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当前共找到 827 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-11-25 |
Computational Drug Repurposing for Alzheimer's Disease via Sheaf Theoretic Population-Scale Analysis of snRNA-seq Data
2025-Sep-29, ArXiv
PMID:41256885
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研究论文 | 通过层论拓扑方法和机器学习模型，利用群体规模单核RNA测序数据进行阿尔茨海默病药物重定位研究 | 首次将持久层拉普拉斯算子应用于蛋白质-蛋白质相互作用分析，并结合群体规模snRNA-seq数据开发顺序靶点-药物选择模型 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证预测结果 | 开发计算药物重定位方法治疗阿尔茨海默病 | 阿尔茨海默病患者脑组织中的小胶质细胞和脑血管组织细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序(snRNA-seq), 差异基因表达分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 机器学习模型, 持久层拉普拉斯模型 | 基因表达数据 | 来自多患者多区域研究的数十万个细胞核 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-11-24 |
Reduced intestinal GLP-1 + cell numbers are associated with an inflammation-related epithelial metabolic signature
2025-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.05.641577
PMID:41040310
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研究论文 | 本研究探讨肠道炎症中GLP-1+细胞数量减少与炎症相关上皮代谢特征的关系 | 首次系统证明GLP-1+细胞在肠道炎症中普遍减少，并揭示其与线粒体功能障碍和代谢重编程的因果关系 | 主要依赖动物模型，人类数据来自公共数据库，需要进一步临床验证 | 阐明肠内分泌细胞在肠道炎症中的作用机制 | 小鼠模型、克罗恩病患者黏膜活检、肠道类器官 | 分子生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，转录组分析，器官培养 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 4种小鼠炎症模型和克罗恩病患者活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-11-23 |
A single-cell transcriptomic atlas of inner ear morphogenesis in zebrafish
2025-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.30.679639
PMID:41256471
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了斑马鱼内耳形态发生的转录组图谱 | 首次提供了发育中内耳最全面的转录组分析，发现了半规管发生区的最早标记物、内淋巴囊中组织收缩相关基因、神经丘与耳部感觉斑块的平行基因集，以及在耳道和囊中细胞周期暂停的保守作用 | 研究仅使用斑马鱼胚胎模型，结果在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 揭示内耳发育过程中不同细胞状态的建立机制 | 野生型和突变型斑马鱼胚胎的内耳组织 | 单细胞转录组学 | 内耳发育异常 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-11-23 |
Low Dose GLP-1 Therapy Attenuates Pathological Cardiac and Hepatic Remodelling in HFpEF Independent of Weight Loss
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.26.678829
PMID:41256540
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研究论文 | 本研究探讨低剂量GLP-1受体激动剂在保留射血分数心衰模型中的心脏和肝脏保护作用 | 首次证明低剂量GLP-1受体激动剂在不依赖体重减轻的情况下改善HFpEF的心脏和肝脏病理重构 | 研究使用啮齿类动物模型，结果需在人类临床试验中验证 | 探究低剂量GLP-1受体激动剂在HFpEF中的非体重减轻依赖性治疗机制 | 自发性HFpEF的ZSF1肥胖大鼠 | 心血管疾病研究 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学，二维超声心动图，有创血流动力学检测 | 动物模型 | 多组学数据，生理参数，组织学数据 | 6只接受低剂量索马鲁肽治疗的ZSF1肥胖大鼠 | NA | 单细胞RNA测序，蛋白质组学 | NA | NA |
| 65 | 2025-11-23 |
The Integrated Stress Response Pathway Improves Aged Murine Muscle Stem Cell Activation and in vivo Regeneration
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.26.678822
PMID:41256688
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研究论文 | 本研究揭示整合应激反应通路在调控衰老肌肉干细胞激活和再生功能中的关键作用 | 首次发现整合应激反应通路是调控肌肉干细胞状态转变的关键分子调节器，并证明其药理激活可改善衰老肌肉干细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类肌肉干细胞中的适用性仍需验证 | 探究衰老过程中肌肉干细胞激活和再生功能的分子调控机制 | 成年和衰老小鼠的肌肉干细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关肌肉疾病 | 单细胞RNA测序, Cell Painting, 异质运动性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 表型数据 | 成年和衰老小鼠肌肉干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2025-11-21 |
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579839
PMID:38405697
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研究论文 | 提出一种名为NCLUSION的非参数聚类方法，能够在单细胞RNA测序数据中同时进行细胞聚类和标记基因选择 | 使用无限混合模型结合贝叶斯稀疏先验，实现聚类与标记基因选择的同步进行，避免了传统方法中差异表达分析带来的假发现率膨胀问题 | NA | 开发可扩展的单细胞RNA测序数据分析方法，解决现有聚类方法的局限性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无限混合模型，变分推断算法 | 基因表达数据 | 可达数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-11-20 |
CDK4 or CDK6 upregulation induces DNA replication stress and genomic instability to cause EGFR targeted therapy resistance in lung cancer
2025-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.12.584638
PMID:41256559
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研究论文 | 本研究揭示了CDK4或CDK6上调通过诱导DNA复制应激和基因组不稳定性导致EGFR突变肺癌对靶向治疗产生耐药性的机制 | 首次阐明CDK4/6上调通过复制应激和基因组不稳定性驱动EGFR靶向治疗耐药的具体分子机制 | 机制研究主要基于临床前模型，需要进一步临床验证 | 探究CDK4/6上调导致EGFR突变肺癌靶向治疗耐药的分子机制 | EGFR突变肺腺癌患者样本和临床前模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,拷贝数分析 | NA | 基因表达数据,拷贝数变异数据,单细胞测序数据 | EGFR突变肺腺癌患者活检样本和临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-11-20 |
Inferring spatial single-cell-level interactions through interpreting cell state and niche correlations learned by self-supervised graph transformer
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.21.608964
PMID:41256640
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研究论文 | 提出一种基于自监督图变换器的模型GITIII，用于从空间转录组数据中推断单细胞水平的细胞间相互作用 | 将细胞视为单词，细胞周围环境视为上下文，通过自监督图变换器学习细胞状态与生态位相关性来推断细胞间相互作用 | NA | 开发能够从空间转录组数据中推断和解释单细胞水平细胞间相互作用的新方法 | 多个物种、器官和平台的四个空间转录组数据集中的细胞 | 空间转录组学 | 肿瘤微环境，脑部疾病 | 空间转录组学，图神经网络 | 图变换器，自监督学习 | 空间转录组数据，单细胞数据 | 四个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2025-11-20 |
Spatiomolecular mapping reveals anatomical organization of heterogeneous cell types in the human nucleus accumbens
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.10.675374
PMID:40964296
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，构建了人类伏隔核细胞类型和空间域的空间分子图谱 | 首次在人类大脑中发现连续的基因表达空间梯度，揭示了DRD1和DRD2中型多棘神经元更复杂的空间组织模式 | 研究基于10名神经典型成年捐赠者的死后组织样本，样本量相对有限 | 解析人类伏隔核细胞类型和空间组织的分子特征及其与神经精神疾病的关联 | 人类伏隔核组织样本 | 空间转录组学 | 神经精神疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 10名神经典型成年捐赠者的伏隔核组织 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-11-20 |
CD1d+ Goblet Cells Expand Colon-Resident Immature, Intermediate and Differentiated iNKT Cells to Limit Colitis
2025-Sep-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7603392/v1
PMID:41041542
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现结肠中存在不同发育阶段的iNKT细胞，并揭示杯状细胞通过CD1d介导的抗原呈递促进iNKT细胞扩增从而抑制结肠炎 | 首次证明成人结肠中存在具有可塑性的iNKT细胞前体，并发现杯状细胞作为非经典抗原呈递细胞的新功能 | NA | 探究结肠iNKT细胞的发育特性和在结肠炎中的保护机制 | 人类和小鼠的结肠iNKT细胞及CD1d+杯状细胞 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-11-19 |
Tumor microenvironment delineates differential responders to trastuzumab emtansine in HER2-positive metastatic breast cancer patients previously treated with pyrotinib: an exploratory biomarker analysis of a phase II study (NJMU-BC02)
2025-Sep-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02409-2
PMID:41016944
|
研究论文 | 探索T-DM1在既往接受吡咯替尼治疗的HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效及肿瘤微环境生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序揭示癌细胞低细胞周期活性、活化巨噬细胞和CD8+ T细胞与T-DM1良好疗效相关 | 样本量较小（36例），为探索性生物标志物分析 | 评估T-DM1在既往接受吡咯替尼和/或曲妥珠单抗+帕妥珠单抗治疗失败的HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效和安全性 | HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 36例HER2阳性转移性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-11-19 |
How Single-Cell Transcriptomics of Hydractinia Is Informing the Evolution of Cnidarian Sensory Systems
2025-Sep-26, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf090
PMID:40504553
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术构建了水螅虫成年群体的细胞图谱，探索其细胞生物学和细胞类型表达谱 | 构建了更新的水螅虫单细胞转录组图谱，首次全面探索其感觉细胞类型（包括刺细胞和神经元）及其基因表达的进化 | NA | 深入了解水螅虫的细胞生物学、细胞分化遗传调控以及感觉系统的进化 | 水螅虫（Hydractinia symbiolongicarpus 和 H. echinata）的成年群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR/Cas9基因敲除，shRNA敲低，合成RNA过表达 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2025-11-19 |
Distinct roles for NF-κB in hematopoietic stem cells and the bone marrow milieu in promoting hematopoietic aging
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116193
PMID:40875292
|
研究论文 | 本研究通过实验模型解析NF-κB在造血衰老中的不同作用机制 | 首次揭示NF-κB在造血干细胞自主功能和骨髓微环境中分别调控造血衰老不同表型的独立机制 | 研究基于特定基因缺陷模型，可能无法完全反映自然衰老过程 | 阐明炎症信号通路NF-κB在造血衰老过程中的具体作用机制 | 造血干细胞和骨髓微环境 | 单细胞生物学 | 造血系统衰老 | 单细胞RNA测序 | IκB缺陷小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及人类HSC数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-11-19 |
Development of an electroconductive Heart-on-a-chip model to investigate cellular and molecular response of human cardiac tissue to gold nanomaterials
2025-Sep, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 开发了一种导电性心脏芯片模型，用于研究人类心脏组织对金纳米材料的细胞和分子响应 | 首次将导电性水凝胶支架与微流控芯片系统结合，构建具有改善电生理特性的3D心脏芯片模型 | 模型仍需进一步验证其在长期培养和疾病建模中的稳定性 | 开发更仿生的体外心脏组织模型以研究心脏发育和药物反应 | 人类诱导多能干细胞来源的心肌细胞和心脏成纤维细胞 | 组织工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 心脏芯片模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-11-18 |
Single-cell sequencing insights into the transcriptional landscape of cerebral cavernous malformations
2025-Sep-30, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-10011-x
PMID:41028361
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在脑 cavernous 血管畸形研究中的应用进展 | 首次系统总结单细胞测序在CCM疾病中揭示不同细胞类型转录景观的研究进展 | NA | 探索单细胞测序技术在脑 cavernous 血管畸形研究中的应用价值 | 脑 cavernous 血管畸形中的内皮细胞、壁细胞、成纤维细胞、星形胶质细胞和免疫细胞 | 单细胞生物学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-11-18 |
Dynamic modulation of claudin18.2 expression and remodeling of the tumor microenvironment in gastric cancer during chemo-immunotherapy
2025-Sep-29, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012683
PMID:41027671
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌化疗免疫治疗期间Claudin18.2表达的动态变化及其与肿瘤微环境重塑的关系 | 首次系统揭示了CLDN18.2在化疗免疫治疗过程中的动态表达规律及其与免疫抑制性、纤维化肿瘤微环境的关联 | 单臂二期临床试验设计，样本量有限（57例患者），生存结果在CLDN182阳性和阴性组间无显著差异 | 阐明CLDN18.2在胃癌化疗免疫治疗中的动态表达模式及其对肿瘤微环境的影响 | 晚期胃癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组织化学, 全转录组测序, 全外显子测序, 单细胞RNA测序 | NA | 组织图像, 基因组数据, 转录组数据 | 57例晚期胃癌患者系列肿瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序, 全外显子测序 | NA | NA |
| 77 | 2025-11-18 |
KC1036, a multi-kinase inhibitor with anti-angiogenic activity, can effectively suppress the tumor growth of Ewing sarcoma
2025-Sep-18, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-10008-6
PMID:40965696
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析尤文肉瘤肿瘤微环境中的细胞间通讯网络，并验证新型多激酶抑制剂KC1036在临床前模型中的抗肿瘤效果 | 首次绘制尤文肉瘤的细胞间通讯图谱，并发现新型多激酶抑制剂KC1036相比现有药物具有更优的抗肿瘤效果 | 研究仅限于临床前模型，尚未进行人体临床试验 | 开发尤文肉瘤的替代治疗策略 | 尤文肉瘤细胞系、细胞系来源异种移植模型和患者来源异种移植模型 | 单细胞测序分析 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | CDX模型、PDX模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-11-18 |
Single-vessel transcriptome map pathological landscapes and reveal NR2F2-mediated smooth muscle cell phenotype acquisition in capillary malformations
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.02.673874
PMID:40950147
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了毛细血管畸形中血管病理景观及NR2F2介导的平滑肌细胞表型获得机制 | 首次在单血管水平构建毛细血管畸形的空间转录组图谱，发现NR2F2在调控平滑肌细胞表型获得中的核心作用 | 研究样本量有限，主要基于体外iPSC模型验证，需要更多临床样本验证 | 探究毛细血管畸形的血管发病机制及病理重塑过程 | 毛细血管畸形病变组织及iPSC分化的血管细胞 | 空间转录组学 | 血管畸形 | 空间全转录组分析,单细胞RNA测序,磷酸化蛋白质组学,免疫荧光染色 | iPSC分化模型,Tet-on系统基因调控 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,磷酸化蛋白质组数据,免疫荧光图像 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序,磷酸化蛋白质组学 | GeoMx | 空间全转录组分析平台 |
| 79 | 2025-11-17 |
Precision and Accuracy in Quantitative Measurement of Gene Expression from Single-cell/nucleus RNA Sequencing Data
2025-Sep-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf077
PMID:40857558
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研究论文 | 系统评估单细胞/单核RNA测序数据中基因表达定量测量的精确度和准确度 | 首次系统评估sc/snRNA-seq数据的定量精确度和准确度，建立了数据驱动的研究设计阈值，并开发了VICE工具评估数据质量 | 研究主要基于单核吞噬细胞数据，可能不适用于所有细胞类型 | 提高单细胞/单核RNA测序研究的可靠性和可重复性 | 单核吞噬细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3,682,576个细胞来自339个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-11-15 |
KEGNI: knowledge graph enhanced framework for gene regulatory network inference
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03780-7
PMID:40983951
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研究论文 | 提出一种知识图谱增强的基因调控网络推断框架KEGNI，利用图自编码器从单细胞RNA测序数据中推断细胞类型特异性基因调控网络 | 首次将知识图谱与图自编码器相结合用于基因调控网络推断，能够识别驱动基因并阐明不同细胞背景下的调控机制 | NA | 开发更准确的细胞类型特异性基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 图自编码器 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |