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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-31 |
Deciphering splicing heterogeneity at single-cell resolution by SCSES
2025-Oct-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64517-5
PMID:41145486
|
研究论文 | 开发了一种名为SCSES的计算框架,用于在单细胞水平增强选择性剪接分析 | 通过数据扩散在相似细胞和事件间共享信息来推断和补全缺失的剪接变化 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序中准确表征剪接变化的挑战 | 单细胞剪接异质性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数据扩散算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 322 | 2025-10-31 |
Hmox1 expression indicates distinct injury phenotypes of proximal tubule cells in sepsis-associated acute kidney injury
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05764-w
PMID:41145479
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,鉴定Hmox1作为脓毒症相关急性肾损伤中近端小管细胞损伤的特异性生物标志物 | 首次发现Hmox1高表达和低表达的近端小管细胞亚群在SAKI中表现出不同的表型特征 | NA | 识别SAKI诊断的特异性生物标志物并阐明其病理机制 | 肾组织中的近端小管细胞 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 323 | 2025-10-31 |
SPP1+ macrophages promote colorectal cancer progression by activating JAK2/STAT3 signaling pathway
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21420-9
PMID:41145614
|
研究论文 | 本研究揭示SPP1+巨噬细胞通过激活JAK2/STAT3信号通路促进结直肠癌进展的机制 | 首次发现SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的极性改变通过JAK2/STAT3通路调控结直肠癌进展 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞极性改变对结直肠癌进展的影响及分子机制 | 结直肠癌细胞(MC38)和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 细胞共培养, CCK-8检测, TUNEL染色, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | 小鼠结直肠癌模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 324 | 2025-10-31 |
Intratumoral plasma cells predict patient prognosis and responsiveness to neoadjuvant immunotherapy in advanced gastric cancer
2025-Oct-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01071-9
PMID:41145683
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研究论文 | 本研究通过多中心数据整合分析,开发了基于肿瘤内浆细胞的MZB1阳性评分系统,用于预测晚期胃癌患者对免疫治疗的预后和反应性 | 首次发现成熟三级淋巴结构是胃癌浸润浆细胞中体细胞超突变和克隆选择的关键位点,并建立了基于浆细胞浸润程度的MZB1阳性评分系统 | 研究依赖于胃镜活检组织,存在组织样本大小的固有局限性 | 开发新的生物标志物来预测胃癌患者对免疫治疗的反应和预后 | 晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,转录组测序 | NA | 组织样本,转录组数据,空间转录组数据 | 来自七个独立医疗中心的胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2025-10-31 |
KIAA1429-mediated M6A methylation inhibits osteoclast differentiation via stabilizing Lrp4 mRNA and protects against osteoporosis
2025-Oct-27, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00800-z
PMID:41146006
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研究论文 | 本研究探讨KIAA1429介导的m6A甲基化通过稳定Lrp4 mRNA抑制破骨细胞分化并预防骨质疏松的机制 | 首次揭示KIAA1429通过m6A-YTHDC1-LRP4-TNFAIP3轴抑制NF-κB信号通路的新机制 | 未明确说明样本规模及临床数据的具体来源 | 探究KIAA1429在骨质疏松及破骨细胞分化中的生物学功能及分子机制 | 骨质疏松患者临床样本、卵巢切除小鼠模型、破骨细胞 | 表观遗传学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, m6A甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 326 | 2025-10-31 |
MX1 is a novel crucial prognostic and therapeutic target inducing chemoresistance in right-sided colon cancer: insights from machine learning-based multi-omics analysis
2025-Oct-27, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00840-8
PMID:41146251
|
研究论文 | 本研究通过机器学习驱动的多组学分析,发现MX1是右侧结肠癌中诱导化疗耐药的关键预后和治疗靶点 | 首次将MX1鉴定为右侧结肠癌中与化疗耐药和肿瘤微环境失调密切相关的关键靶点,并揭示了其通过VEGFA-VEGFR2通路促进血管生成的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要更多体内实验和临床前研究来确认MX1的治疗潜力 | 识别和表征与右侧结肠癌进展和治疗反应相关的关键生物标志物 | 右侧结肠癌患者和结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结肠癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),机器学习算法,单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化染色,CCK-8检测,transwell迁移实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,临床样本数据 | TCGA数据集和四个GEO数据集中的右侧结肠癌样本,临床样本验证 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 327 | 2025-10-31 |
Integrative metaprogram analysis reveals transcriptional dysregulation of oxidative stress response in granulosa cells from polycystic ovary syndrome
2025-Oct-27, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01811-2
PMID:41146316
|
研究论文 | 通过整合元程序分析揭示多囊卵巢综合征颗粒细胞中氧化应激反应的转录失调 | 开发整合单细胞和批量RNA测序的元程序分析框架,首次在PCOS颗粒细胞中鉴定出10个转录元程序并发现GPX3作为连接氧化应激与代谢功能障碍的关键调控基因 | 研究依赖于公共数据集和实验室生成数据,需要进一步实验验证GPX3的功能机制 | 探究多囊卵巢综合征的分子机制,特别关注氧化应激相关通路 | 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,微阵列 | 非负矩阵分解,加权基因共表达网络分析 | RNA测序数据,微阵列数据 | 包含GSE240688单细胞数据集、实验室批量RNA-seq数据集和GSE34526验证微阵列数据集,以及193个GTEx卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,微阵列 | NA | NA |
| 328 | 2025-10-31 |
Identification and Validation of Iron Metabolism-Related Biomarkers in Endometriosis: A Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics Study
2025-Oct-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47100831
PMID:41150779
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞转录组学识别并验证子宫内膜异位症中铁代谢相关生物标志物 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学方法系统研究铁代谢相关基因在子宫内膜异位症中的作用机制 | 研究样本量有限,主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索铁代谢相关基因在子宫内膜异位症中的生物标志物价值 | 子宫内膜异位症患者样本 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个GSE数据集(GSE86534, GSE105764, GSE213216) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 329 | 2025-10-31 |
Harnessing scRNA-seq and bulk RNA-seq to identify CD39+ T cell genes for rheumatoid arthritis diagnosis and therapy
2025-Oct-01, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf130
PMID:40974094
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别CD39+ T细胞相关基因作为类风湿关节炎诊断和治疗的生物标志物 | 首次结合scRNA-seq和bulk RNA-seq分析CD39+ T细胞基因特征,发现PELI1等关键基因的诊断价值并构建lncRNA-miRNA-PELI1调控网络 | 未明确说明样本来源和具体样本量,需要进一步实验验证PELI1的生物学功能 | 识别类风湿关节炎诊断和治疗生物标志物 | CD39+ T细胞及其相关基因 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 330 | 2025-10-31 |
AURKA Enhances Antitumor Immunity by Activating CD4+ T Cell Proliferation in Colorectal Cancer
2025-Oct, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2025.2559403
PMID:40995659
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示AURKA在结直肠癌中通过激活CD4+ T细胞增殖增强抗肿瘤免疫的双重功能 | 首次整合空间转录组学发现AURKA在肿瘤周围T细胞富集区与免疫激活标志物共表达,并证实其可作为免疫治疗生物标志物 | 研究样本量有限,需要在更大队列中验证AURKA的预后和预测价值 | 阐明AURKA在结直肠癌肿瘤增殖和免疫微环境调控中的双重作用机制 | 结直肠癌患者样本和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, CIBERSORT, ssGSEA, IHC, HE染色 | 小鼠模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床病理数据 | 未明确具体样本数量,包含临床队列和小鼠模型 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 331 | 2025-10-31 |
Targeting Intratumoral Copper Inhibits Tumor Progression via p62-Mediated EZH2 Degradation and Potentiates Anti-PD-1 Immunotherapy in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417795
PMID:40719074
|
研究论文 | 本研究揭示了铜在口腔鳞状细胞癌中的关键作用机制,发现通过靶向铜离子可促进EZH2降解并增强抗PD-1免疫治疗效果 | 首次发现铜通过SMURF2调控EZH2蛋白稳定性,并证实铜螯合剂与抗PD-1联合治疗的协同作用 | 研究主要聚焦于OSCC,其他癌症类型的适用性需进一步验证 | 探究铜在口腔鳞状细胞癌进展中的作用机制及治疗潜力 | 口腔鳞状细胞癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化染色,siRNA,蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,组织染色图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 332 | 2025-10-31 |
Mesencephalic Astrocyte-Derived Neurotrophic Factor Binds BAX to Preserve Mitochondrial Homeostasis and Energy Metabolism for Relieving Myocardial Hypertrophy
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502835
PMID:40739335
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研究论文 | 本研究探讨中脑星形胶质细胞源性神经营养因子(MANF)通过结合BAX蛋白维持线粒体稳态和能量代谢来缓解心肌肥厚的机制 | 首次发现MANF与促凋亡蛋白BAX相互作用,抑制其线粒体转位,从而减少线粒体损伤和心肌细胞死亡 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需要进一步验证 | 探究MANF在心肌肥厚中的作用机制 | 心肌细胞特异性MANF基因敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 心肌肥厚 | 单细胞RNA测序,代谢组学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,代谢数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 333 | 2025-10-31 |
Immune Cell Dynamics in Cardiac Diseases: Insights From Single-Cell Sequencing
2025-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70846
PMID:41139809
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综述 | 本文通过单细胞测序技术系统总结免疫细胞在心脏疾病中的动态调控机制 | 首次基于单细胞测序技术全面揭示心脏疾病中免疫细胞的异质性、可塑性及细胞间相互作用 | NA | 阐明免疫细胞在心脏疾病发生发展中的动态调控机制,为精准治疗提供新靶点 | 心脏疾病中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因组和转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 334 | 2025-10-31 |
In Vivo Reprogramming Dysfunctional Retinal Ganglion Cells and Visual-phototransduction via Wireless Charging Nanogold for Leber's Hereditary Optic Neuropathy
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504509
PMID:40852879
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研究论文 | 开发无线充电金纳米颗粒用于治疗Leber遗传性视神经病变,通过线粒体靶向基因递送和电刺激恢复视觉光转导功能 | 首次将无线充电金纳米颗粒同时作为基因递送平台和电刺激介导的光转导恢复工具,实现线粒体靶向治疗 | 研究主要基于小鼠模型和患者来源的视网膜类器官,临床转化效果需进一步验证 | 开发Leber遗传性视神经病变的新型基因治疗方法 | 视网膜神经节细胞、Müller胶质细胞、光感受器细胞 | 基因治疗 | Leber遗传性视神经病变 | 单细胞RNA测序、时空转录组分析、iPSC分化视网膜类器官 | NA | 基因表达数据、电生理数据、转录组数据 | LHON小鼠模型和患者来源的iPSC分化视网膜类器官 | NA | 单细胞RNA测序, 时空转录组分析 | NA | NA |
| 335 | 2025-10-31 |
The overexpression of HOXC6 in LUSC and pan-squamous cell carcinomas indicates the coexistence of nuclear division regulatory mechanisms
2025-Oct, Cancer biomarkers : section A of Disease markers
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/18758592251390255
PMID:41160411
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析HOXC6在肺鳞癌及其他鳞状细胞癌中的表达模式及功能 | 首次在泛鳞状细胞癌层面系统分析HOXC6的表达特征,并揭示其通过调控有丝分裂影响肿瘤发展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证HOXC6调控有丝分裂的具体分子机制 | 探究HOXC6在肺鳞癌及泛鳞状细胞癌中的表达模式、功能及其与肿瘤微环境的关系 | 肺鳞癌、宫颈鳞癌、食管鳞癌、喉鳞癌和口腔鳞癌组织样本 | 生物信息学 | 肺鳞癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫组织化学, CRISPR基因敲除 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 多种鳞状细胞癌组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 336 | 2025-10-30 |
Targeting Mast Cell Activation and MIF-Mediated Remodelling Enhances Chemotherapy Response in Pancreatic Cancer
2025-Oct-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509930
PMID:41159485
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研究论文 | 本研究揭示新辅助化疗AG通过激活肥大细胞和MIF信号通路重塑胰腺癌肿瘤微环境,并提出靶向该通路可增强化疗疗效 | 首次发现AG化疗通过MIF轴激活肥大细胞并促进其与iCAFs和T细胞的抑制性串扰,提出靶向TAMCs-MIF信号可优化新辅助治疗策略 | 研究主要基于动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索新辅助化疗AG对胰腺癌肿瘤微环境的影响及优化治疗策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的细胞组分 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 8个单细胞RNA测序数据集和9个多中心转录组队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 337 | 2025-10-30 |
Predicting Immunotherapy Outcomes in NSCLC Using RNA and Pathology from Multicenter Clinical Trials
2025-Oct-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502037
PMID:41159493
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研究论文 | 开发基于RNA的LIRA模型预测非小细胞肺癌患者免疫治疗疗效 | 首次结合多中心临床试验数据开发LIRA模型,在预测免疫治疗反应方面优于PD-L1表达和肿瘤突变负荷 | 研究样本主要来自临床试验队列,需要进一步验证在真实世界人群中的适用性 | 预测非小细胞肺癌患者免疫治疗疗效并识别潜在耐药机制 | 1127例晚期非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 深度学习 | 随机森林, 深度学习模型 | RNA测序数据, 全切片图像 | 1127例晚期NSCLC患者(来自OAK、POPLAR、ORIENT-11试验和内部队列) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 338 | 2025-10-30 |
IL4/IL13 inhibition via dupilumab reduces malignant T cell proliferation and promotes antitumor immunity in Sezary syndrome
2025-Oct-29, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0677
PMID:41159943
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研究论文 | 本研究探讨了dupilumab通过抑制IL4/IL13通路在Sezary综合征中的抗肿瘤作用机制 | 首次使用单细胞RNA测序结合T细胞免疫组库分析揭示dupilumab在SS治疗中的分子机制,证明其比单独阻断IL4或IL13更有效抑制恶性淋巴细胞增殖 | 研究样本量有限,主要基于体外实验和患者特异性转录变化分析 | 评估dupilumab在Sezary综合征中的治疗潜力及其对肿瘤微环境的影响 | Sezary综合征患者的恶性T淋巴细胞、反应性T淋巴细胞、单核细胞和树突状细胞 | 单细胞测序分析 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,T细胞免疫组库分析 | NA | 单细胞转录组数据 | Sezary综合征患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 339 | 2025-10-30 |
The transcription factor RBPJ is required for inflammatory macrophage activation in thoracic aortic dissection by mediating mechanotransduction-induced glycolysis
2025-Oct-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05908-1
PMID:41148245
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子RBPJ通过介导机械转导诱导的糖酵解在胸主动脉夹层中促进炎症性巨噬细胞活化的机制 | 首次发现RBPJ在胸主动脉夹层中通过Piezo1感应机械力并上调PDK1促进糖酵解,从而驱动巨噬细胞向M1样极化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限 | 探究RBPJ在胸主动脉夹层中巨噬细胞活化的作用和分子机制 | 胸主动脉夹层患者样本、BAPN诱导的小鼠模型、骨髓来源巨噬细胞 | 分子生物学 | 胸主动脉夹层 | RNA测序、单细胞RNA测序、基因敲除 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 小鼠模型和体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 340 | 2025-10-30 |
Integrated Single-Nucleus and Spatial Transcriptomics Elucidate Heterogeneity and Hypoxia-Driven Organization of Supratentorial Ependymoma
2025-Oct-28, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2694
PMID:41150895
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研究论文 | 通过整合单核和空间转录组学技术,阐明幕上室管膜瘤的异质性及缺氧驱动的空间组织结构 | 发现两个与细胞外基质重塑和ZFTA融合身份相关的新转录程序,并开发了对混合点转录组敏感的空间评分算法 | 样本量相对有限(单核样本63个,空间样本30个),需要进一步验证 | 解析幕上室管膜瘤的分子异质性和空间组织结构 | 幕上室管膜瘤组织样本 | 空间转录组学 | 脑肿瘤 | 单核转录组测序, 空间转录组测序 | 空间评分算法 | 转录组数据 | 单核样本63个,空间样本30个 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |