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当前共找到 792 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-08-04 |
SLC16A3 as an immunosuppressive Kupffer cell marker predicts poor prognosis in HBV-positive hepatocellular carcinoma
2025-09-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06861-0
PMID:40898206
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和外部转录组测序数据库，分析SLC16A3在HBV阳性肝细胞癌中的表达及其对肿瘤微环境的影响，并通过临床队列和细胞系实验验证其预后价值 | 首次揭示SLC16A3作为免疫抑制性Kupffer细胞标志物在HBV阳性肝细胞癌中的预后作用，并结合多组学分析阐明其与免疫微环境及代谢模式的关系 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证；临床样本量可能有限，需进一步大规模验证 | 探讨SLC16A3在HBV阳性肝细胞癌中的表达及其对预后和免疫微环境的影响 | HBV阳性肝细胞癌患者及细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组测序,免疫组化 | NA | 基因表达数据,临床样本 | 多个外部验证数据集和临床队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-08-02 |
Inferring spatial single-cell-level interactions through interpreting cell state and niche correlations learned by self-supervised graph transformer
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.21.608964
PMID:41256640
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研究论文 | 提出GITIII，一种基于自监督图变换器的轻量级可解释模型，通过解释细胞状态与微环境相关性来推断空间单细胞水平的细胞间相互作用。 | 创新性地将细胞视为词、周围细胞邻域视为上下文，利用自监督图变换器学习细胞状态与微环境的相关性，从而推断CCI，解决了当前分析中配体-受体对测量有限、空间编码不足和可解释性低的问题。 | 摘要中未提及明确限制，但可能受限于配体-受体对测量的有限性、模型对数据质量的依赖或计算资源的约束。 | 开发一种可解释的深度学习模型，以单细胞分辨率从成像空间转录组数据中推断细胞间相互作用，并应用于脑和肿瘤微环境。 | 来自多个物种、器官和平台的四个空间转录组数据集，包括脑和肿瘤微环境。 | 深度学习 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 图变换器 | 空间转录组图像及基因表达数据 | 四个空间转录组数据集，具体规模未在摘要中说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 103 | 2026-08-01 |
Single-cell RNA sequencing reveals the adverse role of cDC3s in the response of ulcerative colitis patients to anti-TNF-α therapy
2025-09-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06909-1
PMID:41029683
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示溃疡性结肠炎患者对抗TNF-α治疗反应中cDC3s的不利作用 | 首次在抗TNF-α治疗前后对UC患者肠道黏膜组织进行单细胞测序，并关联治疗反应，发现cDC3s比例减少及其与成纤维细胞的相互作用减弱可作为预测治疗结果的潜在生物标志物 | 样本量可能有限，需进一步验证cDC3s作为生物标志物的可靠性，且机制研究尚浅 | 探究UC患者抗TNF-α治疗反应中免疫细胞动态变化，特别是cDC3s的作用 | 溃疡性结肠炎患者的肠道黏膜组织免疫细胞 | 单细胞测序 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | UC患者治疗前后肠道黏膜组织样本，具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-08-01 |
SH3BP5-driven metabolic-immune crosstalk in DLBCL: a prognostic biomarker and therapeutic target for reshaping immunosuppressive microenvironment
2025-09-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06951-z
PMID:40993727
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研究论文 | 本研究探讨SH3BP5在弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）中的表达及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力，揭示其驱动代谢-免疫串扰并重塑免疫抑制微环境的机制 | 首次多维度解析SH3BP5在DLBCL ABC亚型中的过表达及其与免疫逃逸和代谢重编程的关联，提出其作为预后标志物和治疗靶点的新见解 | 研究主要基于公开数据集和体外实验，缺乏大规模临床队列和体内功能验证 | 评估SH3BP5作为DLBCL预后生物标志物和治疗靶点的价值，阐明其在肿瘤代谢和免疫微环境中的作用机制 | 弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者样本及细胞系 | 生物信息学、肿瘤免疫学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、功能实验 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | 多个数据集及验证队列（具体样本量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-08-01 |
Integrative single-cell and machine learning approach to characterize immunogenic cell death and tumor microenvironment in LUAD
2025-09-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06889-2
PMID:40993741
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和机器学习方法，表征肺腺癌中免疫原性细胞死亡（ICD）相关的转录特征，并构建预后模型ICDRS，验证其预测性能及SLC2A1的致癌作用 | 基于超过100种机器学习算法组合筛选出CoxBoost+SuperPC方法构建ICDRS模型，该模型在多个队列中优于112个已发表的LUAD签名；首次结合单细胞分析揭示巨噬细胞具有最高ICD活性 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探讨ICD在肺腺癌进展和免疫治疗反应中的具体作用，并开发稳健的预后生物标志物 | 肺腺癌患者样本、细胞系及异种移植模型 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、CCK-8、Transwell、集落形成、异种移植实验 | CoxBoost、SuperPC | 单细胞转录组数据、基因表达数据、临床数据 | 六个外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-11-19 |
Tumor microenvironment delineates differential responders to trastuzumab emtansine in HER2-positive metastatic breast cancer patients previously treated with pyrotinib: an exploratory biomarker analysis of a phase II study (NJMU-BC02)
2025-09-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02409-2
PMID:41016944
|
研究论文 | 探索T-DM1在既往接受吡咯替尼治疗的HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效及肿瘤微环境生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序揭示癌细胞低细胞周期活性、活化巨噬细胞和CD8+ T细胞与T-DM1良好疗效相关 | 样本量较小（36例），为探索性生物标志物分析 | 评估T-DM1在既往接受吡咯替尼和/或曲妥珠单抗+帕妥珠单抗治疗失败的HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效和安全性 | HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 36例HER2阳性转移性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-10-05 |
Bone marrow B lymphopoiesis accelerates early cerebral amyloid pathology
2025-09-18, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02419-0
PMID:40962797
|
研究论文 | 本研究揭示了骨髓B淋巴细胞生成通过IL-6信号通路加速早期脑淀粉样蛋白病理的机制 | 首次发现Aβ在AD患者颅骨骨髓中积累，并证实骨髓来源的年龄相关B细胞通过增强小胶质细胞反应性加剧AD神经病理 | 研究主要基于小鼠AD模型，人类样本验证有限 | 探究骨髓造血系统改变在阿尔茨海默病神经炎症和脑Aβ病理中的作用 | AD患者骨髓样本、5×FAD和APP/PS1小鼠模型、IL-6敲除小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 流式细胞术、细胞追踪分析、单细胞测序、体外小胶质细胞培养 | NA | 细胞计数数据、基因表达数据、行为学数据 | 两种经典AD小鼠模型（5×FAD和APP/PS1）及IL-6敲除小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-09-06 |
Screening, Validation, and Machine Learning-Based Evaluation of Serum Protein Biomarkers for Esophageal Squamous Cell Carcinoma Based on Single-Cell Subtype-Specific Genes
2025-09-05, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.5c00475
PMID:40799020
|
研究论文 | 基于单细胞亚型特异性基因筛选、验证血清蛋白生物标志物，并利用机器学习构建食管鳞状细胞癌诊断模型 | 整合scRNA-seq、蛋白质组学和ELISA技术，利用成纤维细胞和上皮细胞的异质性相关基因开发诊断流程，并构建了交互式网络诊断工具 | 模型在验证集的AUC为0.767，性能有待进一步提升 | 开发食管鳞状细胞癌的早期诊断生物标志物和诊断模型 | 食管鳞状细胞癌患者、高级别上皮内瘤变病例和正常对照 | 数字病理学 | 食管癌 | scRNA-seq, 蛋白质组学, ELISA, 机器学习 | SVM | 蛋白质表达数据 | 344例ESCC患者、46例HGIN病例和390例正常对照 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2026-05-12 |
ArchVelo: Archetypal Velocity Modeling for Single-cell Multi-omic Trajectories
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.14.676182
PMID:41000980
|
研究论文 | 介绍了ArchVelo，一种利用单细胞同时测定的染色质可及性（scATAC-seq）和转录组（scRNA-seq）数据来建模基因调控和推断细胞轨迹的新方法 | 将染色质可及性表示为基因调控程序的集合（原型），并建模其对转录的动态影响，与传统方法相比提高了推理准确性和基因级潜伏时间对齐能力 | NA | 从静态单细胞测量中推断动态细胞过程，建模基因调控并识别细胞轨迹 | 发育中的小鼠大脑、人类造血系统以及响应病毒感染的CD8 T细胞 | 机器学习 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | 原型模型（Archetypal Velocity Model） | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞ATAC测序， 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2026-07-23 |
TRAF3IP2-AS1 Deficiency Induces Necroptosis to Promote Pancreatic Cancer Liver Metastasis
2025-09-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4784
PMID:40586914
|
研究论文 | 发现TRAF3IP2-AS1缺失通过诱导坏死性凋亡促进胰腺癌肝转移，并揭示了其分子机制及免疫抑制微环境形成 | 首次发现长链非编码RNA TRAF3IP2-AS1通过调控MLKL mRNA稳定性和RIPK3磷酸化来抑制坏死性凋亡，并揭示TGFβ1反馈环路在平衡坏死性凋亡中的作用 | 仅使用患者来源类器官模型和小鼠模型，未在更大样本队列中验证；机制研究主要集中于体外实验 | 探究TRAF3IP2-AS1在胰腺癌肝转移中的作用及分子机制 | 胰腺导管腺癌患者样本、患者来源类器官、TGFβ1条件性敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、条件性基因敲除小鼠模型 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 111 | 2026-07-23 |
Tumor-Specific MHC-II Activates CD4+ and CD8+ T Cells in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma to Boost Immunotherapy Efficacy
2025-09-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4383
PMID:40540325
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和T细胞受体测序，揭示肿瘤特异性MHC-II通过激活CD4+和CD8+ T细胞增强头颈鳞癌免疫治疗效果 | 首次鉴定肿瘤特异性MHC-II作为头颈鳞癌新辅助免疫治疗的优越预测标志物，并阐明其通过诱导趋化因子CCL5招募T细胞、激活Th1免疫应答及依赖CD4+ T细胞抑制肿瘤生长的机制 | NA | 探究肿瘤特异性MHC-II在头颈鳞癌新辅助免疫治疗中的作用机制及其作为生物标志物的价值 | 头颈鳞癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 头颈鳞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, T细胞受体序列 | II期新辅助免疫治疗临床试验前的头颈鳞癌活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 112 | 2026-07-10 |
Paired single-cell and spatial transcriptional profiling reveals a central osteopontin macrophage response mediating tuberculous granuloma formation
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01559-25
PMID:40772762
|
研究论文 | 通过配对单细胞和空间转录组测序揭示了骨桥蛋白巨噬细胞在结核肉芽肿形成中的核心作用 | 首次结合单细胞与空间转录组分析，绘制了人类结核肉芽肿的细胞转录层结构，并鉴定出SPP1/骨桥蛋白表达的巨噬细胞为关键调节细胞群 | 样本数量有限，且主要依赖于活检组织，可能无法完全代表肉芽肿的动态发展过程 | 解析结核肉芽肿的细胞组成、空间组织及分子调控机制 | 结核病患者活检组织中的肉芽肿 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多名结核病患者活检标本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-07-10 |
Defining the host dependencies and the transcriptional landscape of RSV infection
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01010-25
PMID:40815167
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研究论文 | 该论文结合全基因组CRISPR敲除筛选和单细胞RNA测序，解析呼吸道合胞病毒（RSV）感染中宿主依赖性因素及转录组景观 | 首次联合CRISPR筛选和单细胞测序，揭示RSV感染细胞与旁观者细胞的差异转录模式，并系统比较29个已发表筛选结果 | 未提供具体局限性说明 | 阐明RSV感染的宿主决定因素及宿主应答的细胞类型特异性转录特征 | RSV感染的宿主细胞及未感染旁观者细胞 | 机器学习 | 呼吸道合胞病毒感染 | CRISPR敲除筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29个已发表筛选研究（覆盖17种病毒的交叉分析） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 114 | 2026-07-10 |
AP2X-1 is a negative regulator of Toxoplasma gondii sexual commitment
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00052-25
PMID:40823841
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研究论文 | 本研究揭示了AP2X-1是弓形虫有性发育的关键负调控因子，通过调节HDAC3/MORC复合体功能抑制缓殖子分化和有性转化 | 首次发现AP2X-1作为负调控因子控制弓形虫有性发育，阐明其通过影响染色质可及性和HDAC3/MORC复合体功能的新机制 | 未明确AP2X-1与HDAC3/MORC复合体相互作用的分子细节，且体内实验仅局限于小鼠模型 | 探究弓形虫生命周期转换的调控机制，特别是有性发育的负调控因子 | 弓形虫AP2X-1基因及其在速殖子、缓殖子、裂殖子阶段的表达和功能 | 分子生物学 | 弓形虫病 | 单细胞测序, CUT&Tag, ATAC-seq, 基因敲除 | NA | 测序数据, 基因表达数据 | 弓形虫野生型及AP2X-1敲除株, 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-07-05 |
Single-cell dissection of the genotype-immunophenotype relationship in glioblastoma
2025-Sep-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf129
PMID:40215269
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究胶质母细胞瘤的基因型与免疫表型关系 | 利用基因工程小鼠模型在单细胞水平系统性地描绘了三种胶质母细胞瘤亚型（EGFRvIII、PDGFB和NF1驱动）的基因型-免疫表型关系 | 未明确提及局限性，但可能包括小鼠模型与人类肿瘤的差异以及样本量限制 | 揭示胶质母细胞瘤中驱动突变对肿瘤微环境免疫表型的影响，为人鼠整合分析平台提供基础 | 基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型（EGFRvIII、PDGFB和NF1驱动突变） | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种基因工程小鼠模型，具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2026-07-04 |
Current concepts in the pathogenesis and clinical management of lymphangioleiomyomatosis
2025-09-01, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000001185
PMID:40501369
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综述 | 综述了淋巴管平滑肌瘤病在发病机制和临床管理方面的最新进展，包括激素通路、免疫系统相互作用、mTOR信号抑制和肿瘤微环境等 | 整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和人工智能等新技术在该罕见病诊断和治疗开发中的应用潜力 | 未明确讨论当前研究的局限性，可能受限于罕见病的样本量小和研究数据有限 | 总结淋巴管平滑肌瘤病的发病机制和治疗管理的最新研究进展，为未来诊断和治疗策略提供方向 | 淋巴管平滑肌瘤病（LAM）及其相关细胞和分子机制 | 机器学习 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序， 空间转录组学， 人工智能 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 117 | 2026-07-04 |
Taming renal inflammation: signaling pathways and therapeutic advances in lupus nephritis
2025-09-01, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-025-04434-3
PMID:40890617
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综述 | 本文综述了狼疮性肾炎的免疫发病机制、信号通路及治疗进展，强调了单细胞转录组学和多组学平台在个性化治疗中的应用 | 整合新兴的单细胞转录组学与多组学平台，重点介绍CD19靶向CAR-T细胞疗法在狼疮性肾炎中诱导无药缓解的突破性进展 | 未提供定量数据或荟萃分析结果，主要基于已有研究的定性总结 | 总结狼疮性肾炎的免疫病理机制及新兴治疗策略，推动精准医学应用 | 狼疮性肾炎患者的肾脏组织及免疫细胞 | 生物信息学, 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞转录组学, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 信号通路数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-06-26 |
How Single-Cell Transcriptomics of Hydractinia Is Informing the Evolution of Cnidarian Sensory Systems
2025-09-26, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf090
PMID:40504553
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综述 | 利用单细胞转录组学揭示水螅虫感觉系统的进化信息 | 通过构建更新的成年水螅虫群体单细胞转录组图谱，系统研究感觉细胞类型（如刺细胞和神经元）及其基因表达的进化 | 尚未明确说明研究的具体局限性 | 探究水螅虫感觉系统的细胞生物学和进化机制 | 两种水螅虫物种：H. symbiolongicarpus 和 H. echinata 的成年群体 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2026-06-26 |
Shedding Light on Patterns of Unconventional Expression of Opsin Genes in Hydra vulgaris
2025-09-26, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf100
PMID:40581592
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研究论文 | 通过分析水螅单细胞RNA测序和染色质可及性数据，揭示了视蛋白基因在神经元和非神经元细胞类型中的非常规表达模式 | 首次系统描绘了刺胞动物水螅中视蛋白基因在非神经元细胞中的广泛表达及其与发育基因的共调控关系 | 基于已发表数据的再分析，可能受限于原始实验的覆盖度和分辨率 | 探究刺胞动物水螅中视蛋白基因的非神经元表达模式及其潜在功能 | 水螅（Hydra vulgaris）的多种细胞类型及其分化状态 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序, 转座酶可及性染色质测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 已发表的水螅单细胞RNA测序和ATAC测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-06-26 |
Cancer-associated fibroblast-derived extracellular vesicles loaded with GLUT1 inhibitor synergize anti-PD-L1 to suppress tumor growth via degrading matrix stiffness and remodeling tumor microenvironment
2025-09-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.113998
PMID:40609836
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研究论文 | 本研究首次利用癌症相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡装载GLUT1抑制剂BAY-876，通过降解基质刚性和重塑肿瘤微环境，协同抗PD-L1治疗抑制肿瘤生长 | 首次将CAFs来源的细胞外囊泡作为药物载体靶向GLUT1高表达的CAFs和肿瘤细胞，实现肿瘤基质特异性治疗以增强免疫检查点抑制剂的疗效 | 未提供明确的局限性信息 | 开发一种靶向肿瘤微环境代谢的联合免疫疗法，通过抑制GLUT1改善基质刚性和免疫抑制状态 | 肺癌细胞系、癌症相关成纤维细胞、小鼠肺癌模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |