单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-09-18	Targeting CLK1/SRSF7 axis-dependent alternative splicing sensitizes pancreatic ductal adenocarcinoma to chemotherapy and immunotherapy 2025-Nov, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2025.101292 PMID:40840404	研究论文	本研究揭示了环状RNA cALG8通过调控选择性剪接促进胰腺导管腺癌化疗耐药和免疫抑制的分子机制	首次发现cALG8作为蛋白支架促进CLK1磷酸化SRSF7，从而形成ATM203变体增强DNA损伤修复能力	研究主要基于临床前模型，尚未进行人体临床试验验证	阐明胰腺导管腺癌吉西他滨耐药机制并开发靶向治疗策略	胰腺导管腺癌细胞系、患者来源类器官(PDO)和异种移植模型(PDX)	肿瘤生物学	胰腺癌	环状RNA测序、液相色谱-质谱联用(LC-MS)、单细胞测序、反义寡核苷酸(ASO)	NA	基因组数据、蛋白质组数据、单细胞数据	化疗敏感与耐药肿瘤样本、PDO/PDX模型
2	2025-09-18	IV Immunoglobulin Is Associated With Epigenetic, Ribosomal, and Immune Changes in Pediatric Acute-Onset Neuropsychiatric Syndrome 2025-Nov, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation DOI:10.1212/NXI.0000000000200467 PMID:40953324	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析IV免疫球蛋白对儿童急性发作神经精神综合征（PANS）患者外周免疫细胞基因表达的影响	首次在单细胞水平揭示IVIg治疗可逆转PANS患者的免疫和核糖体通路异常，并下调组蛋白修饰通路	样本量较小（5例患者和4例对照），且为开放标签设计	探究IV免疫球蛋白对PANS患者细胞特异性基因表达的影响	5名PANS儿童患者和4名健康对照儿童	免疫学	神经精神疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	5名PANS患者（治疗前后配对样本）和4名健康对照，共分析144,470个细胞
3	2025-09-15	RAB26 promotes prostate cancer progression via the MAPK/ERK-TWIST1 signaling axis 2025-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101689 PMID:40821113	研究论文	本文探讨了RAB26通过MAPK/ERK-TWIST1信号轴促进前列腺癌进展的机制	首次揭示RAB26在前列腺癌中通过激活MAPK/ERK通路和TWIST1表达促进上皮-间质转化和肿瘤干细胞特性	NA	阐明RAB26在前列腺癌中的功能作用及其分子机制	前列腺癌细胞	癌症研究	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	基于GSE141445数据集的前列腺癌细胞
4	2025-09-15	Integrated analysis of single-cell RNA-seq and ATAC-seq in lens epithelial cells: Unveiling the role of ATF6 as a key transcription factor 2025-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101610 PMID:40837408	研究论文	通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序分析，揭示ATF6作为关键转录因子在晶状体上皮细胞稳态维持和上皮间质转化中的作用	首次在单细胞分辨率下整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，发现ATF6通过调节STAT3磷酸化影响晶状体上皮细胞的EMT过程	研究基于9-23周胎儿眼组织数据，结果在成人组织中的普适性需要进一步验证	探究晶状体上皮细胞上皮间质转化的分子机制	晶状体上皮细胞	单细胞组学	白内障	scRNA-seq, scATAC-seq	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据	9-23周胎儿眼组织（具体样本数量未明确说明）
5	2025-09-13	Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneous response of interlamellar cell mass to hypoxic stress in crucian carp (Carassius auratus) gills 2025-Nov, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1 DOI:10.1016/j.fsi.2025.110584 PMID:40701446	研究论文	利用单细胞RNA测序技术研究鲫鱼鳃中间层细胞团（ILCM）对缺氧应激的异质性响应	首次在鲫鱼鳃中应用scRNA-seq揭示ILCM细胞在缺氧下的比例变化、功能抑制及细胞凋亡机制	研究聚焦于鲫鱼特定细胞类型，结果可能不直接适用于其他物种或组织	探究鱼类鳃部细胞对缺氧应激的分子响应机制与适应策略	鲫鱼（Carassius auratus）鳃部的中间层细胞团（ILCM）	单细胞组学	缺氧应激	scRNA-seq（单细胞RNA测序），组织学分析	NA	单细胞转录组数据，组织切片图像	未明确样本数量，但涉及鲫鱼鳃部细胞的scRNA-seq分析
6	2025-09-13	Hemocyte diversity in crustaceans 2025-Nov, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1 DOI:10.1016/j.fsi.2025.110612 PMID:40750028	综述	本文回顾了甲壳动物血细胞多样性的研究进展，探讨传统形态学分类的局限性及单细胞RNA测序等新技术带来的新发现	引入单细胞RNA测序技术揭示传统形态学分类的不足，发现新的分子标记和潜在血细胞亚型	NA	总结甲壳动物血细胞类型与功能的研究历史与最新进展	甲壳动物（如小龙虾和虾）的血细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	分子标记数据	NA
7	2025-09-13	Nkx2.5 triggers vascular remodeling in chicken but not in emu wing mesoderm 2025-Nov, Developmental biology IF:2.5Q2 DOI:10.1016/j.ydbio.2025.08.007 PMID:40812617	研究论文	本研究通过对比鸡和鸸鹋胚胎中Nkx2.5基因的表达效应，揭示了其在肢体中胚层血管重塑中的物种特异性功能	首次发现Nkx2.5在鸡翅膀中胚层过表达可诱导血管生成程序，但在正常发育的鸸鹋翅膀中不产生类似效应	研究主要基于模式生物鸡和鸸鹋的对比，结论向其他物种的推广需谨慎	探究Nkx2.5转录因子在肢体中胚层发育中的细胞效应和物种差异	鸡胚胎和鸸鹋胚胎的翅膀中胚层组织	发育生物学	NA	局部电穿孔基因过表达、单细胞RNA测序分析	NA	基因表达数据、单细胞转录组数据	鸡胚胎实验样本和鸸鹋胚胎scRNA-seq数据集
8	2025-09-12	Smpd3 regulates odontoblast differentiation through the Shh-Gli1 pathway 2025-Nov, Bone IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.bone.2025.117587 PMID:40639673	研究论文	本研究揭示了Smpd3通过Shh-Gli1通路调控成牙本质细胞分化的分子机制	首次发现Smpd3基因通过Shh信号通路调控成牙本质细胞分化，并证实其促进牙本质形成的能力	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床相关性尚需进一步验证	探究Smpd3在成牙本质细胞分化中的功能及其分子机制	小鼠牙乳头细胞(mDPCs)和小鼠磨牙牙胚	发育生物学	牙科疾病	单细胞RNA测序，siRNA敲低，RNA测序，体外培养	NA	基因表达数据，组织学图像	小鼠牙乳头细胞和牙胚样本（具体数量未明确说明）
9	2025-09-12	Origin, functions, heterogeneity and associated diseases of B-1 cells 2025-Nov, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2025.110561 PMID:40651736	综述	本文综述了B-1细胞的起源、功能、异质性及其在疾病中的作用	讨论了单细胞测序分析对B-1细胞异质性的新见解	NA	探讨B-1细胞的生物学特性及其与疾病的关联	B-1细胞	免疫学	自身免疫病、感染性疾病、炎症性疾病	单细胞测序分析	NA	NA	NA
10	2025-09-12	Large-scale proteomics analysis identifies plasma protein biomarkers and potential therapeutic targets for rheumatoid arthritis: A prospective study in UK Biobank 2025-Nov, Bone IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.bone.2025.117593 PMID:40669587	研究论文	通过大规模蛋白质组学分析鉴定类风湿关节炎的血浆蛋白生物标志物和潜在治疗靶点	整合蛋白质组学、GWAS和单细胞RNA测序数据，首次系统评估RA风险相关蛋白并发现ICAM3、CTSV和RNASET2等新靶点	预测模型性能中等（AUC=0.74），预测窗口为5年，需进一步验证	识别类风湿关节炎的生物标志物和治疗靶点	类风湿关节炎患者和健康对照者	生物医学信息学	类风湿关节炎	蛋白质组学、GWAS、单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析	XGBoost	蛋白质组数据、基因组数据、转录组数据	706例RA患者和1410例对照
11	2025-09-10	BCAP31 promotes colorectal cancer metastasis via oxidative phosphorylation-dependent macrophage immunosuppression: A single-cell transcriptomic study 2025-Nov, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.08.002 PMID:40769312	研究论文	通过单细胞转录组研究揭示BCAP31通过氧化磷酸化依赖的巨噬细胞免疫抑制促进结直肠癌转移	首次发现BCAP31作为关键风险基因通过线粒体-免疫串扰机制驱动免疫抑制，并建立10基因巨噬细胞相关预后特征	NA	探究结直肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞驱动的免疫抑制机制	结直肠癌组织样本及肿瘤微环境中的免疫细胞	生物信息学	结直肠癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 孟德尔随机化分析	NA	单细胞转录组数据	NA
12	2025-09-10	Hyperactivation of the m6A demethylase FTO to down-regulate SLC7A11/xCT-mediated redox homeostasis and epigenetic remodeling in facial infiltrating lipomatosis 2025-Nov, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.08.001 PMID:40769313	研究论文	本研究揭示了m6A去甲基化酶FTO通过下调SLC7A11破坏氧化还原稳态和表观遗传重编程，从而驱动面部浸润性脂肪瘤病（FIL）发生的分子机制	首次发现FTO通过m6A依赖性方式抑制SLC7A11表达，破坏GSH/GSSG氧化还原平衡，并通过SIRT6-H3K9ac表观遗传重编程促进脂肪生成的新机制	研究主要基于细胞和动物模型，临床转化仍需进一步验证	探究面部浸润性脂肪瘤病（FIL）的分子发病机制和治疗靶点	FIL脂肪组织、脂肪干细胞和祖细胞（ASPCs）以及小鼠异种移植模型	分子生物学	面部浸润性脂肪瘤病	Western blotting, qPCR, 免疫组化, 单细胞RNA测序, MeRIP-seq, RIP-qPCR, 荧光素酶报告实验, ATAC-seq, ChIP-qPCR, 酶活性检测	NA	分子生物学数据、测序数据、蛋白质表达数据	FIL患者组织和细胞样本，以及小鼠模型
13	2025-09-10	Transcriptional profiling uncovers microglial HIF-1α signaling as a therapeutic target of radiation-induced brain injury 2025-Nov, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.08.014 PMID:40784586	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示颅脑辐射后小胶质细胞HIF-1α信号通路的特异性激活，并证明其作为辐射性脑损伤治疗靶点的潜力	首次在单细胞水平发现辐射特异性激活小胶质细胞HIF-1α信号通路，且该现象无法通过传统批量分析检测	研究基于小鼠模型，临床转化需进一步验证；HIF-1α抑制仅带来认知功能部分恢复	探究辐射性脑损伤的细胞分子机制并寻找治疗靶点	小鼠模型中的小胶质细胞和海马体相关认知功能	神经科学	脑部疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），药理学抑制	NA	转录组数据	小鼠实验模型（具体数量未明确说明）
14	2025-09-05	A human-mouse atlas of intrarenal myeloid cells identifies conserved disease-associated macrophages in lupus nephritis 2025-Nov-03, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20241873 PMID:40900124	研究论文	通过跨物种单细胞分析比较人类和小鼠狼疮性肾炎中的肾内髓系细胞，鉴定保守的疾病相关巨噬细胞	首次建立人类与小鼠肾内髓系细胞图谱，发现跨物种保守的疾病相关单核/巨噬细胞亚群及其基因表达特征	研究基于155例患者和四种小鼠模型，样本量和模型多样性可能存在限制	探索狼疮性肾炎中髓系细胞的病理机制及小鼠模型对人类疾病的转化价值	人类狼疮性肾炎患者和小鼠模型的肾内髓系细胞	数字病理学	狼疮性肾炎	单细胞测序、空间转录组学、功能研究	NA	单细胞数据、空间转录数据	155例狼疮性肾炎患者和四种小鼠模型
15	2025-09-05	Alternative splicing as a novel pathogenic mechanism in chronic kidney disease 2025-Nov, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111972 PMID:40614890	综述	本文探讨选择性剪接作为慢性肾病新型致病机制的调控作用及治疗潜力	首次系统阐述选择性剪接在慢性肾病中的致病机制，并提出靶向剪接的治疗新策略	需进一步研究剪接动态变化及其调控因子在疾病中的具体功能贡献	阐明选择性剪接与慢性肾病之间的功能联系	肾小管上皮细胞及剪接异构体	病理机制研究	慢性肾病	单细胞测序	NA	基因组数据	全球超过10%人口（流行病学数据）
16	2025-09-05	N-glycosylation stabilized TNFAIP6 promotes ovarian cancer metastasis by activating the PI3K-AKT signaling pathway 2025-Nov, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112013 PMID:40701312	研究论文	本研究揭示N-糖基化稳定的TNFAIP6通过激活PI3K-AKT信号通路促进卵巢癌转移	首次发现N-糖基化通过抑制泛素化降解稳定TNFAIP6蛋白，并阐明其通过PI3K/AKT通路调控EMT和免疫抑制微环境的新机制	研究主要基于细胞和动物模型，临床转化价值需进一步验证	阐明卵巢癌转移的分子机制并寻找治疗靶点	卵巢癌细胞系、动物模型及临床样本数据	癌症生物学	卵巢癌	RNA-seq, scRNA-seq, Western blot, 免疫荧光, 慢病毒敲低/过表达, Co-IP, 计算反卷积算法	NA	基因组数据、蛋白质数据、临床预后数据	TCGA和GEO数据库的多组学数据，具体样本量未明确说明
17	2025-09-05	A STAT1-GBP3-STING positive feedback loop governs inflammation, oxidative stress, and DNA damage to trigger acute aortic dissection 2025-Nov, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112015 PMID:40714274	研究论文	本研究揭示了STAT1-GBP3-STING正反馈环路在急性主动脉夹层中调控炎症、氧化应激和DNA损伤的分子机制	首次发现STAT1-GBP3-STING正反馈环路是连接炎症、氧化应激和DNA损伤的核心机制，并验证STAT1抑制剂Fludarabine的治疗潜力	研究主要基于小鼠模型和细胞实验，人类临床验证尚需进一步开展	阐明急性主动脉夹层的分子发病机制并探索潜在治疗靶点	小鼠主动脉夹层模型、IFN-γ刺激的血管平滑肌细胞和人升主动脉组织	分子病理学	心血管疾病	ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA测序, ROS染色, ChIP-PCR, CoIP分析	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质互作数据	小鼠主动脉夹层模型和人类主动脉组织（具体数量未明确说明）
18	2025-09-05	G protein-coupled estrogen receptor promotes human extravillous trophoblast invasion via YAP-Snail-mediated CYR61 expression 2025-Nov, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112033 PMID:40744331	研究论文	本研究揭示了G蛋白偶联雌激素受体通过YAP-Snail信号轴调控CYR61表达促进滋养细胞侵袭的分子机制	首次发现GPER-YAP-Snail-CYR61信号轴在滋养细胞侵袭中的调控作用，并证实该通路在子痫前期患者中异常	机制研究主要基于细胞模型，需进一步体内实验验证	探究GPER调控CYR61表达的分子机制及其在滋养细胞侵袭中的作用	人绒毛外滋养细胞（HTR-8/SVneo细胞系和原代细胞）	分子生物学	子痫前期	scRNA-seq, 功能缺失实验	NA	基因表达数据	细胞系实验及公共scRNA-seq数据库分析
19	2025-07-31	Single-cell transcriptome analysis of in vivo and in vitro human pancreas development 2025-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101573 PMID:40735693	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
20	2025-07-22	Bulk RNA sequencing combined with single-cell RNA sequencing analysis revealed the ferroptosis immune target of osteoarthritis synovial fibroblasts 2025-Nov, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101587 PMID:40687616	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA