell alterations in primary glioblastoma associated with prognosis
2025-Nov-12, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04206-w
PMID:41222641
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据分析，揭示了原发性胶质母细胞瘤中与年龄相关的免疫细胞变化及其与预后的关联 | 首次系统比较了原发性与复发性胶质母细胞瘤中年龄相关的免疫细胞差异，并发现小胶质细胞在老年原发性患者中经历显著的细胞状态变化，其中HSPB1高表达与不良预后相关 | 研究样本量相对有限，单细胞数据仅来自25名患者，且主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探究衰老如何影响胶质母细胞瘤进展，特别是年龄相关的免疫细胞变化在原发性与复发性肿瘤中的差异 | 胶质母细胞瘤患者（包括原发性和复发性）以及年轻和老年小鼠的异种移植模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，批量转录组分析，细胞间通讯分析，轨迹分析 | NA | 转录组数据，临床数据，基因组变异数据 | 13名原发性胶质母细胞瘤患者和12名复发性患者，共计88,908个细胞的单细胞数据；TCGA和CGGA数据库的批量数据；年轻和老年小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2025-12-04 |
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-Nov-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110925
PMID:41207622
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠皮下白色脂肪组织中胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组可塑性及其混合起源 | 首次在单细胞水平上全面解析了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组动态变化，并揭示了其混合起源（成年骨髓和胚胎来源） | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；急性冷暴露的长期效应和具体机制仍需进一步探索 | 探究胆碱能脂肪巨噬细胞在急性产热反应中的转录组可塑性和细胞起源 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞（表达胆碱乙酰转移酶） | 单细胞转录组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及热中性或急性冷暴露条件下的小鼠脂肪组织 | 未明确指定 | 单细胞RNA-seq | 未明确指定 | 未明确指定 |