单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2025-10-05
Single-Cell Transcription Reveals the Fibroblast Heterogeneity and Neural Cells' Significance in Desmoid Fibromatosis
2025-Oct, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示硬纤维瘤中成纤维细胞的异质性及神经细胞在肿瘤微环境中的重要作用 首次揭示硬纤维瘤中成纤维细胞的异质性,鉴定出特异性标志物ADAM12和转录因子CREB3L1,发现神经细胞在维持促纤维化微环境中的关键作用 NA 揭示硬纤维瘤的细胞特征和肿瘤微环境组成 硬纤维瘤组织,并与瘢痕疙瘩成纤维细胞和正常成纤维细胞进行对比 单细胞测序 硬纤维瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 使用公共数据集GSE163973,包含硬纤维瘤、瘢痕疙瘩成纤维细胞和正常成纤维细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
482 2025-10-05
Pan-Cancer Analyses Refine the Single-Cell Portrait of Tumor-Infiltrating Dendritic Cells
2025-Oct-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 通过整合33种癌症类型的单细胞RNA测序数据,建立了人类树突状细胞的全面蓝图 发现了肿瘤浸润的罕见树突状细胞亚群,揭示了LAMP3+ DCs的多重细胞起源与功能潜力 NA 探索肿瘤微环境中树突状细胞的异质性,为基于DC的免疫疗法开发提供见解 肿瘤浸润树突状细胞 生物信息学 泛癌分析 单细胞RNA测序 机器学习模型 单细胞RNA测序数据 2500多个样本,涵盖33种癌症类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
483 2025-10-05
Epigenetic drift score captures directional methylation variability and links aging to transcriptional, metabolic, and genetic alterations
2025-Oct-01, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过大规模表观基因组分析开发了表观遗传漂变评分,揭示了DNA甲基化变异性与衰老过程的关联 首次在大型中国人群中开展全面的表观基因组漂变研究,开发了量化个体漂变负担的表观遗传漂变评分,并揭示了漂变与转录变异性、代谢特征和遗传决定因素的关联 研究主要基于850K EPIC芯片数据,可能未覆盖全基因组所有CpG位点,且不同人群队列的样本量存在差异 探究表观遗传漂变在人类衰老过程中的规模、生物学意义和人群特异性 中国人群(n=3538)和欧洲人群(n=956)的DNA甲基化数据 表观遗传学 衰老相关疾病 DNA甲基化芯片分析,单细胞RNA-seq,全基因组关联分析(GWAS) 统计检验(White's test),表观遗传漂变评分模型 DNA甲基化数据,转录组数据,脂质组数据,临床数据 总样本量5961人(中国人群5005人,欧洲人群956人) Illumina DNA甲基化芯片,单细胞RNA-seq 850K EPIC array Illumina EPIC 850K甲基化芯片
484 2025-10-05
Intergenic accumulation of RNA polymerase II maintains the potential for swift transcriptional restart upon release from quiescence
2025-Oct-01, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过追踪芽殖酵母静息细胞中转录活性的全局变化,揭示了RNA聚合酶II在基因间区域的积累对快速重启转录的关键作用 发现静息细胞中RNA聚合酶II在三分之一基因启动子处的特异性积累,这种分布模式确保细胞在重返生长时能快速启动转录反应 研究仅限于芽殖酵母模型,在高等真核生物中的普适性仍需验证 探究静息细胞如何维持快速重启转录的分子机制 芽殖酵母的静息细胞群体 分子生物学 NA 单细胞RNA测序,细胞分选 NA 转录组数据 分选的静息细胞群体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
485 2025-10-05
Infiltrating macrophages replace Kupffer cells and play diverse roles in severe alcohol-associated hepatitis
2025-Oct, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了严重酒精相关性肝炎中浸润巨噬细胞替代库普弗细胞并发挥多种功能 发现sAH肝脏中独特的C1Q巨噬细胞群,可能通过清除凋亡中性粒细胞发挥补偿作用 研究主要基于人类肝脏移植样本和实验动物模型,需要进一步验证这些发现 探究严重酒精相关性肝炎中巨噬细胞的多样性和功能 酒精性肝硬化患者和严重酒精相关性肝炎患者的肝脏样本,以及酒精诱导肝损伤实验模型 单细胞生物学 酒精性肝病 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 人类肝脏移植样本(sAH和AC患者)和实验小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
486 2025-10-05
LAG3 as a Tumor Suppressor and Immune Regulator in Cervical Cancer: From Functional Validation to Therapeutic Strategy
2025-Oct, Cancer medicine IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过多组学分析和实验验证,系统表征了宫颈癌中焦亡相关基因的特征,并发现LAG3作为关键肿瘤抑制因子和免疫调节因子 首次建立基于焦亡相关基因的宫颈癌预后模型,并通过功能实验证实LAG3的肿瘤抑制功能 研究样本主要来自公共数据库,需要更大规模的前瞻性研究验证 系统分析宫颈癌中焦亡相关基因的预后和治疗价值 宫颈癌患者样本和细胞系 生物信息学 宫颈癌 多组学分析,单细胞RNA测序,Western blot,CCK-8,集落形成,transwell实验 LASSO-Cox回归模型 基因组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 TCGA和GEO数据库中的宫颈癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
487 2025-10-05
Artemisia annua-derived extracellular vesicles reprogram breast tumor immune microenvironment via altering macrophage polarization and synergizing recruitment of T lymphocytes
2025-Oct-01, Chinese medicine IF:5.3Q1
研究论文 本研究从青蒿中分离细胞外囊泡,探索其通过改变巨噬细胞极化和协同招募T淋巴细胞来重编程乳腺癌免疫微环境的作用机制 首次发现青蒿来源的细胞外囊泡能够通过激活NF-κB信号通路和抑制PPARγ通路,促进巨噬细胞从M2型向M1型极化,并增强T淋巴细胞向肿瘤床的浸润 青蒿细胞外囊泡在乳腺癌治疗中的临床应用潜力仍需进一步验证 探索青蒿来源细胞外囊泡对乳腺癌免疫微环境的重编程作用 乳腺癌细胞、巨噬细胞、T淋巴细胞 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序, mRNA测序, 透射电子显微镜, 纳米颗粒跟踪分析, 超高效液相色谱-质谱联用, 高效液相色谱 NA 单细胞RNA测序数据, mRNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
488 2025-10-05
Exploring the mechanisms underlying effects of oxygenated polycyclic aromatic hydrocarbons exposure on inflammatory bowel disease
2025-Oct-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了氧代多环芳烃暴露对炎症性肠病影响的分子机制 首次系统揭示OPAHs通过氧化应激和免疫反应途径影响IBD的分子机制,并识别出三个核心靶点基因 研究主要基于网络毒理学和计算分析,实验验证相对有限 探索环境污染物OPAHs与炎症性肠病之间的毒性作用机制 氧代多环芳烃(OPAHs)和炎症性肠病(IBD) 生物信息学 炎症性肠病 网络毒理学、单细胞RNA测序、分子对接、体外实验 机器学习算法 基因表达数据、分子对接数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
489 2025-10-05
Deciphering the carcinogenic role of benzo[a]pyrene in glioblastoma: Insights from network toxicology, single-cell transcriptomics, and Mendelian randomization
2025-Oct-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过整合网络毒理学、单细胞转录组学、孟德尔随机化和文献计量学方法,揭示了苯并[a]芘通过靶向TP53基因促进胶质母细胞瘤发生的机制 首次将网络毒理学、单细胞转录组学、孟德尔随机化和文献计量学整合应用于环境致癌物与胶质母细胞瘤关系研究,发现BaP通过靶向TP53驱动胶质母细胞瘤发生 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏体内实验验证 探索苯并[a]芘在胶质母细胞瘤中的致癌机制 胶质母细胞瘤相关基因和细胞亚群 生物信息学 胶质母细胞瘤 网络毒理学, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 文献计量学分析 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 分子对接模型 基因表达数据, 单细胞转录组数据 单细胞RNA-seq数据集GSE131928 NA 单细胞RNA-seq NA NA
490 2025-10-05
Ptgs2+ CPTC Function as a "Force-Immune Axis" by Responding to Acupuncture and Mediating M2 Macrophage Activation for Anti-Inflammatory Effects
2025-Oct-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序发现Ptgs2+ CPTC作为“力-免疫轴”响应针刺刺激并通过Il6-Il6st-Stat3通路激活M2巨噬细胞发挥抗炎作用 首次确立Ptgs2+ CPTC作为连接机械刺激与免疫调节的关键“力-免疫轴”,揭示了针灸抗炎的细胞机制 研究局限于腹部中线筋膜组织,未验证其他筋膜区域的普适性 探索筋膜组织中特络细胞的细胞景观及其在针灸抗炎中的作用机制 大鼠腹部中线筋膜组织和特络细胞亚群 数字病理学 炎症性肠病 单细胞测序, 深度学习 深度学习模型 单细胞RNA测序数据, 细胞形态学数据 痢疾大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
491 2025-10-05
Comprehensive bioinformatics evaluation uncovers the possible oncogenic contribution of acrylamide to endometrial cancer
2025-Oct-02, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过生物信息学方法评估丙烯酰胺在子宫内膜癌中的潜在致癌机制 首次整合转录组数据和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法系统揭示丙烯酰胺通过关键基因介导子宫内膜癌发生的分子机制 需要进一步的实验验证才能将这些发现转化为预防和治疗策略 探索丙烯酰胺在子宫内膜癌发生发展中的致癌机制 子宫内膜癌转录组数据和单细胞RNA测序数据 生物信息学 子宫内膜癌 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接 LASSO回归, 支持向量机, 随机森林 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 来自GEO数据集(GSE17025, GSE63678, GSE106191, GSE115810)和单细胞RNA测序数据(PRJNA786266) NA 单细胞RNA测序 NA NA
492 2025-10-05
Mechanisms of dexamethasone-induced bone toxicity in developing bone: a single-cell perspective
2025-Oct, JBMR plus IF:3.4Q2
研究论文 通过单细胞转录组学揭示地塞米松对发育中骨骼毒性的分子机制 首次从单细胞层面系统揭示地塞米松对发育骨骼中成骨细胞、软骨细胞和B细胞谱系的影响 研究仅使用C57BL/6JRj雄性小鼠模型,未涉及其他品系或雌性动物 阐明地塞米松诱导发育骨骼毒性的分子机制 骨骼未成熟的C57BL/6JRj雄性小鼠 单细胞生物学 骨骼发育障碍 单细胞RNA测序,微计算机断层扫描 NA 单细胞转录组数据,影像数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
493 2025-10-05
Single-cell multiomics reveals multiple adipogenic pathways and diverse multilineage specializations during embryonic fat tail morphogenesis
2025-Oct-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 通过单细胞多组学技术揭示胚胎期脂肪尾形态发生过程中的多种脂肪生成途径和多样化的多谱系特化 首次在脂肪尾绵羊胚胎发育过程中应用单细胞多组学测序,揭示了脂肪沉积的三种主要细胞来源和关键增强子驱动的基因调控网络 研究受限于胚胎组织的时间敏感性、有限的组织体积和伦理考量 探究哺乳动物胚胎期脂肪生成的细胞起源和分子调控机制 脂肪尾绵羊胚胎发育过程中的脂肪组织 单细胞生物学 NA 单细胞多组学测序, scRNA-seq, snATAC-seq NA 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 胚胎期E50至E80所有脂肪生成阶段的样本 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学 NA NA
494 2025-10-05
The Role of p53 in Adipocyte Differentiation and Lipid Metabolism in Obese Mice via Transcriptional Regulation of Lgals3
2025-Oct, Obesity (Silver Spring, Md.)
研究论文 本研究探讨p53通过转录调控Lgals3在肥胖小鼠脂肪细胞分化和脂质代谢中的作用 首次揭示p53通过转录抑制Lgals3调控脂肪细胞分化和脂质代谢的新机制 研究主要基于小鼠模型和3T3-L1细胞系,人类临床相关性需进一步验证 研究p53对Lgals3表达的调控作用及其在肥胖代谢中的功能 高脂饮食诱导的肥胖小鼠和3T3-L1前脂肪细胞 分子生物学 肥胖症 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 双荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀, RT-qPCR, Western blot NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢表型数据 6个肥胖相关微阵列数据集和单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序, 微阵列 NA NA
495 2025-10-05
Alpha Linolenic and Stearic Acids Modulate Genes Related to Viral Entry and Inflammatory Response in THP-1 Derived Macrophages Exposed to SARS-CoV-2
2025-Oct, Food science & nutrition IF:3.5Q2
研究论文 探讨α-亚麻酸和硬脂酸对THP-1来源巨噬细胞暴露于SARS-CoV-2时病毒进入和炎症反应相关基因的调控作用 首次通过单细胞RNA-seq数据发现巨噬细胞在COVID-19中基因表达的关键变化,并验证游离脂肪酸对病毒进入和炎症反应的调控作用 研究仅限于体外细胞实验,未进行动物模型或临床试验验证 阐明肥胖影响COVID-19预后的分子机制 THP-1来源巨噬细胞和Beas2B支气管上皮细胞 分子生物学 COVID-19 单细胞RNA测序, 体外细胞实验 NA 基因表达数据, 细胞实验数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
496 2025-10-05
Platelet-derived growth factor signaling in porcine testicular tubular somatic cells
2025-Oct, Cell and tissue research IF:3.2Q3
研究论文 本研究探讨血小板衍生生长因子信号通路在猪睾丸管状体细胞中的作用及其对细胞功能和形态发生的影响 首次在高等哺乳动物猪中系统研究PDGF信号通路在睾丸体细胞间的通讯机制,并发现其对细胞骨架和初级纤毛的调控作用 初级纤毛调控的PDGF信号在睾丸中的具体作用机制尚未明确 阐明PDGF信号通路在猪睾丸体细胞相互作用和形态发生中的功能 1周龄猪睾丸管状体细胞 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
497 2025-10-06
Decoding chicken growth regulation through multi-omics insights and emerging genetic tools for growth optimization
2025-Oct, Poultry science IF:3.8Q1
综述 本文综述了鸡生长性状的遗传调控机制,整合多组学方法和新兴基因工具以优化生长性能 强调单细胞RNA测序在解析生长相关组织细胞异质性中的应用,结合CRISPR/Cas9基因组编辑技术开辟精准育种新途径 现有遗传变异发现对可持续高效家禽生产的应用仍有限制 阐明鸡生长性状的遗传调控网络,推动精准育种策略开发 鸡的生长性状(体重和生长)及其遗传调控机制 基因组学 NA 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因组编辑, 多组学分析(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学) NA 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 基因组测序 NA NA
498 2025-10-05
Taurine improves bovine oocyte maturation through recovering mitochondrial dysfunction and oxidative stress-induced apoptosis after microplastics exposure
2025-Oct, Journal of dairy science IF:3.7Q2
研究论文 本研究探讨微塑料暴露对牛卵母细胞成熟的影响及牛磺酸的修复作用 首次揭示微塑料通过线粒体功能障碍导致牛卵母细胞成熟失败,并发现牛磺酸具有修复作用 研究仅针对牛卵母细胞,对人类生殖系统的直接适用性需要进一步验证 探究微塑料对雌性生殖系统的毒性作用及牛磺酸的保护机制 牛卵母细胞 生殖生物学 生殖系统疾病 免疫荧光染色,单细胞转录组测序 NA 图像数据,基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
499 2025-10-05
Lichenoid graft-versus-host disease shows a high interferon score, with IFNAR1 inhibition preventing skin inflammation
2025-Oct, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了苔藓样移植物抗宿主病的干扰素特征,并证明IFNAR1抗体可预防皮肤炎症 首次通过单细胞分辨率揭示lGVHD的干扰素特征,并验证IFNAR1阻断的治疗潜力 人类样本量较小(n=3),小鼠模型需进一步验证 解析苔藓样GVHD的免疫机制并评估I型干扰素通路阻断的治疗效果 人类lGVHD皮肤样本和小鼠ccGVHD模型 单细胞基因组学 移植物抗宿主病 scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, qPCR, 微阵列 小鼠GVHD模型 基因表达数据 人类样本:3例lGVHD+4例对照(scRNA-Seq),13例lGVHD+10例对照(qPCR);小鼠公开数据 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
500 2025-10-05
SPP1 exacerbates ischemic stroke by promoting ferroptosis induced brain injury
2025-Oct-01, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究揭示SPP1通过PI3K/AKT信号通路加剧铁死亡诱导的脑损伤,从而恶化缺血性卒中 首次发现SPP1通过调控PI3K/AKT信号通路促进铁死亡在缺血性卒中中的作用机制 研究主要基于细胞和动物模型,尚未在临床患者中验证 探究SPP1在缺血性卒中中铁死亡机制中的作用及潜在治疗靶点 HT22细胞系和小鼠MCAO/R模型 神经科学 缺血性卒中 单细胞测序, Western blot, 蛋白组学分析, 免疫荧光, 电子显微镜 NA 蛋白质表达数据, 细胞成像, 分子信号通路数据 细胞系和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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