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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-10-29 |
ARHGAP11A, a member of Rho GTPase activating protein family, as a prognostic biomarker linked to DNA damage response across pan-cancer
2025-Oct-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15106-8
PMID:41136949
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证,发现ARHGAP11A作为RhoGAP家族成员在泛癌中过表达,与DNA损伤反应和免疫调节相关,是潜在的预后标志物 | 首次在泛癌水平系统分析RhoGAP家族基因,鉴定ARHGAP11A为最显著过表达成员,并揭示其与DNA损伤反应和免疫调节的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能机制研究 | 探究RhoGAP家族基因在癌症中的作用,特别关注ARHGAP11A的生物学功能和临床意义 | 33种癌症类型的10,000多个样本,包括肿瘤组织和癌旁正常组织 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞测序,Western blotting,集落形成实验 | NA | 基因组数据,蛋白质数据,临床数据 | 超过10,000个样本,涵盖33种癌症类型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 382 | 2025-10-29 |
Whole-genome sequencing reveals individual and cohort level insights into chromosome 9p syndromes
2025-Oct-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01563-0
PMID:41137173
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序分析100名9号染色体综合征患者,揭示了个体和队列水平的基因组特征 | 首个大规模9号染色体综合征全基因组测序研究,开发了DiamondsDenovo计算工具和机器学习预测模型 | 样本量相对有限,仅针对9号染色体特定区域 | 深入解析9号染色体缺失和重复综合征的基因组结构特征 | 100名来自9号染色体综合征家庭的个体 | 基因组学 | 染色体异常综合征 | 全基因组测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因组序列数据 | 100名个体 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 383 | 2025-10-29 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2025-Oct-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02830-6
PMID:41125832
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序构建结肠衰老的细胞和空间图谱 | 开发了cSplotch计算框架,利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息,学习与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达层次贝叶斯模型 | 研究仅限于小鼠模型,人类结肠衰老的适用性需要进一步验证 | 研究结肠组织结构和分子回路在衰老过程中的时空动态变化 | 小鼠结肠组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约1,500个小鼠肠道组织, 约400,000个单核RNA测序图谱 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 384 | 2025-10-29 |
Cell Subtype-specific Analysis of Neuronal Membrane Proteasome in Somatosensory Neurons
2025-Oct-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69061
PMID:41144432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞分选技术揭示了神经元膜蛋白酶体在特定感觉神经元亚型中的表达及其在痛觉调节中的关键作用 | 首次在特定外周体感神经元亚群中发现并表征了神经元膜蛋白酶体(NMP),证明其选择性抑制可降低机械和疼痛敏感性而不引起神经病变 | 研究主要基于小鼠模型,在体实验仅限于爪部皮肤,人类相关性尚需进一步验证 | 探究神经元膜蛋白酶体在体感神经元中的细胞亚型特异性表达及其在感觉信号传导中的功能 | 小鼠体感神经元,特别是MrgprA3和Cysltr2神经元亚群 | 神经科学 | 疼痛疾病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选,抗体标记 | NA | 单细胞转录组数据,细胞分选数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 385 | 2025-10-29 |
Identification of a PRDM1-regulated T cell network to regulate atherosclerotic plaque inflammation
2025-Oct-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01541-6
PMID:41039608
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研究论文 | 本研究通过网络分析方法识别了调控动脉粥样硬化斑块炎症的PRDM1调节T细胞网络 | 首次采用加权基因共表达网络分析和贝叶斯网络推断相结合的方法,识别了区分高低风险斑块的PRDM1调控T细胞网络 | 样本量相对有限(人类斑块样本n=43),且PRDM1靶向药物尚未开发 | 探索人类动脉粥样硬化斑块从低风险向高风险转变过程中的免疫基因调控机制 | 人类颈动脉斑块(稳定型和不稳定型)和Ldlr基因敲除小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 贝叶斯网络推断, 单细胞RNA测序, 计算机药物重定位 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 人类颈动脉斑块样本43例(稳定型16例,不稳定型27例),Ldlr基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 386 | 2025-10-26 |
Natural killer cells and IFN-γ protect against liver injury during HAV infection in mice
2025-Oct-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01395-25
PMID:40970716
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了自然杀伤细胞和干扰素-γ在甲型肝炎病毒感染早期对肝脏的保护作用 | 首次在免疫活性小鼠模型中证明NK细胞通过产生IFN-γ抑制HAV复制并保护肝脏,而非引起病理损伤 | 研究使用基因修饰小鼠模型,结果在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 阐明甲型肝炎病毒感染早期NK细胞的免疫应答机制及其在肝脏保护中的作用 | 肝细胞特异性I型干扰素受体敲除小鼠和全局敲除小鼠模型 | 免疫学 | 病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序,基因敲除技术,细胞耗竭实验 | NA | 基因表达数据,血清生化指标,组织病理学数据 | 多种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 387 | 2025-10-26 |
A novel ZIKV-targeted scRNA-seq method for precise quantification of ZIKV RNA
2025-Oct-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01114-25
PMID:40990513
|
研究论文 | 开发了一种新型寨卡病毒靶向单细胞RNA测序方法,用于精确量化单个细胞中的寨卡病毒RNA | 开发了专门针对缺乏poly(A)尾的寨卡病毒RNA的靶向scRNA-seq方法,解决了传统方法检测寨卡病毒RNA的难题 | 研究仅使用免疫健全乳鼠模型,样本量有限,需要在更广泛的模型中验证 | 开发能够精确检测和量化寨卡病毒RNA的单细胞测序方法,并识别易感细胞类型 | 寨卡病毒感染的免疫健全乳鼠脑组织 | 单细胞测序技术 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 寨卡病毒感染和对照乳鼠脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 388 | 2025-10-26 |
Concerted changes in Epithelium and Stroma: a multi-scale, multi-omics analysis of progression from Barrett's Esophagus to adenocarcinoma
2025-Oct-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.034
PMID:40695287
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研究论文 | 通过多尺度多组学分析研究巴雷特食管向腺癌进展过程中上皮和间质的协同变化 | 整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白质组学、组织力学和空间蛋白质组学,首次系统揭示巴雷特食管进展为多组分协调系统 | 样本量相对有限(26名患者的107个样本),需要在更大队列中验证发现 | 阐明巴雷特食管向食管腺癌进展的分子和细胞机制 | 从鳞状上皮经化生、异型增生到腺癌的进展路径样本 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 空间蛋白质组学, 组织力学分析 | 多组学整合分析 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间定位数据, 力学数据 | 26名患者的107个样本,来自两个独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 389 | 2025-10-26 |
Enzyme-converted O kidneys allow ABO-incompatible transplantation without hyperacute rejection in a human decedent model
2025-Oct-03, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01513-6
PMID:41044341
|
研究论文 | 本研究开发了一种供体导向的器官工程策略,通过酶转化将A型肾脏转化为O型肾脏,实现ABO血型不相容肾脏移植 | 首次提出供体导向的脱敏方案,在低温灌注期间通过酶处理去除肾脏A抗原,避免传统受体脱敏方案的并发症 | 研究仅在人类遗体模型中进行,观察时间仅2天,长期效果和安全性需要进一步验证 | 开发ABO血型不相容肾脏移植的新方法,提高器官分配的公平性和可及性 | 人类A型肾脏和O型脑死亡受体 | 器官移植工程 | 终末期肾病 | 酶转化技术,单细胞测序 | NA | 临床观察数据,基因表达数据 | 人类遗体模型研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 390 | 2025-10-26 |
Cholesterol metabolic reprogramming mediates microglia-induced chronic neuroinflammation and hinders neurorestoration following stroke
2025-Oct, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01379-7
PMID:40987840
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研究论文 | 本研究揭示了胆固醇代谢重编程介导小胶质细胞诱导的慢性神经炎症并阻碍脑卒中后神经修复的机制 | 首次发现缺血性损伤通过胆固醇代谢重编程诱导持续性小胶质细胞活化,并证明通过CYP46A1激活减轻胆固醇负荷可促进白质修复和功能恢复 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未验证在雌性动物中的效果 | 探究脑卒中后慢性神经炎症的机制及胆固醇代谢在其中的作用 | 雄性小鼠和小胶质细胞 | 神经科学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 391 | 2025-10-26 |
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-Oct, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251372607
PMID:41020442
|
综述 | 探讨氧化还原机制在微血管生理和病理生理中的作用及其治疗策略 | 强调微血管与大血管对ROS/RNS反应的差异,并指出单细胞RNA测序研究揭示不同血管床内皮细胞的独特基因特征 | 技术挑战限制了可靠关联ROS/RNS水平变化与微血管结果的能力,且缺乏针对微血管氧化还原信号的特效疗法 | 阐明氧化还原机制在微血管功能调节和疾病发病机制中的作用 | 微血管系统及其内皮细胞 | 血管生物学 | 心血管疾病,自身免疫疾病,感染性疾病,血红蛋白病,炎症性疾病,血管炎,代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 392 | 2025-10-26 |
Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix Domain Containing 1 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression by Regulating Transforming Growth Factor Beta Receptor 1 in the Tumor Immune Microenvironment
2025-Oct, Genetic testing and molecular biomarkers
IF:1.1Q4
DOI:10.1177/19450265251384161
PMID:41022542
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研究论文 | 本研究探讨了CHCHD1通过调节TGF-β1信号通路促进肝细胞癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次揭示CHCHD1在肝细胞癌中通过调节TGF-β受体1影响肿瘤免疫微环境的新功能 | 研究样本量相对有限,机制研究主要在细胞系中进行,需要更多体内实验验证 | 探究CHCHD1在肝细胞癌进展中的分子机制及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肝细胞癌组织样本和SMMC-7721细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,免疫浸润分析,蛋白质印迹,细胞迁移/侵袭实验 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 272例HCC组织和50例正常肝组织 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | NA |
| 393 | 2025-10-24 |
Engineering a Lipid Nanoparticle with Atypical Calcium Crystal Structure for Enhanced IFNβ-Mediated Immunotherapy
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202419870
PMID:40605669
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研究论文 | 本研究开发了一种具有非典型晶体结构的磷酸钙脂质体纳米材料,通过激活干扰素通路增强抗肿瘤免疫治疗 | 发现具有非典型晶体结构和pH响应特性的纳米材料NanoCa,通过Ca-calcineurin-NFATc2-PKCβ-IRF3信号通路激活干扰素,增强抗肿瘤免疫反应 | NA | 开发新型纳米材料以增强免疫检查点抑制剂的治疗效果 | 骨髓源性树突状细胞、CT26肿瘤模型、肿瘤引流淋巴结中的免疫细胞 | 纳米医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 394 | 2025-10-22 |
SAMHD1 deficiency disrupts macrophage autophagy-lysosomal homeostasis and promotes inflammation via the mTOR-MITF-CTSD axis in ulcerative colitis
2025-Oct, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147188
PMID:40886983
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研究论文 | 本研究揭示了SAMHD1通过调控mTOR-MITF-CTSD轴维持巨噬细胞自噬-溶酶体稳态并抑制溃疡性结肠炎炎症的机制 | 首次发现SAMHD1在溃疡性结肠炎巨噬细胞中的关键调控作用,并阐明其通过mTOR-MITF-CTSD轴影响自噬-溶酶体功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究SAMHD1在溃疡性结肠炎发病机制中的作用及其分子调控机制 | 巨噬细胞、髓系特异性SAMHD1缺陷小鼠、结肠组织 | 分子生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 395 | 2025-10-21 |
Novel biomarkers related to mitochondrial permeability transition driven-necrosis in hypertrophic cardiomyopathy
2025-Oct, Journal of cardiology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.jjcc.2025.04.008
PMID:40306461
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研究论文 | 本研究通过转录组学和孟德尔随机化分析识别与肥厚型心肌病中线粒体渗透性转换驱动坏死相关的新基因 | 首次结合单细胞RNA测序、转录组测序和孟德尔随机化分析识别HCM中MPTDN相关基因 | NA | 探索线粒体渗透性转换驱动坏死相关基因与肥厚型心肌病的关联 | 肥厚型心肌病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, mRNA-seq, 孟德尔随机化分析, 基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 三个GEO数据集:GSE36961(训练集)、GSE141910(验证集)、GSE174691(单细胞数据集) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 396 | 2025-10-20 |
Unraveling the Role of MDK-SDC4 Interaction in Pancreatic Cancer-Associated New-Onset Diabetes by Single-Cell Transcriptomic Analysis
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409987
PMID:40709672
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示MDK-SDC4相互作用在胰腺癌相关新发糖尿病中的机制 | 首次发现MDK作为肿瘤细胞与β细胞间的相互作用介质,并通过SDC4受体下调Ras信号通路影响胰岛素分泌 | 未明确说明样本量大小及研究人群的具体特征 | 探索胰腺癌相关新发糖尿病(PCAND)的发病机制并寻找区分PCAND与2型糖尿病的生物标志物 | 胰腺癌细胞、β细胞、PCAND患者和T2DM患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 397 | 2025-10-19 |
Multimodal glioma immunotherapy combining TLR9-targeted STAT3 antisense oligodeoxynucleotides with PD1 immune checkpoint blockade
2025-Oct-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf099
PMID:40214214
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向STAT3的双链反义寡核苷酸联合PD1免疫检查点阻断的多模式胶质瘤免疫疗法 | 开发了细胞选择性的双链STAT3反义寡核苷酸,可特异性靶向胶质瘤细胞和胶质瘤相关髓系细胞而不影响T细胞 | 单药治疗无法达到治愈效果,仅能招募有限数量的耗竭CD8+ T细胞 | 开发胶质母细胞瘤免疫治疗新策略,克服治疗耐药性 | 人U251胶质母细胞瘤异种移植模型、小鼠GL261和QPP8胶质瘤模型 | 生物医学 | 胶质母细胞瘤 | 反义寡核苷酸技术、免疫检查点阻断、空间转录组学 | 动物模型 | 实验数据 | 免疫正常和免疫缺陷小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 398 | 2025-10-19 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis identifies B-cell subpopulations and associated cancer subtypes with distinct clinical and molecular characteristics
2025-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01082-5
PMID:40526246
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据识别B细胞亚群及其与癌症预后的关联 | 首次在泛癌水平系统鉴定8个B细胞亚群并构建预后预测模型 | 样本来源和癌症类型仍有限,需要进一步实验验证 | 研究B细胞亚群在癌症中的临床意义和分子特征 | 424名患者的102,504个细胞,涵盖15种癌症类型 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,轨迹分析 | 无监督聚类,预测模型 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据,空间转录组数据 | 102,504个细胞来自424名患者,15种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 399 | 2025-10-18 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Depletion and Dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-Specific Th1 and Th17 Cells Early After Acquisition of Human Immunodeficiency Virus
2025-Oct-15, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf354
PMID:40605619
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了HIV感染早期结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭与功能失调 | 首次在HIV感染前后纵向分析结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞的单细胞转录组特征,发现早期耗竭模式和干细胞样细胞的富集 | 样本量有限,仅对部分个体进行了纵向分析 | 探究HIV感染对结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞频率和功能的影响 | HIV感染者和未感染者的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞 | 单细胞生物学 | 结核病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | HIV感染和未感染个体队列,部分个体纵向采样 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 400 | 2025-10-17 |
Antibiotic treatment limits survival of peripheral and bone marrow B-cell populations
2025-Oct-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024013694
PMID:40668665
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析,揭示了抗生素治疗通过破坏细胞生存信号导致骨髓B细胞耗竭的机制 | 首次发现抗生素治疗会导致骨髓B细胞在所有发育阶段的显著耗竭,并证实这与MYC生存信号通路受损有关,而非干扰素信号中断 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类中进行验证;抗生素的具体种类和剂量影响需进一步研究 | 探究抗生素治疗对骨髓造血系统特别是B细胞群体的影响机制 | 小鼠骨髓造血室和周围B细胞群体 | 免疫学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 粪便微生物群移植 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |