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当前共找到 592 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-10, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251372607
PMID:41020442
|
综述 | 探讨氧化还原调控在微血管生理和病理中的作用，以及相关治疗策略和局限性 | 强调微血管与大血管对氧化还原反应的差异，提出基于单细胞RNA测序的血管床特异性基因特征，呼吁开发靶向微血管的氧化还原治疗药物 | 技术挑战限制了可靠关联活性氧/活性氮水平与微血管结果；缺乏有效的靶向治疗药物 | 综述氧化还原机制在微血管功能与功能障碍中的研究现状，指出未来研究方向 | 微血管中的活性氧和活性氮物种及其调控机制 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病、自身免疫性疾病、感染性疾病、血红蛋白病、炎症性疾病、血管炎、代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-05 |
Plasma proteome correlations with liver stiffness in pediatric cholestasis implicate epithelial to mesenchymal transition
2025-Oct-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000796
PMID:41021277
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研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析探索儿童胆汁淤积性肝病中肝脏硬度与蛋白质表达的相关性 | 首次在多种儿童胆汁淤积性疾病中系统分析血浆蛋白质组与肝脏硬度的疾病特异性相关性，并发现上皮间质转化通路在所有三种疾病中均显著富集 | 研究为横断面分析，无法确定因果关系；样本量相对有限 | 探究儿童胆汁淤积性肝病中血浆蛋白质组与肝脏硬度的相关性及其生物学意义 | 187名儿童（93例胆道闭锁、31例α-1抗胰蛋白酶缺乏症、46例Alagille综合征患者及17名健康对照） | 蛋白质组学 | 肝胆疾病 | 慢解离速率修饰适体扫描分析、振动控制弹性成像、单细胞转录组学、机器学习 | 弹性网络模型 | 蛋白质组数据、临床参数、转录组数据 | 187名儿童（93例BA、31例A1AT、46例ALGS、17名健康对照） | NA | 血浆蛋白质组分析、单细胞转录组学 | NA | 慢解离速率修饰适体扫描分析技术检测7000多种血浆蛋白质 |
| 3 | 2026-05-16 |
Role of Hydrogen Sulfide Regulation of Programmed Cell Death: Implications for Cardiovascular Diseases
2025-10, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251386449
PMID:41137369
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综述 | 总结硫化氢在心血管疾病中对程序性细胞死亡调控的作用及其机制 | 系统综述硫化氢在不同程序性细胞死亡模式（如NETosis、凋亡、坏死性凋亡、焦亡、铁死亡和铜死亡）中的调控作用，并探讨其在多种心血管疾病中的差异影响 | 硫化氢对不同细胞类型中程序性细胞死亡模式的差异性作用机制尚需进一步证据支持，且其在疾病条件下是否充当不同程序性细胞死亡通路之间的开关仍需确定 | 阐明硫化氢在心血管疾病中调控程序性细胞死亡的分子机制，以理解其病理生理作用 | 硫化氢及程序性细胞死亡相关信号通路在心血管疾病（如糖尿病心肌病、心肌肥厚与纤维化、高血压、心力衰竭、动脉粥样硬化和心肌缺血/再灌注损伤）患者中的作用 | 生物信息学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2025-10-31 |
Mapping disease-specific vascular cell populations responsible for obliterative arterial remodelling during the development of pulmonary arterial hypertension
2025-Oct-28, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf146
PMID:40875786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别肺动脉高压发展中导致闭塞性动脉重构的疾病特异性血管细胞群 | 首次在肺动脉高压模型中通过多时间点单细胞转录组分析鉴定出两种疾病特异性内皮细胞群，并发现TM4SF1作为动脉重构的新治疗靶点 | 研究基于动物模型，在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 阐明肺动脉高压发展中闭塞性动脉病变形成的细胞机制 | 肺动脉高压大鼠模型和PAH患者的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，RNA velocity分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的肺动脉高压模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-15 |
Large Language Models for Translational Cancer Informatics
2025-10, JCO clinical cancer informatics
IF:3.3Q2
DOI:10.1200/CCI-25-00108
PMID:41086385
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综述 | 探讨大语言模型在癌症研究中的应用，涵盖单细胞转录组学、空间转录组学和计算病理学 | 系统性地从细胞和病理两个角度评估大语言模型在精准肿瘤学中的潜力，覆盖多模态数据分析 | 多数模型未针对癌症特定应用进行优化，缺乏领域特定的微调和可扩展适应策略 | 综述大语言模型在癌症转化信息学中的应用，推动精准肿瘤学发展 | 2022年至2025年间发表的24种大语言模型及其在癌症研究中的应用 | 自然语言处理 | 癌症 | 大语言模型、单细胞RNA测序、空间转录组学、组织病理学 | 大语言模型 | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-05-12 |
Shared Lineage, Distinct Outcomes: Yap and Taz Loss Differentially Impact Schwann and Olfactory Ensheathing Cell Development Without Disrupting GnRH-1 Migration
2025-10, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70057
PMID:40631762
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示Yap和Taz缺失对施万细胞和嗅鞘细胞发育的不同影响，且不影响GnRH-1神经元迁移 | 首次发现Yap和Taz在嗅鞘细胞发育中的重要性，并证明施万细胞与嗅鞘细胞共享共同起源但存在显著遗传差异 | 未完全阐明Yap/Taz调控嗅觉上皮发育的分子机制 | 探究Yap和Taz在嗅鞘细胞和施万细胞发育中的作用及其对GnRH-1神经元迁移的影响 | 小鼠胚胎鼻组织中的嗅鞘细胞、施万细胞、黑色素细胞及嗅觉感觉神经元 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎鼻组织样本（数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-05-12 |
Diverse Subpopulations of Reactive Astrocytes Following Chronic Toxoplasma Infection
2025-10, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70053
PMID:40635167
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究慢性弓形虫感染后反应性星形胶质细胞的异质性亚群及其动态变化 | 首次揭示慢性神经炎症期间反应性星形胶质细胞亚群的长期演变过程，并发现表达转甲状腺素蛋白的新型免疫调节亚群 | 仅使用一种感染模型（弓形虫）和一种报告基因小鼠品系，可能无法完全代表所有慢性神经炎症情况 | 探究慢性神经炎症过程中反应性星形胶质细胞亚群的多样性和功能 | 反应性星形胶质细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Lcn2CreERT2报告基因小鼠模型中的脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 8 | 2026-05-09 |
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts identifies perivascular neurons resilient to glaucoma
2025-Oct-15, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.07.025
PMID:40840447
|
研究论文 | 优化了基于成像的空间转录组学（MERFISH）与免疫染色的工作流程，分析了视网膜平铺片上神经节细胞的空间分布，发现血管周围神经元对青光眼具有抵抗力 | 首次在视网膜平铺片上结合MERFISH和免疫染色，创建了全面的RGC类型空间图谱，揭示了血管周围微环境在神经保护中的作用 | 未提及 | 研究小鼠视网膜神经节细胞的空间分布及其局部微环境对功能的影响，探索青光眼模型中神经元的差异脆弱性 | 小鼠视网膜神经节细胞（RGCs） | 数字病理学 | 青光眼 | MERFISH, 免疫染色 | NA | 图像 | 小鼠视网膜平铺片（具体样本数未提及） | NA | 空间转录组学, 多重荧光原位杂交 | MERFISH | 成像型空间转录组学结合免疫染色 |
| 9 | 2026-05-08 |
Semi-parametric Empirical Bayes Method for Multiplet Detection in snATAC-seq with Probabilistic Multi-omic Integration
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.23.684138
PMID:41279855
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研究论文 | 提出一种半参数经验贝叶斯方法SEBULA，用于snATAC-seq数据中的多细胞检测，并支持概率性多组学整合 | 首次将半参数经验贝叶斯模型应用于snATAC-seq多细胞检测，实现良好校准的后验概率并支持多模态证据整合 | 未提及具体局限性，但可能受限于snATAC-seq数据的稀疏性和过度离散性 | 开发一种高效的多细胞检测方法以控制错误发现率 | snATAC-seq和trimodal DOGMA-seq数据集 | 机器学习 | NA | snATAC-seq, scRNA-seq | 半参数经验贝叶斯模型 | 染色质可及性数据、单细胞多组学数据 | 七个标注的三模态DOGMA-seq数据集及模拟数据 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-05-08 |
Cardiomyocyte-specific plakophilin-2 loss is sufficient to induce aging and senescence of nonmyocytes. Relevance to arrhythmogenic cardiomyopathy
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.22.682160
PMID:41279511
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研究论文 | 心肌细胞特异性PKP2缺失足以诱导非心肌细胞的衰老和早衰，与致心律失常性心肌病相关 | 首次证明心肌细胞特异性PKP2缺失足以诱导非心肌细胞中的促炎性衰老和整体心脏早衰，揭示了细胞衰老与桥粒致心律失常性心肌病的关联 | 研究基于小鼠模型，结果需在人类中验证；未在心肌细胞中发现典型衰老标志物，但观察到早衰相关结构特征 | 探讨心肌细胞特异性PKP2缺失是否足以诱导心脏非心肌细胞（驻留细胞）的过早衰老和促炎性衰老 | 心肌细胞特异性、他莫昔芬激活的PKP2缺失小鼠（PKP2cKO模型） | 数字病理学 | 致心律失常性右心室心肌病 | 空间转录组学、多重成像、细胞因子阵列、表观遗传时钟、扩展显微镜、结构照明显微镜 | NA | 图像、转录组、蛋白质组 | PKP2cKO小鼠模型，具体数量未在摘要中说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2026-05-08 |
Limited nasal IFN production contributes to delayed respiratory virus clearance and suboptimal vaccine responses
2025-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182836
PMID:40956633
|
研究论文 | 利用小鼠模型和单细胞RNA测序，发现鼻腔干扰素产生不足导致呼吸道病毒清除延迟和疫苗反应不佳 | 首次揭示人偏肺病毒感染中鼻腔局部干扰素反应的抑制机制，并通过鼻腔施用干扰素改善疫苗反应 | 主要基于小鼠模型，人类数据仅来自COVID-19患者，其他呼吸道病毒验证不足 | 探究鼻腔干扰素反应在呼吸道病毒感染和疫苗免疫中的作用 | 人偏肺病毒感染的小鼠模型和COVID-19患者 | 机器学习 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人偏肺病毒感染小鼠和COVID-19患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-05-08 |
Deciphering context-specific gene programs from single-cell and spatial transcriptomics data with DeCEP
2025-10-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279689.124
PMID:40841173
|
研究论文 | 提出名为DeCEP的计算框架，利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据解码特定上下文基因程序 | DeCEP通过整合功能基因列表和有向图，构建特定细胞或空间上下文下的功能网络，并基于网络拓扑识别依赖上下文的枢纽基因，实现对基因程序的细粒度表征，尤其擅长处理转录异质性显著的数据 | 文中未明确指出局限性，但可能依赖于功能基因列表的完整性和准确性，以及对有向图构建的要求 | 开发一种能够利用单细胞和空间转录组学数据表征上下文特异性基因程序的计算方法 | 模拟生物数据集以及真实生物数据集，包括正常肝组织、阿尔茨海默病和癌症样本 | 计算生物学 | 阿尔茨海默病，癌症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 基于网络拓扑的计算框架 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-05-08 |
Multicondition and multimodal temporal profile inference during mouse embryonic development
2025-10-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279997.124
PMID:40813249
|
研究论文 | 提出Sunbear框架，整合小鼠胚胎发育过程中多条件、多模态单细胞时间序列数据 | 首次提出能同时处理多条件（如性别、批次、疾病）和多模态（scRNA-seq、scATAC-seq）单细胞时间序列数据的联合建模框架Sunbear | 未明确提及局限性，但可能受限于单细胞数据本身的破坏性测量和跨时间点匹配的困难 | 开发整合多条件多模态单细胞时间序列数据的联合建模框架 | 小鼠胚胎发育过程中的单细胞 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | Sunbear联合建模框架 | 单细胞时间序列数据 | 小鼠胚胎发育过程中的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-05-06 |
Nonhuman Primate Model of Super-selective Intra-arterial Ophthalmic Arterial Interventional Thrombolysis for Treatment of Ophthalmic Arterial Embolism Resulting From Hyaluronic Acid Filler Cosmetic Injection
2025-10-16, Aesthetic surgery journal
IF:3.0Q1
DOI:10.1093/asj/sjaf132
PMID:40601619
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研究论文 | 建立非人灵长类动物模型，评估超选择性眼动脉介入溶栓治疗透明质酸填充剂注射所致眼动脉栓塞的疗效 | 首次在非人灵长类动物模型中模拟临床眼动脉缺血再灌注，并验证超选择性眼动脉介入溶栓治疗在一定时间窗内能有效改善视觉功能 | 模型中仍观察到部分视觉功能损伤，且单细胞测序显示栓塞时间长会导致视紫红质细胞因子表达下降 | 证明超选择性眼动脉介入溶栓治疗在特定时间窗内能有效改善透明质酸栓塞导致的视觉功能损伤，并提出一个临床相关的视网膜缺血再灌注模型 | 猕猴（恒河猴） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 介入溶栓，单细胞RNA测序，数字减影血管造影，眼底荧光血管造影，视网膜电图，苏木精-伊红染色，透射电子显微镜 | NA | 图像，文本，基因表达数据 | 猕猴样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于检测视网膜细胞变化 |
| 15 | 2026-05-06 |
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2025-Oct-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7766748/v1
PMID:41282081
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示了镰状细胞贫血中I型干扰素介导的转录重编程驱动骨髓偏斜造血的内在机制 | 首次阐明I型干扰素信号异常激活是镰状细胞贫血中造血干细胞向髓系分化的关键驱动因素，并发现SCA祖细胞通过上调CSF3R对G-CSF产生意外反应，导致单核细胞系偏向性造血 | NA | 探索镰状细胞贫血中粒细胞和单核细胞持续升高的内在机制 | 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞（HSPCs） | 自然语言处理 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 16 | 2026-05-06 |
Decoding the association between mucosal-associated invariant T cells and prostate cancer via multi-omics analysis
2025-Oct-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000044781
PMID:41054053
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研究论文 | 通过多组学分析揭示黏膜相关恒定T细胞与前列腺癌的关联 | 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，首次揭示MAIT细胞在前列腺癌中的潜在因果作用并发现关键调控基因ZFP36L2 | NA | 探究MAIT细胞与前列腺癌易感性的关联并识别潜在调控基因 | 前列腺癌样本和癌旁正常样本 | NA | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据 | 4个前列腺癌样本和4个癌旁正常样本，共计13139个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序 |
| 17 | 2026-05-06 |
TMEM258 modulates immune infiltration networks underlying co-susceptibility to Crohn disease and acute pancreatitis
2025-Oct-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000044807
PMID:41054129
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析，发现TMEM258是克罗恩病和急性胰腺炎的共同易感基因，并调节免疫浸润网络 | 首次利用孟德尔随机化结合多组学数据（eQTL、bulk和单细胞RNA测序）揭示TMEM258作为CD和AP共病的共享遗传因子，并阐明其通过调控T细胞浸润影响疾病风险的机制 | 样本量较小（23例共病患者），且基于小鼠模型验证，需进一步在更大队列和功能实验中验证 | 探究克罗恩病与急性胰腺炎共病的遗传机制和免疫调节网络 | 克罗恩病和急性胰腺炎患者，以及DSS诱导的急性结肠炎小鼠模型 | machine learning | 克罗恩病, 急性胰腺炎 | 孟德尔随机化, 表达数量性状位点分析, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-PCR | NA | 基因表达数据, 临床数据, 免疫细胞数据 | 23名CD患者，31864名个体的血液样本（来自37个队列的5421个顺式eQTL基因） | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-05-05 |
Integrated single-cell whole genome sequencing and spatial transcriptomics reveal latent intra-tumoral heterogeneity in ovarian cancer
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.676897
PMID:41279090
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研究论文 | 通过整合单细胞全基因组测序和空间转录组学揭示卵巢癌中潜在的肿瘤内异质性 | 首次结合单细胞全基因组测序与空间转录组学，在细胞、克隆和亚克隆水平系统解析卵巢癌的肿瘤内异质性，并发现功能相关的拷贝数改变及驱动突变的自发回复现象 | 样本量较小（仅5例卵巢癌样本），且未涉及纵向研究或治疗前后对比 | 阐明卵巢癌肿瘤内异质性的分子特征及其对复发和治疗失败的影响 | 5例上皮性卵巢癌组织的单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序，空间转录组学 | NA | 基因测序数据，空间基因表达数据 | 5例卵巢癌样本 | 10x Genomics | 单细胞测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 单细胞全基因组测序和空间转录组学平台 |
| 19 | 2026-05-01 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis identifies B-cell subpopulations and associated cancer subtypes with distinct clinical and molecular characteristics
2025-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01082-5
PMID:40526246
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析，识别B细胞亚群及相关癌症亚型，揭示其不同的临床和分子特征 | 首次在泛癌层面系统识别八个B细胞亚群，并基于特异性基因签名构建预测癌症预后和免疫治疗反应的模型 | NA | 识别B细胞亚群特异性标志物在泛癌中的临床相关性，并构建预测癌症预后和免疫治疗反应的模型 | B细胞亚群、癌症患者样本（15种癌症类型） | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 | 无监督聚类模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、空间转录组数据 | 424名患者，102,504个细胞，涵盖15种癌症类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-05-01 |
Fibroblast-derived PI16 enhances tumor immune-suppressive microenvironment via inducing Tregs differentiation
2025-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01090-5
PMID:40694273
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研究论文 | 研究了成纤维细胞来源的PI16通过诱导Treg分化增强食管鳞癌肿瘤免疫抑制微环境的作用机制 | 首次揭示PI16+成纤维细胞通过DOCK2依赖性机制促进Treg分化，并提出PI16+成纤维细胞作为克服肿瘤免疫抑制的新型治疗靶点 | 未明确提及研究局限性 | 探讨成纤维细胞来源的PI16在食管鳞癌肿瘤微环境中对免疫抑制的调控作用 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境中的成纤维细胞和调节性T细胞 | 机器学习和单细胞测序分析 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫共沉淀、质谱分析、多重荧光免疫组化 | NA | scRNA-seq数据（GSE203115） | 公共scRNA-seq数据集及体外/体内实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |