单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202510-202510] [清除筛选条件]
当前共找到 592 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2025-11-15
YTHDF1 regulates YTHDF2 stability via m6A-dependent mechanisms in hepatocellular carcinoma: insights from in vitro, in vivo, and multi-cohort clinical studies
2025-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology IF:2.0Q3
研究论文 本研究揭示YTHDF1通过m6A依赖性机制调控YTHDF2稳定性促进肝细胞癌进展 首次发现YTHDF1通过m6A依赖性方式增强YTHDF2的mRNA稳定性和翻译效率,并揭示两者在肝细胞癌中的空间共表达模式 未明确说明样本规模和研究人群的详细特征 探索YTHDF同源蛋白在肝细胞癌中的调控网络和临床相关性 肝细胞癌组织、YTHDF蛋白家族 分子生物学 肝细胞癌 免疫组织化学、空间转录组学、Western blot、实时定量PCR、RNA免疫沉淀、e-CLIP测序、双荧光报告基因检测、RNA稳定性实验 NA 蛋白质表达数据、RNA表达数据、空间转录组数据、临床预后数据 两个临床队列的肝细胞癌患者 NA 空间转录组学 NA NA
282 2025-11-15
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identified TIMP1 as a Prognostic Marker in Colorectal Cancer
2025-Oct, Immune network IF:4.3Q2
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建结直肠癌免疫预后模型并鉴定TIMP1作为预后标志物 首次结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建结直肠癌免疫预后模型,并实验验证TIMP1的生物学功能 NA 解析结直肠癌免疫异质性并开发预后预测模型 结直肠癌患者 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序,差异表达分析,功能富集分析,随机森林分析,LASSO方法 随机森林,LASSO 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
283 2025-11-15
[RNA Sequencing Reveals Molecular Alternations of Splenocytes Associated with Anti-FⅧ Immune Response in Hemophilia A Murine Model]
2025-Oct, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
研究论文 通过RNA测序技术研究血友病A小鼠模型中与抗FⅧ免疫反应相关的脾细胞分子变化 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术系统分析血友病A小鼠抗FⅧ免疫反应的分子机制 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 探究血友病A中抗FⅧ免疫反应的分子机制 血友病A小鼠模型的脾细胞 生物信息学 血友病A RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 NA 基因表达数据 血友病A小鼠模型 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA CASAVA碱基识别技术
284 2025-11-15
[Research Progress of Epigenetic Modification in Hematopoietic Stem Cell Functional Regulation--Review]
2025-Oct, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
综述 本文综述了表观遗传修饰在造血干细胞发育、功能调控和扩增中的研究进展 整合了单细胞测序、空间转录组和追踪技术等新兴技术对造血干细胞表观遗传调控机制的最新研究成果 NA 探讨表观遗传修饰在造血干细胞功能调控中的作用机制 造血干细胞 表观遗传学 NA 单细胞测序技术, 空间转录组技术, 追踪技术 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
285 2025-11-14
Exploring Sex Differences in Type 2 Diabetes via a Male-Dominant Beta-Cell Cluster from Single-Cell Pancreatic Sequencing of Public Datasets
2025-Oct, Endocrinology and metabolism (Seoul, Korea)
研究论文 通过分析公共单细胞数据集发现男性主导的β细胞簇,揭示2型糖尿病性别差异的分子机制 首次在2型糖尿病患者中鉴定出男性主导的β细胞亚群,该亚群具有独特的基因表达模式和细胞通讯特征 基于公共数据集进行二次分析,样本来源和数量受原始数据限制 探索2型糖尿病性别差异的分子基础 2型糖尿病患者的胰腺β细胞 单细胞基因组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序,轨迹推断,差异基因表达分析,基因集富集分析,细胞通讯分析 NA 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 来自四个公共数据集的2型糖尿病患者胰腺样本 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
286 2025-11-14
Expression of marker genes to assess the spermatogenic capacity in patients with idiopathic non-obstructive azoospermia
2025-Oct, Journal of assisted reproduction and genetics IF:3.2Q2
研究论文 本研究开发了一种基于单细胞RNA测序的定量方法,用于评估特发性非梗阻性无精子症患者的睾丸生精能力 利用单细胞RNA测序技术开发了生精能力评分系统,并鉴定了与生精潜能相关的关键基因标记物 样本量相对较小(18名iNOA患者),需要在更大群体中进一步验证 开发评估特发性非梗阻性无精子症患者睾丸生精能力的可靠定量方法 特发性非梗阻性无精子症患者 单细胞测序分析 男性不育症 单细胞RNA测序, RT-qPCR 模糊聚类, 基因表达趋势分析 单细胞基因表达数据 18名iNOA患者,近4000个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
287 2025-11-13
Stress-NRF2 response axis polarizes tumor macrophages and undermines immunotherapy
2025-Oct-31, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了NRF2转录因子在肿瘤相关巨噬细胞极化为免疫抑制状态中的关键作用及其对免疫疗法的负面影响 首次发现NRF2激活梯度将肿瘤相关巨噬细胞分为促炎CXCL9+和抗炎SPP1+亚群,并证明其通过沉默IFN-STAT1通路导致免疫抑制 研究主要基于小鼠模型,人类癌症中的验证仍需进一步临床研究 探索NRF2在肿瘤相关巨噬细胞极化中的作用及其对免疫疗法疗效的影响 肿瘤相关巨噬细胞、MC38结肠肿瘤模型、MMTV-PyMT乳腺肿瘤模型 肿瘤免疫学 结肠癌、乳腺癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、三维细胞培养、体内肿瘤模型 小鼠肿瘤模型 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 多种小鼠肿瘤模型及人类癌症样本 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
288 2025-11-13
Clonally expanded effector CD4+ cytotoxic T lymphocytes are associated with severe neurological adverse events after immune checkpoint inhibitor therapy
2025-Oct-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞基因组学分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗后神经系统不良事件与克隆扩增的CD4+细胞毒性T淋巴细胞之间的关联 首次在单细胞水平上揭示了n-irAEs患者体内存在特异性克隆扩增的CD4+CTLs,并发现其表达与神经炎症相关的效应基因谱 样本量较小(仅17例患者),且仅分析了外周血细胞而未直接研究中枢神经系统 探究免疫检查点抑制剂治疗诱发神经系统不良事件的免疫学机制和风险因素 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者,包括8例急性神经毒性患者 单细胞基因组学 癌症治疗相关神经系统并发症 单细胞RNA测序,T细胞受体谱分析 伪时间分析 单细胞转录组数据,TCR序列数据 17例癌症患者(8例n-irAEs患者),共186,435个免疫细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
289 2025-11-13
Acquisition of an immunosuppressive microenvironment after anti-CD19 CAR T-cell therapy is associated with T-cell dysfunction and resistance
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析,揭示了抗CD19 CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境获得免疫抑制特性与T细胞功能障碍和治疗抵抗的关联 首次在单细胞水平系统描述了CAR-T治疗后骨髓微环境的动态变化,发现髓系细胞激活、干扰素反应、缺氧和TGF-β信号通路在驱动免疫抑制中的关键作用 样本量有限,需要在更大队列中验证发现;机制研究主要基于相关性分析,需要进一步功能验证 探究CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境变化与治疗反应的关系 B细胞急性淋巴细胞白血病患者和造血干细胞人源化小鼠模型 单细胞生物学 B细胞急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 B-ALL患者治疗前后骨髓样本,人源化小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
290 2025-11-13
TRIM28 drives immune evasion via PARP1 SUMOylation and NAD+ depletion in clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了TRIM28通过PARP1 SUMO化和NAD+耗竭驱动透明细胞肾细胞癌免疫逃逸的新机制 首次发现TRIM28通过双重免疫代谢机制促进免疫抵抗:稳定PARP1并促进其SUMO化,以及耗竭肿瘤微环境中的NAD+ 研究主要基于细胞模型和动物实验,需要进一步临床验证 探索透明细胞肾细胞癌中免疫逃逸的分子机制 透明细胞肾细胞癌细胞系、CD8+ T细胞、患者来源异种移植模型 癌症免疫学 肾细胞癌 单细胞转录组学、RNA-seq、质谱分析、代谢组学、虚拟筛选 Geneformer、患者来源异种移植模型 转录组数据、代谢组数据、蛋白质相互作用数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA GSE159115数据集
291 2025-11-13
SPP1high macrophage-induced T-cell stress promotes colon cancer liver metastasis through SPP1/CD44/PI3K/AKT signaling
2025-Oct-20, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示SPP1高表达巨噬细胞通过SPP1/CD44/PI3K/AKT信号通路诱导T细胞应激状态促进结肠癌肝转移的机制 首次发现SPP1高表达巨噬细胞诱导的T细胞应激状态在结肠癌肝转移中的作用,并揭示SPP1/CD44/PI3K/AKT信号通路机制 研究样本量有限,主要基于体外实验验证机制 阐明结肠癌肝转移免疫抑制微环境的形成机制并寻找免疫治疗新靶点 结肠癌肝转移患者的肿瘤标本和匹配的肝转移灶 单细胞转录组学 结肠癌肝转移 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 结肠癌肝转移患者肿瘤标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
292 2025-11-13
ALCAM-CD6 axis suppression: a key determinant of immune-mediated metastasis recurrence in stage III non-small cell lung cancer
2025-Oct-10, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了ALCAM-CD6轴在III期非小细胞肺癌转移复发中的关键作用机制 首次发现ALCAM-CD6相互作用抑制导致免疫抑制状态,并通过转录因子MYB调控ALCAM表达影响肿瘤进展 研究样本仅限于III期NSCLC患者,未涵盖其他分期或肺癌亚型 探究III期非小细胞肺癌转移复发的生物学机制 接受肺癌切除术的III期非小细胞肺癌患者 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞测序,组织流式细胞分析,实时PCR,Western blotting,基因沉默,细胞共培养,流式细胞术,染色质免疫沉淀定量PCR NA 单细胞测序数据,组织样本,临床数据 2018年8月至2021年7月期间接受肺癌切除术的III期NSCLC患者组织样本和临床数据 NA 单细胞测序 NA NA
293 2025-11-13
Neural stem cell-delivered oncolytic virus via intracerebroventricular administration enhances glioblastoma therapy and immune modulation
2025-Oct-08, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过脑室内注射神经干细胞递送溶瘤病毒,评估其对胶质母细胞瘤的治疗效果和免疫调节作用 利用神经干细胞作为溶瘤病毒载体通过脑室内给药增强肿瘤靶向性,并结合单细胞RNA测序揭示其通过下调S100A8/A9抑制髓源性抑制细胞募集的免疫调节机制 研究主要基于动物模型,尚未在人体临床试验中验证 开发改善胶质母细胞瘤治疗效果的创新疗法 胶质母细胞瘤细胞、神经干细胞、溶瘤病毒 肿瘤免疫治疗 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外细胞实验、动物模型 异种移植模型、原位肿瘤模型、人源化免疫系统小鼠模型 基因表达数据、细胞表型数据 未明确具体样本数量,使用多种小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
294 2025-11-13
Multiomics elucidation of surrounding AT2 cells impeding tertiary lymphoid structures function in neoadjuvant chemoimmunotherapy response of multiple primary lung cancers
2025-Oct-08, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过多组学分析揭示AT2细胞通过MIF-SIAE信号轴抑制三级淋巴结构中B细胞功能,影响多原发肺癌新辅助化疗免疫治疗的疗效 首次发现AT2细胞通过MIF-SIAE信号轴抑制三级淋巴结构中B细胞功能,揭示了多原发肺癌免疫治疗反应不一致的新机制 样本量有限,仅分析了少数MPLC病例 探究多原发肺癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应不一致的机制 多原发肺癌患者的肿瘤病灶 多组学分析 肺癌 多组学分析,单细胞RNA测序,多重免疫组织化学,空间共定位分析 细胞邻域分析 单细胞数据,空间转录组数据,免疫组织化学数据 1例MPLC患者的所有病灶,外加3例MPLC患者的4个无反应结节 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
295 2025-11-13
Spatial transcriptomic profiling of metastatic renal cell carcinoma identifies chemokine-driven macrophage and CD8+ T-cell interactions predictive of immunotherapy response
2025-Oct-02, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过空间转录组学分析转移性肾细胞癌,发现预测免疫治疗反应的巨噬细胞和CD8+ T细胞相互作用 首次使用高分辨率空间转录组技术揭示转移灶特异性免疫生态位对免疫检查点抑制剂疗效的决定性作用 样本量较小(12例初治患者),需要更大规模研究验证 开发预测转移性肾细胞癌免疫治疗反应的生物标志物 转移性肾细胞癌患者组织样本 空间转录组学 肾细胞癌 空间转录组学,单细胞RNA-seq 细胞类型反卷积分析 空间转录组数据,临床数据 12例初治mRCC患者,其中6例提供匹配转移灶样本 10x Genomics, NanoString 空间转录组学 10x Visium, NanoString COSMx 10x Visium空间转录组技术,NanoString COSMx空间分子成像
296 2025-11-13
Plasma Exosomes Derived from Patients with Primary Immune Thrombocytopenia Attenuate TBX21+ Regulatory T Cell-Mediated Immune Suppression via MiR-363-3p
2025-Oct, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究揭示了原发性免疫性血小板减少症患者血浆外泌体通过miR-363-3p削弱调节性T细胞免疫抑制功能的分子机制 首次发现ITP患者外泌体通过miR-363-3p-ARID3A/SPI1/TBX21轴调控Treg功能,并利用单细胞测序技术鉴定出TBX21高表达的Treg亚群 研究样本量未明确说明,机制研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 探究原发性免疫性血小板减少症中调节性T细胞功能减弱的分子机制 原发性免疫性血小板减少症患者的血浆外泌体和调节性T细胞 免疫学 原发性免疫性血小板减少症 单细胞测序,Treg功能测定,细胞因子分析 NA 单细胞测序数据,功能实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
297 2025-11-10
scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations
2025-Oct-27, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 提出一种基于视觉迁移学习和表格到图像转换的标记基因细胞类型注释方法scMapNet 结合掩码自编码器和视觉变换器,通过树状图转换利用细胞标记基因信息,并在大量未标记数据上进行预训练 NA 开发能够充分学习细胞标记基因知识和未标记数据信息的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 单细胞RNA测序数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 掩码自编码器(MAE), 视觉变换器(ViT) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
298 2025-11-09
Multi-omics integrative analysis of the mechanisms linking environmental pollutant exposure to bladder cancer pathogenesis
2025-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 通过多组学整合分析揭示环境污染物暴露与膀胱癌发病机制之间的分子联系 首次通过整合多组学数据和孟德尔随机化分析,系统构建了环境-基因相互作用网络,识别出三个因果枢纽基因及其与34种高风险污染物的关联 研究主要基于现有数据库和队列数据,需要进一步实验验证污染物与基因相互作用的生物学机制 探究环境污染物暴露与膀胱癌发病的分子机制 膀胱癌相关基因和环境污染物 生物信息学 膀胱癌 多组学整合分析, 转录组学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 孟德尔随机化 孟德尔随机化模型, 分子对接模型 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 多个膀胱癌队列的转录组数据 NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
299 2025-11-09
Deciphering the crucial role of IGF2BP3 in modulating stemness traits of salivary adenoid cystic carcinoma
2025-Oct-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
研究论文 本研究系统阐明了IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌干细胞特性调控中的关键作用及机制 首次通过单细胞测序数据验证IGF2BP3与SACC干细胞特性的关联,并系统揭示其调控干细胞特性的分子机制 未明确IGF2BP3下游具体作用靶点及信号通路细节 探究IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌中的功能作用及调控机制 唾液腺腺样囊性癌细胞 癌症生物学 唾液腺腺样囊性癌 RNA测序, 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
300 2025-11-08
Spatial Transcriptomics of Adipose Tissue: Technologies, Applications, and Challenges
2025-Oct-30, Journal of obesity & metabolic syndrome IF:4.7Q1
综述 本文综述了空间转录组学在脂肪组织研究中的技术进展、应用场景和当前挑战 系统整合了空间转录组学技术在解析脂肪组织空间结构方面的最新突破,强调了该技术在揭示脂肪生成微环境、区域特异性重塑和免疫细胞相互作用方面的独特优势 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳总结 探讨空间转录组学技术在脂肪组织生物学研究中的应用前景 脂肪组织的空间结构和细胞微环境 空间转录组学 代谢疾病 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
回到顶部