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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2025-10-06 |
From molecular chaos to precision medicine in the treatment of cardiac hypertrophy: A rational use of natural products by integrating artificial intelligence and multi-omics data
2025-Sep, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107898
PMID:40754044
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综述 | 本文提出通过整合天然产物、人工智能和多组学技术治疗心脏肥大的创新方法 | 首次将天然产物与人工智能和多组学技术相结合,系统阐述心脏肥大的精准医疗策略 | NA | 探索心脏肥大的精准药物治疗新策略 | 心脏肥大的分子机制和天然产物治疗 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞空间转录组学,多组学技术 | 机器学习算法 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 882 | 2025-10-06 |
Integrated multidimensional bioinformatics analysis of the molecular mechanisms of ulcerative colitis-associated colorectal cancer and MMP1 as a potential therapeutic target
2025-Sep, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00917-5
PMID:40681672
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研究论文 | 通过整合多组学分析研究溃疡性结肠炎相关结直肠癌的分子机制并确定MMP1作为潜在治疗靶点 | 首次通过孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合,揭示MMP1在UC相关CRC中的保护作用及免疫调节机制 | 研究依赖于公共数据库数据,需要实验验证 | 研究溃疡性结肠炎相关结直肠癌的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 溃疡性结肠炎和结直肠癌的分子机制 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,全基因组关联研究,分子对接 | 孟德尔随机化分析,蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据,基因组数据 | 来自GEO、TCGA和GWAS数据库的数据 | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
| 883 | 2025-10-06 |
Single-cell immunomics reveals the immunological hallmarks about the onset and different outcomes for ankylosing spondylitis patients
2025-Sep, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-025-07549-y
PMID:40665054
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研究论文 | 通过单细胞免疫组学揭示强直性脊柱炎发病和不同预后的免疫学特征 | 首次通过单细胞RNA测序结合TCR/BCR分析系统揭示AS不同病程阶段的免疫细胞克隆扩增模式和V(D)J基因使用特征 | 样本量有限,未包含其他免疫细胞类型的深入分析 | 探索强直性脊柱炎发生发展和不同预后的免疫学机制 | 健康供者和不同病程阶段AS患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序,T细胞受体分析,B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据,免疫受体序列数据 | 健康供者和不同病程阶段AS患者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 884 | 2025-10-06 |
Semaglutide ameliorates retinal vascular permeability destruction in diabetic retinopathy by AnxA2-mediated MMP-9 activation and basement membrane remodeling
2025-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118409
PMID:40749340
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研究论文 | 本研究揭示索马鲁肽通过上调AnxA2激活MMP-9改善糖尿病视网膜病变中基底膜增厚和血管通透性破坏的分子机制 | 首次发现索马鲁肽通过AnxA2-MMP-9信号轴改善糖尿病视网膜病变,揭示了其不依赖血糖控制的血管保护作用 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究索马鲁肽在糖尿病视网膜病变中的治疗机制 | 2型糖尿病小鼠模型的视网膜组织 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,免疫荧光,免疫组化,Western blot,透射电镜 | NA | 图像,文本 | 糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 885 | 2025-10-06 |
Multi-omics identification of circulating protein biomarkers for intervertebral disc degeneration using Mendelian randomization and scRNA-seq
2025-Sep, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-025-07606-6
PMID:40745068
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法识别与椎间盘退变相关的循环蛋白生物标志物 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序识别椎间盘退变的因果循环蛋白标志物 | 需要进一步的体内验证研究来确认临床相关性和治疗适用性 | 识别与椎间盘退变因果相关的循环蛋白生物标志物 | 椎间盘退变患者和健康个体的循环蛋白及椎间盘组织 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 机器学习分类模型 | 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 | 4907个循环蛋白的蛋白质组数据, FinnGen队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 886 | 2025-10-06 |
Lamin A/C Expression in Hematopoietic Cells Declines During Human Aging and Constrains Atherosclerosis in Mice
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322893
PMID:40605747
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研究论文 | 本研究探讨了人类衰老过程中造血细胞Lamin A/C表达下降对动脉粥样硬化的影响机制 | 首次发现人类衰老与血液白细胞Lamin A/C表达下降相关,并创建了首个体内Lamin A功能获得性模型 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的直接验证有限 | 研究衰老过程中Lamin A/C表达变化对动脉粥样硬化发展的影响 | 人类循环白细胞、Ldlr-/-缺陷小鼠、Lmna-null小鼠和Lmnatg转基因小鼠 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、骨髓移植、活体显微镜检查、油红O染色 | NA | 基因表达数据、图像数据、测序数据 | 人类白细胞样本和多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 887 | 2025-10-06 |
Tricuspid Aortic Valve Regurgitation Associates With Ascending Aortic Aneurysm Through Endothelial Activation and Lipoprotein Infiltration
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323112
PMID:40740135
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研究论文 | 本研究探讨了三尖瓣主动脉瓣反流通过内皮细胞间质激活和脂蛋白浸润与升主动脉瘤形成的关联机制 | 首次揭示了主动脉瓣反流通过双向血流介导的内皮细胞间质激活和载脂蛋白B脂蛋白浸润在升主动脉瘤形成中的独特病理作用 | 研究样本仅限于三尖瓣主动脉瓣患者,未包含其他类型主动脉瓣病变患者 | 研究主动脉瓣反流与血管激活和炎症的关系,探索升主动脉瘤的发病机制 | 接受择期开胸手术的三尖瓣主动脉瓣患者和器官捐献者的主动脉标本 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,免疫组织化学,超声心动图 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,影像数据 | 未明确具体样本数量,包括患者和器官捐献者标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 888 | 2025-10-06 |
Anti-tumor effects on tumor-infiltrating natural killer cells by localized ablative immunotherapy and immune checkpoint inhibitors: An integrated and comparative study using scRNAseq analysis
2025-Sep-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217825
PMID:40436260
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤浸润自然杀伤细胞的调控作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统比较LAIT和ICI对NK细胞的转录调控,发现二者通过不同但互补的机制增强NK细胞抗肿瘤反应 | 研究主要基于小鼠乳腺癌模型,临床转化需要进一步验证 | 阐明局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤浸润自然杀伤细胞的调控机制 | 肿瘤浸润自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠乳腺癌模型,TCGA数据库乳腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 889 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data reveals the key targets of the combination of cisplatin and saikosaponin D in gastric cancer cells
2025-Sep-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152359
PMID:40674817
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析,揭示柴胡皂苷D联合顺铂治疗胃癌细胞的关键靶点 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据,系统分析柴胡皂苷D增强胃癌细胞对顺铂敏感性的分子机制,发现FAK/AKT/mTOR信号通路的关键作用 | 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型验证;样本量相对有限 | 探究柴胡皂苷D增强胃癌细胞对顺铂敏感性的分子机制和潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系(AGS和SGC-7901)及TCGA-GTEx数据库中的胃腺癌数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时PCR, 蛋白质印迹, 网络药理学, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 胃癌细胞系和TCGA-GTEx数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 890 | 2025-10-06 |
HSD17B2 serves as a novel tumor-suppressive regulator in colorectal cancer progression
2025-Sep-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152396
PMID:40706248
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现HSD17B2是结直肠癌进展中的新型肿瘤抑制因子 | 首次系统鉴定HSD17B2在结直肠癌中的肿瘤抑制功能,并通过多数据集整合分析和功能验证证实其作用机制 | 研究主要基于数据库分析和细胞系实验,缺乏更深入的体内机制研究和临床前验证 | 探索结直肠癌发病机制中的关键分子调控因子 | 结直肠癌组织、人结直肠癌细胞系(Caco-2, HT-29, HCT-116)和AOM/DSS诱导的小鼠结直肠癌模型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, WGCNA分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个GEO数据集(GSE103512, GSE39923, GSE44076, GSE68468, GSE221575)和3个人类结直肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 891 | 2025-10-06 |
Integrating transcriptomics, network analysis, and single-cell RNA sequencing to identify and validate key target genes of gynostemma in the treatment of non-alcoholic fatty liver disease
2025-Sep-01, European journal of pharmaceutical sciences : official journal of the European Federation for Pharmaceutical Sciences
IF:4.3Q1
DOI:10.1016/j.ejps.2025.107214
PMID:40706769
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学、网络分析和单细胞RNA测序,探索绞股蓝治疗非酒精性脂肪肝的靶基因和机制 | 首次结合网络分析、机器学习算法和单细胞RNA测序系统鉴定绞股蓝治疗NAFLD的关键靶基因PIM1、TYMS和SLC29A1 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索绞股蓝治疗非酒精性脂肪肝的分子机制和关键靶基因 | 非酒精性脂肪肝疾病相关的基因表达数据和HepG2、HuH7、QSG7701肝细胞系 | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 网络分析, 机器学习, RT-qPCR | 机器学习算法, WGCNA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 2569个差异表达基因, 1279个关键模块基因, 532个靶基因, 3种肝细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 892 | 2025-10-06 |
VEGFA and APOE regulate distinct functional states of mast cells in hepatocellular carcinoma: A single-cell transcriptome analysis
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146131
PMID:40683486
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝细胞癌中肥大细胞的功能异质性及其对预后的影响 | 首次在肝细胞癌中鉴定出四种功能不同的肿瘤相关肥大细胞亚群,并发现VEGFA和APOE分别调控其促癌和抑癌功能状态 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证发现 | 研究肝细胞癌中肥大细胞的异质性及其在肿瘤发展中的双重作用 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化,细胞功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,免疫组化数据,公共数据库数据 | 32例HCC患者肿瘤组织,5例癌旁组织,90对验证用肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序,多重免疫组化 | NA | NA |
| 893 | 2025-10-06 |
Regulatory mechanisms of the Hippo/YAP axis by G-protein coupled estrogen receptor in gastric signet-ring cell carcinoma
2025-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101199
PMID:40554953
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研究论文 | 本研究揭示了G蛋白偶联雌激素受体通过调控Hippo/YAP信号轴在胃印戒细胞癌中的致癌机制 | 首次在胃印戒细胞癌中发现GPER通过竞争性结合ARRB2抑制LATS1介导的YAP磷酸化,并揭示GPER与YAP之间存在的正反馈循环机制 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,缺乏临床患者样本的验证 | 阐明GPER在胃印戒细胞癌中调控Hippo/YAP信号轴的功能机制 | 胃印戒细胞癌细胞系和裸鼠异种移植模型 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序,体外细胞功能实验,体内异种移植模型 | NA | 测序数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 894 | 2025-10-06 |
Multi-omics integrative analysis reveals novel genetic loci and candidate genes for ischemic stroke
2025-Sep-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102633
PMID:40777745
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研究论文 | 通过整合多组学数据识别缺血性脑卒中的新遗传位点和候选基因 | 首次整合三大GWAS数据库进行meta分析,发现124个新的IS相关位点,并开发基于大语言模型的智能助手StrokeGene | 遗传研究的发现需要进一步功能验证,样本来源限于现有数据库 | 探索缺血性脑卒中的遗传基础和新致病机制 | 人类遗传数据和动物模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | GWAS meta分析, eQTL, pQTL, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析 | 大语言模型 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 三大GWAS数据库(GWAS Catalog, MEGASTROKE, Open GWAS)的整合数据 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 895 | 2025-10-06 |
Current insight into HIV-1 persistence from single-cell transcriptome profiling in acutely treated cohorts of infection
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000962
PMID:40638066
|
综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术研究急性HIV-1感染患者中病毒储存库细胞特征的最新进展 | 应用单细胞RNA测序技术揭示HIV-1感染急性期治疗队列中病毒储存库细胞的异质性和分子标记 | NA | 探讨单细胞转录组学在解析HIV-1病毒持久性机制中的应用 | HIV感染者的免疫细胞 | 生物信息学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数十万个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 896 | 2025-10-06 |
Single cell analyses of the HIV reservoir in the CNS and CSF: recent insights and implications
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000958
PMID:40742782
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综述 | 本综述重点介绍了单细胞组学技术在解析HIV在中枢神经系统和脑脊液中病毒储存库的最新进展 | 应用多种单细胞组学技术揭示HIV在中枢神经系统中的持续存在机制和细胞特异性特征 | NA | 探讨单细胞技术对HIV中枢神经系统储存库研究的推动作用 | HIV感染者的尸检脑组织和脑脊液样本 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, ATAC-seq, CITE-seq, AIRR-seq, 多组学平台, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组, 表观基因组, 空间转录组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 897 | 2025-08-08 |
Single-cell sequencing technologies: a multiomics toolbox for investigating HIV-1 persistence
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000966
PMID:40772512
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 898 | 2025-10-06 |
Current concepts in the pathogenesis and clinical management of lymphangioleiomyomatosis
2025-Sep-01, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000001185
PMID:40501369
|
综述 | 本文综述了淋巴管平滑肌瘤病(LAM)的发病机制和临床管理最新进展 | 整合了激素通路、免疫系统相互作用、mTOR信号抑制和肿瘤微环境的最新研究,提出了具有治愈潜力的联合治疗策略 | NA | 总结LAM疾病在发病机制理解和治疗策略方面的最新进展 | 淋巴管平滑肌瘤病(LAM)患者及疾病机制 | 医学研究 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 899 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analyses reveal cellular and molecular patterns of rose petal responses to gray mold infection
2025-Sep, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf152
PMID:40756631
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了玫瑰花瓣对灰霉病感染的细胞和分子响应模式 | 首次在单细胞水平上解析玫瑰花瓣对灰霉病感染的细胞类型特异性响应机制 | 初步研究,样本量有限,仅针对'Jumilia'品种 | 阐明玫瑰对灰霉病抗性的分子机制 | 玫瑰花瓣细胞 | 植物病理学 | 灰霉病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 900 | 2025-10-06 |
Integrative Analysis of Bulk Multiomics and Single-Cell Transcriptomics Elucidates Age-Related Molecular Landscape Alterations in Cervical Cancer
2025-Sep, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-17464-w
PMID:40415156
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研究论文 | 通过整合分析批量多组学和单细胞转录组数据,揭示宫颈癌中与年龄相关的分子景观变化 | 首次系统比较不同年龄段宫颈癌患者的分子特征差异,结合批量多组学和单细胞转录组数据进行综合分析 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 阐明年龄对宫颈癌分子特征的影响 | 307例宫颈癌患者(来自TCGA)和11例宫颈癌样本(来自GEO) | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量多组学分析 | 比较分析 | 转录组数据, 基因组数据, 表观遗传数据, 临床数据 | 307例批量多组学样本 + 11例单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量多组学 | NA | NA |