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当前共找到 591 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-12-02 |
Psychological stress and social support are associated with opposing single-cell pro-inflammatory gene regulatory mechanisms in adults
2025-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.14.682318
PMID:41278935
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性分析，探讨了心理压力和社会支持对非洲裔美国成年人外周血单个核细胞中基因调控的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了心理压力和社会支持对免疫基因调控的相反作用机制，特别是通过干扰素信号通路和转录因子活性变化 | 研究样本仅包括非洲裔美国成年人，年龄范围较窄（50-89岁），可能限制了结果的普遍性 | 探究心理压力和社会支持如何影响免疫系统的基因调控机制，以理解其与慢性炎症的关联 | 165名自报非洲裔美国成年人（年龄50-89岁）的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 慢性炎症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞基因表达数据，单细胞染色质可及性数据 | 165名非洲裔美国成年人 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-12-02 |
Innovations in spinal cord cell type heterogeneity across vertebrate evolution
2025-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.09.680955
PMID:41279330
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研究论文 | 本研究通过比较鱼类、蛙类、小鼠和人类的脊髓细胞类型，揭示了脊椎动物进化过程中脊髓细胞类型异质性的保守与分化模式 | 首次跨物种比较脊椎动物脊髓细胞类型图谱，发现发育阶段细胞类型高度保守，而成年阶段兴奋性神经元亚群出现物种特异性分化，并定位到哺乳动物特有的背侧脊髓感觉整合中枢 | 研究主要基于转录组数据，缺乏功能验证；物种覆盖范围有限（仅四种代表性物种）；空间转录组分辨率仍有提升空间 | 探究脊椎动物脊髓细胞类型在进化过程中的保守性与多样性，解析运动控制回路的进化起源 | 鱼类、蛙类、小鼠和人类的脊髓组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 跨四个物种（鱼类、蛙类、小鼠、人类）的脊髓样本，涵盖约4.5亿年进化历程 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2025-12-02 |
Comprehensive benchmarking of somatic mutation detection by the SMaHT Network
2025-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.09.678885
PMID:41279200
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研究论文 | SMaHT网络通过四项大规模基准实验，评估了检测体细胞突变的测序技术、实验方法和计算策略 | 整合短读长和长读长测序、使用供体特异性组装和人类泛基因组，并比较了六种双链测序技术，展示了单细胞测序在解析细胞类型特异性突变模式方面的优势 | 未明确提及具体的技术限制或样本多样性不足等问题 | 评估和优化体细胞突变检测的技术与方法，以实现准确、全基因组的体细胞突变发现和分析 | 体细胞突变检测的测序技术、实验方法和计算策略 | 基因组学 | NA | 短读长测序、长读长测序、双链测序、单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | 九个分析样本 | NA | 单细胞测序、双链测序、短读长测序、长读长测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-12-02 |
Ex Vivo Expanded Regulatory T Cells Inhibit AAA Progression by Limiting CD4+ and CD8+ T Cell Accumulation in Aortic Tissue
2025-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681290
PMID:41279653
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞（Tregs）在腹主动脉瘤（AAA）进展中的作用，通过小鼠模型验证Treg疗法能通过限制CD4+和CD8+ T细胞在主动脉组织中的积累来抑制AAA发展 | 利用单细胞RNA测序数据识别T细胞在AAA中的关键作用，并通过同种移植Tregs到AAA诱导小鼠中，揭示Tregs通过定位于引流淋巴结而非主动脉微环境来减少促炎细胞浸润，从而抑制AAA进展 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；Tregs在主动脉微环境中未被检测到，其具体作用机制需进一步探索；临床转化潜力尚未在人体试验中验证 | 研究Tregs在AAA进展中的具体机制，探索Treg疗法作为早期AAA治疗策略的潜力 | 人类和小鼠AAA单细胞RNA测序数据、AAA诱导的野生型C57BL/6J小鼠、Thy1.1等位基因供体小鼠的Tregs | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、qRT-PCR、Verhoeff-van Gieson染色、苏木精-伊红染色、免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、图像数据、流式细胞数据 | 使用小鼠模型，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2025-12-02 |
Integrated single-cell whole genome sequencing and spatial transcriptomics reveal latent intra-tumoral heterogeneity in ovarian cancer
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.676897
PMID:41279090
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞全基因组测序和空间转录组学技术，揭示了卵巢癌中潜在的肿瘤内异质性 | 首次结合单细胞全基因组测序与空间转录组学，系统分析卵巢癌的细胞、克隆和亚克隆水平异质性，并关联组织病理学和基因表达程序 | 研究仅基于五个上皮性卵巢癌样本，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探究卵巢癌的肿瘤内异质性及其对疾病复发和治疗失败的影响 | 五个上皮性卵巢癌样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 | 5个上皮性卵巢癌样本 | NA | 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-12-02 |
Single-Cell Profiling of HDAC Inhibitor-Induced EBV Lytic Heterogeneity Defines Abortive and Refractory States in B Lymphoblasts
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.09.681362
PMID:41279324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了HDAC抑制剂在EBV阳性B淋巴细胞中诱导的裂解异质性，定义了流产和耐药状态 | 首次在单细胞水平上揭示了HDAC抑制剂诱导EBV裂解反应的异质性，并识别了流产裂解细胞中NF-κB通路和免疫信号基因的上调 | 研究仅基于四种EBV阳性细胞系，且裂解反应仅在少数细胞中成功，可能限制了结果的普遍性 | 探究HDAC抑制剂对EBV阳性恶性肿瘤细胞裂解反应的影响，并阐明宿主因子在阻止成功裂解中的作用 | 四种EBV阳性细胞系：P3HR1-ZHT BL、Jijoye BL、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和感染衍生的淋巴母细胞系 | 单细胞组学 | EBV相关恶性肿瘤（如伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四种EBV阳性细胞系，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-12-02 |
Epicardial contributions to fibro-inflammatory signaling in a Pkp2-deficient arrhythmogenic cardiomyopathy model
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.680826
PMID:41279609
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研究论文 | 本研究通过构建Pkp2缺陷小鼠模型，探究了心外膜来源细胞在致心律失常性心肌病中纤维炎症信号传导的作用 | 首次在单细胞水平揭示了Pkp2缺陷导致心外膜来源成纤维细胞获得衰老相关分泌表型，并阐明了B细胞在疾病早期炎症和纤维化反应中的作用 | 研究基于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需谨慎；B细胞耗竭仅延迟早期反应，未显著改变终末期心脏生理 | 探究Pkp2缺陷在心外膜来源细胞中对致心律失常性心肌病纤维炎症信号传导和发病机制的贡献 | 转基因小鼠（Pkp2-cKO和Pkp2-ceKO模型）及其心脏组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，流式细胞术，qRT-PCR，超声心动图 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据，定量PCR数据，生理测量数据 | 转基因小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2025-12-02 |
Targeting tumor-intrinsic TAK1 triggers anti-tumor immunity and sensitizes pancreatic cancer to checkpoint blockade
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681226
PMID:41280086
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研究论文 | 本文发现TAK1是胰腺导管腺癌中维持基因组完整性的关键介质，并揭示其作为治疗靶点可诱导炎症性肿瘤微环境，使PDAC对免疫检查点阻断敏感 | 首次将TAK1鉴定为胰腺癌中与T细胞功能障碍相关的异常激活激酶，并阐明其通过磷酸化EphA2和RAD51调控DNA修复和cGAS-STING通路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床验证尚需进一步开展 | 探索逆转胰腺癌免疫抑制微环境的新治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫组化、蛋白质组学 | 基因工程小鼠模型（GEMM） | 测序数据、图像数据、蛋白质数据 | 人类PDAC样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-12-02 |
Optimal Gene Panel Selection for Targeted Spatial Transcriptomics Experiments
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681071
PMID:41279853
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ReconST的新方法，用于自动设计空间转录组学分析中的最优基因面板 | ReconST利用现有scRNA-seq数据，通过门控自编码器识别最优基因子集，在重建准确性和空间模式保留方面优于现有方法 | NA | 优化基因面板选择以最大化空间转录组学分析的效用 | 基因面板设计 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析，scRNA-seq | 门控自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2025-12-02 |
Accelerating scRNA-seq Analysis: Automated cell type annotation using representation learning and vector search
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680787
PMID:41279915
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研究论文 | 本文介绍了一种基于表示学习和向量搜索的自动化细胞类型注释服务，用于加速单细胞RNA测序分析 | 采用反向搜索方法，避免依赖预定义标记基因或组织特异性参考，提供细粒度和粗粒度注释 | NA | 自动化单细胞RNA测序中的细胞类型注释，以提高分析速度和准确性 | 10x Genomics单细胞基因表达样本中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 表示学习 | 基因表达谱数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 71 | 2025-12-02 |
SpaDiff: Denoising for Sequence-based Spatial Transcriptomics via Diffusion Process
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.07.681011
PMID:41280001
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaDiff的去噪方法，用于处理基于序列的空间转录组学数据中的spot-swapping噪声 | 将spot-swapping噪声建模为扩散过程，并模拟RNA分子的位移以逆转噪声，从而恢复原始空间分布 | NA | 提高空间转录组学数据的空间特异性和数据完整性 | 空间转录组学数据中的RNA分子 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 扩散过程模型 | 序列数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2025-12-02 |
Multi-omics analysis identifies S100a10/Anxa2 complex within proximal tubule aggravates acute kidney injury through p-Stat3/Spp1 signaling
2025-Oct, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2025.11.003
PMID:41265636
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研究论文 | 通过多组学分析发现S100a10/Anxa2复合物在近端小管内通过p-Stat3/Spp1信号通路加剧急性肾损伤 | 首次结合bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学技术，系统性地识别了S100a10/Anxa2复合物在AKI中的作用，并通过实验验证了其通过p-Stat3/Spp1信号通路调控AKI的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中进行验证，且具体信号通路的上下游调控细节有待进一步探索 | 探究急性肾损伤（AKI）的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 小鼠肾脏组织，特别是近端小管上皮细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, ChIP-seq | NA | RNA-seq数据, 空间转录组数据, ChIP-seq数据 | 未明确指定样本数量，但涉及对照组和AKI模型组 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2025-12-01 |
Investigating the Effects of Long-Term Fine Particulate Matter Exposure on Autism Spectrum Disorder Severity: Evidence from Multiple Analytical Approaches
2025-Oct-28, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics13110922
PMID:41304474
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研究论文 | 本研究通过多种分析方法探讨长期细颗粒物暴露与自闭症谱系障碍严重程度之间的关联及其潜在机制 | 采用全球疾病负担数据与孟德尔随机化相结合的分析方法，结合网络毒理学、单细胞转录组学和动物实验，首次系统揭示PM暴露通过神经炎症激活加剧ASD症状的分子机制 | 存在多种潜在混杂因素如其他污染物共同暴露和社会经济变量未完全控制，需要在更大更多样化的群体中进一步验证 | 探索长期PM暴露与ASD症状恶化的关联及其作用机制 | 自闭症谱系障碍患者和动物模型 | 环境健康与神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 孟德尔随机化, 网络毒理学, 单细胞转录组学, 动物实验 | NA | 流行病学数据, 环境监测数据, 基因表达数据, 行为学数据 | 基于全球疾病负担数据和中国高分辨率空气污染数据库的队列研究 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 74 | 2025-12-01 |
StomachDB: An Integrated Multi-Omics Database for Gastric Diseases
2025-Oct-24, Biology
DOI:10.3390/biology14111484
PMID:41300276
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研究论文 | 开发了首个专注于胃部疾病的综合多组学数据库StomachDB | 首个专注于胃部疾病的综合多组学数据库，整合了6种生物数据类型 | NA | 增强胃部疾病的诊断和治疗理解 | 44种胃部相关病理，包括胃癌、胃溃疡和胃炎 | 生物信息学 | 胃部疾病 | 多组学整合分析 | NA | 基因组学、转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | 约250万个标准化数据文件和268,394个疾病-基因关联 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学整合 | NA | NA |
| 75 | 2025-12-01 |
Attention-Guided Probabilistic Diffusion Model for Generating Cell-Type-Specific Gene Regulatory Networks from Gene Expression Profiles
2025-Oct-24, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16111255
PMID:41300707
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研究论文 | 提出一种基于扩散模型的深度学习框架Planet，用于从单细胞RNA测序数据生成细胞类型特异性基因调控网络 | 采用三重混合注意力Transformer捕获长程调控依赖关系，并引入快速采样策略加速推理过程 | 与DigNet方法相比在可比条件下仅实现轻微性能提升 | 构建具有全局一致性的细胞特异性基因调控网络 | 小鼠肺Cd8Gzmk T细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 扩散模型, Transformer | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2025-12-01 |
An ApiAP2 Family Transcriptional Factor PfAP2-06B Regulates Erythrocyte Invasion Indirectly in Plasmodium falciparum
2025-Oct-22, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens14111076
PMID:41305314
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研究论文 | 本研究揭示了疟原虫ApiAP2家族转录因子PfAP2-06B通过调控入侵相关基因间接调节红细胞入侵过程 | 首次发现PfAP2-06B转录因子通过调节入侵相关基因表达间接影响疟原虫红细胞入侵，并揭示了其在细胞间基因表达随机变异中的作用 | 未明确PfAP2-06B具体调控的下游靶基因网络及其直接作用机制 | 探究PfAP2-06B转录因子在疟原虫红细胞内发育周期中对红细胞入侵过程的调控作用 | 恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)及其红细胞入侵过程 | 分子生物学 | 疟疾 | 条件性基因敲低, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-11-30 |
Tumor-intrinsic MHC-II activation in pancreatic ductal adenocarcinoma enhances immune response and treatment efficacy
2025-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.21.683745
PMID:41278823
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研究论文 | 本研究探讨胰腺导管腺癌中恶性细胞固有MHC-II表达对免疫微环境和治疗效果的调控作用 | 首次系统揭示恶性细胞固有MHC-II表达在PDAC中的预后价值及其通过增强抗原呈递促进抗肿瘤免疫的机制 | 研究主要基于临床前模型，需要在更大规模的人类队列中验证 | 探究MHC-II在PDAC恶性细胞中的表达特征及其对免疫治疗疗效的影响 | 人类PDAC样本和KPC小鼠PDAC模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重免疫组织化学,体外培养实验 | NA | 基因表达数据,空间定位数据,组织切片图像 | 人类PDAC样本和KPC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-11-30 |
Identification of Apically Localized Endogenous Dental Pulp Stem Cells
2025-Oct-18, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251378094
PMID:41108143
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和谱系追踪技术识别了小鼠磨牙根尖定位的内源性Axin2+牙髓干细胞 | 首次在牙根尖部位发现内源性Axin2+牙髓干细胞，并揭示其在牙髓组织形成和损伤修复中的动态过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类牙髓干细胞的特性和行为可能存在差异 | 探索牙髓干细胞在牙髓和牙本质再生中的原位作用机制 | 小鼠磨牙牙髓组织和根尖乳头组织 | 干细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞转录组学，谱系追踪 | NA | 基因表达数据，细胞谱系数据 | 小鼠磨牙组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-11-30 |
Age- and Sex- Driven Transcriptional and Metabolic Diversity in Myeloid-Derived Suppressor Cells After Mouse Sepsis
2025-Oct-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680736
PMID:41278644
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了年龄和性别对脓毒症诱导的髓源性抑制细胞转录组和代谢状态的显著影响 | 首次在单细胞水平系统揭示年龄和性别因素对脓毒症中MDSC转录组和代谢状态的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明年龄和性别因素如何影响脓毒症诱导的髓源性抑制细胞生物学特性 | 年轻和老年雄性和雌性小鼠的脾脏白细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻组(3-4个月)和老年组(18-24个月)雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-11-29 |
Single-cell transcriptomics reveals dynamics of natural killer cell expansion in a feeder cell-free culture of peripheral blood mononuclear cells-implications for immunotherapy
2025-Oct-25, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2025.10.004
PMID:41308233
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了在无饲养细胞的外周血单个核细胞培养中自然杀伤细胞扩增的动态过程及其对免疫治疗的意义 | 首次在无饲养细胞培养系统中使用单细胞转录组学技术追踪NK细胞扩增过程，识别了影响供体间变异性的关键因素和潜在生物标志物 | 研究仅包含三个供体样本，样本量较小，限制了结果的普遍适用性 | 识别影响供体外周血单个核细胞体外扩增NK细胞过程中供体间变异性的因素 | 来自三个供体的外周血单个核细胞在体外培养的NK细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞转录组测序 | 轨迹推断，差异基因表达分析 | 单细胞RNA测序数据 | 3个供体的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |