单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 591 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-11 |
Biology as vulnerability in follicular lymphoma: genetics, epigenetics, and immunogenetics
2025-Oct-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026020
PMID:40089999
|
综述 | 本文综述了滤泡性淋巴瘤的遗传学、表观遗传学和免疫遗传学特征及其作为治疗脆弱性的生物学基础 | 整合了高通量测序、空间转录组学和成像技术的最新发现，系统阐述了滤泡性淋巴瘤的生物学脆弱性 | 主要基于现有研究综述，缺乏原始实验数据验证 | 探讨滤泡性淋巴瘤的生物学特征及其治疗脆弱性 | 滤泡性淋巴瘤及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 高通量测序, 空间转录组学, 成像技术 | NA | 基因组数据, 表观遗传数据, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 402 | 2025-10-11 |
Profiling the spatial architecture of multiple myeloma in human bone marrow trephine biopsy specimens with spatial transcriptomics
2025-Oct-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025028896
PMID:40643106
|
研究论文 | 使用空间转录组学技术分析多发性骨髓瘤患者骨髓活检样本中的空间结构特征 | 首次应用亚细胞空间转录组学解析多发性骨髓瘤骨髓微环境的空间异质性，发现恶性浆细胞亚群形成不同的微环境 | 样本量相对有限（21例个体），需要更大规模研究验证发现 | 探索多发性骨髓瘤骨髓微环境的细胞和分子特征 | 人类骨髓环钻活检样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 21例个体（7例癌前病变，10例新诊断多发性骨髓瘤，4例健康） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 403 | 2025-10-11 |
Epigenetic dynamics and molecular mechanisms in oncogenesis, tumor progression, and therapy resistance
2025-Oct, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04217-5
PMID:40358685
|
综述 | 本文综述了癌症发生发展过程中遗传、表观遗传和分子机制的动态相互作用，重点关注肿瘤发生、转移和治疗抵抗的关键分子通路 | 整合了分子、遗传和表观遗传多维度视角，强调肿瘤微环境在癌症进展中的作用，并探讨CRISPR-Cas9表观基因组编辑和单细胞RNA测序等前沿技术的应用 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献综合分析 | 阐明癌症发生发展、转移和治疗抵抗的分子机制，为开发创新靶向治疗方法提供理论基础 | 癌症细胞及其分子调控机制，包括肿瘤微环境 | 癌症生物学 | 癌症 | CRISPR-Cas9表观基因组编辑，单细胞RNA测序 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-11 |
Engineering CRISPR System-Based Bacterial Outer Membrane Vesicle Potentiates T Cell Immunity for Enhanced Cancer Immunotherapy
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202501565
PMID:40495695
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR系统的工程化细菌外膜囊泡，用于增强T细胞免疫以改善癌症免疫治疗 | 通过工程化改造大肠杆菌BL21来源的外膜囊泡，实现了多基因的高效包装和递送，显著增强了T细胞的趋化和活化能力 | 研究主要在小鼠模型中进行验证，在人类患者中的有效性和安全性仍需进一步评估 | 开发新型癌症免疫治疗策略，克服免疫检查点阻断治疗的局限性 | 细菌外膜囊泡(OMVs)、T细胞免疫、癌症免疫治疗 | 生物医学工程 | 膀胱癌、乳腺癌 | CRISPR系统、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | MB49和B16F10小鼠肿瘤模型、人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 405 | 2025-10-11 |
Precision Medicine in Surgery: Immunomodulation and Cellular Regeneration Strategies for Immunologic and Surgical Diseases
2025-Oct-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006849
PMID:40698837
|
研究论文 | 本文提出了一种研究lacritin肽对β细胞增殖、胰岛存活和免疫调节作用的方法学框架 | 首次结合体外和体内模型系统研究lacritin肽在免疫调节和细胞再生中的双重作用 | 研究仍处于临床前阶段，需要进一步验证其在人类疾病治疗中的效果 | 开发针对免疫性和外科疾病的精准医疗策略 | 胰岛β细胞、免疫细胞、糖尿病小鼠模型 | 精准医疗 | 自身免疫疾病、糖尿病、克罗恩病、心力衰竭、肺纤维化、慢性肾病、神经损伤 | 质谱流式细胞术、成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、体外胰岛测试、体内移植 | NA | 单细胞测序数据、质谱数据、影像数据 | 非肥胖糖尿病小鼠模型和糖尿病小鼠受体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 406 | 2025-10-08 |
The transcription factor LHX2 mediates and enhances oncogenic BMP signaling in medulloblastoma
2025-Oct, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01488-6
PMID:40148468
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子LHX2在髓母细胞瘤中介导并增强致癌性BMP信号通路的分子机制 | 首次发现LHX2通过转录诱导BMP I型受体ACVR1表达，形成BMP信号的正反馈环路，并证实其在肿瘤干细胞特性和化疗耐药中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，临床转化价值需进一步验证 | 探索BMP信号通路在髓母细胞瘤中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者来源的肿瘤样本和细胞模型 | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学、转录组分析、免疫组织化学、细胞移植 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | 多个髓母细胞瘤亚组的患者来源肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 407 | 2025-10-07 |
scSTD: A Swin Transformer-Based Diffusion Model for Recovering scRNA-Seq Data
2025-Oct, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3570265
PMID:40366848
|
研究论文 | 提出一种基于Swin Transformer和扩散模型的单细胞RNA测序数据恢复方法scSTD | 首次将Swin Transformer架构与潜在扩散模型相结合用于scRNA-seq数据恢复 | 未明确说明方法在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件和技术噪声问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Swin Transformer, 扩散模型, 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 408 | 2025-10-07 |
Human airway epithelial B-cell activating factor is reduced in early life but is virally induced via JAK/STAT
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.04.034
PMID:40409377
|
研究论文 | 本研究揭示了人类气道上皮细胞通过JAK/STAT信号通路调控B细胞活化因子产生，影响早期生命阶段气道B细胞发育和抗病毒免疫应答的机制 | 首次发现婴儿气道上皮细胞BAFF产生减少但可通过病毒刺激激活，并阐明其通过I型和III型干扰素及JAK/STAT信号通路诱导的分子机制 | 研究主要关注儿科人群，缺乏成人对照；机制研究主要在体外进行，需要更多体内验证 | 探究人类气道B细胞发育动态及其与气道上皮细胞的相互作用，特别是在早期生命阶段和病毒感染条件下的变化 | 儿科患者的气道B细胞和气道上皮细胞 | 免疫学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序，PCR确认，体外刺激实验 | NA | 基因表达数据，细胞培养数据 | 不同儿科年龄组的气道样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiling of vitiligo patients shows polar immune dysregulation in involved and uninvolved skin
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.002
PMID:40513622
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示白癜风患者皮损和非皮损区域存在极化的免疫失调现象 | 首次全面揭示白癜风不仅皮损区域存在TH1/干扰素驱动的免疫异常，非皮损区域也表现出明显的TH2和TH17/22相关标志物上调 | 样本量相对有限（15例白癜风样本和14例健康对照），需要更大规模研究验证 | 获取白癜风皮损和非皮损区域的整体皮肤转录组特征 | 白癜风患者的皮损和非皮损皮肤活检样本 | 转录组学 | 白癜风 | RNA测序, 实时PCR, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 基因表达数据 | 15例白癜风皮损和非皮损样本，14例匹配健康对照 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2025-10-06 |
Cell-type-directed network-correcting combination therapy for Alzheimer's disease
2025-Oct-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.06.035
PMID:40695276
|
研究论文 | 提出一种基于细胞类型特异性网络校正的阿尔茨海默病联合疗法 | 首次将单细胞转录组学、药物扰动数据库和临床记录整合，开发细胞类型特异性多靶点药物发现策略 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 开发针对阿尔茨海默病多因素特征的精准联合疗法 | 阿尔茨海默病小鼠模型（同时具有Aβ和tau沉积） | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、临床记录 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 411 | 2025-10-06 |
An inducible model of human post-implantation development derived from primed and naive stem cells
2025-Oct-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.08.005
PMID:40885193
|
研究论文 | 本研究通过结合启动态和初始态人多能干细胞开发了可诱导干细胞胚胎模型，模拟人类植入后早期发育过程 | 首次通过结合启动态hPSC和初始态hPSC来源的转基因诱导胚外细胞，建立了可诱导的干细胞胚胎模型 | 模型尚不完美，存在一定局限性 | 研究人类植入后早期发育过程 | 人类干细胞胚胎模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 可诱导干细胞胚胎模型(iSCBEMs) | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 412 | 2025-10-05 |
Meiotic cohesin RAD21L shapes 3D genome structure and transcription in the male germline
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv2283
PMID:41032613
|
研究论文 | 本研究探讨减数分裂特异性黏连蛋白亚基RAD21L缺失对雄性生殖细胞3D基因组结构和基因表达的影响 | 首次揭示RAD21L在调控减数分裂染色质空间组织和异源染色体端粒相互作用中的关键作用 | 研究主要关注雄性生殖细胞，未涉及雌性生殖系统的相关机制 | 阐明RAD21L在精子发生过程中对3D基因组结构和转录调控的功能 | 雄性生殖细胞（精原细胞和初级精母细胞） | 基因组学 | 生殖系统疾病 | 荧光激活细胞分选, 高通量染色体构象捕获, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组三维结构数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 染色体构象捕获 | NA | NA |
| 413 | 2025-10-05 |
Single-cell atlas of cervical organoids uncovers epithelial immune heterogeneity and intercellular cross-talk during Chlamydia infection
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady1640
PMID:41042872
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示宫颈类器官在衣原体感染期间的免疫异性和细胞间通讯 | 首次整合患者来源宫颈类器官与单细胞转录组技术构建感染期间上皮细胞图谱，发现未感染旁观者细胞在免疫应答中的关键作用 | 研究主要聚焦上皮细胞，其他免疫细胞类型参与程度需进一步验证 | 解析宫颈上皮细胞在病原体感染过程中的免疫协调机制 | 患者来源宫颈类器官和天然宫颈组织 | 单细胞生物学 | 生殖道感染 | 单细胞RNA测序，三维类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据，组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2025-10-05 |
Padlock-designed MOFs triggers an "avalanche effect" to enhance apoptosis and suppress metastasis in central nervous system lymphoma
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv2647
PMID:41042871
|
研究论文 | 开发了一种靶向肠道巨噬细胞的卡铂锁设计MOF系统，通过肠脑轴实现中枢神经系统淋巴瘤的精准治疗 | 首次利用锁设计MOF触发“雪崩效应”，通过肠道巨噬细胞迁移实现脑靶向给药，重新定义了中枢神经系统淋巴瘤的治疗策略 | NA | 克服血脑屏障障碍，开发中枢神经系统淋巴瘤的新型治疗方法 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 生物医学工程 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 415 | 2025-10-05 |
Identification of prognostic genes associated with phase separation in lung adenocarcinoma and construction of prognostic models
2025-Oct-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17884-4
PMID:41044260
|
研究论文 | 本研究通过识别与液-液相分离相关的预后基因构建了肺腺癌预后风险模型 | 首次将液-液相分离相关基因应用于肺腺癌预后预测，并整合单细胞RNA测序数据进行细胞类型特异性表达分析 | 使用公共数据库数据，缺乏外部验证队列 | 开发肺腺癌预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，差异表达分析，LASSO回归，多变量Cox回归 | Cox回归风险模型，列线图 | 基因表达数据，临床数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2025-10-05 |
GWAS-informed data integration and non-coding CRISPRi screen illuminate genetic etiology of bone mineral density
2025-Oct-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03802-4
PMID:41044600
|
研究论文 | 本研究通过整合GWAS数据和单细胞CRISPRi筛选，揭示了骨矿物质密度遗传病因中的效应基因 | 首次将GWAS信息与单细胞CRISPRi筛选相结合，系统识别BMD GWAS位点中的效应基因 | 研究主要基于人类胎儿成骨细胞，可能无法完全代表其他骨细胞类型或体内环境 | 阐明骨矿物质密度GWAS信号中的效应基因及其作用机制 | 人类胎儿成骨细胞和89个非编码调控元件 | 功能基因组学 | 骨质疏松症 | CRISPR干扰筛选, 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 分层LD评分回归 | CRISPRi | 基因组数据, 转录组数据 | 89个非编码元件筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2025-10-05 |
MNDA promotes immunosuppression in microsatellite instability-high colorectal cancer by facilitating PMN-MDSC infiltration via H3K18 lactylation
2025-Oct-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07097-8
PMID:41044625
|
研究论文 | 本研究揭示了MNDA通过促进H3K18乳酸化修饰驱动PMN-MDSC浸润导致MSI-H结直肠癌免疫抑制的新机制 | 首次发现MNDA通过招募EP300介导CXCR2启动子H3K18乳酸化修饰，促进PMN-MDSC浸润和免疫抑制微环境形成 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，需要更大规模的临床验证 | 探索MSI-H结直肠癌对PD-1抑制剂耐药机制并寻找新的治疗靶点 | 微卫星不稳定性高(MSI-H)结直肠癌 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, ChIP-seq, qRT-PCR, Co-IP | 小鼠MC38 MSI-H结直肠癌模型 | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 | PD-1敏感和耐药结直肠癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2025-10-05 |
Integrating bulk RNA-seq, scRNA-seq, and spatial transcriptomics data to identify novel post-translational modification-related molecular subtypes and therapeutic responses in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03964-y
PMID:41044669
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2025-10-05 |
α-hederin inhibits cervical cancer progression by inducing DNA damage-dependent cell cycle blockade and apoptosis
2025-Oct-03, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14920-4
PMID:41044707
|
研究论文 | 本研究探讨α-hederin通过诱导DNA损伤依赖性细胞周期阻滞和凋亡抑制宫颈癌进展的机制 | 首次系统揭示α-hederin通过ATM-CHK1-CDC25B/CDC25C和ATM-P53-P21信号通路调控CDK1/Cyclin B活性，诱导G2M期阻滞的分子机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型，缺乏临床样本验证 | 探索α-hederin治疗宫颈癌的潜力及其作用机制 | 宫颈癌细胞系（SiHa和HeLa）及裸鼠肿瘤模型 | 癌症研究 | 宫颈癌 | 转录组测序, 单细胞测序, 代谢组学, 蛋白质印迹, 免疫荧光, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢物数据 | 两种宫颈癌细胞系和裸鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞测序, 转录组测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 420 | 2025-10-05 |
Cellular and molecular features of acute myeloid leukemia investigation based on single-cell RNA sequencing
2025-Oct-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03962-0
PMID:41044754
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析急性髓系白血病的细胞组成和分子特征 | 首次在单细胞水平系统描绘AML骨髓细胞图谱，发现髓细胞和前髓细胞两个关键细胞类型及其枢纽基因 | 样本量较小（5例患者和3例对照），需要更大规模验证 | 识别AML主要细胞簇及其相关枢纽基因 | 急性髓系白血病患者的骨髓细胞 | 单细胞转录组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例AML患者和3例对照的58,717个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |