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当前共找到 929 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Gene-metabolite interactions in aortic dissection: Insights from metabolic and single-cell analyses
2025-Nov-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045846
PMID:41305697
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、代谢组学、机器学习和孟德尔随机化方法，探讨主动脉夹层中平滑肌细胞变化及基因-代谢物相互作用 | 首次构建主动脉夹层的基因-代谢物网络，明确APOE和PLTP通过调节胆固醇酯和甘油三酯影响平滑肌细胞功能及疾病进展 | 样本量较小（9个代谢组学样本），且未提供功能验证实验 | 探索主动脉夹层的发病机制，寻找潜在治疗靶点 | 主动脉夹层组织样本中的平滑肌细胞及代谢物 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、代谢组学、机器学习、孟德尔随机化 | Seurat、Monocle2、机器学习模型 | 单细胞基因表达数据、代谢组学数据 | 9个样本（6个主动脉夹层，3个对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-16 |
Pan-cancer NK cell-related immunotherapy signatures for predicting PD-1 treatment response
2025-Nov-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045753
PMID:41305714
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研究论文 | 利用机器学习和单细胞RNA测序数据构建泛癌自然杀伤细胞免疫治疗预测模型（NKCIPM），用于预测PD-1治疗反应 | 首次通过整合多种癌症类型的单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据，结合机器学习算法，建立泛癌水平的NK细胞免疫治疗预测模型，并鉴定出APOE作为关键枢纽基因 | NK细胞在癌症中的全面研究仍有限，尤其是对免疫治疗反应的影响 | 建立泛癌NK细胞免疫治疗预测模型，评估免疫治疗反应并指导临床决策 | 自然杀伤细胞及其在肿瘤微环境中的特征基因 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据 | 164份样本（6种癌症类型） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-16 |
S100A12 as a key biomarker in a neutrophil-associated gene prediction model for sepsis diagnosis
2025-Nov-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046140
PMID:41305822
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和机器学习框架构建败血症诊断模型，并识别S100A12为关键生物标志物 | 通过113种机器学习框架结合SHAP分析，从单细胞数据中筛选出4个中性粒细胞相关基因构建最优诊断模型，并首次强调S100A12作为关键驱动基因和潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性，可能包括样本来源单一、缺乏多中心验证或模型泛化性待评估 | 开发败血症诊断模型并识别关键驱动生物标志物 | 败血症患者和健康对照者的外周血样本 | 机器学习 | 败血症 | 单细胞RNA测序 | 随机森林（RF）模型 | 单细胞基因表达数据 | 来自GEO数据库的公开数据，具体规模未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-16 |
Brain tumors induce widespread disruption of calvarial bone and alteration of skull marrow immune landscape
2025-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02064-4
PMID:41044343
|
研究论文 | 脑肿瘤（胶质母细胞瘤）会导致颅骨异常和颅骨骨髓免疫景观改变 | 首次揭示胶质母细胞瘤对颅骨和颅骨骨髓免疫环境的影响，并发现抑制骨吸收会促进肿瘤进展并削弱免疫治疗效果 | 未在文中明确提及 | 探究脑肿瘤（胶质母细胞瘤）对颅骨和颅骨骨髓免疫景观的影响 | 小鼠模型和胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和胶质母细胞瘤患者（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 5 | 2026-05-15 |
Single-Cell Analysis Reveals a Critical Role for Macrophage Epsins in Regulating the Origin of Foam Cells in Atherosclerosis
2025-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323288
PMID:40931837
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞Epsin在调控动脉粥样硬化泡沫细胞起源中的关键作用 | 首次发现巨噬细胞特异性Epsin缺失可减少泡沫细胞形成，并揭示其对血管平滑肌细胞向巨噬细胞转化的抑制作用 | 未具体说明，但可能包括小鼠模型与人类的差异，需进一步在人体中验证 | 探究巨噬细胞Epsin在动脉粥样硬化中调控泡沫细胞起源的细胞与分子机制 | 巨噬细胞Epsin对动脉粥样硬化小鼠模型的泡沫细胞形成、血管平滑肌细胞和内皮细胞表型的影响 | 生物信息学 | 心血管疾病（动脉粥样硬化） | 单细胞RNA测序、代谢分析、qRT-PCR、免疫染色、共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | WT/Apoe-/-和LysM-DKO/Apoe-/-小鼠（每组3只？具体数量未明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 6 | 2026-05-15 |
scRNA-seq of Penaeus japonicus hemocytes under environmentally-induced restriction of sand-diving behavior
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111125
PMID:41038398
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析日本对虾血细胞在环境诱导的沙潜行为限制下的分子响应 | 首次利用单细胞转录组技术研究日本对虾血细胞在底质缺失条件下的分子变化，识别出与沙潜行为调控相关的关键候选基因 | 关键候选基因（如trpa1、trpm和cut蛋白家族）的具体功能有待进一步验证 | 探究日本对虾在沙潜行为受限时的分子响应机制 | 日本对虾（Penaeus japonicus）血细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qRT-PCR、RNA原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 日本对虾血细胞样品，涉及三种培养系统（沙组、无沙组、无沙应激组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-05-15 |
ScASplicer: An interactive shiny/R application for alternative splicing analysis of single-cell sequencing
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111116
PMID:41038402
|
研究论文 | 开发了一个名为ScASplicer的交互式Shiny/R应用程序，用于单细胞测序的可变剪接分析 | 通过开发Python包简化输入文件生成并扩展MARVEL至多细胞群体分析，首次提供无需编程的交互式单细胞可变剪接探索平台 | 未说明限制条件 | 为单细胞RNA测序的可变剪接分析提供一个通用且用户友好的网络应用程序 | 单细胞RNA测序数据中的可变剪接事件 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-05-15 |
SerpinB2 promotes the proliferation of glioma cells by regulating the cell cycle through the Wnt/β-catenin signaling pathway
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111148
PMID:41176096
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研究论文 | 本文结合转录组测序和单细胞转录组分析，揭示了SerpinB2通过Wnt/β-catenin信号通路调控细胞周期促进胶质瘤细胞增殖的分子机制 | 首次利用转录组与单细胞转录组联合分析阐明SerpinB2在胶质瘤中的促增殖机制，并通过Wnt/β-catenin通路调控细胞周期S期 | 未提及具体局限性，可能包括样本量有限及动物模型与人类肿瘤的差异 | 阐明SerpinB2在胶质瘤细胞增殖中的分子机制 | 胶质瘤细胞及荷瘤小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 胶质瘤 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | 转录组序列数据、单细胞转录组数据 | CGGA和TISCH数据库中的胶质瘤样本及荷瘤小鼠 | NA | 单细胞转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-05-15 |
A bioinformatics pipeline for identifying homoplasmic and heteroplasmic mitochondrial DNA SNVs in single-cell RNA-Seq datasets
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111122
PMID:41061772
|
研究论文 | 开发了一个用于在单细胞RNA测序数据中鉴定同质和异质性线粒体DNA单核苷酸变异的生物信息学流程 | 该流程通过质控、比对到线粒体基因组、SNV识别和注释，并使用覆盖率阈值检测异质性，同时过滤测序错误和新颖的删除策略，包括链偏倚、RNA修饰错误和过度代表变异 | 未在本文中明确讨论，但可能依赖于scRNA-seq数据的质量和现有比对方法的准确性 | 提高从公共scRNA-seq数据中可靠检测mDNA SNV的能力，理解其机制和临床表现 | 单细胞RNA测序数据中的线粒体DNA同质和异质性单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-05-12 |
Functional Diversity of Two Novel Embryonic Microglial Subpopulations and Their Developmental Trajectories in Developing Mouse Brains
2025-11, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70064
PMID:40714978
|
research paper | 发现小鼠胚胎大脑中两种新型小胶质细胞亚群及其发育轨迹 | 首次通过无分选单细胞RNA测序识别出两种新型胚胎小胶质细胞亚群EM1和EM2，并揭示其从CD68阴性向CD68阳性转化的发育轨迹 | 尚未在其他物种或人类中验证这些亚群的存在及其功能 | 探究胚胎小胶质细胞的异质性和发育轨迹 | 小鼠胚胎期第14天及出生后第1、14、90天的大脑细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光染色 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 胚胎期第14天小鼠大脑样本，以及出生后不同时间点样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-05-09 |
Single Cell and Spatial Transcriptomics Identify Novel Immune-Stromal Interactions in Cardiac Allograft Vasculopathy
2025-Nov-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7812112/v1
PMID:41333445
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，表征心脏同种异体移植血管病变（CAV）中独特的免疫-基质细胞相互作用，并发现潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学，全面解析CAV新生内膜微环境中调节性血管平滑肌细胞和巨噬细胞亚群的相互作用，并确定干扰素信号通路为关键致病机制 | 未说明具体局限性，但可能包括动物模型与人体研究的差异、样本量有限等 | 阐明心脏同种异体移植血管病变（CAV）的细胞和分子机制，寻找新的治疗靶点 | 人类冠状动脉组织（CAV vs 动脉粥样硬化性冠状动脉疾病 vs 非疾病对照）及小鼠CAV模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 人类冠状动脉样本（具体数量未明确）和小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Spatial Gene Expression |
| 12 | 2026-05-09 |
Three-dimensional cell spheroid technology: Recent advances and emerging strategies in cartilage regeneration
2025-11, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2025.10.001
PMID:41046113
|
综述 | 本文综述了三维细胞球体技术在软骨再生中的最新进展和新兴策略，重点讨论了其形成机制、工程策略和临床应用，并分析了大规模生产和免疫安全等关键挑战 | 系统总结了三维细胞球体技术在软骨再生中的优势，包括模拟体内微环境、增强细胞间相互作用、促进细胞外基质生成，同时提出结合智能生物材料和机器学习等新兴解决方案以实现个性化标准化生产 | 临床转化受限于细胞球体的长期稳定性有限、大规模生产困难和体内植入后的免疫排斥反应 | 总结三维细胞球体技术在软骨再生领域的最新发展和未来方向，促进临床转化应用 | 三维细胞球体技术及其在软骨损伤修复、骨关节炎模型构建、药物筛选平台开发中的应用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 三维细胞球体技术、单细胞RNA测序 | 机器学习 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-05-08 |
CRATER tumor niches facilitate CD8+ T cell engagement and correspond with immunotherapy success
2025-Nov-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.09.021
PMID:41109214
|
研究论文 | 利用斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本，通过长期体内成像和高分辨率空间转录组学鉴定出肿瘤微环境中促进免疫治疗响应的CRATER肿瘤生态位 | 首次发现并定义CRATER（抗原呈递和T细胞结合滞留区）作为肿瘤基质与黑色素细胞边界处的口袋结构，该区域富含抗原识别分子并具有最高密度CD8 T细胞，在免疫检查点阻断治疗后扩张并与临床响应相关 | 未明确说明研究限制 | 鉴定在免疫治疗期间促进免疫应答的肿瘤微环境域 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、体内成像 | NA | 图像、转录组数据 | 斑马鱼肿瘤样本和人类黑色素瘤活检样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-05-08 |
HMGA2 links morphological evolution and microenvironment dynamics to systemic therapy response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012568
PMID:41290257
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研究论文 | 本研究探讨了HMGA2在透明细胞肾细胞癌中连接形态演变与肿瘤微环境动态，并影响系统治疗反应的作用 | 首次揭示HMGA2在ccRCC中通过促进形态演化和调节免疫微环境（特别是Tpex与cDC1的ICAM-1依赖性互作）来影响免疫检查点抑制剂联合疗法的反应 | 结论需要额外的实验研究来验证这些机制 | 研究HMGA2在ccRCC形态演变、肿瘤微环境动态及系统治疗反应中的作用及其临床影响 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的肿瘤样本，包括原发性和转移性队列 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学, 免疫组化, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 图像, 文本, 转录组数据 | 原发性ccRCC样本（ST样本）、转移性ccRCC队列（IHC及RNA-seq数据）以及scRNA-seq和mIHC数据集 | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Visium, NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台、Illumina NovaSeq平台用于批量RNA测序和单细胞RNA测序 |
| 15 | 2026-05-06 |
Pan-cancer multi-omics profiling of MS4A2 unveils its functional landscape in lung adenocarcinoma
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002903
PMID:40607924
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研究论文 | 通过多组学泛癌分析揭示MS4A2在肺腺癌中的功能景观，并将其重新定义为肥大细胞驱动的肿瘤进展守护者 | 首次整合四个生存指标（OS/DSS/PFI/DFI）的预后评估，并发现MS4A2通过双向趋化因子调控建立免疫抑制微环境，同时高表达肿瘤对化疗药物敏感 | 未在独立外部队列中验证其预后模型的泛化性，且MS4A2调控免疫微环境的具体分子机制仍需进一步实验验证 | 阐明MS4A2在肺腺癌中的预后价值及其作为治疗靶点的潜力 | 33种癌症类型的转录组数据（TCGA/GTEx）和非小细胞肺癌单细胞转录组数据 | 机器学习 | 肺腺癌 | 转录组测序,单细胞转录组测序 | Cox回归,Kaplan-Meier模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据,药物敏感性数据 | 33种癌症的bulk RNA-seq样本和NSCLC单细胞测序队列 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | TCGA/GTEx数据库和GDSC药物基因组学数据 |
| 16 | 2026-05-05 |
Phylogenomic Analysis of Deep-Branching Telonemid
2025-11-28, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf202
PMID:41157959
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序和系统基因组学分析，研究深分支Telonemid的进化关系 | 首次从太平洋远洋水域分离出TEL2亚群的单细胞，填补了Telonemia类群稀疏采样空白，并揭示了其与SAR超类群及其他不稳定超类群的系统发育关系 | 贝叶斯分析未能收敛到同一拓扑结构，且结果在不同数据子集和参数设置下表现出不稳定性 | 探究Telonemia类群与Stramenopila-Alveolata-Rhizaria超类群及其他稀疏采样超类群的进化关系 | 太平洋远洋水域中分离的单个Telonemid细胞（TEL2亚群） | 系统基因组学 | NA | 单细胞转录组测序、系统基因组学分析 | 最大似然法 | 转录组序列 | 1个单细胞样本（太平洋远洋水域） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-03 |
Alterations in Resident Immune Cells in Prenatal Trisomy 21 Lungs
2025-Nov-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14231866
PMID:41369355
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了产前唐氏综合征（T21）胎儿肺部的免疫细胞变化，发现B细胞显著减少，可能解释了对呼吸道感染的易感性增加 | 首次在产前阶段利用单细胞RNA测序技术系统描绘唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞图谱，并发现B细胞数量和成熟标志物的显著改变 | 样本量较小（T21组5例，对照组4例），且仅关注产前阶段，未探讨出生后免疫系统的变化 | 探究产前唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞的变化，以解释其对呼吸道感染易感性增高的原因 | 产前唐氏综合征（T21）和非唐氏综合征（非T21）胎儿的肺部组织 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 免疫荧光染色, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据, 组织切片图像 | 5例唐氏综合征胎肺和4例非唐氏综合征胎肺 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 18 | 2026-05-03 |
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-11-03, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352826.125
PMID:40774817
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研究论文 | 通过时间序列单细胞RNA测序和单核ATAC测序，研究小鼠皮层放射状胶质细胞谱系进程驱动的细胞多样化 | 首次结合时间序列scRNA-seq和snATAC-seq，系统揭示了放射状胶质细胞从早期到晚期转变过程中，通过限制广泛表达的转录因子到特定阶段和细胞类型，驱动皮层细胞多样化的染色质可及性机制 | 未提及 | 研究小鼠皮层放射状胶质细胞内在程序如何驱动皮层细胞多样化 | 纯化的小鼠皮层祖细胞（放射状胶质细胞、中间神经元祖细胞、中间胶质祖细胞） | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 多个胚胎和出生后阶段的小鼠皮层祖细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-03 |
Highly accurate reference and method selection for universal cross-data set cell type annotation with CAMUS
2025-Nov-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280821.125
PMID:41034048
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研究论文 | 提出了一种名为CAMUS的跨数据集细胞类型注释方法，通过通用参考数据和方法选择策略实现高准确率和高效率的注释 | 首次提出一种通用的参考数据和方法选择策略，用于跨数据集细胞类型注释，显著提升注释准确率 | 未明确提及局限性，但可能依赖于参考数据集的多样性和覆盖度 | 开发一种能够自动选择最佳参考数据和方法的高准确率细胞类型注释方法 | 跨物种单细胞RNA测序、单细胞空间转录组和单细胞ATAC测序数据集 | 机器学学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达矩阵 | 672对跨物种单细胞RNA测序数据集、80个单细胞空间转录组数据集和5个单细胞ATAC测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-03 |
Single-cell RNA profiling of blood CD4+ T cells identifies distinct helper and dysfunctional regulatory clusters in children with SLE
2025-Nov, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02297-2
PMID:41120754
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童系统性红斑狼疮（SLE）患者血液中CD4+ T细胞的异质性，发现辅助性和功能失调的调节性T细胞亚群 | 首次在儿童SLE患者中通过单细胞RNA测序详细描绘CD4+ T细胞的复杂亚群，特别是发现功能失调的调节性T细胞亚群与狼疮肾炎相关，并揭示TLR5和FCRL3在SLE初始T细胞中的上调可能关联粘膜微生物失调 | 未提供具体局限性信息 | 阐明系统性红斑狼疮（SLE）中CD4+ T细胞的复杂性和亚群特征，以理解其对疾病活动性和免疫失调的影响 | 儿童SLE患者和健康供体的血液CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自儿科患者和健康供体的血液CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用分选后的血液CD4+ T细胞进行单细胞RNA测序 |