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当前共找到 592 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-11-05 |
Integrating single-cell RNA-seq datasets with substantial batch effects
2025-Oct-30, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12126-3
PMID:41168710
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研究论文 | 提出一种基于条件变分自编码器的新方法sysVI，用于整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集 | 采用VampPrior和循环一致性约束，解决了现有方法在整合跨系统数据集时过度去除生物信号的问题 | NA | 开发能够有效整合跨系统单细胞RNA测序数据集的计算方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器(cVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 302 | 2025-11-05 |
egal-1 and microtubules promote regeneration polarity in planarians
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204668
PMID:41099308
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了涡虫头部与尾部再生极性决定的新机制 | 首次发现Egal-1和微管系统共同调控涡虫纵向肌肉纤维中notum基因的不对称表达，从而决定再生极性 | 对纵向肌肉纤维内具体分子机制的理解仍不完整 | 探究涡虫头部与尾部再生极性决定的分子机制 | 涡虫（planarians）及其纵向肌肉细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA干扰，药物处理 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 303 | 2025-11-05 |
PMEPA1-Mediated Treg Cell Impairment Promotes Endometrial Stromal Invasion via Excessive PI3K/AKT Signaling in Endometriosis
2025-Oct, Current medical science
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11596-025-00125-0
PMID:41100035
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研究论文 | 本研究揭示了PMEPA1通过过度激活PI3K/AKT信号通路损害调节性T细胞功能，从而促进子宫内膜异位症中子宫内膜基质细胞的侵袭能力 | 首次阐明PMEPA1在调节性T细胞中的具体作用机制及其通过PI3K/AKT信号通路影响子宫内膜异位症病理过程的分子机制 | 样本量较小（仅3例患者进行单细胞测序），需要更大规模研究验证 | 探究PMEPA1调控调节性T细胞功能及其在子宫内膜异位症发病机制中的作用 | 子宫内膜异位症患者的卵巢异位病灶和正常在位子宫内膜组织、外周血单核细胞来源的原代人调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附试验, 细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 3例子宫内膜异位症患者的配对异位卵巢病灶和在位子宫内膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 304 | 2025-11-05 |
Publisher Correction: Investigation of the relationship between COVID-19 disease and semen parameters in idiopathic male infertility patients
2025-Oct, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202510_37463
PMID:41182310
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更正 | 本文是对已发表文章中参考文献列表错误的更正说明 | NA | 由于排版最终化过程中的内部错误，导致最终PDF中无意插入了另一篇文章的错误参考文献 | 更正已发表文章中的参考文献错误 | NA | NA | COVID-19 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2025-11-04 |
A novel spatial framework to validate arsenic exposure gene expression profiling in bladder cancer using multiplex FISH and AI-powered digital pathology
2025-Oct-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23396-y
PMID:41168438
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研究论文 | 本研究开发了一种结合多重荧光原位杂交和AI数字病理学的空间框架，用于验证膀胱癌中砷暴露相关基因表达特征 | 首次将mFISH与AI驱动的数字病理学整合，在单细胞分辨率下验证砷暴露相关三基因风险模型的空间分布特征 | 仅为探索性试点研究，样本量较小（5个膀胱肿瘤标本），需要更大规模研究验证 | 验证砷暴露相关基因表达特征在膀胱癌中的空间分布及其临床意义 | 膀胱肿瘤组织标本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 多重荧光原位杂交(mFISH), AI数字病理分析 | HoverNet | 全切片图像, 基因表达数据 | 5个膀胱肿瘤标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 306 | 2025-11-04 |
Genome-wide association, single-cell, and spatial transcriptomics analyses reveal the role of the STK24-expressing positive cells in LUAD progression and the tumor microenvironment, identifying STK24 as a potential therapeutic target
2025-Oct-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07111-z
PMID:41168822
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研究论文 | 本研究通过整合基因组关联分析、单细胞转录组学和空间转录组学，揭示了STK24阳性细胞在肺腺癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 首次整合GWAS、单细胞和空间转录组学数据，发现STK24作为新的凋亡相关基因在LUAD中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探索肺腺癌的遗传机制和潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | GWAS, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 多种机器学习算法, 预后模型 | 基因组数据, 转录组数据, 空间位置数据 | 来自FinnGen、IEU OpenGWAS、GWAS Catalog和GEO数据库的多中心样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 307 | 2025-11-04 |
Ex vivo lung-organoid model for aberrant basaloid cell induction and activation
2025-Oct-30, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00396-z
PMID:41168897
|
研究论文 | 本研究开发了一种离体小鼠肺类器官模型，用于诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞 | 开发了首个能够诱导和激活肺纤维化特异性异常基底样细胞的离体肺类器官模型，并识别出两种不同的ABC亚群 | 研究基于小鼠模型，与人类疾病可能存在差异；模型验证仍需进一步临床相关性研究 | 研究肺纤维化中异常基底样细胞的诱导机制和功能 | 小鼠肺类器官和异常基底样细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，细胞-细胞相互作用分析 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 308 | 2025-11-04 |
Advancements in Personalized Medicine for Leukemia: Integrating Genetic, Transcriptomic, and Artificial Intelligence Insights
2025-Oct-29, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
综述 | 探讨遗传学、转录组学和人工智能在白血病精准医疗中的整合应用与进展 | 整合多组学数据与人工智能算法推动白血病个性化治疗策略的优化 | 存在克隆进化、遗传异质性和治疗耐药性等挑战 | 推进白血病精准医疗发展 | 白血病患者 | 自然语言处理 | 白血病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习, 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 309 | 2025-11-04 |
Temporal Clonal Tracing Reveals Tumor-Intrinsic IFNγ-Dependencies Driving Niche Adaptation and Early Metastatic Colonization
2025-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.669778
PMID:40832237
|
研究论文 | 通过单细胞条形码和转录组分析揭示肿瘤细胞在转移灶中的克隆动态及IFNγ信号的关键作用 | 开发MetTag单细胞追踪技术，首次发现早期播散克隆具有IFNγ依赖的转移适应机制 | 研究主要聚焦腹膜转移模型，其他转移器官的普适性需进一步验证 | 解析肿瘤细胞在转移灶中的克隆动态和分子决定因素 | 播散性肿瘤细胞(DTCs)和转移微环境 | 单细胞组学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9筛选,RNA速度分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 腹水和转移灶组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 310 | 2025-11-04 |
Isolation of mitochondrial mutation-specific T cell receptors
2025-Oct-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf139
PMID:40587813
|
研究论文 | 本研究首次成功分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性T细胞受体 | 首次报道从健康供体中分离出针对肿瘤线粒体DNA突变的特异性TCRs，证明了线粒体突变也能产生可被T细胞识别的新抗原 | 研究中存在一些生物学障碍需要考虑，且仅针对HLA-A*0201等位基因进行了筛选 | 探索肿瘤线粒体DNA突变是否能够产生被T细胞受体识别的新抗原 | 肿瘤线粒体DNA非同义突变及其对应的T细胞受体 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞测序，表位预测算法，TCR筛选验证 | NA | 基因组数据，蛋白质序列数据 | 10名HLA-A*0201纯合子健康供体，38种肿瘤类型的3,798个非同义单核苷酸突变 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 311 | 2025-11-04 |
Single-Cell Transcriptomics Shows Cellular Heterogeneity, Intercellular Communication, and Extracellular Matrix Remodeling in Corneal Fibrosis In Vivo
2025-Oct-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.13.48
PMID:41147949
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示兔角膜纤维化过程中细胞异质性、细胞间通讯和细胞外基质重塑的动态变化 | 首次在体内建立角膜纤维化的整合转录组框架，识别四种基质细胞亚群及其双向分化轨迹 | 研究仅使用新西兰白兔模型，未验证人类样本 | 表征角膜纤维化过程中的细胞异质性和细胞外基质重塑机制 | 新西兰白兔的正常和碱损伤纤维化角膜 | 单细胞组学 | 角膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类、轨迹推断、CellChat分析 | 单细胞转录组数据 | 新西兰白兔角膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 312 | 2025-11-03 |
Systematic characterization of full-length RNA isoforms in human colorectal cancer at single-cell resolution
2025-Oct-31, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf049
PMID:40702779
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研究论文 | 通过单细胞长读长RNA测序系统表征人类结直肠癌中的全长RNA亚型 | 首次在单细胞分辨率下使用高深度长读长scRNA-seq技术系统解析结直肠癌全长转录组，揭示不同分子亚型间的选择性剪接调控模式 | 样本量相对有限（12例患者），功能验证实验仍需进一步扩展 | 系统表征结直肠癌中全长RNA亚型的多样性及其在肿瘤发生中的作用 | 结直肠癌患者的结肠上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2025-11-03 |
Tumor-derived RAC1A159V mutation promotes an immunosuppressive microenvironment that represses response to immune checkpoint inhibitor
2025-Oct-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea1212
PMID:41160695
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研究论文 | 本研究揭示肿瘤来源的RAC1A159V突变通过激活mTORC1信号通路促进免疫抑制微环境，导致对免疫检查点抑制剂治疗产生抵抗 | 首次证明RAC1突变通过上调糖鞘脂生物合成激活mTORC1信号，进而改变肿瘤代谢和免疫细胞相互作用机制 | 研究主要基于基因编辑小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究RAC1突变如何影响肿瘤免疫微环境及免疫治疗反应 | 携带RAC1突变的肿瘤细胞和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 基因编辑、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 314 | 2025-11-03 |
Implication of an exosome-based gene signature for estimating clinical outcomes of triple-negative breast cancer and assisting in individualized therapy
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-16751-6
PMID:41162433
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研究论文 | 本研究开发了一种基于外泌体基因特征的三阴性乳腺癌预后评估模型 | 首次构建基于外泌体相关基因的TNBC预后特征模型，并发现FAM129B作为潜在治疗靶点 | 研究样本量未明确说明，需要进一步临床验证 | 开发三阴性乳腺癌预后评估工具并指导个体化治疗 | 三阴性乳腺癌患者和TNBC细胞系(MDA-MB-231, MDA-MB-468) | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | LASSO分析, 转录组学, 基因突变分析, siRNA转染, EdU检测, 伤口愈合实验 | LASSO回归模型 | 转录组数据, 基因突变数据, 实验数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2025-11-03 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomics identify RELB, S100A9, and SOCS1 as key autophagy-endoplasmic reticulum stress genes linking T2DM with MAFLD
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21641-y
PMID:41162503
|
研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞转录组分析，鉴定出RELB、S100A9和SOCS1作为连接2型糖尿病与代谢相关脂肪性肝病的关键自噬-内质网应激基因 | 首次整合批量转录组、单细胞转录组分析和实验验证，系统揭示T2DM与MAFLD的共同分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，需要在人类临床样本中进一步验证 | 揭示2型糖尿病与代谢相关脂肪性肝病之间的共同分子机制 | 基因表达数据、大鼠模型肝组织 | 生物信息学 | 2型糖尿病, 代谢相关脂肪性肝病 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组织化学 | 机器学习, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 四个GEO数据集, T2DM伴MAFLD大鼠模型 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2025-11-03 |
The role of miR-21 in early-stage lung adenocarcinoma: clinical and bioinformatics insights
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21742-8
PMID:41162544
|
研究论文 | 本研究探讨miR-21在早期肺腺癌中的临床意义及其分子机制 | 结合临床样本与生物信息学分析，系统揭示miR-21在肺腺癌中的调控网络和预后价值 | 样本量有限（50例患者），主要依赖公共数据库验证 | 识别肺腺癌发病机制中的关键miRNA和基因 | 早期肺腺癌患者和健康对照者 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 生物信息学分析, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | 50例早期肺腺癌患者和50例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 317 | 2025-11-03 |
Targeting LAG3 to alter the tumor immune reactivity of CD8+T cells is a potential therapy for skin cutaneous melanoma
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22377-5
PMID:41162565
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析，揭示了CD8+T细胞在皮肤黑色素瘤中的功能异质性，并证明LAG3抑制可抑制肿瘤增殖和转移 | 首次将CD8+T细胞分为CD8+LAG3+T细胞和CD8+LAG3-T细胞两个亚群，并证实LAG3抑制剂ZYF0033和单克隆抗体Miptenalimab能显著增强免疫细胞浸润并抑制肿瘤进展 | 研究主要在鼠类模型中进行，需要进一步临床验证；CD8+T细胞在SKCM中的具体作用机制仍需深入探索 | 探索CD8+T细胞在皮肤黑色素瘤免疫治疗中的作用和机制 | 皮肤黑色素瘤( SKCM )中的CD8+T细胞亚群 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞间通讯分析, 差异基因表达分析, 免疫浸润分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2025-11-03 |
A prognostic risk prediction model for gastric cancer based on the EFNA4 and ETS1 regulatory axis in tumor cells
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21728-6
PMID:41162582
|
研究论文 | 基于EFNA4和ETS1调控轴构建胃癌预后风险预测模型 | 首次发现EFNA4和ETS1在胃癌中的表达模式，并构建基于肿瘤细胞特征的整合预后模型 | EFNA4高表达与良好预后的矛盾机制尚未完全阐明，需要进一步探索 | 开发胃癌预后风险预测模型 | 胃癌组织和相关基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 风险特征模型 | 基因表达数据 | 373个TCGA-STAD数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 319 | 2025-11-03 |
scGSDR: Harnessing gene semantics for single-cell pharmacological profiling
2025-Oct-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08788-0
PMID:41162674
|
研究论文 | 开发了整合基因语义知识的单细胞药物反应预测模型scGSDR | 通过整合细胞状态和基因信号通路知识来增强基因语义理解，并采用可解释性模块识别耐药表型相关通路 | NA | 提高单细胞水平药物反应预测的准确性 | 单细胞药物反应数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 注意力机制模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 320 | 2025-11-03 |
Systematic discovery of subcellular RNA patterns in the gut epithelium
2025-Oct-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03786-1
PMID:41163196
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研究论文 | 本研究通过APEX-seq和MERFISH技术系统绘制了肠道上皮细胞中亚细胞RNA定位图谱 | 首次系统发现肠道上皮中亚细胞RNA定位模式，揭示颗粒结构定位特征及调控机制 | 研究主要基于小鼠肠道类器官和组织，人类样本验证尚需进一步研究 | 探索肠道上皮细胞中亚细胞RNA定位模式及其调控机制 | 小鼠肠道类器官和成年小鼠肠道组织 | 空间转录组学 | NA | APEX-seq, MERFISH, 空间转录组学 | NA | RNA空间定位数据 | 小鼠肠道类器官和成年小鼠肠道组织样本 | NA | 邻近标记技术, 空间转录组学 | APEX-seq, MERFISH | APEX-seq用于邻近标记，MERFISH用于空间转录组分析 |