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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2025-10-06 |
HL-BscPF: Hybrid learning facilitates brain cell auto-identification in multiple pathologies
2025-Sep-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123751
PMID:40414555
|
研究论文 | 提出混合学习框架HL-BscPF用于脑细胞自动分类和疾病相关通路分析 | 整合ItClust和TOSICA模型,结合自编码器降维和transformer架构提升预测精度 | 未明确说明样本量的具体数值和数据集来源限制 | 开发自动化细胞类型分类方法并揭示脑疾病相关通路 | 脑单细胞转录组数据,涵盖衰老、阿尔茨海默病、术后认知功能障碍和中风等神经病理状态 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 自编码器, transformer, 混合学习 | 单细胞转录组数据 | 四个脑特异性单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 822 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell sequencing for the development of a GJA4-based precision immuno-prognostic model in melanoma
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102450
PMID:40639089
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序数据开发了基于GJA4的黑色素瘤精准免疫预后模型 | 首次发现GJA4是肿瘤相关内皮细胞终末亚群的关键标志基因,并构建了基于GJA4的精准预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索肿瘤相关内皮细胞与肿瘤的相互作用机制,开发黑色素瘤精准预后模型 | 黑色素瘤患者、肿瘤相关内皮细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 微阵列 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的黑色素瘤和胶质瘤患者数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 823 | 2025-10-06 |
Novel multi-omics analysis revealing metabolic heterogeneity of breast cancer cell and subsequent development of associated prognostic signature
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102444
PMID:40639090
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示乳腺癌细胞的代谢异质性,并开发了相关的预后特征 | 首次通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据系统分析乳腺癌代谢异质性,构建了基于代谢特征的预后模型,并验证了PDCD1的致癌作用 | 研究样本量有限,需要在更大规模队列中验证代谢特征的预测效能 | 探究乳腺癌代谢异质性及其与肿瘤微环境的相互作用,开发预后预测工具 | 乳腺癌细胞和患者样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,WGCNA,机器学习 | 加权基因共表达网络分析,机器学习算法 | 基因表达数据,临床数据 | 多个队列的乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 824 | 2025-10-06 |
Tumor-associated Schwann cells promote salivary adenoid cystic carcinoma stem-like reprogramming via IGF2/IGF1R induced histone H3 lysine 18 lactylation
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217847
PMID:40466903
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关雪旺细胞通过IGF2/IGF1R信号轴诱导组蛋白H3K18乳酸化修饰,促进唾液腺腺样囊性癌干细胞样重编程的分子机制 | 首次发现TA-SCs通过旁分泌IGF2信号提升组蛋白乳酸化水平,并阐明IGF2/IGF1R-H3K18la轴在SACC干细胞样重编程中的关键作用 | TA-SCs重编程的具体分子通路细节仍需进一步探索,临床转化潜力有待验证 | 探究肿瘤相关雪旺细胞在唾液腺腺样囊性癌进展和干细胞样重编程中的功能机制 | 唾液腺腺样囊性癌肿瘤微环境中的雪旺细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤微环境研究 | 唾液腺腺样囊性癌 | 组织透明化三维成像, 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 图像数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 825 | 2025-10-06 |
Dynamic evolution of venetoclax resistance in acute myeloid leukemia unveiled by longitudinal single-cell RNA-seq
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217853
PMID:40482912
|
研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示急性髓系白血病中venetoclax耐药的动态演化过程 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘venetoclax治疗期间骨髓微环境重塑的动态过程,发现两种关键耐药机制并建立预后预测模型 | 样本量相对有限,需要在更大队列中进一步验证 | 研究急性髓系白血病患者对venetoclax治疗的耐药机制和骨髓微环境动态变化 | 接受DAV方案治疗的急性髓系白血病患者骨髓标本 | 单细胞测序分析 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | AML患者治疗前后配对骨髓标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 826 | 2025-10-06 |
Characterizing chromosome instability reveals its association with lipid-associated macrophages and clonal evolution of lymph node metastasis in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217874
PMID:40516322
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了染色体不稳定性在食管鳞癌淋巴结转移中的作用机制 | 首次发现染色体不稳定性通过易错DNA双链断裂修复途径与脂质相关巨噬细胞形成新型关联,促进淋巴结转移 | 研究样本量有限,机制验证仍需进一步实验 | 探究染色体不稳定性在食管鳞癌淋巴结转移中的作用及机制 | 食管鳞癌患者组织样本、类器官模型及淋巴结转移灶 | 癌症基因组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 基因组测序, 空间蛋白质分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 食管鳞癌临床标本及类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 827 | 2025-10-06 |
The role of tumor microenvironment and immune cell crosstalk in triple-negative breast cancer (TNBC): Emerging therapeutic opportunities
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217865
PMID:40516902
|
综述 | 本综述整合了三阴性乳腺癌肿瘤微环境与免疫细胞相互作用的研究现状,探讨新兴治疗机遇 | 系统阐述TME中T细胞异质性、Tregs免疫抑制机制、MUC1-C/CXCL9调控作用及空间分析在预测复发中的价值 | 未涉及具体临床实验数据验证,主要基于现有研究文献整合分析 | 探索三阴性乳腺癌肿瘤微环境与免疫细胞互作的机制及治疗靶点 | 三阴性乳腺癌肿瘤微环境组成成分及免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 828 | 2025-10-06 |
Targeting the cholinergic-astrocyte axis: A novel strategy for brain metastasis prevention in lung adenocarcinoma
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217870
PMID:40516905
|
研究论文 | 本研究揭示了胆碱能代谢-星形胶质细胞轴在肺腺癌脑转移中的作用机制,并提出多奈哌齐作为预防脑转移的潜在治疗策略 | 首次发现胆碱能代谢激活是肺腺癌脑转移的特征性标志,并阐明乙酰胆碱酯酶通过免疫抑制和血脑屏障破坏的双重促转移机制 | 样本量相对有限,需要更大规模临床试验验证多奈哌齐的预防效果 | 探索肺腺癌脑转移的发病机制并开发预防策略 | 肺腺癌患者肿瘤组织和脑转移灶 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,组织芯片,体外实验 | NA | 基因表达数据,组织样本 | 875例RNA测序病例,280例组织芯片验证,26个脑转移灶和8个正常脑组织单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 829 | 2025-10-06 |
Neoadjuvant PD-1 blockade induces the autophagy of immune cells: a new target for synergistic therapy of recurrent glioblastoma
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102119
PMID:40678806
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析新辅助PD-1阻断诱导复发性胶质母细胞瘤免疫细胞自噬的机制,并探索协同治疗策略 | 首次揭示新辅助PD-1阻断通过诱导淋巴样细胞自活化,发现L+M细胞作为关键免疫组分,并鉴定利巴韦林作为潜在协同治疗药物 | 自噬在特定免疫细胞亚群中的具体作用机制尚未完全阐明,药物靶向效果需要进一步实验验证 | 探索新辅助PD-1阻断对复发性胶质母细胞瘤免疫细胞自噬的影响及协同治疗靶点 | 复发性胶质母细胞瘤患者组织样本 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 830 | 2025-10-06 |
Evaluation of PANoptosis activation in irreversible pulpitis: An in vitro study based on human tissue samples
2025-Sep, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
|
研究论文 | 通过分析人牙髓组织样本,评估不可逆性牙髓炎中PANoptosis的激活状态 | 首次在牙髓炎中系统研究PANoptosis三种细胞死亡途径的激活情况及其在不同细胞类型中的分布 | 未检测到caspase-8和PYCARD的相互作用,且仅证实凋亡和焦亡的激活 | 研究牙髓炎中PANoptosome的激活机制 | 健康与炎症牙髓组织 | 生物信息学 | 牙髓疾病 | RNA-seq, qRT-PCR, 免疫印迹, 共免疫沉淀, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人类牙髓组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 831 | 2025-10-06 |
siHIF-1α-loaded micellar nanoparticles inhibit M1 macrophage activation to ameliorate chronic rhinosinusitis
2025-Sep, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究探讨了负载siHIF-1α的胶束纳米颗粒通过调控巨噬细胞极化和铁死亡改善慢性鼻窦炎的分子机制 | 首次揭示HIF-1α通过激活TFRC转录驱动M1巨噬细胞极化和铁死亡的新机制,并开发了基于纳米技术的siRNA递送系统用于CRS治疗 | 需要进一步验证长期安全性和临床转化潜力 | 研究纳米颗粒递送siHIF-1α对慢性鼻窦炎中巨噬细胞极化和铁死亡的调控作用 | 慢性鼻窦炎小鼠模型和Raw264.7巨噬细胞系 | 生物医学工程 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告实验, 流式细胞术, 动态光散射, 凝胶阻滞实验 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 组织病理数据 | GSE10406数据集和CRS小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat软件包进行单细胞RNA测序数据分析 |
| 832 | 2025-10-06 |
Specificity protein 1 suppresses prohibitin 1 to induce macrophage M1 polarization and impair phagocytosis, exacerbating sepsis-associated acute lung injury
2025-Sep, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示了特异性蛋白1通过抑制抑制素1诱导巨噬细胞M1极化并削弱吞噬功能,从而加剧脓毒症相关急性肺损伤的分子机制 | 首次发现SP1/PHB1轴在调控巨噬细胞极化和功能中的关键作用,并阐明其通过炎症因子分泌、线粒体功能障碍和氧化应激介导脓毒症诱导的急性肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型,未来需要临床验证;靶向治疗策略尚未进行临床前评估 | 探究SP1/PHB1轴在脓毒症相关急性肺损伤中调控巨噬细胞极化和功能的分子机制 | CLP诱导的脓毒症小鼠模型和巨噬细胞 | 机器学习 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 高通量测序, 机器学习算法, 免疫荧光, ELISA, RT-qPCR, Western blot | 机器学习算法 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高通量测序 | NA | NA |
| 833 | 2025-10-06 |
Novel NLRP3 inhibitors mitigate acute radiation-induced lung injury by suppressing pyroptosis in alveolar epithelial cells
2025-Sep, Toxicology and applied pharmacology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.taap.2025.117458
PMID:40618790
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研究论文 | 本研究开发新型NLRP3抑制剂并通过抑制肺泡上皮细胞焦亡来减轻急性辐射性肺损伤 | 首次设计靶向NLRP3蛋白NACHT结构域的喹喔啉酮衍生物抑制剂,并证实其通过NLRP3/GSDMD通路特异性抑制肺泡2型细胞焦亡 | 研究主要聚焦早期辐射损伤阶段,长期疗效和安全性需进一步验证 | 开发针对辐射性肺损伤的新型治疗策略 | 肺泡上皮细胞(A549、MLE-12细胞系)和C57BL/6小鼠模型 | 分子药理学 | 辐射性肺损伤 | 单细胞测序、分子对接、高内涵筛选、Western blot、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、蛋白质印迹数据、组织病理图像 | 细胞系实验和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 834 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals pathogenic mechanism of renal fibrosis in imiquimod-induced lupus nephritis in mice
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102087
PMID:40641741
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术揭示咪喹莫特诱导的小鼠狼疮性肾炎肾纤维化的致病机制 | 首次建立狼疮性肾炎肾脏的单核与空间转录组图谱,识别出外髓质内条纹区成纤维细胞特异性激活及促纤维化巨噬细胞亚型Lyz2 | 研究局限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 阐明狼疮性肾炎肾纤维化的细胞分子病理机制 | 咪喹莫特诱导的狼疮性肾炎小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单核RNA测序数据 | 狼疮性肾炎与对照组小鼠肾脏样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 835 | 2025-10-06 |
PerturbSeq.db: An Integrated Repository for Comprehensive Analysis of Single-cell Perturbation Data
2025-Sep-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169209
PMID:40381983
|
研究论文 | 介绍了一个整合单细胞扰动数据的综合数据库PerturbSeq.db | 开发了首个全面整合和统一处理单细胞扰动数据的数据库,采用统一处理流程确保数据一致性 | 未提及具体的数据更新频率和长期维护计划 | 解决单细胞扰动研究领域数据可访问性和整合性的挑战 | 单细胞扰动数据集,包括遗传和化学干预数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 189个数据集来自77项研究,涵盖约50种不同细胞系或组织 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 836 | 2025-10-06 |
Reference Vector-guided Evolutionary Algorithm for cluster analysis of single-cell transcriptomes
2025-Sep, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108873
PMID:40499345
|
研究论文 | 提出一种基于参考向量引导的进化算法RVEA-CAST,用于单细胞转录组数据的聚类分析 | 首次将单细胞转录组聚类问题建模为多目标优化问题,并设计了三个问题感知的变异算子 | 仅在十个真实scRNA-seq数据集上验证,需要更多数据集验证通用性 | 解决单细胞RNA测序数据的聚类分析问题 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 参考向量引导的进化算法 | 基因表达数据 | 十个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 837 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals distinct immune characteristics of hepatocellular carcinoma in HBV-positive vs. HBV-negative cases
2025-Sep, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2871
PMID:40636452
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较HBV阳性和阴性肝细胞癌的免疫特征差异 | 首次在单细胞水平揭示HBV感染如何改变肝细胞癌肿瘤微环境中免疫细胞的组成和状态 | 未完全阐明HBV诱导肿瘤微环境改变的具体分子机制 | 探究HBV感染对肝细胞癌免疫微环境的影响 | HBV阳性和阴性肝细胞癌患者的肿瘤样本 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 838 | 2025-10-06 |
Comparison of single-cell long-read and short-read transcriptome sequencing via cDNA molecule matching: quality evaluation of the MAS-ISO-seq approach
2025-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf089
PMID:40630932
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研究论文 | 通过cDNA分子匹配比较单细胞长读长和短读长转录组测序方法,评估MAS-ISO-seq方法的质量 | 首次通过细胞条形码和UMI匹配的cDNA分子直接比较长读长和短读长单细胞转录组测序方法 | 仅使用10x Genomics 3' cDNA平台,未评估其他单细胞技术平台 | 评估长读长和短读长单细胞转录组测序方法的可比性和偏差 | 单细胞转录组测序数据 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序,cDNA测序 | NA | 基因表达数据,转录本序列 | NA | 10x Genomics, Illumina, Pacific Biosciences | 单细胞RNA-seq,长读长测序,短读长测序 | 10x Chromium, Illumina测序平台, PacBio测序平台 | 10x Genomics 3' cDNA,Illumina短读长测序,Pacific Biosciences长读长测序 |
| 839 | 2025-10-06 |
Sirtuin 2 regulates NOD-like receptor protein 3/nuclear factor kappa B axis to promote cartilage repair in osteoarthritis
2025-Sep, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.70031
PMID:40620356
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研究论文 | 本研究揭示了SIRT2通过调节NF-κB/NLRP3信号轴促进骨关节炎软骨修复的分子机制 | 首次阐明SIRT2通过去乙酰化NF-κB p65抑制NLRP3炎症小体激活,从而促进软骨修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未进行人体临床试验验证 | 阐明SIRT2在骨关节炎中调节NLRP3/NF-κB信号轴促进软骨修复的作用机制 | 骨关节炎小鼠模型和软骨细胞培养物 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 实时PCR, 共免疫沉淀, 染色质免疫沉淀 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 840 | 2025-10-06 |
Decoding the crossroads of aging and cancer through single-cell analysis: Implications for precision oncology
2025-Sep-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35456
PMID:40268523
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综述 | 通过单细胞分析探讨衰老与癌症的交叉机制及其对精准肿瘤学的意义 | 整合单细胞技术与空间转录组学、分子探针和人工智能等先进工具,揭示衰老在肿瘤微环境中的异质性作用 | NA | 阐明衰老过程对癌症发生、发展及治疗耐药性的影响机制 | 衰老细胞与肿瘤微环境中的细胞异质性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞分析,空间转录组学,人工智能 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |