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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-03-24 |
Inflammatory, transcriptomic, and cell fate responses underlying the mammalian transmission of avian influenza viruses
2025-09-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00647-25
PMID:40778772
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研究论文 | 本研究通过分析雪貂鼻腔上皮对一组H1N1禽流感病毒感染的反应,揭示了与病毒空气传播表型相关的宿主应答特征 | 首次系统描述了禽流感病毒在哺乳动物呼吸道(鼻腔上皮)感染时,与空气传播能力相关的宿主转录组、炎症反应和细胞命运变化 | 研究主要基于雪貂模型,结果向人类外推需谨慎;未深入验证特定分子通路在传播中的因果机制 | 探究禽流感病毒在哺乳动物呼吸道传播的宿主决定因素 | H1N1禽流感病毒株及雪貂鼻腔上皮细胞 | NA | 禽流感 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 雪貂鼻腔上皮样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-03-24 |
Multi-Omics Validation of Myelin Water Fraction as a Myelin-Specific MRI Biomarker
2025-Sep-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.27.25334582
PMID:40950466
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,验证了髓鞘水分数作为髓鞘特异性MRI生物标志物的生物学相关性 | 首次将BMC-mcDESPOT MRI方法与高通量血浆蛋白质组学和空间转录组学相结合,从分子层面验证了MWF的髓鞘特异性 | 研究样本仅限成人,未涵盖发育或衰老过程;区域分析限于主要白质和深部灰质区域 | 验证髓鞘水分数作为髓鞘特异性MRI生物标志物的生物学有效性 | 成人主要白质和深部灰质区域 | 神经影像学 | 神经系统疾病 | BMC-mcDESPOT MRI成像,高通量血浆蛋白质组学,空间转录组学 | 贝叶斯蒙特卡洛分析 | MRI图像,蛋白质组数据,基因表达数据 | NA | SomaLogic, Allen Institute | 血浆蛋白质组学,空间转录组学 | SomaScan 7k平台,Allen Human Brain Atlas | SomaScan 7k蛋白质组分析平台,Allen人脑图谱空间基因表达数据 |
| 103 | 2026-03-21 |
Gastric cancer adapts high lipid microenvironment via suppressing PPARG-FABP1 axis after arriving in the lymph node
2025-09, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103759
PMID:40694956
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌细胞在淋巴结转移过程中通过抑制PPARG-FABP1轴适应高脂微环境的机制 | 揭示了胃癌细胞在淋巴结转移中通过下调PPARγ-FABP1轴来适应高脂微环境并避免铁死亡的新机制 | NA | 研究胃癌细胞在淋巴结转移过程中的代谢适应,特别是脂质代谢重编程 | 胃癌细胞 | 肿瘤代谢 | 胃癌 | 非靶向脂质组学测序、肿瘤细胞流式分选、RNA测序、单细胞测序、透射电子显微镜、BODIPY 581/591染色、ChIP-qPCR | NA | 测序数据、显微镜图像、染色数据 | NA | NA | 单细胞测序、RNA测序、脂质组学 | NA | NA |
| 104 | 2026-03-21 |
Multi-Omics Integrated Analysis of the Protective Effect of Tertiary Lymphoid Structures and Associated Key Regulatory Genes in Human Gallbladder Cancer
2025-09, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70037
PMID:40997892
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析探讨了三级淋巴结构(TLSs)在人类胆囊癌中的保护作用及其相关关键调控基因 | 首次在胆囊癌中系统评估TLS与预后的关联,并利用单细胞RNA测序、批量RNA测序和深度学习筛选出六个TLS相关候选基因,通过实验验证了CTSG和HSPB8在免疫调节中的作用 | 样本量相对较小(85例患者),且研究主要基于回顾性分析,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究TLS在胆囊癌中的预后价值及其相关基因的调控机制 | 胆囊癌患者组织样本及相关基因 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 深度学习 | 深度学习 | RNA测序数据 | 85例胆囊癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-03-22 |
Spatial Transcriptomics Reveals Differential Inflammatory Pathways in Discoid Lupus Erythematosus and Lichen Planus
2025-Sep, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.02.148
PMID:40113031
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2026-03-20 |
An integrated single-nucleus and spatial transcriptomics atlas reveals the molecular landscape of the human hippocampus
2025-Sep, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02022-0
PMID:40739059
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,揭示了人类海马体的分子景观和细胞类型空间组织 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术,构建了人类海马体的综合分子图谱,并利用NMF和标签转移方法整合数据,揭示了兴奋性和抑制性突触后特化的空间组织模式 | 研究仅基于十名成年神经典型捐赠者的样本,样本量相对较小,且可能未涵盖所有海马体亚区域或疾病状态 | 解析人类海马体中细胞类型的分子特征和空间组织,以理解其与认知和情绪功能的关联 | 人类海马体组织样本 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 非负矩阵分解, 标签转移 | 转录组数据 | 十名成年神经典型捐赠者的海马体样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 107 | 2026-03-18 |
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579839
PMID:38405697
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研究论文 | 本文提出了一种名为NCLUSION的非参数聚类方法,用于单细胞RNA测序数据分析,该方法能够同时进行聚类和标记基因选择 | 提出了一种基于无限混合模型的非参数聚类方法,利用贝叶斯稀疏先验在聚类过程中同步识别标记基因,避免了传统方法中事后差异表达分析带来的高假阳性率问题 | 未明确说明方法在特定细胞类型或复杂组织中的适用性限制,也未讨论对批次效应的处理能力 | 开发一种可扩展的单细胞RNA测序数据聚类方法,同时解决聚类参数依赖和标记基因识别假阳性率高的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无限混合模型,变分推断算法 | 基因表达数据 | 可达数百万细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-03-17 |
Tryptophan metabolic dysregulation drives immune activation and cartilage degradation in osteoarthritis: Functional validation integrated with transcriptomic and single-cell RNA sequencing
2025-09-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152497
PMID:40907267
|
研究论文 | 本研究系统探索了色氨酸代谢异常在骨关节炎发病机制中的潜在作用,整合转录组学和单细胞RNA测序数据 | 首次系统揭示色氨酸代谢失调驱动骨关节炎免疫激活和软骨降解的代谢机制,提出犬尿氨酸通路作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于体外细胞模型和测序数据,缺乏体内实验验证和临床样本的直接证据 | 阐明色氨酸代谢在骨关节炎发病中的作用机制 | 骨关节炎软骨组织、IL-1β刺激的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2026-03-17 |
Single-cell transcriptomic analysis of interactions of peritoneal mesenchymal stem cells with macrophages in prevention of peritoneal membrane injury
2025-09-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152491
PMID:40829206
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了腹膜间充质干细胞与巨噬细胞的相互作用在预防腹膜透析诱导的腹膜损伤中的作用 | 首次在腹膜损伤模型中应用单细胞RNA测序技术解析pMSCs通过调控巨噬细胞亚群发挥保护作用的分子机制 | 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的有效性仍需验证;单细胞测序样本量有限 | 探究腹膜间充质干细胞(pMSCs)与巨噬细胞相互作用在预防腹膜透析诱导的腹膜膜损伤中的机制 | Sprague-Dawley大鼠的腹膜组织、腹膜间充质干细胞、巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 腹膜损伤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 大鼠模型(具体数量未明确说明) | Illumina | 单细胞RNA-seq | HiSeq X Ten | HiSeq X Ten平台进行单细胞RNA测序,使用Cell Ranger软件和Mouse_ref_Immgen数据集进行分析 |
| 110 | 2026-03-17 |
Rutaecarpine alleviates liver fibrosis by modulating the TRPV1/Connexin 43 axis: A study based on transcriptome data, single-cell sequencing data, and cell experiments
2025-09-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152506
PMID:40848544
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研究论文 | 本研究基于转录组数据、单细胞测序数据和细胞实验,探讨了吴茱萸碱通过调节TRPV1/Connexin 43轴缓解肝纤维化的潜在机制 | 结合转录组、单细胞测序和细胞实验,首次揭示了吴茱萸碱通过调控TRPV1/Cx43轴缓解肝纤维化的新机制 | 研究主要基于体外细胞模型和公开数据集,缺乏体内动物模型的验证 | 探索吴茱萸碱缓解肝纤维化的潜在分子机制 | 肝纤维化相关的分子通路(TRPV1/Cx43轴)及吴茱萸碱的药理作用 | 生物信息学与分子生物学 | 肝纤维化 | 转录组分析、单细胞测序、分子对接、细胞模型实验 | 逻辑回归模型、ROC曲线分析、分子对接模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据、体外细胞实验数据 | 基于公开数据集GSE84044,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-03-16 |
Loss of BAP1 defines a unique subtype of TP53-mutated de novo AML and confers sensitivity to BCL-xL inhibitors
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026417
PMID:40540751
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研究论文 | 本文发现BAP1缺失与TP53突变在急性髓系白血病中共存,定义了独特的亚型,并揭示了其对BCL-xL抑制剂的敏感性 | 首次揭示BAP1缺失与TP53突变在AML中的协同作用,定义了新的白血病亚型,并发现其依赖BCL2L1表达,对BCL-xL抑制剂敏感 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,人类疾病异质性可能未被完全捕捉 | 探究与TP53缺陷协同促进红细胞白血病转化的遗传改变 | TP53突变的急性髓系白血病患者及小鼠模型 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-03-14 |
Multi-step genomics on single cells and live cultures in sub-nanoliter capsules
2025-Sep-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.642839
PMID:40166192
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研究论文 | 本文开发了一种名为CAGEs的胶囊技术,用于在单细胞水平上进行高通量多步基因组学分析,包括活细胞培养与全基因组读出的结合 | CAGEs胶囊技术首次实现了在单细胞水平上结合活细胞培养与高通量多步基因组学分析,突破了传统方法在活细胞分析中的限制 | 未明确提及技术局限性,但可能涉及胶囊制备的复杂性或特定应用场景的适应性 | 开发一种新型单细胞分析平台,以支持活细胞的高通量多步基因组学测量 | 单细胞和活细胞培养 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞测序、基因组学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 数万个扩展克隆的转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | CAGEs胶囊技术 |
| 113 | 2026-03-10 |
Single-cell transcriptome combined with genetic tracing reveals a roadmap of fibrosis formation during proliferative vitreoretinopathy
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424487122
PMID:40920930
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪技术,揭示了增殖性玻璃体视网膜病变(PVR)中纤维化形成的细胞起源和机制,并识别了TSP-1作为关键驱动基因 | 首次结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪,系统绘制了PVR纤维化形成的细胞路线图,并发现TSP-1作为治疗靶点 | NA | 解析增殖性玻璃体视网膜病变(PVR)中纤维化形成的细胞机制,以开发治疗策略 | 视网膜色素上皮细胞、免疫细胞和Müller细胞在PVR病变中的贡献 | 数字病理学 | 增殖性玻璃体视网膜病变 | 单细胞转录组学,遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-03-10 |
Dynamic and precise electromagnetic levitation of single cells
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2512246122
PMID:40920932
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Electro-LEV的创新平台,它结合电磁和磁悬浮原理,实现了在3-D微流体环境中对单细胞位置进行动态精确控制 | 该平台通过周期性调制和跟踪细胞在z轴的位置,能够区分单细胞与细胞簇的悬浮行为,并显著提高了悬浮分选的纯度和效率 | NA | 开发一种用于动态3-D控制细胞位置的新平台,以研究细胞异质性、区分细胞大小和类型,并提高细胞分选效率 | 单细胞和细胞簇 | 数字病理学 | NA | 电磁悬浮和磁悬浮 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2026-03-06 |
The pericardium forms as a distinct structure during heart formation
2025-Sep-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63599-5
PMID:41022776
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研究论文 | 本研究揭示了心包在心脏形成过程中作为一个独立结构起源于侧板中胚层中的特定间皮祖细胞 | 发现心包起源于侧板中胚层中与经典心区不同的特定间皮祖细胞,并证明其形成过程独立于心脏形成 | NA | 探究心包的发育起源及其在心脏形态发生中的作用 | 斑马鱼、哺乳动物和新生大鼠的心包发育过程 | 发育生物学 | 小儿扩张型心肌病 | 单细胞转录组学、光片成像、机器学习支持的细胞追踪 | 机器学习 | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-03-06 |
A Novel Proteoglycan-4 Isoform Drives Skeletal Regeneration
2025-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.15.676417
PMID:41001003
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研究论文 | 本文通过小鼠胫骨骨折模型,揭示了PRG4蛋白在骨骼再生中的新作用,特别是其独特剪接异构体在骨形成中的关键功能 | 发现了PRG4的一个新型剪接异构体(缺失三个编码外显子),并首次证明其在骨骼再生中具有成骨作用,突破了PRG4仅作为关节软骨润滑蛋白的传统认知 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证;局部siRNA递送可能影响其他细胞过程 | 探究PRG4在骨骼再生过程中的功能及其剪接异构体的作用 | 小鼠胫骨骨折模型及骨折骨痂组织 | 数字病理学 | 骨骼疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲低 | NA | RNA序列数据 | 多个骨折后时间点的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-03-06 |
Human-mouse cross-species comparison identifies common and unique aspects of intestinal mesenchyme development
2025-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.03.674033
PMID:40950081
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组织学方法,比较了小鼠和人类肠道间充质细胞在发育过程中的细胞身份、多样性和组织结构的异同 | 首次在小鼠和人类之间进行跨物种比较,揭示了肠道间充质细胞类型/状态的高度保守性,同时识别了物种间谱系定义基因的差异 | NA | 探究小鼠和人类肠道间充质细胞在发育过程中的保守性和独特性 | 小鼠和人类发育中的肠道间充质(成纤维细胞)群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荧光原位杂交(FISH)、免疫荧光(IF) | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-03-06 |
Isotope-encoded spatial biology identifies plaque-age-dependent maturation and synaptic loss in an Alzheimer's disease mouse model
2025-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63328-y
PMID:40890115
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研究论文 | 本研究结合质谱成像与稳定同位素标记技术,在阿尔茨海默病小鼠模型中时间标记Aβ斑块,并整合空间转录组学分析,揭示了斑块年龄依赖性成熟与突触丢失的关系 | 首次将稳定同位素标记与质谱成像结合,实现对Aβ斑块从初始沉积开始的时空老化追踪,并独立于小鼠年龄或疾病阶段关联斑块年龄与基因表达变化 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类阿尔茨海默病;技术整合的复杂性可能限制广泛应用 | 探究Aβ斑块随时间演变如何影响周围组织,特别是斑块成熟与神经毒性之间的关系 | App敲入Aβ小鼠模型中的淀粉样蛋白斑块及其周围脑组织 | 空间生物学 | 阿尔茨海默病 | 质谱成像、稳定同位素标记、空间转录组学 | NA | 质谱成像数据、空间转录组数据、结构特异性染料图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-03-05 |
p53 maintains lineage fidelity during lung capillary injury-repair in neonatal hyperoxia
2025-Sep-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182880
PMID:40763040
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研究论文 | 本研究揭示了p53在新生儿高氧损伤后肺毛细血管修复过程中维持内皮细胞谱系保真性的关键作用 | 首次发现Cap2细胞在高氧损伤中被Cap1细胞替代,并证实EC特异性p53缺失可通过诱导过渡性内皮细胞状态改善血管表型和肺泡简化 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;过渡性EC状态的具体调控机制仍需进一步探索 | 探究p53在新生儿高氧诱导肺损伤修复过程中对内皮细胞谱系保真性的调控作用 | 新生小鼠肺组织内皮细胞亚群(Cap1/Cap2)及人类支气管肺发育不良(BPD)伴肺动脉高压样本 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良(BPD) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量(含小鼠模型和人类BPD样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-03-04 |
Tumor-expressed GPNMB orchestrates Siglec-9+ TAM polarization and EMT to promote metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Sep-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503081122
PMID:40892920
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤表达的GPNMB如何通过调控Siglec-9+ TAM极化和EMT来促进三阴性乳腺癌的转移 | 揭示了GPNMB通过诱导单核细胞中次级GPNMB表达,形成前馈放大环路,促进免疫抑制性TAM极化,并首次阐明了GPNMB不同唾液酸化修饰(α2,3 vs α2,6)导致Siglec-9差异识别的机制 | 研究主要基于体外共培养和体内小鼠模型,人类临床样本验证相对有限,且Siglec-9在人体中的功能需进一步验证 | 阐明GPNMB在三阴性乳腺癌转移中的分子机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞、单核细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq)、去卷积分析、体外共培养、体内小鼠模型 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | 基于公开可用的TNBC scRNA-seq数据集和TNBC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |