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当前共找到 627 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-12-01 |
StomachDB: An Integrated Multi-Omics Database for Gastric Diseases
2025-Oct-24, Biology
DOI:10.3390/biology14111484
PMID:41300276
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研究论文 | 开发了首个专注于胃部疾病的综合多组学数据库StomachDB | 首个专注于胃部疾病的综合多组学数据库，整合了6种生物数据类型 | NA | 增强胃部疾病的诊断和治疗理解 | 44种胃部相关病理，包括胃癌、胃溃疡和胃炎 | 生物信息学 | 胃部疾病 | 多组学整合分析 | NA | 基因组学、转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | 约250万个标准化数据文件和268,394个疾病-基因关联 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学整合 | NA | NA |
| 302 | 2025-12-01 |
Attention-Guided Probabilistic Diffusion Model for Generating Cell-Type-Specific Gene Regulatory Networks from Gene Expression Profiles
2025-Oct-24, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16111255
PMID:41300707
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研究论文 | 提出一种基于扩散模型的深度学习框架Planet，用于从单细胞RNA测序数据生成细胞类型特异性基因调控网络 | 采用三重混合注意力Transformer捕获长程调控依赖关系，并引入快速采样策略加速推理过程 | 与DigNet方法相比在可比条件下仅实现轻微性能提升 | 构建具有全局一致性的细胞特异性基因调控网络 | 小鼠肺Cd8Gzmk T细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 扩散模型, Transformer | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 303 | 2025-12-01 |
An ApiAP2 Family Transcriptional Factor PfAP2-06B Regulates Erythrocyte Invasion Indirectly in Plasmodium falciparum
2025-Oct-22, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens14111076
PMID:41305314
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研究论文 | 本研究揭示了疟原虫ApiAP2家族转录因子PfAP2-06B通过调控入侵相关基因间接调节红细胞入侵过程 | 首次发现PfAP2-06B转录因子通过调节入侵相关基因表达间接影响疟原虫红细胞入侵，并揭示了其在细胞间基因表达随机变异中的作用 | 未明确PfAP2-06B具体调控的下游靶基因网络及其直接作用机制 | 探究PfAP2-06B转录因子在疟原虫红细胞内发育周期中对红细胞入侵过程的调控作用 | 恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)及其红细胞入侵过程 | 分子生物学 | 疟疾 | 条件性基因敲低, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 304 | 2025-11-29 |
IGF1R deficiency mitigates acute lung injury by promoting anti-inflammatory transcriptional profiles
2025-Oct-22, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03339-x
PMID:41126254
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示IGF1R缺陷通过调控转录和表观遗传特征减轻急性肺损伤 | 首次系统阐明IGF1R缺陷通过调节细胞因子风暴、DNA损伤、代谢重编程和表观遗传调控等多重机制缓解急性肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；未涉及临床治疗应用 | 探究IGF1R在急性肺损伤发病机制中的作用及潜在治疗价值 | 人类COVID-19患者肺组织、小鼠肺组织、原代小鼠胚胎成纤维细胞 | 生物医学研究 | 急性肺损伤/COVID-19 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质检测, DNA损伤评估, 甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 表观遗传数据 | 人类COVID-19病例和对照捐赠者肺组织、博来霉素诱导的Igf1r缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 305 | 2025-11-29 |
Entrywise splitting cross-validation in generalized factor models: from sample splitting to entrywise splitting
2025-Oct-08, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf153
PMID:41311195
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研究论文 | 本文提出了一种基于条目分割的交叉验证方法，用于确定广义因子模型中的因子数量 | 提出条目分割而非样本分割的交叉验证方法，并引入带惩罚项的条目分割交叉验证准则 | NA | 解决广义因子模型中因子数量确定的挑战 | 广义因子模型和因子数量确定方法 | 机器学习 | NA | 交叉验证，信息理论准则 | 广义因子模型 | 多元数据（包括二元选择、计数和连续观测值） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2025-11-28 |
Exploring microRNAs, One Cell at a Time
2025-Oct-22, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna11060073
PMID:41283328
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研究论文 | 本文探讨了单细胞水平下microRNA的分析工具与计算方法 | 开发了分析细胞特异性miRNA丰度的实验工具和计算方法 | NA | 揭示miRNA生物学的复杂性，增进对生命科学和疾病的理解 | microRNAs（miRNAs） | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2025-11-27 |
Cross-expression meta-analysis of mouse brain slices reveals coordinated gene expression across spatially adjacent cells
2025-Oct-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03747-8
PMID:41163012
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研究论文 | 本研究提出“交叉表达”概念，通过整合多个小鼠大脑数据集构建元分析网络，揭示相邻细胞间基因表达的协调模式 | 引入“交叉表达”新概念，无需细胞类型标签或预定义数据库即可分析相邻细胞间基因表达协调性 | 方法依赖于基因表达和细胞位置矩阵的准确性，未考虑细胞间直接通讯机制 | 研究空间相邻细胞间基因表达的协调机制 | 小鼠大脑切片中的细胞 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组学，元分析 | 交叉表达网络 | 基因表达数据，空间位置数据 | 约2500万个细胞，695个切片，52个大脑 | 多种技术平台 | 空间转录组学 | 多种技术 | 8种不同技术平台的数据集 |
| 308 | 2025-11-26 |
Modeling Alzheimer's Disease with APOE4 Neuron-Glial Brain Assembloids Reveals IGFBPs as Therapeutic Targets
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683162
PMID:41279729
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研究论文 | 本研究开发了一种模拟阿尔茨海默病的3D脑类组装体模型，揭示了IGFBP通路在疾病进展中的新作用 | 首次创建包含神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞的3D类组装体模型，能够完整模拟阿尔茨海默病病理特征 | 模型仍需进一步验证其与人类疾病进展的完全一致性 | 开发能够准确模拟阿尔茨海默病进展的人类遗传背景模型，并探索治疗靶点 | iPSC来源的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 疾病建模 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，iPSC分化技术 | 3D类组装体模型 | 基因表达数据 | APOE4/4和同基因对照细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 309 | 2025-11-26 |
Activated fatty acid synthesis pathway in macrophages propagates pathogenic fibroblast expansion after myocardial infarction
2025-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.10.681697
PMID:41279812
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研究论文 | 本研究揭示心肌梗死后巨噬细胞中脂肪酸合成通路通过ACLY和FASN促进致病性成纤维细胞扩增的机制 | 首次发现心脏巨噬细胞通过脂肪酸合成通路调控成纤维细胞扩增，并阐明ACLY通过乙酰化调控促纤维化细胞因子IL-33产生的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究巨噬细胞脂肪酸合成通路在心肌梗死后炎症和心脏重塑中的作用 | 心肌梗死小鼠模型和人类心脏样本中的巨噬细胞与成纤维细胞 | 代谢组学与单细胞生物学 | 心血管疾病 | 空间代谢组学,CUT&RUN,RNA测序,单细胞RNA测序,空间多组学 | 基因敲除小鼠模型 | 代谢组数据,基因组数据,转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间多组学 | NA | NA |
| 310 | 2025-11-26 |
Nutritional hyperketonemia by dietary medium-chain fatty acids is driven by the liver without contribution from the intestine
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681190
PMID:41279942
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型和细胞实验证明膳食中链脂肪酸诱导的营养性高酮血症主要由肝脏介导，肠道几乎不参与此过程 | 首次明确区分肝脏和肠道在膳食中链脂肪酸诱导酮体生成中的具体作用，挑战了通过门静脉代谢物测量推断肠道贡献的常规做法 | 研究主要聚焦于C8:0中链脂肪酸，其他类型中链脂肪酸的作用尚未验证；细胞实验可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明膳食中链脂肪酸诱导营养性高酮血症的主要器官来源 | 基因敲除小鼠、原代肝细胞、人和小鼠肠道细胞系 | 代谢研究 | 代谢疾病 | RNA测序、细胞培养、代谢物测量 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、代谢物浓度数据 | 多种基因型小鼠、原代细胞和细胞系 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 311 | 2025-11-26 |
Transcriptional and epigenetic repression of hematopoietic stem cells underlies bone marrow failure after spinal cord injury
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.05.680535
PMID:41279599
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研究论文 | 本研究揭示了脊髓损伤通过转录和表观遗传抑制导致造血干细胞功能受损和骨髓衰竭的机制 | 首次发现脊髓损伤通过抑制造血干细胞的转录程序和染色质可塑性导致骨髓衰竭的系统性后果 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究脊髓损伤对造血干细胞功能和长期造血的影响机制 | 造血干细胞(HSCs) | 表观遗传学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组学,染色质可及性分析,体内移植实验 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,ATAC-seq | NA | NA |
| 312 | 2025-11-26 |
Investigating the dynamic signaling pathways involved in the specialization and differentiation of epiblast cells in early human embryos
2025-Oct, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.05.014
PMID:40581241
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胚胎早期发育过程中外胚层细胞特化的动态信号通路 | 首次系统揭示BMP、WNT、FGF、LIF和TGFβ等多条信号通路在人类胚胎外胚层发育中的动态作用模式 | 研究结果基于RNA表达模式推断，需要蛋白质水平和功能验证 | 探索人类胚胎外胚层细胞特化和分化过程中的细胞间通讯机制 | 人类早期胚胎发育过程中的外胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涵盖植入前、植入后、原肠胚形成前和早期原肠胚形成阶段的人类胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2025-11-25 |
Individual Host Variation in Single-cell Responses to Enteroaggregative Escherichia coli Infection Modeled with Human Colon Organoids
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.24.684350
PMID:41279052
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研究论文 | 本研究利用人类结肠类器官和单细胞RNA测序技术，探索个体宿主对肠聚集性大肠杆菌感染的异质性反应 | 首次在单细胞水平揭示人类结肠类器官对EAEC感染的个体特异性反应，发现三种不同的反应表型 | 仅使用三名健康成人供体的类器官样本，样本量有限 | 理解宿主驱动的EAEC感染疾病异质性 | 人类结肠类器官 | 单细胞生物学 | 肠道感染疾病 | 单细胞RNA测序 | 人类结肠类器官感染模型 | 单细胞转录组数据 | 三名健康成人供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 314 | 2025-11-25 |
Chromosomal instability degrades developmental phenotypes essential for anti-GD2 immunotherapy outcomes in high-risk neuroblastoma
2025-Oct-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102375
PMID:41015032
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研究论文 | 本研究通过分析840个高风险神经母细胞瘤样本，揭示了染色体不稳定性通过降解发育表型影响抗GD2免疫治疗效果 | 首次发现染色体11q缺失通过降解去甲肾上腺素能和代谢表型影响抗GD2免疫治疗效果 | 基因组与治疗结果的相关性研究仍有限，仅分析了19对活检样本的克隆演化 | 探索高风险神经母细胞瘤多模式治疗（含抗GD2免疫治疗）的基因组相关性 | 高风险神经母细胞瘤患者肿瘤样本 | 癌症基因组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，基因组分析 | NA | 基因组数据，单细胞RNA测序数据 | 840个肿瘤样本，19对活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 315 | 2025-11-25 |
Region-specific human brain organoids reveal synaptic and cell state drivers of glioblastoma invasion
2025-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.15.682580
PMID:41278684
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研究论文 | 本研究利用区域特异性人脑类器官揭示胶质母细胞瘤侵袭的突触和细胞状态驱动因素 | 开发了完全人源化的神经-GBM连接组模型，首次在区域特异性脑类器官中系统研究GBM侵袭机制 | 样本数量有限(15个独立样本)，类器官模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 识别侵袭性GBM细胞的分子特征及其在神经微环境中的调控因子 | 患者来源的胶质母细胞瘤细胞和人诱导多能干细胞衍生的脑类器官 | 神经肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | 狂犬病病毒单突触示踪,单细胞转录组学 | 脑类器官模型 | 转录组数据,示踪数据 | 15个独立GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2025-11-25 |
Characterization of immunosenescent alveolar macrophages in rhesus macaques
2025-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.10.681684
PMID:41279789
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序表征了恒河猴肺泡巨噬细胞在自然衰老过程中的免疫衰老特征 | 首次在非人灵长类动物模型中系统揭示肺泡巨噬细胞在自然衰老过程中的转录组和功能变化，并发现巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)作为潜在生物标志物 | 支气管肺泡灌洗液可能无法准确反映肺组织中肺泡巨噬细胞的真实状态，样本量未明确说明 | 研究自然衰老对肺泡巨噬细胞的影响及其在肺部衰老中的作用机制 | 年轻与老年恒河猴的肺泡巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序, 细胞因子分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 年轻和老年恒河猴(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 317 | 2025-11-25 |
Optimal transport modeling uncovers spatial domain dynamics in spatiotemporal transcriptomics studies
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680672
PMID:41278900
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研究论文 | 提出了一种名为SpaDOT的计算方法，用于识别空间转录组学研究中的空间域并推断其跨时间点的动态变化 | 结合变分自编码器框架与最优传输理论，首次在空间转录组学中同时建模全局空间连续性和局部结构异质性，并能追踪空间域随时间的动态转变 | NA | 开发计算方法来识别和追踪空间转录组学数据中的空间域动态变化 | 时空转录组学数据 | 空间转录组学 | 心脏瓣膜发育 | 时空转录组学 | 变分自编码器(VAE), 高斯过程, 最优传输(OT) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 318 | 2025-11-25 |
A Phase I Trial of Evorpacept, Lenalidomide, and Rituximab for Patients with B-Cell Non-Hodgkin Lymphoma
2025-Oct-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1826
PMID:40729376
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研究论文 | 评估Evorpacept联合来那度胺和利妥昔单抗治疗B细胞非霍奇金淋巴瘤患者的安全性及抗肿瘤活性 | 首次将CD47阻断剂Evorpacept与来那度胺和利妥昔单抗联合用于治疗B细胞非霍奇金淋巴瘤，并证明其可逆转SIRPα+巨噬细胞介导的耐药机制 | 单臂I期研究，样本量较小（20例患者），缺乏对照组 | 评估Evorpacept联合来那度胺和利妥昔单抗在B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的安全性和初步疗效 | 接受过至少两种系统治疗的B细胞非霍奇金淋巴瘤成年患者 | 肿瘤免疫治疗 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 20例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 319 | 2025-11-25 |
BTK Inhibitor Synergizes With CD19-Targeted Chimeric Antigen Receptor-T Cells in Patients With Relapsed or Refractory B-Cell Lymphoma: An Open-Label Pragmatic Clinical Trial
2025-Oct, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71321
PMID:41123227
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研究论文 | 本研究评估BTK抑制剂联合CD19靶向CAR-T细胞治疗复发或难治性B细胞淋巴瘤的安全性和疗效 | 首次在临床试验中证实BTK抑制剂能够增强CAR-T细胞疗法的抗肿瘤效果，并发现BTKi治疗组T细胞更倾向于早期分化且衰竭程度更低 | 非随机化试验设计，样本量较小（n=37），组间分配基于患者自主选择 | 评估BTK抑制剂联合CD19-CAR-T细胞治疗B细胞淋巴瘤的安全性和临床疗效 | 37例复发或难治性B细胞淋巴瘤患者 | 临床医学 | B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，单细胞转录组数据 | 37例患者（CAR-T单药组24例，联合治疗组13例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 320 | 2025-11-24 |
Single-cell profiles delineate immune cell remodeling and enhanced tumor-fibroblast interaction of hepatoblastoma after chemotherapy
2025-Oct-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102401
PMID:41038160
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了化疗后肝母细胞瘤免疫细胞重塑及肿瘤-成纤维细胞相互作用增强的机制 | 首次在肝母细胞瘤中整合单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学、多重免疫荧光和患者来源异种移植模型，全面解析化疗后肿瘤微环境变化 | 样本量相对有限（32个肿瘤），且为观察性研究，需要进一步功能验证 | 阐明化疗对肝母细胞瘤肿瘤微环境的影响及化疗耐药机制 | 肝母细胞瘤患者肿瘤组织（化疗前后） | 单细胞生物学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，批量转录组学，多重免疫荧光，患者来源异种移植 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，批量转录组数据，免疫荧光图像 | 32个肝母细胞瘤肿瘤（化疗前后配对样本） | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，批量RNA测序 | NA | NA |