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当前共找到 591 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-29 |
IGF1R deficiency mitigates acute lung injury by promoting anti-inflammatory transcriptional profiles
2025-Oct-22, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03339-x
PMID:41126254
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示IGF1R缺陷通过调控转录和表观遗传特征减轻急性肺损伤 | 首次系统阐明IGF1R缺陷通过调节细胞因子风暴、DNA损伤、代谢重编程和表观遗传调控等多重机制缓解急性肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；未涉及临床治疗应用 | 探究IGF1R在急性肺损伤发病机制中的作用及潜在治疗价值 | 人类COVID-19患者肺组织、小鼠肺组织、原代小鼠胚胎成纤维细胞 | 生物医学研究 | 急性肺损伤/COVID-19 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质检测, DNA损伤评估, 甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 表观遗传数据 | 人类COVID-19病例和对照捐赠者肺组织、博来霉素诱导的Igf1r缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-11-29 |
Transcriptomic Profiling of Bronchial Epithelium Reveals Dysregulated Interferon and Inflammatory Responses to Rhinovirus in Exacerbation-Prone Pediatric Asthma
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.19.683298
PMID:41279354
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示易急性发作儿童哮喘患者支气管上皮细胞对鼻病毒感染的干扰素和炎症反应失调机制 | 首次在器官型支气管上皮培养模型中结合bulk和单细胞转录组学，揭示易急性发作哮喘儿童存在基线干扰素应答低下和病毒感染后反应过度现象 | 研究样本量有限，且为体外培养模型，需在更大队列和体内模型中验证 | 阐明鼻病毒诱发哮喘急性发作的宿主易感性机制 | 哮喘儿童和健康儿童的器官型支气管上皮细胞培养物 | 转录组学 | 哮喘 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 靶向蛋白分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 特征明确的哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2025-11-29 |
Entrywise splitting cross-validation in generalized factor models: from sample splitting to entrywise splitting
2025-Oct-08, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf153
PMID:41311195
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研究论文 | 本文提出了一种基于条目分割的交叉验证方法，用于确定广义因子模型中的因子数量 | 提出条目分割而非样本分割的交叉验证方法，并引入带惩罚项的条目分割交叉验证准则 | NA | 解决广义因子模型中因子数量确定的挑战 | 广义因子模型和因子数量确定方法 | 机器学习 | NA | 交叉验证，信息理论准则 | 广义因子模型 | 多元数据（包括二元选择、计数和连续观测值） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-11-28 |
Exploring microRNAs, One Cell at a Time
2025-Oct-22, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna11060073
PMID:41283328
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研究论文 | 本文探讨了单细胞水平下microRNA的分析工具与计算方法 | 开发了分析细胞特异性miRNA丰度的实验工具和计算方法 | NA | 揭示miRNA生物学的复杂性，增进对生命科学和疾病的理解 | microRNAs（miRNAs） | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-11-28 |
Comprehensive profiling of transcription factors for reprogramming human astrocytes to neuronal cells through endogenous CRISPR-based gene activation
2025-Oct-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.11.681828
PMID:41278743
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研究论文 | 本研究建立了基于CRISPR激活的方法，通过高通量筛选鉴定转录因子，将人类星形胶质细胞重编程为神经元细胞 | 首次使用CRISPRa技术对人类所有转录因子编码基因进行系统性筛选，发现单个转录因子即可诱导星形胶质细胞向多种神经元亚型分化 | NA | 鉴定能够将人类星形胶质细胞重编程为神经元细胞的高效转录因子 | 人类原代星形胶质细胞 | 基因编辑与细胞重编程 | 神经退行性疾病 | CRISPR激活(CRISPRa), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-11-27 |
Cross-expression meta-analysis of mouse brain slices reveals coordinated gene expression across spatially adjacent cells
2025-Oct-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03747-8
PMID:41163012
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研究论文 | 本研究提出“交叉表达”概念，通过整合多个小鼠大脑数据集构建元分析网络，揭示相邻细胞间基因表达的协调模式 | 引入“交叉表达”新概念，无需细胞类型标签或预定义数据库即可分析相邻细胞间基因表达协调性 | 方法依赖于基因表达和细胞位置矩阵的准确性，未考虑细胞间直接通讯机制 | 研究空间相邻细胞间基因表达的协调机制 | 小鼠大脑切片中的细胞 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组学，元分析 | 交叉表达网络 | 基因表达数据，空间位置数据 | 约2500万个细胞，695个切片，52个大脑 | 多种技术平台 | 空间转录组学 | 多种技术 | 8种不同技术平台的数据集 |
| 87 | 2025-11-27 |
Spatial transcriptomics of glioblastoma defines biologically and clinically significant reprogramming patterns across unique spatial microenvironments
2025-Oct-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683110
PMID:41279756
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析胶质母细胞瘤的空间微环境，揭示其生物学重编程模式和细胞间相互作用 | 开发了空间信息整合方法，将基因共表达网络模块与细胞通讯变化相结合，提供了首个包含14个样本的Visium空间转录组数据集 | 样本量相对有限(14个样本)，研究聚焦于特定空间区域(Ivy GBM Atlas Project区域) | 解析胶质母细胞瘤的空间异质性及其对肿瘤行为和治疗反应的影响 | 胶质母细胞瘤组织样本及其空间微环境 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 基因共表达网络分析 | 空间转录组数据 | 14个胶质母细胞瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组技术 |
| 88 | 2025-11-27 |
Gsx2 Regulates Oligodendrocyte Precursor Formation in the Zebrafish Spinal Cord
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.18.683250
PMID:41279990
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术发现Gsx2基因在斑马鱼脊髓中调控少突胶质前体细胞形成的机制 | 首次在斑马鱼脊髓中发现pre-OPCs亚群，并证实Gsx2基因通过调控基因网络影响OPC形成时机 | 研究仅限于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物中验证 | 探究Gsx2基因在少突胶质前体细胞形成过程中的调控机制 | 斑马鱼脊髓神经前体细胞和少突胶质前体细胞 | 发育生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 89 | 2025-11-27 |
Clinical Interventions and Inflammatory Signaling Shape the Transcriptional and Cellular Architecture of the Early Postnatal Lung
2025-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683116
PMID:41278997
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研究论文 | 通过单细胞测序构建早期出生后人类肺部细胞图谱，揭示肺泡2型细胞的两种新转录状态及其与炎症信号和临床干预的关联 | 首次发现肺泡2型细胞存在两种互斥的转录状态，并证明炎症信号和抗炎药物可调控这些状态的平衡 | 样本量相对有限（23例），仅涵盖0-2岁年龄段 | 解析早期出生后人类肺部的细胞结构和转录调控机制 | 人类早期出生后肺部组织（0-2岁） | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 23例组织学正常样本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 90 | 2025-11-27 |
C. elegans astrocytes mature in two phases from lineally distinct progenitors through CEH-43/DLX-mediated convergent transcription
2025-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.682973
PMID:41279325
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研究论文 | 本研究通过谱系限制性单细胞RNA测序揭示了线虫CEPsh星形胶质细胞的两阶段发育程序 | 发现星形胶质细胞从谱系和转录不同的祖细胞通过CEH-43介导的趋同转录分化为相同类型 | 研究仅限于线虫模型，哺乳动物中的直接验证尚不充分 | 揭示星形胶质细胞分化的基因调控程序 | 秀丽隐杆线虫CEPsh星形胶质细胞及其祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-11-26 |
Spatial analysis reveals the cellular microenvironments and mechanisms of inflammation and kidney injury in acute interstitial nephritis
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.29.684811
PMID:41278888
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研究论文 | 通过空间分析技术揭示急性间质性肾炎中细胞微环境、炎症机制和肾损伤的分子通路 | 首次使用高分辨率成像质谱流式和单细胞空间转录组学识别CXCL9-CXCR3轴为AIN的特异性免疫特征，并发现烟酰胺磷酸核糖转移酶协调代谢-炎症微环境 | 研究样本仅限于人类肾活检组织，样本量未明确说明 | 阐明急性间质性肾炎的发病机制并识别潜在治疗靶点 | 人类肾活检组织（包括AIN、非免疫性急性肾小管损伤和参考组织） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 成像质谱流式技术, 单细胞空间转录组学 | NA | 空间蛋白质组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 成像质谱流式 | NA | NA |
| 92 | 2025-11-26 |
Subclinical Fields of BRAF V600E-Mutant Melanocytes Populate Human Skin and Are Enriched Around Melanoma and Naevi
2025-Oct-28, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf412
PMID:41148046
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研究论文 | 本研究在黑色素瘤高风险人群的正常皮肤中发现普遍存在BRAF V600E突变黑色素细胞亚临床区域 | 首次证实正常皮肤中存在BRAF V600E突变黑色素细胞区域，这些区域在肿瘤邻近皮肤中密度更高、频率更高 | 样本主要来自高风险澳大利亚人群，样本量为97例 | 确定BRAF V600E突变黑色素细胞是否常见于高风险成人非病变皮肤 | 高风险澳大利亚黑色素瘤队列的非病变皮肤样本及新生儿包皮来源的黑色素母细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 免疫组织化学,液滴数字PCR,单细胞RNA测序 | NA | 组织切片,基因表达数据 | 97例非病变皮肤样本及新生儿包皮黑色素母细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-11-26 |
Cardiomyocyte-specific plakophilin-2 loss is sufficient to induce aging and senescence of nonmyocytes. Relevance to arrhythmogenic cardiomyopathy
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.22.682160
PMID:41279511
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研究论文 | 本研究通过心肌细胞特异性PKP2敲除模型，首次证实仅心肌细胞中plakophilin-2缺失足以诱导非心肌细胞衰老和心脏整体早衰 | 首次将细胞衰老和早衰机制与桥粒性心律失常心肌病相关联，揭示了心肌细胞基因缺陷通过旁分泌机制引发非心肌细胞衰老的新路径 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；衰老机制的具体信号通路尚未完全阐明 | 探究PKP2缺陷是否仅通过心肌细胞即可引发非心肌细胞衰老和心脏早衰 | 心肌细胞特异性PKP2敲除小鼠模型中的心肌细胞和非心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心律失常性心肌病 | 多重成像、细胞因子阵列、表观遗传时钟、空间转录组学、扩展显微镜、结构照明显微镜 | 基因敲除小鼠模型 | 图像、转录组、蛋白质组、表观遗传数据 | PKP2cKO小鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | 空间转录组学、多重免疫组化 | NA | NA |
| 94 | 2025-11-26 |
Glutamine synthetase loss in β-catenin-mutant hepatocellular carcinoma promotes tumor burden through macrophage metabolic reprogramming
2025-Oct-23, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001591
PMID:41129335
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研究论文 | 本研究探讨β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失如何通过巨噬细胞代谢重编程促进肿瘤负荷 | 首次揭示肿瘤细胞GS缺失后巨噬细胞通过代谢适应维持mTOR激活的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 阐明β-连环蛋白突变肝癌中谷氨酰胺合成酶缺失对肿瘤进展的影响机制 | 肝细胞癌小鼠模型和TCGA数据库中的肝癌患者数据 | 癌症代谢研究 | 肝细胞癌 | 单细胞空间转录组学，基因条件性敲除，巨噬细胞清除 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据，组织学数据 | TCGA数据库中的CTNNB1突变肝癌患者和小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 95 | 2025-11-26 |
Modeling Alzheimer's Disease with APOE4 Neuron-Glial Brain Assembloids Reveals IGFBPs as Therapeutic Targets
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683162
PMID:41279729
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研究论文 | 本研究开发了一种模拟阿尔茨海默病的3D脑类组装体模型，揭示了IGFBP通路在疾病进展中的新作用 | 首次创建包含神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞的3D类组装体模型，能够完整模拟阿尔茨海默病病理特征 | 模型仍需进一步验证其与人类疾病进展的完全一致性 | 开发能够准确模拟阿尔茨海默病进展的人类遗传背景模型，并探索治疗靶点 | iPSC来源的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 疾病建模 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，iPSC分化技术 | 3D类组装体模型 | 基因表达数据 | APOE4/4和同基因对照细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-11-26 |
Activated fatty acid synthesis pathway in macrophages propagates pathogenic fibroblast expansion after myocardial infarction
2025-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.10.681697
PMID:41279812
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研究论文 | 本研究揭示心肌梗死后巨噬细胞中脂肪酸合成通路通过ACLY和FASN促进致病性成纤维细胞扩增的机制 | 首次发现心脏巨噬细胞通过脂肪酸合成通路调控成纤维细胞扩增，并阐明ACLY通过乙酰化调控促纤维化细胞因子IL-33产生的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究巨噬细胞脂肪酸合成通路在心肌梗死后炎症和心脏重塑中的作用 | 心肌梗死小鼠模型和人类心脏样本中的巨噬细胞与成纤维细胞 | 代谢组学与单细胞生物学 | 心血管疾病 | 空间代谢组学,CUT&RUN,RNA测序,单细胞RNA测序,空间多组学 | 基因敲除小鼠模型 | 代谢组数据,基因组数据,转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间多组学 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-26 |
ST2HE: A Cross-Platform Framework for Virtual Histology and Annotation of High-Resolution Spatial Transcriptomics Data
2025-Oct-13, ArXiv
PMID:41281202
|
研究论文 | 提出ST2HE跨平台生成框架，能够从高分辨率空间转录组数据直接合成虚拟H&E图像 | 首次开发了基于一步扩散模型的跨平台框架，整合细胞核形态和空间转录坐标生成组织学忠实的虚拟H&E图像 | NA | 为高分辨率空间转录组数据开发标准化的组织学注释框架 | 乳腺癌、非小细胞肺癌和卡波西肉瘤组织样本 | 计算病理学 | 多种癌症 | 空间转录组学 | 扩散模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 高分辨率空间转录组学 | NA | NA |
| 98 | 2025-11-26 |
Transposable Elements and Homotypic Niches Drive Immune Dynamics and Resistance in Melanoma Epigenetic-based immunotherapy
2025-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.09.679175
PMID:41278906
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学和高分辨率空间转录组学分析，揭示了表观遗传免疫疗法如何重塑黑色素瘤生态系统 | 发现转座子元件激活和同型生态位驱动免疫动态，识别NFATC2作为神经嵴样表型的主调控因子和耐药促进因子 | 样本来源于单一临床试验队列，需要更大规模验证 | 探索表观遗传免疫疗法对黑色素瘤生态系统重塑的机制 | 黑色素瘤患者纵向活检样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 单细胞多组学，空间转录组学 | 空间建模 | 单细胞多组学数据，空间转录组数据 | NIBIT-M4临床试验患者纵向活检样本 | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2025-11-26 |
Nutritional hyperketonemia by dietary medium-chain fatty acids is driven by the liver without contribution from the intestine
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681190
PMID:41279942
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型和细胞实验证明膳食中链脂肪酸诱导的营养性高酮血症主要由肝脏介导，肠道几乎不参与此过程 | 首次明确区分肝脏和肠道在膳食中链脂肪酸诱导酮体生成中的具体作用，挑战了通过门静脉代谢物测量推断肠道贡献的常规做法 | 研究主要聚焦于C8:0中链脂肪酸，其他类型中链脂肪酸的作用尚未验证；细胞实验可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明膳食中链脂肪酸诱导营养性高酮血症的主要器官来源 | 基因敲除小鼠、原代肝细胞、人和小鼠肠道细胞系 | 代谢研究 | 代谢疾病 | RNA测序、细胞培养、代谢物测量 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、代谢物浓度数据 | 多种基因型小鼠、原代细胞和细胞系 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2025-11-26 |
SpaGene: A Deep Adversarial Framework for Spatial Gene Imputation
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.03.680242
PMID:41278680
|
研究论文 | 提出一种名为SpaGene的深度学习框架，用于整合单细胞RNA测序和空间转录组数据以填补空间基因表达缺失 | 采用包含两个编码器-解码器对、两个翻译器和两个判别器的深度对抗框架，实现空间转录组数据中缺失基因表达的有效填补 | NA | 整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，提升空间基因表达数据的完整性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 深度学习, 对抗生成网络 | 基因表达数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |