单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202510-202510] [清除筛选条件]
当前共找到 592 篇文献,本页显示第 41 - 60 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-04-18
Single-cell transcriptomic and genomic changes in the ageing human brain
2025-10, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组测序、单细胞全基因组测序和空间转录组学技术,揭示了人类前额叶皮层从婴儿期到百岁老人期的基因表达和基因组变化 首次结合单细胞转录组、单细胞全基因组和空间转录组学技术,全面解析人类大脑衰老过程中的细胞特异性变化和突变特征 研究主要聚焦于前额叶皮层,可能无法代表整个大脑的衰老模式;样本年龄范围虽广,但具体样本数量未明确说明 探究人类大脑衰老过程中的转录组和基因组动态变化 人类前额叶皮层细胞 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序, 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 单细胞基因组数据, 空间转录组数据 从婴儿到百岁老人的多个年龄段人类前额叶皮层样本 NA 单细胞RNA测序, 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 NA NA
42 2026-04-15
Amoeboid-Mesenchymal Transition and the Proteolytic Control of Cancer Invasion Plasticity
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了癌症细胞在侵袭过程中通过阿米巴-间质转化和蛋白水解控制来调节侵袭可塑性的机制 意外发现阿米巴型和间质型侵袭程序均涉及通过ECM屏障的主动隧道形成和基质降解金属蛋白酶的表达,并强调MMP14在维持核完整性和支持侵袭活性中的关键作用 研究主要基于癌症球体-3D基质模型、单细胞RNA测序和人组织外植体,可能无法完全模拟体内复杂微环境 探究控制间质与阿米巴侵袭的机制,特别是MMP14在癌症侵袭可塑性中的角色 癌症细胞,包括在3D基质模型和人乳腺癌组织外植体中的侵袭行为 癌症生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学分析,CRISPR/Cas9基因编辑 NA 基因表达数据,组织图像 未明确指定样本数量,但涉及癌症球体模型和人组织外植体 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
43 2026-04-15
Sepsis Induces Age- and Sex-Specific Chromatin Remodeling in Myeloid-Derived Suppressor Cells
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单分子检测技术MAPit-FENGC,结合单细胞RNA测序,揭示了脓毒症后骨髓源性抑制细胞中年龄和性别特异性的染色质重塑机制 首次应用MAPit-FENGC技术同时分析DNA甲基化和染色质可及性,在临床相关小鼠模型中系统揭示了脓毒症诱导的年龄和性别特异性表观遗传重编程 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;样本量相对有限,可能影响统计效力 探究脓毒症幸存者长期免疫功能障碍的表观遗传机制,特别是骨髓源性抑制细胞在年龄和性别特异性免疫失调中的作用 年轻和老年成年雄性和雌性小鼠的脾脏骨髓源性抑制细胞 表观遗传学 脓毒症 MAPit-FENGC, 单细胞RNA测序 无监督聚类 表观遗传数据, 转录组数据 年轻和老年成年雄性和雌性小鼠的脾脏MDSCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
44 2026-04-12
Cell Subtype-specific Analysis of Neuronal Membrane Proteasome in Somatosensory Neurons
2025-10-10, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文研究了神经元膜蛋白酶体(NMP)在体感神经元亚型中的特异性表达及其在机械、痒和痛觉感知中的关键作用 首次在体感神经元亚型中鉴定出神经元膜蛋白酶体(NMP),并揭示其作为感觉神经元间通讯的关键调节器,选择性抑制NMP可减少机械和痛觉敏感性而不引起神经病变 研究主要基于小鼠模型,体外研究结果需在体内进一步验证,且NMP的具体信号肽释放机制尚未完全阐明 探究神经元膜蛋白酶体(NMP)在体感神经元中的亚型特异性表达及其在感觉感知中的功能 小鼠外周体感神经元,特别是表达MrgprA3和Cysltr2的神经元亚型 神经科学 疼痛相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、抗体喂养、荧光激活细胞分选(FACS) NA RNA测序数据、细胞分选数据 小鼠体感神经元样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
45 2026-04-12
Flow Cytometry and Single-Cell Analysis for Characterizing Microglia Activation in Early Postnatal Mouse Brain Development
2025-10-03, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种结合流式细胞术和单细胞RNA测序的互补方法,用于研究小鼠小脑组织中小胶质细胞在早期出生后大脑发育中的激活状态 为早期出生后大脑组织优化了流式细胞术方案,并首次将相同的上游细胞分离步骤与10X Genomics单细胞RNA测序结合,提供了一个可重复且适应性强的框架来研究小胶质细胞的多样性 协议主要针对小鼠小脑组织,其通用性在其他脑区或物种中可能需要进一步验证;单细胞测序部分仅在区分性别样本时应用了随机森林分类器,功能分析可能有限 研究早期出生后大脑发育中小胶质细胞的激活特征和多样性 小鼠小脑组织中的小胶质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 流式细胞术 随机森林 基因表达数据, 细胞表面标记物数据 未明确说明具体样本数量,但涉及早期出生后小鼠脑组织 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10X Genomics 未指定具体产品型号,但遵循10X Genomics单细胞RNA测序流程
46 2026-04-12
Epigenetic dynamics and molecular mechanisms in oncogenesis, tumor progression, and therapy resistance
2025-Oct, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
综述 本文综述了癌症发生、进展和治疗抵抗中涉及的遗传、表观遗传及分子机制 整合了分子、遗传和表观遗传视角,并强调了CRISPR-Cas9表观基因组编辑和单细胞RNA测序等前沿技术在理解癌症异质性中的作用 作为一篇综述,不包含原始实验数据或新的模型验证 阐明癌症发生、进展和治疗抵抗的复杂机制,为开发创新性靶向治疗提供理论基础 癌症(肿瘤) NA 癌症 CRISPR-Cas9介导的表观基因组编辑,单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
47 2026-04-10
IL-6+ fibroblasts contribute to shaping the pro-inflammatory microenvironment in severe periodontitis after non-surgical periodontal therapy
2025-Oct-15, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了重度牙周炎非手术治疗后残余深牙周袋的细胞组成和分子环境,并发现IL-6+成纤维细胞在塑造促炎微环境中起关键作用 首次在重度牙周炎非手术治疗后的残余深牙周袋中,识别出IL-6+成纤维细胞亚型及其介导的缺氧微环境网络,阐明了其与FCN1+巨噬细胞的相互作用如何加剧炎症和骨吸收 NA 揭示重度牙周炎非手术治疗后残余深牙周袋的炎症浸润细胞组成和分子环境,为靶向治疗提供见解 重度牙周炎患者非手术治疗后的牙周组织以及健康供者的牙周组织 数字病理学 牙周炎 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,多重免疫组织化学免疫荧光 NA RNA测序数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
48 2026-04-10
CREBBP Mutation as a Culprit for Negative SSTR2 PET in Neuroendocrine Tumors
2025-Oct, Molecular imaging and biology IF:3.0Q2
研究论文 本研究旨在揭示导致神经内分泌肿瘤68Ga-DOTATATE PET成像阴性的分子和遗传因素 首次通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序,揭示了CREBBP突变与SSTR2表达阴性/低表达及PET成像阴性之间的关联 回顾性研究,样本量较小(18例患者),需要更大规模的前瞻性研究验证 阐明神经内分泌肿瘤中68Ga-DOTATATE PET成像阴性的分子遗传机制 肺、回肠或胰腺神经内分泌肿瘤患者 数字病理学 神经内分泌肿瘤 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 单细胞体细胞变异检测, PET/CT成像 NA 基因组测序数据, 单细胞转录组数据, 医学影像数据 18例神经内分泌肿瘤患者 NA 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 NA NA
49 2026-04-07
Comprehensive Spatial Profiling of Species-agnostic Transcriptomes via Stereo-seq
2025-10-31, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种名为Stereo-seq的空间物种无关转录组分析方法,用于FFPE组织,通过随机探针方法实现亚细胞分辨率 该方法采用随机引物进行空间条形码,不同于标准空间转录组学方法,能同时检测宿主和非宿主RNA,包括微生物、病毒和真菌RNA 协议需考虑环境和处理污染物对组织内外RNA的区分影响 开发一种空间物种无关的转录组分析技术,以研究细胞类型和病原物种的相互作用 FFPE组织中的宿主和非宿主RNA,包括细菌、病毒和真菌RNA 空间转录组学 NA 空间物种无关转录组分析,随机探针方法 NA RNA序列数据 NA NA 空间转录组学 Stereo-seq Stereo-seq方法使用0.22 µm大小的随机捕获珠,每0.5 µm在阵列中重复,实现基于测序的亚细胞分辨率
50 2026-04-07
Collection of Human Follicular Fluid, Follicle Somatic Cells, and Immature Oocytes from Individuals Undergoing In Vitro Fertilization
2025-10-24, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种从接受体外受精个体中系统收集和处理卵泡液、卵泡体细胞及未成熟卵母细胞的标准化实验方案 开发了无需酶法脱颗粒的卵丘细胞分离方法以保持转录组完整性,并建立了从新鲜卵泡液制备单细胞悬液用于单细胞RNA测序的逐步方案 方案依赖于辅助生殖技术过程中产生的废弃生物材料,样本获取受临床流程限制 建立标准化方案以利用辅助生殖技术产生的生物副产物研究卵巢生理学 人类卵泡内容物(卵泡液、卵母细胞、卵丘细胞、颗粒细胞等) 生殖生物学 生殖功能障碍 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、密度梯度离心、体外卵母细胞成熟 NA 单细胞转录组数据、细胞因子、激素、代谢物、环境毒物数据 未明确说明具体样本数量,但方案适用于接受取卵手术的女性个体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
51 2026-04-07
Single-cell RNA sequencing defines developmental progression and reproductive transitions of Pneumocystis carinii
2025-Oct-07, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术首次绘制了卡氏肺孢子虫的发育进展和生殖转变图谱 首次应用单细胞RNA测序技术构建卡氏肺孢子虫的转录组图谱,揭示了其生命周期的关键发育阶段和生殖转变过程 研究依赖于从感染大鼠中分离的病原体,可能无法完全模拟人类感染环境,且无法进行连续培养验证 阐明卡氏肺孢子虫的生命周期和生殖转变机制 卡氏肺孢子虫(Pneumocystis carinii) 数字病理学 肺孢子菌肺炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq),RT-qPCR NA 单细胞转录组数据 87,716个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Genomics平台 NA
52 2026-04-04
EGFR-STAT1 pathway drives fibrosis initiation in fibroinflammatory skin diseases
2025-Oct-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序图谱揭示了EGFR-STAT1信号通路在驱动纤维炎症性皮肤病中纤维化起始的关键作用 首次发现STAT1在成纤维细胞中的非干扰素依赖性功能,即通过EGFR-JAK非依赖性途径直接激活纤维化基因表达,并确定了活化的角质形成细胞分泌的高亲和力EGFR配体是该通路的触发因素 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据,人类样本的临床验证和长期治疗效果评估尚需进一步研究 探究慢性炎症性皮肤病中决定纤维化发生的信号通路 七种炎症性皮肤病及其健康对照的皮肤组织样本 数字病理学 皮肤纤维化疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多种炎症性皮肤病及健康对照的皮肤组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2026-04-02
Mechanisms of lactylation-related biomarker in neonatal hypoxic-ischemic brain damage analyzed through multi-omics data
2025-Oct-30, Pediatric research IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过多组学数据分析,探讨了乳酸化相关基因在新生大鼠缺氧缺血性脑损伤中的作用,并筛选出关键生物标志物GFAP和LCP1,验证了银杏内酯B和橘皮素的神经保护作用 首次在新生大鼠缺氧缺血性脑病模型中采用多组学方法,并研究了乳酸代谢相关基因的作用,为药物开发提供了新靶点和方向 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化需进一步验证 探究乳酸化相关基因在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的机制,并寻找潜在治疗靶点 新生SD大鼠的脑组织 机器学习和多组学分析 新生儿缺氧缺血性脑损伤 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、分子对接 机器学习 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 SD大鼠模型,具体数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
54 2026-04-02
Engineering unnatural cells with a 21st amino acid as a living epigenetic sensor
2025-Oct-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了能够生物合成和遗传编码乙酰赖氨酸的自主细胞,作为活体表观遗传传感器,用于实时监测活体动物中的蛋白质翻译后修饰动态 利用遗传密码扩展技术,首次在活体动物中实现了基于21种氨基酸的工程化细胞作为非侵入性表观遗传传感器,用于实时跟踪去乙酰化酶活性和抑制剂效果 未明确说明传感器在复杂生物环境中的长期稳定性或潜在免疫反应,且可能仅限于乙酰化修饰的监测 开发非侵入性方法以实时监测活体动物中蛋白质翻译后修饰的动态变化 工程化的原核和真核细胞,以及活体动物模型 合成生物学 NA 遗传密码扩展技术 NA NA NA NA NA NA NA
55 2026-04-02
Concerted changes in Epithelium and Stroma: a multi-scale, multi-omics analysis of progression from Barrett's Esophagus to adenocarcinoma
2025-Oct-20, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了从巴雷特食管到食管腺癌进展过程中上皮与基质细胞的协同变化 首次整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白质组学、组织力学和空间蛋白质组学,系统描绘了从鳞状上皮到腺癌的多阶段进展特征 样本量相对有限(26例患者),且为观察性研究,需要更大队列验证 阐明巴雷特食管向食管腺癌进展的分子与细胞机制 食管组织样本(包括鳞状上皮、化生、异型增生和腺癌阶段) 数字病理学 食管腺癌 单细胞RNA测序、蛋白质组学、空间蛋白质组学、组织力学分析 多组学整合分析 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、空间蛋白表达数据、力学测量数据 107个样本来自26例患者(两个独立队列) NA 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学, 蛋白质组学 NA NA
56 2026-04-02
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-10, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文提出了一种多组学单细胞测序方法,用于精确评估CRISPR编辑后疾病相关等位基因的功能效应 开发了一种结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模态单细胞测序方法,能够直接检测疾病等位基因的功能后果 未明确说明样本量或实验重复次数,可能受限于编辑效率和培养条件引起的非特异性转录变化 旨在克服CRISPR编辑中效率低、编辑结果异质性和非特异性转录变化的限制,以识别疾病相关非编码等位基因的因果变异和功能 人类T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因以及多重编辑 单细胞多组学 自身免疫性疾病 CRISPR-Cas编辑,单细胞测序 NA 基因组DNA,转录组,蛋白质表达数据 NA NA 单细胞多组学测序 NA NA
57 2026-04-01
Identification of tumor initiating cells and early marker genes in normal colonic epithelium that lead to neoplastic transformation
2025-Oct-27, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在正常结肠上皮中识别了肿瘤起始细胞及其早期标志基因,揭示了从正常组织向癌前病变转变的分子机制 首次在组织学正常的结肠黏膜中识别出肿瘤起始细胞,并揭示了这些细胞在肿瘤发生早期的转录和通路重编程事件 样本量较小(仅7名受试者),且研究主要基于单细胞转录组数据,需要进一步的功能验证 识别结肠癌发生早期的肿瘤起始细胞和分子标志物,以理解肿瘤起始机制 人类结肠组织,包括正常外观黏膜、腺瘤和腺癌 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,RNA-FISH NA 单细胞转录组数据 7名人类受试者的配对正常和病变结肠组织活检 10x Genomics 单细胞RNA测序 10X Genomics平台 NA
58 2026-04-01
Single-Cell Profiling of HDAC Inhibitor-Induced EBV Lytic Heterogeneity Defines Abortive and Refractory States in B Lymphoblasts
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了HDAC抑制剂在EBV阳性B淋巴细胞中诱导的病毒裂解异质性,定义了流产性和难治性状态 首次在单细胞水平上揭示了HDAC抑制剂诱导EBV裂解反应中的异质性,并识别了与NF-κB活性和免疫信号相关的基因上调在流产性裂解细胞中的作用 研究仅基于四种EBV阳性细胞系,且裂解反应仅在少数细胞中成功,可能限制了结果的普遍性 探究HDAC抑制剂在EBV相关恶性肿瘤中诱导病毒裂解反应的机制及宿主因素的作用 四种EBV阳性细胞系:P3HR1-ZHT BL、Jijoye BL、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和感染衍生的淋巴母细胞样细胞系 单细胞组学 EBV相关恶性肿瘤(如伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌) 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 四种EBV阳性细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
59 2026-03-30
Integration of elemental imaging and spatial transcriptomic profiling for proof-of-concept metals-based pathway analysis of colon tumor microenvironment
2025-Oct-14, Metallomics : integrated biometal science IF:2.9Q3
研究论文 本研究通过整合元素成像和空间转录组学,对结直肠癌肿瘤微环境中的金属依赖性信号通路进行了概念验证分析 首次将元素成像与空间转录组学整合,实现了组织范围内金属-基因相互作用的全面探索,突破了传统孤立研究金属或基因的局限 本研究仅为单样本概念验证,样本量有限,未来需要扩大患者队列进行验证 探索肿瘤微环境中金属丰度、转运机制、细胞分布与肿瘤进展相关生物通路(如代谢、胶原重塑)之间的复杂相互作用 结直肠癌肿瘤微环境 空间转录组学 结直肠癌 元素成像、空间转录组学、基因表达相关性分析 空间多模态工作流程 图像、基因表达数据、细胞组成数据、组织病理学特征 单一样本(结直肠癌肿瘤) NA 空间转录组学、元素成像 NA NA
60 2026-03-30
Conditional Ablation of PKCλ/ι in CD4+ T Cells Ameliorates Hepatic Fibrosis in Schistosoma japonicum-Infected Mice via T Follicular Helper (Tfh) Cell Suppression Coupled with Increased Follicular Regulatory T (Tfr) and Regulatory B (Breg) Cell Activities
2025-10-09, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过构建CD4+ T细胞特异性PKCλ/ι条件性敲除小鼠模型,探讨了PKCλ/ι在血吸虫感染诱导的肝纤维化中的作用机制 首次在CD4+ T细胞中条件性敲除PKCλ/ι,揭示了其通过调控Tfh/Tfr细胞平衡和Breg细胞功能来减轻肝纤维化的新机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;单细胞测序样本量有限;具体信号通路细节有待进一步阐明 探究PKCλ/ι在血吸虫感染诱导的肝纤维化中的免疫调节作用 感染日本血吸虫的小鼠模型,重点关注CD4+ T细胞、Tfh细胞、Tfr细胞和Breg细胞 数字病理学 肝纤维化 单细胞RNA测序,流式细胞术,RT-qPCR,ELISA,转录组分析 条件性基因敲除小鼠模型 RNA测序数据,流式细胞数据,基因表达数据 未明确说明具体样本数量的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部