单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 627 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-11-16 |
Single-cell multi-omics and spatial transcriptomics reveal the transcriptional regulatory landscape of clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-328
PMID:41230160
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研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示透明细胞肾细胞癌的转录调控景观 | 首次整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学全面解析ccRCC的细胞异质性、表观遗传调控和转录因子网络 | 研究样本量有限，功能验证仅针对YBX3基因 | 全面表征ccRCC的细胞异质性、表观遗传调控和转录因子网络，识别具有预后和治疗意义的关键基因 | 透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的细胞群体 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 伪时间分析, 基因集富集分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 362 | 2025-11-15 |
Intratumoral SPP1+BCL2A1+ Tumor-Associated Macrophages Predict Poor Response to PD1 Blockade
2025-Oct-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15212680
PMID:41225975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现SPP1+BCL2A1+肿瘤相关巨噬细胞是预测肝细胞癌患者PD1阻断治疗反应不良的新型生物标志物 | 首次鉴定出SPP1和BCL2A1双阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，并证实其与免疫检查点抑制剂治疗反应不良相关 | 样本量相对较小，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索肝细胞癌免疫治疗反应的预测生物标志物 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 发现队列10例，ICB队列4例，验证队列18例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 363 | 2025-11-16 |
Visceral Peritoneum Hyperpigmentation in Chickens Is Associated with DCT Expression
2025-Oct-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15213076
PMID:41227407
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研究论文 | 本研究探讨了鸡内脏腹膜色素沉着过度(HVP)的遗传基础及其调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定HVP相关黑色素细胞群体，发现DCT基因在HVP中过度表达并确定其多态性可作为遗传选择标记 | 研究样本量有限，功能验证实验主要在细胞水平进行，需要进一步体内验证 | 阐明鸡内脏腹膜色素沉着异常的遗传原因和分子机制 | 鸡内脏腹膜组织和黑色素细胞 | 生物信息学 | 色素沉着异常 | HPLC, bulk RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 超过9700个高质量单细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2025-11-16 |
Identification of two distinct uveal melanoma subtypes based on the immune cell infiltration of the primary tumour
2025-Oct-23, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04198-7
PMID:41128887
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研究论文 | 本研究基于原发性葡萄膜黑色素瘤的免疫细胞浸润特征，识别出两种不同的肿瘤亚型 | 首次在单细胞水平揭示葡萄膜黑色素瘤的免疫异质性，发现具有特定染色体变异和信号通路活性的侵袭性黑色素细胞亚群 | 样本量有限（8例肿瘤活检），仅使用二次数据分析 | 表征葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的细胞组成和免疫特征 | 原发性葡萄膜黑色素瘤肿瘤样本 | 单细胞组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 8例原发性葡萄膜黑色素瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 365 | 2025-11-16 |
Mapping early human blood cell differentiation using single-cell proteomics and transcriptomics
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr8785
PMID:40839704
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞蛋白质组学和转录组学技术，绘制了人类早期血细胞分化图谱 | 首次将单细胞质谱蛋白质组学与单细胞RNA测序整合，揭示了mRNA无法反映的干细胞功能相关蛋白质，并建立了推断细胞分化进程的翻译动态模型 | 研究仅针对CD34+造血干细胞和祖细胞，样本类型相对有限 | 解析人类早期血细胞分化过程中的分子机制 | 人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | 单细胞多组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞质谱蛋白质组学 | 翻译动态模型 | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 超过2500个人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 366 | 2025-11-16 |
Tumor-draining lymph nodes respond to immune checkpoint inhibition and orchestrate tumor immune remodeling
2025-Oct-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04187-w
PMID:41051631
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 首次通过单细胞测序技术系统阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的具体作用机制，发现其作为肿瘤特异性T细胞的来源地 | 研究样本仅限于结直肠癌患者，需要进一步验证在其他癌症类型中的普适性 | 阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的响应机制及其对肿瘤微环境的调控作用 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 367 | 2025-11-15 |
YTHDF1 regulates YTHDF2 stability via m6A-dependent mechanisms in hepatocellular carcinoma: insights from in vitro, in vivo, and multi-cohort clinical studies
2025-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-2025-363
PMID:41220748
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研究论文 | 本研究揭示YTHDF1通过m6A依赖性机制调控YTHDF2稳定性促进肝细胞癌进展 | 首次发现YTHDF1通过m6A依赖性方式增强YTHDF2的mRNA稳定性和翻译效率，并揭示两者在肝细胞癌中的空间共表达模式 | 未明确说明样本规模和研究人群的详细特征 | 探索YTHDF同源蛋白在肝细胞癌中的调控网络和临床相关性 | 肝细胞癌组织、YTHDF蛋白家族 | 分子生物学 | 肝细胞癌 | 免疫组织化学、空间转录组学、Western blot、实时定量PCR、RNA免疫沉淀、e-CLIP测序、双荧光报告基因检测、RNA稳定性实验 | NA | 蛋白质表达数据、RNA表达数据、空间转录组数据、临床预后数据 | 两个临床队列的肝细胞癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 368 | 2025-11-15 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identified TIMP1 as a Prognostic Marker in Colorectal Cancer
2025-Oct, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e38
PMID:41220845
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建结直肠癌免疫预后模型并鉴定TIMP1作为预后标志物 | 首次结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建结直肠癌免疫预后模型，并实验验证TIMP1的生物学功能 | NA | 解析结直肠癌免疫异质性并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,差异表达分析,功能富集分析,随机森林分析,LASSO方法 | 随机森林,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2025-11-15 |
[RNA Sequencing Reveals Molecular Alternations of Splenocytes Associated with Anti-FⅧ Immune Response in Hemophilia A Murine Model]
2025-Oct, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
|
研究论文 | 通过RNA测序技术研究血友病A小鼠模型中与抗FⅧ免疫反应相关的脾细胞分子变化 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术系统分析血友病A小鼠抗FⅧ免疫反应的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究血友病A中抗FⅧ免疫反应的分子机制 | 血友病A小鼠模型的脾细胞 | 生物信息学 | 血友病A | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 血友病A小鼠模型 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | CASAVA碱基识别技术 |
| 370 | 2025-11-15 |
[Research Progress of Epigenetic Modification in Hematopoietic Stem Cell Functional Regulation--Review]
2025-Oct, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
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综述 | 本文综述了表观遗传修饰在造血干细胞发育、功能调控和扩增中的研究进展 | 整合了单细胞测序、空间转录组和追踪技术等新兴技术对造血干细胞表观遗传调控机制的最新研究成果 | NA | 探讨表观遗传修饰在造血干细胞功能调控中的作用机制 | 造血干细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞测序技术, 空间转录组技术, 追踪技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 371 | 2025-11-14 |
Exploring Sex Differences in Type 2 Diabetes via a Male-Dominant Beta-Cell Cluster from Single-Cell Pancreatic Sequencing of Public Datasets
2025-Oct, Endocrinology and metabolism (Seoul, Korea)
DOI:10.3803/EnM.2025.2297
PMID:40389209
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研究论文 | 通过分析公共单细胞数据集发现男性主导的β细胞簇，揭示2型糖尿病性别差异的分子机制 | 首次在2型糖尿病患者中鉴定出男性主导的β细胞亚群，该亚群具有独特的基因表达模式和细胞通讯特征 | 基于公共数据集进行二次分析，样本来源和数量受原始数据限制 | 探索2型糖尿病性别差异的分子基础 | 2型糖尿病患者的胰腺β细胞 | 单细胞基因组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，轨迹推断，差异基因表达分析，基因集富集分析，细胞通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 来自四个公共数据集的2型糖尿病患者胰腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 372 | 2025-11-14 |
Expression of marker genes to assess the spermatogenic capacity in patients with idiopathic non-obstructive azoospermia
2025-Oct, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03584-5
PMID:40681857
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞RNA测序的定量方法，用于评估特发性非梗阻性无精子症患者的睾丸生精能力 | 利用单细胞RNA测序技术开发了生精能力评分系统，并鉴定了与生精潜能相关的关键基因标记物 | 样本量相对较小（18名iNOA患者），需要在更大群体中进一步验证 | 开发评估特发性非梗阻性无精子症患者睾丸生精能力的可靠定量方法 | 特发性非梗阻性无精子症患者 | 单细胞测序分析 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 模糊聚类, 基因表达趋势分析 | 单细胞基因表达数据 | 18名iNOA患者，近4000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2025-11-13 |
Stress-NRF2 response axis polarizes tumor macrophages and undermines immunotherapy
2025-Oct-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013063
PMID:41176316
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研究论文 | 本研究揭示了NRF2转录因子在肿瘤相关巨噬细胞极化为免疫抑制状态中的关键作用及其对免疫疗法的负面影响 | 首次发现NRF2激活梯度将肿瘤相关巨噬细胞分为促炎CXCL9+和抗炎SPP1+亚群，并证明其通过沉默IFN-STAT1通路导致免疫抑制 | 研究主要基于小鼠模型，人类癌症中的验证仍需进一步临床研究 | 探索NRF2在肿瘤相关巨噬细胞极化中的作用及其对免疫疗法疗效的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞、MC38结肠肿瘤模型、MMTV-PyMT乳腺肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌、乳腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、三维细胞培养、体内肿瘤模型 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠肿瘤模型及人类癌症样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 374 | 2025-11-13 |
Clonally expanded effector CD4+ cytotoxic T lymphocytes are associated with severe neurological adverse events after immune checkpoint inhibitor therapy
2025-Oct-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012350
PMID:41167637
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组学分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗后神经系统不良事件与克隆扩增的CD4+细胞毒性T淋巴细胞之间的关联 | 首次在单细胞水平上揭示了n-irAEs患者体内存在特异性克隆扩增的CD4+CTLs，并发现其表达与神经炎症相关的效应基因谱 | 样本量较小（仅17例患者），且仅分析了外周血细胞而未直接研究中枢神经系统 | 探究免疫检查点抑制剂治疗诱发神经系统不良事件的免疫学机制和风险因素 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者，包括8例急性神经毒性患者 | 单细胞基因组学 | 癌症治疗相关神经系统并发症 | 单细胞RNA测序，T细胞受体谱分析 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | 17例癌症患者（8例n-irAEs患者），共186,435个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 375 | 2025-11-13 |
Acquisition of an immunosuppressive microenvironment after anti-CD19 CAR T-cell therapy is associated with T-cell dysfunction and resistance
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011768
PMID:41135951
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析，揭示了抗CD19 CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境获得免疫抑制特性与T细胞功能障碍和治疗抵抗的关联 | 首次在单细胞水平系统描述了CAR-T治疗后骨髓微环境的动态变化，发现髓系细胞激活、干扰素反应、缺氧和TGF-β信号通路在驱动免疫抑制中的关键作用 | 样本量有限，需要在更大队列中验证发现；机制研究主要基于相关性分析，需要进一步功能验证 | 探究CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境变化与治疗反应的关系 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者和造血干细胞人源化小鼠模型 | 单细胞生物学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | B-ALL患者治疗前后骨髓样本，人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 376 | 2025-11-13 |
TRIM28 drives immune evasion via PARP1 SUMOylation and NAD+ depletion in clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013025
PMID:41135953
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研究论文 | 本研究揭示了TRIM28通过PARP1 SUMO化和NAD+耗竭驱动透明细胞肾细胞癌免疫逃逸的新机制 | 首次发现TRIM28通过双重免疫代谢机制促进免疫抵抗：稳定PARP1并促进其SUMO化，以及耗竭肿瘤微环境中的NAD+ | 研究主要基于细胞模型和动物实验，需要进一步临床验证 | 探索透明细胞肾细胞癌中免疫逃逸的分子机制 | 透明细胞肾细胞癌细胞系、CD8+ T细胞、患者来源异种移植模型 | 癌症免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组学、RNA-seq、质谱分析、代谢组学、虚拟筛选 | Geneformer、患者来源异种移植模型 | 转录组数据、代谢组数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE159115数据集 |
| 377 | 2025-11-13 |
SPP1high macrophage-induced T-cell stress promotes colon cancer liver metastasis through SPP1/CD44/PI3K/AKT signaling
2025-Oct-20, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012330
PMID:41120125
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示SPP1高表达巨噬细胞通过SPP1/CD44/PI3K/AKT信号通路诱导T细胞应激状态促进结肠癌肝转移的机制 | 首次发现SPP1高表达巨噬细胞诱导的T细胞应激状态在结肠癌肝转移中的作用，并揭示SPP1/CD44/PI3K/AKT信号通路机制 | 研究样本量有限，主要基于体外实验验证机制 | 阐明结肠癌肝转移免疫抑制微环境的形成机制并寻找免疫治疗新靶点 | 结肠癌肝转移患者的肿瘤标本和匹配的肝转移灶 | 单细胞转录组学 | 结肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 结肠癌肝转移患者肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 378 | 2025-11-13 |
ALCAM-CD6 axis suppression: a key determinant of immune-mediated metastasis recurrence in stage III non-small cell lung cancer
2025-Oct-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010416
PMID:41073134
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研究论文 | 本研究揭示了ALCAM-CD6轴在III期非小细胞肺癌转移复发中的关键作用机制 | 首次发现ALCAM-CD6相互作用抑制导致免疫抑制状态，并通过转录因子MYB调控ALCAM表达影响肿瘤进展 | 研究样本仅限于III期NSCLC患者，未涵盖其他分期或肺癌亚型 | 探究III期非小细胞肺癌转移复发的生物学机制 | 接受肺癌切除术的III期非小细胞肺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序,组织流式细胞分析,实时PCR,Western blotting,基因沉默,细胞共培养,流式细胞术,染色质免疫沉淀定量PCR | NA | 单细胞测序数据,组织样本,临床数据 | 2018年8月至2021年7月期间接受肺癌切除术的III期NSCLC患者组织样本和临床数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 379 | 2025-11-13 |
Neural stem cell-delivered oncolytic virus via intracerebroventricular administration enhances glioblastoma therapy and immune modulation
2025-Oct-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012934
PMID:41062177
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研究论文 | 本研究通过脑室内注射神经干细胞递送溶瘤病毒，评估其对胶质母细胞瘤的治疗效果和免疫调节作用 | 利用神经干细胞作为溶瘤病毒载体通过脑室内给药增强肿瘤靶向性，并结合单细胞RNA测序揭示其通过下调S100A8/A9抑制髓源性抑制细胞募集的免疫调节机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 开发改善胶质母细胞瘤治疗效果的创新疗法 | 胶质母细胞瘤细胞、神经干细胞、溶瘤病毒 | 肿瘤免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外细胞实验、动物模型 | 异种移植模型、原位肿瘤模型、人源化免疫系统小鼠模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确具体样本数量，使用多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 380 | 2025-11-13 |
Multiomics elucidation of surrounding AT2 cells impeding tertiary lymphoid structures function in neoadjuvant chemoimmunotherapy response of multiple primary lung cancers
2025-Oct-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011882
PMID:41062178
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研究论文 | 通过多组学分析揭示AT2细胞通过MIF-SIAE信号轴抑制三级淋巴结构中B细胞功能，影响多原发肺癌新辅助化疗免疫治疗的疗效 | 首次发现AT2细胞通过MIF-SIAE信号轴抑制三级淋巴结构中B细胞功能，揭示了多原发肺癌免疫治疗反应不一致的新机制 | 样本量有限，仅分析了少数MPLC病例 | 探究多原发肺癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应不一致的机制 | 多原发肺癌患者的肿瘤病灶 | 多组学分析 | 肺癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,多重免疫组织化学,空间共定位分析 | 细胞邻域分析 | 单细胞数据,空间转录组数据,免疫组织化学数据 | 1例MPLC患者的所有病灶，外加3例MPLC患者的4个无反应结节 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |