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当前共找到 589 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-02-12
Divergence between neural and retinal lineage specification during human brain development by signal transduction
2025-Oct-22, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究利用基因工程人类胚胎干细胞衍生的脑类器官,探讨了p70 S6激酶1(S6K1)在人类大脑发育中的作用 首次在人类脑类器官模型中揭示S6K1信号通路在神经元与视网膜谱系分化中的精细调控作用,并区分了细胞自主与非自主功能 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内大脑发育的复杂性 阐明S6K1在人类大脑发育过程中的功能机制 S6K1缺失的人类胚胎干细胞衍生的背侧前脑类器官 发育生物学 NA 单细胞RNA测序,ATAC测序 脑类器官模型 基因表达数据,染色质可及性数据 早期(5周)和晚期(14周)阶段的脑类器官 NA 单细胞RNA-seq,ATAC-seq NA NA
2 2026-02-12
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Oct-07, Research square
研究论文 本文介绍了一种名为VISTA的新方法,用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平 VISTA结合变分推理和几何深度学习,联合建模单细胞RNA-seq数据和空间转录组学数据,并引入不确定性量化,以解决空间转录组学技术中基因数量有限的问题 NA 旨在通过预测未观测基因的表达,增强空间转录组学数据的分析能力,以更好地理解空间诱导的细胞状态和特征 空间转录组学数据和单细胞RNA-seq数据 空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 变分推理, 几何深度学习 基因表达数据 四个空间转录组学数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3 2026-02-11
The NEAT1/miR-124-3p/CCL2 axis in chronic kidney disease progression: integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2025-Oct, Epigenomics IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,揭示了NEAT1/miR-124-3p/CCL2轴在慢性肾病进展中的关键调控作用 首次构建并验证了NEAT1/miR-124-3p/CCL2这一ceRNA调控轴在慢性肾病进展中的作用机制 生物信息学和临床队列的样本量有限 识别慢性肾病的新型诊断生物标志物和治疗靶点 慢性肾病患者、健康对照者、TCMK1细胞系 生物信息学 慢性肾病 单细胞测序、双荧光素酶报告基因检测、生物信息学分析 NA 基因表达数据、临床样本数据 64名慢性肾病患者和20名健康对照者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-02-10
Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels
2025-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组和染色质可及性测序,揭示了十三纹地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的调控机制 发现了视锥细胞不仅来源于早期神经祖细胞,还来源于晚期神经祖细胞,这种延长生成期由转录因子表达的异时性转变驱动 未明确说明样本数量,且机制验证主要在基因表达层面,缺乏更深入的体内功能验证 探究地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的分子调控机制 十三纹地松鼠的视网膜发育过程 发育生物学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
5 2026-02-07
Accumulation of Lymphoid Progenitors with Defective B Cell Differentiation and of Putative Natural Killer Progenitors in Aging Human Bone Marrow
2025-Oct-28, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了人类骨髓中淋巴祖细胞在衰老过程中积累缺陷性B细胞分化和记忆样自然杀伤祖细胞的新特征 首次发现衰老人类骨髓中淋巴轨迹下游积累了一个独特细胞群,该群细胞包含B细胞分化标记缺陷的细胞以及具有记忆样自然杀伤祖细胞转录组特征的细胞 样本量较小(15名健康受试者),年龄范围较宽(19-74岁),且仅限于骨髓样本分析 探究人类骨髓造血干细胞和祖细胞在衰老过程中的变化,特别是淋巴分化轨迹的年龄相关差异 人类骨髓中的造血干细胞和祖细胞(HSPCs,CD34阳性) 单细胞转录组学 衰老相关疾病 单细胞RNA测序,功能转录组分析,发育轨迹研究 NA 单细胞RNA测序数据 15名健康人类受试者的骨髓样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-02-05
Systematic correlation analysis of human CD molecules reveals upregulated co-expression of CD58, CD63, and CD147 in patients with primary Sjögren's syndrome
2025-Oct-14, Immunologic research IF:3.3Q3
研究论文 本研究通过生物信息学方法系统分析了人类CD分子在免疫细胞中的表达相关性,并在原发性干燥综合征患者中验证了CD58、CD63和CD147在T细胞中的共表达上调 首次系统性地研究了386个蛋白编码CD分子在多种免疫细胞中的共表达和互斥表达模式,并验证了Pearson和Spearman相关性分析仅适用于共表达分析,而不适用于互斥表达分析 研究主要基于RNA测序数据,蛋白质水平的验证仅限于少数CD分子;样本量未在摘要中明确说明 揭示免疫细胞表型库的共表型和丢失表型,探索CD分子共表达与原发性干燥综合征的关联 人类CD4 T细胞、CD8 T细胞、B细胞、NK细胞和单核细胞 生物信息学 原发性干燥综合征 生物信息学分析、流式细胞术 相关性分析网络 RNA测序数据、流式细胞术数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
7 2026-02-03
A molecular, spatial and regulatory atlas of the Hydra vulgaris nervous system
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术,对Hydra vulgaris神经系统进行了全面的分子和空间图谱绘制 首次提供了Hydra vulgaris神经系统最全面的分子和空间特征,识别了8种神经元类型和15种转录亚型,并整合了基因调控网络分析 研究主要基于单细胞测序数据,可能未完全覆盖所有神经元功能或动态变化 揭示Hydra vulgaris神经系统的发育、稳态、再生和功能的分子机制 Hydra vulgaris的神经系统 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, ATAC-seq NA 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
8 2026-02-03
Multi-scaled transcriptomics of chronically inflamed nasal epithelium reveals immune-epithelial dynamics and tissue remodeling in nasal polyp formation
2025-Oct-14, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了慢性鼻窦炎中免疫细胞与上皮细胞之间的相互作用及组织重塑机制,特别是在鼻息肉形成过程中的作用 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统解析了慢性鼻窦炎中免疫-上皮细胞互作网络,并识别了与鼻息肉形成相关的基底细胞轨迹 研究主要基于人类组织样本,可能受样本异质性影响,且机制验证仍需进一步功能实验 探究慢性鼻窦炎的病理生理机制,特别是免疫-上皮细胞相互作用在疾病进展和组织重塑中的作用 慢性鼻窦炎患者(伴或不伴鼻息肉)及对照个体的鼻窦组织 数字病理学 慢性鼻窦炎 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 超过100名慢性鼻窦炎患者及对照个体的组织样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
9 2026-02-02
GZMK+CD8+ T cells target a specific acinar cell type in Sjögren's disease
2025-Oct-28, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞和空间转录组学技术,揭示了干燥综合征中特定腺泡细胞的选择性丢失和GZMK+CD8+ T细胞的增加,并阐明了其通过亚细胞毒性效应机制导致上皮损伤的病理过程 首次识别了PRR4⁺CST3⁺WFDC2⁻浆粘液腺泡细胞群在干燥综合征中的选择性丢失,并揭示了GZMK⁺CD8⁺ T细胞通过非经典细胞毒性机制(损害线粒体完整性、激活先天免疫信号)驱动疾病的新机制 研究主要基于人类小唾液腺样本,可能无法完全代表其他外分泌腺(如泪腺)的病理变化;体外共培养实验虽能验证机制,但与体内复杂微环境存在差异 探究干燥综合征中唾液腺细胞类型的复杂相互作用及其在疾病病理中的作用 人类小唾液腺组织、患者来源的原代上皮细胞和自体T细胞 数字病理学 干燥综合征 单细胞转录组学、空间转录组学、空间免疫表型分析、体外细胞共培养 NA 转录组数据、空间多组学数据、蛋白质组数据 干燥综合征患者及非干燥综合征对照的人类小唾液腺样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
10 2026-02-02
Reversal of tumour immune evasion via enhanced MHC-Class-I antigen presentation by a dual-functional RNA regulated system
2025-Oct-14, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于RNA的双功能调控系统,通过增强肿瘤细胞MHC-I类抗原呈递来逆转免疫逃逸,用于肝细胞癌的免疫治疗 设计了一种同时递送靶向PCSK9的siRNA和编码肿瘤抗原mRNA的氟化脂质纳米颗粒(h-LNP),该系统能特异性靶向肝脏,并通过抑制PCSK9来阻止MHC-I降解,从而将抗原呈递效率提升高达6倍 研究主要在临床前动物模型中进行,其人体安全性和有效性尚需进一步临床验证 开发一种新型免疫治疗策略,以克服肝细胞癌中因MHC-I下调导致的免疫逃逸 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞、肿瘤微环境(TME)中的免疫细胞 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、小干扰RNA(siRNA)、mRNA技术 NA 基因表达数据、单细胞测序数据 一组肝细胞癌患者的肿瘤和癌旁组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-01-30
Ectopic Expression of MUC5B in the Respiratory Bronchiole Initiates Endoplasmic Reticulum Stress in the IPF Lung
2025-Oct-15, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,探讨了MUC5B在特发性肺纤维化(IPF)发病机制中的作用,特别是其异位表达如何引发内质网应激 首次通过空间转录组学揭示了MUC5B在呼吸性细支气管中的异位表达与内质网应激的直接关联,并验证了其在IPF肺组织中的共表达模式 样本量相对有限(15例IPF和13例对照),且依赖于特定平台(CosMx),可能影响结果的普遍性 深入理解MUC5B驱动的肺纤维化发病机制,特别是其在IPF中的作用 特发性肺纤维化(IPF)患者和未受影响对照者的肺组织样本 空间转录组学 特发性肺纤维化 空间转录组学 半监督聚类 空间转录组数据 15例IPF患者和13例对照者的肺组织,共捕获43个视野 NA 空间转录组学 CosMx平台 NA
12 2026-01-30
GSTA1 Conferred Tolerance to Osimertinib and Provided Strategies to Overcome Drug-Tolerant Persister in EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma
2025-Oct-10, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了接受奥希替尼治疗的肺腺癌患者样本,揭示了GSTA1在药物耐受持久性细胞形成中的作用,并提出了联合GSTA1抑制剂克服耐药的新策略 首次发现RSPH1调控的GSTA1上调促进奥希替尼降解,并阐明RSPH1+ DTP细胞通过PROS1-AXL信号与巨噬细胞相互作用形成免疫抑制微环境 研究样本量有限,且临床前模型结果需进一步在临床试验中验证 探究EGFR突变肺腺癌中奥希替尼诱导的药物耐受持久性细胞形成机制,并开发克服耐药的治疗策略 接受一线奥希替尼治疗的肺腺癌患者样本(包括基线、DTP和稳定耐药状态)及对应的体外/体内模型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 未明确具体样本数量,但包含患者样本队列及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
13 2026-01-30
Single-cell analysis of Barrett's esophagus and carcinoma reveals cell types conferring risk via genetic predisposition
2025-Oct-08, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析Barrett食管和食管腺癌,结合全基因组关联数据,揭示细胞类型特异性遗传风险及参与疾病发展的细胞过程 首次整合单细胞转录组数据与全基因组关联分析,识别Barrett食管和食管腺癌发展中的关键细胞类型及细胞过程,特别是肠化生细胞和柱状细胞分化过程 未明确提及样本量限制或技术验证细节,可能需进一步实验验证细胞类型特异性机制 确定Barrett食管和食管腺癌发展中涉及的细胞类型及其遗传风险,探索疾病预测的生物标志物 Barrett食管、食管腺癌及配对正常组织样本 数字病理学 食管腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-01-30
Sensitive dissection of a genomic regulatory landscape using bulk and targeted single-cell activation
2025-Oct-08, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究开发了TESLA-seq技术,结合CRISPRa筛选与靶向单细胞RNA测序,用于高灵敏度解析PHOX2B基因座附近的增强子及其靶基因调控网络 开发了TESLA-seq新技术,首次将CRISPRa筛选与靶向单细胞RNA测序结合,实现了对数百个增强子与所有基因位点关系的并行检测 研究主要聚焦于PHOX2B基因座,可能未涵盖更广泛的基因组区域;实验系统可能无法完全模拟体内环境 识别和功能扰动内源性增强子,解析基因调控网络 PHOX2B基因座附近的增强子(CaREs)及其靶基因 基因组学 神经母细胞瘤 CRISPR激活筛选,靶向单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-01-30
Integrated Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveals Poor Prognostic Ligand-Receptor Pairs in Glioblastoma
2025-Oct-01, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学,揭示了胶质母细胞瘤中与不良预后相关的配体-受体对及其在肿瘤组织内的空间定位 首次结合单细胞和空间转录组学数据,全面评估胶质母细胞瘤中的细胞间相互作用,并识别出与细胞外基质相关、影响预后的特定配体-受体对 这些配体-受体对的临床重要性仍需进一步研究 识别胶质母细胞瘤中的预后相关配体-受体对及其在肿瘤内的空间定位 胶质母细胞瘤细胞及其与微环境细胞的相互作用 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据 40,958个细胞来自单细胞RNA测序数据集,以及三个独立的胶质母细胞瘤队列用于空间转录组分析 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
16 2026-01-29
Multi-Omics Dissection of TIMP1 in Monocytes/Macrophages Reveals Pathogenic Mechanisms and Therapeutic Opportunities in Ankylosing Spondylitis
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合蛋白质组学、miRNA分析和单细胞测序数据,揭示了TIMP1在单核/巨噬细胞中下调通过RHOA途径促进强直性脊柱炎发病的机制,并筛选出多种潜在治疗化合物 首次通过多组学整合分析系统阐明TIMP1在AS单核/巨噬细胞中的表达调控网络及下游RHOA信号通路机制,并筛选出包括传统中药成分在内的多种靶向TIMP1的潜在治疗化合物 研究主要基于生物信息学分析和体外模型验证,缺乏在体动物模型或临床样本中的功能验证实验 阐明强直性脊柱炎的发病机制并探索潜在治疗靶点 强直性脊柱炎患者样本(推测)及慢性炎症模型中的椎旁韧带肌肉组织 生物信息学 强直性脊柱炎 蛋白质组学, miRNA分析, 单细胞测序, qPCR NA 蛋白质组数据, miRNA表达数据, 单细胞转录组数据, qPCR数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-01-29
Comprehensive Analysis of Epigenetic Signatures in Non-Small Cell Lung Cancer: Development and Validation of an Epigenetics-Based Prognostic Model for Drug Sensitivity Prediction
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,开发并验证了一个基于表观遗传特征的NSCLC预后模型,用于预测药物敏感性 首次系统整合单细胞RNA测序与批量转录组数据,构建基于表观遗传特征的预后模型,并实验验证了关键基因LYPD3的致癌功能 样本量相对有限,单细胞数据仅来自42个NSCLC和11个正常样本,模型在其他癌症类型中的泛化能力需进一步验证 开发一个基于表观遗传特征的预后模型,用于预测NSCLC的药物敏感性和临床结局 非小细胞肺癌(NSCLC)患者样本,包括肿瘤组织和邻近正常组织 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序,qRT-PCR,免疫组化 随机生存森林(RSF) 基因表达数据,表观遗传数据 单细胞数据:42个NSCLC样本和11个正常样本;批量转录组数据:TCGA-NSCLC队列993例,GSE13213队列110例,GSE42127队列176例 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
18 2026-01-29
Interplay of PRMTs and Identification of Biomarkers Through Machine Learning Algorithms in Pan-Cancer, Highlighting PRMT3 as a Biomarker in Pancreatic Cancer
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过机器学习算法探索PRMTs在泛癌中的作用,并识别PRMT3作为胰腺癌的潜在预后生物标志物 首次结合三种机器学习算法系统分析PRMTs在泛癌中的预后价值,并通过单细胞RNA测序数据验证PRMT3在胰腺癌中的功能 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于胰腺癌模型,需进一步体内外实验确认 探究PRMTs在癌症中的调控机制并识别相关预后生物标志物 泛癌数据集及胰腺癌细胞 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序,分子对接,Transwell实验,伤口愈合实验 机器学习算法 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 泛癌数据集及胰腺癌单细胞RNA测序样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
19 2026-01-29
COL6A1, LAPTM5, and ZFAND2A as Crucial Biomolecules Driving Immunoregulation in Human Nucleus Pulposus Degeneration
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、转录组学和孟德尔随机化分析,揭示了椎间盘退变中关键的免疫调控生物分子及其作用机制 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析相结合,系统性地识别了与椎间盘退变风险显著相关的关键基因(COL6A1、LAPTM5、ZFAND2A),并阐明了它们在免疫微环境中的调控作用 样本量较小(仅4名患者),且研究结果主要在蛋白水平进行了验证,缺乏更深入的体内功能实验验证 探究椎间盘退变的免疫调控机制,并识别驱动该过程的关键生物分子 人类髓核组织 生物信息学 椎间盘退行性疾病 单细胞RNA测序,转录组学,孟德尔随机化分析,eQTL分析 NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据,基因组关联数据 4名椎间盘退变患者的髓核样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-01-29
A Lactylation-Based Diagnostic Model Reveals Molecular Subtypes and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组数据和乳酸化相关基因,构建了一个基于乳酸化的诊断模型,用于扩张型心肌病的分子分型和治疗靶点识别 首次将蛋白质乳酸化与扩张型心肌病诊断模型结合,利用集成机器学习算法识别核心乳酸化相关基因,并揭示了两种分子亚型及免疫代谢重塑机制 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏大规模前瞻性临床队列验证,且治疗化合物的预测需进一步实验证实 开发基于乳酸化相关基因的扩张型心肌病诊断模型,探索分子亚型及潜在治疗靶点 扩张型心肌病患者及小鼠心肌组织的转录组和单细胞RNA测序数据 生物信息学 心血管疾病 转录组测序, 单细胞RNA测序 集成机器学习算法 基因表达数据 来自GEO数据库的多个外部队列数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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