单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 959 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-10-05 |
Long-chain sulfatide enrichment is an actionable metabolic vulnerability in intraductal papillary mucinous neoplasm (IPMN)-associated pancreatic cancers
2025-Sep-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335220
PMID:40268349
|
研究论文 | 本研究通过跨物种空间分析发现长链硫苷脂富集是胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤恶性进展的关键代谢弱点 | 首次发现长链硫苷脂在IPMN/PDAC中的选择性富集，并证实UGT8抑制可通过神经酰胺介导的线粒体自噬激活内在凋亡通路 | 样本量相对有限（n=23），主要基于小鼠模型验证 | 揭示IPMN向PDAC恶性进展的生化分子驱动机制 | 人类切除的IPMN/PDAC组织（n=23）和Kras;Gnas突变小鼠模型 | 空间多组学 | 胰腺癌 | MALDI质谱成像, Visium空间转录组, CRISPR/cas9, siRNA, 药理学抑制 | NA | 空间代谢组, 空间转录组 | 23例人类组织样本及小鼠模型 | 10x Genomics | 空间转录组 | Visium | Visium空间转录组技术 |
| 702 | 2025-10-05 |
The ferroptosis-associated gene TIMP1 facilitates skin scar formation through the interaction with CST3 in fibroblasts
2025-Sep-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115496
PMID:40925202
|
研究论文 | 本研究揭示铁死亡相关基因TIMP1通过与CST3相互作用促进皮肤瘢痕形成的分子机制 | 首次发现TIMP1通过调控铁死亡过程促进成纤维细胞分化，并构建了'成纤维细胞-巨噬细胞'双向调控网络 | 研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探究皮肤瘢痕形成的分子调控机制 | 人皮肤成纤维细胞和巨噬细胞 | 生物医学 | 皮肤瘢痕 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 细胞通讯分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 703 | 2025-10-05 |
Repurposing zafirlukast confers renal protection in ischemia-reperfusion injury via suppressing macrophage METosis
2025-Sep-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115459
PMID:40925201
|
研究论文 | 本研究通过重新利用哮喘药物扎鲁司特，发现其通过抑制巨噬细胞METosis对肾脏缺血再灌注损伤具有保护作用 | 首次证明扎鲁司特通过靶向巨噬细胞METosis发挥肾脏保护作用，为药物再利用提供了新策略 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 开发更安全的肾脏缺血再灌注损伤治疗药物 | 小鼠肾脏缺血再灌注损伤模型 | 医学研究 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞转录组学、免疫荧光、流式细胞术 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 704 | 2025-10-05 |
Differential phagocytosis induces diverse macrophage activation states in malignant gliomas
2025-Sep-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012211
PMID:40912739
|
研究论文 | 本研究探讨放疗和CD47阻断如何通过调节巨噬细胞吞噬作用影响恶性胶质瘤中的巨噬细胞活化状态 | 首次通过单细胞RNA测序揭示吞噬性巨噬细胞与非吞噬性巨噬细胞的转录组差异，发现吞噬作用驱动巨噬细胞特化和可塑性的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索放疗与CD47阻断联合治疗对巨噬细胞吞噬功能和活化状态的影响机制 | 弥漫性中线胶质瘤和胶质母细胞瘤细胞系，外周血单核细胞来源和骨髓来源的巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 恶性胶质瘤 | 流式细胞术, ELISA, 单细胞RNA测序, 体外吞噬实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 人源和小鼠胶质瘤细胞系，异种移植和同系小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 705 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of Barrett's esophagus and carcinoma reveals cell types conferring risk via genetic predisposition
2025-Sep-02, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100980
PMID:40925382
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析巴雷特食管和食管腺癌，揭示与遗传易感性相关的风险细胞类型 | 首次整合单细胞RNA测序与全基因组关联数据，确定巴雷特食管和食管腺癌的细胞类型特异性遗传风险 | 未探讨所识别细胞类型和细胞过程标记物的诊断价值 | 确定参与巴雷特食管和食管腺癌遗传易感性的特定细胞类型 | 巴雷特食管、食管腺癌及配对正常组织 | 单细胞基因组学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 巴雷特食管、食管腺癌及配对正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2025-10-05 |
Validation of single-cell transcriptomic profiles from Illumina and MGI Tech sequencing platforms
2025-Sep, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70087
PMID:40490970
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研究论文 | 本研究验证了Illumina和MGI Tech两个测序平台在单细胞转录组分析中的性能比较 | 首次系统比较Illumina和MGI Tech在单细胞RNA测序中的表现，特别是在异质性样本中的影响 | 仅使用三个人类癌症样本，样本量有限 | 评估不同测序平台对单细胞转录组分析结果的影响 | 人类癌症样本 | 单细胞测序 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个人类癌症样本 | Illumina, MGI Tech | 单细胞RNA-seq | NA | 高通量短读长测序平台 |
| 707 | 2025-10-05 |
Genetics of Congenital Heart Disease: A Narrative Review of Challenges and Strategies in Identifying Novel Genes
2025-Sep, Cureus
DOI:10.7759/cureus.91674
PMID:40917916
|
综述 | 本文综述了先天性心脏病遗传学研究面临的挑战与识别新基因的策略 | 系统总结了新一代测序技术在发现表观遗传修饰、体细胞嵌合和非编码调控变异等新型遗传因素方面的最新进展 | 将基因组数据转化为临床风险预测和治疗指导仍面临挑战 | 通过基因组技术进展更好理解心脏发育遗传学与CHD发病机制的关联 | 先天性心脏病患者及其遗传因素 | 基因组学 | 先天性心脏病 | 新一代测序，单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 708 | 2025-10-05 |
Inherent single-cell heterogeneity of the transcriptional response to hypoxia in cancer cells
2025-Sep, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcaf021
PMID:40918648
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了癌细胞在缺氧条件下HIF反应的内在异质性 | 首次在相同培养条件下证明癌细胞对缺氧的转录反应存在显著的单细胞异质性，特别是HIF-2靶基因的异质性远超预期 | 研究主要基于体外细胞系模型，未涉及完整的肿瘤微环境 | 探究癌细胞在缺氧条件下转录反应的单个细胞水平异质性 | 非克隆细胞系和多个克隆衍生物，包括HIF-1α或HIF-2α敲除细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个非克隆细胞系和克隆衍生物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 709 | 2025-10-05 |
Less is more: improving cell-type identification with augmentation-free single-cell RNA-Seq contrastive learning
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf437
PMID:40794574
|
研究论文 | 提出一种无需数据增强的单细胞RNA测序对比学习算法AF-RCL，用于改进细胞类型识别 | 简化传统数据增强操作并采用新的对比学习损失函数，在细胞类型识别任务中实现最先进的预测性能 | NA | 改进单细胞RNA测序分析中的细胞类型识别任务 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 710 | 2025-10-05 |
Mitigation of multi-scale biases in cell-type deconvolution for spatially resolved transcriptomics using HarmoDecon
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf451
PMID:40796171
|
研究论文 | 提出HarmoDecon模型用于缓解空间转录组学中细胞类型反卷积的多尺度偏差问题 | 首次解决了空间转录组学中三个尺度的偏差问题：单个点、整个组织样本以及不同平台间的数据分布差异 | NA | 开发能够减少空间转录组学细胞类型反卷积偏差的新方法 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 半监督深度学习，高斯混合图卷积网络 | 基因表达空间数据 | STARmap和osmFISH数据集，10x Visium数据集，人类乳腺癌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Visium | NA |
| 711 | 2025-10-05 |
Unveiling the role of STAT1-activated macrophages in abdominal aortic aneurysm: Insights from scRNA-seq and prognostic signature development
2025-Sep, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2025.107528
PMID:40803394
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示STAT1激活的巨噬细胞在腹主动脉瘤中的作用并开发预后特征 | 首次通过单细胞RNA测序发现STAT1通路介导M1/M2巨噬细胞间通讯，并构建了十基因炎症特征预测AAA预后 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明腹主动脉瘤发病机制中巨噬细胞极化的分子机制 | 腹主动脉瘤小鼠模型和健康对照小鼠 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，Western blotting，实时PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 3个AAA小鼠模型和2个健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 712 | 2025-10-05 |
Maternal-Fetal Interface Cell Dysfunction in Patients With Preeclampsia Revealed via Single-Cell RNA Sequencing
2025-Sep, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70101
PMID:40924867
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示先兆子痫患者母胎界面细胞功能障碍 | 首次在单细胞水平揭示先兆子痫患者绒毛滋养层细胞向合体滋养层细胞异常分化的趋势，并发现TMEM200A基因表达下降导致绒毛外滋养细胞侵袭能力减弱 | 样本量较小（PE组3例，正常妊娠组3例），需要更大规模研究验证 | 探究先兆子痫发病机制中胎盘和蜕膜组织细胞类型的异质性变化 | 剖宫产获取的胎盘和蜕膜组织细胞 | 单细胞测序 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序 | 基因集变异分析(GSVA)，伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 6例患者（3例先兆子痫，3例正常妊娠），共32,279个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 713 | 2025-10-05 |
Testis-specific protein HSF5 is essential for proper chromatin organization and transcriptional reprogramming to drive pachynema progression
2025-Sep-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了睾丸特异性蛋白HSF5在调控粗线期染色质组织和转录重编程中的关键作用 | 首次发现HSF5通过形成HSF5-USP7复合物抑制减数分裂性染色体上的H2AK119ub修饰，并揭示其在XY小体形成和精子蛋白酶体活性调控中的新功能 | HSF5调控转录调控网络的具体分子机制尚未完全阐明 | 阐明HSF5在哺乳动物减数分裂前期I粗线期进展中的分子调控机制 | 小鼠精母细胞 | 生殖生物学 | 男性不育症 | ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 714 | 2025-10-05 |
Acrylamide-induced noradrenergic axon degeneration is promoted via a non-cell autonomous mechanism, involving microglial Tnfaip2/TNF-α and oxidative stress pathways
2025-Sep-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139125
PMID:40664071
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研究论文 | 本研究揭示了丙烯酰胺通过非细胞自主机制促进去甲肾上腺素能轴突退化的分子机制 | 首次发现丙烯酰胺通过小胶质细胞TNF-α和氧化应激通路以非细胞自主方式促进轴突退化 | 研究主要基于小鼠和细胞模型，人类相关性需进一步验证 | 探究环境毒物诱导认知功能障碍的神经退行性机制 | 小鼠脑组织、小胶质细胞BV2系、1C11神经元细胞系 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 715 | 2025-10-05 |
Mitoribosome-Targeting Antibiotics Suppress Osteoclastogenesis and Periodontitis-Induced Bone Loss by Blocking Mitochondrial Protein Synthesis
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501619R
PMID:40923938
|
研究论文 | 本研究探讨靶向线粒体核糖体的抗生素雷德唑胺通过抑制线粒体蛋白质合成来抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失 | 首次发现雷德唑胺通过靶向线粒体功能抑制破骨细胞分化，为牙周炎治疗提供新策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 研究雷德唑胺抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失的机制 | RAW264.7细胞、骨髓来源巨噬细胞(BMM)和牙周炎大鼠模型 | 单细胞测序分析 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、电子显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | 健康个体和重度慢性牙周炎患者的牙周组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 716 | 2025-10-05 |
Identifying potential therapeutic targets in periodontitis: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2025-Sep-09, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04580-3
PMID:40921808
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析，识别与牙周炎相关的关键基因特征 | 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合，识别出牙周炎的四个枢纽基因(CXCR4, ARHGDIB, PLAT, C19orf10) | 仅分析了GEO数据库中的三个独立数据集，样本来源有限 | 识别牙周炎的潜在治疗靶点和分子机制 | 牙周炎相关基因表达数据和细胞类型 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 转录组学分析, GO/KEGG富集分析 | LASSO, 随机森林 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 三个独立数据集(来自GEO数据库) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 717 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover the prognostic, epigenetic, and immunological roles of FANCC in low-grade glioma
2025-Sep-09, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2556255
PMID:40923898
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了FANCC在低级别胶质瘤中的预后、表观遗传和免疫调控作用 | 首次报道FANCC作为低级别胶质瘤的致癌驱动因子，通过免疫微环境重编程和DNA修复失调协同促进肿瘤进展 | NA | 全面研究FANCC在低级别胶质瘤中的临床意义、预后价值和分子机制，以确定新的治疗靶点 | 低级别胶质瘤患者样本 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, GSEA分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 718 | 2025-10-05 |
NOTCH3 drives fatty acid oxidation and ferroptosis resistance in aggressive meningiomas
2025-Sep-09, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-05208-5
PMID:40924320
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研究论文 | 本研究揭示了NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中通过驱动脂肪酸氧化代谢重编程赋予铁死亡抵抗性的新机制 | 首次发现NOTCH3通过促进脂肪酸氧化代谢重编程导致脂质耗竭，从而赋予脑膜瘤细胞铁死亡抵抗性 | 研究主要基于细胞系模型，需要进一步在体内验证 | 探究NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中的代谢调控机制及其与治疗抵抗的关系 | 人类脑膜瘤细胞系和患者来源的原代脑膜瘤细胞 | 癌症代谢 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 脂质组学, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 脂质数据 | 人类脑膜瘤细胞系和患者来源的原代脑膜瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 719 | 2025-10-05 |
Protective Role of Apelin in a Mouse Model of Post-Intensive Care Syndrome
2025-Sep-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0028OC
PMID:40920972
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型发现Apelin-APJ信号通路在重症监护后综合征(PICS)中的保护作用 | 首次揭示Apelin-APJ信号通路受损通过破坏器官间稳态参与PICS发病机制 | 需要进一步研究明确组织特异性作用 | 探讨PICS的分子机制及潜在治疗策略 | 小鼠模型和ARDS/严重COVID-19幸存者 | NA | 重症监护后综合征 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 基因表达数据,血液样本 | 小鼠模型和ARDS/COVID-19患者(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | NA |
| 720 | 2025-10-05 |
Extracellular Matrix and Fibroblast Activation in Lymphangioleiomyomatosis
2025-Sep-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0237OC
PMID:40920984
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析淋巴管平滑肌瘤病中细胞外基质和成纤维细胞激活的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术将LAM细胞按癌症干细胞基因表达分为三个亚群，并发现mTORC1驱动的4E-BP1/eIF4E翻译控制机制 | 研究针对罕见疾病样本量有限，机制研究主要基于体外实验 | 探究淋巴管平滑肌瘤病中细胞外基质和成纤维细胞激活的分子机制 | 淋巴管平滑肌瘤病细胞和LAM相关成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |