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当前共找到 594 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-12-07 |
Emerging Roles of Megakaryocytes in Immune Regulation and Potential Therapeutic Prospects
2025-Oct-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211677
PMID:41227322
|
综述 | 本文综述了巨核细胞在传统血小板生成功能之外，在免疫调节、造血干细胞微环境调控以及应对病理生理刺激中的新兴作用 | 揭示了巨核细胞群体的显著异质性及其在止血、免疫和再生过程中的整合作用，并探讨了其作为治疗靶点在再生医学和免疫疗法中的潜力 | NA | 探讨巨核细胞在免疫调节中的新兴功能及其治疗应用前景 | 巨核细胞 | NA | NA | 成像技术，单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 202 | 2025-12-07 |
Matrix stiffness induces endothelial network senescence
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.05.680536
PMID:41278992
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研究论文 | 本研究开发了一种三维人类模型，揭示了细胞外基质硬化通过机械应力诱导内皮细胞衰老的机制 | 开发了能够将机械应力与炎症或生化输入解耦的三维人类模型，首次证明在没有炎症信号的情况下，基质硬化可通过Notch-JNK-FOS信号轴诱导内皮细胞衰老表型 | 模型可能无法完全模拟体内复杂的微环境，临床样本仅限于合成乳房植入物患者的纤维化包膜组织 | 研究细胞外基质硬化如何通过机械应力驱动内皮细胞衰老，以理解组织功能衰退的机制 | 内皮细胞、三维人类内皮网络模型、患者纤维化包膜组织 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 三维人类模型 | 基因表达数据、组织样本 | 患者纤维化包膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 203 | 2025-12-06 |
Identification of C1QA as a prognostic marker and regulator of immunosuppressive neutrophils in early-stage lung adenocarcinoma through integrated bioinformatics analyses
2025-Oct-31, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01881-y
PMID:41171372
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析，鉴定出C1QA是早期肺腺癌的预后标志物，并揭示了其通过调节免疫抑制性中性粒细胞影响肿瘤微环境的机制 | 首次在早期肺腺癌中系统性地将C1QA鉴定为与中性粒细胞丰度相关的关键枢纽基因，并利用单细胞RNA测序和细胞通讯分析阐明了其通过补体受体与中性粒细胞相互作用、驱动免疫抑制性肿瘤微环境的具体机制 | 研究主要基于公开的基因表达数据集和生物信息学分析，实验验证相对有限；结论需要在更大规模的独立队列和体内模型中进一步验证 | 探究早期肺腺癌中中性粒细胞的分子调控机制，并寻找相关的预后标志物和治疗靶点 | 早期肺腺癌患者样本、基因表达数据、中性粒细胞、巨噬细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、CIBERSORTx反卷积分析、RT-qPCR、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 基于公共数据集GSE31210等，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2025-12-05 |
BASIN: Bayesian mAtrix variate normal model with Spatial and sparsIty priors in Non-negative deconvolution
2025-Oct-24, ArXiv
PMID:41281239
|
研究论文 | 本文提出了一种名为BASIN的贝叶斯矩阵变量正态模型，用于空间转录组学中的细胞类型反卷积，通过结合空间和稀疏性先验来提高反卷积的准确性和效率 | BASIN首次将矩阵变量贝叶斯非负矩阵分解方法应用于细胞类型反卷积，通过保持变量矩阵形式推导更高效的矩阵正态后验，并提供不确定性量化 | 未明确说明模型在复杂组织或高噪声数据中的泛化能力，以及计算效率在大规模数据集上的具体表现 | 开发一种新的细胞类型反卷积方法，以从空间转录组学数据中推断细胞组成 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 205 | 2025-12-05 |
A lifespan transcriptomic atlas of the human prefrontal cortex at single-cell resolution
2025-Oct-06, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.11.06.24316592
PMID:41282859
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研究论文 | 本研究构建了人类背外侧前额叶皮层（DLPFC）的首个跨生命周期的单细胞核转录组图谱，揭示了其细胞和分子程序随年龄变化的动态规律 | 首次构建了覆盖人类完整生命周期（0-97岁）的DLPFC单细胞核转录组图谱，识别了三个不同的转录组阶段和十种年龄相关轨迹，并发现了成年晚期神经元核心生物钟节律丧失与胶质细胞应激适应性节律出现的新现象 | 研究基于死后样本，可能无法完全反映活体组织的动态过程；样本量虽大但个体差异可能影响部分结论的普适性 | 绘制人类前额叶皮层跨生命周期的细胞和分子图谱，以理解大脑发育、衰老及疾病易感性的基础 | 人类背外侧前额叶皮层（DLPFC） | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞核RNA测序，空间转录组学 | 非线性建模，伪时间分析 | 转录组数据，空间基因表达数据 | 284例死后样本，超过130万个细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 206 | 2025-12-05 |
Acellular Tissue Engineered Vessels as Coronary Artery Bypass Grafts
2025-Oct, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2025.101379
PMID:40939573
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研究论文 | 本研究评估了一种小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的可行性和耐久性 | 首次在灵长类动物模型中评估小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的长期性能，并利用空间转录组学揭示了宿主细胞浸润对血管重塑的调控机制 | 研究样本量较小（n=5），仅评估了6个月的短期效果，未与传统自体血管进行直接比较 | 开发冠状动脉旁路移植术的替代血管移植物 | 成年狒狒的冠状动脉系统 | 组织工程 | 心血管疾病 | 空间转录组学，计算机断层扫描血管造影 | NA | 影像数据，基因表达数据，组织学数据 | 5只成年狒狒 | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2025-12-04 |
Coxiella burnetii Strains Elicit Distinct Inflammatory Responses in Human Macrophages
2025-Oct-29, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens14111101
PMID:41305339
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了不同毒力的贝氏柯克斯体菌株在人巨噬细胞中引发差异化的炎症反应和极化状态 | 首次系统比较了不同毒力贝氏柯克斯体菌株在人肺泡巨噬细胞和THP-1细胞中引发的宿主转录组反应异质性，并揭示了菌株特异性和细胞特异性因素在塑造宿主免疫中的重要性 | 研究主要基于体外细胞模型，未在动物模型或临床样本中验证；单细胞RNA测序仅针对NMII菌株感染的THP-1细胞 | 阐明贝氏柯克斯体不同菌株与宿主巨噬细胞相互作用的分子机制，为Q热的靶向治疗提供依据 | 人肺泡巨噬细胞(hAMs)和THP-1巨噬细胞系 | 感染免疫学 | Q热 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 细胞因子检测 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用人肺泡巨噬细胞和THP-1细胞系进行感染实验 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 208 | 2025-09-18 |
Author Correction: Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain
2025-Oct, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02077-z
PMID:40958041
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2025-12-03 |
Neuroprotective role of DNTαβ Cell transplantation on modulating immune microenvironment in spinal cord injured mice
2025-Oct, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00743
PMID:40987706
|
研究论文 | 本研究探讨了DNTαβ细胞移植在脊髓损伤小鼠中通过调节免疫微环境发挥神经保护作用的机制 | 首次利用单细胞测序揭示DNT细胞的异质性，并验证DNTαβ细胞移植通过Gzmb和IFN通路调节免疫反应，促进脊髓损伤后的早期修复和神经保护 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证，且具体分子机制需进一步深入探索 | 探究DNTαβ细胞移植对脊髓损伤后免疫微环境的调节作用及其神经保护效果 | 脊髓损伤小鼠模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 流式细胞术、单细胞测序、转录组测序、免疫组织化学 | NA | 单细胞测序数据、转录组数据、流式细胞术数据、免疫组织化学图像 | 未明确指定样本数量，但使用小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2025-12-02 |
Interregional human assembloids recapitulate fetal brain morphologies and enhance neuronal complexity
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.24.684445
PMID:41278870
|
研究论文 | 本研究利用3D共聚焦成像和手动重建技术，分析了人类前脑、丘脑器官样体及组装体，揭示了其神经元形态与胎儿大脑的相似性及组装体增强的形态复杂性 | 首次系统描述人类神经器官样体和组装体中神经元形态的多样性，并发现组装体比单个器官样体具有更高的形态复杂性，包括更广泛的树突分支、更长投射和多样化的胞体形状 | 研究仅基于735个神经元的样本量，可能无法完全代表整体多样性；手动重建方法可能引入主观偏差 | 验证人类神经模型并建模形态功能性疾病 | 人类前脑（背侧和腹侧）和丘脑（背侧和腹侧）器官样体，以及前脑、丘脑和皮质丘脑组装体 | 数字病理学 | NA | 3D共聚焦成像和手动重建 | NA | 图像 | 735个神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2025-12-02 |
Rapid canalization of chromosome conformation-transcription fingerprints during embryogenesis revealed by fully-automated cell identity decoding with CeSCALE
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.22.684035
PMID:41279329
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为CeSCALE的新型算法，结合单细胞基因组学，揭示了胚胎发育过程中局部染色体构象-转录'指纹'与细胞谱系的关系及其遗传模式 | 开发了基于最优传输理论的CeSCALE算法，首次实现了对广泛发育窗口中谱系解析的单个细胞表型的全自动量化，并揭示了局部构象-转录'指纹'沿细胞谱系的稳定遗传现象 | 研究主要基于胚胎发育模型，结论在其他生物系统或疾病状态中的普适性有待验证 | 探究胚胎发育过程中染色体高级构象与转录活性之间的关系及其沿细胞谱系的遗传机制 | 胚胎发育过程中的细胞谱系 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞基因组学，单分子染色体追踪，单细胞转录组学 | CeSCALE（基于Sinkhorn的细胞对齐算法） | 单细胞基因组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞基因组学，单细胞转录组学 | NA | NA |
| 212 | 2025-12-02 |
Epithelial-Mesenchymal Transition is Associated with Altered Immune Composition and Cytotoxic Function in Triple-Negative Breast Cancer
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.22.683714
PMID:41280107
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了三阴性乳腺癌中上皮-间质转化（EMT）谱系与肿瘤免疫微环境组成及功能变化之间的关联 | 首次系统揭示了EMT中间状态（非完全上皮或完全间质状态）与免疫细胞组成及功能的梯度变化关系，阐明了EMT谱系上肿瘤细胞MHC分子表达下调、细胞毒性T细胞和NK细胞功能抑制以及B细胞亚群转变的渐进模式 | 研究基于小鼠4T1肿瘤细胞系衍生的克隆模型，其结论在人类乳腺癌中的普适性需要进一步验证；单细胞RNA测序数据主要反映转录组水平变化，蛋白质水平和功能验证有待补充 | 探究三阴性乳腺癌中上皮-间质转化（EMT）不同状态对肿瘤免疫微环境组成和功能的影响 | 从4T1小鼠三阴性乳腺癌细胞系建立的五个具有不同EMT表型的单细胞克隆群体及其形成的肿瘤 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 五个单细胞克隆群体及其衍生的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2025-12-02 |
Innovations in spinal cord cell type heterogeneity across vertebrate evolution
2025-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.09.680955
PMID:41279330
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研究论文 | 本研究通过比较鱼类、蛙类、小鼠和人类的脊髓细胞类型，揭示了脊椎动物进化过程中脊髓细胞类型异质性的保守与分化模式 | 首次跨物种比较脊椎动物脊髓细胞类型图谱，发现发育阶段细胞类型高度保守，而成年阶段兴奋性神经元亚群出现物种特异性分化，并定位到哺乳动物特有的背侧脊髓感觉整合中枢 | 研究主要基于转录组数据，缺乏功能验证；物种覆盖范围有限（仅四种代表性物种）；空间转录组分辨率仍有提升空间 | 探究脊椎动物脊髓细胞类型在进化过程中的保守性与多样性，解析运动控制回路的进化起源 | 鱼类、蛙类、小鼠和人类的脊髓组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 跨四个物种（鱼类、蛙类、小鼠、人类）的脊髓样本，涵盖约4.5亿年进化历程 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 214 | 2025-12-02 |
Comprehensive benchmarking of somatic mutation detection by the SMaHT Network
2025-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.09.678885
PMID:41279200
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研究论文 | SMaHT网络通过四项大规模基准实验，评估了检测体细胞突变的测序技术、实验方法和计算策略 | 整合短读长和长读长测序、使用供体特异性组装和人类泛基因组，并比较了六种双链测序技术，展示了单细胞测序在解析细胞类型特异性突变模式方面的优势 | 未明确提及具体的技术限制或样本多样性不足等问题 | 评估和优化体细胞突变检测的技术与方法，以实现准确、全基因组的体细胞突变发现和分析 | 体细胞突变检测的测序技术、实验方法和计算策略 | 基因组学 | NA | 短读长测序、长读长测序、双链测序、单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | 九个分析样本 | NA | 单细胞测序、双链测序、短读长测序、长读长测序 | NA | NA |
| 215 | 2025-12-02 |
Ex Vivo Expanded Regulatory T Cells Inhibit AAA Progression by Limiting CD4+ and CD8+ T Cell Accumulation in Aortic Tissue
2025-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681290
PMID:41279653
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞（Tregs）在腹主动脉瘤（AAA）进展中的作用，通过小鼠模型验证Treg疗法能通过限制CD4+和CD8+ T细胞在主动脉组织中的积累来抑制AAA发展 | 利用单细胞RNA测序数据识别T细胞在AAA中的关键作用，并通过同种移植Tregs到AAA诱导小鼠中，揭示Tregs通过定位于引流淋巴结而非主动脉微环境来减少促炎细胞浸润，从而抑制AAA进展 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；Tregs在主动脉微环境中未被检测到，其具体作用机制需进一步探索；临床转化潜力尚未在人体试验中验证 | 研究Tregs在AAA进展中的具体机制，探索Treg疗法作为早期AAA治疗策略的潜力 | 人类和小鼠AAA单细胞RNA测序数据、AAA诱导的野生型C57BL/6J小鼠、Thy1.1等位基因供体小鼠的Tregs | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、qRT-PCR、Verhoeff-van Gieson染色、苏木精-伊红染色、免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、图像数据、流式细胞数据 | 使用小鼠模型，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 216 | 2025-12-02 |
Epicardial contributions to fibro-inflammatory signaling in a Pkp2-deficient arrhythmogenic cardiomyopathy model
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.680826
PMID:41279609
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研究论文 | 本研究通过构建Pkp2缺陷小鼠模型，探究了心外膜来源细胞在致心律失常性心肌病中纤维炎症信号传导的作用 | 首次在单细胞水平揭示了Pkp2缺陷导致心外膜来源成纤维细胞获得衰老相关分泌表型，并阐明了B细胞在疾病早期炎症和纤维化反应中的作用 | 研究基于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需谨慎；B细胞耗竭仅延迟早期反应，未显著改变终末期心脏生理 | 探究Pkp2缺陷在心外膜来源细胞中对致心律失常性心肌病纤维炎症信号传导和发病机制的贡献 | 转基因小鼠（Pkp2-cKO和Pkp2-ceKO模型）及其心脏组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，流式细胞术，qRT-PCR，超声心动图 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据，定量PCR数据，生理测量数据 | 转基因小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 217 | 2025-12-02 |
Optimal Gene Panel Selection for Targeted Spatial Transcriptomics Experiments
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681071
PMID:41279853
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ReconST的新方法，用于自动设计空间转录组学分析中的最优基因面板 | ReconST利用现有scRNA-seq数据，通过门控自编码器识别最优基因子集，在重建准确性和空间模式保留方面优于现有方法 | NA | 优化基因面板选择以最大化空间转录组学分析的效用 | 基因面板设计 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析，scRNA-seq | 门控自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 218 | 2025-12-02 |
Accelerating scRNA-seq Analysis: Automated cell type annotation using representation learning and vector search
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680787
PMID:41279915
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研究论文 | 本文介绍了一种基于表示学习和向量搜索的自动化细胞类型注释服务，用于加速单细胞RNA测序分析 | 采用反向搜索方法，避免依赖预定义标记基因或组织特异性参考，提供细粒度和粗粒度注释 | NA | 自动化单细胞RNA测序中的细胞类型注释，以提高分析速度和准确性 | 10x Genomics单细胞基因表达样本中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 表示学习 | 基因表达谱数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 219 | 2025-12-02 |
SpaDiff: Denoising for Sequence-based Spatial Transcriptomics via Diffusion Process
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.07.681011
PMID:41280001
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaDiff的去噪方法，用于处理基于序列的空间转录组学数据中的spot-swapping噪声 | 将spot-swapping噪声建模为扩散过程，并模拟RNA分子的位移以逆转噪声，从而恢复原始空间分布 | NA | 提高空间转录组学数据的空间特异性和数据完整性 | 空间转录组学数据中的RNA分子 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 扩散过程模型 | 序列数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 220 | 2025-12-02 |
Multi-omics analysis identifies S100a10/Anxa2 complex within proximal tubule aggravates acute kidney injury through p-Stat3/Spp1 signaling
2025-Oct, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2025.11.003
PMID:41265636
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研究论文 | 通过多组学分析发现S100a10/Anxa2复合物在近端小管内通过p-Stat3/Spp1信号通路加剧急性肾损伤 | 首次结合bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学技术，系统性地识别了S100a10/Anxa2复合物在AKI中的作用，并通过实验验证了其通过p-Stat3/Spp1信号通路调控AKI的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中进行验证，且具体信号通路的上下游调控细节有待进一步探索 | 探究急性肾损伤（AKI）的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 小鼠肾脏组织，特别是近端小管上皮细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, ChIP-seq | NA | RNA-seq数据, 空间转录组数据, ChIP-seq数据 | 未明确指定样本数量，但涉及对照组和AKI模型组 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |