单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 594 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-29 |
Deciphering lactate/lactylation networks in AML: integrated scRNA-seq and transcriptomics reveal functions and prognostic model
2025-Oct-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14938-8
PMID:41139200
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组学数据，揭示乳酸/乳酸化网络在急性髓系白血病中的功能并构建预后模型 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据系统研究乳酸代谢和组蛋白乳酸化在AML中的预后价值，并构建了基于机器学习的7基因预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要进一步的功能实验验证机制 | 探索乳酸/乳酸化相关基因在急性髓系白血病中的预后价值和分子机制 | 急性髓系白血病患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Western blot | 10种机器学习算法构建的预后模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-10-29 |
ARHGAP11A, a member of Rho GTPase activating protein family, as a prognostic biomarker linked to DNA damage response across pan-cancer
2025-Oct-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15106-8
PMID:41136949
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证，发现ARHGAP11A作为RhoGAP家族成员在泛癌中过表达，与DNA损伤反应和免疫调节相关，是潜在的预后标志物 | 首次在泛癌水平系统分析RhoGAP家族基因，鉴定ARHGAP11A为最显著过表达成员，并揭示其与DNA损伤反应和免疫调节的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要进一步的功能机制研究 | 探究RhoGAP家族基因在癌症中的作用，特别关注ARHGAP11A的生物学功能和临床意义 | 33种癌症类型的10,000多个样本，包括肿瘤组织和癌旁正常组织 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞测序，Western blotting，集落形成实验 | NA | 基因组数据，蛋白质数据，临床数据 | 超过10,000个样本，涵盖33种癌症类型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 423 | 2025-10-29 |
Whole-genome sequencing reveals individual and cohort level insights into chromosome 9p syndromes
2025-Oct-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01563-0
PMID:41137173
|
研究论文 | 本研究通过全基因组测序分析100名9号染色体综合征患者，揭示了个体和队列水平的基因组特征 | 首个大规模9号染色体综合征全基因组测序研究，开发了DiamondsDenovo计算工具和机器学习预测模型 | 样本量相对有限，仅针对9号染色体特定区域 | 深入解析9号染色体缺失和重复综合征的基因组结构特征 | 100名来自9号染色体综合征家庭的个体 | 基因组学 | 染色体异常综合征 | 全基因组测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因组序列数据 | 100名个体 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 424 | 2025-10-29 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2025-Oct-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02830-6
PMID:41125832
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序构建结肠衰老的细胞和空间图谱 | 开发了cSplotch计算框架，利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息，学习与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达层次贝叶斯模型 | 研究仅限于小鼠模型，人类结肠衰老的适用性需要进一步验证 | 研究结肠组织结构和分子回路在衰老过程中的时空动态变化 | 小鼠结肠组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约1,500个小鼠肠道组织, 约400,000个单核RNA测序图谱 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2025-10-29 |
Identification of a PRDM1-regulated T cell network to regulate atherosclerotic plaque inflammation
2025-Oct-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01541-6
PMID:41039608
|
研究论文 | 本研究通过网络分析方法识别了调控动脉粥样硬化斑块炎症的PRDM1调节T细胞网络 | 首次采用加权基因共表达网络分析和贝叶斯网络推断相结合的方法，识别了区分高低风险斑块的PRDM1调控T细胞网络 | 样本量相对有限（人类斑块样本n=43），且PRDM1靶向药物尚未开发 | 探索人类动脉粥样硬化斑块从低风险向高风险转变过程中的免疫基因调控机制 | 人类颈动脉斑块（稳定型和不稳定型）和Ldlr基因敲除小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 贝叶斯网络推断, 单细胞RNA测序, 计算机药物重定位 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 人类颈动脉斑块样本43例（稳定型16例，不稳定型27例），Ldlr基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 426 | 2025-10-26 |
Cholesterol metabolic reprogramming mediates microglia-induced chronic neuroinflammation and hinders neurorestoration following stroke
2025-Oct, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01379-7
PMID:40987840
|
研究论文 | 本研究揭示了胆固醇代谢重编程介导小胶质细胞诱导的慢性神经炎症并阻碍脑卒中后神经修复的机制 | 首次发现缺血性损伤通过胆固醇代谢重编程诱导持续性小胶质细胞活化，并证明通过CYP46A1激活减轻胆固醇负荷可促进白质修复和功能恢复 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未验证在雌性动物中的效果 | 探究脑卒中后慢性神经炎症的机制及胆固醇代谢在其中的作用 | 雄性小鼠和小胶质细胞 | 神经科学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-26 |
Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix Domain Containing 1 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression by Regulating Transforming Growth Factor Beta Receptor 1 in the Tumor Immune Microenvironment
2025-Oct, Genetic testing and molecular biomarkers
IF:1.1Q4
DOI:10.1177/19450265251384161
PMID:41022542
|
研究论文 | 本研究探讨了CHCHD1通过调节TGF-β1信号通路促进肝细胞癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次揭示CHCHD1在肝细胞癌中通过调节TGF-β受体1影响肿瘤免疫微环境的新功能 | 研究样本量相对有限，机制研究主要在细胞系中进行，需要更多体内实验验证 | 探究CHCHD1在肝细胞癌进展中的分子机制及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肝细胞癌组织样本和SMMC-7721细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,免疫浸润分析,蛋白质印迹,细胞迁移/侵袭实验 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 272例HCC组织和50例正常肝组织 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | NA |
| 428 | 2025-10-24 |
Engineering a Lipid Nanoparticle with Atypical Calcium Crystal Structure for Enhanced IFNβ-Mediated Immunotherapy
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202419870
PMID:40605669
|
研究论文 | 本研究开发了一种具有非典型晶体结构的磷酸钙脂质体纳米材料，通过激活干扰素通路增强抗肿瘤免疫治疗 | 发现具有非典型晶体结构和pH响应特性的纳米材料NanoCa，通过Ca-calcineurin-NFATc2-PKCβ-IRF3信号通路激活干扰素，增强抗肿瘤免疫反应 | NA | 开发新型纳米材料以增强免疫检查点抑制剂的治疗效果 | 骨髓源性树突状细胞、CT26肿瘤模型、肿瘤引流淋巴结中的免疫细胞 | 纳米医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-22 |
SAMHD1 deficiency disrupts macrophage autophagy-lysosomal homeostasis and promotes inflammation via the mTOR-MITF-CTSD axis in ulcerative colitis
2025-Oct, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147188
PMID:40886983
|
研究论文 | 本研究揭示了SAMHD1通过调控mTOR-MITF-CTSD轴维持巨噬细胞自噬-溶酶体稳态并抑制溃疡性结肠炎炎症的机制 | 首次发现SAMHD1在溃疡性结肠炎巨噬细胞中的关键调控作用，并阐明其通过mTOR-MITF-CTSD轴影响自噬-溶酶体功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究SAMHD1在溃疡性结肠炎发病机制中的作用及其分子调控机制 | 巨噬细胞、髓系特异性SAMHD1缺陷小鼠、结肠组织 | 分子生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-10-21 |
Novel biomarkers related to mitochondrial permeability transition driven-necrosis in hypertrophic cardiomyopathy
2025-Oct, Journal of cardiology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.jjcc.2025.04.008
PMID:40306461
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和孟德尔随机化分析识别与肥厚型心肌病中线粒体渗透性转换驱动坏死相关的新基因 | 首次结合单细胞RNA测序、转录组测序和孟德尔随机化分析识别HCM中MPTDN相关基因 | NA | 探索线粒体渗透性转换驱动坏死相关基因与肥厚型心肌病的关联 | 肥厚型心肌病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, mRNA-seq, 孟德尔随机化分析, 基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 三个GEO数据集：GSE36961（训练集）、GSE141910（验证集）、GSE174691（单细胞数据集） | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-20 |
Unraveling the Role of MDK-SDC4 Interaction in Pancreatic Cancer-Associated New-Onset Diabetes by Single-Cell Transcriptomic Analysis
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409987
PMID:40709672
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示MDK-SDC4相互作用在胰腺癌相关新发糖尿病中的机制 | 首次发现MDK作为肿瘤细胞与β细胞间的相互作用介质，并通过SDC4受体下调Ras信号通路影响胰岛素分泌 | 未明确说明样本量大小及研究人群的具体特征 | 探索胰腺癌相关新发糖尿病(PCAND)的发病机制并寻找区分PCAND与2型糖尿病的生物标志物 | 胰腺癌细胞、β细胞、PCAND患者和T2DM患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 432 | 2025-10-19 |
Multimodal glioma immunotherapy combining TLR9-targeted STAT3 antisense oligodeoxynucleotides with PD1 immune checkpoint blockade
2025-Oct-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf099
PMID:40214214
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向STAT3的双链反义寡核苷酸联合PD1免疫检查点阻断的多模式胶质瘤免疫疗法 | 开发了细胞选择性的双链STAT3反义寡核苷酸，可特异性靶向胶质瘤细胞和胶质瘤相关髓系细胞而不影响T细胞 | 单药治疗无法达到治愈效果，仅能招募有限数量的耗竭CD8+ T细胞 | 开发胶质母细胞瘤免疫治疗新策略，克服治疗耐药性 | 人U251胶质母细胞瘤异种移植模型、小鼠GL261和QPP8胶质瘤模型 | 生物医学 | 胶质母细胞瘤 | 反义寡核苷酸技术、免疫检查点阻断、空间转录组学 | 动物模型 | 实验数据 | 免疫正常和免疫缺陷小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 433 | 2025-10-17 |
Distinct follicular T cell subsets regulate lymphoma progression and outcomes
2025-Oct-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.013
PMID:40614737
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了滤泡性淋巴瘤中非Tfh滤泡T细胞亚群的异质性及其在肿瘤进展和预后中的作用 | 首次系统鉴定了滤泡性淋巴瘤中转录和空间特征独特的非Tfh滤泡T细胞亚群，并发现其具有抗肿瘤特性和独立预后价值 | 未明确说明样本规模和研究人群特征，机制研究仍需进一步验证 | 探索滤泡性淋巴瘤中滤泡T细胞的异质性及其在疾病进展和预后中的作用机制 | 滤泡性淋巴瘤患者的滤泡T细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴瘤 | 多组学分析、单细胞测序、空间转录组、多重蛋白分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 434 | 2025-10-17 |
Coordinated regulation of cortical astrocyte maturation by OLIG1 and OLIG2 through BMP7 signaling modulation
2025-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.03.008
PMID:40139307
|
研究论文 | 本研究揭示了OLIG1和OLIG2通过调控BMP7信号通路协调皮质星形胶质细胞成熟的分子机制 | 首次发现OLIG1和OLIG2协同调控星形胶质细胞成熟，并阐明其通过直接结合Bmp7增强子抑制表达的作用机制 | NA | 探索皮质星形胶质细胞成熟的调控机制 | 皮质星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除，体内过表达 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-17 |
Comprehensive molecular characterization of craniopharyngiomas using whole transcriptome and spatial transcriptomics approaches
2025-Oct, Brain tumor pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s10014-025-00509-z
PMID:40634824
|
研究论文 | 通过全转录组和空间转录组学方法对颅咽管瘤进行全面的分子特征分析 | 首次结合批量转录组测序和原位空间转录组学技术系统分析颅咽管瘤两种亚型的分子差异 | 样本量相对有限（24个肿瘤样本），健康垂体组织数据来自公共数据库 | 分析颅咽管瘤两种亚型的体细胞突变和基因表达差异 | 颅咽管瘤肿瘤样本（包括ACP和PCP亚型）和健康垂体组织 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序, 空间转录组学, Sanger测序 | 生物信息学分析流程 | 转录组数据, 空间基因表达数据 | 24个肿瘤样本，外加GTEx数据库中的健康垂体数据 | NA | 全转录组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 436 | 2025-10-17 |
Inhibition of Glutamine Metabolism Attenuates Tumor Progression Through Remodeling of the Macrophage Immune Microenvironment
2025-Oct, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400738
PMID:40653724
|
研究论文 | 本研究通过开发谷氨酰胺拮抗剂前药JHU083，探索了抑制谷氨酰胺代谢通过重塑巨噬细胞免疫微环境来抑制肿瘤进展的机制 | 开发了在癌组织中选择性生物活化的谷氨酰胺拮抗剂前药JHU083，并首次系统揭示了其通过同时靶向谷氨酰胺成瘾的癌细胞和调节巨噬细胞M1/M2平衡发挥抗肿瘤作用 | 研究仅限于两种免疫完整的小鼠癌症模型，尚未在人类临床试验中验证 | 评估谷氨酰胺代谢抑制对肿瘤细胞和免疫微环境的影响 | 两种免疫完整的小鼠肿瘤模型和体外骨髓来源的巨噬细胞 | 癌症免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 437 | 2025-10-17 |
Leptin Aggravates Thoracic Aortic Dissection Through Impairment of Energy Metabolism in Nrip2+ Smooth Muscle Cells
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502027
PMID:40667784
|
研究论文 | 本研究探讨瘦素通过影响Nrip2+平滑肌细胞的能量代谢加剧胸主动脉夹层的机制 | 发现新型Nrip2平滑肌细胞亚群及其在瘦素诱导的血管平滑肌细胞表型转换中的保护作用 | 研究主要基于动物模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明肥胖相关瘦素升高在胸主动脉夹层发病机制中的作用 | 瘦素敲除小鼠和胸主动脉夹层患者的血管平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 438 | 2025-10-17 |
PLAUR+ Neutrophils Drive Anti-PD-1 Therapy Resistance in Patients with Hepatocellular Carcinoma by Shaping an Immunosuppressive Microenvironment
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507167
PMID:40673864
|
研究论文 | 本研究揭示PLAUR+中性粒细胞通过塑造免疫抑制微环境驱动肝细胞癌患者抗PD-1治疗耐药 | 首次发现PLAUR+中性粒细胞是免疫治疗耐药的关键驱动因素，并开发出新型PLAUR抑制剂 | NA | 探索肝细胞癌免疫治疗耐药的机制并开发逆转策略 | 肝细胞癌患者和临床前模型中的中性粒细胞亚群 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,多组学分析,基于结构的虚拟筛选 | NA | 转录组数据,空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2025-10-16 |
From Harmony to Discord: Multicellular Coordination in Tissues and Its Rewiring in Cancer
2025-Oct-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3155
PMID:40698653
|
评论 | 讨论CoVarNet计算框架如何通过单细胞和空间转录组学解析多细胞模块在组织中的协调作用及其在癌症中的重编程 | 提出从细胞中心生物学向生态系统水平生物学的概念转变，开发可映射跨组织多细胞模块的通用计算框架 | 模块化组织生物学中仍存在未解决的问题 | 研究组织水平的多细胞协调机制及其在癌症中的重编程 | 35种人体组织中的多细胞模块 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | CoVarNet | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 35种人体组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 440 | 2025-10-16 |
Tumor-resident probiotic Clostridium butyricum improves aPD-1 efficacy in colorectal cancer models by inhibiting IL-6-mediated immunosuppression
2025-Oct-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.07.012
PMID:40780216
|
研究论文 | 本研究鉴定出丁酸梭菌作为益生菌可通过抑制IL-6介导的免疫抑制增强抗PD-1疗法在结直肠癌模型中的疗效 | 首次发现丁酸梭菌表面蛋白secD通过结合GRP78受体抑制PI3K-AKT-NF-κB通路，减少免疫抑制因子IL-6分泌，从而增强免疫检查点阻断疗效 | 研究主要基于小鼠模型和类器官共培养系统，尚未在人体临床试验中验证 | 探索增强结直肠癌免疫检查点阻断疗法疗效的新策略 | 结直肠癌模型、丁酸梭菌、免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 类器官共培养 | NA | 基因表达数据 | 多种结直肠癌模型（原位移植瘤、AOM/DSS诱导模型、无菌小鼠、人源化小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |