单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-09-14	Single-Cell Sequencing Screening of Biomarkers Associated with Lipophagy in the MPTP Model Mice of Parkinson's Disease 2025-Oct, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-025-05014-0 PMID:40537664	研究论文	通过单细胞测序筛选与帕金森病MPTP模型小鼠脂噬相关生物标志物	首次结合脂噬机制在帕金森病中筛选出Ubb、Gapdh、Cox4i1和Hsp90aa1四个关键生物标志物，并揭示少突胶质细胞和神经元的关键作用	样本量较小（n=3/组），仅使用小鼠模型，未进行人类样本验证	探究脂噬在帕金森病中的具体分子机制及潜在治疗靶点	MPTP诱导的帕金森病模型小鼠脑组织细胞	单细胞生物学	帕金森病	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	细胞聚类分析、伪时间分析	单细胞转录组数据	6只小鼠（3只PD模型，3只对照组）
22	2025-09-14	Single-Cell Transcriptome Patterns of Transposable Elements in Alzheimer's Disease 2025-Oct, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-025-05140-9 PMID:40537665	研究论文	通过单细胞核RNA测序分析阿尔茨海默病患者前额叶皮层样本，揭示转座子转录本在不同脑细胞类型中的表达模式	首次在单细胞水平系统报道AD中转座子转录本的细胞类型特异性变化模式，特别是发现兴奋性神经元中逆转录转座子转录本增加最显著	研究主要基于前额叶皮层样本，可能无法完全代表其他脑区的变化	探究阿尔茨海默病中转座子转录本的细胞类型特异性表达规律	阿尔茨海默病患者前额叶皮层细胞	生物信息学	阿尔茨海默病	sc/snRNA-seq, bulk RNA-seq	NA	单细胞转录组数据	143,951个细胞
23	2025-09-14	The brainstem BBSome regulates glucose homeostasis and lean mass in a state-dependent manner 2025-Oct, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2025.102222 PMID:40744313	研究论文	本研究探讨了脑干纤毛和BBSome蛋白复合体在能量平衡和葡萄糖稳态中的作用	揭示了脑干特定神经元中BBSome通过自主神经平衡调节葡萄糖稳态的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证	研究脑干纤毛和BBSome在代谢调节中的功能	Phox2b神经元、小鼠模型	神经代谢学	代谢性疾病	免疫荧光、共聚焦成像、单细胞RNA测序、病毒技术、神经记录	基因敲除小鼠模型	图像数据、转录组数据、生理指标数据	使用Phox2bCre/Ift88 fl/fl和Phox2bCre/Bbs1fl/fl基因工程小鼠，在高脂饮食和对照饮食条件下进行研究
24	2025-09-14	Effects of β-catenin deficiency on adipose tissue physiology 2025-Oct, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2025.102226 PMID:40759324	研究论文	本研究探讨了脂肪细胞中β-catenin缺失对白色脂肪组织基因表达及细胞间通讯的影响	揭示了性别特异性代谢表型，并发现内皮细胞和细胞外囊泡通过上调Ctnnb1 mRNA维持组织稳态的补偿机制	研究主要基于小鼠模型，未明确人类组织中的适用性；性别差异机制尚未完全阐明	探究脂肪细胞Wnt/β-catenin信号缺失对脂肪组织稳态维持的分子机制	脂肪细胞特异性β-catenin敲除小鼠（Ctnnb1AdKO）的脂肪组织及基质血管细胞	分子生物学	代谢性疾病	代谢表型分析、bulk RNA测序、流式细胞术、单细胞RNA测序、细胞外囊泡分离	基因敲除小鼠模型	RNA测序数据、流式细胞数据、代谢参数	性别分组的转基因小鼠模型（具体数量未明确说明）
25	2025-09-14	Regulating the cell differentiation trajectory of progenitor cells in adipose tissue fibrosis 2025-Oct, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2025.102231 PMID:40780446	研究论文	本研究探讨了基质Gla蛋白（MGP）在脂肪组织纤维化中对祖细胞分化轨迹的调控作用	发现MGP缺失会促使脂肪源性干细胞（ASC）从成脂分化转向纤维化分化，并鉴定出两个新的ASC亚群（ASC1和ASC4）	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证	阐明MGP在白色脂肪组织纤维化中的作用机制	脂肪祖细胞（APCs）和小鼠模型	细胞生物学	代谢性疾病	scRNA-seq, 信号通路研究	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	使用全局和Pdgfral-Cre介导的Mgp缺失小鼠模型
26	2025-09-13	Molecular insights into the causal role of TG/IDL in rheumatoid arthritis: Integrating Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing 2025-Oct-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123883 PMID:40754101	研究论文	本研究结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序，探讨TG/IDL与类风湿性关节炎的因果关系及分子机制	首次整合MR和scRNA-seq方法，鉴定出ABCA1、PLTP和GAS6等关键基因介导TG/IDL与RA的关联	NA	明确TG/IDL与类风湿性关节炎的因果关联并探索其分子机制	类风湿性关节炎患者滑膜组织、CIA小鼠模型和成纤维样滑膜细胞	生物医学研究	类风湿性关节炎	孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、GWAS	NA	基因组数据、单细胞转录组数据	NA
27	2025-09-13	Gastric dilation following vertical sleeve gastrectomy reflects adaptive stem cell-driven regeneration without association with weight regain or increased cancer risk 2025-Oct-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123899 PMID:40816501	研究论文	本研究探讨垂直袖状胃切除术后胃扩张的机制及其与体重恢复和癌症风险的关联	挑战了胃扩张导致体重恢复的传统假设，揭示其与干细胞驱动的适应性再生及潜在抗癌保护机制相关	NA	探究VSG术后胃扩张的生物学机制及临床意义	饮食诱导肥胖小鼠模型和VSG患者的胃体上皮样本	NA	肥胖及相关并发症	单细胞RNA测序，RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型和人类患者样本（具体数量未明确说明）
28	2025-09-13	Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Effect of MIF on Myeloid-Derived Suppressor Cells in Multiple Myeloma 2025-Oct, International journal of laboratory hematology IF:2.2Q3 DOI:10.1111/ijlh.14473 PMID:40176414	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析探讨了MIF在多发性骨髓瘤骨髓微环境中对髓源性抑制细胞的影响	首次在单细胞水平将MDSCs按MIF表达分为不同亚群，并发现MIF+MDSCs通过RETN-CAP1通路与浆细胞相互作用	研究基于公开数据集GSE124310，样本来源和数量可能受限，需要进一步实验验证	探索骨髓微环境中MIF与MDSCs的相互关系及其在多发性骨髓瘤中的作用机制	多发性骨髓瘤患者和正常对照的骨髓样本	单细胞组学	多发性骨髓瘤	scRNA-seq, 流式细胞术, CellChat分析	NA	单细胞RNA测序数据	GSE124310数据集中的多发性骨髓瘤和正常样本
29	2025-09-13	Canonical Wnt Pathway Enhanced Dental Pulp Mesenchymal Stem Cells-Mediated Cementum Regeneration 2025-Oct, Journal of oral rehabilitation IF:3.1Q1 DOI:10.1111/joor.14001 PMID:40369784	研究论文	本研究探讨了经典Wnt通路增强牙髓间充质干细胞介导的牙骨质再生的分子机制	发现Wnt3a通过激活经典Wnt通路促进DPSCs的牙骨质生成分化，揭示了非经典Wnt通路限制再生效率的新机制	NA	阐明Wnt信号通路在牙骨质再生中的表达差异和功能机制	牙髓间充质干细胞(DPSCs)、牙骨质、牙髓和牙周组织	组织再生医学	牙周组织疾病	RNA Smart转录组测序、单细胞测序、western blotting	NA	基因表达数据、蛋白质数据	NA
30	2025-09-13	Precision Medicine in Surgery: Immunomodulation and Cellular Regeneration Strategies for Immunologic and Surgical Diseases 2025-Oct-01, Annals of surgery IF:7.5Q1 DOI:10.1097/SLA.0000000000006849 PMID:40698837	研究论文	本文提出了一种研究lacritin肽对β细胞增殖、胰岛存活和免疫调节作用的方法学框架	结合体外和体内模型系统研究lacritin肽的双重免疫调节和再生功能	NA	探索精准医疗在免疫和外科疾病中的应用，特别是lacritin肽的治疗潜力	胰岛细胞、免疫细胞、糖尿病小鼠模型	精准医疗	自身免疫疾病、糖尿病	mass cytometry, imaging mass cytometry, single-cell RNA sequencing	NA	分子数据、细胞成像数据	使用糖尿病小鼠模型进行临床前评估
31	2025-09-13	Complete Response to BET Inhibitor in Primary Pulmonary NUT Carcinoma With Single-Cell Sequencing-Based Analysis: A Case Report 2025-Oct, JTO clinical and research reports IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.jtocrr.2025.100885 PMID:40926997	病例报告	一例原发性肺NUT癌患者通过BET抑制剂NHWD-870单药治疗实现完全缓解，并利用单细胞测序分析其免疫微环境变化	首次报道BET抑制剂单药治疗实现NUT癌完全缓解，并通过单细胞测序揭示其通过激活CD8+ T细胞调控肿瘤微环境的双重作用机制	单病例报告，样本量有限，需要更大规模研究验证	探讨BET抑制剂在NUT癌治疗中的疗效及作用机制	36岁IIIB期原发性肺NUT癌患者	肿瘤学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	1例患者肿瘤组织
32	2025-09-12	Single-cell sequencing revealed the recurrence causes of ETV6:RUNX1 fusion-positive B-ALL in children 2025-Oct, Molecular and cellular probes IF:2.3Q4 DOI:10.1016/j.mcp.2025.102041 PMID:40659095	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序探索ETV6:RUNX1融合阳性儿童B细胞急性淋巴细胞白血病复发机制	首次在单细胞水平揭示复发样本中T细胞耗竭、代谢通路改变及LGALS9-HAVCR2等新型细胞互作机制	样本量较小（仅4例患者），需更大队列验证	解析ETV6:RUNX1阳性B-ALL患者复发驱动通路	儿童B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者	单细胞组学	白血病	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	4例B-ALL患者（3例新诊断，1例复发），选自25例患者队列
33	2025-09-12	Establishment of CRISPR/Cas9 lineage tracking technology for pig embryos 2025-Oct, Molecular and cellular probes IF:2.3Q4 DOI:10.1016/j.mcp.2025.102046 PMID:40816522	研究论文	开发了一种结合CRISPR/Cas9分子条码和单细胞转录组学的猪胚胎高分辨率谱系追踪技术	首次在猪中建立了结合DNA条码（CRISPR/Cas9靶位点和intBC）与组成型Cas9-EGFP的谱系追踪系统，并与scRNA-seq整合	NA	研究猪组织发育和细胞谱系，用于生物医学研究和遗传工程	猪胚胎细胞	发育生物学	NA	CRISPR/Cas9, CRISPR/Cas12a, piggyBac转座, 单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因组DNA, 单细胞转录组数据	NA
34	2025-09-11	KAT6A Promotes Macrophage Inflammation and Periodontitis 2025-Oct, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1 DOI:10.1111/jcpe.14203 PMID:40635126	研究论文	本研究揭示了KAT6A在巨噬细胞炎症和牙周炎进展中的关键作用	首次发现KAT6A在牙周炎患者巨噬细胞中上调表达，并通过基因敲除小鼠模型证实其调控炎症反应的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证	探究KAT6A在牙周炎发病机制中的作用	巨噬细胞、牙周炎小鼠模型、人类牙周组织样本	表观遗传学	牙周炎	单细胞RNA测序、qRT-PCR、RNA-seq、流式细胞术、Cut&tag技术	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、表观遗传数据	牙周炎患者组织样本和基因敲除小鼠模型
35	2025-09-10	Multi-omics analysis of polyamine metabolism implicates NT5E/CD73 in the progression of pancreatic cancer 2025-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217887 PMID:40582491	研究论文	通过多组学分析揭示多胺代谢在胰腺癌进展中的作用，并鉴定NT5E/CD73为关键调控基因	首次对胰腺癌中多胺代谢进行系统性多组学整合分析，开发基于多胺代谢的预后模型（PMscore），并发现NT5E在代谢重编程和免疫调控中的双重功能	NA	探究多胺代谢在胰腺导管腺癌（PDAC）中的全面作用及临床意义	胰腺导管腺癌（PDAC）患者样本及肿瘤微环境	多组学分析	胰腺癌	批量转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、主成分分析、随机森林算法	预后模型（PMscore）	转录组数据、单细胞数据	NA
36	2025-09-10	CEMIP2 sensitizes PDAC to chemotherapy through extracellular matrix remodeling by hyaluronan degradation 2025-Oct-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217898 PMID:40623543	研究论文	本文揭示了CEMIP2通过降解透明质酸重塑细胞外基质，增强胰腺导管腺癌对化疗的敏感性	首次阐明CEMIP2通过HA降解机制调节肿瘤微环境，发现其与CAF亚群和免疫细胞的功能状态调控相关	机制研究主要基于小鼠模型，临床样本验证仍需扩展	探究CEMIP2在PDAC化疗耐药性中的分子机制和治疗潜力	胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和小鼠模型	肿瘤生物学	胰腺癌	scRNA-seq, CyTOF, 蛋白质组学分析	NA	基因表达数据、蛋白质数据、单细胞测序数据	临床PDAC标本和小鼠模型，具体样本量未明确说明
37	2025-09-10	The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis 2025-Oct, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2025.05.015 PMID:40389038	研究论文	本研究通过大鼠脓毒性腹膜炎模型，揭示内脏大神经消融通过选择性调节中性粒细胞亚群平衡显著增强细菌清除能力	首次证明内脏大神经特异性调控中性粒细胞（而非巨噬细胞）的激活状态，并发现其通过改变杀菌性中性粒细胞与静止亚群的比例影响免疫应答	研究局限于大鼠模型，尚未在人类中验证；神经消融的长期效应未评估	阐明交感神经内脏大神经在感染过程中对免疫调节和细菌清除的具体作用机制	大肠杆菌诱导脓毒性腹膜炎的SD大鼠模型	免疫学	脓毒症	流式细胞术、单细胞RNA测序、蛋白质标记检测	NA	基因表达数据、蛋白质数据、细胞计数数据	大鼠模型（具体数量未明确说明），包含假手术对照组和神经消融实验组
38	2025-09-10	Multimodal associations between brain morphology, immune-inflammatory markers, spatial transcriptomics, and behavioural symptoms in autism spectrum disorder 2025-Oct, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2025.07.021 PMID:40721173	研究论文	本研究探讨自闭症谱系障碍中攻击行为与神经炎症、脑结构差异及基因表达模式的关联	首次结合空间转录组学与多模态神经生物学数据，揭示攻击行为与前额-边缘-纹状体网络失衡及神经炎症的复杂相互作用	样本量较小（n=42），仅包含男性参与者，且神经影像数据仅来自攻击组子集（n=13）	识别自闭症谱系障碍中攻击行为的神经生物学机制并为治疗策略提供依据	42名11-38岁男性自闭症谱系障碍患者（分攻击组与非攻击组）	神经科学	自闭症谱系障碍	多重检测分析、MRI、变形基形态测量法（DBM）、空间转录组学	NA	行为问卷数据、血浆生物标志物数据、神经影像数据、基因表达数据	42名男性ASD患者（21名攻击组/21名非攻击组），其中13名攻击组参与者接受MRI扫描
39	2025-09-09	Crustacean cardioactive peptide (CCAP) negatively regulates sand-diving behaviour in kuruma shrimp, Penaeus japonicus 2025 Oct-Dec, Comparative biochemistry and physiology. Part B, Biochemistry & molecular biology DOI:10.1016/j.cbpb.2025.111143 PMID:40812679	研究论文	研究甲壳动物心脏活性肽(CCAP)对日本对虾沙潜行为的负向调控作用	首次通过基因干扰和过表达实验证实CCAP对甲壳动物沙潜行为的负向调节作用	NA	探究CCAP基因表达与日本对虾沙潜行为的关系	日本对虾(Penaeus japonicus)	分子生物学	NA	RT-qPCR, 原位杂交, RNA干扰, 基因过表达	NA	基因表达数据, 行为观察数据	NA
40	2025-09-07	Evolution of comparative transcriptomics: biological scales, phylogenetic spans, and modeling frameworks 2025-Oct, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.gde.2025.102387 PMID:40774064	综述	本文讨论比较转录组学领域在技术发展、系统发育覆盖和建模框架三个方向的演变趋势	系统总结了单细胞与空间转录组技术带来的范式转变、更广泛的系统发育覆盖以及机器学习驱动的新建模框架	NA	探讨比较转录组学领域的演进方向和发展趋势	转录组数据与进化生物学研究	生物信息学	NA	RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学	机器学习	转录组数据	NA