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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-11-02 |
Cold Exposure Induces Swine Brown Adipocytes to Display an Island-like Distribution with Atypical Characteristics
2025-Oct-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209871
PMID:41155166
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现猪体内存在棕色脂肪细胞,并揭示其在冷暴露下呈现岛状分布的非典型特征 | 首次在猪体内鉴定出棕色脂肪细胞,发现其独特的岛状分布模式和不同于典型棕色脂肪细胞的分子特征 | UCP2/3蛋白含量未显著增加,论文提供了重复实验以提高该蛋白含量的方法 | 确认猪体内棕色脂肪细胞的存在及其在冷暴露下的特征 | 猪棕色脂肪细胞与小鼠棕色脂肪组织的比较分析 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序, ceRNA网络分析, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 302 | 2025-11-02 |
Conditional Ablation of PKCλ/ι in CD4+ T Cells Ameliorates Hepatic Fibrosis in Schistosoma japonicum-Infected Mice via T Follicular Helper (Tfh) Cell Suppression Coupled with Increased Follicular Regulatory T (Tfr) and Regulatory B (Breg) Cell Activities
2025-Oct-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15101430
PMID:41154658
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除CD4+ T细胞中的PKCλ/ι基因,探讨其在日本血吸虫感染诱导的小鼠肝纤维化中的作用机制 | 首次揭示了PKCλ/ι通过调控Tfh细胞分化、促进Tfr功能及激活IL-10产生的Breg细胞来减轻肝纤维化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究PKCλ/ι在血吸虫感染诱导的肝纤维化中的免疫调节作用 | CD4+ T细胞条件性PKCλ/ι敲除小鼠和野生型对照小鼠 | 免疫学 | 肝纤维化 | 流式细胞术, RT-qPCR, ELISA, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 条件性敲除小鼠和野生型对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 303 | 2025-11-02 |
Preclinical Diagnosis of Type 1 Diabetes: Reality or Utopia
2025-Oct-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13102444
PMID:41153727
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综述 | 评估1型糖尿病经典与新兴生物标志物在早期诊断中的应用现状与潜力 | 系统整合传统标志物与新兴技术(如单细胞转录组、FTIR光谱等),提出多标志物联合诊断策略 | 多数新兴生物标志物证据基础不足,尚未在临床诊断中广泛应用 | 评估生物标志物在1型糖尿病早期诊断中的适用性,推动新型诊断方法开发 | 1型糖尿病生物标志物(包括HLA、自身抗体、细胞因子、cfDNA等) | 生物信息学 | 1型糖尿病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、FTIR光谱 | 多基因风险评分(PRS) | 基因组数据、转录组数据、光谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 304 | 2025-11-02 |
Harpagide Confers Protection Against Acute Lung Injury Through Multi-Omics Dissection of Immune-Microenvironmental Crosstalk and Convergent Therapeutic Mechanisms
2025-Oct-04, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18101494
PMID:41155609
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示钩果草苷通过调节免疫微环境对急性肺损伤的保护作用 | 首次采用单细胞转录组学、蛋白质组学与分子动力学模拟相结合的多组学策略,系统解析钩果草苷在急性肺损伤中的多通路调控机制 | 研究仅基于LPS诱导的小鼠模型,尚未在临床样本中验证 | 探究钩果草苷对急性肺损伤的保护作用及其分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 多组学分析 | 急性肺损伤 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,表面等离子共振,细胞热位移分析,分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,分子相互作用数据 | 6只小鼠/组 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 305 | 2025-11-02 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Multi-Compartmental Cellular Cascade Underlying Elahere-Induced Ocular Toxicity in Rats
2025-Oct-04, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18101492
PMID:41155607
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了Elahere在大鼠中诱导眼毒性的多区室细胞级联反应机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统解析ADC药物Elahere引起的眼毒性细胞特异性分子机制 | 研究仅使用大鼠模型,与人类病理生理可能存在差异 | 阐明Elahere诱导眼毒性的细胞类型特异性分子机制 | Sprague-Dawley大鼠角膜细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 47,606个角膜细胞 | BD Biosciences | single-cell RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统 |
| 306 | 2025-11-02 |
Exploring the Abnormal Characteristics of the Ovaries During the Estrus Period of Kazakh Horses Based on Single-Cell Transcriptome Technology
2025-Oct-02, Biology
DOI:10.3390/biology14101351
PMID:41154754
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术探索哈萨克马发情期卵巢的异常特征 | 首次构建了哈萨克马卵巢的单细胞转录组图谱,揭示了不同卵巢细胞类型及其亚型在发情期的分子特征 | 研究仅针对哈萨克马特定品种,结果可能不适用于其他马种 | 探究马匹发情期卵巢功能衰退的分子机制 | 哈萨克马的卵巢组织 | 单细胞转录组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 112,861个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2025-11-02 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Immune Response to COVID-19 and Tuberculosis Coinfection
2025-Oct, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240022
PMID:41163794
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示COVID-19与结核病共感染患者的免疫反应特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘COVID-19与结核病共感染的免疫图谱,揭示重症患者特有的免疫细胞群改变和免疫病理机制 | 样本量有限,未明确说明具体样本数量;主要关注重症患者,缺乏轻症患者的对比分析 | 阐明COVID-19与结核病共感染的免疫病理机制和保护性免疫反应 | COVID-19与结核病共感染患者(特别是重症患者)的免疫细胞 | 单细胞组学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 308 | 2025-11-02 |
Improved gene regulatory network inference from single cell data with dropout augmentation
2025-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013603
PMID:41134910
|
研究论文 | 提出一种通过dropout增强改进单细胞数据中基因调控网络推断的新方法 | 提出Dropout Augmentation(DA)方法增强模型对零膨胀数据的鲁棒性,并开发基于DA的DAZZLE模型用于基因调控网络推断 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中的基因调控网络推断 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达和调控关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器结构方程模型 | 基因表达数据 | 包含超过15,000个基因的小鼠小胶质细胞纵向数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 309 | 2025-11-01 |
Mechanisms of lactylation-related biomarker in neonatal hypoxic-ischemic brain damage analyzed through multi-omics data
2025-Oct-30, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04538-4
PMID:41168403
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析乳酰化相关生物标志物在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的作用机制 | 首次在新生大鼠缺氧缺血性脑病模型中采用多组学方法,探索乳酸盐代谢相关基因的作用 | 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 研究乳酰化相关基因在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的机制并探索潜在治疗靶点 | SD大鼠新生幼鼠的脑组织 | 多组学分析 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接 | 机器学习 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞数据 | SD大鼠脑组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 310 | 2025-10-31 |
Andrias Davidianus Peptide Hydrogel Enables Sustained SR9011 Release to Promote Efferocytosis and Alleviate Colitis
2025-Oct-30, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202509049
PMID:41163542
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研究论文 | 本研究开发了一种大鲵肽水凝胶用于持续释放SR9011,通过激活NR1D1促进胞葬作用并缓解结肠炎 | 首次发现NR1D1在溃疡性结肠炎中的表达降低及其对CD47的转录抑制功能,并创新性地开发了大鲵肽水凝胶递送系统 | 药代动力学分析仅限于结肠组织,未进行全身性评估 | 探索NR1D1在溃疡性结肠炎发病机制中的作用并开发新型治疗策略 | 人类UC活检组织、小鼠结肠炎模型、肠上皮细胞特异性Nr1d1缺陷小鼠 | 生物医学工程 | 溃疡性结肠炎 | CUT&Tag, ChIP-qPCR, 荧光素酶报告实验, 单细胞RNA测序 | DSS诱导结肠炎小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据, 单细胞转录组数据 | 人类UC活检组织和小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 311 | 2025-10-31 |
FXYD3 Promotes Tumor Progression by Binding With IRF7 to Regulate JAK2/STAT5 Signaling in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510782
PMID:41164952
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研究论文 | 本研究揭示了FXYD3通过结合IRF7调控JAK2/STAT5信号通路促进肝内胆管癌恶性进展的机制 | 首次发现FXYD3通过其60-87aa结构域直接与IRF7相互作用,通过cGAS/STING通路形成正反馈环路持续激活JAK2/STAT5信号 | 未明确说明样本量的具体数值和研究局限性 | 探究FXYD3在肝内胆管癌进展中的作用机制 | 肝内胆管癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝内胆管癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组分析, 生物信息学分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 312 | 2025-10-31 |
CHB-Induced Immune Zonation Chaos Elicited LXRα-mediated Lipid Metabolism Disorders in Kupffer Cells to Induce Cancer Stem Cell Formation
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510275
PMID:41164971
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了慢性乙型肝炎中Kupffer细胞区室化紊乱通过LXRα介导的脂代谢异常诱导癌症干细胞形成的机制 | 首次揭示了Kupffer细胞区室化在疾病进展中的作用,发现了LXRα在Kupffer细胞中的关键调控功能 | 研究主要基于AAV-HBV小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究慢性乙型肝炎向肝癌转变过程中肝脏微环境的动态分子机制 | AAV-HBV小鼠模型和HBV患者的肝脏组织 | 空间转录组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | AAV-HBV小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | AAV-HBV小鼠模型和HBV患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 313 | 2025-10-31 |
Spatially resolved airway niches: mapping epithelial-immune microenvironments in asthma
2025-Oct-29, Expert review of respiratory medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/17476348.2025.2582244
PMID:41146609
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综述 | 本文综述了空间组学技术在哮喘研究中揭示气道上皮-免疫微环境空间异质性的应用 | 整合多种空间组学技术揭示哮喘中先前被忽视的疾病定义性微环境生态位 | 检测成本较高、RNA扩散问题、FFPE工作流程标准化不足、需要全球队列的多组学整合 | 通过空间组学技术解析哮喘气道上皮-免疫微环境的分子环路和异质性 | 人气道活检组织、离体肺切片、小鼠哮喘模型 | 空间转录组学 | 哮喘 | 空间转录组学、多重成像蛋白质组学、空间代谢组学 | 基于图的人工智能 | 空间分子数据 | NA | 10x Genomics,Nanostring,Akoya Biosciences,Vizgen,Ionpath,Standard BioTools | 空间转录组学,多重成像蛋白质组学,空间代谢组学 | Visium-HD,Xenium,CosMx SMI,MERFISH,Imaging Mass Cytometry,MIBI,MALDI-MSI | 10x Visium HD,10x Xenium,Nanostring CosMx SMI,Vizgen MERFISH,Standard BioTools Imaging Mass Cytometry,Ionpath MIBI,高分辨率MALDI-MSI |
| 314 | 2025-10-31 |
scCT-DB, an omnibus for cancer patient-derived paired pre- and post-treatment single-cell transcriptomes to reveal drug perturbation and drug resistance mechanisms
2025-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1065
PMID:41160885
|
研究论文 | 开发了一个癌症治疗相关单细胞转录组数据库scCT-DB,用于揭示药物扰动和耐药机制 | 首个全面收集患者治疗前后配对单细胞转录组数据的数据库,采用统一流程处理并提供结构化元数据 | NA | 揭示药物扰动和耐药机制,发现预测治疗反应的生物标志物 | 癌症患者治疗前后的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 619万个细胞,来自1142个原始患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2025-10-31 |
DeepSpaceDB: a spatial transcriptomics atlas for interactive in-depth analysis of tissues and tissue microenvironments
2025-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1117
PMID:41160880
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研究论文 | 介绍DeepSpaceDB空间转录组数据库,提供交互式组织微环境分析工具 | 开发了新一代空间转录组数据库,强调交互性和高级分析功能,支持跨样本比较和用户数据上传 | 当前版本主要聚焦10X Genomics Visium样本,平台覆盖范围有限 | 解决空间转录组数据分析和交互探索的技术挑战 | 组织切片和微环境,如阿尔茨海默病模型小鼠海马区域 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组技术 | NA | 空间基因表达数据 | NA | 10X Genomics | 空间转录组学 | 10X Visium | 10X Genomics Visium样本 |
| 316 | 2025-10-31 |
Targeting astrocyte-monocyte-neuron crosstalk in spinal cord injury: therapeutic insights from methyl gallate
2025-Oct-29, Spinal cord
IF:2.1Q1
DOI:10.1038/s41393-025-01127-4
PMID:41162682
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法探究没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制 | 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和网络药理学系统解析没食子酸甲酯对星形胶质细胞-单核细胞-神经元通讯的调节作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探究没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制 | 脊髓损伤小鼠模型、星形胶质细胞、单核细胞和神经元 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, bulk transcriptomics, Mendelian randomization, network pharmacology, molecular docking | NA | 基因表达数据、GWAS汇总数据 | 小鼠亚急性脊髓损伤模型(损伤后3-14天) | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 317 | 2025-10-31 |
Mapping disease-specific vascular cell populations responsible for obliterative arterial remodelling during the development of pulmonary arterial hypertension
2025-Oct-28, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf146
PMID:40875786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别肺动脉高压发展中导致闭塞性动脉重构的疾病特异性血管细胞群 | 首次在肺动脉高压模型中通过多时间点单细胞转录组分析鉴定出两种疾病特异性内皮细胞群,并发现TM4SF1作为动脉重构的新治疗靶点 | 研究基于动物模型,在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 阐明肺动脉高压发展中闭塞性动脉病变形成的细胞机制 | 肺动脉高压大鼠模型和PAH患者的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,RNA velocity分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的肺动脉高压模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2025-10-31 |
Changes in neural progenitor lineage composition during astrocytic differentiation of human iPSCs
2025-Oct-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96423
PMID:41150379
|
研究论文 | 本研究通过追踪人类iPSCs分化为星形胶质细胞的过程,揭示了神经祖细胞谱系组成的变化及其对星形胶质细胞区域特性的影响 | 首次证明iPSCs衍生的星形胶质细胞谱系组成不能准确反映原始祖细胞群体,并识别了LMX1A祖细胞来源星形胶质细胞的独特转录组特征 | 研究仅聚焦于LMX1A腹侧中脑祖细胞,未涵盖其他脑区祖细胞类型 | 探究人类iPSCs分化为星形胶质细胞过程中神经祖细胞谱系组成的变化规律 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs)及其分化的神经祖细胞和星形胶质细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,细胞谱系追踪 | 人类iPSCs分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深度单细胞RNA测序 |
| 319 | 2025-10-31 |
TBXAS1 deficiency causes autoinflammation responsive to IL-6 inhibitor
2025-Oct-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.09.014
PMID:41162285
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研究论文 | 本研究揭示了TBXAS1缺陷通过花生四烯酸代谢异常导致自身炎症的新机制,并证实IL-6抑制剂治疗的有效性 | 首次发现TBXAS1缺陷通过PGE2-EP2/cAMP/CREB通路诱导IL-6表达引发自身炎症,并成功应用IL-6抑制剂治疗 | 研究仅纳入2例患者,样本量较小 | 探索TBXAS1缺陷引起自身炎症的分子机制并研究靶向治疗策略 | 2例TBXAS1缺陷患者及其外周血单个核细胞 | NA | Ghosal血骨发育不良 | 全外显子组测序, Sanger测序, qRT-PCR, Western blotting, 细胞因子珠阵列, ELISA, 质谱分析, 飞行时间流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质数据, 代谢物数据, 单细胞转录组数据 | 2例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 320 | 2025-10-31 |
Multi-omics profiling uncovers paradoxical Epstein-Barr virus involvement in autoimmune liver disease pathogenesis
2025-Oct-27, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01975-6
PMID:41144108
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研究论文 | 通过多组学分析揭示EB病毒在自身免疫性肝病发病机制中的复杂作用 | 首次提供EB病毒与自身免疫性肝病关联的遗传学证据,发现EB病毒在疾病中可能扮演双重角色 | 基于观察性研究和数据库分析,因果关系仍需进一步验证 | 探究EB病毒与自身免疫性肝病之间的因果关系和分子机制 | 自身免疫性肝病患者群体和EB病毒相关抗体 | 生物信息学 | 自身免疫性肝病 | 双样本孟德尔随机化分析,GSMR,GWAS,转录组分析,单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞测序数据 | 基于FinnGen数据库的GWAS汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | NA |