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当前共找到 594 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-11-07 |
Improving immunotherapy responses by dual inhibition of macrophage migration inhibitory factor and PD-1
2025-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191539
PMID:41122966
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研究论文 | 本研究探讨了联合抑制巨噬细胞移动抑制因子(MIF)和PD-1在两种小鼠肿瘤模型中的免疫治疗效果 | 首次证明抗MIF疗法可增强抗PD-1免疫检查点抑制剂的抗肿瘤效果，并发现Cd74/C1q/Aif1表达巨噬细胞的抗肿瘤表型 | 研究仅限于小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 评估抗MIF疗法与抗PD-1联合使用的抗肿瘤疗效 | YUMMER1.7黑色素瘤和MC38结直肠癌小鼠模型，以及人类黑色素瘤患者 | 免疫肿瘤学 | 黑色素瘤，结直肠癌 | scRNA-Seq，流式细胞术，免疫组织化学，细胞因子分析 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据，临床数据 | 多种基因型小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2025-11-07 |
Unraveling enteroendocrine cell lineage dynamics and associated gene regulatory networks during intestinal development
2025-Oct-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.062083
PMID:41117135
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研究论文 | 本研究通过小鼠胚胎和人类多能干细胞来源的肠道类器官模型，结合单细胞转录组学，揭示了肠道内分泌细胞在发育过程中的谱系动态和基因调控网络 | 首次系统性地揭示了发育过程中肠道内分泌细胞亚型特化的机制，发现其独立于完整的隐窝-绒毛结构和饮食/微生物刺激 | 研究主要基于模型系统，需要进一步在体内验证；某些EEC亚型的出现机制仍需深入探索 | 阐明肠道内分泌细胞在发育过程中的谱系动态和分化机制 | 小鼠胚胎、人类多能干细胞来源的肠道类器官 | 单细胞生物学 | 肠道发育疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠胚胎和人类肠道类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2025-11-07 |
Uncovering Cellular Interactome Drivers of Immune Checkpoint Inhibitor Response in Advanced Melanoma Patients
2025-Oct, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-025-00857-y
PMID:41185627
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据构建细胞相互作用网络，识别与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的网络模式 | 首次将肿瘤微环境中的细胞间相互作用建模为加权有向网络，并识别与治疗反应相关的网络模式 | 依赖于公开可用的单细胞RNA测序数据，样本量有限 | 识别与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的细胞相互作用网络驱动因素 | 晚期黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 多元统计学习方法 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 多个黑色素瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 324 | 2025-11-06 |
Translational framework linking perfluoroheptanoic acid (PFHpA) exposure to metabolic dysfunction associated steatotic liver disease in adolescents
2025-Oct-29, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-01168-z
PMID:41162609
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研究论文 | 开发了一个连接PFHpA暴露与青少年代谢功能障碍相关脂肪肝病的转化研究框架 | 首次将人类队列数据与体外单细胞转录组学整合，揭示短链未受监管的PFAS同系物PFHpA与MASLD的关联 | 样本量相对较小(n=136)，且研究对象仅限于接受减肥手术的肥胖青少年 | 阐明PFAS对代谢功能障碍相关脂肪肝病发展的影响 | 青少年肥胖患者(平均年龄16.8岁)和体外培养的人肝球状体 | 生物医学研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学、肝活检 | LUCID模型 | 血浆样本、蛋白质组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 136名青少年肥胖患者 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 325 | 2025-11-06 |
Invariant HVC size in female canaries singing under testosterone: Unlocking function through neural differentiation, not growth
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426847122
PMID:41115194
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研究论文 | 通过体内成像和空间转录组学研究发现，睾酮诱导雌性金丝雀唱歌时HVC核团大小保持不变，而是通过神经元表型和基因网络变化实现功能分化 | 挑战了传统认为HVC核团在功能状态转换时会发生显著大小变化的观点，揭示了功能分化可在稳定解剖框架内通过转录组重组实现 | 研究仅针对雌性金丝雀，未验证其他物种或性别；样本数量有限 | 探究睾酮诱导唱歌行为时HVC核团的神经机制变化 | 成年雌性金丝雀的HVC song control nucleus | 神经科学 | NA | 双光子体内成像，空间转录组学 | NA | 图像数据，转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 326 | 2025-11-06 |
Spatial gene expression analysis reveals pathological niches in Japanese encephalitis virus neuroinvasion
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515006122
PMID:41129224
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析日本脑炎病毒在小鼠大脑中的早期感染过程 | 首次在单细胞分辨率下绘制JEV感染过程中病毒RNA和宿主基因表达的空间分布图谱 | 研究仅关注感染早期阶段（1-4天），未涵盖疾病全程发展 | 阐明日本脑炎病毒神经侵袭的细胞动力学和病理生态位 | JEV感染的小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 脑炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠大脑切片（1dpi和4dpi时间点） | NA | 空间转录组学 | NA | 高多重空间转录组平台 |
| 327 | 2025-11-06 |
Single-cell metabolome and RNA-seq multiplexing on single plant cells
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2512828122
PMID:41134629
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研究论文 | 本研究开发了一种在单个植物细胞上同时进行单细胞代谢组和RNA测序的多重分析技术 | 首次实现在同一植物细胞上同时进行单细胞RNA测序和单细胞质谱代谢组学分析，实现基因表达与代谢物水平的直接比较 | 概念验证研究，样本量有限，仅使用药用植物叶片细胞 | 阐明植物天然产物生物合成途径的基因与代谢物关系 | 药用植物叶片原生质体 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞质谱代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物浓度数据 | 96孔板分选的单个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞代谢组学 | SMART-seq | 微流控机器人分选系统，适用于scMS和SMART-seq单细胞协议 |
| 328 | 2025-11-06 |
Bcl6 expression is associated with a distinct immune landscape and spatial transcriptome in COVID-19
2025-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189134
PMID:40924502
|
研究论文 | 本研究通过多重成像和空间转录组学分析COVID-19患者肺引流淋巴结，揭示Bcl6表达与免疫景观和空间转录组的关联 | 首次在COVID-19背景下基于Bcl6表达水平对反应性滤泡进行分类，并发现不同Bcl6表达水平与特定免疫细胞亚群和分子通路的关联 | 样本来源于尸检组织，可能无法完全反映活体免疫动态；样本量有限 | 探索病毒感染急性期人类淋巴结中滤泡和生发中心免疫反应的调控机制 | COVID-19患者尸检获取的肺引流淋巴结和膈下淋巴结 | 空间转录组学 | COVID-19 | 多重成像, 空间转录组学 | NA | 图像, 空间转录组数据 | COVID-19尸检淋巴结样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 329 | 2025-11-06 |
Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101323
PMID:41142913
|
研究论文 | 开发了一种结合统计和生物物理模型的混合建模方法，通过基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的机制模型相结合，通过可解释的线性稀疏回归模型将基因表达与生物物理模型参数联系起来 | 模型与数据之间存在不匹配问题，需要通过模拟推理来克服 | 建立基因表达与神经元生理特性之间的联系，理解离子通道基因在决定神经放电特性中的机制作用 | 多种皮层细胞类型的神经元 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学，多模式Patch-seq数据 | Hodgkin-Huxley模型，线性稀疏回归模型 | 基因表达数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 330 | 2025-11-06 |
Stage-specific regulation by autophagy-related transcription factors drives hematopoietic stem cell formation
2025-Oct, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2551671
PMID:40878056
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和metaTF分析揭示了自噬相关转录因子在小鼠造血干细胞发育不同阶段的调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序与metaTF分析，系统解析了造血干细胞发育过程中自噬相关转录因子的阶段特异性调控网络 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探索自噬相关转录因子在造血干细胞发育过程中的调控机制 | 小鼠造血干细胞发育过程中的六个连续阶段，包括主动脉-性腺-中肾区域、胎肝和成年骨髓 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, metaTF分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎期E10.5、E12.5、E14.5及成年期多个发育阶段的造血干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 331 | 2025-11-06 |
RELA Haploinsufficiency Manifesting as an Atypical Phenotype of Crohn's Disease
2025-Oct-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaf159
PMID:40876844
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研究论文 | 本研究通过基因测序和免疫分析揭示RELA单倍体不足导致克罗恩病样非典型表型的机制 | 首次将RELA单倍体不足与克罗恩病样胃肠道表现相关联，并通过多组学分析揭示其免疫机制 | 仅研究单一病例，需要更大样本量验证 | 表征由RELA单倍体不足驱动的非典型克罗恩病样表型的临床、基因组和免疫学特征 | 一名17岁男性患者，患有全肠型克罗恩病、肛周瘘管、慢性皮肤黏膜念珠菌病和慢性淋巴细胞减少症 | 医学遗传学 | 克罗恩病 | 全外显子组测序,Sanger测序,蛋白质建模,Western blotting,免疫荧光,核提取物NF-κB激活测定,质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,蛋白质数据,单细胞转录组数据 | 1例患者及对照样本 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 332 | 2025-11-05 |
Hidden network preserved in Slide-tags data allows reference-free spatial reconstruction
2025-Oct-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65295-w
PMID:41173855
|
研究论文 | 通过重新分析Slide-tags数据发现隐藏的细胞-磁珠网络，实现无需参考的空间重建 | 发现Slide-tags数据中意外形成的空间信息细胞-磁珠网络，将其重新定义为基于网络的测序成像方法 | NA | 开发无需预索引阵列的空间组织重建方法 | Slide-tags空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 网络优化模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | Slide-tags | 基于预解码磁珠阵列的空间条形码标记技术 |
| 333 | 2025-11-05 |
Transcriptomic response analysis of rubber tree saplings to water-deficit stress at single-cell resolution
2025-Oct-31, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09046-z
PMID:41174182
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了橡胶树幼苗在水分胁迫下的细胞和分子响应机制 | 首次构建了橡胶树树皮在水分胁迫下的高分辨率单细胞转录组图谱，系统揭示了不同细胞类型对干旱胁迫的响应特征 | 研究仅分析了4天和7天两个时间点的胁迫响应，未涵盖更长期的适应过程 | 探究橡胶树对水分胁迫的分子适应机制，为提升其抗旱性提供理论基础 | 橡胶树幼苗的树皮组织 | 植物生物学 | 非疾病研究（植物胁迫响应） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,994个单个细胞，来自对照、4天和7天干旱胁迫的树皮组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴式单细胞RNA测序技术 |
| 334 | 2025-11-05 |
Pan-Cancer Landscape of Magnesium Homeostasis: Bulk Omics Research and Single-Cell Sequencing Validation
2025-Oct-31, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00294-1
PMID:41174507
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研究论文 | 本研究全面分析了33种癌症类型中镁稳态的作用，探索其在肿瘤发生、免疫调节和治疗潜力中的意义 | 首次在泛癌水平系统研究镁稳态，结合批量组学分析和单细胞测序验证，提出镁稳态评分作为预后生物标志物 | 需要进一步的临床验证来推进个性化癌症治疗 | 全面分析镁稳态在多种癌症类型中的作用机制 | 33种癌症类型的肿瘤样本和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 多种癌症 | 批量组学分析, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 单细胞测序数据 | 33种癌症类型的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量组学分析 | NA | NA |
| 335 | 2025-11-05 |
From pixels to cell types: a comprehensive review of computational methods for spatial transcriptomics deconvolution
2025-Oct-31, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00055-2
PMID:41174717
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综述 | 本文全面回顾了空间转录组学反卷积的二十种计算方法，分析其方法论基础和技术特点 | 首次系统对比分析二十种空间转录组反卷积算法的方法论基础、计算原理和处理范式 | NA | 为研究人员提供空间转录组反卷积计算方法的全面理解和实践指导 | 空间转录组反卷积计算方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 336 | 2025-11-05 |
Integrating single-cell RNA-seq datasets with substantial batch effects
2025-Oct-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12126-3
PMID:41168710
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研究论文 | 提出一种基于条件变分自编码器的新方法sysVI，用于整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集 | 采用VampPrior和循环一致性约束，解决了现有方法在整合跨系统数据集时过度去除生物信号的问题 | NA | 开发能够有效整合跨系统单细胞RNA测序数据集的计算方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器(cVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 337 | 2025-11-05 |
egal-1 and microtubules promote regeneration polarity in planarians
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204668
PMID:41099308
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了涡虫头部与尾部再生极性决定的新机制 | 首次发现Egal-1和微管系统共同调控涡虫纵向肌肉纤维中notum基因的不对称表达，从而决定再生极性 | 对纵向肌肉纤维内具体分子机制的理解仍不完整 | 探究涡虫头部与尾部再生极性决定的分子机制 | 涡虫（planarians）及其纵向肌肉细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA干扰，药物处理 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 338 | 2025-11-05 |
PMEPA1-Mediated Treg Cell Impairment Promotes Endometrial Stromal Invasion via Excessive PI3K/AKT Signaling in Endometriosis
2025-Oct, Current medical science
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11596-025-00125-0
PMID:41100035
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研究论文 | 本研究揭示了PMEPA1通过过度激活PI3K/AKT信号通路损害调节性T细胞功能，从而促进子宫内膜异位症中子宫内膜基质细胞的侵袭能力 | 首次阐明PMEPA1在调节性T细胞中的具体作用机制及其通过PI3K/AKT信号通路影响子宫内膜异位症病理过程的分子机制 | 样本量较小（仅3例患者进行单细胞测序），需要更大规模研究验证 | 探究PMEPA1调控调节性T细胞功能及其在子宫内膜异位症发病机制中的作用 | 子宫内膜异位症患者的卵巢异位病灶和正常在位子宫内膜组织、外周血单核细胞来源的原代人调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附试验, 细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 3例子宫内膜异位症患者的配对异位卵巢病灶和在位子宫内膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 339 | 2025-11-05 |
Publisher Correction: Investigation of the relationship between COVID-19 disease and semen parameters in idiopathic male infertility patients
2025-Oct, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202510_37463
PMID:41182310
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更正 | 本文是对已发表文章中参考文献列表错误的更正说明 | NA | 由于排版最终化过程中的内部错误，导致最终PDF中无意插入了另一篇文章的错误参考文献 | 更正已发表文章中的参考文献错误 | NA | NA | COVID-19 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2025-11-04 |
A novel spatial framework to validate arsenic exposure gene expression profiling in bladder cancer using multiplex FISH and AI-powered digital pathology
2025-Oct-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23396-y
PMID:41168438
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研究论文 | 本研究开发了一种结合多重荧光原位杂交和AI数字病理学的空间框架，用于验证膀胱癌中砷暴露相关基因表达特征 | 首次将mFISH与AI驱动的数字病理学整合，在单细胞分辨率下验证砷暴露相关三基因风险模型的空间分布特征 | 仅为探索性试点研究，样本量较小（5个膀胱肿瘤标本），需要更大规模研究验证 | 验证砷暴露相关基因表达特征在膀胱癌中的空间分布及其临床意义 | 膀胱肿瘤组织标本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 多重荧光原位杂交(mFISH), AI数字病理分析 | HoverNet | 全切片图像, 基因表达数据 | 5个膀胱肿瘤标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |