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当前共找到 592 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-12-01 |
Investigating the Effects of Long-Term Fine Particulate Matter Exposure on Autism Spectrum Disorder Severity: Evidence from Multiple Analytical Approaches
2025-Oct-28, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics13110922
PMID:41304474
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研究论文 | 本研究通过多种分析方法探讨长期细颗粒物暴露与自闭症谱系障碍严重程度之间的关联及其潜在机制 | 采用全球疾病负担数据与孟德尔随机化相结合的分析方法，结合网络毒理学、单细胞转录组学和动物实验，首次系统揭示PM暴露通过神经炎症激活加剧ASD症状的分子机制 | 存在多种潜在混杂因素如其他污染物共同暴露和社会经济变量未完全控制，需要在更大更多样化的群体中进一步验证 | 探索长期PM暴露与ASD症状恶化的关联及其作用机制 | 自闭症谱系障碍患者和动物模型 | 环境健康与神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 孟德尔随机化, 网络毒理学, 单细胞转录组学, 动物实验 | NA | 流行病学数据, 环境监测数据, 基因表达数据, 行为学数据 | 基于全球疾病负担数据和中国高分辨率空气污染数据库的队列研究 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 162 | 2025-12-01 |
StomachDB: An Integrated Multi-Omics Database for Gastric Diseases
2025-Oct-24, Biology
DOI:10.3390/biology14111484
PMID:41300276
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研究论文 | 开发了首个专注于胃部疾病的综合多组学数据库StomachDB | 首个专注于胃部疾病的综合多组学数据库，整合了6种生物数据类型 | NA | 增强胃部疾病的诊断和治疗理解 | 44种胃部相关病理，包括胃癌、胃溃疡和胃炎 | 生物信息学 | 胃部疾病 | 多组学整合分析 | NA | 基因组学、转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | 约250万个标准化数据文件和268,394个疾病-基因关联 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学整合 | NA | NA |
| 163 | 2025-12-01 |
Attention-Guided Probabilistic Diffusion Model for Generating Cell-Type-Specific Gene Regulatory Networks from Gene Expression Profiles
2025-Oct-24, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16111255
PMID:41300707
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研究论文 | 提出一种基于扩散模型的深度学习框架Planet，用于从单细胞RNA测序数据生成细胞类型特异性基因调控网络 | 采用三重混合注意力Transformer捕获长程调控依赖关系，并引入快速采样策略加速推理过程 | 与DigNet方法相比在可比条件下仅实现轻微性能提升 | 构建具有全局一致性的细胞特异性基因调控网络 | 小鼠肺Cd8Gzmk T细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 扩散模型, Transformer | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2025-12-01 |
An ApiAP2 Family Transcriptional Factor PfAP2-06B Regulates Erythrocyte Invasion Indirectly in Plasmodium falciparum
2025-Oct-22, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens14111076
PMID:41305314
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研究论文 | 本研究揭示了疟原虫ApiAP2家族转录因子PfAP2-06B通过调控入侵相关基因间接调节红细胞入侵过程 | 首次发现PfAP2-06B转录因子通过调节入侵相关基因表达间接影响疟原虫红细胞入侵，并揭示了其在细胞间基因表达随机变异中的作用 | 未明确PfAP2-06B具体调控的下游靶基因网络及其直接作用机制 | 探究PfAP2-06B转录因子在疟原虫红细胞内发育周期中对红细胞入侵过程的调控作用 | 恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)及其红细胞入侵过程 | 分子生物学 | 疟疾 | 条件性基因敲低, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 165 | 2025-11-30 |
Tumor-intrinsic MHC-II activation in pancreatic ductal adenocarcinoma enhances immune response and treatment efficacy
2025-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.21.683745
PMID:41278823
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研究论文 | 本研究探讨胰腺导管腺癌中恶性细胞固有MHC-II表达对免疫微环境和治疗效果的调控作用 | 首次系统揭示恶性细胞固有MHC-II表达在PDAC中的预后价值及其通过增强抗原呈递促进抗肿瘤免疫的机制 | 研究主要基于临床前模型，需要在更大规模的人类队列中验证 | 探究MHC-II在PDAC恶性细胞中的表达特征及其对免疫治疗疗效的影响 | 人类PDAC样本和KPC小鼠PDAC模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重免疫组织化学,体外培养实验 | NA | 基因表达数据,空间定位数据,组织切片图像 | 人类PDAC样本和KPC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 166 | 2025-11-30 |
Identification of Apically Localized Endogenous Dental Pulp Stem Cells
2025-Oct-18, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251378094
PMID:41108143
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和谱系追踪技术识别了小鼠磨牙根尖定位的内源性Axin2+牙髓干细胞 | 首次在牙根尖部位发现内源性Axin2+牙髓干细胞，并揭示其在牙髓组织形成和损伤修复中的动态过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类牙髓干细胞的特性和行为可能存在差异 | 探索牙髓干细胞在牙髓和牙本质再生中的原位作用机制 | 小鼠磨牙牙髓组织和根尖乳头组织 | 干细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞转录组学，谱系追踪 | NA | 基因表达数据，细胞谱系数据 | 小鼠磨牙组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2025-11-30 |
Age- and Sex- Driven Transcriptional and Metabolic Diversity in Myeloid-Derived Suppressor Cells After Mouse Sepsis
2025-Oct-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680736
PMID:41278644
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了年龄和性别对脓毒症诱导的髓源性抑制细胞转录组和代谢状态的显著影响 | 首次在单细胞水平系统揭示年龄和性别因素对脓毒症中MDSC转录组和代谢状态的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明年龄和性别因素如何影响脓毒症诱导的髓源性抑制细胞生物学特性 | 年轻和老年雄性和雌性小鼠的脾脏白细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻组(3-4个月)和老年组(18-24个月)雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2025-11-29 |
IGF1R deficiency mitigates acute lung injury by promoting anti-inflammatory transcriptional profiles
2025-Oct-22, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03339-x
PMID:41126254
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示IGF1R缺陷通过调控转录和表观遗传特征减轻急性肺损伤 | 首次系统阐明IGF1R缺陷通过调节细胞因子风暴、DNA损伤、代谢重编程和表观遗传调控等多重机制缓解急性肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；未涉及临床治疗应用 | 探究IGF1R在急性肺损伤发病机制中的作用及潜在治疗价值 | 人类COVID-19患者肺组织、小鼠肺组织、原代小鼠胚胎成纤维细胞 | 生物医学研究 | 急性肺损伤/COVID-19 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质检测, DNA损伤评估, 甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 表观遗传数据 | 人类COVID-19病例和对照捐赠者肺组织、博来霉素诱导的Igf1r缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-11-29 |
Entrywise splitting cross-validation in generalized factor models: from sample splitting to entrywise splitting
2025-Oct-08, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf153
PMID:41311195
|
研究论文 | 本文提出了一种基于条目分割的交叉验证方法，用于确定广义因子模型中的因子数量 | 提出条目分割而非样本分割的交叉验证方法，并引入带惩罚项的条目分割交叉验证准则 | NA | 解决广义因子模型中因子数量确定的挑战 | 广义因子模型和因子数量确定方法 | 机器学习 | NA | 交叉验证，信息理论准则 | 广义因子模型 | 多元数据（包括二元选择、计数和连续观测值） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-11-28 |
Exploring microRNAs, One Cell at a Time
2025-Oct-22, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna11060073
PMID:41283328
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研究论文 | 本文探讨了单细胞水平下microRNA的分析工具与计算方法 | 开发了分析细胞特异性miRNA丰度的实验工具和计算方法 | NA | 揭示miRNA生物学的复杂性，增进对生命科学和疾病的理解 | microRNAs（miRNAs） | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 171 | 2025-11-28 |
Comprehensive profiling of transcription factors for reprogramming human astrocytes to neuronal cells through endogenous CRISPR-based gene activation
2025-Oct-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.11.681828
PMID:41278743
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研究论文 | 本研究建立了基于CRISPR激活的方法，通过高通量筛选鉴定转录因子，将人类星形胶质细胞重编程为神经元细胞 | 首次使用CRISPRa技术对人类所有转录因子编码基因进行系统性筛选，发现单个转录因子即可诱导星形胶质细胞向多种神经元亚型分化 | NA | 鉴定能够将人类星形胶质细胞重编程为神经元细胞的高效转录因子 | 人类原代星形胶质细胞 | 基因编辑与细胞重编程 | 神经退行性疾病 | CRISPR激活(CRISPRa), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2025-11-27 |
Cross-expression meta-analysis of mouse brain slices reveals coordinated gene expression across spatially adjacent cells
2025-Oct-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03747-8
PMID:41163012
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研究论文 | 本研究提出“交叉表达”概念，通过整合多个小鼠大脑数据集构建元分析网络，揭示相邻细胞间基因表达的协调模式 | 引入“交叉表达”新概念，无需细胞类型标签或预定义数据库即可分析相邻细胞间基因表达协调性 | 方法依赖于基因表达和细胞位置矩阵的准确性，未考虑细胞间直接通讯机制 | 研究空间相邻细胞间基因表达的协调机制 | 小鼠大脑切片中的细胞 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组学，元分析 | 交叉表达网络 | 基因表达数据，空间位置数据 | 约2500万个细胞，695个切片，52个大脑 | 多种技术平台 | 空间转录组学 | 多种技术 | 8种不同技术平台的数据集 |
| 173 | 2025-11-26 |
Cardiomyocyte-specific plakophilin-2 loss is sufficient to induce aging and senescence of nonmyocytes. Relevance to arrhythmogenic cardiomyopathy
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.22.682160
PMID:41279511
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研究论文 | 本研究通过心肌细胞特异性PKP2敲除模型，首次证实仅心肌细胞中plakophilin-2缺失足以诱导非心肌细胞衰老和心脏整体早衰 | 首次将细胞衰老和早衰机制与桥粒性心律失常心肌病相关联，揭示了心肌细胞基因缺陷通过旁分泌机制引发非心肌细胞衰老的新路径 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；衰老机制的具体信号通路尚未完全阐明 | 探究PKP2缺陷是否仅通过心肌细胞即可引发非心肌细胞衰老和心脏早衰 | 心肌细胞特异性PKP2敲除小鼠模型中的心肌细胞和非心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心律失常性心肌病 | 多重成像、细胞因子阵列、表观遗传时钟、空间转录组学、扩展显微镜、结构照明显微镜 | 基因敲除小鼠模型 | 图像、转录组、蛋白质组、表观遗传数据 | PKP2cKO小鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | 空间转录组学、多重免疫组化 | NA | NA |
| 174 | 2025-11-26 |
Glutamine synthetase loss in β-catenin-mutant hepatocellular carcinoma promotes tumor burden through macrophage metabolic reprogramming
2025-Oct-23, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001591
PMID:41129335
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研究论文 | 本研究探讨β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失如何通过巨噬细胞代谢重编程促进肿瘤负荷 | 首次揭示肿瘤细胞GS缺失后巨噬细胞通过代谢适应维持mTOR激活的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 阐明β-连环蛋白突变肝癌中谷氨酰胺合成酶缺失对肿瘤进展的影响机制 | 肝细胞癌小鼠模型和TCGA数据库中的肝癌患者数据 | 癌症代谢研究 | 肝细胞癌 | 单细胞空间转录组学，基因条件性敲除，巨噬细胞清除 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据，组织学数据 | TCGA数据库中的CTNNB1突变肝癌患者和小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 175 | 2025-11-26 |
Modeling Alzheimer's Disease with APOE4 Neuron-Glial Brain Assembloids Reveals IGFBPs as Therapeutic Targets
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683162
PMID:41279729
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研究论文 | 本研究开发了一种模拟阿尔茨海默病的3D脑类组装体模型，揭示了IGFBP通路在疾病进展中的新作用 | 首次创建包含神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞的3D类组装体模型，能够完整模拟阿尔茨海默病病理特征 | 模型仍需进一步验证其与人类疾病进展的完全一致性 | 开发能够准确模拟阿尔茨海默病进展的人类遗传背景模型，并探索治疗靶点 | iPSC来源的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 疾病建模 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，iPSC分化技术 | 3D类组装体模型 | 基因表达数据 | APOE4/4和同基因对照细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2025-11-26 |
Activated fatty acid synthesis pathway in macrophages propagates pathogenic fibroblast expansion after myocardial infarction
2025-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.10.681697
PMID:41279812
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研究论文 | 本研究揭示心肌梗死后巨噬细胞中脂肪酸合成通路通过ACLY和FASN促进致病性成纤维细胞扩增的机制 | 首次发现心脏巨噬细胞通过脂肪酸合成通路调控成纤维细胞扩增，并阐明ACLY通过乙酰化调控促纤维化细胞因子IL-33产生的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究巨噬细胞脂肪酸合成通路在心肌梗死后炎症和心脏重塑中的作用 | 心肌梗死小鼠模型和人类心脏样本中的巨噬细胞与成纤维细胞 | 代谢组学与单细胞生物学 | 心血管疾病 | 空间代谢组学,CUT&RUN,RNA测序,单细胞RNA测序,空间多组学 | 基因敲除小鼠模型 | 代谢组数据,基因组数据,转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间多组学 | NA | NA |
| 177 | 2025-11-26 |
ST2HE: A Cross-Platform Framework for Virtual Histology and Annotation of High-Resolution Spatial Transcriptomics Data
2025-Oct-13, ArXiv
PMID:41281202
|
研究论文 | 提出ST2HE跨平台生成框架，能够从高分辨率空间转录组数据直接合成虚拟H&E图像 | 首次开发了基于一步扩散模型的跨平台框架，整合细胞核形态和空间转录坐标生成组织学忠实的虚拟H&E图像 | NA | 为高分辨率空间转录组数据开发标准化的组织学注释框架 | 乳腺癌、非小细胞肺癌和卡波西肉瘤组织样本 | 计算病理学 | 多种癌症 | 空间转录组学 | 扩散模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 高分辨率空间转录组学 | NA | NA |
| 178 | 2025-11-26 |
Transposable Elements and Homotypic Niches Drive Immune Dynamics and Resistance in Melanoma Epigenetic-based immunotherapy
2025-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.09.679175
PMID:41278906
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学和高分辨率空间转录组学分析，揭示了表观遗传免疫疗法如何重塑黑色素瘤生态系统 | 发现转座子元件激活和同型生态位驱动免疫动态，识别NFATC2作为神经嵴样表型的主调控因子和耐药促进因子 | 样本来源于单一临床试验队列，需要更大规模验证 | 探索表观遗传免疫疗法对黑色素瘤生态系统重塑的机制 | 黑色素瘤患者纵向活检样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 单细胞多组学，空间转录组学 | 空间建模 | 单细胞多组学数据，空间转录组数据 | NIBIT-M4临床试验患者纵向活检样本 | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 179 | 2025-11-26 |
Nutritional hyperketonemia by dietary medium-chain fatty acids is driven by the liver without contribution from the intestine
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681190
PMID:41279942
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型和细胞实验证明膳食中链脂肪酸诱导的营养性高酮血症主要由肝脏介导，肠道几乎不参与此过程 | 首次明确区分肝脏和肠道在膳食中链脂肪酸诱导酮体生成中的具体作用，挑战了通过门静脉代谢物测量推断肠道贡献的常规做法 | 研究主要聚焦于C8:0中链脂肪酸，其他类型中链脂肪酸的作用尚未验证；细胞实验可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明膳食中链脂肪酸诱导营养性高酮血症的主要器官来源 | 基因敲除小鼠、原代肝细胞、人和小鼠肠道细胞系 | 代谢研究 | 代谢疾病 | RNA测序、细胞培养、代谢物测量 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、代谢物浓度数据 | 多种基因型小鼠、原代细胞和细胞系 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2025-11-26 |
Transcriptional and epigenetic repression of hematopoietic stem cells underlies bone marrow failure after spinal cord injury
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.05.680535
PMID:41279599
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研究论文 | 本研究揭示了脊髓损伤通过转录和表观遗传抑制导致造血干细胞功能受损和骨髓衰竭的机制 | 首次发现脊髓损伤通过抑制造血干细胞的转录程序和染色质可塑性导致骨髓衰竭的系统性后果 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究脊髓损伤对造血干细胞功能和长期造血的影响机制 | 造血干细胞(HSCs) | 表观遗传学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组学,染色质可及性分析,体内移植实验 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,ATAC-seq | NA | NA |