单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202510-202510] [清除筛选条件]
当前共找到 594 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-05-31
Age- and Sex- Driven Transcriptional and Metabolic Diversity in Myeloid-Derived Suppressor Cells After Mouse Sepsis
2025-Oct-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠脓毒症后年龄和性别对骨髓源性抑制细胞转录和代谢多样性的影响 首次系统性地描述了年龄和性别对脓毒症后MDSC的扩增、转录组、通路激活、RNA速度、线粒体代谢及细胞间通讯的差异影响 未在人类样本中进行验证,且仅使用小鼠模型,可能无法完全反映人类脓毒症的复杂性 探究年龄和性别对脓毒症后骨髓源性抑制细胞(MDSC)转录和代谢状态的影响 年轻(3-4个月)和老年(18-24个月)成年雄性和雌性小鼠的脾脏白细胞 机器学习 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠脾脏白细胞样本,包括年轻和老年雄性和雌性小鼠各若干只 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
22 2026-05-30
KIAA0319 Plays a Critical Role in Cortical Neuronal Maturation and Synaptic Development Through a Dyslexia-Associated Gene Network
2025-Oct-18, Biological psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 通过构建KIAA0319敲除的人脑类器官,研究该基因在神经发育中的作用,揭示其与阅读障碍相关基因网络的关联 首次利用CRISPR-Cas9构建KIAA0319敲除人脑类器官模型,结合单细胞RNA测序揭示其通过调控纤毛形成和神经元成熟影响阅读障碍的分子机制 仅基于体外类器官模型,未在体内动物模型中验证;未探讨KIAA0319在阅读障碍患者中的具体突变类型 阐明KIAA0319在神经发育中的功能及其与阅读障碍相关的分子机制 KIAA0319敲除人胚胎干细胞分化的脑类器官 机器学习 阅读障碍 CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 NA 图像、文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
23 2026-05-29
Single-Cell Profiling of HDAC Inhibitor-Induced EBV Lytic Heterogeneity Defines Abortive and Refractory States in B Lymphoblasts
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞技术分析HDAC抑制剂诱导的EBV裂解性复制异质性,定义了B淋巴母细胞中的流产性和难治性状态 首次在单细胞水平揭示HDAC抑制剂对EBV阳性B淋巴瘤细胞系裂解性复制的异质性影响,并鉴定出NF-κB及CD137/CD137L信号轴在流产性裂解细胞中的上调作用 研究仅基于四种EBV阳性细胞系(P3HR1-ZHT BL、Jijoye BL、IBL-1和LCL),可能无法完全代表体内肿瘤微环境的复杂性;单细胞测序仅针对P3HR1-ZHT BL系,其他细胞系的机制未深入探索 探索HDAC抑制剂(帕比司他和纳诺司他)对EBV阳性恶性肿瘤细胞裂解性复制的影响及宿主因子在抑制成功裂解中的作用 四种EBV阳性细胞系:P3HR1-ZHT伯基特淋巴瘤、Jijoye伯基特淋巴瘤、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和感染衍生的淋巴母细胞系 单细胞测序 EBV相关恶性肿瘤,伯基特淋巴瘤,霍奇金淋巴瘤,鼻咽癌,胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 四种细胞系,具体单细胞数量未在摘要中说明 未明确说明,但推测可能使用10x Genomics或类似平台(常见于scRNA-seq),具体公司不可直接从摘要中得出,此处输出NA 单细胞RNA测序 NA NA
24 2026-05-29
Polyamine acetylation mediates crosstalk between cancer cells and myeloid cells to promote mesenchymal/plurimetabolic states in glioblastoma
2025-Oct-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 揭示多胺乙酰化在胶质母细胞瘤中介导癌细胞与髓系细胞之间的代谢对话,促进间充质/多代谢表型 首次发现SAT1及其产物N1-乙酰亚精胺在连接肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞/髓系细胞的代谢活动中起桥接作用,共同促进胶质母细胞瘤的间充质/多代谢状态和治疗抵抗 未提及 研究多胺代谢重塑如何影响胶质母细胞瘤的恶性细胞内在和微环境依赖的生物学过程,进而影响亚型分类 人源和鼠源胶质母细胞瘤肿瘤及细胞系 机器学习 胶质母细胞瘤 液相色谱-串联质谱法、单细胞RNA测序 NA 文本 人源和鼠源胶质母细胞瘤肿瘤样本和细胞系(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2026-05-29
Selective EPAC1 activators enhance endothelial function in models of vascular inflammation
2025-10, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 通过体外和离体模型,研究选择性EPAC1激活剂在血管炎症中增强内皮功能的作用 首次证明选择性EPAC1激活剂可通过SOCS3上调抑制JAK/STAT3信号通路,有效改善IL-6介导的内皮功能障碍,并在多种模型中验证其治疗潜力 未提及临床验证;主要在动物模型和体外系统中进行,缺乏人体临床试验数据 探究EPAC1在调节血管炎症和内皮功能中的作用,评估选择性EPAC1激活剂的治疗潜力 健康及动脉粥样硬化小鼠主动脉、动脉粥样硬化人类冠状动脉、主动脉环、三细胞共培养系统(人血管内皮细胞、平滑肌细胞、巨噬细胞) 心血管生物医学 血管炎症、动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(单细胞RNA)、功能性血管反应数据 小鼠主动脉(健康与动脉粥样硬化模型)、人类冠状动脉(动脉粥样硬化样本)、主动脉环、三细胞共培养系统 NA 单细胞RNA测序 NA NA
26 2026-05-28
Gastric dilation following vertical sleeve gastrectomy reflects adaptive stem cell-driven regeneration without association with weight regain or increased cancer risk
2025-Oct-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用小鼠模型和患者样本,揭示垂直袖状胃切除术后的胃扩张是一种由干细胞驱动的适应性再生反应,与体重反弹或癌症风险增加无关 通过单细胞RNA测序首次揭示VSG术后胃扩张的细胞机制,证明其是适应性再生而非病理反应,并发现肿瘤抑制基因上调可能提供抗癌保护 未提及 探究垂直袖状胃切除术后胃扩张的机制及其与体重反弹和癌症风险的关联 饮食诱导的肥胖小鼠模型和接受VSG手术的患者胃体上皮样本 机器学习 肥胖症 单细胞RNA测序、RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型及患者胃体上皮样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台进行胃体上皮细胞测序
27 2026-05-27
Supervised machine learning identifies impaired mitochondrial quality control in β cells with development of type 2 diabetes
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发一个可解释的有监督机器学习框架,通过单细胞RNA测序分析β细胞线粒体质量控制在2型糖尿病发展中的作用 结合稀疏规则分类、路径约束建模和线粒体适应性分层三种机器学习方法,首次在单细胞水平识别出与2型糖尿病相关的β细胞亚型和关键调节因子 NA 解析2型糖尿病中β细胞衰竭的分子机制 来自52名人类供体的β细胞的单细胞RNA测序数据 机器学习 2型糖尿病 单细胞RNA测序 SnakeClassifier, BlackSwanClassifier, Kolmogorov-Arnold神经网络 基因表达数据 52名人类供体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
28 2026-05-27
CagA-dependent Hobit+ gastric tissue-resident memory T cells confer full protection from Helicobacter pylori reinfection
2025-10-08, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究揭示依赖CagA的Hobit+胃组织驻留记忆T细胞能完全保护宿主免受幽门螺杆菌再感染 首次证明胃组织驻留记忆T细胞(TRM)是幽门螺杆菌免疫保护的相关指标,并揭示其依赖于毒力因子CagA和转录因子Hobit的诱导机制 研究主要基于小鼠模型和少量人体样本,对胃TRM细胞在人类长期保护中的具体功能验证尚不充分 探究胃TRM细胞在幽门螺杆菌初次感染和再感染过程中的诱导、发育和功能 小鼠和人类胃组织中的幽门螺杆菌特异性TRM细胞 机器学习 幽门螺杆菌感染 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、免疫荧光、ChipCytometry染色 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
29 2026-05-27
SpaGene: A Deep Adversarial Framework for Spatial Gene Imputation
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种名为SpaGene的深度学习框架,用于整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,以填补空间转录组中的缺失基因表达 利用两个编码器-解码器对、两个翻译器和两个判别器的对抗学习框架,实现空间转录组数据中缺失基因的高精度推断 未明确说明,可能包括对特定组织类型或平台泛化性的潜在限制 开发一种深度学习方法,整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,以增强空间基因表达推断 多种数据集上的空间转录组和单细胞RNA测序数据 机器学习 肺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 生成对抗网络(GAN) 基因表达数据 多种数据集 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
30 2026-05-27
The bone marrow immune ecosystem shapes daratumumab acquired resistance in plasma cell myeloma
2025-10, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究探讨了骨髓免疫生态系统在多发性骨髓瘤获得性达雷妥尤单抗耐药中的作用 首次通过单细胞RNA测序和数字空间分析技术,鉴定了与获得性耐药相关的免疫细胞变化和MYC调控机制 样本量有限,且主要基于配对样本分析,外部验证队列的异质性可能影响结论的普适性 揭示获得性达雷妥尤单抗耐药的免疫生态系统机制 多发性骨髓瘤患者治疗前后配对样本 机器学习 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 单细胞调控网络推理 基因表达数据 来自多个队列的样本,包括GSE24080、GSE136337、GSE57317和coMMpass 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 数字空间分析 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序和数字空间分析平台
31 2026-05-23
TGFB1/SMAD3-driven macrophage-myofibroblast transition promotes fibrosis progression in endometriosis
2025-10-02, Molecular human reproduction IF:3.6Q1
研究论文 本研究证明TGFB1/SMAD3信号通路驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化是子宫内膜异位症中肌成纤维细胞的新来源,并促进纤维化进展 首次报道巨噬细胞-肌成纤维细胞转化是子宫内膜异位症纤维化中肌成纤维细胞的新来源,并明确TGFB1/SMAD3通路的调控作用 未提及 探讨巨噬细胞-肌成纤维细胞转化在子宫内膜异位症纤维化中的作用及调控机制 子宫内膜异位症患者和模型小鼠的子宫内膜组织 数字病理学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人类子宫内膜组织及小鼠模型样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
32 2026-05-23
Temporal dynamics of uterine immune microenvironment remodeling in a murine model of adenomyosis
2025-10-02, Molecular human reproduction IF:3.6Q1
研究论文 利用他莫昔芬诱导的子宫腺肌症小鼠模型,探究孕前子宫免疫微环境随时间变化的动态重塑过程 首次系统描绘子宫腺肌症早期(1-3个月)子宫免疫微环境的时序动态变化,揭示先天与适应性免疫串扰作为病理早期驱动因素,并提出IL-6通路作为潜在治疗靶点 依赖单一动物模型、仅分析两个时间点、缺乏调节性T细胞功能评估 阐明子宫腺肌症孕前子宫免疫微环境的演变规律及其在疾病发生中的作用 他莫昔芬诱导的子宫腺肌症小鼠模型子宫组织 免疫学 子宫腺肌症 免疫荧光、流式细胞术、定量聚合酶链反应 NA 组织样本、基因表达数据、细胞表型数据 他莫昔芬诱导后1个月和3个月小鼠子宫组织样本(具体数量未提及) NA NA NA NA
33 2026-05-22
Smooth muscle expression of RNA editing enzyme ADAR1 controls activation of the RNA sensor MDA5 in atherosclerosis
2025-Oct, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了RNA编辑酶ADAR1在平滑肌细胞中调控RNA传感器MDA5的激活,从而影响动脉粥样硬化的发展 首次阐明平滑肌细胞特异性ADAR1表达通过抑制MDA5激活维持血管完整性,限制动脉粥样硬化和钙化,并发现RNA编辑在CAD中的细胞类型特异性作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类队列分析为相关性结果,因果关系需进一步验证 探讨ADAR1介导的RNA编辑在冠状动脉疾病和动脉粥样硬化中的作用机制 人类动脉粥样硬化斑块、人类冠状动脉平滑肌细胞、条件性SMC特异性Adar敲除小鼠模型 机器学习 冠状动脉疾病, 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 测序数据 人类斑块分析、Athero-Express颈动脉内膜切除术队列(具体样本数未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2026-05-21
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts identifies perivascular neurons resilient to glaucoma
2025-Oct-15, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 通过结合成像空间转录组学和免疫染色技术,分析小鼠视网膜神经节细胞在视网膜平面上的分子和空间分布,发现血管周围神经元对青光眼具有恢复力 首次建立了全面的视网膜神经节细胞空间图谱,并揭示了血管微环境对神经退行性疾病中细胞差异易感性的影响 主要基于小鼠模型,研究未涵盖人类视网膜;对血管周围保护机制的进一步分子通路验证不足 研究视网膜神经节细胞在二维视网膜表面上的空间分布及其局部微环境对功能的影响,探索青光眼模型中神经元的保护机制 小鼠视网膜神经节细胞 数字病理学 青光眼 MERFISH, 免疫染色 NA 图像 小鼠视网膜扁平样本 NA 空间转录组学 MERFISH 基于成像的空间转录组学(MERFISH)结合免疫染色
35 2026-05-21
Targeting tumor-intrinsic TAK1 triggers anti-tumor immunity and sensitizes pancreatic cancer to checkpoint blockade
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 揭示肿瘤内部TAK1激酶通过维持基因组完整性抑制抗肿瘤免疫,抑制TAK1可增强免疫检查点阻断剂对胰腺癌的疗效 发现TAK1通过磷酸化EphA2和RAD51维持基因组稳定性,并揭示其作为免疫检查点阻断剂的敏感化靶点 NA 探究TAK1在胰腺导管腺癌免疫微环境中的功能及其作为治疗靶点的潜力 人类PDAC组织样本、p48-Cre;TP53 flox/flox;LSL-KRAS G12D基因工程小鼠模型、肿瘤-CD8 T细胞共培养系统 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序、多路免疫组化、蛋白质组学 NA 基因表达数据、组织图像 人类PDAC样本和基因工程小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-05-21
Islet-intrinsic sex differences in inflammatory signaling contribute to autoimmune diabetes susceptibility
2025-Oct-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究揭示了胰岛β细胞在炎症反应中的性别差异如何影响自身免疫性糖尿病的易感性 首次发现雄性胰岛对促炎细胞因子具有更强的干扰素信号诱导和发育信号抑制反应,并证明雌二醇通过重编程β细胞降低免疫原性,为性别偏倚的1型糖尿病易感性提供机制见解 研究主要基于体外实验和NOD小鼠模型,人体内的长期效应和临床转化潜力尚需进一步验证 阐明性激素如何在胰岛内调控炎症反应,从而影响1型糖尿病的性别差异 人类胰岛(男性和女性供体)、小鼠β细胞、非肥胖糖尿病(NOD)小鼠 机器学习(若指数据分析方法) 1型糖尿病(自身免疫疾病) 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 人类胰岛来自男性和女性供体(样本量未明确说明);NOD小鼠和C57BL/6小鼠(具体数量未提及) NA 单细胞RNA-seq NA NA
37 2026-05-21
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-10, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1
综述 探讨氧化还原调控在微血管生理与病理中的作用,并评估现有治疗策略及其局限性 强调微血管与大型血管在氧化还原反应中的差异,并引入单细胞RNA测序揭示不同血管床内皮细胞的独特基因特征 技术挑战限制了对活性氧/活性氮水平与微血管结局的可靠关联;缺乏针对微血管氧化还原信号的特效治疗方法 阐明氧化还原介导的微血管功能障碍在多种疾病中的机制,并推动靶向治疗的发展 微血管系统(包括细胞存活与死亡、血管生成、血管扩张、屏障功能等) 心血管领域 心血管疾病, 自身免疫性疾病, 感染性疾病, 血红蛋白病, 炎症性疾病, 血管炎, 代谢性疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
38 2026-05-20
Video - Visual Integration of Drosophila Enhancer Organization: A tool for integrating and visualizing chromatin accessibility, in vivo transcription factor binding and motif occurrence in tissue-specific differentially expressed genes
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍VIDEO工具,用于整合和可视化果蝇增强子组织中的染色质可及性、体内转录因子结合及基序出现情况 提供了首个交互式网络工具,能够整合染色质可及性、转录因子结合和基序出现数据,在组织特异性上下文中探索基因调控 未在正文中明确说明其局限性,但可能受限于果蝇模型及预设的数据类型和基因列表来源 开发一个网络分析工具,以可视化和整合组织特异性差异表达基因中保守转录因子结合基序、染色质可及性和转录因子结合数据 果蝇组织特异性差异表达基因及其近端增强子区域 生物信息学 NA RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 原位杂交, 微阵列, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据、染色质可及性数据、转录因子结合数据 NA(工具演示涉及唾液腺和胚胎后肠的特定基因集) NA NA NA NA
39 2026-05-20
Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveal Tumor Cell Characteristics and Communication Features of Primary and Lymphatic Metastatic Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma
2025-10, Head & neck
研究论文 通过单细胞和 bulk RNA 测序揭示原发性和淋巴转移性下咽鳞状细胞癌的肿瘤细胞特征及通讯特点 首次系统比较原发灶与淋巴转移灶中恶性上皮细胞的基因表达差异和细胞通讯特征,并基于配体-受体对构建预后预测模型,有效区分淋巴结转移状态 未明确提及样本大小和外部验证队列,可能影响模型泛化性 探究下咽鳞癌淋巴结转移的关键驱动因素和潜在治疗靶点,建立预后预测工具 下咽鳞状细胞癌原发肿瘤和淋巴转移样本中的恶性上皮细胞 RNA测序 下咽鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 配体-受体对模型(4-LRs模型) 单细胞RNA测序数据、bulk RNA测序数据 训练集、测试集和整个队列,具体样本数未明确 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
40 2026-05-18
Brain somatic mutations in Alzheimer's disease: linking genetic mosaicism to neurodegeneration
2025-10-09, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
review 探讨阿尔茨海默病中脑体细胞突变如何将遗传嵌合现象与神经退行性病变相联系 系统总结了体细胞突变在阿尔茨海默病发病和进展中的作用,特别是神经元中突变负荷增加与关键致病基因(如PSEN1、PSEN2、APP)的关联,并提出了体细胞突变的神经保护性角色可能 体细胞突变导致神经功能紊乱的机制仍不完全清楚,且部分突变的神经保护作用需要进一步验证 综述体细胞突变在阿尔茨海默病中的新兴作用,并强调未来整合先进测序和基因编辑技术以发现新治疗靶点的潜力 阿尔茨海默病相关脑体细胞突变的研究文献 NA 阿尔茨海默病 单细胞测序、全基因组分析 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部