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当前共找到 592 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-05 |
Benchmarking scRNA-seq copy number variation callers
2025-Oct-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62359-9
PMID:41038850
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研究论文 | 本研究对六种单细胞RNA测序拷贝数变异检测工具进行了系统性评估 | 首次对单细胞RNA测序CNV检测方法进行独立基准测试，并开发了用于新数据集方法选择的基准测试流程 | 性能受数据集特定因素影响，包括数据集大小、CNV数量和类型以及参考数据集选择 | 评估单细胞RNA测序CNV检测方法的准确性和性能 | 六种流行的单细胞RNA测序CNV检测计算方法 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 21个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序数据集 |
| 462 | 2025-10-05 |
Identification and expression analysis of papain-like cysteine proteases gene family and response to B. cinerea stress in F. vesca
2025-Oct-02, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-025-07291-2
PMID:41039302
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研究论文 | 本研究通过系统分析森林草莓中木瓜样半胱氨酸蛋白酶基因家族，揭示了其在灰葡萄孢菌胁迫响应中的功能 | 首次在森林草莓中系统鉴定PLCP基因家族，结合单细胞转录组和双转录组分析揭示了该基因家族在病原菌胁迫下的细胞类型特异性表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析和表达验证，缺乏直接的基因功能验证实验 | 探究森林草莓PLCP基因家族在生物胁迫响应中的功能 | 森林草莓(Fragaria vesca)的PLCP基因家族 | 植物分子生物学 | 植物真菌病害 | 系统发育分析,染色体定位,Ka/Ks分析,顺式元件分析,单细胞转录组测序,双转录组测序,RT-qPCR,瞬时表达实验 | NA | 基因组数据,转录组数据,基因表达数据 | 44个FvPLCP基因 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 463 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing and mass spectrometry imaging reveal the multicellular compartmentalization map of plant triterpenes: A ginsenoside in Panax ginseng example
2025-Oct, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70198
PMID:40626415
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和质谱成像技术揭示了人参中三萜类化合物人参皂苷的多细胞区室化分布图谱 | 首次报道植物三萜类化合物的生物合成多细胞定位图谱，构建了人参皂苷的多细胞区室化分布图 | 仅以人参皂苷为例研究植物三萜类化合物，未涵盖其他三萜类化合物 | 揭示植物三萜类化合物的多细胞区室化分布规律 | 人参（Panax ginseng）组织中的三萜类化合物人参皂苷 | 植物代谢组学 | NA | 单细胞测序，质谱成像 | 伪时间分析 | 单细胞基因表达数据，空间代谢物分布图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间代谢组学 | NA | NA |
| 464 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcription Reveals the Fibroblast Heterogeneity and Neural Cells' Significance in Desmoid Fibromatosis
2025-Oct, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70160
PMID:40706632
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示硬纤维瘤中成纤维细胞的异质性及神经细胞在肿瘤微环境中的重要作用 | 首次揭示硬纤维瘤中成纤维细胞的异质性，鉴定出特异性标志物ADAM12和转录因子CREB3L1，发现神经细胞在维持促纤维化微环境中的关键作用 | NA | 揭示硬纤维瘤的细胞特征和肿瘤微环境组成 | 硬纤维瘤组织，并与瘢痕疙瘩成纤维细胞和正常成纤维细胞进行对比 | 单细胞测序 | 硬纤维瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用公共数据集GSE163973，包含硬纤维瘤、瘢痕疙瘩成纤维细胞和正常成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 465 | 2025-10-05 |
Pan-Cancer Analyses Refine the Single-Cell Portrait of Tumor-Infiltrating Dendritic Cells
2025-Oct-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3595
PMID:40742316
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研究论文 | 通过整合33种癌症类型的单细胞RNA测序数据，建立了人类树突状细胞的全面蓝图 | 发现了肿瘤浸润的罕见树突状细胞亚群，揭示了LAMP3+ DCs的多重细胞起源与功能潜力 | NA | 探索肿瘤微环境中树突状细胞的异质性，为基于DC的免疫疗法开发提供见解 | 肿瘤浸润树突状细胞 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 2500多个样本，涵盖33种癌症类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 466 | 2025-10-05 |
Epigenetic drift score captures directional methylation variability and links aging to transcriptional, metabolic, and genetic alterations
2025-Oct-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280155.124
PMID:40750330
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研究论文 | 本研究通过大规模表观基因组分析开发了表观遗传漂变评分，揭示了DNA甲基化变异性与衰老过程的关联 | 首次在大型中国人群中开展全面的表观基因组漂变研究，开发了量化个体漂变负担的表观遗传漂变评分，并揭示了漂变与转录变异性、代谢特征和遗传决定因素的关联 | 研究主要基于850K EPIC芯片数据，可能未覆盖全基因组所有CpG位点，且不同人群队列的样本量存在差异 | 探究表观遗传漂变在人类衰老过程中的规模、生物学意义和人群特异性 | 中国人群(n=3538)和欧洲人群(n=956)的DNA甲基化数据 | 表观遗传学 | 衰老相关疾病 | DNA甲基化芯片分析，单细胞RNA-seq，全基因组关联分析(GWAS) | 统计检验(White's test)，表观遗传漂变评分模型 | DNA甲基化数据，转录组数据，脂质组数据，临床数据 | 总样本量5961人(中国人群5005人，欧洲人群956人) | Illumina | DNA甲基化芯片，单细胞RNA-seq | 850K EPIC array | Illumina EPIC 850K甲基化芯片 |
| 467 | 2025-10-05 |
Intergenic accumulation of RNA polymerase II maintains the potential for swift transcriptional restart upon release from quiescence
2025-Oct-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279874.124
PMID:40796281
|
研究论文 | 本研究通过追踪芽殖酵母静息细胞中转录活性的全局变化，揭示了RNA聚合酶II在基因间区域的积累对快速重启转录的关键作用 | 发现静息细胞中RNA聚合酶II在三分之一基因启动子处的特异性积累，这种分布模式确保细胞在重返生长时能快速启动转录反应 | 研究仅限于芽殖酵母模型，在高等真核生物中的普适性仍需验证 | 探究静息细胞如何维持快速重启转录的分子机制 | 芽殖酵母的静息细胞群体 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序，细胞分选 | NA | 转录组数据 | 分选的静息细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 468 | 2025-10-05 |
Deciphering context-specific gene programs from single-cell and spatial transcriptomics data with DeCEP
2025-Oct-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279689.124
PMID:40841173
|
研究论文 | 提出DeCEP计算框架，用于从单细胞和空间转录组数据中识别特定背景的基因程序 | 利用功能基因列表和有向图构建功能网络，基于网络拓扑识别背景依赖的枢纽基因，实现更精细的基因程序表征 | NA | 开发计算框架以解析特定细胞或空间背景下的基因程序 | 单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病, 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 功能网络分析 | 基因表达数据 | 模拟和真实生物数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 469 | 2025-10-05 |
Infiltrating macrophages replace Kupffer cells and play diverse roles in severe alcohol-associated hepatitis
2025-Oct, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01343-1
PMID:40962953
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了严重酒精相关性肝炎中浸润巨噬细胞替代库普弗细胞并发挥多种功能 | 发现sAH肝脏中独特的C1Q巨噬细胞群，可能通过清除凋亡中性粒细胞发挥补偿作用 | 研究主要基于人类肝脏移植样本和实验动物模型，需要进一步验证这些发现 | 探究严重酒精相关性肝炎中巨噬细胞的多样性和功能 | 酒精性肝硬化患者和严重酒精相关性肝炎患者的肝脏样本，以及酒精诱导肝损伤实验模型 | 单细胞生物学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 人类肝脏移植样本（sAH和AC患者）和实验小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 470 | 2025-10-05 |
Plasma proteome correlations with liver stiffness in pediatric cholestasis implicate epithelial to mesenchymal transition
2025-Oct-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000796
PMID:41021277
|
研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析探索儿童胆汁淤积性肝病中肝脏硬度与蛋白质表达的相关性 | 首次在多种儿童胆汁淤积性疾病中系统分析血浆蛋白质组与肝脏硬度的疾病特异性相关性，并发现上皮间质转化通路在所有三种疾病中均显著富集 | 研究为横断面分析，无法确定因果关系；样本量相对有限 | 探究儿童胆汁淤积性肝病中血浆蛋白质组与肝脏硬度的相关性及其生物学意义 | 187名儿童（93例胆道闭锁、31例α-1抗胰蛋白酶缺乏症、46例Alagille综合征患者及17名健康对照） | 蛋白质组学 | 肝胆疾病 | 慢解离速率修饰适体扫描分析、振动控制弹性成像、单细胞转录组学、机器学习 | 弹性网络模型 | 蛋白质组数据、临床参数、转录组数据 | 187名儿童（93例BA、31例A1AT、46例ALGS、17名健康对照） | NA | 血浆蛋白质组分析、单细胞转录组学 | NA | 慢解离速率修饰适体扫描分析技术检测7000多种血浆蛋白质 |
| 471 | 2025-10-05 |
LAG3 as a Tumor Suppressor and Immune Regulator in Cervical Cancer: From Functional Validation to Therapeutic Strategy
2025-Oct, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71278
PMID:41025546
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，系统表征了宫颈癌中焦亡相关基因的特征，并发现LAG3作为关键肿瘤抑制因子和免疫调节因子 | 首次建立基于焦亡相关基因的宫颈癌预后模型，并通过功能实验证实LAG3的肿瘤抑制功能 | 研究样本主要来自公共数据库，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 系统分析宫颈癌中焦亡相关基因的预后和治疗价值 | 宫颈癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 多组学分析，单细胞RNA测序，Western blot，CCK-8，集落形成，transwell实验 | LASSO-Cox回归模型 | 基因组数据，转录组数据，单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO数据库中的宫颈癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 472 | 2025-10-05 |
Artemisia annua-derived extracellular vesicles reprogram breast tumor immune microenvironment via altering macrophage polarization and synergizing recruitment of T lymphocytes
2025-Oct-01, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-025-01210-1
PMID:41029711
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研究论文 | 本研究从青蒿中分离细胞外囊泡，探索其通过改变巨噬细胞极化和协同招募T淋巴细胞来重编程乳腺癌免疫微环境的作用机制 | 首次发现青蒿来源的细胞外囊泡能够通过激活NF-κB信号通路和抑制PPARγ通路，促进巨噬细胞从M2型向M1型极化，并增强T淋巴细胞向肿瘤床的浸润 | 青蒿细胞外囊泡在乳腺癌治疗中的临床应用潜力仍需进一步验证 | 探索青蒿来源细胞外囊泡对乳腺癌免疫微环境的重编程作用 | 乳腺癌细胞、巨噬细胞、T淋巴细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, mRNA测序, 透射电子显微镜, 纳米颗粒跟踪分析, 超高效液相色谱-质谱联用, 高效液相色谱 | NA | 单细胞RNA测序数据, mRNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 473 | 2025-10-05 |
Multicondition and multimodal temporal profile inference during mouse embryonic development
2025-Oct-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279997.124
PMID:40813249
|
研究论文 | 提出Sunbear联合建模框架，用于整合多条件和多模态的单细胞时间序列数据 | 开发能够同时处理多条件和多模态单细胞时间序列数据的联合建模方法 | 由于单细胞测量的破坏性特性，无法捕获特定细胞的完整时间轨迹 | 推断小鼠胚胎发育过程中的多条件和多模态时间谱 | 小鼠胚胎发育过程中的单细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 联合建模框架 | 单细胞时间序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 474 | 2025-10-05 |
Exploring the mechanisms underlying effects of oxygenated polycyclic aromatic hydrocarbons exposure on inflammatory bowel disease
2025-Oct-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119153
PMID:41038021
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研究论文 | 本研究探讨了氧代多环芳烃暴露对炎症性肠病影响的分子机制 | 首次系统揭示OPAHs通过氧化应激和免疫反应途径影响IBD的分子机制，并识别出三个核心靶点基因 | 研究主要基于网络毒理学和计算分析，实验验证相对有限 | 探索环境污染物OPAHs与炎症性肠病之间的毒性作用机制 | 氧代多环芳烃(OPAHs)和炎症性肠病(IBD) | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 网络毒理学、单细胞RNA测序、分子对接、体外实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据、分子对接数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 475 | 2025-10-05 |
Deciphering the carcinogenic role of benzo[a]pyrene in glioblastoma: Insights from network toxicology, single-cell transcriptomics, and Mendelian randomization
2025-Oct-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119155
PMID:41038024
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、单细胞转录组学、孟德尔随机化和文献计量学方法，揭示了苯并[a]芘通过靶向TP53基因促进胶质母细胞瘤发生的机制 | 首次将网络毒理学、单细胞转录组学、孟德尔随机化和文献计量学整合应用于环境致癌物与胶质母细胞瘤关系研究，发现BaP通过靶向TP53驱动胶质母细胞瘤发生 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏体内实验验证 | 探索苯并[a]芘在胶质母细胞瘤中的致癌机制 | 胶质母细胞瘤相关基因和细胞亚群 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 网络毒理学, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 文献计量学分析 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 分子对接模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 单细胞RNA-seq数据集GSE131928 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 476 | 2025-10-05 |
Ptgs2+ CPTC Function as a "Force-Immune Axis" by Responding to Acupuncture and Mediating M2 Macrophage Activation for Anti-Inflammatory Effects
2025-Oct-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501175RR
PMID:41017691
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现Ptgs2+ CPTC作为“力-免疫轴”响应针刺刺激并通过Il6-Il6st-Stat3通路激活M2巨噬细胞发挥抗炎作用 | 首次确立Ptgs2+ CPTC作为连接机械刺激与免疫调节的关键“力-免疫轴”，揭示了针灸抗炎的细胞机制 | 研究局限于腹部中线筋膜组织，未验证其他筋膜区域的普适性 | 探索筋膜组织中特络细胞的细胞景观及其在针灸抗炎中的作用机制 | 大鼠腹部中线筋膜组织和特络细胞亚群 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 细胞形态学数据 | 痢疾大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 477 | 2025-10-05 |
Comprehensive bioinformatics evaluation uncovers the possible oncogenic contribution of acrylamide to endometrial cancer
2025-Oct-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03612-x
PMID:41037154
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研究论文 | 通过生物信息学方法评估丙烯酰胺在子宫内膜癌中的潜在致癌机制 | 首次整合转录组数据和单细胞RNA测序数据，结合机器学习方法系统揭示丙烯酰胺通过关键基因介导子宫内膜癌发生的分子机制 | 需要进一步的实验验证才能将这些发现转化为预防和治疗策略 | 探索丙烯酰胺在子宫内膜癌发生发展中的致癌机制 | 子宫内膜癌转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接 | LASSO回归, 支持向量机, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据集(GSE17025, GSE63678, GSE106191, GSE115810)和单细胞RNA测序数据(PRJNA786266) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 478 | 2025-10-05 |
Mechanisms of dexamethasone-induced bone toxicity in developing bone: a single-cell perspective
2025-Oct, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf146
PMID:41025095
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示地塞米松对发育中骨骼毒性的分子机制 | 首次从单细胞层面系统揭示地塞米松对发育骨骼中成骨细胞、软骨细胞和B细胞谱系的影响 | 研究仅使用C57BL/6JRj雄性小鼠模型，未涉及其他品系或雌性动物 | 阐明地塞米松诱导发育骨骼毒性的分子机制 | 骨骼未成熟的C57BL/6JRj雄性小鼠 | 单细胞生物学 | 骨骼发育障碍 | 单细胞RNA测序，微计算机断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据，影像数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 479 | 2025-10-05 |
Single-cell multiomics reveals multiple adipogenic pathways and diverse multilineage specializations during embryonic fat tail morphogenesis
2025-Oct-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113496
PMID:41019374
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术揭示胚胎期脂肪尾形态发生过程中的多种脂肪生成途径和多样化的多谱系特化 | 首次在脂肪尾绵羊胚胎发育过程中应用单细胞多组学测序，揭示了脂肪沉积的三种主要细胞来源和关键增强子驱动的基因调控网络 | 研究受限于胚胎组织的时间敏感性、有限的组织体积和伦理考量 | 探究哺乳动物胚胎期脂肪生成的细胞起源和分子调控机制 | 脂肪尾绵羊胚胎发育过程中的脂肪组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞多组学测序, scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 胚胎期E50至E80所有脂肪生成阶段的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 480 | 2025-10-05 |
The Role of p53 in Adipocyte Differentiation and Lipid Metabolism in Obese Mice via Transcriptional Regulation of Lgals3
2025-Oct, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.24363
PMID:40897545
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研究论文 | 本研究探讨p53通过转录调控Lgals3在肥胖小鼠脂肪细胞分化和脂质代谢中的作用 | 首次揭示p53通过转录抑制Lgals3调控脂肪细胞分化和脂质代谢的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和3T3-L1细胞系，人类临床相关性需进一步验证 | 研究p53对Lgals3表达的调控作用及其在肥胖代谢中的功能 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠和3T3-L1前脂肪细胞 | 分子生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 双荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀, RT-qPCR, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢表型数据 | 6个肥胖相关微阵列数据集和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |