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当前共找到 627 篇文献,本页显示第 121 - 140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
121 2026-08-12
Transposable Elements and Homotypic Niches Drive Immune Dynamics and Resistance in Melanoma Epigenetic-based immunotherapy
2025-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究通过单细胞多组学和空间转录组学分析黑色素瘤患者的纵向活检样本,揭示了表观遗传免疫治疗中肿瘤可塑性和耐药性的机制 首次结合单细胞多组学和高分辨率空间转录组学分析表观遗传免疫治疗的纵向活检样本,识别出罕见Wnt/β-catenin驱动的黑色素细胞状态和去分化神经嵴样状态,并发现NFATC2作为耐药关键调控因子 样本量较小(来自单一临床试验),且纵向活检可能受限于肿瘤异质性,具体样本量未在摘要中说明 阐明表观遗传重塑在治疗压力下如何重塑肿瘤生态系统,揭示黑色素瘤可塑性和耐药性的机制 黑色素瘤患者的纵向肿瘤活检样本 数字病理学 黑色素瘤 单细胞多组学、空间转录组学 NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据 黑色素瘤患者的纵向活检样本(具体数量未在摘要中提供) 10x Genomics 单细胞多组学, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞多组学(可能含单细胞RNA-seq和ATAC-seq),10x Visium空间转录组学
122 2026-08-11
Single-cell transcriptomic profiling of the whole colony of Botrylloides diegensis: insights into tissue specialization and blastogenesis
2025-10-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 通过单细胞RNA测序解析Botrylloides diegensis整个群体的细胞异质性,识别细胞和组织标记,并研究组织特化与出芽发育过程 首次对整个群体进行scRNA-seq,识别了29个主要细胞簇,并通过原位杂交验证标记基因的空间表达,揭示了胃上皮特化区域和祖细胞到分化组织的发育轨迹 未提及 解析B. diegensis群体的细胞异质性和组织特化,为发育、再生研究提供资源 Botrylloides diegensis群体的完整菌落(包括个员、芽体和血管被囊) 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、原位杂交 细胞轨迹投影(cell trajectory projections)模型 单细胞转录组数据、空间表达图像 一个完整群体(包括多个个员、芽体和血管被囊) NA scRNA-seq NA NA
123 2026-08-08
Chd4 remodels chromatin to control retinal cell type specification and lineage termination
2025-10-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究通过条件性敲除小鼠视网膜中的Chd4基因,发现其通过染色质重塑调控视网膜细胞类型特化和谱系终止,Chd4缺失导致早期细胞过度产生、后期细胞生成不足及Müller胶质细胞分化延迟。 首次揭示了Chd4依赖的核小体重塑在视网膜发育中调控时间性谱系终止的关键作用,并整合CUT&RUN-seq和ATAC-seq以及单细胞转录组数据,展示了表观遗传调控与转录输出之间的直接关联。 研究仅聚焦于视网膜发育的特定时间窗口,未深入探讨Chd4在其他时间转换或不同组织中的功能;此外,未提供Chd4如何被招募到特定基因组位点的具体机制。 阐明Chd4介导的染色质重塑在神经祖细胞产生多样化细胞类型和时间性谱系终止中的具体作用及分子机制。 小鼠视网膜神经祖细胞及其分化产生的各类神经元和胶质细胞(如视网膜神经节细胞、无长突细胞、杆状光感受器和Müller胶质细胞)。 表观遗传学 NA CUT&RUN-seq, ATAC-seq, 单细胞转录组学, 条件性基因敲除 NA 基因组数据,转录组数据 小鼠视网膜组织(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
124 2026-08-04
Mapping disease-specific vascular cell populations responsible for obliterative arterial remodelling during the development of pulmonary arterial hypertension
2025-10-28, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过多重单细胞RNA测序,在严重肺动脉高压模型的不同时间点,描绘了导致闭塞性动脉重塑的疾病特异性血管细胞群体 首次在肺动脉高压发展过程中,通过时间序列的单细胞RNA测序,识别出两个疾病特异性的内皮细胞群体,并发现TM4SF1作为潜在的治疗靶点 研究基于动物模型,需要进一步在人类样本中验证;未提供具体的样本数量或临床数据 阐明肺动脉高压中血管重塑的细胞机制,并寻找新的治疗靶点 肺动脉高压大鼠模型中的肺细胞群体,特别是内皮细胞和血管平滑肌样周细胞 单细胞转录组学 肺动脉高压 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 未明确,但使用了严重PAH大鼠模型的多个时间点 NA 单细胞RNA测序 NA 多重单细胞RNA测序
125 2026-08-01
HIVEP1 aggravates NASH by reprogramming polyamine metabolism in TH17 cells
2025-10-22, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞ATAC测序和单细胞RNA测序发现HIVEP1通过重编程TH17细胞的多胺代谢加剧非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的发展,并揭示ODC1作为潜在治疗靶点。 首次利用单细胞ATAC-seq技术揭示HIVEP1在TH17细胞分化及NASH发病中的关键作用,并阐明多胺代谢在其中的机制。 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证有限。 探究免疫细胞在从NAFLD向NASH转变中的作用,并识别关键转录因子及治疗靶点。 小鼠肝脏中的免疫细胞,特别是TH17细胞。 单细胞测序 非酒精性脂肪性肝炎 scATAC-seq, scRNA-seq 不适用 基因表达和染色质可及性数据 小鼠肝脏样本(具体数量未提供)及GEO数据库中的公开数据。 10x Genomics 单细胞ATAC-seq,单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell ATAC-seq 和 10x Chromium Single Cell 3' RNA-seq,但具体配置未提供。
126 2026-08-01
Maternal monocyte-derived IFN-α1 triggers early fetal demise
2025-10-14, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和动物模型,发现母体CD14+单核细胞通过IFN-α1导致早期胎儿死亡,揭示了其作用机制。 首次直接证明母体单核细胞迁移与胚胎存活率之间的关联,发现IFN-α1作为关键效应分子,并提出了潜在的治疗靶点。 研究样本量较小(20例),且主要基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;未深入探讨其他免疫细胞或分子的潜在影响。 阐明早期胎儿死亡中母体免疫失调的具体细胞和分子机制,特别是单核细胞和IFN-α1的作用。 早期胎儿死亡患者、健康孕妇和非孕妇的外周血单核细胞,以及小鼠胚胎和绒毛组织、大鼠心肌细胞。 单细胞生物学 早期流产 单细胞RNA测序 小鼠模型、细胞培养 基因表达数据、图像数据 20例人类外周血单核细胞样本(包括患者和对照),以及小鼠胚胎和大鼠心肌细胞。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于PBMC的scRNA-seq分析
127 2026-08-01
H2BC9 lactylation modulates esophageal squamous cell carcinoma progression via the Wnt/β-catenin signaling pathway
2025-10-14, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和功能实验,揭示了组蛋白H2B变体H2BC9的乳酸化修饰通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进食管鳞状细胞癌进展的机制。 首次发现H2BC9 K44位点的乳酸化修饰作为表观遗传调控因子,通过增强Wnt7b转录活性激活Wnt/β-catenin通路,推动ESCC进展,并揭示其与免疫抑制微环境和化疗耐药的相关性。 主要基于体外实验和小鼠异种移植模型,缺乏更大规模临床样本验证;未深入探索H2BC9乳酸化的上游调控因子及其在其他肿瘤中的普遍性。 探究组蛋白乳酸化在ESCC进展中的功能作用,特别是H2BC9乳酸化对Wnt/β-catenin信号通路的调控机制。 食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞系、异种移植肿瘤模型、TCGA和GEO转录组数据。 癌症生物学、表观遗传学 食管鳞状细胞癌 RNA-seq、单细胞RNA-seq、染色质免疫沉淀-定量PCR (ChIP-qPCR)、免疫沉淀-蛋白质印迹 (IP-WB)、质谱、荧光素酶报告基因检测 NA 转录组数据、蛋白质组数据、基因表达数据、蛋白质-蛋白质相互作用 未明确说明样本数量,涉及TCGA和GEO公共数据及细胞系和异种移植模型。 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'文库制备,Illumina NovaSeq测序
128 2026-08-01
A multi-omics Mendelian randomization study reveals PAM as a potential therapeutic target for type 2 diabetes
2025-10-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过多组学孟德尔随机化研究,发现PAM可作为2型糖尿病潜在治疗靶点 整合遗传和功能数据,通过孟德尔随机化、共定位分析及单细胞RNA-seq等多组学方法,首次确定PAM为2型糖尿病的治疗靶点,并通过分子对接和功能实验验证其与油酸的相互作用及对β细胞完整性的关键作用 未明确说明 利用多组学方法优先排序2型糖尿病的治疗靶点,并验证PAM作为潜在治疗靶点的可行性 循环蛋白质、2型糖尿病相关遗传数据、胰岛β细胞及糖尿病小鼠胰岛 基因组学 2型糖尿病 孟德尔随机化、共定位分析、全现象组关联研究、单细胞RNA测序、分子对接、功能实验 NA 基因表达数据、蛋白质定量数据、图像数据 14种循环蛋白质(9种共定位),2种排除脱靶效应,7种候选蛋白质,1种蛋白质表达于>80%β细胞,糖尿病小鼠胰岛,INS1β细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
129 2026-08-01
HEBP2-governed glutamine competition between tumor and macrophages dictates immunotherapy efficacy in triple-negative breast cancer
2025-Oct-07, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示HEBP2调控的肿瘤细胞与巨噬细胞之间的谷氨酰胺竞争影响三阴性乳腺癌免疫治疗效果 首次在单细胞水平上描绘HEBP2/GSTP1轴调控的肿瘤-巨噬细胞代谢检查点,并将其作为评估免疫治疗脆弱性的范式 文中未提及,输出NA 阐明三阴性乳腺癌免疫治疗疗效相关的代谢串扰机制,并探索提高免疫治疗效果的策略 三阴性乳腺癌肿瘤细胞和CCL3巨噬细胞 数字病理学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 免疫治疗队列27例和空间转录组队列88例 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
130 2026-08-01
A novel anti-PD-L1/IL-8 bispecific antibody BP2402 enhances antitumor immunity and modulates inflammatory signaling in triple-negative breast cancer mice model
2025-10-06, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究评估了新型双特异性抗体BP2402同时靶向PD-L1和IL-8在三阴性乳腺癌小鼠模型中的抗肿瘤效果和机制 首次开发并评估同时靶向PD-L1和IL-8的双特异性抗体BP2402,通过双重阻断免疫检查点和炎症信号通路增强抗肿瘤免疫 需要进一步的临床前优化和临床研究来全面评估该免疫疗法的治疗潜力 探究双靶向PD-L1和IL-8通路在三阴性乳腺癌治疗中的潜力,并阐明双特异性抗体的效应机制 人源化小鼠模型,植入MDA-MB-231三阴性乳腺癌细胞,使用来自五名供体的外周血单核细胞 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 五名供体,每组5只小鼠 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
131 2026-08-01
Deciphering metabolic reprogramming of immune cells within the tumor microenvironment
2025-10-06, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了结直肠癌肿瘤微环境中免疫细胞的代谢重编程异质性及其动态变化 首次系统描绘了肿瘤进展过程中浸润免疫细胞的代谢图谱,并发现肿瘤相关巨噬细胞的脂质代谢异质性与前肿瘤表型及不良临床预后相关 主要依赖公开的数据集和小鼠模型,缺乏大规模临床样本验证,且未深入探讨代谢改变的分子机制 解析肿瘤微环境中免疫细胞的代谢重编程特性,为靶向代谢增强抗肿瘤免疫的治疗策略提供新见解 结直肠癌患者肿瘤及癌旁组织中的免疫细胞,以及MC38小鼠肿瘤模型中的主要免疫细胞群体 癌症免疫学、单细胞转录组学 结直肠癌 单细胞转录组测序 无(基于单细胞转录组数据分析) 单细胞基因表达数据 结直肠癌患者的公开单细胞转录组数据集,具体样本数未说明;MC38小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组测序平台(具体信息未在标题和摘要中说明)
132 2026-08-01
Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals that EZH2 regulates the MIF-CD74 axis to modulate T cell activation and exhaustion in hepatocellular carcinoma
2025-10-01, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本文通过整合单细胞RNA-seq分析,发现EZH2通过调控MIF-CD74轴影响肝细胞癌中T细胞的激活与耗竭,并构建了一个预测预后和免疫治疗反应的集成模型。 首次结合与自噬、衰老、休眠、线粒体功能和肿瘤干细胞相关的基因构建了16基因集成模型,并利用单细胞转录组和免疫活性小鼠模型揭示了EZH2在调控CD8+ T细胞激活和耗竭中的新机制。 研究可能受限于模型在临床应用的验证,以及单细胞分析的样本量和异质性,且具体分子机制仍需进一步实验证实。 开发一个可靠的模型以预测肝细胞癌的预后和对免疫检查点抑制剂的反应,并探索相关基因在肿瘤免疫微环境中的作用。 肝细胞癌患者的基因表达数据、免疫细胞(特别是CD8+ T细胞)以及小鼠模型。 机器学习和数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 集成模型(可能包括多种机器学习算法) 基因表达数据、单细胞转录组数据 未提供具体样本数量,涉及肝细胞癌患者和小鼠模型。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
133 2026-07-30
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveal macrophage subpopulation characteristics and the role of STAT1 in rheumatoid arthritis
2025-10-23, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示巨噬细胞亚群特征及STAT1在类风湿关节炎中的作用 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,结合LASSO回归和随机森林模型,识别STAT1为关键基因,并证实其通过调节自噬和铁死亡通路参与RA发病 仅使用AIA大鼠模型验证,缺乏人类样本的进一步验证;STAT1下游调控机制未完全阐明 阐明类风湿关节炎中巨噬细胞的异质性和分子特征,探索STAT1作为潜在治疗靶点的可能性 类风湿关节炎患者的滑膜组织巨噬细胞及AIA大鼠模型 机器学习, 数字病理学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, LASSO回归, 随机森林 随机森林, LASSO回归模型 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 26,923个细胞(来自scRNA-seq数据)和AIA大鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
134 2026-07-30
ITGB5-mediated biomechanical regulation in pancreatic ductal adenocarcinoma stroma impacts tumor progression and prognosis
2025-10-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 整合多种技术研究ITGB5介导的胰腺导管腺癌基质生物力学调控及其对肿瘤进展和预后的影响 首次通过整合磁共振弹性成像、原子力显微镜和单细胞RNA测序等多模态方法,系统解析了ITGB5在CAFs中调控基质刚度的分子机制,并靶向ITGB5减弱肿瘤硬度 ITGB5靶向对患者预后的影响尚需临床研究证实 探究胰腺导管腺癌中CAFs介导的基质力学调控与肿瘤进展及预后的关联,并鉴定新型治疗靶点 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织样本、细胞系及动物模型 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 磁共振弹性成像, 原子力显微镜, 加权基因共表达网络分析 NA 转录组数据, 图像数据, 力学数据 TCGA数据库中的PDAC样本(数量未明确);此外包含体外细胞实验和动物模型 Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 Illumina NovaSeq TCGA来源的批量RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据
135 2026-07-30
Single-cell transcriptomics identifies PDIA4 as a marker of progression and therapeutic vulnerability in multiple myeloma
2025-10-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞转录组学鉴定PDIA4作为多发性骨髓瘤进展和治疗脆弱性的标志物 首次从单细胞水平揭示PDIA4在多发性骨髓瘤终末阶段浆细胞中的上调表达及其在蛋白质未折叠反应中的关键调控作用,并证明靶向PDIA4可增强蛋白酶体抑制剂的疗效 研究主要基于RPMI-8226细胞系和异种移植模型,未在更多患者来源样本或临床队列中验证PDIA4靶向治疗的效果 阐明多发性骨髓瘤恶性进展和肿瘤细胞长期存活的转录调控机制,并探索潜在治疗靶点 健康供者、意义未明的单克隆丙种球蛋白病、冒烟型多发性骨髓瘤和新诊断多发性骨髓瘤患者的浆细胞 单细胞转录组学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 伪时间轨迹分析 单细胞转录组数据 GEO数据集GSE124310和GSE271107中的健康供者、MGUS、SMM和NDMM患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA GEO数据集GSE124310和GSE271107(具体平台未在摘要中说明)
136 2026-07-30
Glioblastoma resistance to EGFR antibody-drug conjugate is driven by transcriptional reprogramming and TEK-induced EGFR suppression
2025-10-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过患者来源异种移植模型揭示了胶质母细胞瘤对EGFR抗体-药物偶联物耐药性的转录重编程及TEK诱导的EGFR抑制机制 首次发现TEK S466I点突变及TEK信号通路介导的EGFR下调是GBM对ABT-414耐药的新机制 临床转化验证尚未完成,部分机制在体外模型中验证 阐明胶质母细胞瘤对EGFR抗体-药物偶联物耐药性的分子机制 胶质母细胞瘤患者来源异种移植模型 机器学习 胶质母细胞瘤 全外显子测序、批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA 基因组和转录组数据 多个GBM12 PDX肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序、全外显子测序 NA NA
137 2026-07-30
Macrophage dynamics and the role of TREM2 at the oral mucosal barrier
2025-10-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了TREM2在口腔黏膜屏障巨噬细胞动态变化及牙周病中的作用 首次揭示TREM2在口腔黏膜巨噬细胞中的表达及其在牙周病缓解期的免疫调节功能 NA 研究TREM2在牙周病期间对口腔黏膜巨噬细胞的调控作用 口腔黏膜巨噬细胞 机器学习 牙周病 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 基因表达数据,图像 野生型和TREM2-/-小鼠,以及人类口腔黏膜巨噬细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
138 2026-07-30
Compositional data modeling of high-dimensional single cell RNA-seq (CoDA-hd): its advantages over commonly used normalization approaches
2025-10-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 探索高维组成数据分析(CoDA-hd)在单细胞RNA-seq数据中的应用优势 提出创新的计数添加方案(如SGM),使CoDA能应用于高维稀疏单细胞数据,并证明中心对数比(CLR)变换在降维、聚类和轨迹推断中优于常用归一化方法 仅基于模拟和有限真实数据集验证,未充分评估所有下游分析(如差异表达分析)的兼容性 评估CoDA框架在高维单细胞RNA-seq数据中的适应性及其对数比变换的优势 单细胞RNA-seq的原始计数矩阵(含超过20,000个基因成分) 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达计数数据 使用模拟数据集和真实数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
139 2026-07-30
Metabolic and immune crosstalk between cancer-associated fibroblasts and pancreatic cancer cells
2025-10-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
综述 探讨胰腺癌相关成纤维细胞与胰腺癌细胞之间的代谢和免疫相互作用,揭示其对肿瘤进展的影响 通过整合单细胞测序和空间组学数据,提供了CAFs驱动的代谢串扰和免疫景观重塑的新见解,为靶向基质相互作用的治疗策略奠定基础 未提及具体局限性 综述CAFs与胰腺癌细胞间的代谢和免疫相互作用,为开发新的治疗策略提供基础 胰腺癌相关成纤维细胞和胰腺癌细胞 数字病理学 胰腺癌 NA NA 组学数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间组学 NA NA
140 2026-07-30
Investigation into the molecular mechanism of obesity: an integrated approach of multi-omics analysis, machine learning and experimental validation
2025-10-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
research paper 通过多组学分析、机器学习与实验验证的整合方法研究肥胖的分子机制 首次整合转录组、单细胞RNA测序与机器学习算法(LASSO回归和随机森林)系统鉴定肥胖关键基因,并通过动物实验验证TREM2在巨噬细胞中的特异性表达及其作为潜在诊断生物标志物的作用 仅基于GEO数据库的公开数据集,未进行大规模临床样本验证;动物实验仅限于小鼠模型,未涉及人类样本 系统识别影响肥胖病理进展的关键靶点及其潜在机制 肥胖相关的转录组和单细胞RNA测序数据以及肥胖小鼠脂肪组织 machine learning obesity RNA-seq, scRNA-seq, LASSO回归, 随机森林 LASSO, 随机森林 基因表达数据, 单细胞基因表达数据 来自GEO数据库的多个转录组和单细胞RNA测序数据集,具体样本量未详细说明 Illumina bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq Illumina NovaSeq 未明确说明平台具体配置
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