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当前共找到 592 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-12-11 |
A universal and cost-efficient sample labeling approach for multiplexed single-cell RNA-seq based on recombinant HUH-endonuclease-agglutinin tagging
2025-Oct-28, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.10.004
PMID:41167558
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HEATag的通用细胞膜标记方法，用于多路复用单细胞RNA测序，以降低成本并提高效率 | 结合鸭环病毒HUH内切酶和小麦胚芽凝集素，实现高效、序列特异性的单链DNA标记，适用于多种物种和细胞状态 | NA | 开发一种成本效益高且可扩展的样本标记方法，以促进高通量单细胞研究 | 新鲜或固定细胞的细胞膜 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单链DNA标记数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-12-11 |
Transcriptome Analysis Identified SPP1-Positive Monocytes as a Key in Extracellular Matrix Formation in Thrombi
2025-Oct-07, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.044299
PMID:41025474
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研究论文 | 本研究通过转录组分析发现SPP1阳性单核细胞在血栓细胞外基质形成中起关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出SPP1高表达的单核细胞/巨噬细胞亚群，并揭示其在血栓成熟过程中的核心作用 | 样本量较小（3个血栓用于RNA表达比较），且主要基于脑血栓和肺动脉血栓数据，可能不适用于所有血栓类型 | 探究血栓成熟的详细机制，特别是细胞外基质形成的关键因素 | 人类血栓样本（来自脑血管和肺动脉） | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | RNA表达数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 3个血栓用于RNA表达比较，66个血栓用于免疫组织化学验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-12-11 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.12.623125
PMID:39605504
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转变及蚊虫-寄生虫相互作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序与共聚焦显微镜技术，系统解析了疟原虫在蚊媒中肠内的发育轨迹和细胞互作网络，并发现转录因子SIP2对子孢子感染人肝细胞的关键作用 | 研究主要基于实验室培养的蚊虫-寄生虫体系，虽验证了部分野外来源寄生虫，但自然条件下的复杂互作机制仍需进一步探索 | 阐明疟原虫在按蚊体内的发育生物学机制及蚊虫-寄生虫相互作用 | 恶性疟原虫与按蚊的相互作用体系 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，功能分析 | NA | 单细胞转录组数据，显微成像数据 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊虫细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2025-12-11 |
The immune landscape of pediatric (extra)cranial solid tumors: A systematic review and integration of immunohistochemistry and single-cell RNA sequencing data
2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2025.115708
PMID:40857838
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系统综述 | 本文通过整合免疫组化和单细胞RNA测序数据，系统性地综述了儿童（颅）外实体瘤的免疫微环境特征 | 首次系统性地整合了免疫组化和单细胞/单核RNA测序数据，对儿童实体瘤的免疫景观进行了全面分析，并创建了公开可用的交互式热图图谱 | 纳入研究的方法学存在异质性，且部分肿瘤类型的数据仅来自单一技术 | 阐明儿童（颅）外实体瘤的独特免疫微环境，以指导针对儿童癌症的免疫治疗策略的开发与选择 | 儿童脑肿瘤和颅外实体瘤 | 数字病理学 | 儿童实体瘤 | 免疫组化，单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 图像，测序数据 | 共73项研究，包含2187个肿瘤样本（IHC）和272个肿瘤样本（sc/snSeq） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2025-12-10 |
Nonhuman Primate Model of Super-selective Intra-arterial Ophthalmic Arterial Interventional Thrombolysis for Treatment of Ophthalmic Arterial Embolism Resulting From Hyaluronic Acid Filler Cosmetic Injection
2025-Oct-16, Aesthetic surgery journal
IF:3.0Q1
DOI:10.1093/asj/sjaf132
PMID:40601619
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研究论文 | 本研究建立了一种非人灵长类动物模型，用于模拟眼动脉栓塞及超选择性眼动脉内介入溶栓治疗，以评估透明质酸填充剂注射后视网膜缺血再灌注的疗效 | 首次在非人灵长类动物中建立眼动脉栓塞模型，并应用单细胞RNA测序技术分析视网膜细胞在缺血再灌注过程中的分子变化 | 研究样本量较小，且模型可能无法完全模拟人类临床情况的复杂性 | 评估眼动脉内溶栓治疗对透明质酸填充剂注射所致眼动脉栓塞后视觉功能改善的有效性，并建立临床相关的视网膜缺血再灌注模型 | 恒河猴（非人灵长类动物） | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、数字减影血管造影、眼底荧光血管造影、视网膜电图、组织学染色、透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据、影像数据、电生理数据、组织学数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多个时间点（立即、1、4、24小时）的干预 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-12-10 |
Computer Vision Methods for Spatial Transcriptomics: A Survey
2025-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.13.682148
PMID:41280008
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综述 | 本文首次系统性地综述了计算机视觉AI模型在空间转录组学分析中的应用，涵盖架构、学习范式、任务和数据集，并追踪其技术演变 | 首次系统性地综述计算机视觉方法在空间转录组学中的应用，强调其超越传统生物信息学、整合形态学与分子状态、以及解决ST技术限制（如高成本、临床适用性有限、2D分析限制）的新视角 | 作为一篇综述文章，未直接进行实验研究，因此不涉及具体模型或数据的局限性；但文中讨论了ST技术本身的限制（如高成本、2D分析） | 综述计算机视觉AI模型在空间转录组学分析中的应用，探索其如何利用组织学图像增强空间转录组数据分析，并推动基础研究和临床实践 | 空间转录组学数据及相关计算机视觉AI模型 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像（组织学图像）和空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 127 | 2025-12-10 |
Islet-intrinsic sex differences in inflammatory signaling contribute to autoimmune diabetes susceptibility
2025-Oct-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680429
PMID:41279069
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛内在的性别差异在炎症信号传导中的作用，以解释1型糖尿病（T1D）的性别偏向易感性 | 揭示了男性胰岛对促炎细胞因子反应更强烈，而雌激素（E2）能抑制炎症信号并降低β细胞免疫原性，为性别偏向的T1D易感性提供了机制性见解 | 研究主要基于体外实验和NOD小鼠模型，人类样本的临床验证有限，且未全面探索其他性激素或长期效应 | 探究性别特异性胰岛炎症反应如何影响1型糖尿病的易感性差异 | 人类胰岛、小鼠β细胞、非肥胖糖尿病（NOD）小鼠 | NA | 1型糖尿病 | 转录组学分析、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 人类胰岛来自男性和女性供体，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2025-12-09 |
A Single-Cell Atlas of Transcriptional and Immunoglobulin Repertoire Evolution in Early B Cell Development
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681095
PMID:41278878
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，深入分析了早期B细胞发育过程中的转录组和免疫球蛋白库演化，揭示了重组事件后的增殖爆发和库特征变化 | 首次在单细胞水平上对早期B细胞发育进行深度转录组和免疫球蛋白库分析，发现了前B细胞阶段BCR重组后未描述的增殖爆发现象 | 研究仅基于六名健康供体，样本量相对有限，且未涵盖疾病状态或更广泛的个体差异 | 探究早期B细胞发育中转录组和免疫球蛋白库的演化规律，理解成熟免疫库多样性的形成基础 | 人类骨髓中的B细胞，包括从祖细胞到成熟B细胞的不同发育亚群 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 65,110个B细胞，来自六名健康供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-12-09 |
Spatiotemporal dynamics of neuron differentiation and migration in the developing human spinal cord
2025-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.08.004
PMID:40825501
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和原位测序技术，揭示了人类和小鼠脊髓发育过程中神经元分化和迁移的时空动态与调控机制 | 首次在人类脊髓发育的早期阶段（Carnegie Stages 16-21）系统描绘了神经元分化和迁移的时空动态，并识别了跨物种保守的关键转录因子 | 研究主要聚焦于胚胎发育的特定阶段（CS16-21/E8.0-11.5），未涵盖更晚期的发育或成熟过程 | 探究人类脊髓发育过程中神经元亚型特化和迁移的分子机制 | 人类和小鼠胚胎脊髓组织 | 单细胞组学 | 神经系统发育 | 单细胞转录组测序, 原位测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据 | 人类脊髓样本（CS16-21阶段）和小鼠脊髓样本（E8.0-11.5阶段） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 130 | 2025-12-08 |
FLT3LG as an inflammatory hub bridging tumor immune surveillance to therapy response in breast cancer
2025-Oct-29, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01889-4
PMID:41152656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和炎症基因网络分析，发现FLT3LG作为乳腺癌中关键的炎症枢纽，连接肿瘤免疫监视与治疗反应，并评估其作为预后和治疗靶点的潜力 | 首次基于单细胞RNA测序和炎症基因网络分析，将FLT3LG识别为乳腺癌中连接免疫监视与治疗反应的关键炎症枢纽，并揭示其与特定基因突变模式（如PIK3CA和TP53）及免疫检查点抑制剂反应的关联 | 研究主要基于相关性分析，缺乏直接的体内或体外功能验证实验来证实FLT3LG的因果作用机制 | 探索乳腺癌中炎症驱动的免疫失调机制，并寻找新的预后标志物和治疗靶点 | 乳腺癌患者队列及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，基因网络分析 | NA | RNA测序数据，基因表达数据 | 多个患者队列（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-12-08 |
Positionally distinct interferon-stimulated dermal immune-acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet syndrome
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.05.029
PMID:40516577
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了Sweet综合征皮肤中干扰素激活的成纤维细胞在促进中性粒细胞招募中的关键作用 | 首次在Sweet综合征中识别出位置不同的干扰素激活成纤维细胞亚群，并阐明其通过I型干扰素识别和趋化因子表达驱动中性粒细胞浸润的机制 | 研究基于存档临床样本，样本量有限；功能验证主要在体外细胞培养中进行，缺乏体内模型验证 | 阐明Sweet综合征的细胞和分子景观，特别是中性粒细胞浸润的机制 | Sweet综合征、坏疽性脓皮症患者及健康对照的皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | 转录组数据、空间定位数据 | 存档临床皮肤样本（Sweet综合征、坏疽性脓皮症患者及健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2025-12-07 |
Emerging Roles of Megakaryocytes in Immune Regulation and Potential Therapeutic Prospects
2025-Oct-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211677
PMID:41227322
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综述 | 本文综述了巨核细胞在传统血小板生成功能之外，在免疫调节、造血干细胞微环境调控以及应对病理生理刺激中的新兴作用 | 揭示了巨核细胞群体的显著异质性及其在止血、免疫和再生过程中的整合作用，并探讨了其作为治疗靶点在再生医学和免疫疗法中的潜力 | NA | 探讨巨核细胞在免疫调节中的新兴功能及其治疗应用前景 | 巨核细胞 | NA | NA | 成像技术，单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2025-12-07 |
Matrix stiffness induces endothelial network senescence
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.05.680536
PMID:41278992
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研究论文 | 本研究开发了一种三维人类模型，揭示了细胞外基质硬化通过机械应力诱导内皮细胞衰老的机制 | 开发了能够将机械应力与炎症或生化输入解耦的三维人类模型，首次证明在没有炎症信号的情况下，基质硬化可通过Notch-JNK-FOS信号轴诱导内皮细胞衰老表型 | 模型可能无法完全模拟体内复杂的微环境，临床样本仅限于合成乳房植入物患者的纤维化包膜组织 | 研究细胞外基质硬化如何通过机械应力驱动内皮细胞衰老，以理解组织功能衰退的机制 | 内皮细胞、三维人类内皮网络模型、患者纤维化包膜组织 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 三维人类模型 | 基因表达数据、组织样本 | 患者纤维化包膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2025-12-06 |
Identification of C1QA as a prognostic marker and regulator of immunosuppressive neutrophils in early-stage lung adenocarcinoma through integrated bioinformatics analyses
2025-Oct-31, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01881-y
PMID:41171372
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析，鉴定出C1QA是早期肺腺癌的预后标志物，并揭示了其通过调节免疫抑制性中性粒细胞影响肿瘤微环境的机制 | 首次在早期肺腺癌中系统性地将C1QA鉴定为与中性粒细胞丰度相关的关键枢纽基因，并利用单细胞RNA测序和细胞通讯分析阐明了其通过补体受体与中性粒细胞相互作用、驱动免疫抑制性肿瘤微环境的具体机制 | 研究主要基于公开的基因表达数据集和生物信息学分析，实验验证相对有限；结论需要在更大规模的独立队列和体内模型中进一步验证 | 探究早期肺腺癌中中性粒细胞的分子调控机制，并寻找相关的预后标志物和治疗靶点 | 早期肺腺癌患者样本、基因表达数据、中性粒细胞、巨噬细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、CIBERSORTx反卷积分析、RT-qPCR、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 基于公共数据集GSE31210等，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-12-05 |
Video - Visual Integration of Drosophila Enhancer Organization: A tool for integrating and visualizing chromatin accessibility, in vivo transcription factor binding and motif occurrence in tissue-specific differentially expressed genes
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684897
PMID:41279708
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研究论文 | 本文介绍了一个名为VIDEO的基于网络的分析工具，用于整合和可视化果蝇增强子组织中染色质可及性、转录因子结合及基序出现情况 | 开发了一个交互式工具，允许研究人员在组织特异性背景下探索转录因子结合基序如何与转录活性和染色质可及性相交 | NA | 开发一个工具以促进对组织特异性差异表达基因调控机制的理解 | 果蝇增强子组织、组织特异性差异表达基因 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 原位杂交, 微阵列, scRNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 136 | 2025-12-05 |
BASIN: Bayesian mAtrix variate normal model with Spatial and sparsIty priors in Non-negative deconvolution
2025-Oct-24, ArXiv
PMID:41281239
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研究论文 | 本文提出了一种名为BASIN的贝叶斯矩阵变量正态模型，用于空间转录组学中的细胞类型反卷积，通过结合空间和稀疏性先验来提高反卷积的准确性和效率 | BASIN首次将矩阵变量贝叶斯非负矩阵分解方法应用于细胞类型反卷积，通过保持变量矩阵形式推导更高效的矩阵正态后验，并提供不确定性量化 | 未明确说明模型在复杂组织或高噪声数据中的泛化能力，以及计算效率在大规模数据集上的具体表现 | 开发一种新的细胞类型反卷积方法，以从空间转录组学数据中推断细胞组成 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2025-12-05 |
Sepsis Induces Age- and Sex-Specific Chromatin Remodeling in Myeloid-Derived Suppressor Cells
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.26.656229
PMID:41279791
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研究论文 | 本研究利用单分子表观遗传学技术揭示了脓毒症后骨髓源性抑制细胞（MDSCs）中与年龄和性别相关的染色质重塑机制 | 首次使用MAPit-FENGC单分子技术同时分析DNA甲基化和染色质可及性，构建了脓毒症后MDSCs的高分辨率表观遗传图谱，并揭示了年龄和性别特异性的染色质动态变化 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证；样本量相对有限 | 阐明脓毒症幸存者长期免疫功能障碍的表观遗传机制 | 骨髓源性抑制细胞（MDSCs） | 表观遗传学 | 脓毒症 | MAPit-FENGC（单分子DNA甲基化和染色质可及性分析），单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 表观遗传数据，转录组数据 | 年轻和年老成年雄性和雌性小鼠的脾脏MDSCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2025-12-05 |
A lifespan transcriptomic atlas of the human prefrontal cortex at single-cell resolution
2025-Oct-06, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.11.06.24316592
PMID:41282859
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研究论文 | 本研究构建了人类背外侧前额叶皮层（DLPFC）的首个跨生命周期的单细胞核转录组图谱，揭示了其细胞和分子程序随年龄变化的动态规律 | 首次构建了覆盖人类完整生命周期（0-97岁）的DLPFC单细胞核转录组图谱，识别了三个不同的转录组阶段和十种年龄相关轨迹，并发现了成年晚期神经元核心生物钟节律丧失与胶质细胞应激适应性节律出现的新现象 | 研究基于死后样本，可能无法完全反映活体组织的动态过程；样本量虽大但个体差异可能影响部分结论的普适性 | 绘制人类前额叶皮层跨生命周期的细胞和分子图谱，以理解大脑发育、衰老及疾病易感性的基础 | 人类背外侧前额叶皮层（DLPFC） | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞核RNA测序，空间转录组学 | 非线性建模，伪时间分析 | 转录组数据，空间基因表达数据 | 284例死后样本，超过130万个细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 139 | 2025-12-05 |
Acellular Tissue Engineered Vessels as Coronary Artery Bypass Grafts
2025-Oct, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2025.101379
PMID:40939573
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研究论文 | 本研究评估了一种小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的可行性和耐久性 | 首次在灵长类动物模型中评估小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的长期性能，并利用空间转录组学揭示了宿主细胞浸润对血管重塑的调控机制 | 研究样本量较小（n=5），仅评估了6个月的短期效果，未与传统自体血管进行直接比较 | 开发冠状动脉旁路移植术的替代血管移植物 | 成年狒狒的冠状动脉系统 | 组织工程 | 心血管疾病 | 空间转录组学，计算机断层扫描血管造影 | NA | 影像数据，基因表达数据，组织学数据 | 5只成年狒狒 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2025-12-04 |
Coxiella burnetii Strains Elicit Distinct Inflammatory Responses in Human Macrophages
2025-Oct-29, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens14111101
PMID:41305339
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了不同毒力的贝氏柯克斯体菌株在人巨噬细胞中引发差异化的炎症反应和极化状态 | 首次系统比较了不同毒力贝氏柯克斯体菌株在人肺泡巨噬细胞和THP-1细胞中引发的宿主转录组反应异质性，并揭示了菌株特异性和细胞特异性因素在塑造宿主免疫中的重要性 | 研究主要基于体外细胞模型，未在动物模型或临床样本中验证；单细胞RNA测序仅针对NMII菌株感染的THP-1细胞 | 阐明贝氏柯克斯体不同菌株与宿主巨噬细胞相互作用的分子机制，为Q热的靶向治疗提供依据 | 人肺泡巨噬细胞(hAMs)和THP-1巨噬细胞系 | 感染免疫学 | Q热 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 细胞因子检测 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用人肺泡巨噬细胞和THP-1细胞系进行感染实验 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |