单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 589 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-30 |
Resolving intra-tumor heterogeneity and clonal evolution of core-binding factor acute myeloid leukemia patients with single-cell resolution
2025-Oct-28, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00718-4
PMID:41152985
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量DNA测序数据解析核心结合因子急性髓系白血病的肿瘤内异质性和克隆演化 | 开发了将亚克隆体细胞拷贝数变异整合到系统发育树和克隆演化分析的方法，在单细胞水平证明融合基因是白血病发生的最早期事件 | 样本量有限（8例初诊患者和3例化疗后患者） | 解析肿瘤内异质性和克隆演化，识别化疗耐药机制 | 核心结合因子急性髓系白血病患者 | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞DNA测序，批量DNA测序 | 系统发育树分析 | DNA测序数据 | 8例初诊患者和3例化疗后患者 | NA | 单细胞DNA测序，批量DNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2025-10-30 |
Panmim: a resource of pan-cancer metastasis immune microenvironment
2025-Oct-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06484-5
PMID:41152997
|
研究论文 | 开发了一个名为Panmim的整合资源，用于研究转移性肿瘤的免疫微环境 | 构建了首个专注于癌症转移免疫微环境的综合数据库，整合了90个单细胞RNA-seq数据集 | 数据库资源仍需不断扩展和更新，当前仅包含特定类型和部位的转移癌数据 | 研究癌症转移过程中的免疫微环境特征和分子机制 | 转移性癌症的单细胞RNA-seq数据，涵盖14个转移部位和36种原发癌类型 | 生物信息学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 90个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 363 | 2025-10-30 |
Unveiling metabolic pathway dysregulation in the malignant transformation of polyps to colorectal cancer: a single-cell analysis of epithelial cell trajectories
2025-Oct-27, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003859
PMID:41159285
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌发展过程中上皮细胞代谢通路失调和细胞通讯变化 | 首次在单细胞水平构建结直肠癌上皮细胞分化轨迹，揭示脂肪酸和胆汁酸代谢通路失调与乳酰化修饰在癌变过程中的关键作用 | 研究样本量有限，需要更大队列验证发现；机制研究主要基于计算推断，需要实验验证 | 探究结直肠癌发展过程中代谢通路重编程和细胞通讯变化机制 | 正常结肠组织、息肉组织和结直肠癌组织中的上皮细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析，细胞通讯分析，调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 包含正常、息肉和肿瘤结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 364 | 2025-10-30 |
Interrogation of the cellular hierarchies reveals neoplastic evolution and therapeutic vulnerability in craniopharyngioma
2025-Oct-24, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf249
PMID:41159376
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示颅咽管瘤的细胞层级结构和肿瘤演化过程 | 首次在单细胞和空间水平揭示颅咽管瘤的肿瘤编程和演化，识别出PCP和RCC之间的疾病谱系连续性 | 研究样本数量有限，动物模型结果需要进一步临床验证 | 阐明颅咽管瘤的发病机制和肿瘤演化过程 | 颅咽管瘤（包括ACP、PCP亚型）和Rathke裂囊肿 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，多重免疫组化，离体垂体培养 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，组织学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 365 | 2025-10-30 |
Enhanced RNA Preservation in Mouse Brain Tissue: A Strategy Combining Cardiac Perfusion with Hypersaline Immersion
2025-Oct-21, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05379
PMID:41141763
|
研究论文 | 开发了一种结合心脏灌注和高渗盐水浸泡的策略，用于增强小鼠脑组织RNA保存效果 | 首次将心脏灌注与高渗盐水浸泡相结合，建立了标准化的RNA保存框架，显著延长了RNA在组织切片中的完整性保持时间 | 仅在小鼠脑组织中验证，未在其他组织类型或物种中测试 | 解决空间转录组学研究中RNA降解问题，建立标准化的RNA保存方法 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，RNA完整性检测 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 366 | 2025-10-30 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal intratumor heterogeneity and immune evasion in natural killer/T cell lymphoma
2025-Oct-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113626
PMID:41142990
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和免疫逃逸机制 | 首次在NKTCL中鉴定出五个具有不同功能通路、分化轨迹和空间分布的恶性元程序亚群，并发现FABP5抑制剂可下调c-Myc抑制肿瘤生长 | NA | 探究自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境相互作用 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 367 | 2025-10-30 |
Deciphering the cellular tumor microenvironment landscape in salivary gland carcinomas using multiplexed imaging mass cytometry
2025-Oct-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03551-z
PMID:41083996
|
研究论文 | 利用多重成像质谱流式技术解析唾液腺癌肿瘤微环境的细胞景观 | 首次在唾液腺癌中应用13标志物成像质谱流式技术进行空间单细胞分析，发现基质癌相关成纤维细胞(mCAF)与内皮细胞的空间相互作用与转移相关 | 样本量相对有限(54例)，空间转录组数据仅包含3例病例 | 空间表征唾液腺癌单细胞肿瘤微环境并鉴定预后生物标志物 | 唾液腺癌患者组织样本，包括唾液腺导管癌、腺泡细胞癌、黏液表皮样癌和分泌性癌 | 数字病理 | 唾液腺癌 | 成像质谱流式技术，空间转录组学，RNA测序 | CAF算法，空间分析，Cox回归分析 | 多通道图像数据，单细胞数据，RNA测序数据 | 54例原发灶和淋巴结转移病例，验证队列包含67例唾液腺导管癌病例 | NA | 成像质谱流式，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | 13标志物成像质谱流式面板 |
| 368 | 2025-10-30 |
Linking ion channel gene expression to neuronal firing patterns through a statistical-biophysical model
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101390
PMID:41142910
|
研究论文 | 通过统计生物物理模型建立离子通道基因表达与神经元放电模式之间的定量联系 | 开发了基于生物物理模拟和现代机器学习技术的新型统计生物物理模型 | NA | 建立转录组特性与生理特性之间的机制联系 | 神经元 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 电生理记录, 形态学重建 | 统计生物物理模型, 机器学习 | 基因表达数据, 电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2025-10-30 |
Tumor-derived CD109 orchestrates reprogramming of tumor-associated macrophages to dampen immune response
2025-Oct, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.03.035
PMID:40220905
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤源性可溶性CD109通过重编程肿瘤相关巨噬细胞抑制免疫反应的机制 | 首次发现sCD109作为'分泌性免疫检查点'通过双重机制调控CD73表达，并证明CD109与PD-L1双重阻断可增强免疫治疗效果 | 研究主要在临床前模型中进行，需要进一步临床验证 | 探索iCCA免疫抑制机制并开发新的免疫治疗靶点 | 肝内胆管癌(iCCA)及其肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组学分析、单细胞转录组学、飞行时间质谱流式细胞术、RNA测序、质谱分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 370 | 2025-10-30 |
Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence
2025-Oct, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589
PMID:40999941
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序和高重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展 | 利用单细胞技术发现了新的免疫细胞亚群，包括GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞和双阴性3型B细胞 | 尚未将机制发现与靶向治疗完全衔接，需要改进动物模型和开展转化研究 | 探讨IgG4相关疾病的免疫发病机制 | 浆母细胞、活化B细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞、巨噬细胞、树突状细胞、成纤维细胞等免疫细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序, 高重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 371 | 2025-10-30 |
Immunophenotypic changes in the tumor and tumor microenvironment during progression to multiple myeloma
2025-Oct, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011848
PMID:41056512
|
研究论文 | 通过单细胞分析研究多发性骨髓瘤进展过程中肿瘤细胞和肿瘤微环境的免疫表型变化 | 首次在未分选的骨髓单核细胞样本中结合单细胞RNA测序、表面蛋白分析和B淋巴细胞抗原受体分析，构建了骨髓微环境的细胞图谱 | 样本量相对有限，需要进一步验证研究结果 | 研究多发性骨髓瘤前驱疾病向活动性疾病进展过程中的细胞和分子机制 | 健康志愿者和单克隆丙种球蛋白病、冒烟型多发性骨髓瘤、多发性骨髓瘤患者 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 表面蛋白分析, B淋巴细胞抗原受体分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白表达数据 | 123名受试者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 372 | 2025-10-30 |
Liquid Biopsy-Multiomics Link Adhesion Pathway Dysregulation to Kidney Injury Severity
2025-Oct, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2025.07.021
PMID:41141506
|
研究论文 | 本研究通过液体活检多组学分析揭示细胞粘附通路失调与急性肾损伤严重程度的关联 | 首次结合尿液蛋白质组学、血浆蛋白质组学和尿液沉淀单细胞转录组学，系统识别严重急性肾损伤的细胞特异性机制 | 样本量相对有限，特别是单细胞转录组学样本仅40例 | 预测急性肾损伤严重结局并探索其分子机制 | COVID相关和非COVID相关的急性肾损伤患者 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 蛋白质组学，单细胞转录组学，机器学习 | 随机森林 | 蛋白质组数据，单细胞转录组数据 | 169例尿液蛋白质组学样本，437例血浆蛋白质组学样本，40例尿液沉淀单细胞转录组学样本 | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 373 | 2025-10-30 |
Single-cell multi-omic and spatial profiling of esophageal squamous cell carcinoma reveals the immunosuppressive role of GPR116+ pericytes in cancer metastasis
2025-Oct, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02341-9
PMID:41073785
|
研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学揭示食管鳞癌中GPR116+周细胞通过免疫抑制促进肿瘤转移的机制 | 首次发现GPR116+周细胞亚群在食管鳞癌转移中的关键作用，阐明其通过分泌EGFL6激活整合素β1/NF-κB通路促进转移的分子机制 | 样本量相对有限（16个单细胞多组学样本，5个空间转录组样本），动物模型结果需进一步临床验证 | 探究食管鳞癌肿瘤微环境中细胞多样性和空间结构对肿瘤转移的影响机制 | 食管鳞癌患者组织样本（人类）和Prrx1基因敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞多组学测序，空间转录组学，基因敲除技术 | NA | 单细胞多组学数据，空间转录组数据 | 16个单细胞多组学样本（117,169个细胞），5个空间转录组样本（195,366个细胞） | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 374 | 2025-10-29 |
Single-cell RNA sequencing reveals the protective role of renal Cx3cr1+ macrophages in cisplatin-induced acute kidney injury
2025-Oct-28, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70302
PMID:41147753
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肾脏Cx3cr1+巨噬细胞在顺铂诱导的急性肾损伤中的保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序解析了顺铂诱导的急性肾损伤中肾脏巨噬细胞的异质性，并发现Cx3cr1+巨噬细胞亚群具有保护功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究急性肾损伤中肾脏巨噬细胞亚群的分类和功能 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠模型中的肾脏巨噬细胞 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，bulk测序，细胞耗竭实验，过继转移实验，细胞共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，bulk转录组数据 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠肾脏样本（从第0天到第7天的时间序列） | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 375 | 2025-10-29 |
The CXCL12-CXCR4 Axis Mediates Lymphocyte Immune Overactivation in IgG4-Related Chronic Rhinosinusitis
2025-Oct-27, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70124
PMID:41144786
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IgG4相关慢性鼻窦炎中CXCL12-CXCR4轴介导淋巴细胞免疫过度激活的机制 | 首次在单细胞水平揭示IgG4相关慢性鼻窦炎的转录组变化，发现CXCL12-CXCR4轴在免疫细胞过度激活中的关键作用 | 样本量较小（仅5例患者），需要更大规模研究验证 | 阐明IgG4相关慢性鼻窦炎的发病机制 | IgG4相关慢性鼻窦炎患者的鼻黏膜组织 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 多色免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 组织图像 | 5例患者样本+3个已发表对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 376 | 2025-10-29 |
CD70-Targeting CAR-NK Cells Overcome BCMA Downregulation and Improve Survival in High-Risk Multiple Myeloma Models
2025-Oct-27, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0130
PMID:41144785
|
研究论文 | 本研究开发了靶向CD70的CAR-NK细胞疗法，可克服BCMA下调并在高危多发性骨髓瘤模型中提高生存率 | 首次证明CD70在高危多发性骨髓瘤中高表达且与不良预后相关，并开发了包含CD27和IL-15的CAR-NK细胞疗法 | 临床前研究阶段，需通过临床试验进一步验证疗效和安全性 | 开发针对高危多发性骨髓瘤的新型免疫疗法 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞模型 | 免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | CAR-NK细胞, CAR-T细胞 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞功能数据 | 两个多发性骨髓瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 377 | 2025-10-29 |
CSF1R and macrophage infiltration: Integrated magnetic resonance imaging radiomics and deep learning-driven models for the preoperative assessment of glioma
2025-Oct-27, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003827
PMID:41146428
|
研究论文 | 本研究开发了基于磁共振影像组学和深度学习的CSF1R预测模型，用于术前评估胶质瘤 | 首次整合传统影像组学特征和深度学习特征构建CSF1R预测模型，并系统验证其与巨噬细胞浸润的关联 | 样本量相对有限，特别是单细胞测序样本较少(n=2)，需要更大规模验证 | 开发非侵入性术前预测胶质瘤CSF1R水平的影像学方法 | 胶质瘤患者 | 医学影像分析 | 胶质瘤 | 磁共振成像、影像组学、深度学习、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 支持向量机、随机森林、朴素贝叶斯等12种机器学习分类器 | 磁共振图像、基因表达数据、免疫组化数据、单细胞测序数据 | 477例患者（训练集64例，内部测试38例，外部验证101例，生存分析255例，免疫组化16例，单细胞测序2例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 378 | 2025-10-29 |
In vitro models of cancer-associated fibroblast heterogeneity uncover subtype-specific effects of CRISPR perturbations
2025-Oct-27, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70153
PMID:41146557
|
研究论文 | 开发了能够可靠代表肿瘤中观察到的癌症相关成纤维细胞表型的共培养模型，并利用单细胞转录组学分析CAF亚型异质性 | 建立了能够模拟肿瘤微环境中CAF表型的可转化共培养模型系统，并首次系统评估了CRISPR扰动对不同CAF亚型的特异性影响 | 研究主要基于胰腺癌患者的CAF细胞系，模型系统的可转化性仍需进一步验证 | 研究癌症相关成纤维细胞亚型异质性及其对CRISPR扰动的特异性响应 | 胰腺癌患者来源的原代CAF和永生化肿瘤细胞系 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, CRISPR基因编辑 | 共培养模型 | 单细胞RNA测序数据 | 胰腺癌患者来源的CAF细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 379 | 2025-10-29 |
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2025-Oct-25, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf248
PMID:41137658
|
研究论文 | 开发了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法，用于研究胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调节 | 首次将人血浆样培养基与稳定同位素示踪技术结合，在体外模型中保留了肿瘤微环境的完整性 | 体外模型仍无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 研究胶质瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫系统的相互作用 | 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | 癌症代谢研究 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪, 空间转录组学 | 体外培养模型 | 代谢组数据, 转录组数据 | 人IDH野生型胶质母细胞瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 380 | 2025-10-29 |
Deciphering lactate/lactylation networks in AML: integrated scRNA-seq and transcriptomics reveal functions and prognostic model
2025-Oct-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14938-8
PMID:41139200
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组学数据，揭示乳酸/乳酸化网络在急性髓系白血病中的功能并构建预后模型 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据系统研究乳酸代谢和组蛋白乳酸化在AML中的预后价值，并构建了基于机器学习的7基因预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要进一步的功能实验验证机制 | 探索乳酸/乳酸化相关基因在急性髓系白血病中的预后价值和分子机制 | 急性髓系白血病患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Western blot | 10种机器学习算法构建的预后模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |