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当前共找到 923 篇文献,本页显示第 181 - 200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
181 2026-07-29
DAPK1-positve macrophages facilitate immunosuppressive microenvironment and determine immunotherapy efficacy in colorectal cancer
2025-11-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序等技术,发现DAPK1阳性巨噬细胞促进结直肠癌免疫抑制微环境并影响免疫治疗效果 首次揭示DAPK1阳性巨噬细胞在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫抑制特性及其作为免疫检查点阻断治疗协同靶点的潜力 仅基于小鼠模型和临床样本,缺乏大规模前瞻性验证研究 鉴定结直肠癌中促进癌症进展和免疫治疗耐药的特定巨噬细胞亚群 结直肠癌患者及小鼠模型的肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 图像、文本、测序数据 多个临床队列及小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
182 2026-07-29
Neutrophil extracellular traps regulate LDHA expression to promote colorectal cancer liver metastasis
2025-11-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了中性粒细胞胞外陷阱(NETs)如何通过调节LDHA表达促进结直肠癌肝转移 首次揭示了NETs通过PI3K/AKT通路调控LDHA表达,进而促进结直肠癌肝转移的分子机制 主要基于体外实验和裸鼠异种移植模型,缺乏大规模临床样本验证 阐明NETs在结直肠癌肝转移中的作用及分子机制 结直肠癌组织和肝转移病灶 机器学习 结直肠癌 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 基于公开单细胞转录组数据库样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
183 2026-07-29
A novel palmitoylation-based molecular signature reveals COX6A1 as a key regulator in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-11-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 开发了一种基于棕榈酰化的分子特征,揭示COX6A1在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的关键调控作用 首次构建基于棕榈酰化相关基因的分子分型,并利用机器学习和单细胞分析发现COX6A1作为潜在诊断标志物和治疗靶点 主要基于公共数据库分析,缺乏大规模临床队列验证;体外实验仅使用HepG2细胞系,未进行体内动物模型验证 探索棕榈酰化、线粒体功能和免疫重塑在MASLD中的分子联系 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 机器学习 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 共识聚类, WGCNA, 机器学习(12种算法,113种模型组合) 基因表达数据 4个GEO批量RNA-seq队列和1个单细胞RNA-seq队列 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
184 2026-07-28
PPIF+ neutrophils promote mtROS driven NETosis mediated progression of colorectal cancer
2025-11-11, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 探索肿瘤相关中性粒细胞胞外陷阱(NETs)驱动结直肠癌进展的机制,并分析肿瘤微环境中的细胞亚群 首次揭示PPIF+中性粒细胞亚群通过促进线粒体活性氧产生驱动NETs形成,进而促进结直肠癌进展,并发现RACK1可能作为关键生态位基因 主要依赖公共数据库的单细胞RNA-seq数据,缺乏体外和体内实验验证 阐明NETs在结直肠癌进展中的作用机制,识别潜在治疗靶点 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞亚群,特别是中性粒细胞亚群 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自GEO数据库的公共数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
185 2026-07-28
Integrated clinical and single-cell profiling of BCMA CAR-T therapy in relapsed/refractory multiple myeloma
2025-11-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过对6例复发/难治性多发性骨髓瘤患者进行自体BCMA CAR-T细胞治疗的单臂试验,结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序,评估其安全性与疗效,并揭示CAR-T细胞异质性、克隆适应性和免疫调节的作用 首次在BCMA CAR-T治疗中整合单细胞RNA测序和T细胞受体测序,揭示持久应答者中CD8+ T细胞亚群的功能专化性和克隆进化,以及早期CAR-T耗竭和调节性T细胞增加与复发的关联 样本量较小(仅6例患者),单臂试验设计缺乏对照组,且临床结局差异的机制仅基于两名患者的比较分析 评估本地生产的BCMA CAR-T细胞在复发/难治性多发性骨髓瘤中的安全性和疗效,并通过单细胞测序解析CAR-T细胞的异质性和免疫动力学 6例复发/难治性多发性骨髓瘤患者 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq), T细胞受体测序(TCR-seq) NA 基因表达数据, T细胞受体序列数据 6例复发/难治性多发性骨髓瘤患者 NA 单细胞RNA测序, scRNA-seq, TCR-seq NA NA
186 2026-07-28
A PCD-related prognostic signature and the oncogenic role of TRIM8 in osteosarcoma progression
2025-11-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 基于程序性细胞死亡相关基因构建骨肉瘤预后模型并验证TRIM8的致癌作用 首次综合运用突变分析、生存分析、机器学习算法及单细胞RNA测序数据构建基于程序性细胞死亡的骨肉瘤预后模型,并通过湿实验验证模型基因TRIM8促进肿瘤增殖和迁移的功能 模型验证主要依赖TARGET-OS队列,未提及在其他独立外部队列中的验证;湿实验仅针对单个模型基因TRIM8,未全面验证其他16个基因的功能 开发可可靠预测骨肉瘤患者预后及评估治疗反应的PCD相关生物标志物模型 骨肉瘤患者及肿瘤样本 机器学习 骨肉瘤 单细胞RNA测序、突变分析、生存分析、机器学习 Cox回归、LASSO回归、随机森林等组合模型 基因表达数据、突变数据、单细胞转录组数据 TARGET-OS队列(具体样本数未在摘要中提及) NA 单细胞RNA-seq NA NA
187 2026-07-28
Multi-omics analyses identify mannose phosphate isomerase-centered hypoxia-induced angiogenesis signature in colorectal cancer
2025-11-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过多组学分析发现结直肠癌中甘露糖磷酸异构酶驱动的缺氧诱导血管生成特征 首次构建基于缺氧诱导血管生成相关基因的预后评分系统,并发现MPI通过JAK2/STAT3信号通路促进结直肠癌增殖和血管生成 未提及具体限制,可能包括样本量有限、缺乏外部验证等(根据摘要推断) 探索结直肠癌中缺氧诱导血管生成相关基因的调控网络、分子机制及预后价值 结直肠癌患者和细胞系 机器学习, 数字病理学 结直肠癌 ChIP-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 微阵列 ssGSEA, SRGA, 一致性聚类 多组学数据(包括图像、文本) 来自结直肠癌患者和细胞系的多组学数据(具体数量未提及) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
188 2026-07-28
Integrating genetics and transcriptome analyses identify potential biomarkers and immune interactions in metabolic syndrome-related sarcopenia
2025-11-05, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过整合遗传学和转录组分析,识别代谢综合征相关肌少症的潜在生物标志物和免疫相互作用 从遗传学角度揭示了代谢综合征与肌少症共病机制,发现了共享的遗传架构和免疫相互作用 未在论文标题和摘要中明确说明 探索代谢综合征与肌少症之间的潜在机制和生物标志物 代谢综合征和肌少症相关特征 机器学习和生物信息学 代谢综合征,肌少症 全基因组关联研究,转录组关联研究,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA(未提供具体样本数量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
189 2026-07-28
Conserved sphingolipid metabolism under transcriptomic diversity: a prognostic and therapeutic target in triple-negative breast cancer
2025-11-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究在转录组多样性背景下鉴定出保守的鞘脂代谢通路,并评价其作为三阴性乳腺癌预后标志物和治疗靶点的潜力 首次在转录组高度异质性的三阴性乳腺癌中鉴定出鞘脂代谢作为保守通路,并通过多组学分析(单细胞RNA测序、空间转录组学)和功能实验验证其作为可靠预后标志物和治疗靶点的可行性 未提及患者样本来源、模型验证范围及潜在通用性,可能限制结论的广泛适用性 在三阴性乳腺癌中识别异质性但保守的分子通路,为克服治疗抵抗提供可靠靶点 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本及细胞系 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、KEGG富集分析、ssGSEA 非负矩阵分解、细胞通讯分析、预后模型 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、基因组数据 TCGA-TNBC队列(样本量未明确)、GSE176078单细胞RNA测序数据集、多区域TNBC数据集 Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Illumina NovaSeq 未提供具体配置细节
190 2026-07-28
Fragile X mental retardation 1 gene FMR1 promotes proliferation, migration, and invasion of gastric cancer cells via c-MYC
2025-11-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 研究FMR1基因通过c-MYC信号通路促进胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的作用机制 首次揭示FMR1在胃癌中高表达并通过与c-MYC蛋白相互作用、抑制其蛋白酶体降解来稳定c-MYC,进而促进肿瘤进展的分子机制 研究主要依赖体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证 探究FMR1在胃癌中的表达、功能及其分子机制 胃癌细胞系及临床胃癌组织样本 机器学习 胃癌 qRT-PCR, Western blotting, 免疫组化, 单细胞转录组学, co-IP, 蛋白质合成抑制实验 NA 基因表达数据, 临床病理数据, 免疫浸润数据 TCGA队列胃癌及正常胃组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
191 2026-07-27
Consensus spectral clustering with weighted similarity functions for single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-16, Communications in statistics: Simulation and computation
研究论文 本文探索了一种基于加权相似函数的共识谱聚类方法,用于单细胞RNA测序数据的无监督聚类分析 提出了基于随机采样的共识聚类框架与流形谱聚类相结合,并引入测地距离度量和两种加权度量改进相似性核函数,从而提升单细胞RNA-seq数据的聚类性能 未说明局限性,但可能存在对数据集变异类型的依赖,且未提及跨平台验证或大规模数据集的可扩展性 开发一种有效的无监督聚类算法,以解决单细胞RNA-seq数据的高维度、稀疏性和噪声问题,从而准确识别细胞类型和状态 单细胞RNA测序数据集(包含不同变异类型) 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 谱聚类(共识聚类框架结合流形谱聚类) 基因表达数据 多个单细胞RNA-seq数据集(具体数量未说明) NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
192 2025-11-30
Spatial omics in 3D culture model systems: decoding cellular positioning mechanisms and microenvironmental dynamics
2025-11-26, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
综述 探讨空间组学技术与3D培养模型系统的整合应用,解析细胞定位机制和微环境动态 聚焦前沿空间组学技术与3D培养模型的无缝整合,提供基因、蛋白质、代谢物和染色质景观的空前图谱 复杂多模态数据集的系统整合及其向临床可用生物标志物的转化仍面临巨大挑战 深化对组织模式、疾病进展和治疗干预空间动态的理解 类器官、肿瘤球体、3D生物打印构建体等3D培养模型 空间组学 肿瘤 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间表观基因组学 NA 分子信息、空间定位数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间表观基因组学 NA 高分辨率空间组学平台与生物打印组织、微流体器官芯片等精密工程3D模型结合
193 2025-11-04
Identification of a CD138-Negative Therapy-Resistant Subpopulation in Multiple Myeloma with Vulnerability to Splicing Factor Inhibition
2025-11-03, Blood cancer discovery IF:11.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序识别多发性骨髓瘤中CD138阴性的耐药亚群及其对剪接因子抑制的敏感性 发现CD138阴性多发性骨髓瘤细胞中存在耐药亚群,并首次揭示该亚群对剪接通路抑制具有特异性脆弱性 研究样本量有限,耐药机制需进一步验证 探索多发性骨髓瘤治疗抵抗的分子机制 从患者骨髓中纯化的原代多发性骨髓瘤细胞 单细胞测序 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序, VDJ靶向测序, CRISPR/Cas9筛选 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
194 2026-07-13
Single-cell analysis of human airway epithelium identifies cell-type-specific responses to Aspergillus and Coccidioides
2025-11-12, mBio IF:5.1Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序分析人原代气道上皮细胞对两种真菌病原体的细胞特异性反应 首次报道了曲霉和球孢子菌感染人原代气道上皮细胞的单细胞转录组分析,揭示了不同真菌诱导的细胞类型特异性应激和信号通路差异 未提供具体局限性信息 研究气道上皮细胞对曲霉和球孢子菌感染的早期致病机制及细胞特异性反应 人原代气道上皮细胞感染曲霉或球孢子菌后的单细胞转录组 单细胞转录组学 呼吸道真菌感染 单细胞RNA测序 未明确提及 单细胞转录组数据 使用人原代气道上皮细胞(具体数量未提及) 未明确提及 单细胞RNA测序 未明确提及 未明确提及
195 2026-07-10
Mapping the tumor immune landscape: single-cell RNA sequencing in cancer immunotherapy
2025-Nov-28, Cancer letters IF:9.1Q1
综述 系统总结了单细胞RNA测序在肿瘤免疫微环境研究中的分析流程、最佳实践及新兴应用与挑战 全面梳理了scRNA-seq在肿瘤免疫治疗中的核心分析工作流及数据处理最佳实践 未提及具体局限性 探讨scRNA-seq在肿瘤免疫微环境研究和转化肿瘤学中的应用 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞状态和细胞间相互作用 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
196 2026-07-10
Insights into the lactylation-immune regulatory axis as a mechanistic bridge in migraine pathophysiology
2025-Nov-18, The journal of headache and pain IF:7.3Q1
评论 对一篇关于乳酰化-免疫调节轴在偏头痛病理生理学中作用的多组学孟德尔随机化研究提出四个方面的澄清请求 通过多组学孟德尔随机化框架首次将乳酰化-免疫介导通路与偏头痛风险联系起来,并提名EP300、SIRT1和SLC16A1为潜在因果驱动因子 未能明确EP300和SIRT1在多组学修饰中的特异性、外周与中枢免疫的权重比较、单细胞RNA测序中SIRT1和SLC16A1的差异表达在样本量或技术层面可能存在的局限性,以及该通路在不同偏头痛亚型中的临床异质性有待探索 澄清乳酰化-免疫调节轴在偏头痛中的机制,并为生物标志物选择和转化研究提供指导 偏头痛相关的乳酰化修饰、免疫细胞表型(B细胞和NKT细胞)及基因(EP300、SIRT1、SLC16A1) 机器学习和生物信息学 偏头痛 多组学孟德尔随机化、单细胞RNA测序 孟德尔随机化模型 基因表达数据、免疫细胞表型数据 未明确提及,但包括外周血单细胞RNA测序样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
197 2026-07-04
Single-cell RNA sequencing reveals immune cell dysfunction and rewired interaction networks in the peripheral blood of active tuberculosis patients
2025-11-28, BMC immunology IF:2.9Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序分析活动性肺结核患者外周血中免疫细胞功能障碍和网络交互重编程 首次利用单细胞RNA测序全面解析活动性肺结核患者外周血免疫细胞功能障碍和配体-受体交互网络的重编程,揭示RNA代谢失调和TGF-β介导的免疫抑制为关键机制 依赖于外周血样本,样本量小,缺乏蛋白质水平的验证 探索活动性肺结核的免疫机制,为结核病免疫病理学研究和治疗开发提供见解 活动性肺结核患者和健康对照者的外周血单核细胞 机器学习 结核病 单细胞RNA测序 细胞通信分析(CellChat) 单细胞转录组数据 3名活动性肺结核患者和2名健康对照者的外周血单核细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
198 2026-07-04
Cleanet: Robust Doublet Detection in Cytometry Data Based on Protein Expression Patterns
2025-11, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
研究论文 提出Cleanet方法,基于蛋白表达模式自动检测流式和质谱流式细胞术数据中的双细胞事件,并验证其有效性 首次将单细胞转录组学中的双细胞检测方法应用于细胞术领域,并利用模拟双细胞事件基于蛋白表达模式进行识别,可自动检测同型和异型双细胞,还能根据组成细胞类型对双细胞进行分类,挖掘细胞间相互作用信息 文中未明确提及,但可能包括对双细胞模拟的准确性依赖、在复杂样本中的泛化能力等(根据上下文推测) 自动化细胞术数据中的双细胞检测与分类,提高大规模研究的数据分析效率并准确表征免疫细胞群体和细胞间相互作用 流式细胞术和质谱流式细胞术数据中的单细胞与双细胞事件 计算生物学,数字病理学 NA 流式细胞术,质谱流式细胞术 Cleanet(基于模拟双细胞事件和蛋白表达相似性识别的方法) 蛋白表达数据 验证使用质谱和流式细胞术获取的数据集,并利用ImageStream和Discover A8仪器的成像流式细胞术数据验证,具体样本规模未提及 NA 流式细胞术,质谱流式细胞术,成像流式细胞术 ImageStream,Discover A8 ImageStream成像流式细胞仪,Discover A8仪器
199 2026-07-03
Wnt1's Differential Effects on Craniofacial Bone and Tooth Development
2025-11, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 研究Wnt1信号对颅面骨和牙齿发育的不同影响 揭示了Wnt1在颅面骨和牙齿发育中的差异性作用,特别是基于骨起源的差异,并通过体内外实验证明了Wnt1对破骨细胞生成的剂量依赖性抑制 主要基于小鼠模型,且长期胚胎诱导导致出生后死亡,限制了部分表型观察 探究Wnt1信号在颅面骨和牙齿发育中的具体作用和机制 小鼠门齿中的颅面骨和牙齿组织 机器学习 NA 单细胞测序、批量RNA测序、微计算机断层扫描 转基因小鼠模型 单细胞测序数据、基因表达数据、三维影像数据 公开的小鼠门齿单细胞测序数据及转基因小鼠样本 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
200 2026-07-03
Single-Cell Atlas of Immune Microenvironment in Orthodontic Tooth Movement
2025-11, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序解析正畸牙齿移动过程中的免疫微环境 首次在单细胞水平上全面描绘正畸牙齿移动过程中的免疫景观,揭示免疫细胞动态变化、功能及细胞间相互作用 研究仅基于小鼠模型,需进一步在人体中验证;未分析其他免疫细胞与基质细胞的相互作用 更全面地揭示正畸牙齿移动过程中的免疫微环境动态变化及细胞互作机制 正畸牙齿移动小鼠的牙周组织免疫细胞 单细胞组学 无特定疾病 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 小鼠样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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