单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 627 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-11-13 |
Spatial transcriptomic profiling of metastatic renal cell carcinoma identifies chemokine-driven macrophage and CD8+ T-cell interactions predictive of immunotherapy response
2025-Oct-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012991
PMID:41043857
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析转移性肾细胞癌，发现预测免疫治疗反应的巨噬细胞和CD8+ T细胞相互作用 | 首次使用高分辨率空间转录组技术揭示转移灶特异性免疫生态位对免疫检查点抑制剂疗效的决定性作用 | 样本量较小（12例初治患者），需要更大规模研究验证 | 开发预测转移性肾细胞癌免疫治疗反应的生物标志物 | 转移性肾细胞癌患者组织样本 | 空间转录组学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 细胞类型反卷积分析 | 空间转录组数据，临床数据 | 12例初治mRCC患者，其中6例提供匹配转移灶样本 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | 10x Visium, NanoString COSMx | 10x Visium空间转录组技术，NanoString COSMx空间分子成像 |
| 382 | 2025-11-13 |
Plasma Exosomes Derived from Patients with Primary Immune Thrombocytopenia Attenuate TBX21+ Regulatory T Cell-Mediated Immune Suppression via MiR-363-3p
2025-Oct, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02275-8
PMID:40032779
|
研究论文 | 本研究揭示了原发性免疫性血小板减少症患者血浆外泌体通过miR-363-3p削弱调节性T细胞免疫抑制功能的分子机制 | 首次发现ITP患者外泌体通过miR-363-3p-ARID3A/SPI1/TBX21轴调控Treg功能，并利用单细胞测序技术鉴定出TBX21高表达的Treg亚群 | 研究样本量未明确说明，机制研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探究原发性免疫性血小板减少症中调节性T细胞功能减弱的分子机制 | 原发性免疫性血小板减少症患者的血浆外泌体和调节性T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫性血小板减少症 | 单细胞测序,Treg功能测定,细胞因子分析 | NA | 单细胞测序数据,功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 383 | 2025-11-09 |
Multi-omics integrative analysis of the mechanisms linking environmental pollutant exposure to bladder cancer pathogenesis
2025-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119251
PMID:41110307
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示环境污染物暴露与膀胱癌发病机制之间的分子联系 | 首次通过整合多组学数据和孟德尔随机化分析，系统构建了环境-基因相互作用网络，识别出三个因果枢纽基因及其与34种高风险污染物的关联 | 研究主要基于现有数据库和队列数据，需要进一步实验验证污染物与基因相互作用的生物学机制 | 探究环境污染物暴露与膀胱癌发病的分子机制 | 膀胱癌相关基因和环境污染物 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 多组学整合分析, 转录组学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 孟德尔随机化 | 孟德尔随机化模型, 分子对接模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 多个膀胱癌队列的转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 384 | 2025-11-09 |
Deciphering the crucial role of IGF2BP3 in modulating stemness traits of salivary adenoid cystic carcinoma
2025-Oct-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03068-7
PMID:41082045
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研究论文 | 本研究系统阐明了IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌干细胞特性调控中的关键作用及机制 | 首次通过单细胞测序数据验证IGF2BP3与SACC干细胞特性的关联，并系统揭示其调控干细胞特性的分子机制 | 未明确IGF2BP3下游具体作用靶点及信号通路细节 | 探究IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌中的功能作用及调控机制 | 唾液腺腺样囊性癌细胞 | 癌症生物学 | 唾液腺腺样囊性癌 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 385 | 2025-11-08 |
Differentiation latency and dormancy signatures define fetal liver hematopoietic stem cells at single-cell resolution
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116289
PMID:40971295
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了胎儿肝脏造血干细胞具有分化延迟和休眠特征 | 首次在单细胞水平鉴定了胎儿肝脏造血干细胞的区分特征，包括分化延迟、细胞分裂对称性和生物合成休眠特征 | 研究主要基于体外培养平台，可能无法完全模拟体内真实微环境 | 探索胎儿肝脏造血干细胞自我更新的内在和外在调控机制 | 胎儿肝脏造血干细胞 | 单细胞分析 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活细胞成像, 移植实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 386 | 2025-11-08 |
CCL26 and CXCL12 preserve insulin-sensitizing macrophages in subcutaneous adipose tissue in obesity
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116450
PMID:41100258
|
研究论文 | 本研究揭示了皮下脂肪组织通过CCL26和CXCL12信号通路维持胰岛素敏感巨噬细胞的新机制 | 首次发现皮下脂肪组织巨噬细胞释放的小细胞外囊泡具有改善胰岛素敏感性的功能，并阐明CCL26和CXCL12信号通路在维持巨噬细胞稳态中的作用 | 研究主要聚焦于肥胖模型，其他代谢疾病状态下的机制尚需进一步验证 | 探究皮下脂肪组织在肥胖中抵抗胰岛素抵抗的保护机制 | 皮下脂肪组织巨噬细胞、小细胞外囊泡、脂肪细胞及其前体细胞 | 代谢疾病研究 | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序, 体内外细胞生长和迁移测量 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 387 | 2025-11-08 |
The multifaceted role of YAP in the tumor microenvironment and its therapeutic implications in cancer
2025-Oct, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01551-9
PMID:41028521
|
综述 | 本文综述了YAP/TAZ在肿瘤微环境中的多重作用及其在癌症治疗中的意义 | 系统阐述了YAP/TAZ作为Hippo信号通路关键效应子在肿瘤微环境重塑中的核心调控作用，及其与免疫治疗联合应用的潜力 | 肿瘤选择性和耐药机制等挑战仍然存在 | 探讨YAP在肿瘤微环境中的作用机制及其治疗意义 | 肿瘤微环境中的YAP/TAZ信号通路 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 388 | 2025-11-07 |
Unraveling enteroendocrine cell lineage dynamics and associated gene regulatory networks during intestinal development
2025-Oct-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.062083
PMID:41117135
|
研究论文 | 本研究通过小鼠胚胎和人类多能干细胞来源的肠道类器官模型，结合单细胞转录组学，揭示了肠道内分泌细胞在发育过程中的谱系动态和基因调控网络 | 首次系统性地揭示了发育过程中肠道内分泌细胞亚型特化的机制，发现其独立于完整的隐窝-绒毛结构和饮食/微生物刺激 | 研究主要基于模型系统，需要进一步在体内验证；某些EEC亚型的出现机制仍需深入探索 | 阐明肠道内分泌细胞在发育过程中的谱系动态和分化机制 | 小鼠胚胎、人类多能干细胞来源的肠道类器官 | 单细胞生物学 | 肠道发育疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠胚胎和人类肠道类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 389 | 2025-11-07 |
Uncovering Cellular Interactome Drivers of Immune Checkpoint Inhibitor Response in Advanced Melanoma Patients
2025-Oct, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-025-00857-y
PMID:41185627
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据构建细胞相互作用网络，识别与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的网络模式 | 首次将肿瘤微环境中的细胞间相互作用建模为加权有向网络，并识别与治疗反应相关的网络模式 | 依赖于公开可用的单细胞RNA测序数据，样本量有限 | 识别与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的细胞相互作用网络驱动因素 | 晚期黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 多元统计学习方法 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 多个黑色素瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 390 | 2025-11-06 |
Translational framework linking perfluoroheptanoic acid (PFHpA) exposure to metabolic dysfunction associated steatotic liver disease in adolescents
2025-Oct-29, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-01168-z
PMID:41162609
|
研究论文 | 开发了一个连接PFHpA暴露与青少年代谢功能障碍相关脂肪肝病的转化研究框架 | 首次将人类队列数据与体外单细胞转录组学整合，揭示短链未受监管的PFAS同系物PFHpA与MASLD的关联 | 样本量相对较小(n=136)，且研究对象仅限于接受减肥手术的肥胖青少年 | 阐明PFAS对代谢功能障碍相关脂肪肝病发展的影响 | 青少年肥胖患者(平均年龄16.8岁)和体外培养的人肝球状体 | 生物医学研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学、肝活检 | LUCID模型 | 血浆样本、蛋白质组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 136名青少年肥胖患者 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 391 | 2025-11-06 |
Invariant HVC size in female canaries singing under testosterone: Unlocking function through neural differentiation, not growth
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426847122
PMID:41115194
|
研究论文 | 通过体内成像和空间转录组学研究发现，睾酮诱导雌性金丝雀唱歌时HVC核团大小保持不变，而是通过神经元表型和基因网络变化实现功能分化 | 挑战了传统认为HVC核团在功能状态转换时会发生显著大小变化的观点，揭示了功能分化可在稳定解剖框架内通过转录组重组实现 | 研究仅针对雌性金丝雀，未验证其他物种或性别；样本数量有限 | 探究睾酮诱导唱歌行为时HVC核团的神经机制变化 | 成年雌性金丝雀的HVC song control nucleus | 神经科学 | NA | 双光子体内成像，空间转录组学 | NA | 图像数据，转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 392 | 2025-11-06 |
Spatial gene expression analysis reveals pathological niches in Japanese encephalitis virus neuroinvasion
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515006122
PMID:41129224
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析日本脑炎病毒在小鼠大脑中的早期感染过程 | 首次在单细胞分辨率下绘制JEV感染过程中病毒RNA和宿主基因表达的空间分布图谱 | 研究仅关注感染早期阶段（1-4天），未涵盖疾病全程发展 | 阐明日本脑炎病毒神经侵袭的细胞动力学和病理生态位 | JEV感染的小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 脑炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠大脑切片（1dpi和4dpi时间点） | NA | 空间转录组学 | NA | 高多重空间转录组平台 |
| 393 | 2025-11-06 |
Single-cell metabolome and RNA-seq multiplexing on single plant cells
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2512828122
PMID:41134629
|
研究论文 | 本研究开发了一种在单个植物细胞上同时进行单细胞代谢组和RNA测序的多重分析技术 | 首次实现在同一植物细胞上同时进行单细胞RNA测序和单细胞质谱代谢组学分析，实现基因表达与代谢物水平的直接比较 | 概念验证研究，样本量有限，仅使用药用植物叶片细胞 | 阐明植物天然产物生物合成途径的基因与代谢物关系 | 药用植物叶片原生质体 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞质谱代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物浓度数据 | 96孔板分选的单个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞代谢组学 | SMART-seq | 微流控机器人分选系统，适用于scMS和SMART-seq单细胞协议 |
| 394 | 2025-11-06 |
Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101323
PMID:41142913
|
研究论文 | 开发了一种结合统计和生物物理模型的混合建模方法，通过基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的机制模型相结合，通过可解释的线性稀疏回归模型将基因表达与生物物理模型参数联系起来 | 模型与数据之间存在不匹配问题，需要通过模拟推理来克服 | 建立基因表达与神经元生理特性之间的联系，理解离子通道基因在决定神经放电特性中的机制作用 | 多种皮层细胞类型的神经元 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学，多模式Patch-seq数据 | Hodgkin-Huxley模型，线性稀疏回归模型 | 基因表达数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 395 | 2025-11-05 |
Hidden network preserved in Slide-tags data allows reference-free spatial reconstruction
2025-Oct-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65295-w
PMID:41173855
|
研究论文 | 通过重新分析Slide-tags数据发现隐藏的细胞-磁珠网络，实现无需参考的空间重建 | 发现Slide-tags数据中意外形成的空间信息细胞-磁珠网络，将其重新定义为基于网络的测序成像方法 | NA | 开发无需预索引阵列的空间组织重建方法 | Slide-tags空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 网络优化模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | Slide-tags | 基于预解码磁珠阵列的空间条形码标记技术 |
| 396 | 2025-11-05 |
Transcriptomic response analysis of rubber tree saplings to water-deficit stress at single-cell resolution
2025-Oct-31, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09046-z
PMID:41174182
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了橡胶树幼苗在水分胁迫下的细胞和分子响应机制 | 首次构建了橡胶树树皮在水分胁迫下的高分辨率单细胞转录组图谱，系统揭示了不同细胞类型对干旱胁迫的响应特征 | 研究仅分析了4天和7天两个时间点的胁迫响应，未涵盖更长期的适应过程 | 探究橡胶树对水分胁迫的分子适应机制，为提升其抗旱性提供理论基础 | 橡胶树幼苗的树皮组织 | 植物生物学 | 非疾病研究（植物胁迫响应） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,994个单个细胞，来自对照、4天和7天干旱胁迫的树皮组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴式单细胞RNA测序技术 |
| 397 | 2025-11-05 |
Pan-Cancer Landscape of Magnesium Homeostasis: Bulk Omics Research and Single-Cell Sequencing Validation
2025-Oct-31, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00294-1
PMID:41174507
|
研究论文 | 本研究全面分析了33种癌症类型中镁稳态的作用，探索其在肿瘤发生、免疫调节和治疗潜力中的意义 | 首次在泛癌水平系统研究镁稳态，结合批量组学分析和单细胞测序验证，提出镁稳态评分作为预后生物标志物 | 需要进一步的临床验证来推进个性化癌症治疗 | 全面分析镁稳态在多种癌症类型中的作用机制 | 33种癌症类型的肿瘤样本和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 多种癌症 | 批量组学分析, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 单细胞测序数据 | 33种癌症类型的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量组学分析 | NA | NA |
| 398 | 2025-11-05 |
From pixels to cell types: a comprehensive review of computational methods for spatial transcriptomics deconvolution
2025-Oct-31, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00055-2
PMID:41174717
|
综述 | 本文全面回顾了空间转录组学反卷积的二十种计算方法，分析其方法论基础和技术特点 | 首次系统对比分析二十种空间转录组反卷积算法的方法论基础、计算原理和处理范式 | NA | 为研究人员提供空间转录组反卷积计算方法的全面理解和实践指导 | 空间转录组反卷积计算方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 399 | 2025-11-05 |
Integrating single-cell RNA-seq datasets with substantial batch effects
2025-Oct-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12126-3
PMID:41168710
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研究论文 | 提出一种基于条件变分自编码器的新方法sysVI，用于整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集 | 采用VampPrior和循环一致性约束，解决了现有方法在整合跨系统数据集时过度去除生物信号的问题 | NA | 开发能够有效整合跨系统单细胞RNA测序数据集的计算方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器(cVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 400 | 2025-11-05 |
egal-1 and microtubules promote regeneration polarity in planarians
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204668
PMID:41099308
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了涡虫头部与尾部再生极性决定的新机制 | 首次发现Egal-1和微管系统共同调控涡虫纵向肌肉纤维中notum基因的不对称表达，从而决定再生极性 | 对纵向肌肉纤维内具体分子机制的理解仍不完整 | 探究涡虫头部与尾部再生极性决定的分子机制 | 涡虫（planarians）及其纵向肌肉细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA干扰，药物处理 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |