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当前共找到 964 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals pathogenic mechanism of renal fibrosis in imiquimod-induced lupus nephritis in mice
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102087
PMID:40641741
|
研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术揭示咪喹莫特诱导的小鼠狼疮性肾炎肾纤维化的致病机制 | 首次建立狼疮性肾炎肾脏的单核与空间转录组图谱，识别出外髓质内条纹区成纤维细胞特异性激活及促纤维化巨噬细胞亚型Lyz2 | 研究局限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 阐明狼疮性肾炎肾纤维化的细胞分子病理机制 | 咪喹莫特诱导的狼疮性肾炎小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单核RNA测序数据 | 狼疮性肾炎与对照组小鼠肾脏样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 942 | 2025-10-06 |
PerturbSeq.db: An Integrated Repository for Comprehensive Analysis of Single-cell Perturbation Data
2025-Sep-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169209
PMID:40381983
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研究论文 | 介绍了一个整合单细胞扰动数据的综合数据库PerturbSeq.db | 开发了首个全面整合和统一处理单细胞扰动数据的数据库，采用统一处理流程确保数据一致性 | 未提及具体的数据更新频率和长期维护计划 | 解决单细胞扰动研究领域数据可访问性和整合性的挑战 | 单细胞扰动数据集，包括遗传和化学干预数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 189个数据集来自77项研究，涵盖约50种不同细胞系或组织 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 943 | 2025-10-06 |
Reference Vector-guided Evolutionary Algorithm for cluster analysis of single-cell transcriptomes
2025-Sep, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108873
PMID:40499345
|
研究论文 | 提出一种基于参考向量引导的进化算法RVEA-CAST，用于单细胞转录组数据的聚类分析 | 首次将单细胞转录组聚类问题建模为多目标优化问题，并设计了三个问题感知的变异算子 | 仅在十个真实scRNA-seq数据集上验证，需要更多数据集验证通用性 | 解决单细胞RNA测序数据的聚类分析问题 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 参考向量引导的进化算法 | 基因表达数据 | 十个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 944 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals distinct immune characteristics of hepatocellular carcinoma in HBV-positive vs. HBV-negative cases
2025-Sep, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2871
PMID:40636452
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较HBV阳性和阴性肝细胞癌的免疫特征差异 | 首次在单细胞水平揭示HBV感染如何改变肝细胞癌肿瘤微环境中免疫细胞的组成和状态 | 未完全阐明HBV诱导肿瘤微环境改变的具体分子机制 | 探究HBV感染对肝细胞癌免疫微环境的影响 | HBV阳性和阴性肝细胞癌患者的肿瘤样本 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 945 | 2025-10-06 |
Comparison of single-cell long-read and short-read transcriptome sequencing via cDNA molecule matching: quality evaluation of the MAS-ISO-seq approach
2025-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf089
PMID:40630932
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研究论文 | 通过cDNA分子匹配比较单细胞长读长和短读长转录组测序方法，评估MAS-ISO-seq方法的质量 | 首次通过细胞条形码和UMI匹配的cDNA分子直接比较长读长和短读长单细胞转录组测序方法 | 仅使用10x Genomics 3' cDNA平台，未评估其他单细胞技术平台 | 评估长读长和短读长单细胞转录组测序方法的可比性和偏差 | 单细胞转录组测序数据 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序，cDNA测序 | NA | 基因表达数据，转录本序列 | NA | 10x Genomics, Illumina, Pacific Biosciences | 单细胞RNA-seq，长读长测序，短读长测序 | 10x Chromium, Illumina测序平台, PacBio测序平台 | 10x Genomics 3' cDNA，Illumina短读长测序，Pacific Biosciences长读长测序 |
| 946 | 2025-10-06 |
Sirtuin 2 regulates NOD-like receptor protein 3/nuclear factor kappa B axis to promote cartilage repair in osteoarthritis
2025-Sep, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.70031
PMID:40620356
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研究论文 | 本研究揭示了SIRT2通过调节NF-κB/NLRP3信号轴促进骨关节炎软骨修复的分子机制 | 首次阐明SIRT2通过去乙酰化NF-κB p65抑制NLRP3炎症小体激活，从而促进软骨修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未进行人体临床试验验证 | 阐明SIRT2在骨关节炎中调节NLRP3/NF-κB信号轴促进软骨修复的作用机制 | 骨关节炎小鼠模型和软骨细胞培养物 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 实时PCR, 共免疫沉淀, 染色质免疫沉淀 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 947 | 2025-10-06 |
Decoding the crossroads of aging and cancer through single-cell analysis: Implications for precision oncology
2025-Sep-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35456
PMID:40268523
|
综述 | 通过单细胞分析探讨衰老与癌症的交叉机制及其对精准肿瘤学的意义 | 整合单细胞技术与空间转录组学、分子探针和人工智能等先进工具，揭示衰老在肿瘤微环境中的异质性作用 | NA | 阐明衰老过程对癌症发生、发展及治疗耐药性的影响机制 | 衰老细胞与肿瘤微环境中的细胞异质性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞分析，空间转录组学，人工智能 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 948 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing identifies a unique ZEB2-Regulated Clec4d+ macrophage state contributing to early inflammatory injury in cardiac hypertrophy
2025-Sep-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.177867
PMID:40543740
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定ZEB2调控的Clec4d+巨噬细胞状态在心脏肥大早期炎症损伤中的作用 | 首次在心脏肥大模型中鉴定出Clec4d+巨噬细胞的特异状态，并揭示转录因子ZEB2通过调控Unc93b1促进巨噬细胞炎症激活的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究巨噬细胞在心脏肥大早期炎症反应中的调控机制 | 横向主动脉缩窄(TAC)诱导的心脏肥大小鼠模型心脏组织中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, ChIP-seq, 差异表达分析, 调控网络分析, 轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 25,328个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 949 | 2025-10-06 |
Tissue-origin transcriptomic interactions as indicators of inflammatory aging and aging gene discovery
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110534
PMID:40527241
|
研究论文 | 本研究开发了一种将单细胞RNA测序数据转换为图像表示的方法，用于构建组织特异性炎症衰老时钟 | 首次提出将scRNA-seq数据转换为语义上有意义的图像表示（genomap），通过空间编码转录组相互作用来揭示衰老相关的相互作用模式变化 | 未在文中明确说明具体的研究局限性 | 识别精确的免疫遗传衰老标志物并构建组织特异性炎症衰老时钟 | 衰老过程中的基因-基因相互作用模式和转录组相互作用 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 图像表示学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 950 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics and machine-learning approaches uncover a novel metabolic-related signature associated with cancer-associated fibroblasts in gastric cancer development
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110653
PMID:40543274
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，揭示了胃癌中癌症相关成纤维细胞的代谢相关特征及其预后价值 | 首次发现CAF_6成纤维细胞亚群与胃癌患者不良预后显著相关，并构建了具有强预后相关性的代谢相关特征 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索胃癌中癌症相关成纤维细胞的分子和功能异质性，开发预后预测模型 | 胃癌患者样本数据 | 机器学习 | 胃癌 | 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA测序 | 机器学习组合策略 | 基因表达数据 | GSE15459、GSE26253、GSE183904和TCGA-STAD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 951 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omics analysis reveals the plasticity of isthmus stem cells in gastric carcinogenesis
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110662
PMID:40580616
|
研究论文 | 通过单细胞多组学测序揭示胃峡部干细胞在胃癌发生中的可塑性 | 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，识别出胃峡部干细胞在胃癌背景下的三种不同状态，并重建了胃癌细胞的谱系轨迹 | NA | 探究胃癌发生过程中细胞组成和发育轨迹 | 胃癌患者的配对肿瘤和癌旁组织样本 | 单细胞多组学 | 胃癌 | 单细胞多组学测序，单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学测序，单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 952 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals the expansion and diversity of T cell subsets in the bone marrow microenvironment of chronic myeloid leukemia
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101626
PMID:40612663
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示慢性髓系白血病骨髓微环境中T细胞亚群的扩增和多样性变化 | 首次在单细胞水平系统解析CML患者骨髓T细胞图谱，发现CD8终末效应T细胞的独特特征及其与微环境细胞的相互作用 | 样本量有限，未涉及治疗前后动态变化分析 | 解析慢性髓系白血病骨髓免疫微环境中T细胞的改变特征 | 慢性髓系白血病患者的骨髓T细胞 | 单细胞组学 | 慢性髓系白血病 | 单细胞测序，T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，T细胞受体序列数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 953 | 2025-10-06 |
Single-cell landscape of immunological responses in patients with juvenile idiopathic arthritis
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101577
PMID:40605976
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示幼年特发性关节炎患者免疫细胞的异质性和功能变化 | 首次在JIA患者中系统绘制免疫细胞单细胞图谱，发现sJIA患者特有的干扰素反应异常和MIF-CXCR7/CD44配体-受体对 | 样本量有限（14例患者和4例健康对照），未包含所有JIA亚型 | 解析幼年特发性关节炎患者免疫细胞的转录组特征和功能变化 | 幼年特发性关节炎患者和健康个体的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析，细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 14例JIA患者和4例健康个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 954 | 2025-10-06 |
Blood and urine-based biomarkers in prostate cancer: Current advances, clinical applications, and future directions
2025-Sep, The journal of liquid biopsy
DOI:10.1016/j.jlb.2025.100305
PMID:40606769
|
综述 | 全面概述前列腺癌诊断、预后和预测生物标志物的最新进展、临床应用及未来发展方向 | 整合了液体活检、单细胞组学、人工智能模型等新兴技术在前列腺癌生物标志物研究中的应用 | NA | 总结前列腺癌生物标志物的研究现状并展望未来发展方向 | 前列腺癌患者 | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、液体活检、机器学习 | 人工智能驱动模型 | 血液样本、尿液样本、分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、液体活检 | NA | NA |
| 955 | 2025-10-06 |
Progress and applications of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptome technology in acute kidney injury research
2025-Sep-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102583
PMID:40568028
|
综述 | 概述单细胞RNA测序和空间转录组技术在急性肾损伤研究中的进展与应用 | 整合单细胞转录组与空间组学数据，从多维度分析视角揭示急性肾损伤中细胞异质性和细胞间相互作用的动态过程 | 讨论了单细胞RNA测序与空间组学在急性肾损伤研究中当前存在的技术限制 | 探讨单细胞测序和空间转录组技术在急性肾损伤研究中的应用前景 | 急性肾损伤相关的细胞异质性和组织微环境 | 数字病理 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 956 | 2025-06-17 |
Data-informed insights into sex differences in peripheral blood mononuclear cells from single-cell transcriptomics
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101525
PMID:40520998
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 957 | 2025-06-17 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals epithelial cell alterations in benign prostatic hyperplasia following finasteride treatment
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101526
PMID:40520997
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 958 | 2025-10-06 |
Loss of Plxdc2 exacerbates microglia-mediated neuroinflammation and ischemic brain injury
2025-Sep, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115302
PMID:40345569
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研究论文 | 本研究揭示了Plxdc2蛋白在调节小胶质细胞稳态和减轻缺血性脑损伤中的关键作用 | 首次发现Plxdc2在小胶质细胞中高表达并在脑卒中后显著下调，阐明了其通过PPARγ通路调控NF-κB信号和脂质代谢的新机制 | 研究主要聚焦于小胶质细胞，Plxdc2在其他神经细胞中的作用尚未完全阐明 | 探究Plxdc2在缺血性脑卒中中小胶质细胞功能调节中的作用机制 | 小胶质细胞和缺血性脑损伤模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | scRNA-seq, 转录组分析, 腺相关病毒(AAV)过表达, 慢病毒干扰 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 959 | 2025-10-06 |
3D-printed advanced scaffold armed with exosomes derived from human skeletal stem cell identified by single-cell RNA sequencing enhances osteochondral regeneration
2025-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.04.028
PMID:40487240
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研究论文 | 本研究开发了一种装载人骨骼干细胞外泌体的3D打印水凝胶支架，用于增强骨软骨再生 | 利用单细胞RNA测序鉴定具有高分化潜能的骨骼干细胞，并首次将其外泌体与3D打印技术结合构建新型生物支架 | 研究仅在动物模型中进行验证，尚未进行临床试验 | 开发有效的骨软骨缺损修复策略 | 大鼠骨软骨缺损模型、人骨骼干细胞、骨髓间充质干细胞 | 组织工程 | 骨软骨缺损 | 单细胞RNA测序, 3D打印, 流式细胞术, 高通量测序 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 960 | 2025-10-06 |
Comprehensive study of the murine MASH models' applicability by comparing human liver transcriptomes
2025-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123723
PMID:40404118
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研究论文 | 通过比较人类肝脏转录组，全面评估多种小鼠MASH模型的适用性 | 首次系统整合多种小鼠MASH模型的转录组数据并与人类MASH数据集进行对比分析 | 仅评估了部分常用小鼠模型，未涵盖所有可能的MASH建模方法 | 建立详细的转录组参考以指导MASH研究中的模型选择和实验设计 | 小鼠MASH模型和人类MASH肝脏组织 | 转录组学 | 代谢相关脂肪性肝炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三种小鼠MASH模型（HFD、MCD、CDA-HFD）及CCl₄诱导模型和人类MASH数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |