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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-11-15 |
Intratumoral SPP1+BCL2A1+ Tumor-Associated Macrophages Predict Poor Response to PD1 Blockade
2025-Oct-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15212680
PMID:41225975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现SPP1+BCL2A1+肿瘤相关巨噬细胞是预测肝细胞癌患者PD1阻断治疗反应不良的新型生物标志物 | 首次鉴定出SPP1和BCL2A1双阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群,并证实其与免疫检查点抑制剂治疗反应不良相关 | 样本量相对较小,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索肝细胞癌免疫治疗反应的预测生物标志物 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 发现队列10例,ICB队列4例,验证队列18例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-11-16 |
Visceral Peritoneum Hyperpigmentation in Chickens Is Associated with DCT Expression
2025-Oct-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15213076
PMID:41227407
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研究论文 | 本研究探讨了鸡内脏腹膜色素沉着过度(HVP)的遗传基础及其调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定HVP相关黑色素细胞群体,发现DCT基因在HVP中过度表达并确定其多态性可作为遗传选择标记 | 研究样本量有限,功能验证实验主要在细胞水平进行,需要进一步体内验证 | 阐明鸡内脏腹膜色素沉着异常的遗传原因和分子机制 | 鸡内脏腹膜组织和黑色素细胞 | 生物信息学 | 色素沉着异常 | HPLC, bulk RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 超过9700个高质量单细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-11-16 |
Identification of two distinct uveal melanoma subtypes based on the immune cell infiltration of the primary tumour
2025-Oct-23, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04198-7
PMID:41128887
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研究论文 | 本研究基于原发性葡萄膜黑色素瘤的免疫细胞浸润特征,识别出两种不同的肿瘤亚型 | 首次在单细胞水平揭示葡萄膜黑色素瘤的免疫异质性,发现具有特定染色体变异和信号通路活性的侵袭性黑色素细胞亚群 | 样本量有限(8例肿瘤活检),仅使用二次数据分析 | 表征葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的细胞组成和免疫特征 | 原发性葡萄膜黑色素瘤肿瘤样本 | 单细胞组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | 8例原发性葡萄膜黑色素瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-11-16 |
High-resolution spatial mapping of cell state and lineage dynamics in vivo with PEtracer
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx3800
PMID:40705858
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研究论文 | 开发了一种基于基因编辑的空间谱系追踪技术PEtracer,用于在体研究细胞状态和谱系动态 | 首次将基因编辑技术与空间转录组分析结合,实现高分辨率空间映射的细胞谱系追踪 | NA | 研究发育和疾病过程中细胞命运决定的时空动态 | 小鼠肿瘤转移模型中的细胞 | 空间生物学 | 肿瘤转移 | 基因编辑, 空间转录组 | NA | 空间转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组, 多模态成像 | NA | MERFISH空间转录组分析 |
| 185 | 2025-11-16 |
Mapping early human blood cell differentiation using single-cell proteomics and transcriptomics
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr8785
PMID:40839704
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞蛋白质组学和转录组学技术,绘制了人类早期血细胞分化图谱 | 首次将单细胞质谱蛋白质组学与单细胞RNA测序整合,揭示了mRNA无法反映的干细胞功能相关蛋白质,并建立了推断细胞分化进程的翻译动态模型 | 研究仅针对CD34+造血干细胞和祖细胞,样本类型相对有限 | 解析人类早期血细胞分化过程中的分子机制 | 人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | 单细胞多组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞质谱蛋白质组学 | 翻译动态模型 | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 超过2500个人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 186 | 2025-11-16 |
Tumor-draining lymph nodes respond to immune checkpoint inhibition and orchestrate tumor immune remodeling
2025-Oct-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04187-w
PMID:41051631
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 首次通过单细胞测序技术系统阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的具体作用机制,发现其作为肿瘤特异性T细胞的来源地 | 研究样本仅限于结直肠癌患者,需要进一步验证在其他癌症类型中的普适性 | 阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的响应机制及其对肿瘤微环境的调控作用 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 187 | 2025-11-15 |
Niche environment remodeling promotes long-term endometrium stromal stem cell engraftment and tissue regeneration in thin endometrium
2025-Oct-31, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.053
PMID:41176621
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研究论文 | 通过改造干细胞微环境提高子宫内膜基质干细胞移植效率并促进薄型子宫内膜组织再生 | 提出通过免疫抑制和血管重建双重策略改造干细胞微环境,显著提高子宫内膜基质干细胞移植存活率 | 研究主要基于大鼠模型,人类临床应用效果需进一步验证 | 开发治疗薄型子宫内膜的新型干细胞疗法 | 大鼠薄型子宫内膜模型和人类子宫内膜基质干细胞 | 再生医学 | 子宫内膜疾病 | 单细胞RNA测序,mRNA工程,异种移植模型 | 动物模型 | 基因表达数据,病理数据 | 大鼠模型和人类干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2025-11-15 |
YTHDF1 regulates YTHDF2 stability via m6A-dependent mechanisms in hepatocellular carcinoma: insights from in vitro, in vivo, and multi-cohort clinical studies
2025-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-2025-363
PMID:41220748
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研究论文 | 本研究揭示YTHDF1通过m6A依赖性机制调控YTHDF2稳定性促进肝细胞癌进展 | 首次发现YTHDF1通过m6A依赖性方式增强YTHDF2的mRNA稳定性和翻译效率,并揭示两者在肝细胞癌中的空间共表达模式 | 未明确说明样本规模和研究人群的详细特征 | 探索YTHDF同源蛋白在肝细胞癌中的调控网络和临床相关性 | 肝细胞癌组织、YTHDF蛋白家族 | 分子生物学 | 肝细胞癌 | 免疫组织化学、空间转录组学、Western blot、实时定量PCR、RNA免疫沉淀、e-CLIP测序、双荧光报告基因检测、RNA稳定性实验 | NA | 蛋白质表达数据、RNA表达数据、空间转录组数据、临床预后数据 | 两个临床队列的肝细胞癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 189 | 2025-11-15 |
Single-cell spatial transcriptomics reveal intraglomerular cell activation and ligand-receptor relationships in chronic, active antibody mediated rejection
2025-Oct-29, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.042
PMID:41173191
|
研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术揭示了慢性活动性抗体介导排斥反应中肾小球内细胞激活状态和配体-受体关系 | 首次在单细胞分辨率下通过空间转录组学技术揭示CAMR中肾小球内细胞特异性激活状态和空间分子相互作用机制 | 样本量相对有限,且仅针对肾脏活检组织进行分析 | 探究慢性活动性抗体介导排斥反应的分子机制和细胞间相互作用 | 肾脏移植活检组织中的肾小球内皮细胞、自然杀伤细胞和巨噬细胞 | 空间转录组学 | 肾脏移植排斥反应 | 空间转录组学,单细胞RNA分析 | 细胞分型、聚类分析、降维分析、差异基因表达分析 | 空间转录组数据,基因表达数据 | CAMR患者和对照组的肾脏活检组织 | Nanostring | 单细胞空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪用于福尔马林固定石蜡包埋肾脏活检组织的单细胞分辨率空间转录组分析 |
| 190 | 2025-11-15 |
Focal Adhesion Kinase-Dependent Reprogramming of IFN-γ Signaling through PYK2 Coinhibition Sensitizes Melanoma to Immune Checkpoint Blockade
2025-Oct-14, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.09.376
PMID:41101630
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研究论文 | 本研究揭示了黏着斑激酶(FAK)及其同源物PYK2在IFN-γ介导的免疫检查点阻断耐药中的不同作用机制 | 首次阐明FAK作为主要支架蛋白、PYK2作为辅助因子在IFN-γ信号通路中的协同作用,并提出联合抑制策略可增强免疫治疗效果 | 研究主要基于临床前模型,需进一步临床验证;PYK2抑制的最佳程度尚未完全确定 | 探索克服黑色素瘤免疫检查点阻断耐药的新策略 | 黑色素瘤细胞、小鼠模型、临床患者样本 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 无标记磷酸化蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA皮肤黑色素瘤队列、GSE91061临床数据集、抗PD-1耐药小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-11-15 |
Single-cell clonal lineage tracing identifies the transcriptional program controlling the cell-fate decisions by neoantigen-specific CD8+ T cells
2025-Oct-13, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0203
PMID:41081433
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研究论文 | 通过单细胞克隆谱系追踪揭示新抗原特异性CD8+ T细胞命运决定的转录调控程序 | 首次结合单细胞转录组和T细胞受体谱分析,系统描绘了新抗原特异性CD8+ T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆扩增与分化轨迹 | 研究基于小鼠前列腺癌模型,人类临床样本验证有限 | 解析新抗原特异性CD8+ T细胞命运决定的转录调控机制 | 小鼠前列腺癌模型中的新抗原特异性CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序, T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-11-15 |
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09313-3
PMID:40702188
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研究论文 | 开发了一种多组学单细胞测序方法,用于精确识别CRISPR编辑的疾病变异效应 | 结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模态单细胞功能基因组学方法 | 未明确说明样本量限制或技术适用范围 | 识别疾病相关非编码等位基因的功能后果并确定因果变异 | 人类T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因 | 功能基因组学 | 自身免疫疾病 | CRISPR-Cas编辑, 多组学单细胞测序 | NA | 基因组DNA, 转录组, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 193 | 2025-11-15 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identified TIMP1 as a Prognostic Marker in Colorectal Cancer
2025-Oct, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e38
PMID:41220845
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建结直肠癌免疫预后模型并鉴定TIMP1作为预后标志物 | 首次结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建结直肠癌免疫预后模型,并实验验证TIMP1的生物学功能 | NA | 解析结直肠癌免疫异质性并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,差异表达分析,功能富集分析,随机森林分析,LASSO方法 | 随机森林,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-11-15 |
[RNA Sequencing Reveals Molecular Alternations of Splenocytes Associated with Anti-FⅧ Immune Response in Hemophilia A Murine Model]
2025-Oct, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
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研究论文 | 通过RNA测序技术研究血友病A小鼠模型中与抗FⅧ免疫反应相关的脾细胞分子变化 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术系统分析血友病A小鼠抗FⅧ免疫反应的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究血友病A中抗FⅧ免疫反应的分子机制 | 血友病A小鼠模型的脾细胞 | 生物信息学 | 血友病A | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 血友病A小鼠模型 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | CASAVA碱基识别技术 |
| 195 | 2025-11-15 |
[Research Progress of Epigenetic Modification in Hematopoietic Stem Cell Functional Regulation--Review]
2025-Oct, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
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综述 | 本文综述了表观遗传修饰在造血干细胞发育、功能调控和扩增中的研究进展 | 整合了单细胞测序、空间转录组和追踪技术等新兴技术对造血干细胞表观遗传调控机制的最新研究成果 | NA | 探讨表观遗传修饰在造血干细胞功能调控中的作用机制 | 造血干细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞测序技术, 空间转录组技术, 追踪技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 196 | 2025-11-14 |
Collection of Human Follicular Fluid, Follicle Somatic Cells, and Immature Oocytes from Individuals Undergoing In Vitro Fertilization
2025-Oct-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69122
PMID:41212768
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研究论文 | 本文提出了一种从接受体外受精个体中系统收集和处理卵泡内容物的标准化方案 | 开发了无需酶解剥离的卵丘细胞分离方法,保持转录组完整性;建立了从新鲜卵泡液中制备单细胞悬液用于单细胞RNA测序的逐步方案 | NA | 利用废弃的生殖组织进行人类生育力和生殖生物学的转化研究 | 人类卵巢卵泡内容物,包括卵泡液、卵母细胞、卵丘细胞和体细胞 | 生殖生物学 | 生育障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),体外成熟培养 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-11-14 |
Exploring Sex Differences in Type 2 Diabetes via a Male-Dominant Beta-Cell Cluster from Single-Cell Pancreatic Sequencing of Public Datasets
2025-Oct, Endocrinology and metabolism (Seoul, Korea)
DOI:10.3803/EnM.2025.2297
PMID:40389209
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研究论文 | 通过分析公共单细胞数据集发现男性主导的β细胞簇,揭示2型糖尿病性别差异的分子机制 | 首次在2型糖尿病患者中鉴定出男性主导的β细胞亚群,该亚群具有独特的基因表达模式和细胞通讯特征 | 基于公共数据集进行二次分析,样本来源和数量受原始数据限制 | 探索2型糖尿病性别差异的分子基础 | 2型糖尿病患者的胰腺β细胞 | 单细胞基因组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,轨迹推断,差异基因表达分析,基因集富集分析,细胞通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | 来自四个公共数据集的2型糖尿病患者胰腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 198 | 2025-11-14 |
Expression of marker genes to assess the spermatogenic capacity in patients with idiopathic non-obstructive azoospermia
2025-Oct, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03584-5
PMID:40681857
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞RNA测序的定量方法,用于评估特发性非梗阻性无精子症患者的睾丸生精能力 | 利用单细胞RNA测序技术开发了生精能力评分系统,并鉴定了与生精潜能相关的关键基因标记物 | 样本量相对较小(18名iNOA患者),需要在更大群体中进一步验证 | 开发评估特发性非梗阻性无精子症患者睾丸生精能力的可靠定量方法 | 特发性非梗阻性无精子症患者 | 单细胞测序分析 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 模糊聚类, 基因表达趋势分析 | 单细胞基因表达数据 | 18名iNOA患者,近4000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2025-11-13 |
Stress-NRF2 response axis polarizes tumor macrophages and undermines immunotherapy
2025-Oct-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013063
PMID:41176316
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研究论文 | 本研究揭示了NRF2转录因子在肿瘤相关巨噬细胞极化为免疫抑制状态中的关键作用及其对免疫疗法的负面影响 | 首次发现NRF2激活梯度将肿瘤相关巨噬细胞分为促炎CXCL9+和抗炎SPP1+亚群,并证明其通过沉默IFN-STAT1通路导致免疫抑制 | 研究主要基于小鼠模型,人类癌症中的验证仍需进一步临床研究 | 探索NRF2在肿瘤相关巨噬细胞极化中的作用及其对免疫疗法疗效的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞、MC38结肠肿瘤模型、MMTV-PyMT乳腺肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌、乳腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、三维细胞培养、体内肿瘤模型 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠肿瘤模型及人类癌症样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-11-13 |
Clonally expanded effector CD4+ cytotoxic T lymphocytes are associated with severe neurological adverse events after immune checkpoint inhibitor therapy
2025-Oct-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012350
PMID:41167637
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组学分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗后神经系统不良事件与克隆扩增的CD4+细胞毒性T淋巴细胞之间的关联 | 首次在单细胞水平上揭示了n-irAEs患者体内存在特异性克隆扩增的CD4+CTLs,并发现其表达与神经炎症相关的效应基因谱 | 样本量较小(仅17例患者),且仅分析了外周血细胞而未直接研究中枢神经系统 | 探究免疫检查点抑制剂治疗诱发神经系统不良事件的免疫学机制和风险因素 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者,包括8例急性神经毒性患者 | 单细胞基因组学 | 癌症治疗相关神经系统并发症 | 单细胞RNA测序,T细胞受体谱分析 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 17例癌症患者(8例n-irAEs患者),共186,435个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |