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当前共找到 591 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-17 |
Bi-specific T cell-engaging antibody triggers protective immune memory and glioma microenvironment remodeling in immune-competent preclinical models
2025-Oct-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011714
PMID:41151835
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研究论文 | 本研究在免疫健全的临床前模型中评估了双特异性T细胞衔接抗体（BTE）对胶质母细胞瘤的治疗机制，揭示了其通过激活宿主免疫系统、诱导免疫记忆和重塑肿瘤微环境来延长生存期的机制 | 首次在免疫健全的动物模型中系统研究BTE的作用机制，揭示了其在胶质母细胞瘤治疗中诱导免疫记忆和重塑肿瘤微环境的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类临床转化的有效性仍需进一步验证 | 探究双特异性T细胞衔接抗体在胶质母细胞瘤治疗中的作用机制 | 表达IL13RA2的胶质母细胞瘤细胞和免疫健全的小鼠模型 | NA | 胶质母细胞瘤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光、多参数MRI | NA | 流式细胞数据、单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像、MRI图像 | 多个临床前胶质母细胞瘤模型中的小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-12-16 |
Defects in the DNA Damage Response of Patient-derived Endometriosis Stromal Cells
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.29.685406
PMID:41278719
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研究论文 | 本研究探讨了子宫内膜异位症患者来源的基质细胞在DNA损伤反应中的缺陷 | 首次在患者来源的月经流出物基质细胞中揭示了子宫内膜异位症相关的DNA损伤反应缺陷，并发现其与MRN复合物下调相关 | 研究基于体外细胞系模型，可能无法完全反映体内情况；样本量未明确说明 | 研究子宫内膜异位症患者基质细胞的DNA损伤反应机制 | 患者来源的月经流出物基质细胞（来自健康捐赠者和子宫内膜异位症患者） | 分子生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-12-15 |
A Multi-omics Exploration Revealing SLIT2 as a Prime Therapeutic Target for Peripheral Facial Paralysis: Integrating Single-Cell Transcriptomics and Plasma Proteome Data
2025-Oct-16, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-025-01607-4
PMID:41099890
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化分析和单细胞转录组测序，探索了外周性面瘫的潜在治疗靶点，并首次在面神经损伤后检测到SLIT2的改变 | 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合，系统地从宏观遗传关联到微观细胞功能研究外周性面瘫，并首次在面神经损伤后检测到SLIT2的改变 | 研究主要基于动物模型，且动物与人类在面运动核方面存在显著差异 | 识别外周性面瘫的治疗靶点并理解其分子和细胞机制 | 外周性面瘫患者（通过公开血浆蛋白数据）及SD大鼠面神经损伤模型 | 单细胞组学 | 神经系统疾病（外周性面瘫） | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 免疫荧光分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 1925个公开可用的血浆蛋白顺式遗传力工具；SD大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-12-14 |
Principles of protein abundance regulation across single cells in a mammalian tissue
2025-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.676955
PMID:41000751
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研究论文 | 本文通过单细胞蛋白质合成与清除的系统量化，结合单细胞转录组学，揭示了哺乳动物组织中蛋白质丰度调控的组织原则 | 首次在复杂组织单细胞水平上定量分析蛋白质合成与清除的调控作用，发现翻译和蛋白质清除与细胞生长速率呈线性依赖关系 | 研究仅基于单一原代组织样本，样本多样性有限，且技术方法可能未覆盖所有蛋白质调控机制 | 探究哺乳动物组织中单细胞水平蛋白质丰度调控的分子机制与组织原则 | 来自原代组织的超过4,200个单细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学、蛋白质合成与清除量化 | NA | 单细胞蛋白质与RNA数据 | 超过4,200个原代组织单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-12-14 |
Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
2025-Oct-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029513
PMID:41060335
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术相结合的方法，验证了骨髓中中央骨髓区和骨内膜区两个空间区室的划分，并揭示了炎症如何通过重塑特定骨髓微环境区室来扰动造血功能 | 首次系统验证了骨髓微环境的空间区室划分方法，并发现炎症会特异性地影响不同细胞区室，特别是I型干扰素反应导致表达瘦素受体的间充质基质细胞功能转变，产生过量趋化因子调控局部单核细胞动态 | 研究主要关注急性炎症模型，慢性炎症或其他复杂病理条件下的骨髓微环境变化仍需进一步探索 | 探究骨髓微环境空间区室化在炎症等复杂条件下对造血调控的重要性 | 造血干细胞和祖细胞（HSPC）及骨髓基质细胞 | 单细胞组学 | 炎症相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-12-14 |
RetiGene, a comprehensive gene atlas for inherited retinal diseases
2025-Oct-02, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.08.017
PMID:40961941
|
研究论文 | 本文介绍了RetiGene，一个针对遗传性视网膜疾病的专家策划基因图谱，整合了变异数据、bulk和单细胞RNA测序以及功能注释 | 开发了首个综合性的专家策划基因图谱RetiGene，通过整合多源数据支持基因优先级排序、功能研究和治疗开发 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 解决遗传性视网膜疾病中基因目录不完整和更新不及时的问题，以促进分子诊断和遗传研究 | 遗传性视网膜疾病相关基因 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因变异数据、RNA测序数据、功能注释数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-14 |
From genetic causality to druggable targets: A multiomics framework identifies ZSCAN16 in gout pathogenesis
2025 Oct-Dec, Science progress
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/00368504251407179
PMID:41369912
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研究论文 | 本研究通过多组学框架，结合孟德尔随机化、共定位分析、表型全基因组关联研究和单细胞RNA测序，系统性地识别并优先排序了痛风的新型可成药靶点，最终确定ZSCAN16为高潜力的治疗靶点 | 采用多层遗传和功能基因组学方法，首次系统性地从遗传因果性角度识别并验证痛风的潜在可成药靶点，特别是通过单细胞分析揭示了ZSCAN16在细胞毒性T/NK细胞中的特异性上调 | 研究主要基于遗传关联和计算分析，缺乏直接的体内或体外功能验证实验来证实靶点的生物学机制 | 系统性识别和优先排序痛风的新型、可成药靶点，以克服当前疗法效果不佳和药物开发中缺乏遗传验证靶点的问题 | 痛风患者（基于GWAS队列数据）及相关的候选基因 | 生物信息学与计算生物学 | 痛风 | 孟德尔随机化，共定位分析，表型全基因组关联研究，单细胞RNA测序，分子对接 | NA | 遗传关联数据，基因表达数据，单细胞转录组数据 | 基于两个独立的痛风GWAS队列（openGWAS和FinnGen） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-12-13 |
A spatial transcriptomics dataset of the endometrium from repeated implantation failure patients
2025-Oct-29, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05995-6
PMID:41162434
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，首次构建了正常个体与反复种植失败患者子宫内膜组织的空间转录组图谱 | 首次构建了正常与反复种植失败条件下的子宫内膜空间转录组图谱，并识别出7个具有特定特征的细胞生态位 | 样本量较小（仅8个组织样本），且仅研究了黄体中期阶段 | 增强和深化对反复种植失败患者子宫内膜组织背景的理解 | 来自4名正常个体和4名反复种植失败患者的子宫内膜组织 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 8个子宫内膜组织样本（4名正常个体，4名RIF患者） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium平台 |
| 9 | 2025-12-13 |
Benchmarking large-scale single-cell RNA-seq analysis
2025-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.28.681564
PMID:41279840
|
研究论文 | 本文对五种广泛使用的单细胞RNA测序分析框架进行了基准测试，评估了它们在可扩展性、效率和准确性方面的表现 | 首次系统性地比较了不同算法和基础设施选择对大规模单细胞RNA测序分析性能的影响，并提供了GPU加速和优化配置的实用指南 | 研究主要关注PCA步骤和聚类准确性，可能未全面覆盖所有分析步骤或更复杂的生物场景 | 评估大规模单细胞RNA测序数据分析的计算挑战和性能优化策略 | 五种单细胞RNA测序分析框架（Seurat、OSCA、scrapper、Scanpy和rapids_singlecell）及其算法实现 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA、SVD算法（exact、ARPACK、IRLBA、randomized、Jacobi、incremental PCA） | 单细胞RNA测序数据 | 包括一个130万小鼠脑细胞数据集和三个较小数据集（BE1、scMixology和cord blood CITE-seq） | NA | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-12-13 |
Adipocytes are dispensable in shaping the ovarian cancer tumor microenvironment in the omentum
2025-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.28.685098
PMID:41279871
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研究论文 | 本研究通过构建缺乏成熟脂肪细胞的小鼠模型，挑战了传统观点，揭示了网膜血管内皮细胞而非脂肪细胞在卵巢癌腹膜转移微环境中的关键作用 | 首次通过特异性敲除腹膜成熟脂肪细胞的模型，证明脂肪细胞对卵巢癌生长并非必需，并发现血管内皮细胞高表达FABP4是支持肿瘤代谢生长的关键因素 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限；肿瘤微环境中其他细胞类型的相互作用尚未完全阐明 | 重新评估脂肪细胞在卵巢癌腹膜转移微环境中的作用机制 | 卵巢癌细胞（ID8p53Brca2、BPPNM、KPCA细胞系）、小鼠模型、人类单细胞RNA测序数据 | 肿瘤微环境研究 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、动物实验数据 | 多种卵巢癌细胞系及基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-12-13 |
Identification of tumor initiating cells and early marker genes in normal colonic epithelium that lead to neoplastic transformation
2025-Oct-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7914753/v1
PMID:41282138
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了结肠癌发生过程中的肿瘤起始细胞及早期转录标志物 | 首次在组织学正常的结肠上皮中识别出肿瘤起始细胞，并揭示了其早期转录和通路重编程事件 | 样本量相对较小（7名受试者），且研究主要基于转录组数据，功能验证有限 | 识别结肠癌发生过程中的肿瘤起始细胞和早期分子事件 | 人类结肠组织（包括正常黏膜、息肉和腺癌） | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7名人类受试者的配对正常和病变结肠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10X Genomics平台 | NA |
| 12 | 2025-12-13 |
The gain-of-function TREM2-T96K mutation increases risk for Alzheimer's disease by impairing microglial function
2025-Oct-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.09.032
PMID:41109213
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研究论文 | 本文研究了TREM2-T96K功能获得性突变通过损害小胶质细胞功能增加阿尔茨海默病风险的机制 | 首次揭示TREM2-T96K突变以性别依赖方式损害小胶质细胞功能，并影响其向疾病相关小胶质细胞的转化 | 研究主要基于小鼠模型和细胞培养，人类样本验证有限，性别差异机制尚未完全阐明 | 探究TREM2-T96K突变在阿尔茨海默病发病中的作用机制 | TREM2-T96K突变、小胶质细胞、β-淀粉样蛋白斑块、5xFAD转基因小鼠、人类小胶质细胞培养物 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞培养实验 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据、细胞成像数据 | 家族性和病例对照样本的全基因组测序数据集、5xFAD转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-12-13 |
Integrative and Emerging Models in Antibody Research: A Comprehensive Review
2025-Oct, Antibody therapeutics
DOI:10.1093/abt/tbaf018
PMID:41367414
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综述 | 本文全面回顾了抗体研究中的整合与新兴模型，包括体内、体外和计算模型，并探讨了它们各自的优势、局限及整合应用 | 强调多模型整合以克服可重复性、免疫原性预测和可扩展性等现有挑战，并展望了CRISPR工程、单细胞测序等新兴技术如何重塑抗体发现 | 作为综述文章，未进行原创性实验研究，主要基于现有文献进行评述，可能未涵盖所有最新进展 | 评估抗体研究中的各类模型，推动下一代癌症、自身免疫性疾病和传染病疗法的开发 | 抗体研究模型，包括体内模型（如动物模型）、体外技术（如杂交瘤技术）和计算方法 | 机器学习 | NA | 单细胞测序、微流控、器官芯片、CRISPR工程 | 计算生物学与机器学习模型 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-12-12 |
Resolving ScRNA-Seq Signatures of Antigen-Specific CD4 + T Cells in Tolerance across Semi-Allogeneic Transplantation and Pregnancy
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.06.663404
PMID:40672265
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了半同种异体移植和妊娠中抗原特异性CD4+ T细胞的转录状态，揭示了耐受与排斥反应的差异 | 首次在移植和妊娠模型中同时分析内源性抗原特异性CD4+ T细胞的单细胞转录组，识别出T滤泡辅助细胞和非滤泡效应细胞在排斥反应中的扩张，以及在耐受状态下调节性T细胞的独特聚类变化 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅作为验证，样本规模可能有限，且未涵盖所有临床相关情境 | 探究抗原特异性CD4+ T细胞在移植耐受和妊娠免疫耐受中的转录特征和功能差异 | 内源性抗原特异性CD4+ T细胞，包括调节性T细胞和常规T细胞 | 单细胞组学 | 移植免疫与生殖免疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及同种异体心脏移植模型、未致敏妊娠模型和父系皮肤致敏妊娠模型的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-12-12 |
CMV-specific clonal expansion of Th1, GZMK⁺ CD8⁺, and TEMRA T cells revealed by human PBMC single cell profiling
2025-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.661167
PMID:40666903
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了人类巨细胞病毒（CMV）感染如何重塑免疫细胞组成，并识别出GZMK⁺ CD8⁺ T细胞和Th1细胞是CMV特异性克隆扩增的新特征 | 首次系统性地结合单细胞RNA测序、T细胞受体测序和流式细胞术，在多个队列中揭示了CMV感染导致的GZMK⁺ CD8⁺ T细胞和Th1细胞的克隆扩增，并开发了CMVerify预测模型来识别CMV特异性克隆 | 研究主要基于外周血单个核细胞（PBMC）的分析，未能直接评估组织驻留免疫细胞的变化；队列样本量虽包含多个独立队列，但具体样本数未在摘要中明确说明 | 系统表征CMV感染对人类免疫系统的重塑作用，并识别新的CMV特异性免疫细胞亚群 | 人类外周血单个核细胞（PBMC），包括来自六个队列（其中两个为新构建）的CMV阳性和阴性成年人的样本 | 单细胞组学 | 巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），T细胞受体测序（TCR-seq），流式细胞术 | 预测模型（CMVerify） | 单细胞转录组数据，T细胞受体序列数据，流式细胞术数据 | 来自六个独立人类队列的样本（具体数量未明确），包括两个新构建的队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-12-12 |
Single-cell RNA-seq using UltraMarathonRT expands the known transcriptome
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680646
PMID:41278799
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研究论文 | 本研究首次将II型内含子逆转录酶UltraMarathonRT应用于单细胞RNA测序，揭示了传统方法无法捕获的转录组特征 | 首次在单细胞RNA测序中使用II型内含子逆转录酶uMRT，相比传统鼠白血病病毒来源的逆转录酶，能够捕获更多基因和基因组特征 | NA | 开发新型逆转录酶技术以提升单细胞转录组测序的覆盖度和准确性 | 单细胞转录组 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、代谢RNA标记、核苷转换 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-12-11 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-Oct-29, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术，分析了300多名健康成年人的外周免疫系统，揭示了年龄相关的免疫动态变化 | 首次大规模整合多组学数据，纵向追踪96名成年人两年的免疫反应，揭示了T细胞亚群中非线性的转录重编程，并发现其与B细胞对流感疫苗反应失调的关联 | 研究主要关注外周血单核细胞，可能未完全反映组织特异性免疫变化；样本年龄范围虽广，但未涵盖儿童或青少年群体 | 探究健康成年人年龄相关的免疫系统动态变化及其机制 | 300多名25至90岁的健康成年人，包括96名进行纵向追踪的个体 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 超过300名健康成年人，包括96名纵向追踪个体，生成超过1600万个外周血单核细胞的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-12-11 |
Emergence of endothelial subtypes and role of cell cycle control in arterial-venous specification during embryonic vascular development
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116368
PMID:41066228
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和Fucci胚胎模型，揭示了细胞周期控制在胚胎血管发育早期动静脉分化中的关键作用 | 首次在胚胎发育早期（血流出现前后）系统揭示内皮细胞亚型出现与细胞周期状态的关联，并证明细胞周期抑制剂p27在动静脉分化中的关键调控作用 | 研究主要聚焦于小鼠胚胎早期发育阶段（E8.0-E9.5），后期发育阶段和其他物种的验证仍需进一步探索 | 探究细胞周期控制在胚胎血管发育过程中动静脉分化中的作用机制 | 小鼠胚胎内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，Fucci荧光报告系统，成像分析 | NA | RNA测序数据，成像数据 | E8.0、E8.5、E9.5三个时间点的胚胎内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-12-11 |
A universal and cost-efficient sample labeling approach for multiplexed single-cell RNA-seq based on recombinant HUH-endonuclease-agglutinin tagging
2025-Oct-28, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.10.004
PMID:41167558
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HEATag的通用细胞膜标记方法，用于多路复用单细胞RNA测序，以降低成本并提高效率 | 结合鸭环病毒HUH内切酶和小麦胚芽凝集素，实现高效、序列特异性的单链DNA标记，适用于多种物种和细胞状态 | NA | 开发一种成本效益高且可扩展的样本标记方法，以促进高通量单细胞研究 | 新鲜或固定细胞的细胞膜 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单链DNA标记数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-12-11 |
Transcriptome Analysis Identified SPP1-Positive Monocytes as a Key in Extracellular Matrix Formation in Thrombi
2025-Oct-07, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.044299
PMID:41025474
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研究论文 | 本研究通过转录组分析发现SPP1阳性单核细胞在血栓细胞外基质形成中起关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出SPP1高表达的单核细胞/巨噬细胞亚群，并揭示其在血栓成熟过程中的核心作用 | 样本量较小（3个血栓用于RNA表达比较），且主要基于脑血栓和肺动脉血栓数据，可能不适用于所有血栓类型 | 探究血栓成熟的详细机制，特别是细胞外基质形成的关键因素 | 人类血栓样本（来自脑血管和肺动脉） | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | RNA表达数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 3个血栓用于RNA表达比较，66个血栓用于免疫组织化学验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |