单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 592 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-11-02 |
Integrative Single-Cell and Bulk Transcriptomic Analysis Identifies Macrophage-Related Gene Signatures Predictive of Hepatocellular Carcinoma in Cirrhosis
2025-Oct-15, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16101213
PMID:41153430
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据识别巨噬细胞相关基因特征，构建肝硬化和肝细胞癌的预测模型 | 首次整合单细胞和批量转录组数据系统分析肝硬化向肝癌进展过程中巨噬细胞相关转录组变化 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证模型的普适性 | 开发肝硬化患者肝癌风险的早期预测模型 | 肝硬化患者和肝细胞癌患者的肝组织样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Lasso回归, 随机森林, XGBoost | 基因表达数据 | 肝硬化患者和肝细胞癌患者的肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2025-11-02 |
Determining the Biological Features of Aggressive Meningioma Growth with Transcriptomic Profiling
2025-Oct-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17203324
PMID:41154381
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示侵袭性脑膜瘤生长的生物学特征 | 首次结合RNA-seq和scRNA-seq数据解析脑膜瘤等级相关的基因表达变化及肿瘤微环境特征 | 样本量相对有限（共60例），且为单中心研究 | 识别与脑膜瘤恶性程度相关的基因并评估其功能相关性 | 脑膜瘤组织样本（脑膜上皮型19例、纤维型11例、非典型18例、间变型12例） | 生物信息学 | 脑膜瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | 无监督聚类分析, 基因集富集分析 | 转录组数据, 单细胞数据 | 60例脑膜瘤样本（WHO I级30例，II级18例，III级12例） | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 363 | 2025-11-02 |
Kdm7aa Orchestrates an Immunomodulatory Cardiomyocyte Program to Enable Zebrafish Heart Regeneration
2025-Oct-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262010044
PMID:41155336
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现组蛋白去甲基化酶Kdm7aa在斑马鱼心脏再生过程中协调免疫调节性心肌细胞程序 | 首次揭示Kdm7aa作为再生诱导的表观遗传调节因子，连接组蛋白去甲基化与趋化因子信号通路 | 研究主要基于斑马鱼模型，在哺乳动物中的直接应用仍需验证 | 阐明斑马鱼心脏再生的分子机制，探索增强哺乳动物心脏修复的潜在治疗策略 | 斑马鱼心室心肌细胞，新生和成年小鼠心脏，人类心脏组织 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，CRISPR/Cas9基因编辑，bulk RNA测序，药理学抑制 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 斑马鱼心肌细胞，小鼠心脏组织，人类心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2025-11-02 |
Transcriptomic Signatures in IgA Nephropathy: From Renal Tissue to Precision Risk Stratification
2025-Oct-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262010055
PMID:41155346
|
综述 | 本文综述了转录组学在IgA肾病分子特征解析和精准风险分层中的应用进展 | 首次整合了bulk RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学和非侵入性转录组学数据，将分子特征直接与临床风险分层和精准治疗联系起来 | 存在标准化、队列规模和临床部署方面的挑战 | 总结转录组学在IgA肾病分子特征研究和患者风险分层中的应用 | IgA肾病患者的肾脏组织、尿液和血液样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学、基因表达谱分析、机器学习 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 365 | 2025-11-02 |
Immunometabolic Dysregulation in B-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Revealed by Single-Cell RNA Sequencing: Perspectives on Subtypes and Potential Therapeutic Targets
2025-Oct-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209996
PMID:41155287
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示B细胞急性淋巴细胞白血病中的免疫代谢失调机制 | 首次在单细胞水平系统描绘B-ALL免疫代谢特征，建立基于代谢特征的机器学习分型模型，并识别关键转录因子和靶向药物 | 样本量有限（17例患者），需要更大规模验证 | 探索B-ALL免疫微环境中的代谢失调机制及潜在治疗靶点 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者骨髓样本 | 数字病理 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 17例B-ALL患者和13例健康对照的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2025-11-02 |
RNA-Seq and Single-Cell RNA-Seq Analyses of Tilapia Head Kidney in Response to Streptococcus agalactiae and Aeromonas hydrophila
2025-Oct-11, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15202951
PMID:41153878
|
研究论文 | 通过RNA-Seq和单细胞RNA-Seq分析罗非鱼头肾对无乳链球菌和嗜水气单胞菌感染的免疫应答机制 | 首次结合比较转录组学和单细胞RNA测序技术揭示罗非鱼对不同病原菌的免疫细胞响应差异，特别是发现单核/巨噬细胞根据细菌挑战类型呈现不同分化模式 | 研究聚焦于头肾组织，未涉及其他免疫器官；实验仅针对两种特定病原菌，结论普适性有待验证 | 探究罗非鱼对不同病原菌感染的免疫应答机制 | 罗非鱼头肾组织 | 转录组学 | 细菌感染 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | NA |
| 367 | 2025-11-02 |
Cold Exposure Induces Swine Brown Adipocytes to Display an Island-like Distribution with Atypical Characteristics
2025-Oct-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209871
PMID:41155166
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现猪体内存在棕色脂肪细胞，并揭示其在冷暴露下呈现岛状分布的非典型特征 | 首次在猪体内鉴定出棕色脂肪细胞，发现其独特的岛状分布模式和不同于典型棕色脂肪细胞的分子特征 | UCP2/3蛋白含量未显著增加，论文提供了重复实验以提高该蛋白含量的方法 | 确认猪体内棕色脂肪细胞的存在及其在冷暴露下的特征 | 猪棕色脂肪细胞与小鼠棕色脂肪组织的比较分析 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序, ceRNA网络分析, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 368 | 2025-11-02 |
Preclinical Diagnosis of Type 1 Diabetes: Reality or Utopia
2025-Oct-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13102444
PMID:41153727
|
综述 | 评估1型糖尿病经典与新兴生物标志物在早期诊断中的应用现状与潜力 | 系统整合传统标志物与新兴技术（如单细胞转录组、FTIR光谱等），提出多标志物联合诊断策略 | 多数新兴生物标志物证据基础不足，尚未在临床诊断中广泛应用 | 评估生物标志物在1型糖尿病早期诊断中的适用性，推动新型诊断方法开发 | 1型糖尿病生物标志物（包括HLA、自身抗体、细胞因子、cfDNA等） | 生物信息学 | 1型糖尿病 | 全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、FTIR光谱 | 多基因风险评分（PRS） | 基因组数据、转录组数据、光谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2025-11-02 |
Harpagide Confers Protection Against Acute Lung Injury Through Multi-Omics Dissection of Immune-Microenvironmental Crosstalk and Convergent Therapeutic Mechanisms
2025-Oct-04, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18101494
PMID:41155609
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示钩果草苷通过调节免疫微环境对急性肺损伤的保护作用 | 首次采用单细胞转录组学、蛋白质组学与分子动力学模拟相结合的多组学策略，系统解析钩果草苷在急性肺损伤中的多通路调控机制 | 研究仅基于LPS诱导的小鼠模型，尚未在临床样本中验证 | 探究钩果草苷对急性肺损伤的保护作用及其分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 多组学分析 | 急性肺损伤 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,表面等离子共振,细胞热位移分析,分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,分子相互作用数据 | 6只小鼠/组 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 370 | 2025-11-02 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Multi-Compartmental Cellular Cascade Underlying Elahere-Induced Ocular Toxicity in Rats
2025-Oct-04, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18101492
PMID:41155607
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了Elahere在大鼠中诱导眼毒性的多区室细胞级联反应机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统解析ADC药物Elahere引起的眼毒性细胞特异性分子机制 | 研究仅使用大鼠模型，与人类病理生理可能存在差异 | 阐明Elahere诱导眼毒性的细胞类型特异性分子机制 | Sprague-Dawley大鼠角膜细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 47,606个角膜细胞 | BD Biosciences | single-cell RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统 |
| 371 | 2025-11-02 |
Exploring the Abnormal Characteristics of the Ovaries During the Estrus Period of Kazakh Horses Based on Single-Cell Transcriptome Technology
2025-Oct-02, Biology
DOI:10.3390/biology14101351
PMID:41154754
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术探索哈萨克马发情期卵巢的异常特征 | 首次构建了哈萨克马卵巢的单细胞转录组图谱，揭示了不同卵巢细胞类型及其亚型在发情期的分子特征 | 研究仅针对哈萨克马特定品种，结果可能不适用于其他马种 | 探究马匹发情期卵巢功能衰退的分子机制 | 哈萨克马的卵巢组织 | 单细胞转录组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 112,861个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 372 | 2025-11-02 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Immune Response to COVID-19 and Tuberculosis Coinfection
2025-Oct, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240022
PMID:41163794
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示COVID-19与结核病共感染患者的免疫反应特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘COVID-19与结核病共感染的免疫图谱，揭示重症患者特有的免疫细胞群改变和免疫病理机制 | 样本量有限，未明确说明具体样本数量；主要关注重症患者，缺乏轻症患者的对比分析 | 阐明COVID-19与结核病共感染的免疫病理机制和保护性免疫反应 | COVID-19与结核病共感染患者（特别是重症患者）的免疫细胞 | 单细胞组学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2025-11-02 |
Improved gene regulatory network inference from single cell data with dropout augmentation
2025-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013603
PMID:41134910
|
研究论文 | 提出一种通过dropout增强改进单细胞数据中基因调控网络推断的新方法 | 提出Dropout Augmentation(DA)方法增强模型对零膨胀数据的鲁棒性，并开发基于DA的DAZZLE模型用于基因调控网络推断 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中的基因调控网络推断 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达和调控关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器结构方程模型 | 基因表达数据 | 包含超过15,000个基因的小鼠小胶质细胞纵向数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2025-10-31 |
Changes in neural progenitor lineage composition during astrocytic differentiation of human iPSCs
2025-Oct-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96423
PMID:41150379
|
研究论文 | 本研究通过追踪人类iPSCs分化为星形胶质细胞的过程，揭示了神经祖细胞谱系组成的变化及其对星形胶质细胞区域特性的影响 | 首次证明iPSCs衍生的星形胶质细胞谱系组成不能准确反映原始祖细胞群体，并识别了LMX1A祖细胞来源星形胶质细胞的独特转录组特征 | 研究仅聚焦于LMX1A腹侧中脑祖细胞，未涵盖其他脑区祖细胞类型 | 探究人类iPSCs分化为星形胶质细胞过程中神经祖细胞谱系组成的变化规律 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs)及其分化的神经祖细胞和星形胶质细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序，细胞谱系追踪 | 人类iPSCs分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深度单细胞RNA测序 |
| 375 | 2025-10-31 |
Multi-omics profiling uncovers paradoxical Epstein-Barr virus involvement in autoimmune liver disease pathogenesis
2025-Oct-27, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01975-6
PMID:41144108
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示EB病毒在自身免疫性肝病发病机制中的复杂作用 | 首次提供EB病毒与自身免疫性肝病关联的遗传学证据，发现EB病毒在疾病中可能扮演双重角色 | 基于观察性研究和数据库分析，因果关系仍需进一步验证 | 探究EB病毒与自身免疫性肝病之间的因果关系和分子机制 | 自身免疫性肝病患者群体和EB病毒相关抗体 | 生物信息学 | 自身免疫性肝病 | 双样本孟德尔随机化分析,GSMR,GWAS,转录组分析,单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞测序数据 | 基于FinnGen数据库的GWAS汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | NA |
| 376 | 2025-10-31 |
Deciphering splicing heterogeneity at single-cell resolution by SCSES
2025-Oct-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64517-5
PMID:41145486
|
研究论文 | 开发了一种名为SCSES的计算框架，用于在单细胞水平增强选择性剪接分析 | 通过数据扩散在相似细胞和事件间共享信息来推断和补全缺失的剪接变化 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序中准确表征剪接变化的挑战 | 单细胞剪接异质性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数据扩散算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 377 | 2025-10-31 |
Hmox1 expression indicates distinct injury phenotypes of proximal tubule cells in sepsis-associated acute kidney injury
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05764-w
PMID:41145479
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，鉴定Hmox1作为脓毒症相关急性肾损伤中近端小管细胞损伤的特异性生物标志物 | 首次发现Hmox1高表达和低表达的近端小管细胞亚群在SAKI中表现出不同的表型特征 | NA | 识别SAKI诊断的特异性生物标志物并阐明其病理机制 | 肾组织中的近端小管细胞 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 378 | 2025-10-31 |
SPP1+ macrophages promote colorectal cancer progression by activating JAK2/STAT3 signaling pathway
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21420-9
PMID:41145614
|
研究论文 | 本研究揭示SPP1+巨噬细胞通过激活JAK2/STAT3信号通路促进结直肠癌进展的机制 | 首次发现SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的极性改变通过JAK2/STAT3通路调控结直肠癌进展 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞极性改变对结直肠癌进展的影响及分子机制 | 结直肠癌细胞(MC38)和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 细胞共培养, CCK-8检测, TUNEL染色, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | 小鼠结直肠癌模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 379 | 2025-10-31 |
Intratumoral plasma cells predict patient prognosis and responsiveness to neoadjuvant immunotherapy in advanced gastric cancer
2025-Oct-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01071-9
PMID:41145683
|
研究论文 | 本研究通过多中心数据整合分析，开发了基于肿瘤内浆细胞的MZB1阳性评分系统，用于预测晚期胃癌患者对免疫治疗的预后和反应性 | 首次发现成熟三级淋巴结构是胃癌浸润浆细胞中体细胞超突变和克隆选择的关键位点，并建立了基于浆细胞浸润程度的MZB1阳性评分系统 | 研究依赖于胃镜活检组织，存在组织样本大小的固有局限性 | 开发新的生物标志物来预测胃癌患者对免疫治疗的反应和预后 | 晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,转录组测序 | NA | 组织样本,转录组数据,空间转录组数据 | 来自七个独立医疗中心的胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2025-10-31 |
KIAA1429-mediated M6A methylation inhibits osteoclast differentiation via stabilizing Lrp4 mRNA and protects against osteoporosis
2025-Oct-27, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00800-z
PMID:41146006
|
研究论文 | 本研究探讨KIAA1429介导的m6A甲基化通过稳定Lrp4 mRNA抑制破骨细胞分化并预防骨质疏松的机制 | 首次揭示KIAA1429通过m6A-YTHDC1-LRP4-TNFAIP3轴抑制NF-κB信号通路的新机制 | 未明确说明样本规模及临床数据的具体来源 | 探究KIAA1429在骨质疏松及破骨细胞分化中的生物学功能及分子机制 | 骨质疏松患者临床样本、卵巢切除小鼠模型、破骨细胞 | 表观遗传学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, m6A甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |