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当前共找到 801 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-10-06 |
Spatialsmooth: a spatially-aware convolutional autoencoder framework for enhanced deconvolution of spatial transcriptomics data
2025-Sep-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11959-2
PMID:40890608
|
研究论文 | 提出基于卷积自编码器的空间感知框架Spatialsmooth，用于增强空间转录组数据的反卷积分析 | 整合多种空间反卷积工具，利用位置编码充分挖掘空间位置信息，并通过卷积自编码器优化细胞类型组成的空间分布 | NA | 开发空间转录组数据反卷积方法以提高细胞类型组成推断的准确性和空间一致性 | 胰腺导管腺癌(PDAC)数据集和基准数据 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 卷积自编码器 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 702 | 2025-10-06 |
Identification of severity related mutation hotspots in SARS-CoV-2 using a density-based clustering approach
2025-Sep-01, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-025-00476-3
PMID:40890768
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研究论文 | 使用密度聚类方法识别SARS-CoV-2基因组中与疾病严重程度相关的突变热点区域 | 开发Mutclust密度聚类算法识别突变热点，首次发现28个与COVID-19严重程度相关的突变区域并揭示其与NK细胞功能的关联 | 样本量相对有限（387名患者），需要更大规模验证 | 识别SARS-CoV-2基因组中与患者疾病严重程度相关的突变热点 | SARS-CoV-2病毒基因组突变热点与COVID-19患者 | 生物信息学 | COVID-19 | 密度聚类算法，网络传播分析，单细胞RNA测序 | Mutclust聚类算法 | 基因组序列数据，单细胞RNA-seq数据，细胞因子数据 | 387名感染患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 703 | 2025-10-06 |
Crosstalk between heterogeneous cancer-associated fibroblast subpopulations and the immune system in breast cancer: key players and promising therapeutic targets
2025-Sep-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03527-z
PMID:40890855
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综述 | 探讨乳腺癌中异质性癌症相关成纤维细胞亚群与免疫系统的相互作用及其治疗潜力 | 聚焦CAF异质性与免疫系统的双向互作机制，系统总结基于CAF的乳腺癌治疗策略 | NA | 阐明CAF异质亚群与免疫细胞互作在肿瘤免疫微环境形成中的作用 | 乳腺癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞亚群和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 704 | 2025-10-06 |
Integrated Single-Cell RNA-Seq Reveals Immunosuppressive Mechanisms of Treg Cell Differentiation and Tumor Microenvironment Interactions in Colorectal Cancer
2025-Sep, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71202
PMID:40891683
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据揭示结直肠癌中Treg细胞分化及其与肿瘤微环境相互作用的免疫抑制机制 | 首次系统揭示TGFβ1+ Treg细胞在低分化结直肠腺癌中的扩增及其通过特定配体-受体对介导CD8+ T细胞功能耗竭的新机制 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，样本来源有限，需要更多前瞻性研究验证 | 探索结直肠癌微环境并发现新的治疗靶点 | 结直肠癌患者肿瘤组织中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | 细胞聚类分析, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 整合GEO数据库中三个数据集(GSE164522, GSE132465, GSE144735)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 705 | 2025-10-06 |
Dual probe ligation in situ hybridization with rolling-circle amplification for high-plex spatial transcriptomics
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102207
PMID:40893776
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研究论文 | 开发了一种基于双探针连接和滚环扩增的高通量空间转录组学方法LISH-LnR，用于分析FFPE临床样本中的mRNA空间分布 | 在原有连接原位杂交技术基础上引入滚环扩增，提高了检测灵敏度和多重分析能力，并开发了可精细调控检测性能的分子变阻器系统 | 主要针对FFPE样本中不同程度降解的mRNA进行分析，可能受限于样本质量 | 开发适用于FFPE临床样本的高通量空间转录组学技术 | 包涵体肌炎患者和儿童横纹肌肉瘤患者的固定组织样本 | 空间转录组学 | 肌肉疾病, 儿童癌症 | 连接原位杂交, 滚环扩增, 迭代荧光探针杂交成像 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | 包涵体肌炎和儿童横纹肌肉瘤患者组织样本 | NA | 空间转录组学, 原位杂交 | NA | LISH-Lock'n'Roll (LISH-LnR) 方法 |
| 706 | 2025-10-06 |
ST-deconv: an accurate deconvolution approach for spatial transcriptome data utilizing self-encoding and contrastive learning
2025-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf109
PMID:40896262
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研究论文 | 提出一种基于深度学习的空间转录组数据反卷积方法ST-deconv，整合空间信息提高细胞类型解析精度 | 结合自编码器和对比学习增强相邻点的空间表示，采用领域对抗网络提升跨数据集泛化能力 | 未明确说明方法在更复杂组织类型或更低质量数据上的性能表现 | 开发高精度空间转录组数据反卷积方法以解析细胞类型组成 | 空间转录组数据中的细胞类型组成 | 空间转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 自编码器，对比学习，领域对抗网络 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 小鼠嗅球和人类胰腺导管腺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 707 | 2025-10-06 |
EML4-ALK Rearrangement Creates a Distinctive Myeloid Cell-Dominant Immunosuppressive Microenvironment in Lung Cancer
2025-Sep-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0532
PMID:40627846
|
研究论文 | 本研究揭示了EML4-ALK重排通过创建髓系细胞主导的免疫抑制微环境导致肺癌对免疫治疗不响应的机制 | 首次发现ALK+肺腺癌具有独特的髓系细胞主导免疫抑制微环境，并证实IL6R抑制剂可逆转该免疫抑制状态 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索ALK+肺腺癌对免疫治疗不响应的免疫学机制 | ALK阳性和阴性肺腺癌患者的肿瘤组织及小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，肿瘤浸润白细胞分析 | 小鼠ALK+肺腺癌模型 | 基因表达数据，细胞计数数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 708 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of pig lung transplantation reveals macrophage ferroptosis in lung ischemia-reperfusion injury
2025-Sep, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2025.04.011
PMID:40262727
|
研究论文 | 通过猪肺移植模型的单细胞RNA测序研究巨噬细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用 | 首次建立猪原位单肺移植模型模拟长时间冷缺血再灌注损伤，并通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞铁死亡的关键作用 | 研究样本量有限，需要进一步验证巨噬细胞铁死亡的具体分子机制 | 研究肺缺血再灌注损伤的病理机制并建立大型动物模型 | 猪肺移植模型中的肺组织样本 | 单细胞测序分析 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序，透射电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，显微镜图像 | 猪肺移植模型组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 709 | 2025-10-06 |
Association Between T2DM, TyG Index, Multiple Sclerosis, and Rheumatoid Arthritis: Insights into Potential Mechanisms
2025-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04961-y
PMID:40279037
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析探索2型糖尿病、胰岛素抵抗与自身免疫疾病的因果关系及潜在机制 | 首次结合孟德尔随机化、贝叶斯共定位和单细胞RNA测序综合分析T2DM、TyG指数与自身免疫疾病的因果关系及免疫细胞介导机制 | 研究基于汇总级GWAS数据，无法完全排除潜在混杂因素的影响 | 探索2型糖尿病和胰岛素抵抗与自身免疫疾病的因果关系及免疫机制 | 2型糖尿病、TyG指数、多发性硬化症、类风湿关节炎及特定标志免疫细胞 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 孟德尔随机化分析, 贝叶斯共定位, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 多个GWAS研究的汇总数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 710 | 2025-10-06 |
eIF3f promotes tumour malignancy by remodelling fatty acid biosynthesis in hepatocellular carcinoma
2025-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.02.045
PMID:40154622
|
研究论文 | 本研究揭示了eIF3f通过稳定ACSL4促进肝细胞癌脂肪酸生物合成和肿瘤恶性进展的分子机制 | 首次发现eIF3f通过K48连接的去泛素化稳定ACSL4，促进脂肪酸生物合成，并阐明其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 需要进一步的临床研究来确认eIF3f靶向治疗在人类患者中的疗效 | 确定肝细胞癌中脂肪酸代谢的特征及其分子机制 | 肝细胞癌组织、类器官模型、多物种肿瘤模型 | 肿瘤代谢 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,代谢流分析,透射电子显微镜,飞行时间质谱流式细胞术,多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,代谢物数据,蛋白质数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 711 | 2025-10-06 |
Harnessing Calmodulin-Related Genes to Build a Prognostic Model in Esophageal Squamous Cell Carcinoma for a Comprehensive Analysis of Single-Cell Immune Characteristics and Drug Efficacy
2025-Sep-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000561
PMID:40375794
|
研究论文 | 基于钙调蛋白相关基因构建食管鳞状细胞癌预后模型，并分析单细胞免疫特征和药物疗效 | 首次利用钙调蛋白相关基因构建ESCC预后模型，结合单细胞测序分析基因表达模式，并通过CETSA实验验证药物与靶点的结合稳定性 | 研究基于TCGA数据库，样本量有限，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发食管鳞状细胞癌的预后预测模型并探索潜在治疗药物 | 食管鳞状细胞癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞测序，qPCR，LASSO Cox回归，多变量Cox回归，GSEA富集分析，分子对接，CETSA | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | TCGA-ESCC数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 712 | 2025-10-06 |
Identifying Key Plasma Proteins in the Onset of Parkinson's Disease: Proteome-Wide Mendelian Randomization and Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05041-x
PMID:40380075
|
研究论文 | 通过蛋白质组范围孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析识别帕金森病发病关键血浆蛋白 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序技术系统筛选帕金森病相关血浆蛋白，并揭示其在脑细胞类型中的差异表达模式 | 需要大量实验验证来确认这些蛋白质作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 识别帕金森病发病机制中的关键血浆蛋白，探索诊断标志物和治疗靶点 | 2923种血浆蛋白与帕金森病的因果关系 | 生物信息学 | 帕金森病 | 孟德尔随机化分析、共定位分析、SMR分析、HEIDI检验、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 英国生物银行数据库中的2923种血浆蛋白 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 713 | 2025-10-06 |
The Role of HbA1c in Parkinson's Disease: An Integrative Analysis by Single-Cell, Bulk Transcriptome and Mendelian Randomization
2025-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05063-5
PMID:40397357
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组、批量转录组和孟德尔随机化分析，探讨HbA1c与帕金森病的关系并识别潜在诊断标志物 | 首次结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和孟德尔随机化方法系统研究HbA1c与帕金森病的因果关系 | 研究依赖于公开数据库数据，样本来源和数量可能受限 | 探索HbA1c与帕金森病预后的因果关系并识别诊断生物标志物 | 帕金森病患者与对照组的基因表达数据和遗传变异数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, 机器学习 | 逆方差加权法, 诺莫图, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单核苷酸多态性数据 | 使用GSE20292和GSE157783数据集，包含223个独立SNPs | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 714 | 2025-10-06 |
SEC61G promotes colorectal cancer progression by regulating cytosolic Ca2+ concentration
2025-Sep, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02259-3
PMID:40413702
|
研究论文 | 本研究揭示了SEC61G通过调节胞质钙离子浓度促进结直肠癌进展的机制 | 首次阐明SEC61G通过调节胞质Ca2+浓度激活EGFR通路促进结直肠癌进展的具体分子机制 | 机制研究仍待深入，临床转化价值需要进一步验证 | 探究SEC61G在结直肠癌进展中的作用机制 | 结直肠癌细胞系、肿瘤组织及患者样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析、RT-qPCR、免疫组化、单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 基因组数据、基因表达数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 | TCGA数据集中的结直肠癌样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组测序 | NA | NA |
| 715 | 2025-10-06 |
Spatial omics technology potentially promotes the progress of tumor immunotherapy
2025-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03075-5
PMID:40456924
|
综述 | 本文全面概述了空间组学技术的起源、分类和特点，并探讨其在肿瘤免疫治疗中的应用前景 | 强调空间组学技术相比单细胞测序在保留空间背景和整合多模态分析方面的优势，提出结合其他技术可发现被忽视的治疗靶点 | 临床转化面临挑战，技术应用仍存在局限性 | 探讨空间组学技术如何促进肿瘤免疫治疗的进展 | 肿瘤微环境、B细胞和T细胞、三级淋巴结构 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间组学分析 | NA | 空间多模态数据 | NA | NA | 空间组学 | NA | NA |
| 716 | 2025-10-06 |
Using proteomics and single-cell sequencing to analyze the pathogenesis of recurrent implantation failure associated with uterine natural killer cells
2025-Sep, Archives of gynecology and obstetrics
IF:2.1Q2
DOI:10.1007/s00404-025-08074-8
PMID:40514455
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞测序技术分析了复发性种植失败与子宫自然杀伤细胞的关联机制 | 首次整合蛋白质组学和单细胞测序数据，鉴定出与RIF相关的三个关键基因(AMPD3、H6PD、PAK2)及其调控机制 | 样本量较小(6例RIF患者和6例对照)，需要更大规模研究验证 | 探索复发性种植失败的分子机制，特别关注子宫自然杀伤细胞的作用 | 复发性种植失败患者的子宫内膜组织和自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | 12例子宫内膜组织样本(6例RIF患者和6例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 717 | 2025-10-06 |
Multi-omics reveals the polyethylene terephthalate carcinogenicity: Cancer progression and immune microenvironment
2025-Sep-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118522
PMID:40532600
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研究论文 | 通过多组学方法系统研究聚乙烯 terephthalate (PET) 的致癌机制及其对肿瘤微环境的影响 | 首次整合网络毒理学、机器学习、分子对接、单细胞RNA测序和空间转录omics 系统揭示PET的致癌机制 | 未明确说明样本来源和具体样本数量 | 探究PET塑料的致癌机制及其在肿瘤发生发展中的作用 | PET相关致癌靶点、肿瘤细胞、免疫细胞 | 计算生物学 | 癌症 | 网络毒理学, 机器学习, 分子对接, 单细胞RNA测序, 空间转录omics, 克隆形成实验, western blotting | 机器学习算法 | 组学数据, 分子对接数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录omics | NA | NA |
| 718 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of IGF2BP2 and PRMT5 in gallbladder cancer progression: insights from multi-omics analysis
2025-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03062-w
PMID:40555776
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示IGF2BP2-PRMT5轴在胆囊癌进展中的关键作用 | 首次发现IGF2BP2通过m6A修饰稳定PRMT5表达，并阐明其通过AKT/mTOR通路调控脂质代谢重编程和免疫逃避的新机制 | NA | 阐明驱动胆囊癌进展的分子机制并确定新的治疗靶点 | 胆囊癌细胞和人类化小鼠模型 | 多组学分析 | 胆囊癌 | 单细胞转录组学、高通量测序、蛋白质组学、m6A修饰分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 719 | 2025-10-06 |
CD8+GZMK+CD27+CCR7+ T cells mobilized by splenic sympathetic nerves aggravate brain ischemia‒reperfusion injury via CCL19-positive endothelial cells
2025-Sep, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01311-9
PMID:40659887
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研究论文 | 本研究揭示了脾交感神经通过动员GZMK+CD8+CD27+CCR7+ T细胞亚群经CCL19-CCR7轴加重脑缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现并命名了脑卒中相关的Tsa细胞亚群，阐明了脾交感神经-ADRB2信号通路和CCL19-CCR7趋化轴在脑缺血损伤中的新作用机制 | 研究主要基于动物模型，在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究脾交感神经在脑缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗策略 | 急性缺血性脑卒中患者和短暂性大脑中动脉闭塞小鼠模型 | 免疫神经科学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 急性缺血性脑卒中患者和tMCAO小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 720 | 2025-10-06 |
Expression profile of the ADHD risk gene ADGRL3 during human neurodevelopment and the effects of genetic variation
2025-Sep, The world journal of biological psychiatry : the official journal of the World Federation of Societies of Biological Psychiatry
DOI:10.1080/15622975.2025.2520518
PMID:40552428
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研究论文 | 本研究通过人诱导多能干细胞分化的皮质神经元，探究ADHD风险基因ADGRL3在人类神经发育过程中的表达谱及其遗传变异的影响 | 首次在人类神经发育过程中系统研究ADGRL3基因的表达模式，并揭示rs1397547 SNP对基因转录的调控作用 | 研究基于体外hiPSC分化模型，可能与体内神经发育存在差异 | 阐明ADGRL3基因在人类神经发育过程中的作用及其与ADHD发病机制的关系 | 人诱导多能干细胞分化的皮质神经元 | 神经发育生物学 | 注意缺陷多动障碍 | 单细胞RNA测序,hiPSC分化技术 | NA | 基因表达数据,蛋白质定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |