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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2025-10-06 |
Mature and migratory dendritic cells promote immune infiltration and response to anti-PD-1 checkpoint blockade in metastatic melanoma
2025-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62878-5
PMID:40890106
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析转移性黑色素瘤肿瘤微环境,发现成熟树突状细胞亚型与免疫治疗反应相关 | 识别出表达免疫调节分子的成熟树突状细胞亚型(mregDC),并证明其与TCF7+/- CD8 T细胞比率联合可作为免疫检查点抑制剂疗效的预测生物标志物 | 样本量相对有限(36个样本的单细胞RNA-seq),需要在更大队列中验证 | 探索肿瘤微环境中细胞亚型与免疫检查点抑制剂治疗反应的关系 | 转移性黑色素瘤患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,单核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据 | 36个转移性黑色素瘤样本(约189,000个细胞),验证队列318个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 842 | 2025-10-06 |
Longitudinal liquid biopsy identifies an early predictive biomarker of immune checkpoint blockade response in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63538-4
PMID:40890155
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研究论文 | 本研究通过纵向液体活检开发了一种早期预测头颈鳞状细胞癌免疫检查点阻断治疗反应的生物标志物 | 采用时间分辨多组学方法在小鼠模型中表征ICB治疗期间的动态外周免疫反应,发现应答者早期效应记忆T细胞和B细胞库的扩增 | 研究主要基于小鼠模型,人类队列验证需要进一步扩大样本量 | 开发预测免疫检查点阻断治疗反应的生物标志物 | 头颈鳞状细胞癌患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序,T/B细胞受体分析 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据,免疫受体序列数据 | 小鼠HNSCC模型和独立人类HNSCC队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 843 | 2025-10-06 |
A spatial transcriptomics dataset of pancreas sections in normal glucose tolerance and type 2 diabetic donors
2025-Sep-01, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05450-6
PMID:40890166
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研究论文 | 本研究提供了正常糖耐量和2型糖尿病患者胰腺组织的空间转录组数据集,并开发了转录渗漏的计算校正方法 | 首次报道人类胰腺在正常和2型糖尿病状态下的空间转录组特征,并开发了针对高丰度基因转录渗漏的概率模型校正方法 | 样本量较小(仅6个供体),仅针对胰腺组织,未验证其他器官的转录渗漏问题 | 研究正常和2型糖尿病状态下胰腺基因表达的空间分布规律 | 人类胰腺组织样本 | 空间转录组学 | 2型糖尿病 | 空间转录组测序 | 概率模型 | 空间基因表达数据 | 6个供体(3个2型糖尿病患者,3个正常糖耐量者) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 844 | 2025-10-06 |
AEBP1 drives fibroblast-mediated T cell dysfunction in tumors
2025-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63659-w
PMID:40890191
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研究论文 | 本研究揭示AEBP1通过癌症相关成纤维细胞驱动T细胞功能障碍的新机制 | 首次发现AEBP1是CAF介导的T细胞功能障碍的关键调节因子,并开发了靶向AEBP1-CKAP4相互作用的抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类癌症类型,临床转化仍需进一步验证 | 探究肿瘤微环境中T细胞功能障碍的机制并寻找新的治疗靶点 | 人类结肠腺癌和三阴性乳腺癌组织、小鼠肿瘤模型、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌、乳腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接虚拟筛选 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 人类结肠腺癌和三阴性乳腺癌组织样本 | NA | RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 845 | 2025-10-06 |
Spatialsmooth: a spatially-aware convolutional autoencoder framework for enhanced deconvolution of spatial transcriptomics data
2025-Sep-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11959-2
PMID:40890608
|
研究论文 | 提出基于卷积自编码器的空间感知框架Spatialsmooth,用于增强空间转录组数据的反卷积分析 | 整合多种空间反卷积工具,利用位置编码充分挖掘空间位置信息,并通过卷积自编码器优化细胞类型组成的空间分布 | NA | 开发空间转录组数据反卷积方法以提高细胞类型组成推断的准确性和空间一致性 | 胰腺导管腺癌(PDAC)数据集和基准数据 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 卷积自编码器 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 846 | 2025-10-06 |
Identification of severity related mutation hotspots in SARS-CoV-2 using a density-based clustering approach
2025-Sep-01, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-025-00476-3
PMID:40890768
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研究论文 | 使用密度聚类方法识别SARS-CoV-2基因组中与疾病严重程度相关的突变热点区域 | 开发Mutclust密度聚类算法识别突变热点,首次发现28个与COVID-19严重程度相关的突变区域并揭示其与NK细胞功能的关联 | 样本量相对有限(387名患者),需要更大规模验证 | 识别SARS-CoV-2基因组中与患者疾病严重程度相关的突变热点 | SARS-CoV-2病毒基因组突变热点与COVID-19患者 | 生物信息学 | COVID-19 | 密度聚类算法,网络传播分析,单细胞RNA测序 | Mutclust聚类算法 | 基因组序列数据,单细胞RNA-seq数据,细胞因子数据 | 387名感染患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 847 | 2025-10-06 |
Crosstalk between heterogeneous cancer-associated fibroblast subpopulations and the immune system in breast cancer: key players and promising therapeutic targets
2025-Sep-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03527-z
PMID:40890855
|
综述 | 探讨乳腺癌中异质性癌症相关成纤维细胞亚群与免疫系统的相互作用及其治疗潜力 | 聚焦CAF异质性与免疫系统的双向互作机制,系统总结基于CAF的乳腺癌治疗策略 | NA | 阐明CAF异质亚群与免疫细胞互作在肿瘤免疫微环境形成中的作用 | 乳腺癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞亚群和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 848 | 2025-10-06 |
Integrated Single-Cell RNA-Seq Reveals Immunosuppressive Mechanisms of Treg Cell Differentiation and Tumor Microenvironment Interactions in Colorectal Cancer
2025-Sep, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71202
PMID:40891683
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据揭示结直肠癌中Treg细胞分化及其与肿瘤微环境相互作用的免疫抑制机制 | 首次系统揭示TGFβ1+ Treg细胞在低分化结直肠腺癌中的扩增及其通过特定配体-受体对介导CD8+ T细胞功能耗竭的新机制 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,样本来源有限,需要更多前瞻性研究验证 | 探索结直肠癌微环境并发现新的治疗靶点 | 结直肠癌患者肿瘤组织中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | 细胞聚类分析, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 整合GEO数据库中三个数据集(GSE164522, GSE132465, GSE144735)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 849 | 2025-10-06 |
Dual probe ligation in situ hybridization with rolling-circle amplification for high-plex spatial transcriptomics
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102207
PMID:40893776
|
研究论文 | 开发了一种基于双探针连接和滚环扩增的高通量空间转录组学方法LISH-LnR,用于分析FFPE临床样本中的mRNA空间分布 | 在原有连接原位杂交技术基础上引入滚环扩增,提高了检测灵敏度和多重分析能力,并开发了可精细调控检测性能的分子变阻器系统 | 主要针对FFPE样本中不同程度降解的mRNA进行分析,可能受限于样本质量 | 开发适用于FFPE临床样本的高通量空间转录组学技术 | 包涵体肌炎患者和儿童横纹肌肉瘤患者的固定组织样本 | 空间转录组学 | 肌肉疾病, 儿童癌症 | 连接原位杂交, 滚环扩增, 迭代荧光探针杂交成像 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | 包涵体肌炎和儿童横纹肌肉瘤患者组织样本 | NA | 空间转录组学, 原位杂交 | NA | LISH-Lock'n'Roll (LISH-LnR) 方法 |
| 850 | 2025-10-06 |
ST-deconv: an accurate deconvolution approach for spatial transcriptome data utilizing self-encoding and contrastive learning
2025-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf109
PMID:40896262
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习的空间转录组数据反卷积方法ST-deconv,整合空间信息提高细胞类型解析精度 | 结合自编码器和对比学习增强相邻点的空间表示,采用领域对抗网络提升跨数据集泛化能力 | 未明确说明方法在更复杂组织类型或更低质量数据上的性能表现 | 开发高精度空间转录组数据反卷积方法以解析细胞类型组成 | 空间转录组数据中的细胞类型组成 | 空间转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 自编码器,对比学习,领域对抗网络 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 小鼠嗅球和人类胰腺导管腺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 851 | 2025-10-06 |
[Progress of scRNA-seq technology in nasopharyngeal carcinoma research]
2025-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology head and neck surgery
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在鼻咽癌研究中的应用进展 | 系统总结了单细胞RNA测序技术在揭示鼻咽癌肿瘤异质性、肿瘤微环境和治疗耐药机制中的创新应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在鼻咽癌研究中的应用价值 | 鼻咽癌 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 852 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune regulatory mechanisms and molecular therapeutic strategies in the microenvironment of multiple myeloma
2025-Sep-03, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003306
PMID:40899849
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示多发性骨髓瘤微环境中的免疫调控机制和分子治疗策略 | 整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接技术系统解析骨髓瘤微环境 | 未明确说明样本规模和临床验证阶段 | 探索多发性骨髓瘤微环境中的分子和细胞相互作用以发现治疗靶点 | 多发性骨髓瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接 | Seurat聚类分析, GSVA, 细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 853 | 2025-10-06 |
Multiparametric Profiling of Circulating Immune Cells Identifies an Expansion of CD25high Switched Memory B Cells in Osteoarthritis
2025-Sep, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43186
PMID:40229860
|
研究论文 | 通过多参数分析循环免疫细胞,发现骨关节炎患者中CD25高表达转换记忆B细胞扩增 | 首次在单细胞分辨率下识别骨关节炎相关的循环免疫细胞特征,发现CD25hiCXCR5hiCD27+IgD-转换记忆B细胞亚群扩增 | 样本量有限(21名健康供体,17名OA患者,10名DMT患者),需要更大规模研究验证 | 识别骨关节炎的潜在细胞生物标志物 | 外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞分析 | 骨关节炎 | 飞行时间质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞蛋白质表达数据,单细胞转录组数据 | 48个样本(21健康供体,17OA患者,10DMT患者) | NA | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 29标记物面板的飞行时间质谱流式细胞术 |
| 854 | 2025-10-06 |
Fine particulate matter exacerbates asthma by activating STC2-mediated mitophagy through METTL3/YTHDF2-dependent m6A methylation
2025-Sep-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138854
PMID:40499413
|
研究论文 | 本研究揭示了细颗粒物通过METTL3/YTHDF2依赖的m6A甲基化激活STC2介导的线粒体自噬加剧哮喘的分子机制 | 首次发现PM通过m6A甲基化调控STC2表达激活线粒体自噬的新机制,并验证了季节性PM暴露与METTL3/STC2血清浓度的关联 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅检测了血清标志物,缺乏直接机制验证 | 探究细颗粒物加剧哮喘的分子机制 | 哮喘小鼠模型和哮喘患者外周血样本 | 分子生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,分子机制研究 | NA | 基因表达数据,血清浓度数据 | 哮喘小鼠和季节性采集的哮喘患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 855 | 2025-10-06 |
TRAF3IP2-AS1 Deficiency Induces Necroptosis to Promote Pancreatic Cancer Liver Metastasis
2025-Sep-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4784
PMID:40586914
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研究论文 | 本研究揭示长链非编码RNA TRAF3IP2-AS1通过调控坏死性凋亡和免疫抑制微环境促进胰腺癌肝转移的机制 | 首次发现TRAF3IP2-AS1缺失通过双重机制诱导坏死性凋亡:通过竞争性结合IGF2BP2降低MLKL mRNA稳定性,同时干扰PPM1B泛素化促进RIPK3磷酸化 | 研究主要基于患者来源类器官和动物模型,临床样本验证仍需扩展 | 探究胰腺癌肝转移的分子机制和潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本、患者来源类器官、TGFβ1条件性基因敲除小鼠模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、3D体外模型 | 动物模型、类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | PDAC患者样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 856 | 2025-10-06 |
EML4-ALK Rearrangement Creates a Distinctive Myeloid Cell-Dominant Immunosuppressive Microenvironment in Lung Cancer
2025-Sep-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0532
PMID:40627846
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研究论文 | 本研究揭示了EML4-ALK重排通过创建髓系细胞主导的免疫抑制微环境导致肺癌对免疫治疗不响应的机制 | 首次发现ALK+肺腺癌具有独特的髓系细胞主导免疫抑制微环境,并证实IL6R抑制剂可逆转该免疫抑制状态 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索ALK+肺腺癌对免疫治疗不响应的免疫学机制 | ALK阳性和阴性肺腺癌患者的肿瘤组织及小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,肿瘤浸润白细胞分析 | 小鼠ALK+肺腺癌模型 | 基因表达数据,细胞计数数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 857 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of pig lung transplantation reveals macrophage ferroptosis in lung ischemia-reperfusion injury
2025-Sep, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2025.04.011
PMID:40262727
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研究论文 | 通过猪肺移植模型的单细胞RNA测序研究巨噬细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用 | 首次建立猪原位单肺移植模型模拟长时间冷缺血再灌注损伤,并通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞铁死亡的关键作用 | 研究样本量有限,需要进一步验证巨噬细胞铁死亡的具体分子机制 | 研究肺缺血再灌注损伤的病理机制并建立大型动物模型 | 猪肺移植模型中的肺组织样本 | 单细胞测序分析 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序,透射电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像 | 猪肺移植模型组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 858 | 2025-10-06 |
Association Between T2DM, TyG Index, Multiple Sclerosis, and Rheumatoid Arthritis: Insights into Potential Mechanisms
2025-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04961-y
PMID:40279037
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析探索2型糖尿病、胰岛素抵抗与自身免疫疾病的因果关系及潜在机制 | 首次结合孟德尔随机化、贝叶斯共定位和单细胞RNA测序综合分析T2DM、TyG指数与自身免疫疾病的因果关系及免疫细胞介导机制 | 研究基于汇总级GWAS数据,无法完全排除潜在混杂因素的影响 | 探索2型糖尿病和胰岛素抵抗与自身免疫疾病的因果关系及免疫机制 | 2型糖尿病、TyG指数、多发性硬化症、类风湿关节炎及特定标志免疫细胞 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 孟德尔随机化分析, 贝叶斯共定位, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 多个GWAS研究的汇总数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 859 | 2025-10-06 |
eIF3f promotes tumour malignancy by remodelling fatty acid biosynthesis in hepatocellular carcinoma
2025-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.02.045
PMID:40154622
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研究论文 | 本研究揭示了eIF3f通过稳定ACSL4促进肝细胞癌脂肪酸生物合成和肿瘤恶性进展的分子机制 | 首次发现eIF3f通过K48连接的去泛素化稳定ACSL4,促进脂肪酸生物合成,并阐明其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 需要进一步的临床研究来确认eIF3f靶向治疗在人类患者中的疗效 | 确定肝细胞癌中脂肪酸代谢的特征及其分子机制 | 肝细胞癌组织、类器官模型、多物种肿瘤模型 | 肿瘤代谢 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,代谢流分析,透射电子显微镜,飞行时间质谱流式细胞术,多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,代谢物数据,蛋白质数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 860 | 2025-10-06 |
Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322100
PMID:40371469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的新机制 | 首次在收集淋巴管中表征TRPV4表达谱,发现TRPV4+髓系细胞与淋巴管细胞间的相互作用新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本数量有限 | 探究TRPV4通道在淋巴管收缩功能调控中的作用机制 | 小鼠收集淋巴管和乳腺癌相关淋巴水肿患者活检组织 | 单细胞生物学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜, 细胞内钙活性测量 | Trpv4fx/fx转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据, 功能实验数据 | 小鼠收集淋巴管单细胞数据集和患者淋巴水肿活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |