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当前共找到 594 篇文献,本页显示第 181 - 200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
181 2025-12-21
Lactate metabolism orchestrates immune dysregulation in renal cancer: A multi-omics and causal inference study
2025 Oct-Dec, Science progress IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过多组学分析和因果推断方法,探讨了乳酸代谢基因在肾细胞癌中的调控作用及其与免疫失调的关联 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析,识别出与肾癌风险相关的关键乳酸代谢基因,并通过组织芯片免疫荧光实验验证了基因表达 研究主要基于公共数据库数据,样本来源可能有限,且实验验证仅针对部分基因,需要进一步的功能性研究来确认机制 探究乳酸代谢基因在肾细胞癌进展中的作用,识别潜在的治疗靶点 肾细胞癌患者样本及相关基因表达数据 生物信息学 肾癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 组织芯片免疫荧光 CIBERSORT, GSEA, ssGSEA, RCTD, CellChat 基因表达数据, 空间转录组数据 基于GEO数据库的多项数据集(GSE242299, GSE102101, GSE175540),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
182 2025-12-19
Nanobody Immunolabelling and three-dimensional imaging reveals spatially restricted LYVE1 expression by kidney lymphatic vessels in mice
2025-Oct-13, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究利用纳米抗体免疫标记和三维成像技术,揭示了小鼠肾脏淋巴管中LYVE1表达的空间限制性特征 开发了针对LYVE1的纳米抗体,实现了对完整器官内淋巴管网络的更快速、更深层标记,克服了传统抗体渗透性不足的局限 研究主要聚焦于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证;纳米抗体的应用范围可能受限于特定标记物 开发新型淋巴管标记工具并研究肾脏淋巴管的特异性表达模式 小鼠肾脏、皮肤、心脏和肺部的淋巴管 数字病理学 NA 纳米抗体免疫标记、三维成像、单细胞RNA测序 NA 图像、转录组数据 小鼠器官样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
183 2025-12-16
Defects in the DNA Damage Response of Patient-derived Endometriosis Stromal Cells
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了子宫内膜异位症患者来源的基质细胞在DNA损伤反应中的缺陷 首次在患者来源的月经流出物基质细胞中揭示了子宫内膜异位症相关的DNA损伤反应缺陷,并发现其与MRN复合物下调相关 研究基于体外细胞系模型,可能无法完全反映体内情况;样本量未明确说明 研究子宫内膜异位症患者基质细胞的DNA损伤反应机制 患者来源的月经流出物基质细胞(来自健康捐赠者和子宫内膜异位症患者) 分子生物学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
184 2025-12-15
A Multi-omics Exploration Revealing SLIT2 as a Prime Therapeutic Target for Peripheral Facial Paralysis: Integrating Single-Cell Transcriptomics and Plasma Proteome Data
2025-Oct-16, Cellular and molecular neurobiology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化分析和单细胞转录组测序,探索了外周性面瘫的潜在治疗靶点,并首次在面神经损伤后检测到SLIT2的改变 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合,系统地从宏观遗传关联到微观细胞功能研究外周性面瘫,并首次在面神经损伤后检测到SLIT2的改变 研究主要基于动物模型,且动物与人类在面运动核方面存在显著差异 识别外周性面瘫的治疗靶点并理解其分子和细胞机制 外周性面瘫患者(通过公开血浆蛋白数据)及SD大鼠面神经损伤模型 单细胞组学 神经系统疾病(外周性面瘫) 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 免疫荧光分析 NA 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 1925个公开可用的血浆蛋白顺式遗传力工具;SD大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
185 2025-12-14
Principles of protein abundance regulation across single cells in a mammalian tissue
2025-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单细胞蛋白质合成与清除的系统量化,结合单细胞转录组学,揭示了哺乳动物组织中蛋白质丰度调控的组织原则 首次在复杂组织单细胞水平上定量分析蛋白质合成与清除的调控作用,发现翻译和蛋白质清除与细胞生长速率呈线性依赖关系 研究仅基于单一原代组织样本,样本多样性有限,且技术方法可能未覆盖所有蛋白质调控机制 探究哺乳动物组织中单细胞水平蛋白质丰度调控的分子机制与组织原则 来自原代组织的超过4,200个单细胞 单细胞组学 NA 单细胞转录组学、蛋白质合成与清除量化 NA 单细胞蛋白质与RNA数据 超过4,200个原代组织单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
186 2025-12-14
From genetic causality to druggable targets: A multiomics framework identifies ZSCAN16 in gout pathogenesis
2025 Oct-Dec, Science progress IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过多组学框架,结合孟德尔随机化、共定位分析、表型全基因组关联研究和单细胞RNA测序,系统性地识别并优先排序了痛风的新型可成药靶点,最终确定ZSCAN16为高潜力的治疗靶点 采用多层遗传和功能基因组学方法,首次系统性地从遗传因果性角度识别并验证痛风的潜在可成药靶点,特别是通过单细胞分析揭示了ZSCAN16在细胞毒性T/NK细胞中的特异性上调 研究主要基于遗传关联和计算分析,缺乏直接的体内或体外功能验证实验来证实靶点的生物学机制 系统性识别和优先排序痛风的新型、可成药靶点,以克服当前疗法效果不佳和药物开发中缺乏遗传验证靶点的问题 痛风患者(基于GWAS队列数据)及相关的候选基因 生物信息学与计算生物学 痛风 孟德尔随机化,共定位分析,表型全基因组关联研究,单细胞RNA测序,分子对接 NA 遗传关联数据,基因表达数据,单细胞转录组数据 基于两个独立的痛风GWAS队列(openGWAS和FinnGen) NA 单细胞RNA-seq NA NA
187 2025-12-13
A spatial transcriptomics dataset of the endometrium from repeated implantation failure patients
2025-Oct-29, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,首次构建了正常个体与反复种植失败患者子宫内膜组织的空间转录组图谱 首次构建了正常与反复种植失败条件下的子宫内膜空间转录组图谱,并识别出7个具有特定特征的细胞生态位 样本量较小(仅8个组织样本),且仅研究了黄体中期阶段 增强和深化对反复种植失败患者子宫内膜组织背景的理解 来自4名正常个体和4名反复种植失败患者的子宫内膜组织 空间转录组学 生殖系统疾病 空间转录组测序 NA 空间转录组数据 8个子宫内膜组织样本(4名正常个体,4名RIF患者) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium平台
188 2025-12-13
Benchmarking large-scale single-cell RNA-seq analysis
2025-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文对五种广泛使用的单细胞RNA测序分析框架进行了基准测试,评估了它们在可扩展性、效率和准确性方面的表现 首次系统性地比较了不同算法和基础设施选择对大规模单细胞RNA测序分析性能的影响,并提供了GPU加速和优化配置的实用指南 研究主要关注PCA步骤和聚类准确性,可能未全面覆盖所有分析步骤或更复杂的生物场景 评估大规模单细胞RNA测序数据分析的计算挑战和性能优化策略 五种单细胞RNA测序分析框架(Seurat、OSCA、scrapper、Scanpy和rapids_singlecell)及其算法实现 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 PCA、SVD算法(exact、ARPACK、IRLBA、randomized、Jacobi、incremental PCA) 单细胞RNA测序数据 包括一个130万小鼠脑细胞数据集和三个较小数据集(BE1、scMixology和cord blood CITE-seq) NA 单细胞RNA-seq, CITE-seq NA NA
189 2025-12-13
Adipocytes are dispensable in shaping the ovarian cancer tumor microenvironment in the omentum
2025-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过构建缺乏成熟脂肪细胞的小鼠模型,挑战了传统观点,揭示了网膜血管内皮细胞而非脂肪细胞在卵巢癌腹膜转移微环境中的关键作用 首次通过特异性敲除腹膜成熟脂肪细胞的模型,证明脂肪细胞对卵巢癌生长并非必需,并发现血管内皮细胞高表达FABP4是支持肿瘤代谢生长的关键因素 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;肿瘤微环境中其他细胞类型的相互作用尚未完全阐明 重新评估脂肪细胞在卵巢癌腹膜转移微环境中的作用机制 卵巢癌细胞(ID8p53Brca2、BPPNM、KPCA细胞系)、小鼠模型、人类单细胞RNA测序数据 肿瘤微环境研究 卵巢癌 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型 基因敲除动物模型 基因表达数据、动物实验数据 多种卵巢癌细胞系及基因工程小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
190 2025-12-13
Integrative and Emerging Models in Antibody Research: A Comprehensive Review
2025-Oct, Antibody therapeutics
综述 本文全面回顾了抗体研究中的整合与新兴模型,包括体内、体外和计算模型,并探讨了它们各自的优势、局限及整合应用 强调多模型整合以克服可重复性、免疫原性预测和可扩展性等现有挑战,并展望了CRISPR工程、单细胞测序等新兴技术如何重塑抗体发现 作为综述文章,未进行原创性实验研究,主要基于现有文献进行评述,可能未涵盖所有最新进展 评估抗体研究中的各类模型,推动下一代癌症、自身免疫性疾病和传染病疗法的开发 抗体研究模型,包括体内模型(如动物模型)、体外技术(如杂交瘤技术)和计算方法 机器学习 NA 单细胞测序、微流控、器官芯片、CRISPR工程 计算生物学与机器学习模型 NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
191 2025-12-12
Single-cell RNA-seq using UltraMarathonRT expands the known transcriptome
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究首次将II型内含子逆转录酶UltraMarathonRT应用于单细胞RNA测序,揭示了传统方法无法捕获的转录组特征 首次在单细胞RNA测序中使用II型内含子逆转录酶uMRT,相比传统鼠白血病病毒来源的逆转录酶,能够捕获更多基因和基因组特征 NA 开发新型逆转录酶技术以提升单细胞转录组测序的覆盖度和准确性 单细胞转录组 单细胞测序技术 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、代谢RNA标记、核苷转换 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
192 2025-12-11
Emergence of endothelial subtypes and role of cell cycle control in arterial-venous specification during embryonic vascular development
2025-Oct-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和Fucci胚胎模型,揭示了细胞周期控制在胚胎血管发育早期动静脉分化中的关键作用 首次在胚胎发育早期(血流出现前后)系统揭示内皮细胞亚型出现与细胞周期状态的关联,并证明细胞周期抑制剂p27在动静脉分化中的关键调控作用 研究主要聚焦于小鼠胚胎早期发育阶段(E8.0-E9.5),后期发育阶段和其他物种的验证仍需进一步探索 探究细胞周期控制在胚胎血管发育过程中动静脉分化中的作用机制 小鼠胚胎内皮细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,Fucci荧光报告系统,成像分析 NA RNA测序数据,成像数据 E8.0、E8.5、E9.5三个时间点的胚胎内皮细胞 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
193 2025-12-11
Transcriptome Analysis Identified SPP1-Positive Monocytes as a Key in Extracellular Matrix Formation in Thrombi
2025-Oct-07, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过转录组分析发现SPP1阳性单核细胞在血栓细胞外基质形成中起关键作用 首次通过单细胞RNA测序识别出SPP1高表达的单核细胞/巨噬细胞亚群,并揭示其在血栓成熟过程中的核心作用 样本量较小(3个血栓用于RNA表达比较),且主要基于脑血栓和肺动脉血栓数据,可能不适用于所有血栓类型 探究血栓成熟的详细机制,特别是细胞外基质形成的关键因素 人类血栓样本(来自脑血管和肺动脉) 数字病理学 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 NA RNA表达数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 3个血栓用于RNA表达比较,66个血栓用于免疫组织化学验证 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
194 2025-12-11
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转变及蚊虫-寄生虫相互作用机制 首次结合单细胞RNA测序与共聚焦显微镜技术,系统解析了疟原虫在蚊媒中肠内的发育轨迹和细胞互作网络,并发现转录因子SIP2对子孢子感染人肝细胞的关键作用 研究主要基于实验室培养的蚊虫-寄生虫体系,虽验证了部分野外来源寄生虫,但自然条件下的复杂互作机制仍需进一步探索 阐明疟原虫在按蚊体内的发育生物学机制及蚊虫-寄生虫相互作用 恶性疟原虫与按蚊的相互作用体系 单细胞生物学 疟疾 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,功能分析 NA 单细胞转录组数据,显微成像数据 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊虫细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
195 2025-12-11
The immune landscape of pediatric (extra)cranial solid tumors: A systematic review and integration of immunohistochemistry and single-cell RNA sequencing data
2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
系统综述 本文通过整合免疫组化和单细胞RNA测序数据,系统性地综述了儿童(颅)外实体瘤的免疫微环境特征 首次系统性地整合了免疫组化和单细胞/单核RNA测序数据,对儿童实体瘤的免疫景观进行了全面分析,并创建了公开可用的交互式热图图谱 纳入研究的方法学存在异质性,且部分肿瘤类型的数据仅来自单一技术 阐明儿童(颅)外实体瘤的独特免疫微环境,以指导针对儿童癌症的免疫治疗策略的开发与选择 儿童脑肿瘤和颅外实体瘤 数字病理学 儿童实体瘤 免疫组化,单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA 图像,测序数据 共73项研究,包含2187个肿瘤样本(IHC)和272个肿瘤样本(sc/snSeq) NA 单细胞RNA-seq NA NA
196 2025-12-10
Computer Vision Methods for Spatial Transcriptomics: A Survey
2025-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
综述 本文首次系统性地综述了计算机视觉AI模型在空间转录组学分析中的应用,涵盖架构、学习范式、任务和数据集,并追踪其技术演变 首次系统性地综述计算机视觉方法在空间转录组学中的应用,强调其超越传统生物信息学、整合形态学与分子状态、以及解决ST技术限制(如高成本、临床适用性有限、2D分析限制)的新视角 作为一篇综述文章,未直接进行实验研究,因此不涉及具体模型或数据的局限性;但文中讨论了ST技术本身的限制(如高成本、2D分析) 综述计算机视觉AI模型在空间转录组学分析中的应用,探索其如何利用组织学图像增强空间转录组数据分析,并推动基础研究和临床实践 空间转录组学数据及相关计算机视觉AI模型 计算机视觉 NA 空间转录组学 NA 图像(组织学图像)和空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
197 2025-12-09
A Single-Cell Atlas of Transcriptional and Immunoglobulin Repertoire Evolution in Early B Cell Development
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,深入分析了早期B细胞发育过程中的转录组和免疫球蛋白库演化,揭示了重组事件后的增殖爆发和库特征变化 首次在单细胞水平上对早期B细胞发育进行深度转录组和免疫球蛋白库分析,发现了前B细胞阶段BCR重组后未描述的增殖爆发现象 研究仅基于六名健康供体,样本量相对有限,且未涵盖疾病状态或更广泛的个体差异 探究早期B细胞发育中转录组和免疫球蛋白库的演化规律,理解成熟免疫库多样性的形成基础 人类骨髓中的B细胞,包括从祖细胞到成熟B细胞的不同发育亚群 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 65,110个B细胞,来自六名健康供体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
198 2025-12-09
Spatiotemporal dynamics of neuron differentiation and migration in the developing human spinal cord
2025-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序和原位测序技术,揭示了人类和小鼠脊髓发育过程中神经元分化和迁移的时空动态与调控机制 首次在人类脊髓发育的早期阶段(Carnegie Stages 16-21)系统描绘了神经元分化和迁移的时空动态,并识别了跨物种保守的关键转录因子 研究主要聚焦于胚胎发育的特定阶段(CS16-21/E8.0-11.5),未涵盖更晚期的发育或成熟过程 探究人类脊髓发育过程中神经元亚型特化和迁移的分子机制 人类和小鼠胚胎脊髓组织 单细胞组学 神经系统发育 单细胞转录组测序, 原位测序, 空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据 人类脊髓样本(CS16-21阶段)和小鼠脊髓样本(E8.0-11.5阶段) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
199 2025-12-08
FLT3LG as an inflammatory hub bridging tumor immune surveillance to therapy response in breast cancer
2025-Oct-29, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和炎症基因网络分析,发现FLT3LG作为乳腺癌中关键的炎症枢纽,连接肿瘤免疫监视与治疗反应,并评估其作为预后和治疗靶点的潜力 首次基于单细胞RNA测序和炎症基因网络分析,将FLT3LG识别为乳腺癌中连接免疫监视与治疗反应的关键炎症枢纽,并揭示其与特定基因突变模式(如PIK3CA和TP53)及免疫检查点抑制剂反应的关联 研究主要基于相关性分析,缺乏直接的体内或体外功能验证实验来证实FLT3LG的因果作用机制 探索乳腺癌中炎症驱动的免疫失调机制,并寻找新的预后标志物和治疗靶点 乳腺癌患者队列及其肿瘤组织样本 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,基因网络分析 NA RNA测序数据,基因表达数据 多个患者队列(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
200 2025-12-08
Positionally distinct interferon-stimulated dermal immune-acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet syndrome
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了Sweet综合征皮肤中干扰素激活的成纤维细胞在促进中性粒细胞招募中的关键作用 首次在Sweet综合征中识别出位置不同的干扰素激活成纤维细胞亚群,并阐明其通过I型干扰素识别和趋化因子表达驱动中性粒细胞浸润的机制 研究基于存档临床样本,样本量有限;功能验证主要在体外细胞培养中进行,缺乏体内模型验证 阐明Sweet综合征的细胞和分子景观,特别是中性粒细胞浸润的机制 Sweet综合征、坏疽性脓皮症患者及健康对照的皮肤样本 数字病理学 皮肤疾病 单细胞转录组学、空间转录组学、bulk RNA-seq NA 转录组数据、空间定位数据 存档临床皮肤样本(Sweet综合征、坏疽性脓皮症患者及健康对照) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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