单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 589 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-11-13 |
SPP1high macrophage-induced T-cell stress promotes colon cancer liver metastasis through SPP1/CD44/PI3K/AKT signaling
2025-Oct-20, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012330
PMID:41120125
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示SPP1高表达巨噬细胞通过SPP1/CD44/PI3K/AKT信号通路诱导T细胞应激状态促进结肠癌肝转移的机制 | 首次发现SPP1高表达巨噬细胞诱导的T细胞应激状态在结肠癌肝转移中的作用，并揭示SPP1/CD44/PI3K/AKT信号通路机制 | 研究样本量有限，主要基于体外实验验证机制 | 阐明结肠癌肝转移免疫抑制微环境的形成机制并寻找免疫治疗新靶点 | 结肠癌肝转移患者的肿瘤标本和匹配的肝转移灶 | 单细胞转录组学 | 结肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 结肠癌肝转移患者肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2025-11-13 |
ALCAM-CD6 axis suppression: a key determinant of immune-mediated metastasis recurrence in stage III non-small cell lung cancer
2025-Oct-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010416
PMID:41073134
|
研究论文 | 本研究揭示了ALCAM-CD6轴在III期非小细胞肺癌转移复发中的关键作用机制 | 首次发现ALCAM-CD6相互作用抑制导致免疫抑制状态，并通过转录因子MYB调控ALCAM表达影响肿瘤进展 | 研究样本仅限于III期NSCLC患者，未涵盖其他分期或肺癌亚型 | 探究III期非小细胞肺癌转移复发的生物学机制 | 接受肺癌切除术的III期非小细胞肺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序,组织流式细胞分析,实时PCR,Western blotting,基因沉默,细胞共培养,流式细胞术,染色质免疫沉淀定量PCR | NA | 单细胞测序数据,组织样本,临床数据 | 2018年8月至2021年7月期间接受肺癌切除术的III期NSCLC患者组织样本和临床数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 243 | 2025-11-13 |
Neural stem cell-delivered oncolytic virus via intracerebroventricular administration enhances glioblastoma therapy and immune modulation
2025-Oct-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012934
PMID:41062177
|
研究论文 | 本研究通过脑室内注射神经干细胞递送溶瘤病毒，评估其对胶质母细胞瘤的治疗效果和免疫调节作用 | 利用神经干细胞作为溶瘤病毒载体通过脑室内给药增强肿瘤靶向性，并结合单细胞RNA测序揭示其通过下调S100A8/A9抑制髓源性抑制细胞募集的免疫调节机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 开发改善胶质母细胞瘤治疗效果的创新疗法 | 胶质母细胞瘤细胞、神经干细胞、溶瘤病毒 | 肿瘤免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外细胞实验、动物模型 | 异种移植模型、原位肿瘤模型、人源化免疫系统小鼠模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确具体样本数量，使用多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2025-11-13 |
Multiomics elucidation of surrounding AT2 cells impeding tertiary lymphoid structures function in neoadjuvant chemoimmunotherapy response of multiple primary lung cancers
2025-Oct-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011882
PMID:41062178
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示AT2细胞通过MIF-SIAE信号轴抑制三级淋巴结构中B细胞功能，影响多原发肺癌新辅助化疗免疫治疗的疗效 | 首次发现AT2细胞通过MIF-SIAE信号轴抑制三级淋巴结构中B细胞功能，揭示了多原发肺癌免疫治疗反应不一致的新机制 | 样本量有限，仅分析了少数MPLC病例 | 探究多原发肺癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应不一致的机制 | 多原发肺癌患者的肿瘤病灶 | 多组学分析 | 肺癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,多重免疫组织化学,空间共定位分析 | 细胞邻域分析 | 单细胞数据,空间转录组数据,免疫组织化学数据 | 1例MPLC患者的所有病灶，外加3例MPLC患者的4个无反应结节 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 245 | 2025-11-13 |
Spatial transcriptomic profiling of metastatic renal cell carcinoma identifies chemokine-driven macrophage and CD8+ T-cell interactions predictive of immunotherapy response
2025-Oct-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012991
PMID:41043857
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析转移性肾细胞癌，发现预测免疫治疗反应的巨噬细胞和CD8+ T细胞相互作用 | 首次使用高分辨率空间转录组技术揭示转移灶特异性免疫生态位对免疫检查点抑制剂疗效的决定性作用 | 样本量较小（12例初治患者），需要更大规模研究验证 | 开发预测转移性肾细胞癌免疫治疗反应的生物标志物 | 转移性肾细胞癌患者组织样本 | 空间转录组学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 细胞类型反卷积分析 | 空间转录组数据，临床数据 | 12例初治mRCC患者，其中6例提供匹配转移灶样本 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | 10x Visium, NanoString COSMx | 10x Visium空间转录组技术，NanoString COSMx空间分子成像 |
| 246 | 2025-11-13 |
Plasma Exosomes Derived from Patients with Primary Immune Thrombocytopenia Attenuate TBX21+ Regulatory T Cell-Mediated Immune Suppression via MiR-363-3p
2025-Oct, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02275-8
PMID:40032779
|
研究论文 | 本研究揭示了原发性免疫性血小板减少症患者血浆外泌体通过miR-363-3p削弱调节性T细胞免疫抑制功能的分子机制 | 首次发现ITP患者外泌体通过miR-363-3p-ARID3A/SPI1/TBX21轴调控Treg功能，并利用单细胞测序技术鉴定出TBX21高表达的Treg亚群 | 研究样本量未明确说明，机制研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探究原发性免疫性血小板减少症中调节性T细胞功能减弱的分子机制 | 原发性免疫性血小板减少症患者的血浆外泌体和调节性T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫性血小板减少症 | 单细胞测序,Treg功能测定,细胞因子分析 | NA | 单细胞测序数据,功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2025-11-10 |
scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations
2025-Oct-27, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.056
PMID:41161490
|
研究论文 | 提出一种基于视觉迁移学习和表格到图像转换的标记基因细胞类型注释方法scMapNet | 结合掩码自编码器和视觉变换器，通过树状图转换利用细胞标记基因信息，并在大量未标记数据上进行预训练 | NA | 开发能够充分学习细胞标记基因知识和未标记数据信息的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 掩码自编码器(MAE), 视觉变换器(ViT) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2025-11-09 |
Multi-omics integrative analysis of the mechanisms linking environmental pollutant exposure to bladder cancer pathogenesis
2025-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119251
PMID:41110307
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示环境污染物暴露与膀胱癌发病机制之间的分子联系 | 首次通过整合多组学数据和孟德尔随机化分析，系统构建了环境-基因相互作用网络，识别出三个因果枢纽基因及其与34种高风险污染物的关联 | 研究主要基于现有数据库和队列数据，需要进一步实验验证污染物与基因相互作用的生物学机制 | 探究环境污染物暴露与膀胱癌发病的分子机制 | 膀胱癌相关基因和环境污染物 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 多组学整合分析, 转录组学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 孟德尔随机化 | 孟德尔随机化模型, 分子对接模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 多个膀胱癌队列的转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-11-09 |
Deciphering the crucial role of IGF2BP3 in modulating stemness traits of salivary adenoid cystic carcinoma
2025-Oct-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03068-7
PMID:41082045
|
研究论文 | 本研究系统阐明了IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌干细胞特性调控中的关键作用及机制 | 首次通过单细胞测序数据验证IGF2BP3与SACC干细胞特性的关联，并系统揭示其调控干细胞特性的分子机制 | 未明确IGF2BP3下游具体作用靶点及信号通路细节 | 探究IGF2BP3在唾液腺腺样囊性癌中的功能作用及调控机制 | 唾液腺腺样囊性癌细胞 | 癌症生物学 | 唾液腺腺样囊性癌 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-11-09 |
GreenCells: A comprehensive resource for single-cell analysis of plant lncRNAs
2025-Oct, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110678
PMID:40912654
|
研究论文 | 开发了专门用于植物lncRNA单细胞分析的综合数据库GreenCells | 首个专门针对植物lncRNA的单细胞数据库，填补了现有植物单细胞转录组数据库主要关注蛋白编码基因的空白 | NA | 研究植物长非编码RNA在单细胞水平的表达和功能 | 8种植物物种的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含2177个lncRNA标记基因和68,869个蛋白编码标记基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2025-11-08 |
Spatial Transcriptomics of Adipose Tissue: Technologies, Applications, and Challenges
2025-Oct-30, Journal of obesity & metabolic syndrome
IF:4.7Q1
DOI:10.7570/jomes25078
PMID:41094746
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在脂肪组织研究中的技术进展、应用场景和当前挑战 | 系统整合了空间转录组学技术在解析脂肪组织空间结构方面的最新突破，强调了该技术在揭示脂肪生成微环境、区域特异性重塑和免疫细胞相互作用方面的独特优势 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献进行归纳总结 | 探讨空间转录组学技术在脂肪组织生物学研究中的应用前景 | 脂肪组织的空间结构和细胞微环境 | 空间转录组学 | 代谢疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 252 | 2025-11-08 |
Differentiation latency and dormancy signatures define fetal liver hematopoietic stem cells at single-cell resolution
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116289
PMID:40971295
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了胎儿肝脏造血干细胞具有分化延迟和休眠特征 | 首次在单细胞水平鉴定了胎儿肝脏造血干细胞的区分特征，包括分化延迟、细胞分裂对称性和生物合成休眠特征 | 研究主要基于体外培养平台，可能无法完全模拟体内真实微环境 | 探索胎儿肝脏造血干细胞自我更新的内在和外在调控机制 | 胎儿肝脏造血干细胞 | 单细胞分析 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活细胞成像, 移植实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2025-11-08 |
CCL26 and CXCL12 preserve insulin-sensitizing macrophages in subcutaneous adipose tissue in obesity
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116450
PMID:41100258
|
研究论文 | 本研究揭示了皮下脂肪组织通过CCL26和CXCL12信号通路维持胰岛素敏感巨噬细胞的新机制 | 首次发现皮下脂肪组织巨噬细胞释放的小细胞外囊泡具有改善胰岛素敏感性的功能，并阐明CCL26和CXCL12信号通路在维持巨噬细胞稳态中的作用 | 研究主要聚焦于肥胖模型，其他代谢疾病状态下的机制尚需进一步验证 | 探究皮下脂肪组织在肥胖中抵抗胰岛素抵抗的保护机制 | 皮下脂肪组织巨噬细胞、小细胞外囊泡、脂肪细胞及其前体细胞 | 代谢疾病研究 | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序, 体内外细胞生长和迁移测量 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-11-08 |
The constitutive 20S proteasome is required for the maintenance and differentiation of spermatogonia in mice
2025-Oct-28, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.068
PMID:41167419
|
研究论文 | 本研究揭示了组成型20S蛋白酶体在小鼠精原细胞维持和分化中的关键作用 | 首次证明组成型20S蛋白酶体对精原细胞维持和分化至关重要，并发现s20S蛋白酶体可补偿c20S功能缺失 | 研究仅限于小鼠模型，人类中的相关性尚需验证 | 阐明组成型20S蛋白酶体在精子发生过程中的功能 | 小鼠雄性生殖细胞 | 生殖生物学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 255 | 2025-11-08 |
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveal PAK kinase as a therapeutic target in fibroblastic foci and dense fibrosis of idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Oct, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00022-2025
PMID:40675771
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了PAK激酶作为特发性肺纤维化中成纤维细胞灶和致密纤维化的治疗靶点 | 首次发现一种新型肌成纤维细胞群体在成纤维细胞灶和致密纤维化区域富集，并证实PAK激酶在这些纤维化区域被激活 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 探索特发性肺纤维化中纤维化进展的分子机制和潜在治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者的肺组织样本和博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 空间转录组学,单细胞分析 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 256 | 2025-11-08 |
The multifaceted role of YAP in the tumor microenvironment and its therapeutic implications in cancer
2025-Oct, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01551-9
PMID:41028521
|
综述 | 本文综述了YAP/TAZ在肿瘤微环境中的多重作用及其在癌症治疗中的意义 | 系统阐述了YAP/TAZ作为Hippo信号通路关键效应子在肿瘤微环境重塑中的核心调控作用，及其与免疫治疗联合应用的潜力 | 肿瘤选择性和耐药机制等挑战仍然存在 | 探讨YAP在肿瘤微环境中的作用机制及其治疗意义 | 肿瘤微环境中的YAP/TAZ信号通路 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 257 | 2025-11-07 |
Limited nasal IFN production contributes to delayed respiratory virus clearance and suboptimal vaccine responses
2025-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182836
PMID:40956633
|
研究论文 | 本研究揭示了鼻部干扰素产生受限导致呼吸道病毒清除延迟和疫苗应答不佳的机制 | 发现鼻部免疫环境处于静息状态，干扰素产生受限是病毒清除延迟的关键因素，并通过干扰素佐剂成功改善疫苗应答 | 主要使用小鼠模型，人类数据验证有限 | 探究鼻部免疫应答特征及其对呼吸道病毒清除和疫苗效果的影响 | 人类偏肺病毒(HMPV)感染的小鼠模型和COVID-19患者 | 免疫学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2025-11-07 |
Improving immunotherapy responses by dual inhibition of macrophage migration inhibitory factor and PD-1
2025-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191539
PMID:41122966
|
研究论文 | 本研究探讨了联合抑制巨噬细胞移动抑制因子(MIF)和PD-1在两种小鼠肿瘤模型中的免疫治疗效果 | 首次证明抗MIF疗法可增强抗PD-1免疫检查点抑制剂的抗肿瘤效果，并发现Cd74/C1q/Aif1表达巨噬细胞的抗肿瘤表型 | 研究仅限于小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 评估抗MIF疗法与抗PD-1联合使用的抗肿瘤疗效 | YUMMER1.7黑色素瘤和MC38结直肠癌小鼠模型，以及人类黑色素瘤患者 | 免疫肿瘤学 | 黑色素瘤，结直肠癌 | scRNA-Seq，流式细胞术，免疫组织化学，细胞因子分析 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据，临床数据 | 多种基因型小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2025-11-07 |
Unraveling enteroendocrine cell lineage dynamics and associated gene regulatory networks during intestinal development
2025-Oct-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.062083
PMID:41117135
|
研究论文 | 本研究通过小鼠胚胎和人类多能干细胞来源的肠道类器官模型，结合单细胞转录组学，揭示了肠道内分泌细胞在发育过程中的谱系动态和基因调控网络 | 首次系统性地揭示了发育过程中肠道内分泌细胞亚型特化的机制，发现其独立于完整的隐窝-绒毛结构和饮食/微生物刺激 | 研究主要基于模型系统，需要进一步在体内验证；某些EEC亚型的出现机制仍需深入探索 | 阐明肠道内分泌细胞在发育过程中的谱系动态和分化机制 | 小鼠胚胎、人类多能干细胞来源的肠道类器官 | 单细胞生物学 | 肠道发育疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠胚胎和人类肠道类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2025-11-07 |
Uncovering Cellular Interactome Drivers of Immune Checkpoint Inhibitor Response in Advanced Melanoma Patients
2025-Oct, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-025-00857-y
PMID:41185627
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据构建细胞相互作用网络，识别与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的网络模式 | 首次将肿瘤微环境中的细胞间相互作用建模为加权有向网络，并识别与治疗反应相关的网络模式 | 依赖于公开可用的单细胞RNA测序数据，样本量有限 | 识别与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的细胞相互作用网络驱动因素 | 晚期黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 多元统计学习方法 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 多个黑色素瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |