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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-05 |
High Treg and PMN-MDSC densities are a hallmark of tertiary lymphoid structures in fatal cases of cervical cancer
2025-Sep-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012613
PMID:40998518
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研究论文 | 本研究通过分析三级淋巴结构在宫颈癌和头颈鳞癌中的密度、组成及预后影响,揭示其在HPV相关癌症中的免疫调节作用差异 | 首次发现宫颈癌中三级淋巴结构的高Treg和PMN-MDSC浸润与患者不良预后相关,不同于头颈鳞癌中三级淋巴结构密度与良好预后的正相关 | 样本来源限于HPV相关癌症,未涵盖其他癌症类型;空间转录组学分析范围有限 | 探究三级淋巴结构在HPV诱导的宫颈癌和头颈鳞癌中对抗肿瘤免疫的塑造作用及预后影响 | 宫颈癌和头颈鳞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 多重免疫荧光、免疫组织化学、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 组织切片图像、空间转录组数据、流式细胞数据 | 宫颈癌和头颈鳞癌患者组织样本(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 122 | 2025-10-05 |
Myasthenia thymus reprograms class-switched B cells into BAFF-dependent survivors
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.19.677075
PMID:41000735
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示重症肌无力胸腺中B细胞通过转向BAFF依赖的生存机制逃避正常免疫耐受检查点 | 首次发现重症肌无力胸腺中发生免疫耐受检查点转换,B细胞从T细胞依赖性激活转向BAFF驱动的生存机制 | 研究样本仅限于人类胸腺组织,未验证BAFF-BCMA轴在其他自身免疫疾病中的普适性 | 解析重症肌无力中自身反应性B细胞逃避免疫耐受的分子机制 | 人类胸腺组织中的B细胞和滤泡辅助T细胞 | 单细胞组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序,V(D)J repertoire分析,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,B细胞受体序列数据 | 237,661个细胞,来自人类胸腺样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-05 |
Recent insights in the development and functions of insect hemocytes
2025-Sep-15, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101434
PMID:40962030
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综述 | 本文综述了昆虫血细胞发育与功能研究的最新进展 | 整合了单细胞RNA测序技术对血细胞群体异质性的新发现,拓展了对固着血细胞功能的理解 | 主要基于果蝇、蚊子和鳞翅目昆虫的研究结果,可能不适用于所有昆虫类群 | 探讨昆虫血细胞的个体发育和免疫功能机制 | 昆虫血细胞,特别是果蝇、蚊子和鳞翅目昆虫的血细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-05 |
Decoding the Tumor Microenvironment: Insights and New Targets from Single-Cell Sequencing and Spatial Transcriptomics
2025-Sep-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090730
PMID:41020852
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综述 | 本文探讨单细胞测序和空间转录组学技术在解析肿瘤微环境中的应用与进展 | 整合单细胞测序与空间转录组学技术,在单细胞分辨率下揭示肿瘤微环境的异质性和空间动态 | NA | 探索肿瘤微环境的分子机制并发现新的治疗靶点 | 肿瘤微环境中的细胞组成和空间结构 | 数字病理 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-05 |
Leveraging RNA-seq deconvolution to improve complex in vitro model characterization
2025-Sep, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110510
PMID:40701251
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研究论文 | 本研究评估RNA-seq反卷积方法在复杂体外模型表征中的应用 | 利用公开单细胞RNA-seq数据集通过反卷积方法从批量RNA-seq数据预测细胞比例,改进了复杂体外模型的表征能力 | 反卷积方法的准确性在不同分析中存在显著差异 | 开发复杂体外模型的表征方法以用于毒理学和药物开发 | 基于干细胞的人类肠道类器官CIVM和新生啮齿动物睾丸CIVM | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | 反卷积模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2025-10-05 |
The urokinase receptor/uPAR is a major effector of p53 gain-of-function mutations in gemcitabine-treated pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Sep, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110561
PMID:40759369
|
研究论文 | 本研究揭示了p53功能获得性突变通过上调尿激酶受体(uPAR)表达促进胰腺导管腺癌化疗耐药和侵袭转移的机制 | 首次发现p53功能获得性突变通过上调PLAUR/uPAR表达介导吉西他滨治疗后胰腺癌细胞的侵袭转移能力增强 | 研究主要基于细胞系模型,需要更多体内实验验证;EGFR在uPAR信号通路中的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究p53功能获得性突变在胰腺导管腺癌化疗耐药和侵袭转移中的作用机制 | 胰腺导管腺癌细胞系(PANC1、MIA PaCa-2)和人类PDAC组织样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、基因沉默、细胞迁移侵袭实验、信号通路分析 | 细胞系模型 | 基因表达数据、临床生存数据、单细胞测序数据 | 两个胰腺癌细胞系和TCGA数据库中的PDAC患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2025-10-05 |
After the bite: cellular responses to mosquito blood feeding
2025-Sep, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2025.07.018
PMID:40803965
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析埃及伊蚊吸血后中肠和脂肪体组织的细胞反应 | 首次在单细胞水平系统表征蚊子吸血后不同组织的转录组和代谢组响应,揭示了新型细胞类型和昆虫特异性病毒感染动态 | NA | 研究蚊子吸血后的细胞响应机制 | 埃及伊蚊的中肠和脂肪体组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2025-10-05 |
SMAD1/5-mediated recruitment of the histone demethylase KDM1A controls cell fate programs in embryonic stem cells
2025-Sep, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110591
PMID:40812426
|
研究论文 | 本研究揭示了SMAD1/5通过招募组蛋白去甲基化酶KDM1A调控小鼠胚胎干细胞命运程序的分子机制 | 首次发现SMAD1/5通过招募KDM1A介导H3K4me1/2去甲基化,从而抑制特定基因表达的转录抑制新机制 | 研究主要集中于小鼠胚胎干细胞,在人类细胞或其他细胞类型中的普适性需要进一步验证 | 探究SMAD1/5在小鼠胚胎干细胞中调控细胞命运程序的分子机制 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀测序 | 基因敲除模型 | 基因组学数据,转录组数据 | Smad1/5双敲除和野生型小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,ChIP-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-10-05 |
Plant metabolism: Zoom in to the single-cell level
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf375
PMID:40889291
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在植物代谢研究中的应用进展 | 整合单细胞转录组学与多组学技术揭示植物代谢产物的细胞类型特异性积累模式 | NA | 探索植物代谢产物在细胞水平上的积累规律及其调控机制 | 模式植物和药用植物 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像, 单细胞转录组学, 多组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-05 |
Thymic Stromal Lymphopoietin Promotes Ozone-induced Inflammation in the Airway
2025-Sep-30, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0281OC
PMID:41025995
|
研究论文 | 本研究探讨了胸腺基质淋巴细胞生成素在臭氧诱导的气道炎症中的作用机制 | 首次揭示了cDC1来源的XCR1通过TSLP通路介导臭氧诱导的中性粒细胞气道炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证;部分基因表达机制仍需进一步阐明 | 阐明TSLP在臭氧诱导的气道炎症中的分子机制 | BALB/c小鼠、TSLP受体缺陷小鼠、C57BL/6J小鼠 | 免疫学 | 气道炎症 | 单细胞RNA测序, 细胞因子分析 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | 多种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2025-10-05 |
Neutrophil-enriched gene signature correlates with teplizumab therapy resistance in different stages of type 1 diabetes
2025-Sep-30, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176403
PMID:41026533
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了与teplizumab治疗反应相关的免疫基因特征,发现中性粒细胞富集特征与治疗抵抗相关 | 首次在1型糖尿病不同阶段中鉴定出与teplizumab治疗抵抗相关的中性粒细胞富集基因特征,并开发了26基因血液标志物预测模型 | 研究样本量有限,需要在更大队列中验证预测模型的普适性 | 探索teplizumab在1型糖尿病治疗中反应异质性的免疫学机制 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠和1型糖尿病患者的血液及胰腺样本 | 生物信息学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组测序,弹性网络逻辑回归模型 | 弹性网络逻辑回归 | 单细胞RNA测序数据,全血测序数据 | NOD小鼠配对外周血和胰腺样本,人类TN10(阶段2)和AbATE(阶段3)队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2025-10-05 |
Mechanisms of immune escape and extramedullary tropism in leukemia cutis
2025-Sep-30, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029121
PMID:41026928
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了白血病皮肤浸润的免疫逃逸机制和髓外趋向性特征 | 首次系统比较了髓外急性髓系白血病与骨髓复发白血病的免疫微环境差异,发现T细胞耗竭特征和HLA II类分子下调等免疫逃逸机制 | 样本量较小(10例患者,23份活检),仅针对皮肤和皮下组织的髓外疾病 | 探究急性髓系白血病髓外趋向性的机制和免疫微环境特征 | 10例孤立性髓外疾病患者的23份皮肤和皮下组织活检样本 | 数字病理学 | 白血病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 转录组数据 | 10例患者的23份活检样本,另包括7例骨髓复发对照 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-10-05 |
Impaired immune metabolism in COPD driven by dysfunction of CXCL16 + alveolar macrophages: multivariate causal evidence
2025-Sep-30, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10163-7
PMID:41028288
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法发现CXCL16+肺泡巨噬细胞功能障碍是驱动COPD免疫代谢异常的关键因果机制 | 首次通过孟德尔随机化分析确定CXCL16在肺泡巨噬细胞中的下调与COPD风险存在因果关联,并揭示其通过破坏免疫代谢稳态驱动疾病进展 | 研究样本量相对有限,且主要基于欧洲和东亚人群,需要在更广泛人群中验证 | 识别COPD中肺泡巨噬细胞功能障碍的关键分子驱动因素 | 人类肺组织样本和肺泡巨噬细胞 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化分析, 细胞间通讯分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据 | 1,283个肺泡巨噬细胞特异性基因 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing insights into the transcriptional landscape of cerebral cavernous malformations
2025-Sep-30, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-10011-x
PMID:41028361
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在脑 cavernous 血管畸形研究中的应用进展 | 首次系统总结单细胞测序在CCM疾病中揭示内皮细胞、壁细胞、成纤维细胞、星形胶质细胞和免疫细胞转录组特征的研究进展 | NA | 探索单细胞测序技术在脑 cavernous 血管畸形研究中的应用价值 | 脑 cavernous 血管畸形中的内皮细胞、壁细胞、成纤维细胞、星形胶质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-05 |
ERO1A-positive tumor epithelial cells in colorectal cancer progression: a multi-omics perspective
2025-Sep-30, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02184-z
PMID:41028408
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研究论文 | 通过多组学方法鉴定ERO1A阳性肿瘤上皮细胞在结直肠癌进展中的关键作用 | 首次发现ERO1A阳性上皮细胞亚群在晚期结直肠癌中显著富集,并构建了基于ERO1A+TME评分的预后预测模型ETSRM | 研究基于多中心队列但需进一步验证,机制研究仍需深入 | 探究ERO1A阳性肿瘤上皮细胞在结直肠癌进展中的作用机制 | 结直肠癌患者样本和细胞模型 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、生物信息学分析 | 风险预测模型ETSRM | 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 | 21个多中心队列共2,767例样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 136 | 2025-10-05 |
NQO1/p65/CXCL12 Axis-Recruited Tregs Mediate Resistance to Anti-PD-1 Plus Lenvatinib Therapy in PIVKA-II-Positive Hepatocellular Carcinoma
2025-Sep-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511152
PMID:41028931
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研究论文 | 本研究揭示了PIVKA-II阳性肝细胞癌中通过NQO1/p65/CXCL12轴招募Treg细胞导致抗PD-1联合乐伐替尼治疗耐药的机制 | 首次发现PIVKA-II通过上调NQO1稳定p65蛋白,激活NF-κB/CXCL12轴招募Treg细胞介导治疗耐药的新机制 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探究PIVKA-II阳性肝细胞癌对免疫联合治疗耐药的机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,体外实验,体内实验 | NA | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 156例手术切除患者和104例接受治疗患者,其中22例进行单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2025-10-05 |
The loss of microRNA-26b promotes aortic calcification through the regulation of cell-specific target genes
2025-Sep-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf117
PMID:40737220
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研究论文 | 本研究首次揭示microRNA-26b缺失通过调控细胞特异性靶基因促进主动脉钙化的机制 | 首次发现miR-26b在主动脉钙化中的关键作用,结合单细胞转录组学和网络分析揭示细胞特异性靶点 | NA | 探索miR-26b在血管钙化中的潜在作用机制 | miR-26b基因敲除小鼠和主动脉瘤或瓣膜相关主动脉病变患者的主动脉组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | micro-PET/CT成像, 18F-氟化钠标记, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 网络分析 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | miR-26bKO小鼠和人类主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 138 | 2025-10-05 |
Tumor microenvironment delineates differential responders to trastuzumab emtansine in HER2-positive metastatic breast cancer patients previously treated with pyrotinib: an exploratory biomarker analysis of a phase II study (NJMU-BC02)
2025-Sep-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02409-2
PMID:41016944
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研究论文 | 探索T-DM1在既往接受吡咯替尼治疗的HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效及肿瘤微环境生物标志物 | 首次发现癌细胞低细胞周期活性、活化巨噬细胞和CD8+ T细胞与T-DM1良好疗效相关 | 样本量较小,需更大规模研究验证生物标志物 | 评估T-DM1在既往接受吡咯替尼治疗的HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效和安全性 | HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 36名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-05 |
PD-L1(+) tumor-associated macrophages induce CD8(+) T Cell exhaustion in hepatocellular carcinoma
2025-Sep-29, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101234
PMID:41027276
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、空间分析和功能实验,揭示了PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌中诱导CD8阳性T细胞耗竭的关键作用 | 首次系统阐明PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞通过GM-CSF诱导途径促进CD8阳性T细胞耗竭的具体机制,并证明抗GM-CSF与抗PD-L1联合治疗的协同效应 | 研究样本量相对有限,主要基于手术标本,缺乏更大规模的前瞻性验证 | 阐明PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌免疫抑制微环境中的具体功能和机制 | 肝细胞癌患者肿瘤样本、体外培养的巨噬细胞和CD8阳性T细胞、小鼠原位肝癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光染色、体外功能实验、体内治疗模型 | 小鼠原位肝癌模型 | 单细胞转录组数据、空间分布数据、免疫荧光图像 | 113例肝细胞癌患者手术标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-05 |
Treg-microglia partnership in the injured spinal cord preserves Treg cell function and regulates microglial cholesterol metabolism
2025-Sep-29, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.09.001
PMID:41027425
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研究论文 | 本研究揭示了Treg细胞与小胶质细胞在脊髓损伤中的相互作用机制 | 首次发现胸腺来源的Treg细胞通过外周血浸润损伤脊髓,并阐明其通过MHC II和CTLA-4途径调节小胶质细胞胆固醇代谢的神经保护机制 | Treg细胞与微环境相互作用的详细分子机制仍需进一步探索 | 阐明Treg细胞在脊髓损伤中的时空动态和功能作用 | 脊髓损伤模型中的Treg细胞和小胶质细胞 | 免疫学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |