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当前共找到 592 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-01 |
A multi-omics approach reveals dysregulated TNF-related signaling pathways in circulating NK and T cell subsets of young children with autism
2025-10, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00349-z
PMID:40739030
|
研究论文 | 采用多组学方法揭示幼儿自闭症谱系障碍循环NK和T细胞亚群中TNF相关信号通路失调 | 首次结合转录组、蛋白质组和单细胞RNA-seq多模态方法，在2-4岁阿拉伯自闭症儿童队列中系统分析免疫失调机制，发现JAK3、CUL2和CARD11基因与症状严重度负相关，并揭示TRAIL、RANKL和TWEAK信号通路在特定免疫细胞亚群中的失调 | 样本量有限且仅针对阿拉伯儿童，未包含其他族群；单细胞RNA-seq分析未深入探讨细胞亚群功能状态；缺乏纵向数据评估免疫变化的动态过程 | 探究幼儿自闭症谱系障碍中外周免疫失调的分子机制 | 2-4岁阿拉伯自闭症儿童及其匹配对照人群 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | NGS, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq, 靶向转录组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | 卡塔尔2-4岁阿拉伯自闭症儿童队列及匹配对照（具体数量未在摘要中说明） | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | NA |
| 22 | 2026-05-01 |
Molecular stratification of prostate cancer through sensory perception-related multi-omics analysis reveals chemoresistant mechanisms
2025-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01099-w
PMID:40828231
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研究论文 | 通过感官知觉相关多组学分析揭示前列腺癌分子分型及化疗耐药机制 | 首次将感官知觉相关mRNA和lncRNA整合进行多组学分析，识别出三个与化疗耐药和免疫微环境重塑相关的前列腺癌分子亚型，并发现TNF-CCL20轴是免疫抑制信号和耐药性的核心介质 | 未提及具体局限性 | 探究感官知觉通路在前列腺癌进展中的作用，揭示化疗耐药机制 | 前列腺癌患者组织样本和血清样本 | 机器学习 | 前列腺癌 | 多组学分析、scRNA-seq、TIDE、ESTIMATE、NicheNet | 共识聚类、单细胞轨迹分析 | 基因表达数据（mRNA和lncRNA）、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-05-01 |
Integrating multi-modal transcriptomics identifies cellular subtypes with distinct roles in PDAC progression
2025-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01100-6
PMID:40855036
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研究论文 | 通过整合多种转录组学技术，识别了胰腺导管腺癌进展中具有不同作用的细胞亚型 | 首次结合单细胞RNA测序、Visium空间转录组学、批量RNA测序和高分辨率Xenium空间转录组学，构建了PDAC肿瘤微环境的综合转录组图谱，并揭示了两种对立细胞程序的空间组织 | 仅对两个样本进行了高分辨率Xenium空间转录组学验证，样本量有限 | 阐明胰腺导管腺癌肿瘤微环境中细胞成分的空间和功能组织 | 胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的细胞亚型（POSTN⁺成纤维细胞、SPP1⁺巨噬细胞、CCL4⁺ CD8⁺效应T细胞、IGHG1⁺浆细胞） | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq, Visium空间转录组学, 批量RNA-seq, Xenium空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 单细胞RNA测序88个样本（187,520个细胞），Visium空间转录组学20个样本（67,933个点），批量RNA测序1,383个样本，Xenium空间转录组学2个样本（307,679个细胞） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, 10x Xenium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学，10x Xenium高分辨率空间转录组学 |
| 24 | 2026-04-30 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Depletion and Dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-Specific Th1 and Th17 Cells Early After Acquisition of Human Immunodeficiency Virus
2025-Oct-15, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf354
PMID:40605619
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示HIV感染早期后结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭与失调 | 首次纵向研究HIV感染前后Mtb特异性CD4 T细胞的单细胞RNA测序，揭示早期感染后Th1/Th17细胞优先耗竭及转录调控异常 | 未提及具体局限性 | 评估HIV感染对Mtb特异性CD4 T细胞频率和功能的影响 | HIV阳性与阴性个体中的Mtb特异性CD4 T细胞 | 单细胞转录组学 | 结核病、HIV感染 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 部分个体在HIV感染前后进行纵向单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-04-29 |
Glutamine synthetase loss in β-catenin-mutant hepatocellular carcinoma promotes tumor burden through macrophage metabolic reprogramming
2025-Oct-23, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001591
PMID:41129335
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研究论文 | 探讨β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失通过巨噬细胞代谢重编程促进肿瘤负荷的机制 | 首次揭示β-连环蛋白突变肝癌中谷氨酰胺合成酶缺失后，巨噬细胞通过代谢适应从免疫监视转向免疫抑制，并证明巨噬细胞谷氨酰胺合成酶条件性删除可减轻肿瘤负荷 | 研究主要基于小鼠模型和TCGA数据分析，人类患者样本的验证可能有限 | 研究β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失对肿瘤发展的影响 | β-连环蛋白突变肝细胞癌患者和小鼠模型 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞空间转录组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | TCGA数据库包含CTNNB1突变肝癌患者样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2026-04-29 |
Comparative transcriptomics reveals shifts in cortical architecture at the metatherian/eutherian transition
2025-Oct-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.03.680397
PMID:41256371
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研究论文 | 通过比较转录组学揭示有袋类/真兽类过渡期皮层结构的演变 | 首次利用单核RNA测序和空间转录组学比较有袋类与真兽类哺乳动物初级视皮层的细胞类型和层状结构，揭示皮层柱在进化中的重塑特征 | 仅比较两个物种（小鼠和一种有袋类），样本代表性有限；未直接验证功能差异 | 探究有袋类与真兽类哺乳动物分叉后皮层柱细胞类型特异性组织的变化 | 有袋类动物（具体物种未提及）和小鼠的初级视皮层 | 神经科学 | NA | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 两种哺乳动物物种（有袋类和小鼠）的初级视皮层样本 | 10x Genomics, Illumina | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', Illumina NovaSeq测序平台 |
| 27 | 2026-04-25 |
Data-driven fine-grained region discovery in the mouse brain with transformers
2025-Oct-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64259-4
PMID:41057352
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研究论文 | 使用Transformer模型实现小鼠大脑空间转录组学数据的细粒度区域发现 | 提出一种自监督框架CellTransformer，可扩展到百万细胞级MERFISH和Slide-seqV2数据集，并实现跨组织切片的细胞整合 | 未讨论模型在非脑组织或低分辨率空间数据中的泛化能力 | 建立自监督空间域检测流程，用于发现小鼠大脑中的精细组织区域 | 小鼠大脑组织 | 数字病理学 | 神经科学 | MERFISH, Slide-seqV2 | Transformer (编码器-解码器架构) | 空间转录组数据 | 4只小鼠的900万个细胞，超过200个组织切片 | Vizgen, 10x Genomics | 空间转录组学 | MERFISH, Slide-seqV2 | MERFISH全脑成像系统，Slide-seqV2空间转录组学平台 |
| 28 | 2026-04-25 |
Single-cell nanodroplet processing proteomics pipeline for analysis of human-derived microglia
2025-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.02.680067
PMID:41256374
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研究论文 | 提出了基于FACS辅助分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程，用于分析人类死后脑皮层来源的小胶质细胞 | 首次将纳米液滴处理技术与FACS辅助分离和冷冻保存相结合，实现对死后人脑小胶质细胞的单细胞蛋白质组学分析 | 样本来源仅限于死后脑组织，可能无法完全反映活体状态；作为概念验证，样本量有限 | 开发单细胞蛋白质组学方法以探索小胶质细胞的异质性 | 人类死后脑皮层来源的小胶质细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 单个小胶质细胞 | NA | 单细胞质谱蛋白质组学 | NA | 基于FACS辅助分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程 |
| 29 | 2026-04-25 |
The Landscape of SPP1 + Macrophages Across Tissues and Diseases: A Comprehensive Review
2025-10, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13952
PMID:40395129
|
综述 | 系统总结了分泌型磷蛋白1阳性巨噬细胞在不同组织和疾病中的功能与适应性 | 通过跨疾病比较揭示了SPP1+巨噬细胞的共享特征和组织特异性差异，为其治疗靶向提供新视角 | 基于现有单细胞测序研究进行综述，可能受限于各研究的方法学差异和样本异质性 | 综合解析SPP1+巨噬细胞在肿瘤与非肿瘤疾病中的作用及其微环境适应性 | SPP1+巨噬细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-04-25 |
Microglia-neuron crosstalk through Hex-GM2-MGL2 maintains brain homeostasis
2025-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09477-y
PMID:40769205
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研究论文 | 通过脂质组学、空间脂质成像、单细胞转录组学和细胞特异性突变体，发现小胶质细胞通过Hex-GM2-MGL2通路与神经元交互，维持脑稳态 | 首次揭示小胶质细胞通过溶酶体酶β-己糖胺酶将GM2神经节苷脂降解物传递给神经元的新型交互模式，并阐明该通路失调导致神经退行性病变的机制 | 主要基于小鼠模型，人类患者数据有限；具体机制细节尚需进一步验证 | 探究小胶质细胞与神经元在维持脑稳态中的相互作用机制 | 小胶质细胞与神经元之间的通讯 | 机器学习 | 神经退行性疾病（桑德霍夫病） | 脂质组学、空间脂质成像、单细胞转录组学 | NA | 图像、文本 | 小鼠模型和人类患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 31 | 2026-04-25 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies a Unique Macrophage Population in a Mouse Model of Ozone-induced Asthma Exacerbation
2025-Oct, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0358OC
PMID:40106801
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定臭氧诱导哮喘加重小鼠模型中独特的巨噬细胞群体 | 首次在臭氧诱导哮喘加重模型中利用单细胞RNA测序无偏地分析肺部免疫细胞，发现DRA+O暴露后独特的肺泡巨噬细胞和单核细胞亚群与气道高反应性相关 | 机制探索仍需进一步验证，且模型为小鼠，结果向人类转化需谨慎 | 探究臭氧吸入触发哮喘气道高反应性的免疫细胞机制 | 小鼠肺部免疫细胞，特别是肺泡巨噬细胞和单核细胞 | 机器学习和数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肺部细胞样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-04-24 |
Antibiotic treatment limits survival of peripheral and bone marrow B-cell populations
2025-Oct-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024013694
PMID:40668665
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研究论文 | 本研究评估了抗生素暴露小鼠模型中的骨髓造血区室，发现抗生素处理导致骨髓B细胞在所有发育阶段显著耗竭 | 首次通过单细胞RNA测序揭示抗生素处理导致骨髓B细胞在所有发育阶段显著耗竭，并发现该耗竭与MYC生存信号下调相关，而非依赖于干扰素信号 | 粪便菌群移植未能有效恢复外周或骨髓B细胞群体，提示抗生素的细胞毒性效应和菌群耗竭共同作用 | 探究抗生素处理对骨髓造血区室和B细胞发育的影响及其机制 | 抗生素处理小鼠模型中的骨髓B细胞和外周B细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据 | 抗生素处理小鼠模型，具体样本数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 33 | 2026-04-24 |
Targeting tumor-intrinsic TAK1 triggers anti-tumor immunity and sensitizes pancreatic cancer to checkpoint blockade
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681226
PMID:41280086
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研究论文 | 本文揭示TAK1在胰腺导管腺癌中维持基因组完整性并调节肿瘤免疫微环境的作用，通过抑制TAK1增强免疫检查点阻断疗法的效果 | 首次发现TAK1作为TGF-β通路的关键激酶在胰腺癌中异常激活，并阐明其通过磷酸化EphA2/RAD51轴维持DNA修复、抑制cGAS-STING通路的新机制 | 未明确临床转化中TAK1抑制剂的长期毒性及耐药机制，且结果主要基于小鼠模型需进一步在人类样本中验证 | 探索胰腺癌中TGF-β信号通路的新型治疗靶点，以逆转免疫抑制性肿瘤微环境 | 人类和小鼠胰腺导管腺癌组织、肿瘤CD8 T细胞共培养体系、基因工程小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组化、流式细胞术、蛋白质组学、共培养体系 | NA | 图像、文本 | 人类胰腺癌样本（具体数量未提及）、基因工程小鼠模型（p48-Cre;TP53 flox/flox;LSL-KRAS G12D） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-04-24 |
eNAMPT Is a Novel DAMP and Therapeutic Target in Human and Murine Pulmonary Fibrosis
2025-Oct, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0342OC
PMID:40126452
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研究论文 | 本研究探究eNAMPT作为人类和小鼠肺纤维化中的新型DAMP及治疗靶点的作用 | 首次证明eNAMPT是特发性肺纤维化的可药物靶点，并验证了ALT-100单克隆抗体的中和治疗效果 | 研究主要基于动物模型和体外实验，缺乏大规模的临床验证 | 评估eNAMPT作为肺纤维化治疗靶点的可行性及其抗体的疗效 | 特发性肺纤维化患者和小鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 生化数据, 组织学图像 | 人类样本：血浆、外周血单个核细胞和肺组织；小鼠样本：博来霉素诱导的肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-04-23 |
Disrupted developmental signaling induces novel transcriptional states
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418351122
PMID:41118206
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAISEE的新算法，用于建模单细胞数据集中的扰动响应，并应用于斑马鱼胚胎中ERK信号通路的研究 | 开发了DAISEE算法，能更有效地在复杂实验设计中分离单细胞扰动响应与混杂变异，并揭示了过激活信号通路在发育胚胎中诱导新基因表达状态的能力 | NA | 研究发育信号通路扰动对单细胞转录状态的影响 | 斑马鱼胚胎中的细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解框架 | 单细胞转录组数据 | 5小时龄斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-04-23 |
Single-cell sequencing uncovers sensory neuron-mediated CGRP signaling as a driver of sarcoma progression
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500161122
PMID:41118222
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了感觉神经元介导的CGRP信号在肉瘤进展中的驱动作用 | 首次发现肿瘤相关感觉神经元在骨癌中除疼痛感知外的调控功能，并利用化学遗传学方法验证了TrkA抑制对肉瘤生长和转移的抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限，且干预策略的长期效果和临床转化需进一步评估 | 探究感觉神经元在骨肉瘤进展中的调控机制及潜在治疗靶点 | 小鼠骨肉瘤模型和人类骨肉瘤骨样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学、多模态多组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-04-23 |
The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NF-κB signaling
2025-Oct-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024028199
PMID:40663784
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研究论文 | 本研究揭示了急性髓系白血病（AML）微环境通过NF-κB信号通路损害中性粒细胞成熟和功能，导致免疫抑制和感染易感性增加 | 首次在非照射的宿主中使用中性粒细胞报告小鼠模型，结合单细胞转录组学和体外细胞因子筛选，系统阐明了AML微环境如何通过NF-κB信号通路重塑中性粒细胞的表观遗传和功能 | 研究主要基于小鼠模型，虽然患者样本验证了类似生物学现象，但人类AML的异质性可能带来更复杂的调控机制 | 探究AML微环境对健康中性粒细胞成熟和功能的影响及其分子机制 | AML暴露的中性粒细胞（来自小鼠模型和AML患者） | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学、染色质重塑分析、基序发现、体外细胞因子筛选 | NA | 单细胞RNA-seq数据、表观遗传数据 | 临床前AML小鼠模型及AML患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-04-20 |
RUNX1T1-HDAC Reprogramming of the HOX Code Signaling Drives a Targetable Pan-Cancer Lineage Plasticity
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.07.681000
PMID:41280130
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研究论文 | 本研究通过分析多组学数据，发现RUNX1T1-HDAC复合物通过重编程HOX代码信号驱动泛癌谱系可塑性，并揭示了其作为可药物靶点的潜力 | 首次将RUNX1T1鉴定为泛癌谱系可塑性的新型生物标志物，揭示了RUNX1T1-HDAC复合物调控HOX代码的机制，并证明HDAC抑制可选择性靶向可塑性细胞 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，需要更多体内实验和临床试验进一步证实其治疗潜力 | 探索癌症谱系可塑性的分子机制并寻找可靶向的生物标志物 | 前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病（AML）的癌细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌, 肺癌, 急性髓系白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 多组学分析, AI建模 | AI-based modeling | 转录组数据 | 超过80,000个RNA-seq样本，涵盖114种癌症类型，包括大量临床前和临床队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-04-19 |
ST2HE: A Cross-Platform Framework for Virtual Histology and Annotation of High-Resolution Spatial Transcriptomics Data
2025-Oct-13, ArXiv
PMID:41281202
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研究论文 | 本文提出了一个跨平台生成框架ST2HE，用于从高分辨率空间转录组数据合成虚拟H&E图像，以支持组织学注释 | ST2HE采用一步扩散模型整合细胞核形态和空间转录坐标，实现了跨组织类型和平台的高保真虚拟组织学图像生成，并支持条件性和组织无关的变体 | 未明确提及具体的数据集规模限制或模型泛化能力的详细评估 | 开发一个标准化框架，用于高分辨率空间转录组数据的虚拟组织学注释和表型分类 | 乳腺癌、非小细胞肺癌和卡波西肉瘤的组织样本 | 计算病理学 | 乳腺癌, 非小细胞肺癌, 卡波西肉瘤 | 空间转录组学 | 扩散模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 高分辨率空间转录组学 | NA | NA |
| 40 | 2026-04-18 |
Peripartum dapagliflozin improves late-life maternal cardiovascular outcomes in a murine model of superimposed preeclampsia
2025-Oct, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2025.03.035
PMID:40164294
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研究论文 | 本研究在BPH/2J小鼠模型中证实了达格列净在围产期给药可改善叠加子痫前期的母体心血管结局 | 首次在叠加子痫前期模型中测试了SGLT2抑制剂（达格列净）在妊娠期和产后早期的短期和长期心血管效应，并揭示了其抗纤维化和改善代谢的分子作用机制 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化的有效性尚需进一步验证 | 评估SGLT2抑制剂达格列净在叠加子痫前期模型中作为心血管风险降低干预措施的潜力 | BPH/2J小鼠模型（模拟慢性高血压叠加子痫前期） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学，Masson三色染色，超声心动图，遥测技术 | NA | 图像，文本（转录组数据），生理参数 | BPH/2J怀孕小鼠（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |