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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-26 |
Single-cell RNA-seq reveals cell type-specific molecular and genetic associations with primary open-angle glaucoma
2025-10-10, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02438-x
PMID:41068080
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis of mouse cochlea identifies a novel proinflammatory CD74+CD14+ macrophage subset in mice with age-related and noise-induced hearing loss
2025-10, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2025.109376
PMID:40743638
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠耳蜗免疫细胞,发现与年龄相关和噪声性听力损失相关的促炎性CD74+CD14+巨噬细胞亚群 | 首次在年龄相关和噪声性听力损失中鉴定出CD74+CD14+巨噬细胞亚群,并揭示其与螺旋神经节神经元的增强细胞通讯 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究年龄相关和噪声性听力损失中耳蜗免疫微环境的变化 | 小鼠耳蜗免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-23 |
Mapping Macrophage Diversity in Coats' Disease: A Lipid-Associated Subset in the Pathogenesis of Exudative Retinopathy
2025-10-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.13.19
PMID:41065482
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序首次描绘Coats病视网膜微环境的细胞图谱,揭示脂质相关巨噬细胞在渗出性视网膜病变发病机制中的关键作用 | 首次构建Coats病视网膜微环境单细胞图谱,鉴定出脂质相关巨噬细胞亚群及其由吞噬向炎症和胞外基质重塑的功能转变,并发现ABCA1为核心的调控模块 | 样本量有限,仅来自一名Coats病患者,且未涉及正常对照视网膜组织 | 探究Coats病渗出性视网膜病变的细胞和分子机制 | Coats病患者及增殖性玻璃体视网膜病变对照患者的视网膜前膜和玻璃体样本中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1例Coats病患者和4例增殖性玻璃体视网膜病变对照患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-13 |
Early developmental neuronal activity inhibits oligodendrocyte differentiation through AMPA receptor activation
2025-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683139
PMID:41279286
|
研究论文 | 本研究探讨早期神经元活动通过AMPA受体激活抑制少突胶质细胞分化 | 首次发现发育早期神经元活动抑制而非促进少突胶质细胞分化,并揭示AMPAR信号是关键调节因子 | 研究仅限于小鼠模型,且主要关注感觉诱发和化学遗传调控的神经元活动 | 探究发育早期神经元活动如何影响少突胶质细胞成熟 | 小鼠嗅球、体感皮层和胼胝体中的少突胶质细胞及神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠组织样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-07-13 |
Rethinking large-scale phylogenomics with EukPhylo v.1.0, a flexible toolkit to enable phylogeny-informed data curation and analyses of diverse eukaryotic lineages
2025-10-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01770-25
PMID:40862604
|
研究论文 | 介绍EukPhylo v.1.0,一个模块化、用户友好的管道,用于通过系统发育信息进行数据筛选和分析多种真核生物谱系 | EukPhylo v.1.0 提供基于系统发育信息的污染去除、同源基因家族估计和多序列比对及基因树生成的模块化管道,并包含约15000个古代基因家族的Hook数据库,易于替换,提升了系统发育基因组分析的可重复性和灵活性 | 主要依赖单细胞测序数据,对于不可培养微生物谱系,污染问题仍然存在;最终树挑战了某些文献假说(如CRuMs、Obazoa、Diaphoretickes),需要更多数据验证 | 改进微生物真核生物的系统发育基因组分析,特别是不可培养谱系的数据筛选和污染去除 | 1000种多样真核生物、细菌和古菌中的500个保守基因家族 | 机器学习 | NA | 系统发育基因组分析、单细胞测序 | NA | 序列数据 | 1000种物种(包括真核生物、细菌和古菌)的500个保守基因家族 | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2026-07-05 |
PFKFB3 Promotes Myofibroblast Differentiation and Cardiac Fibrosis Through its Intra- and Extra- Cellular Roles
2025-10, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10688-x
PMID:41166052
|
研究论文 | 本研究揭示了PFKFB3通过细胞内糖酵解调控和细胞外信号双重作用促进心脏纤维化的机制 | 首次发现PFKFB3通过细胞内糖酵解调控和细胞外信号双重驱动心脏纤维化,并揭示其作为治疗靶点的转化潜力 | NA | 阐明PFKFB3在心脏纤维化发病机制中的角色及其潜在治疗价值 | 小鼠模型(异丙肾上腺素和冠状动脉结扎诱导)和心肌病患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、Western blot、ELISA | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 小鼠模型(异丙肾上腺素和冠状动脉结扎诱导)以及心肌病患者血浆样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于分析心肌病中激活的心脏肌成纤维细胞 |
| 7 | 2026-07-04 |
Single-cell transcriptomics of cervical lymph node tuberculosis reveals cellular heterogeneity and enhanced cellular communication
2025-10-21, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00763-y
PMID:41120826
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学分析宫颈淋巴结结核,揭示免疫细胞异质性和增强的细胞间通讯 | 首次对活动性结核感染淋巴结进行配对单细胞RNA测序,揭示细胞类型特异性转录重编程和细胞间相互作用网络 | 样本量较小(5例患者),缺乏功能验证实验,未探讨治疗干预效果 | 解析结核分枝杆菌感染宫颈淋巴结的局部免疫微环境及细胞间通讯机制 | 5例宫颈淋巴结结核患者的结核阳性肿大淋巴结和邻近正常淋巴结 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | CellChat | 基因表达数据 | 5例患者的配对淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-07-01 |
Persistent interferon signaling and clonal expansion mark early events in DNA methylation damage-induced liver cancer
2025-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.01.679856
PMID:41256671
|
研究论文 | 通过纵向分析揭示NDMA诱导的DNA甲基化损伤导致肝癌的早期分子事件,包括持续的干扰素信号和克隆扩增 | 首次通过纵向多组学分析(表型组、转录组、磷酸化蛋白质组)描绘NDMA暴露后从早期DNA损伤响应到数月后肝癌发生的完整分子级联事件,并发现持续的干扰素信号作为主导激活通路与克隆扩增相关 | 未明确提及局限性,但可能包括小鼠模型与人类的差异、单一致癌物暴露场景的局限性 | 阐明NDMA诱导肝癌进展的分子机制,识别早期生物标志物和疾病缓解策略 | 野生型和MGMT缺陷小鼠的肝脏组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 磷酸化蛋白质组学, 转录组学, 空间转录组学 | NA | 文本, 图像 | 未明确样本数量,涉及野生型和MGMT缺陷小鼠的纵向分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-06-30 |
eNAMPT Is a Novel DAMP and Therapeutic Target in Human and Murine Pulmonary Fibrosis
2025-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0342OC
PMID:40126452
|
研究论文 | 本研究探讨eNAMPT作为人类和小鼠肺纤维化新型DAMP及治疗靶点的作用 | 首次证明eNAMPT中和抗体ALT-100在人类和小鼠肺纤维化中的治疗潜力,并揭示其逆转肺泡II型上皮细胞扩增及内皮/上皮-间质转化的机制 | 仅基于体外和小鼠模型,缺乏大规模临床试验验证;未明确eNAMPT/TLR4信号通路在其他纤维化疾病中的通用性 | 评估eNAMPT作为特发性肺纤维化治疗靶点的可行性 | 人类IPF患者血液、PBMC和肺组织;博来霉素诱导的C57Bl6小鼠肺纤维化模型 | 机器学习 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 未见明确模型类型 | 基因表达数据、组织学图像 | 人类IPF患者样本(具体数量未说明);小鼠模型(C57Bl6小鼠) | 未见明确 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 未见明确 | NA |
| 10 | 2026-06-30 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies a Unique Macrophage Population in a Mouse Model of Ozone-induced Asthma Exacerbation
2025-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0358OC
PMID:40106801
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序鉴定小鼠臭氧诱导哮喘加重模型中独特的巨噬细胞群体 | 首次通过单细胞RNA测序无偏分析臭氧暴露后过敏性肺部炎症中的免疫细胞群,发现与臭氧诱导气道高反应性相关的独特巨噬细胞和单核细胞亚群 | NA | 探究臭氧吸入触发哮喘气道高反应性的免疫细胞机制 | 小鼠肺部免疫细胞,特别是肺泡巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞测序 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-06-29 |
Molecular mechanisms underlying the co-pathogenesis of abdominal aortic aneurysm and rheumatoid arthritis: evidence based on bioinformatics analysis and clinical data
2025-Oct-09, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02236-y
PMID:41068798
|
研究论文 | 通过生物信息学和临床数据综合分析腹主动脉瘤与类风湿关节炎的共同发病机制 | 首次利用单细胞RNA测序数据和临床样本验证ITK和单核细胞在两种疾病共病中的关键作用 | 未提供具体研究限制信息,但可推断基于公共数据库和临床样本的验证可能缺乏功能实验验证 | 分析腹主动脉瘤和类风湿关节炎的共同发病机制 | 腹主动脉瘤和类风湿关节炎的转录组数据及临床患者血液样本 | 生物信息学 | 心血管疾病,自身免疫病 | 微阵列芯片,单细胞RNA测序,免疫细胞浸润分析 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 629例临床患者外周血样本 | NA | 微阵列芯片,单细胞RNA测序 | NA | GEO数据库获取的微阵列和单细胞RNA测序数据集 |
| 12 | 2026-06-26 |
The involvement of microglia and the CXCL16-CXCR6 axis in the recruitment of CD8+ T cells to an amyloidogenic mouse brain
2025-Oct-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22137-5
PMID:41174156
|
研究论文 | 研究了小胶质细胞和CXCL16-CXCR6轴在招募CD8+ T细胞到淀粉样变性小鼠大脑中的作用 | 揭示了CXCL16-CXCR6轴在AD病理下招募CD8+ T细胞中的潜在作用,并发现PLX5622敏感的小胶质细胞在招募过程中并非必需 | PLX5622处理后,耐药性小胶质细胞或其他脑驻留髓系细胞补偿性表达Cxcl16,可能掩盖了关键机制;未来需体内分析进一步解析机制 | 探究小胶质细胞和CXCL16-CXCR6轴在CD8+ T细胞招募到AD模型小鼠大脑中的作用 | APP/PS1小鼠和野生型小鼠的脑组织,以及体外培养的永生化和原代小鼠细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公开单细胞RNA测序数据集;APP/PS1小鼠和野生型小鼠;体外永生化和原代细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-06-20 |
Macrophage EHD1 promotes inflammation and stabilizes sortilin to accelerate atherosclerosis
2025-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684958
PMID:41279772
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研究论文 | 该研究揭示了巨噬细胞中EHD1蛋白通过促进炎症反应和稳定分拣蛋白(sortilin)加速动脉粥样硬化的作用机制 | 首次发现EHD1在巨噬细胞中通过调控TNFR2内吞循环和稳定retromer的逆向运输货物sortilin来促进炎症反应,从而加速动脉粥样硬化进展 | 未提及 | 探索EHD1在巨噬细胞免疫反应中的作用及其对动脉粥样硬化进展的贡献 | 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 机器学习 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类斑块样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-20 |
Single-cell sequencing reveals distinct peripheral immune responses in anti-MDA5 antibody positive dermatomyositis with rapidly progressive interstitial lung disease
2025-10-08, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03639-z
PMID:41063280
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序揭示抗MDA5抗体阳性皮肌炎伴快速进展间质性肺病的外周免疫反应特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示MDA5+ DM伴RPILD患者外周血单个核细胞的免疫景观,发现抗病毒反应增强和MHC-II信号通路在CD4+幼稚T细胞中缺失 | 样本量较小(每组3-4例),且仅为外周血样本分析,未涉及组织或纵向时间点研究 | 探索MDA5+ DM伴RPILD的外周免疫机制,寻找潜在治疗靶点 | 抗MDA5抗体阳性皮肌炎伴快速进展间质性肺病患者 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病(皮肌炎伴间质性肺病) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例(4例RPILD,3例非RPILD,3例健康对照) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 15 | 2026-06-18 |
IL-6+ fibroblasts contribute to shaping the pro-inflammatory microenvironment in severe periodontitis after non-surgical periodontal therapy
2025-Oct-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07132-8
PMID:41094591
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研究论文 | 揭示非手术牙周治疗后重度牙周炎残余深袋中IL-6+成纤维细胞促进促炎微环境形成的作用 | 首次发现非手术牙周治疗后重度牙周炎残余深袋中IL-6+成纤维细胞富集,并揭示其与FCN1+巨噬细胞的相互作用通过缺氧微环境驱动持续性炎症和骨吸收,为靶向治疗提供新见解 | 未明确提及 | 探索非手术牙周治疗后重度牙周炎残余深袋的细胞组成和分子环境,为靶向治疗提供关键见解 | 重度牙周炎患者(非手术牙周治疗后)和健康捐赠者的牙周组织 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫组化免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-06-18 |
Human deep subcutaneous adipose tissue is enriched for inflammatory and tissue remodeling pathways
2025-10-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00463.2025
PMID:40833844
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研究论文 | 本研究通过批量与单细胞RNA测序揭示了人类深层皮下脂肪组织与浅层脂肪组织在炎症和组织重塑通路上的差异 | 首次系统比较浅层和深层皮下脂肪组织在转录组水平上的差异,发现深层脂肪组织富含炎症和组织重塑相关基因,并鉴定出特异性细胞亚型,如氧化应激相关Mox巨噬细胞和应激反应性成纤维细胞 | 未提及 | 比较浅层和深层皮下脂肪组织的转录组差异,揭示其在炎症和组织重塑中的不同作用 | 人类浅层和深层皮下脂肪组织 | 机器学习和生物信息学 | 代谢性疾病 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未提及样本数量 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-06-18 |
In Vivo Reprogramming Dysfunctional Retinal Ganglion Cells and Visual-phototransduction via Wireless Charging Nanogold for Leber's Hereditary Optic Neuropathy
2025-10, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504509
PMID:40852879
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研究论文 | 利用无线充电纳米金颗粒在体内重编程功能障碍的视网膜神经节细胞并恢复视觉光转导,用于治疗莱伯遗传性视神经病变 | 提出了一种线粒体靶向的无线充电金纳米颗粒,兼具基因递送平台和电刺激恢复光转导的双重功能 | 该研究仅在小鼠模型和患者来源的类器官中验证,未在人体临床试验中评估疗效和安全性 | 开发一种新型基因治疗策略,通过无线充电纳米颗粒促进视网膜神经节细胞再生和视觉功能恢复,用于治疗莱伯遗传性视神经病变 | 莱伯遗传性视神经病变患者来源的诱导多能干细胞分化的视网膜类器官和LHON小鼠模型 | 数字病理学, 机器学习 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序, 时空转录组学 | NA | 转录组数据 | LHON小鼠模型和患者来源的视网膜类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 18 | 2026-06-17 |
Multi-site Assessment of Methods for Cell Preservation Upstream of Single Cell RNA Sequencing
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.24.684427
PMID:41279168
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研究论文 | 评估三种细胞保存方法在单细胞RNA测序中的性能和可重复性 | 首次跨平台、多站点比较10x Genomics FLEX、Parse Bioscience Evercode WT v2和Honeycomb Bio HIVE三种细胞保存方法在单细胞RNA测序中的表现,并证明保存方法能更好地保留脆弱粒细胞群体 | 检测的基因子集存在平台特异性差异,且研究仅针对同一位健康个体的白细胞,样本多样性有限 | 评估三种商业细胞保存平台在单细胞RNA测序中的性能和可重复性,为科研人员选择最佳保存工作流程提供参考 | 来自一位健康个体的总白细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、流式细胞术数据 | 1位健康个体的白细胞样本 | 10x Genomics, Parse Biosciences, Honeycomb Bio | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics FLEX, Parse Bioscience Evercode WT v2, Honeycomb Bio HIVE | 10x Genomics FLEX固定保存法,Parse Bioscience Evercode WT v2固定保存法,Honeycomb Bio HIVE冷冻保存法 |
| 19 | 2026-06-17 |
Decoding the human PBMC isonome: Isoform-level resolution with single-cell long-read transcriptomics
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.16.682832
PMID:41279381
|
研究论文 | 使用单细胞长读长转录组学解析人类PBMC异构体组,实现异构体水平分辨率 | 首次生成最大规模的人类外周血单核细胞(PBMC)长读长单细胞数据集,结合微流控自由PIPseq工作流程和Oxford Nanopore长读长测序,发现128种新型异构体并鉴定细胞类型特异性异构体表达模式 | NA | 利用单细胞长读长RNA测序在异构体水平研究人类免疫细胞的多样性和功能机制 | 人类外周血单核细胞(PBMC)中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞长读长RNA测序(ONT) | NA | RNA序列数据 | 人类PBMC样本 | Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA-seq | Oxford Nanopore测序平台 | PIPseq工作流程结合Oxford Nanopore长读长测序 |
| 20 | 2026-06-15 |
Microarray and Single-Cell RNA Sequencing Reveals G-Protein Gene Expression Signatures of Spermatogonia Stem Cell
2025-10, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-025-10942-4
PMID:40694278
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研究论文 | 该论文通过微阵列和单细胞RNA测序技术,揭示了与精原干细胞发育相关的G蛋白基因表达特征 | 首次利用微阵列分析结合单细胞转录组学,系统鉴定了人类精原干细胞中G蛋白偶联受体基因的表达模式,并验证了多个新基因在精原干细胞发育中的调控作用 | 未详细说明样本量、验证实验及功能机制研究的局限性 | 探究人类精原干细胞发育的分子机制,为男性生育力基础研究和治疗应用提供依据 | 人类睾丸精原干细胞 | 单细胞转录组学 | 男性不育相关疾病 | 微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫荧光标记 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 6个人类睾丸样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |