单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 592 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-11-17 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomes analyses reveal T cell-related prognostic risk model and tumor immune microenvironment modulation in colorectal cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1104
PMID:41234898
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析，构建了结直肠癌中T细胞相关的预后风险模型并研究肿瘤免疫微环境调控 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据，识别T细胞特征基因并构建三基因预后模型 | 使用公共数据库数据，缺乏实验验证和前瞻性临床验证 | 探索T细胞异质性，识别特征基因并开发可靠的预后模型以预测患者结局和免疫治疗反应 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，Cox回归，LASSO回归 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 242 | 2025-11-17 |
Novel Taxol-Derivative, STO-1, Induces Selective Anti-Tumor Immunity and Sustained Remission of Glioblastoma Without Triggering Autoimmune Reactions
2025-Oct-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211703
PMID:41227348
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型前药STO-1，通过选择性重编程肿瘤相关巨噬细胞实现胶质母细胞瘤的持续缓解且不引发自身免疫反应 | 通过紫杉醇与姜黄素的可裂解共价连接创建新型前药STO-1，实现选择性肿瘤相关巨噬细胞重编程而不引发系统性自身免疫反应 | 研究样本量较小（仅6只原位胶质母细胞瘤小鼠），缺乏人类临床试验验证 | 开发安全有效的胶质母细胞瘤免疫治疗方法 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和肿瘤相关微glia及巨噬细胞 | 癌症免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，高分辨率离体T2加权MRI | NA | 基因表达数据，医学影像数据 | 6只原位胶质母细胞瘤荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2025-11-17 |
Integrated Multi-Omics Analysis Identifies SRI as a Critical Target Promoting Gastric Cancer Progression and Associated with Poor Prognosis
2025-Oct-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213483
PMID:41228276
|
研究论文 | 通过整合多组学分析和实验验证，识别了促进胃癌进展并与不良预后相关的关键分子靶点SRI | 首次通过单细胞RNA测序与空间转录组学结合，识别出胃癌恶性上皮亚群C5和五基因预后特征，并实验验证SRI的关键功能 | 研究样本量有限，需要在更多独立队列中验证预后特征的普适性 | 识别胃癌进展和不良预后的关键分子驱动因素 | 胃癌患者样本和肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,功能验证实验 | LASSO Cox回归模型,多变量Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,临床数据 | 多个队列的胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 244 | 2025-11-17 |
CD5 Expression in CTCL and Its Implications for Anti-CD5 CAR T-Cell Therapy
2025-Oct-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110411
PMID:41226451
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析蕈样肉芽肿中CD5表达模式，评估其作为CAR-T细胞治疗靶点的潜力 | 首次在单细胞水平揭示CTCL中CD5表达的动态变化及其与病变类型的关联 | 样本量有限，需要更多研究阐明临床意义 | 评估CD5在皮肤T细胞淋巴瘤中的表达特征及其治疗靶点价值 | 蕈样肉芽肿患者皮肤活检组织中的CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例斑片/斑块期MF活检、8例肿瘤期MF活检、8例健康对照活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2025-11-17 |
The Anti-Cancer Potential of Genistein: Single-Cell RNA Sequencing Analysis and Spatial Transcriptome Reveal That Genistein Targets HSD17B1 to Inhibit the Progression of Gastric Adenocarcinoma
2025-Oct-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110369
PMID:41226409
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示金雀异黄素通过靶向HSD17B1抑制胃腺癌进展的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术系统解析金雀异黄素在胃腺癌中的'药物-基因-细胞'互作网络 | 研究主要基于生物信息学分析和分子对接验证，缺乏体内外实验进一步验证机制 | 探究金雀异黄素在胃腺癌治疗中的分子靶点及作用机制 | 胃腺癌相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子对接, 分子动力学 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 246 | 2025-11-17 |
Single-Cell Heterogeneity of Epigenetic Factor Regulation Deciphers Alteration of RNA Metabolism During Proliferative SHH-Medulloblastoma
2025-Oct-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213424
PMID:41228218
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析髓母细胞瘤中表观遗传调控因子的表达异质性，揭示其在RNA代谢和肿瘤进展中的作用 | 首次在单细胞水平系统分析髓母细胞瘤表观遗传调控因子的表达异质性，并开发与预后相关的表观遗传评分 | 研究基于现有数据库和两个独立队列，样本来源有限 | 探究表观遗传调控在髓母细胞瘤分子异质性和临床预后中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 两个独立队列（PBTA和Williamson队列） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 247 | 2025-11-17 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Immune Remodeling in Lungs of β-Carotene Oxygenase 2 Knockout Mice with Improved Antiviral Response
2025-Oct-23, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17213329
PMID:41228402
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现β-胡萝卜素加氧酶2敲除小鼠肺部免疫重塑并增强抗病毒反应 | 首次揭示BCO2在肺部免疫架构和抗病毒反应中的调控作用，发现其缺失导致免疫细胞组成改变和细胞状态重编程 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证；机制研究仍需进一步深入 | 探究BCO2缺失对肺部免疫细胞组成和抗病毒反应的影响 | BCO2敲除小鼠和C57BL/6J野生型小鼠的肺部组织 | 单细胞组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，免疫印迹，基因集变异分析 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质数据 | BCO2敲除和野生型小鼠肺部样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2025-11-17 |
TGFB1/SMAD3-driven macrophage-myofibroblast transition promotes fibrosis progression in endometriosis
2025-Oct-02, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf051
PMID:41056423
|
研究论文 | 本研究揭示TGFB1/SMAD3信号通路驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化是子宫内膜异位症纤维化进展的新机制 | 首次发现巨噬细胞-肌成纤维细胞转化是子宫内膜异位症中肌成纤维细胞的新来源，并阐明TGFB1/SMAD3信号通路的调控作用 | NA | 探索子宫内膜异位症纤维化进展的细胞来源和调控机制 | 人类子宫内膜样本和子宫内膜异位症小鼠模型 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，组织学分析，超微结构分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 人类子宫内膜样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-11-16 |
Integrated bulk sequencing and single-cell transcriptomic profiling implicates neutrophil-driven hypoxia in atrial fibrillation development
2025-Oct-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-1066
PMID:41229788
|
研究论文 | 本研究通过整合批量测序和单细胞转录组分析揭示了中性粒细胞驱动的缺氧在房颤发病机制中的作用 | 首次结合批量测序和单细胞转录组数据系统分析房颤中的炎症细胞浸润特征，并建立了基于中性粒细胞相关基因的机器学习诊断模型 | 研究结果需要通过体内、体外实验和外部验证研究进一步确认 | 阐明炎症细胞在房颤发病机制中的具体作用，并建立基于机器学习的诊断模型 | 房颤患者和窦性心律患者的心脏组织样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习 | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 46个房颤样本和18个窦性心律样本 | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-11-16 |
Integrating transcriptomics, single-cell omics, and deep learning-based histopathological features to identify OLFML3 in bladder cancer
2025-Oct-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-365
PMID:41230137
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学、单细胞组学和深度学习技术，识别OLFML3作为膀胱癌1年内复发的关键基因，并构建预测模型 | 首次结合多组学数据与深度学习病理特征识别OLFML3在膀胱癌复发中的作用，并开发基于ResNet50的OLFML3表达预测模型 | 需要进一步研究阐明OLFML3在膀胱癌1年内复发的具体作用机制 | 提高膀胱癌复发预测准确性并改善临床管理 | 膀胱癌患者 | 数字病理 | 膀胱癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,深度学习 | ResNet50,随机森林,Cox回归 | 基因表达数据,临床信息,病理图像 | TCGA和GEO数据库中的膀胱癌患者数据，以及广东省第二人民医院的单细胞RNA测序数据 | NA | RNA-seq,scRNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2025-11-16 |
Single-cell multi-omics and spatial transcriptomics reveal the transcriptional regulatory landscape of clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-328
PMID:41230160
|
研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示透明细胞肾细胞癌的转录调控景观 | 首次整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学全面解析ccRCC的细胞异质性、表观遗传调控和转录因子网络 | 研究样本量有限，功能验证仅针对YBX3基因 | 全面表征ccRCC的细胞异质性、表观遗传调控和转录因子网络，识别具有预后和治疗意义的关键基因 | 透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的细胞群体 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 伪时间分析, 基因集富集分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 252 | 2025-11-15 |
Intratumoral SPP1+BCL2A1+ Tumor-Associated Macrophages Predict Poor Response to PD1 Blockade
2025-Oct-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15212680
PMID:41225975
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现SPP1+BCL2A1+肿瘤相关巨噬细胞是预测肝细胞癌患者PD1阻断治疗反应不良的新型生物标志物 | 首次鉴定出SPP1和BCL2A1双阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，并证实其与免疫检查点抑制剂治疗反应不良相关 | 样本量相对较小，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索肝细胞癌免疫治疗反应的预测生物标志物 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 发现队列10例，ICB队列4例，验证队列18例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2025-11-16 |
Visceral Peritoneum Hyperpigmentation in Chickens Is Associated with DCT Expression
2025-Oct-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15213076
PMID:41227407
|
研究论文 | 本研究探讨了鸡内脏腹膜色素沉着过度(HVP)的遗传基础及其调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定HVP相关黑色素细胞群体，发现DCT基因在HVP中过度表达并确定其多态性可作为遗传选择标记 | 研究样本量有限，功能验证实验主要在细胞水平进行，需要进一步体内验证 | 阐明鸡内脏腹膜色素沉着异常的遗传原因和分子机制 | 鸡内脏腹膜组织和黑色素细胞 | 生物信息学 | 色素沉着异常 | HPLC, bulk RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 超过9700个高质量单细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-11-16 |
Identification of two distinct uveal melanoma subtypes based on the immune cell infiltration of the primary tumour
2025-Oct-23, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04198-7
PMID:41128887
|
研究论文 | 本研究基于原发性葡萄膜黑色素瘤的免疫细胞浸润特征，识别出两种不同的肿瘤亚型 | 首次在单细胞水平揭示葡萄膜黑色素瘤的免疫异质性，发现具有特定染色体变异和信号通路活性的侵袭性黑色素细胞亚群 | 样本量有限（8例肿瘤活检），仅使用二次数据分析 | 表征葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的细胞组成和免疫特征 | 原发性葡萄膜黑色素瘤肿瘤样本 | 单细胞组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 8例原发性葡萄膜黑色素瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 255 | 2025-11-16 |
Mapping early human blood cell differentiation using single-cell proteomics and transcriptomics
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr8785
PMID:40839704
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞蛋白质组学和转录组学技术，绘制了人类早期血细胞分化图谱 | 首次将单细胞质谱蛋白质组学与单细胞RNA测序整合，揭示了mRNA无法反映的干细胞功能相关蛋白质，并建立了推断细胞分化进程的翻译动态模型 | 研究仅针对CD34+造血干细胞和祖细胞，样本类型相对有限 | 解析人类早期血细胞分化过程中的分子机制 | 人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | 单细胞多组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞质谱蛋白质组学 | 翻译动态模型 | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 超过2500个人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 256 | 2025-11-16 |
Tumor-draining lymph nodes respond to immune checkpoint inhibition and orchestrate tumor immune remodeling
2025-Oct-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04187-w
PMID:41051631
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 首次通过单细胞测序技术系统阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的具体作用机制，发现其作为肿瘤特异性T细胞的来源地 | 研究样本仅限于结直肠癌患者，需要进一步验证在其他癌症类型中的普适性 | 阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的响应机制及其对肿瘤微环境的调控作用 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 257 | 2025-11-15 |
YTHDF1 regulates YTHDF2 stability via m6A-dependent mechanisms in hepatocellular carcinoma: insights from in vitro, in vivo, and multi-cohort clinical studies
2025-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-2025-363
PMID:41220748
|
研究论文 | 本研究揭示YTHDF1通过m6A依赖性机制调控YTHDF2稳定性促进肝细胞癌进展 | 首次发现YTHDF1通过m6A依赖性方式增强YTHDF2的mRNA稳定性和翻译效率，并揭示两者在肝细胞癌中的空间共表达模式 | 未明确说明样本规模和研究人群的详细特征 | 探索YTHDF同源蛋白在肝细胞癌中的调控网络和临床相关性 | 肝细胞癌组织、YTHDF蛋白家族 | 分子生物学 | 肝细胞癌 | 免疫组织化学、空间转录组学、Western blot、实时定量PCR、RNA免疫沉淀、e-CLIP测序、双荧光报告基因检测、RNA稳定性实验 | NA | 蛋白质表达数据、RNA表达数据、空间转录组数据、临床预后数据 | 两个临床队列的肝细胞癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 258 | 2025-11-15 |
Focal Adhesion Kinase-Dependent Reprogramming of IFN-γ Signaling through PYK2 Coinhibition Sensitizes Melanoma to Immune Checkpoint Blockade
2025-Oct-14, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.09.376
PMID:41101630
|
研究论文 | 本研究揭示了黏着斑激酶(FAK)及其同源物PYK2在IFN-γ介导的免疫检查点阻断耐药中的不同作用机制 | 首次阐明FAK作为主要支架蛋白、PYK2作为辅助因子在IFN-γ信号通路中的协同作用，并提出联合抑制策略可增强免疫治疗效果 | 研究主要基于临床前模型，需进一步临床验证；PYK2抑制的最佳程度尚未完全确定 | 探索克服黑色素瘤免疫检查点阻断耐药的新策略 | 黑色素瘤细胞、小鼠模型、临床患者样本 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 无标记磷酸化蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA皮肤黑色素瘤队列、GSE91061临床数据集、抗PD-1耐药小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2025-11-15 |
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09313-3
PMID:40702188
|
研究论文 | 开发了一种多组学单细胞测序方法，用于精确识别CRISPR编辑的疾病变异效应 | 结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模态单细胞功能基因组学方法 | 未明确说明样本量限制或技术适用范围 | 识别疾病相关非编码等位基因的功能后果并确定因果变异 | 人类T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因 | 功能基因组学 | 自身免疫疾病 | CRISPR-Cas编辑, 多组学单细胞测序 | NA | 基因组DNA, 转录组, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 260 | 2025-11-15 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identified TIMP1 as a Prognostic Marker in Colorectal Cancer
2025-Oct, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e38
PMID:41220845
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建结直肠癌免疫预后模型并鉴定TIMP1作为预后标志物 | 首次结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建结直肠癌免疫预后模型，并实验验证TIMP1的生物学功能 | NA | 解析结直肠癌免疫异质性并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,差异表达分析,功能富集分析,随机森林分析,LASSO方法 | 随机森林,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |