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当前共找到 591 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-11-03 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomics identify RELB, S100A9, and SOCS1 as key autophagy-endoplasmic reticulum stress genes linking T2DM with MAFLD
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21641-y
PMID:41162503
|
研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞转录组分析，鉴定出RELB、S100A9和SOCS1作为连接2型糖尿病与代谢相关脂肪性肝病的关键自噬-内质网应激基因 | 首次整合批量转录组、单细胞转录组分析和实验验证，系统揭示T2DM与MAFLD的共同分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，需要在人类临床样本中进一步验证 | 揭示2型糖尿病与代谢相关脂肪性肝病之间的共同分子机制 | 基因表达数据、大鼠模型肝组织 | 生物信息学 | 2型糖尿病, 代谢相关脂肪性肝病 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组织化学 | 机器学习, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 四个GEO数据集, T2DM伴MAFLD大鼠模型 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 262 | 2025-11-03 |
The role of miR-21 in early-stage lung adenocarcinoma: clinical and bioinformatics insights
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21742-8
PMID:41162544
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研究论文 | 本研究探讨miR-21在早期肺腺癌中的临床意义及其分子机制 | 结合临床样本与生物信息学分析，系统揭示miR-21在肺腺癌中的调控网络和预后价值 | 样本量有限（50例患者），主要依赖公共数据库验证 | 识别肺腺癌发病机制中的关键miRNA和基因 | 早期肺腺癌患者和健康对照者 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 生物信息学分析, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | 50例早期肺腺癌患者和50例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2025-11-03 |
Targeting LAG3 to alter the tumor immune reactivity of CD8+T cells is a potential therapy for skin cutaneous melanoma
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22377-5
PMID:41162565
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析，揭示了CD8+T细胞在皮肤黑色素瘤中的功能异质性，并证明LAG3抑制可抑制肿瘤增殖和转移 | 首次将CD8+T细胞分为CD8+LAG3+T细胞和CD8+LAG3-T细胞两个亚群，并证实LAG3抑制剂ZYF0033和单克隆抗体Miptenalimab能显著增强免疫细胞浸润并抑制肿瘤进展 | 研究主要在鼠类模型中进行，需要进一步临床验证；CD8+T细胞在SKCM中的具体作用机制仍需深入探索 | 探索CD8+T细胞在皮肤黑色素瘤免疫治疗中的作用和机制 | 皮肤黑色素瘤( SKCM )中的CD8+T细胞亚群 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞间通讯分析, 差异基因表达分析, 免疫浸润分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 264 | 2025-11-03 |
A prognostic risk prediction model for gastric cancer based on the EFNA4 and ETS1 regulatory axis in tumor cells
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21728-6
PMID:41162582
|
研究论文 | 基于EFNA4和ETS1调控轴构建胃癌预后风险预测模型 | 首次发现EFNA4和ETS1在胃癌中的表达模式，并构建基于肿瘤细胞特征的整合预后模型 | EFNA4高表达与良好预后的矛盾机制尚未完全阐明，需要进一步探索 | 开发胃癌预后风险预测模型 | 胃癌组织和相关基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 风险特征模型 | 基因表达数据 | 373个TCGA-STAD数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2025-11-03 |
scGSDR: Harnessing gene semantics for single-cell pharmacological profiling
2025-Oct-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08788-0
PMID:41162674
|
研究论文 | 开发了整合基因语义知识的单细胞药物反应预测模型scGSDR | 通过整合细胞状态和基因信号通路知识来增强基因语义理解，并采用可解释性模块识别耐药表型相关通路 | NA | 提高单细胞水平药物反应预测的准确性 | 单细胞药物反应数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 注意力机制模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 266 | 2025-11-03 |
Systematic discovery of subcellular RNA patterns in the gut epithelium
2025-Oct-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03786-1
PMID:41163196
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研究论文 | 本研究通过APEX-seq和MERFISH技术系统绘制了肠道上皮细胞中亚细胞RNA定位图谱 | 首次系统发现肠道上皮中亚细胞RNA定位模式，揭示颗粒结构定位特征及调控机制 | 研究主要基于小鼠肠道类器官和组织，人类样本验证尚需进一步研究 | 探索肠道上皮细胞中亚细胞RNA定位模式及其调控机制 | 小鼠肠道类器官和成年小鼠肠道组织 | 空间转录组学 | NA | APEX-seq, MERFISH, 空间转录组学 | NA | RNA空间定位数据 | 小鼠肠道类器官和成年小鼠肠道组织样本 | NA | 邻近标记技术, 空间转录组学 | APEX-seq, MERFISH | APEX-seq用于邻近标记，MERFISH用于空间转录组分析 |
| 267 | 2025-11-03 |
Advances in Epigenomic Sequencing and Their Applications in Cancer Diagnostics
2025-Oct-27, Precision chemistry
DOI:10.1021/prechem.5c00014
PMID:41170156
|
综述 | 概述表观基因组测序技术进展及其在癌症诊断中的应用 | 系统整合了单细胞测序、空间工具与多组学技术的临床应用前景 | 未涉及具体临床实施路径和技术标准化挑战 | 推动表观基因组测序技术在精准医疗中的临床应用 | 表观基因组修饰特征与癌症生物标志物 | 生物医学 | 癌症 | 表观基因组测序, 单细胞测序, 空间转录组, 多组学整合 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组, 表观基因组测序 | NA | NA |
| 268 | 2025-11-03 |
Matrix stiffness drives squamous cell carcinoma progression via a Piezo1-mediated mechanotransduction feedback loop
2025-Oct-26, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.041
PMID:41151627
|
研究论文 | 本研究揭示了基质硬度通过Piezo1介导的机械转导反馈环路驱动鳞状细胞癌进展的机制 | 首次发现Piezo1-RCC2-YAP轴将机械信号转化为促肿瘤信号，并形成自增强反馈环路促进肿瘤进展 | 样本量有限，临床相关性研究仅基于53例皮肤鳞癌患者队列 | 研究基质硬度如何通过Piezo1介导的机械转导驱动鳞状细胞癌进展及其临床意义 | 人类皮肤、口腔和肺鳞状细胞癌样本，体外可调硬度凝胶模型，异种移植模型 | 癌症生物学 | 鳞状细胞癌 | 原子力显微镜，空间转录组学，单细胞RNA测序 | 体外细胞模型，异种移植模型 | 基因表达数据，组织硬度测量数据，临床病理数据 | 人类SCC样本（皮肤、口腔、肺），皮肤鳞癌临床队列53例 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2025-11-03 |
Integration of elemental imaging and spatial transcriptomic profiling for proof-of-concept metals-based pathway analysis of colon tumor microenvironment
2025-Oct-14, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf034
PMID:41042257
|
研究论文 | 本研究开发了一种整合元素成像和空间转录组学的多模态工作流程，用于分析结肠肿瘤微环境中金属相关通路 | 首次将元素成像与空间转录组学整合，实现组织范围内金属-基因相互作用的全面探索 | 仅为概念验证研究，仅使用单个样本，需要更大队列验证 | 探索肿瘤微环境中金属依赖性信号传导及其与基因表达的关联 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 空间生物学 | 结直肠癌 | 元素成像, 空间转录组学 | 相关性分析 | 图像, 基因表达数据 | 单个结直肠癌肿瘤样本 | NA | 元素成像, 空间转录组学 | NA | NA |
| 270 | 2025-11-03 |
A comprehensive single-cell atlas of three centenarian cohorts unveils unique natural killer cell signatures and enhanced mutual interactions among peripheral immune cells
2025-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105922
PMID:40945050
|
研究论文 | 通过单细胞技术分析三个百岁老人队列的外周免疫细胞特征，揭示NK细胞的独特年轻化特征和增强的细胞间相互作用 | 首次通过多组学方法系统比较百岁老人与对照人群的免疫特征，发现NK细胞具有年轻化特征和增强的细胞互作网络 | 样本量相对有限，且部分数据来自公共数据库 | 研究百岁老人群体的免疫特征与健康衰老的关系 | 百岁老人、其子女及对照人群的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, 质谱流式, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 31名百岁老人、17名子女和26名对照（来自三个队列） | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱流式, 流式细胞术 | NA | NA |
| 271 | 2025-11-03 |
Qingre huazhuo tang regulates IgA nephropathy through immune checkpoints and ferroptosis
2025-Oct, Journal of traditional and complementary medicine
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.jtcme.2024.11.005
PMID:41169938
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学、单细胞测序和实验验证探讨清热化浊汤通过免疫检查点和铁死亡调节IgA肾病的机制 | 首次结合网络药理学、单细胞测序和实验验证系统阐明清热化浊汤治疗IgA肾病的作用机制 | 机制研究仍需进一步深入验证 | 验证清热化浊汤通过免疫检查点和铁死亡调节IgA肾病的机制 | IgA肾病患者的足细胞 | 生物医学 | IgA肾病 | 单细胞测序, 网络药理学, 实验验证 | NA | 单细胞测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 272 | 2025-11-02 |
CellSNVReg: a multidimensional resource for SNV-mediated regulatory perturbations in single-cell and spatial omics
2025-Oct-31, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1076
PMID:41171131
|
研究论文 | 介绍CellSNVReg——一个系统表征单核苷酸变异在细胞类型和空间分辨率下调控扰动效应的多维资源数据库 | 首次整合单细胞和空间组学数据，在六个维度系统分析SNV介导的调控扰动，并提供定性和定量评估 | NA | 解析单核苷酸变异在多分子层面的调控扰动及其对细胞功能状态的影响 | 人类正常组织、肿瘤组织及其他疾病组织 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 460万个细胞谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 273 | 2025-11-02 |
SEA version 4.0: a major expansion and update of the Super-Enhancer Archive
2025-Oct-31, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1114
PMID:41171129
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研究论文 | 介绍超级增强子数据库SEA版本4.0的重大扩展和更新 | 新增H3K4me1组蛋白标记，扩展至14个物种，引入基于香农熵的算法识别特异性SE，提供交互式调控网络和细胞特异性SE检测器 | NA | 阐明超级增强子在细胞命运和疾病中的表观遗传调控作用 | 超级增强子和增强子 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，组蛋白修饰分析 | 香农熵算法 | 基因组数据，表观遗传数据 | 12个癌症和正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-11-02 |
connectomeDB2025: a rigorously curated, multi-species resource of experimentally supported ligand-receptor interactions
2025-Oct-31, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1108
PMID:41171146
|
研究论文 | 介绍更新版connectomeDB2025，一个经过严格筛选、包含多物种实验支持的配体-受体相互作用的开放获取数据库 | 通过AI辅助文献挖掘和手动筛选，新增827对配体-受体相互作用和718篇支持文献，其中264对为2020年后首次描述，包含2359个独有的证据链接 | 仅包含脊椎动物的肽基配体-受体相互作用，不涵盖其他类型的分子相互作用 | 构建一个经过严格筛选、具有实验支持的配体-受体相互作用参考数据库 | 脊椎动物的配体-受体相互作用 | 生物信息学 | NA | AI辅助文献挖掘，手动筛选 | NA | 文献数据，实验证据 | 3579个脊椎动物相互作用，来自2803篇研究文章，5429个证据链接 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 275 | 2025-11-02 |
Ex Vivo Spatiotemporal Characterization of Spermatogenesis in Mouse Testicular Organoids
2025-Oct-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512670
PMID:41173796
|
研究论文 | 开发了一种小鼠睾丸类器官培养策略，实现了体外精子发生的时空特征表征 | 建立了单细胞悬浮液自重组形成睾丸类器官的方法，首次在体外实现了包含单倍体精子的完整精子发生过程 | 类器官中精子样细胞仅占总生殖细胞的约2.43%，效率仍有待提高 | 研究睾丸类器官中精子发生的时空特征及其在生育力保存中的应用 | 新生小鼠睾丸单细胞悬浮液和睾丸类器官 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，形态学分析，谱系特异性标记分析 | 小鼠睾丸类器官模型 | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | 新生小鼠睾丸细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2025-11-02 |
Exploration of Novel Biomarkers Through a Precision Medicine Approach Using Multi-Omics and Brain Organoids in Patients With Atypical Depression and Psychotic Symptoms
2025-Oct-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508383
PMID:41173797
|
研究论文 | 通过整合临床数据、白细胞单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学和脑类器官模型，探索非典型抑郁症伴精神病性症状患者的新型生物标志物 | 首次将白细胞单细胞转录组、血浆蛋白质组和患者来源脑类器官模型相结合，构建理解精神疾病病理生理学的新框架 | 白细胞计数差异在年龄校正后不显著，样本量未明确说明 | 探索非典型抑郁症伴精神病性症状的精准医学生物标志物 | 非典型抑郁症伴精神病性症状患者 | 精准医学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 脑类器官模型 | 脑类器官模型 | 临床数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 277 | 2025-11-02 |
Systematic production of human kidney organoids for transplantation in porcine kidneys during ex vivo machine perfusion
2025-Oct-31, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01542-1
PMID:41174010
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研究论文 | 开发可规模化生产的人源肾脏类器官并将其移植到离体猪肾中的方法 | 建立了可扩展、可重复且经济高效的人多能干细胞肾脏类器官分化体系，并首次实现在离体机器灌注的猪肾中进行人源类器官移植 | 未明确说明类器官长期存活率和功能整合效果，临床试验可行性仍需进一步验证 | 开发用于移植治疗的人类肾脏类器官规模化生产技术 | 人多能干细胞衍生的肾脏类器官和离体猪肾 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 免疫组化, 流式细胞术, 共聚焦显微镜 | 类器官模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-10-31 |
SpateCV: cross-modality alignment regularization of cell types improves spatial gene imputation for spatial transcriptomics
2025-Oct-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07245-0
PMID:41162996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 279 | 2025-11-02 |
Mitochondrial-activity-driven hematopoietic stem cell fate and lineage choice is first established in the aorta-gonad-mesonephros
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116296
PMID:40966086
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠胚胎主动脉-性腺-中肾区域中线粒体活性动态变化驱动造血干细胞和祖细胞功能异质性的机制 | 首次证明胚胎发育早期线粒体活性差异决定造血干细胞谱系选择倾向，并阐明了Wnt和PI3K信号通路在此过程中的作用机制 | 研究主要基于小鼠胚胎模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究线粒体代谢在胚胎造血干细胞发育过程中的作用机制 | 小鼠胚胎主动脉-性腺-中肾区域的造血干细胞和祖细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序, 药理学干预, 遗传学方法, 体外功能实验, 体内功能实验 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | 小鼠胚胎造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 280 | 2025-11-02 |
Single-cell analysis uncovers preserved prostate cancer lineages and universally altered pathways in Matrigel-free patient-derived organoids
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116352
PMID:41037396
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析无基质胶的前列腺癌患者来源类器官，揭示了其细胞异质性和保留的患者特异性癌细胞谱系 | 发现无基质胶培养条件能更好地保留前列腺癌患者特异性细胞谱系，建立了前列腺类器官单细胞图谱(PPScA)，重新定义了细胞类型标志物 | 研究主要关注短期培养，对长期培养效果和临床转化价值需要进一步验证 | 改进前列腺癌患者来源类器官的培养方法并研究其细胞生物学特性 | 前列腺癌患者来源类器官 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |