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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2025-12-11
Reduced Intestinal GLP-1+ Cell Numbers Are Associated With an Inflammation-related Epithelial Metabolic Signature
2025-Oct-03, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了肠道炎症中GLP-1+细胞数量减少与炎症相关上皮代谢特征之间的关联 首次在多种小鼠模型和克罗恩病患者中一致观察到GLP-1+细胞数量减少,并揭示了线粒体功能障碍在调控L细胞分化中的因果作用 研究主要基于动物模型和体外器官培养,人类样本验证有限,且机制研究尚未完全阐明GLP-1减少如何具体影响炎症过程 探究肠内分泌细胞(特别是GLP-1+ L细胞)在肠道炎症中的作用及其分子机制 小鼠模型(包括白细胞介素-10缺陷小鼠和ClpPΔIEC小鼠)、人类克罗恩病患者黏膜活检样本、以及小鼠和人类肠道类器官 NA 炎症性肠病 单细胞RNA测序、转录组分析、器官培养 NA RNA测序数据、转录组数据 4种不同的小鼠炎症模型、公共单细胞RNA测序数据集中的克罗恩病患者活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2025-12-11
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转变及蚊虫-寄生虫相互作用机制 首次结合单细胞RNA测序与共聚焦显微镜技术,系统解析了疟原虫在蚊媒中肠内的发育轨迹和细胞互作网络,并发现转录因子SIP2对子孢子感染人肝细胞的关键作用 研究主要基于实验室培养的蚊虫-寄生虫体系,虽验证了部分野外来源寄生虫,但自然条件下的复杂互作机制仍需进一步探索 阐明疟原虫在按蚊体内的发育生物学机制及蚊虫-寄生虫相互作用 恶性疟原虫与按蚊的相互作用体系 单细胞生物学 疟疾 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,功能分析 NA 单细胞转录组数据,显微成像数据 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊虫细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
23 2025-12-11
The immune landscape of pediatric (extra)cranial solid tumors: A systematic review and integration of immunohistochemistry and single-cell RNA sequencing data
2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
系统综述 本文通过整合免疫组化和单细胞RNA测序数据,系统性地综述了儿童(颅)外实体瘤的免疫微环境特征 首次系统性地整合了免疫组化和单细胞/单核RNA测序数据,对儿童实体瘤的免疫景观进行了全面分析,并创建了公开可用的交互式热图图谱 纳入研究的方法学存在异质性,且部分肿瘤类型的数据仅来自单一技术 阐明儿童(颅)外实体瘤的独特免疫微环境,以指导针对儿童癌症的免疫治疗策略的开发与选择 儿童脑肿瘤和颅外实体瘤 数字病理学 儿童实体瘤 免疫组化,单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA 图像,测序数据 共73项研究,包含2187个肿瘤样本(IHC)和272个肿瘤样本(sc/snSeq) NA 单细胞RNA-seq NA NA
24 2025-12-10
Nonhuman Primate Model of Super-selective Intra-arterial Ophthalmic Arterial Interventional Thrombolysis for Treatment of Ophthalmic Arterial Embolism Resulting From Hyaluronic Acid Filler Cosmetic Injection
2025-Oct-16, Aesthetic surgery journal IF:3.0Q1
研究论文 本研究建立了一种非人灵长类动物模型,用于模拟眼动脉栓塞及超选择性眼动脉内介入溶栓治疗,以评估透明质酸填充剂注射后视网膜缺血再灌注的疗效 首次在非人灵长类动物中建立眼动脉栓塞模型,并应用单细胞RNA测序技术分析视网膜细胞在缺血再灌注过程中的分子变化 研究样本量较小,且模型可能无法完全模拟人类临床情况的复杂性 评估眼动脉内溶栓治疗对透明质酸填充剂注射所致眼动脉栓塞后视觉功能改善的有效性,并建立临床相关的视网膜缺血再灌注模型 恒河猴(非人灵长类动物) 数字病理学 眼科疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、数字减影血管造影、眼底荧光血管造影、视网膜电图、组织学染色、透射电子显微镜 NA 基因表达数据、影像数据、电生理数据、组织学数据 未明确说明具体样本数量,但涉及多个时间点(立即、1、4、24小时)的干预 NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2025-12-10
Computer Vision Methods for Spatial Transcriptomics: A Survey
2025-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
综述 本文首次系统性地综述了计算机视觉AI模型在空间转录组学分析中的应用,涵盖架构、学习范式、任务和数据集,并追踪其技术演变 首次系统性地综述计算机视觉方法在空间转录组学中的应用,强调其超越传统生物信息学、整合形态学与分子状态、以及解决ST技术限制(如高成本、临床适用性有限、2D分析限制)的新视角 作为一篇综述文章,未直接进行实验研究,因此不涉及具体模型或数据的局限性;但文中讨论了ST技术本身的限制(如高成本、2D分析) 综述计算机视觉AI模型在空间转录组学分析中的应用,探索其如何利用组织学图像增强空间转录组数据分析,并推动基础研究和临床实践 空间转录组学数据及相关计算机视觉AI模型 计算机视觉 NA 空间转录组学 NA 图像(组织学图像)和空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
26 2025-12-10
Islet-intrinsic sex differences in inflammatory signaling contribute to autoimmune diabetes susceptibility
2025-Oct-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了胰岛内在的性别差异在炎症信号传导中的作用,以解释1型糖尿病(T1D)的性别偏向易感性 揭示了男性胰岛对促炎细胞因子反应更强烈,而雌激素(E2)能抑制炎症信号并降低β细胞免疫原性,为性别偏向的T1D易感性提供了机制性见解 研究主要基于体外实验和NOD小鼠模型,人类样本的临床验证有限,且未全面探索其他性激素或长期效应 探究性别特异性胰岛炎症反应如何影响1型糖尿病的易感性差异 人类胰岛、小鼠β细胞、非肥胖糖尿病(NOD)小鼠 NA 1型糖尿病 转录组学分析、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 NA 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 人类胰岛来自男性和女性供体,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
27 2025-12-10
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2025-Oct-07, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了镰状细胞贫血中I型干扰素信号驱动的造血干细胞向髓系分化的转录重编程机制 首次发现镰状细胞贫血中I型干扰素信号异常激活导致造血干细胞转录重编程,并揭示其对G-CSF的意外反应性 未明确I型干扰素信号激活的具体上游触发因素,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 探究镰状细胞贫血中病理性髓系生成和炎症的内在机制 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞 单细胞组学 镰状细胞贫血 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
28 2025-12-09
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Oct-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
研究论文 本文介绍了REMODEL试验的设计和基线特征,旨在通过多模态方法探究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾病中的肾脏特异性效应和作用机制 该试验首次结合MRI成像、肾脏活检以及单核和空间转录组学等多维技术,系统研究GLP-1受体激动剂在糖尿病肾病中的机制 样本量相对较小(106名参与者),且研究周期为52周,可能无法完全捕捉长期效应 探究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾病患者中的肾脏保护作用机制 患有2型糖尿病和慢性肾病的成年人 NA 2型糖尿病和慢性肾病 磁共振成像(MRI)、单核转录组学、空间转录组学、病理学和组织学评估 NA 影像数据、组织样本数据、临床生化数据 106名参与者(其中33名为肾脏活检亚组) NA 单核转录组学, 空间转录组学 NA NA
29 2025-12-09
A Dynamic DNA Nano-Antioxidant Targeting Galectin-3 Attenuates Liver Fibrosis via Reducing Macrophage Oxidative Stress
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了一种靶向Galectin-3的动态DNA纳米抗氧化剂,通过减少巨噬细胞氧化应激来减轻肝纤维化 利用单细胞RNA测序识别Galectin-3与巨噬细胞氧化应激的正相关性,并设计动态DNA纳米结构实现肝巨噬细胞特异性siRNA递送 研究基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证,且长期安全性和脱靶效应需进一步评估 开发靶向治疗肝纤维化的纳米递送平台,以减轻巨噬细胞介导的氧化应激 肝巨噬细胞和Galectin-3蛋白,在CCl4诱导的小鼠肝纤维化模型中测试 生物医学工程 肝纤维化 单细胞RNA测序,IVIS成像,转录组分析 NA 基因表达数据,荧光成像数据 CCl4诱导的小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2025-12-09
Scaling Large Language Models for Next-Generation Single-Cell Analysis
2025-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文基于Cell2Sentence框架,通过训练大型语言模型(LLMs)整合单细胞RNA测序数据和文本信息,以提升单细胞分析的预测和生成能力 将单细胞RNA测序数据表示为文本“细胞句子”,并训练参数达270亿的大型语言模型,实现转录组和文本数据在空前规模上的统一,支持多细胞上下文信息合成的高级下游任务 模型在训练期间未见过的人类细胞模型中进行了实验验证,但可能存在其他未知细胞类型或条件的泛化限制 开发可扩展、灵活且能整合文本信息的下一代单细胞分析平台 单细胞RNA测序数据、生物文本和元数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 大型语言模型(LLMs) 文本 包含超过十亿个转录组数据、生物文本和元数据标记的语料库 NA 单细胞RNA-seq NA NA
31 2025-12-09
A Single-Cell Atlas of Transcriptional and Immunoglobulin Repertoire Evolution in Early B Cell Development
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,深入分析了早期B细胞发育过程中的转录组和免疫球蛋白库演化,揭示了重组事件后的增殖爆发和库特征变化 首次在单细胞水平上对早期B细胞发育进行深度转录组和免疫球蛋白库分析,发现了前B细胞阶段BCR重组后未描述的增殖爆发现象 研究仅基于六名健康供体,样本量相对有限,且未涵盖疾病状态或更广泛的个体差异 探究早期B细胞发育中转录组和免疫球蛋白库的演化规律,理解成熟免疫库多样性的形成基础 人类骨髓中的B细胞,包括从祖细胞到成熟B细胞的不同发育亚群 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 65,110个B细胞,来自六名健康供体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
32 2025-12-09
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Oct-07, Research square
研究论文 本文介绍了一种名为VISTA的新方法,用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平 VISTA结合了变分推断和几何深度学习,联合建模scRNA-seq和SST数据,并引入不确定性量化,以解决SST技术基因检测数量有限的问题 NA 旨在通过预测未观测基因的表达,增强空间转录组学数据的分析能力 空间转录组学数据 数字病理学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 几何深度学习 基因表达数据 四个SST数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
33 2025-12-09
Spatiotemporal dynamics of neuron differentiation and migration in the developing human spinal cord
2025-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序和原位测序技术,揭示了人类和小鼠脊髓发育过程中神经元分化和迁移的时空动态与调控机制 首次在人类脊髓发育的早期阶段(Carnegie Stages 16-21)系统描绘了神经元分化和迁移的时空动态,并识别了跨物种保守的关键转录因子 研究主要聚焦于胚胎发育的特定阶段(CS16-21/E8.0-11.5),未涵盖更晚期的发育或成熟过程 探究人类脊髓发育过程中神经元亚型特化和迁移的分子机制 人类和小鼠胚胎脊髓组织 单细胞组学 神经系统发育 单细胞转录组测序, 原位测序, 空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据 人类脊髓样本(CS16-21阶段)和小鼠脊髓样本(E8.0-11.5阶段) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
34 2025-12-08
FLT3LG as an inflammatory hub bridging tumor immune surveillance to therapy response in breast cancer
2025-Oct-29, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和炎症基因网络分析,发现FLT3LG作为乳腺癌中关键的炎症枢纽,连接肿瘤免疫监视与治疗反应,并评估其作为预后和治疗靶点的潜力 首次基于单细胞RNA测序和炎症基因网络分析,将FLT3LG识别为乳腺癌中连接免疫监视与治疗反应的关键炎症枢纽,并揭示其与特定基因突变模式(如PIK3CA和TP53)及免疫检查点抑制剂反应的关联 研究主要基于相关性分析,缺乏直接的体内或体外功能验证实验来证实FLT3LG的因果作用机制 探索乳腺癌中炎症驱动的免疫失调机制,并寻找新的预后标志物和治疗靶点 乳腺癌患者队列及其肿瘤组织样本 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,基因网络分析 NA RNA测序数据,基因表达数据 多个患者队列(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
35 2025-12-08
Positionally distinct interferon-stimulated dermal immune-acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet syndrome
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了Sweet综合征皮肤中干扰素激活的成纤维细胞在促进中性粒细胞招募中的关键作用 首次在Sweet综合征中识别出位置不同的干扰素激活成纤维细胞亚群,并阐明其通过I型干扰素识别和趋化因子表达驱动中性粒细胞浸润的机制 研究基于存档临床样本,样本量有限;功能验证主要在体外细胞培养中进行,缺乏体内模型验证 阐明Sweet综合征的细胞和分子景观,特别是中性粒细胞浸润的机制 Sweet综合征、坏疽性脓皮症患者及健康对照的皮肤样本 数字病理学 皮肤疾病 单细胞转录组学、空间转录组学、bulk RNA-seq NA 转录组数据、空间定位数据 存档临床皮肤样本(Sweet综合征、坏疽性脓皮症患者及健康对照) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
36 2025-12-07
Emerging Roles of Megakaryocytes in Immune Regulation and Potential Therapeutic Prospects
2025-Oct-27, Cells IF:5.1Q2
综述 本文综述了巨核细胞在传统血小板生成功能之外,在免疫调节、造血干细胞微环境调控以及应对病理生理刺激中的新兴作用 揭示了巨核细胞群体的显著异质性及其在止血、免疫和再生过程中的整合作用,并探讨了其作为治疗靶点在再生医学和免疫疗法中的潜力 NA 探讨巨核细胞在免疫调节中的新兴功能及其治疗应用前景 巨核细胞 NA NA 成像技术,单细胞转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
37 2025-12-07
Matrix stiffness induces endothelial network senescence
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种三维人类模型,揭示了细胞外基质硬化通过机械应力诱导内皮细胞衰老的机制 开发了能够将机械应力与炎症或生化输入解耦的三维人类模型,首次证明在没有炎症信号的情况下,基质硬化可通过Notch-JNK-FOS信号轴诱导内皮细胞衰老表型 模型可能无法完全模拟体内复杂的微环境,临床样本仅限于合成乳房植入物患者的纤维化包膜组织 研究细胞外基质硬化如何通过机械应力驱动内皮细胞衰老,以理解组织功能衰退的机制 内皮细胞、三维人类内皮网络模型、患者纤维化包膜组织 细胞生物学 衰老相关疾病 单细胞RNA测序 三维人类模型 基因表达数据、组织样本 患者纤维化包膜组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
38 2025-12-07
Activated MAFB in ovarian cancer promotes cytoskeletal remodeling and immune microenvironment suppression by interfering with m6A modifications through WTAP competition
2025-Oct, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究揭示了MAFB通过竞争性结合m6A甲基转移酶复合物核心组分WTAP,干扰m6A修饰,从而促进卵巢癌细胞骨架重塑和免疫微环境抑制的新机制 首次发现MAFB通过竞争性结合WTAP干扰m6A修饰的非经典调控轴,将转录调控与表观转录组修饰联系起来,并鉴定出MAFB-WTAP-CD55轴作为卵巢癌的潜在治疗靶点 NA 阐明卵巢癌免疫逃逸的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 卵巢癌 计算生物学 卵巢癌 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 多个临床队列和单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2025-12-06
Identification of C1QA as a prognostic marker and regulator of immunosuppressive neutrophils in early-stage lung adenocarcinoma through integrated bioinformatics analyses
2025-Oct-31, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析,鉴定出C1QA是早期肺腺癌的预后标志物,并揭示了其通过调节免疫抑制性中性粒细胞影响肿瘤微环境的机制 首次在早期肺腺癌中系统性地将C1QA鉴定为与中性粒细胞丰度相关的关键枢纽基因,并利用单细胞RNA测序和细胞通讯分析阐明了其通过补体受体与中性粒细胞相互作用、驱动免疫抑制性肿瘤微环境的具体机制 研究主要基于公开的基因表达数据集和生物信息学分析,实验验证相对有限;结论需要在更大规模的独立队列和体内模型中进一步验证 探究早期肺腺癌中中性粒细胞的分子调控机制,并寻找相关的预后标志物和治疗靶点 早期肺腺癌患者样本、基因表达数据、中性粒细胞、巨噬细胞 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、CIBERSORTx反卷积分析、RT-qPCR、免疫荧光染色 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 基于公共数据集GSE31210等,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
40 2025-12-06
Spatiotemporal transcriptomic and metabolomic landscapes of wild soybean seed development reveal regulatory mechanisms of nutrient accumulation
2025-Oct-29, Plant communications IF:9.4Q1
研究论文 本研究结合空间转录组学和代谢组学,解析了野生大豆种子发育中期细胞分化和养分积累的时空动态机制 首次在野生大豆种子发育中期整合空间转录组学和代谢组学分析,揭示了胚胎背腹侧薄壁细胞在蛋白质和脂质代谢途径上的空间分化模式,并鉴定出关键调控基因GsMAPK23-4 研究仅聚焦于种子发育中期阶段,未涵盖完整的发育过程;功能验证仅在基因敲除突变体中进行 解析野生大豆种子发育过程中细胞分化和养分积累的时空调控机制 野生大豆(Glycine soja)种子 空间转录组学 NA 空间转录组学,代谢组学 NA 空间转录组数据,代谢组数据 野生大豆种子发育中期样本 NA 空间转录组学 NA NA
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