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当前共找到 925 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-30 |
Spatial omics in 3D culture model systems: decoding cellular positioning mechanisms and microenvironmental dynamics
2025-11-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07390-6
PMID:41299674
|
综述 | 探讨空间组学技术与3D培养模型系统的整合应用，解析细胞定位机制和微环境动态 | 聚焦前沿空间组学技术与3D培养模型的无缝整合，提供基因、蛋白质、代谢物和染色质景观的空前图谱 | 复杂多模态数据集的系统整合及其向临床可用生物标志物的转化仍面临巨大挑战 | 深化对组织模式、疾病进展和治疗干预空间动态的理解 | 类器官、肿瘤球体、3D生物打印构建体等3D培养模型 | 空间组学 | 肿瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间表观基因组学 | NA | 分子信息、空间定位数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间表观基因组学 | NA | 高分辨率空间组学平台与生物打印组织、微流体器官芯片等精密工程3D模型结合 |
| 2 | 2026-02-26 |
Four Decades of Inquiry Into the Genetic Bases of Specific Reading Disability
2025-11-11, Journal of speech, language, and hearing research : JSLHR
DOI:10.1044/2025_JSLHR-25-00050
PMID:41091061
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研究论文 | 本研究通过系统梳理过去四十年中与特定阅读障碍相关的候选基因，分析其进化保守性、发育表达模式和功能网络，以揭示阅读障碍的遗传基础 | 挑战了存在阅读特异性基因的观念，提出特定阅读障碍反映了古老进化神经机制在人类特有大脑结构中的破坏，并识别了发育表达转换和功能网络 | 基于文献综述和生物信息学分析，缺乏实验验证，且样本数据主要来自公共数据库，可能受限于数据覆盖范围 | 探究特定阅读障碍的遗传基础，填补阅读能力遗传结构理解的知识空白 | 175个与特定阅读障碍及阅读相关过程相关的候选基因 | 自然语言处理 | 特定阅读障碍 | 生物信息学分析，包括进化保守性分析、发育转录组分析和单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | Allen Brain Atlas | 单细胞RNA-seq，发育转录组学 | NA | Allen Brain Atlas的发育和单细胞转录组数据集 |
| 3 | 2026-07-25 |
Consensus spectral clustering with weighted similarity functions for single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-16, Communications in statistics: Simulation and computation
DOI:10.1080/03610918.2025.2578269
PMID:42491860
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2025-11-04 |
Identification of a CD138-Negative Therapy-Resistant Subpopulation in Multiple Myeloma with Vulnerability to Splicing Factor Inhibition
2025-11-03, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-24-0340
PMID:40890913
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别多发性骨髓瘤中CD138阴性的耐药亚群及其对剪接因子抑制的敏感性 | 发现CD138阴性多发性骨髓瘤细胞中存在耐药亚群，并首次揭示该亚群对剪接通路抑制具有特异性脆弱性 | 研究样本量有限，耐药机制需进一步验证 | 探索多发性骨髓瘤治疗抵抗的分子机制 | 从患者骨髓中纯化的原代多发性骨髓瘤细胞 | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, VDJ靶向测序, CRISPR/Cas9筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-07-13 |
Single-cell analysis of human airway epithelium identifies cell-type-specific responses to Aspergillus and Coccidioides
2025-11-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02121-25
PMID:41081505
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析人原代气道上皮细胞对两种真菌病原体的细胞特异性反应 | 首次报道了曲霉和球孢子菌感染人原代气道上皮细胞的单细胞转录组分析，揭示了不同真菌诱导的细胞类型特异性应激和信号通路差异 | 未提供具体局限性信息 | 研究气道上皮细胞对曲霉和球孢子菌感染的早期致病机制及细胞特异性反应 | 人原代气道上皮细胞感染曲霉或球孢子菌后的单细胞转录组 | 单细胞转录组学 | 呼吸道真菌感染 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 单细胞转录组数据 | 使用人原代气道上皮细胞（具体数量未提及） | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 6 | 2026-07-10 |
Mapping the tumor immune landscape: single-cell RNA sequencing in cancer immunotherapy
2025-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218012
PMID:40889736
|
综述 | 系统总结了单细胞RNA测序在肿瘤免疫微环境研究中的分析流程、最佳实践及新兴应用与挑战 | 全面梳理了scRNA-seq在肿瘤免疫治疗中的核心分析工作流及数据处理最佳实践 | 未提及具体局限性 | 探讨scRNA-seq在肿瘤免疫微环境研究和转化肿瘤学中的应用 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞状态和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-07-10 |
Insights into the lactylation-immune regulatory axis as a mechanistic bridge in migraine pathophysiology
2025-Nov-18, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-025-02208-8
PMID:41254496
|
评论 | 对一篇关于乳酰化-免疫调节轴在偏头痛病理生理学中作用的多组学孟德尔随机化研究提出四个方面的澄清请求 | 通过多组学孟德尔随机化框架首次将乳酰化-免疫介导通路与偏头痛风险联系起来，并提名EP300、SIRT1和SLC16A1为潜在因果驱动因子 | 未能明确EP300和SIRT1在多组学修饰中的特异性、外周与中枢免疫的权重比较、单细胞RNA测序中SIRT1和SLC16A1的差异表达在样本量或技术层面可能存在的局限性，以及该通路在不同偏头痛亚型中的临床异质性有待探索 | 澄清乳酰化-免疫调节轴在偏头痛中的机制，并为生物标志物选择和转化研究提供指导 | 偏头痛相关的乳酰化修饰、免疫细胞表型（B细胞和NKT细胞）及基因（EP300、SIRT1、SLC16A1） | 机器学习和生物信息学 | 偏头痛 | 多组学孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据、免疫细胞表型数据 | 未明确提及，但包括外周血单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-07-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune cell dysfunction and rewired interaction networks in the peripheral blood of active tuberculosis patients
2025-11-28, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00780-x
PMID:41315935
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析活动性肺结核患者外周血中免疫细胞功能障碍和网络交互重编程 | 首次利用单细胞RNA测序全面解析活动性肺结核患者外周血免疫细胞功能障碍和配体-受体交互网络的重编程，揭示RNA代谢失调和TGF-β介导的免疫抑制为关键机制 | 依赖于外周血样本，样本量小，缺乏蛋白质水平的验证 | 探索活动性肺结核的免疫机制，为结核病免疫病理学研究和治疗开发提供见解 | 活动性肺结核患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 细胞通信分析（CellChat） | 单细胞转录组数据 | 3名活动性肺结核患者和2名健康对照者的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-07-04 |
Cleanet: Robust Doublet Detection in Cytometry Data Based on Protein Expression Patterns
2025-11, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24961
PMID:41065042
|
研究论文 | 提出Cleanet方法，基于蛋白表达模式自动检测流式和质谱流式细胞术数据中的双细胞事件，并验证其有效性 | 首次将单细胞转录组学中的双细胞检测方法应用于细胞术领域，并利用模拟双细胞事件基于蛋白表达模式进行识别，可自动检测同型和异型双细胞，还能根据组成细胞类型对双细胞进行分类，挖掘细胞间相互作用信息 | 文中未明确提及，但可能包括对双细胞模拟的准确性依赖、在复杂样本中的泛化能力等（根据上下文推测） | 自动化细胞术数据中的双细胞检测与分类，提高大规模研究的数据分析效率并准确表征免疫细胞群体和细胞间相互作用 | 流式细胞术和质谱流式细胞术数据中的单细胞与双细胞事件 | 计算生物学，数字病理学 | NA | 流式细胞术，质谱流式细胞术 | Cleanet（基于模拟双细胞事件和蛋白表达相似性识别的方法） | 蛋白表达数据 | 验证使用质谱和流式细胞术获取的数据集，并利用ImageStream和Discover A8仪器的成像流式细胞术数据验证，具体样本规模未提及 | NA | 流式细胞术，质谱流式细胞术，成像流式细胞术 | ImageStream，Discover A8 | ImageStream成像流式细胞仪，Discover A8仪器 |
| 10 | 2026-07-03 |
Wnt1's Differential Effects on Craniofacial Bone and Tooth Development
2025-11, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251336191
PMID:40454459
|
研究论文 | 研究Wnt1信号对颅面骨和牙齿发育的不同影响 | 揭示了Wnt1在颅面骨和牙齿发育中的差异性作用，特别是基于骨起源的差异，并通过体内外实验证明了Wnt1对破骨细胞生成的剂量依赖性抑制 | 主要基于小鼠模型，且长期胚胎诱导导致出生后死亡，限制了部分表型观察 | 探究Wnt1信号在颅面骨和牙齿发育中的具体作用和机制 | 小鼠门齿中的颅面骨和牙齿组织 | 机器学习 | NA | 单细胞测序、批量RNA测序、微计算机断层扫描 | 转基因小鼠模型 | 单细胞测序数据、基因表达数据、三维影像数据 | 公开的小鼠门齿单细胞测序数据及转基因小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-07-03 |
Single-Cell Atlas of Immune Microenvironment in Orthodontic Tooth Movement
2025-11, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251334583
PMID:40569824
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析正畸牙齿移动过程中的免疫微环境 | 首次在单细胞水平上全面描绘正畸牙齿移动过程中的免疫景观，揭示免疫细胞动态变化、功能及细胞间相互作用 | 研究仅基于小鼠模型，需进一步在人体中验证；未分析其他免疫细胞与基质细胞的相互作用 | 更全面地揭示正畸牙齿移动过程中的免疫微环境动态变化及细胞互作机制 | 正畸牙齿移动小鼠的牙周组织免疫细胞 | 单细胞组学 | 无特定疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-07-01 |
SMURF: soft-segmentation for single-cell reconstruction and topological analysis of spatial transcriptomic data
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656357
PMID:40502153
|
研究论文 | SMURF是一种用于空间转录组数据单细胞重建和拓扑分析的软分割算法 | 提出了一种跨平台的软分割算法SMURF，不仅能准确将mRNA分配到单个细胞，还能将复杂组织结构投影到笛卡尔坐标上，揭示细胞类型组织和基因表达梯度 | NA | 开发一种新的计算方法，用于高分辨率空间转录组数据中准确将转录本分配到单个细胞，并分析复杂组织结构 | 空间转录组数据中的单个细胞和组织架构 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 软分割算法 | 图像与空间转录组数据 | 跨多个组织和平台的多重样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-07-01 |
Durable B-Cell Impairment While Sparing IgA B Cells After Ocrelizumab Therapy in Multiple Sclerosis
2025-11, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70135
PMID:40781066
|
研究论文 | 评估奥克雷珠单抗治疗复发缓解型多发性硬化症期间B细胞亚群的早期变化，特别是对IgA B细胞的保留作用 | 首次通过光谱流式细胞术和单细胞RNA测序揭示奥克雷珠单抗治疗在保留IgA B细胞的同时导致B细胞功能持久损伤，并发现治疗后B细胞恢复呈现炎症和迁移表型 | 样本量较小（18名患者和10名健康志愿者），停药后B细胞重建分析仅3例患者 | 探究奥克雷珠单抗在多发性硬化症中的作用机制及疾病病理生理学 | 复发缓解型多发性硬化症患者和健康志愿者 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 光谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据，基因表达数据 | 18名患者（治疗前后及停药后），10名健康志愿者，3名停药患者（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-29 |
Multi-omics analysis reveals the role of tumor-infiltrating CD4+CCR7+ T cells in EGFR antibody resistance and prognosis of hepatocellular carcinoma
2025-Nov-29, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15276-5
PMID:41318392
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示CD4+CCR7+肿瘤浸润T细胞在肝细胞癌EGFR抗体耐药与预后中的作用 | 首次在肝细胞癌中通过PDX模型联合单细胞RNA测序和全外显子测序，发现CD4+CCR7+ T细胞富集与EGFR抗体耐药及免疫抑制微环境相关，并构建了基于九基因特征的预后风险模型 | PDX模型样本量有限（14例），且耐药机制验证主要基于关联分析，缺乏直接的因果实验证据 | 探究肝细胞癌中肿瘤浸润T细胞特征与EGFR抗体（尼妥珠单抗）治疗反应及预后的关联 | 14例肝细胞癌患者的患者源性异种移植（PDX）模型及其肿瘤组织和肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、流式细胞术、LASSO回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据、测序数据、免疫荧光图像 | 14例PDX模型，外加2个外部验证数据集（ICGC-JP和GSE141202） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-06-29 |
The co-location of MARCO + macrophages and SPOCK1 + fibroblasts contributes to the poor prognosis and undesirable immunotherapy response in colorectal cancer
2025-Nov-28, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15397-x
PMID:41316065
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研究论文 | 本研究通过整合bulk、单细胞和空间转录组学数据，揭示了MARCO+巨噬细胞与SPOCK1+成纤维细胞在结直肠癌中的共定位与不良预后及免疫治疗反应的关系 | 首次发现MARCO+巨噬细胞和SPOCK1+成纤维细胞的共定位现象，并阐明其通过SPP1/EGF和C3-C3AR1信号通路相互促进的机制 | NA | 探究结直肠癌中巨噬细胞表型异质性、空间分布和细胞互作对预后的影响 | 结直肠癌组织中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像 | NA | 10x Genomics, NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 16 | 2026-06-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07491-2
PMID:41310748
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示基底细胞癌中TNC阳性癌症相关成纤维细胞介导免疫抑制并促进肿瘤进展 | 首次鉴定出C01_TNC成纤维细胞簇作为癌症相关成纤维细胞亚群，揭示其通过上调胶原蛋白与整合素相互作用促进肿瘤侵袭，并通过与调节性T细胞的空间关联增强免疫抑制 | 样本量较小，仅6名患者的9个手术标本；需要进一步在更大队列中验证发现 | 研究基底细胞癌中成纤维细胞亚群及其与肿瘤微环境其他组分的相互作用 | 基底细胞癌肿瘤组织和相邻正常组织 | 数字病理学 | 基底细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 图像 | 6名患者的9个手术标本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 17 | 2026-06-29 |
Uncovering the role of RNA binding proteins in colorectal cancer through single-cell transcriptomic analysis
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29678-9
PMID:41309865
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示RNA结合蛋白在结直肠癌中的作用 | 首次结合批量转录组和单细胞RNA测序数据，系统鉴定结直肠癌中与预后相关的RNA结合蛋白，并揭示其在特定细胞亚型中的表达模式和临床意义 | 样本量较小（仅4例患者和15对配对样本），缺乏大型独立队列的验证，机制研究不够深入 | 探索RNA结合蛋白在结直肠癌进展中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌相关的RNA结合蛋白及其在正常、腺瘤和癌组织中的细胞类型特异性表达模式 | 自然语言处理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 批量转录组分析 | NA | 转录组数据 | 4例患者（正常、腺瘤和结直肠癌组织），15对肿瘤与癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-06-29 |
Polymer-based chemo-immunotherapy: Combining immunogenic cell death induction and PD-L1 blockade enhances antitumor immunity in melanoma
2025-11-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114193
PMID:40907793
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研究论文 | 提出了一种基于聚合物的化学免疫疗法，结合免疫原性细胞死亡诱导和PD-L1阻断，增强黑色素瘤的抗肿瘤免疫 | 首次将可降解HPMA共聚物-表柔比星偶联物（KT-1）与多价HPMA共聚物-PD-L1肽拮抗剂（MPPA）联合用于化学免疫治疗，并证明联合治疗优于单药或序贯给药 | MPPA在没有诱导NOD小鼠自身免疫性糖尿病方面显示出安全性，但长期毒性和临床转化潜力需进一步验证 | 开发一种更安全有效的聚合物基化学免疫疗法，替代传统免疫检查点抑制剂治疗免疫排斥性肿瘤 | B16F10黑色素瘤小鼠模型 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | B16F10黑色素瘤小鼠模型，但未明确具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 19 | 2026-06-26 |
Cell Type-Specific Expression of Long Noncoding RNAs in Human Diabetic Kidneys Identifies TARID as a Key Regulator of Podocyte Function
2025-11-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0272
PMID:40902080
|
研究论文 | 利用单细胞核RNA测序数据识别人类糖尿病肾脏中细胞类型特异性长非编码RNA，并发现TARID在足细胞功能中的关键调控作用 | 首次在单细胞水平上系统分析糖尿病肾病中长非编码RNA的细胞类型特异性表达，并揭示TARID通过调控肌动蛋白细胞骨架重组影响足细胞功能 | NA | 探索长非编码RNA在肾脏细胞类型中的特异性表达及其在糖尿病肾病中的功能 | 人类肾脏样本中的细胞类型，特别是足细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名健康个体和6名糖尿病肾病患者的肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-06-20 |
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-11-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190635
PMID:41178716
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研究论文 | 该研究揭示了脂肪细胞死亡通过促进S100A8+巨噬细胞浸润肝脏，进而驱动肝细胞脂质储存并加剧代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）进展的机制 | 首次发现脂肪细胞死亡后产生的S100A8+巨噬细胞通过抑制CCN3、上调CD36促进肝细胞脂质积累，为MASLD进展提供了新的细胞和分子机制 | 研究仅在动物模型中进行，缺乏人类样本验证；未明确S100A8+巨噬细胞与CCN3抑制之间的完整信号通路细节 | 探究脂肪细胞死亡后介导肝细胞脂肪储存并触发MASLD进展的额外信号 | 高脂饮食喂养的小鼠模型及基因修饰小鼠 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq | NA | 序列数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |