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当前共找到 857 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-10-06 |
Mapping T cell dynamics to molecular profiles through behavior-guided transcriptomics
2025-Sep, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01126-4
PMID:39930061
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研究论文 | 开发了一种将T细胞活体成像数据与单细胞转录组学整合的方法，用于分析动态T细胞行为相关的基因程序 | 将BEHAV3D活体成像平台与单细胞RNA测序相结合，创建了行为引导转录组学(BGT)方法，能够关联T细胞动态行为与分子特征 | 需要使用者具备基本的细胞培养、成像和编程技能，实验周期较长（一个月） | 开发整合T细胞动态行为与转录组分析的方法，识别功能性T细胞的生物标志物 | 患者来源的肿瘤类器官(PDO)与工程化T细胞的共培养体系 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 活体成像, 荧光激活细胞分选 | BEHAV3D平台, 计算机模拟 | 图像数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 活体成像 | NA | BEHAV3D三维活体成像平台 |
| 682 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in aortic tissue from patients with Behçet's syndrome
2025-Sep-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf252
PMID:40372706
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析白塞综合征患者主动脉组织的细胞和分子变化 | 首次在单细胞水平揭示白塞综合征患者主动脉组织的细胞组成变化和细胞间通讯异常 | 样本量较小（仅3例患者和3例对照），需更大样本验证 | 分析白塞综合征患者主动脉组织中不同细胞亚群的表达谱、表型、功能和细胞间通讯 | 白塞综合征患者和动脉粥样硬化患者的主动脉组织 | 数字病理学 | 白塞综合征 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Harmony, CellChat | 单细胞转录组数据 | 6例参与者（3例白塞综合征，3例动脉粥样硬化） | SeekOne | 单细胞RNA测序 | SeekOne® MM High Flux Single Cell Transcriptome Kit V4.1 | SeekOne® MM高通量单细胞转录组试剂盒V4.1 |
| 683 | 2025-10-06 |
LaGrACE: estimating gene program dysregulation with latent regulatory network
2025-Sep, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00115-3
PMID:40588571
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研究论文 | 提出了一种名为LaGrACE的新方法，用于结合组学数据和临床信息评估基因程序的失调情况 | 开发了能够整合组学数据和临床信息来估计基因程序失调的新方法，并在单细胞分辨率下有效识别药物反应信号 | NA | 开发评估基因程序失调的方法以增强疾病亚群中分子机制的发现 | 合成数据、bulk RNA-seq临床数据集（乳腺癌、慢性阻塞性肺疾病）和单细胞RNA-seq药物扰动数据集 | 机器学习 | 乳腺癌,慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 潜在调控网络模型 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 684 | 2025-10-06 |
A semi-supervised Bayesian approach for marker gene trajectory inference from single-cell RNA-seq data
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf454
PMID:40802529
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研究论文 | 提出了一种名为BayesTraj的半监督贝叶斯框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断标记基因轨迹 | 将轨迹推断从无监督学习转变为半监督学习，整合谱系拓扑和标记基因表达的先验知识，通过概率混合模型和参数函数捕获基因动态 | 未明确说明方法对特定类型数据或实验条件的适用性限制 | 从静态单细胞转录组数据中准确推断细胞发育轨迹和命运转换 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯概率模型，Hamiltonian Monte Carlo | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集和真实数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 685 | 2025-09-06 |
Combined endurance and resistance exercise training alters the spatial transcriptome of skeletal muscle in young adults
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113301
PMID:40894879
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术结合免疫荧光和计算方法，解析了联合耐力与抗阻运动训练对人类骨骼肌肌纤维和单核细胞群体的分子适应机制 | 首次采用空间转录组学技术揭示运动诱导的肌纤维类型特异性基因表达变化，并结合单细胞RNAseq数据发现间质细胞群体与血管生成相关的运动诱导转变 | 研究样本仅限于年轻成年人，未涵盖其他年龄组或特殊人群 | 全面分析联合耐力与抗阻运动训练引起的骨骼肌分子变化 | 人类骨骼肌组织中的肌纤维和单核细胞群体 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、免疫荧光、单细胞RNAseq | 计算方法（未指定具体模型） | 空间转录组数据、单细胞RNAseq数据、图像数据 | 年轻成年人骨骼肌样本（具体数量未明确说明） | NA | NA | NA | NA |
| 686 | 2025-09-06 |
MEK inhibition prevents human skin graft rejection by promoting CD8+TCF1+ over CD8 effector T cells
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113310
PMID:40894910
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研究论文 | 本研究探讨MEK抑制剂trametinib通过调节CD8+T细胞分化延缓人类皮肤移植排斥反应的机制 | 首次在人类移植模型中揭示MEK抑制剂通过促进CD8+TCF1+干细胞样T细胞积累而非减少移植物浸润来延长移植物存活 | 研究基于NSG小鼠重建模型，可能无法完全模拟人类体内免疫环境 | 评估MEK抑制剂在器官移植中的免疫调节作用 | 人类皮肤移植模型和重建的免疫系统 | 移植免疫学 | 移植排斥 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用NSG小鼠重建第三方人类PBMCs的皮肤移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 687 | 2025-09-06 |
Screening, Validation, and Machine Learning-Based Evaluation of Serum Protein Biomarkers for Esophageal Squamous Cell Carcinoma Based on Single-Cell Subtype-Specific Genes
2025-Sep-05, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.5c00475
PMID:40799020
|
研究论文 | 基于单细胞亚型特异性基因筛选、验证血清蛋白生物标志物，并利用机器学习构建食管鳞状细胞癌诊断模型 | 整合scRNA-seq、蛋白质组学和ELISA技术，利用成纤维细胞和上皮细胞的异质性相关基因开发诊断流程，并构建了交互式网络诊断工具 | 模型在验证集的AUC为0.767，性能有待进一步提升 | 开发食管鳞状细胞癌的早期诊断生物标志物和诊断模型 | 食管鳞状细胞癌患者、高级别上皮内瘤变病例和正常对照 | 数字病理学 | 食管癌 | scRNA-seq, 蛋白质组学, ELISA, 机器学习 | SVM | 蛋白质表达数据 | 344例ESCC患者、46例HGIN病例和390例正常对照 | NA | NA | NA | NA |
| 688 | 2025-09-06 |
Patient-Derived Organoids from Multiple Sites of a Single Tumor Recapitulates Intratumoral Heterogeneity in Patients with Gastric Cancer
2025-Sep-05, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl250108
PMID:40910272
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析胃癌患者单个肿瘤不同部位来源的类器官，评估其重现肿瘤内异质性的能力 | 首次在单肿瘤多部位来源的类器官模型中系统揭示神经内分泌标志物上调和热休克蛋白异质性对免疫应答的影响 | 类器官模型在捕捉肿瘤内异质性方面存在局限，需要更全面的评估方法 | 评估患者来源类器官模型重现胃癌肿瘤内异质性的能力 | 胃癌患者单个肿瘤不同部位来源的类器官 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | 单细胞转录组学、免疫组织化学染色 | 患者来源类器官(PDO)模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 单个胃癌肿瘤的多部位采样 | NA | NA | NA | NA |
| 689 | 2025-09-06 |
Cuproptosis-Related Gene FDX1 Induces Malignant Progression and Immune Suppression in Triple-Negative Breast Cancer
2025-Sep-05, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11242-9
PMID:40911146
|
研究论文 | 本研究探讨铜死亡相关基因FDX1在三阴性乳腺癌中的促癌作用及免疫抑制机制 | 首次发现FDX1通过调控铜死亡途径促进TNBC恶性进展并抑制CD8 T细胞免疫应答 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，临床样本验证尚不充分 | 阐明FDX1基因在三阴性乳腺癌发生发展中的作用及免疫调控功能 | 三阴性乳腺癌细胞系、CD8 T细胞和小鼠模型 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | scRNA-seq, qPCR, CCK-8, Transwell, CFSE, LDH, ELISA, IHC | NA | 基因表达数据、细胞功能实验数据 | 单细胞RNA测序数据集、体外培养细胞系及小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 690 | 2025-09-06 |
ROS and Drp1-mediated mitochondrial fission contributes to the hyposalivation caused by Sjögren's disease
2025-Sep-04, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003727
PMID:40908878
|
研究论文 | 本研究探讨了活性氧（ROS）和Drp1介导的线粒体分裂在干燥综合征（SjD）导致唾液分泌减少中的作用，并评估了靶向线粒体分裂的治疗潜力 | 首次通过单细胞测序揭示SjD下颌下腺氧化应激损伤机制，并证实Drp1及其Ser616位点在介导线粒体功能障碍中的关键作用，以及使用Mdivi-1导管内灌注改善唾液分泌的创新治疗方法 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床适用性尚需验证；治疗方法的长期安全性和有效性有待进一步评估 | 阐明ROS和线粒体动力学在干燥综合征相关唾液分泌减少中的作用，并探索靶向线粒体分裂的治疗效果 | 干燥综合征小鼠模型的下颌下腺组织和腺体上皮细胞 | NA | 干燥综合征 | 单细胞测序，线粒体功能评估，分子抑制剂治疗 | NA | 测序数据，生理指标数据，细胞功能数据 | 干燥综合征小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | NA | NA | NA |
| 691 | 2025-10-06 |
SARC028 Samples Reveal an Interplay between TGF-β, IFN Signaling, and Low HLA Class I Expression as Contributors to Ewing Sarcoma Checkpoint Blockade Resistance
2025-Sep-02, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3882
PMID:40627445
|
研究论文 | 本研究通过分析SARC028临床试验中尤文肉瘤患者免疫治疗前后的配对活检样本，揭示了TGF-β信号增强、IFN信号减弱和HLA I类低表达共同导致免疫检查点抑制剂耐药的机制 | 首次在尤文肉瘤中通过空间多组学技术识别出与免疫治疗耐药相关的特定细胞邻域特征 | 样本量有限，仅基于SARC028临床试验的活检样本 | 探究尤文肉瘤对PD1抑制剂耐药的免疫微环境特征 | 尤文肉瘤患者治疗前后的配对肿瘤活检样本 | 数字病理 | 尤文肉瘤 | 多重免疫荧光、空间蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 图像、蛋白质表达数据、基因表达数据 | SARC028临床试验中尤文肉瘤患者的配对活检样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 多重免疫荧光 | NA | NA |
| 692 | 2025-09-06 |
The transcriptional regulation of NUPR1 expression by MYC is implicated in the regulation of ferroptosis in human spermatogonial stem cells
2025-Sep-02, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05818-2
PMID:40892246
|
研究论文 | 本研究探讨NUPR1和MYC在人类精原干细胞铁死亡调控中的作用及其作为非梗阻性无精子症治疗靶点的潜力 | 首次揭示MYC通过直接结合NUPR1启动子调控其表达，从而影响精原干细胞铁死亡过程 | 研究主要基于体外细胞实验和测序数据分析，缺乏体内动物模型验证 | 阐明非梗阻性无精子症中铁死亡的分子调控机制 | 人类精原干细胞和非梗阻性无精子症患者睾丸组织 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质免疫沉淀(ChIP)、免疫荧光分析、环己酰亚胺追踪实验 | NA | 单细胞转录组数据、微阵列数据、基因表达数据 | 非梗阻性无精子症和梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 693 | 2025-09-06 |
Skin Explorer: an interactive single-cell RNA-seq resource for healthy human skin
2025-Sep-02, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.025
PMID:40907604
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 694 | 2025-10-06 |
Multi-omics and Single Cell Sequencing Analyses Reveal Associations of Mitophagy-Related Genes Predicting Clinical Prognosis and Immune Infiltration Characteristics in Osteosarcoma
2025-Sep, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01280-w
PMID:39264525
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研究论文 | 本研究通过多组学和单细胞测序分析，揭示了线粒体自噬相关基因与骨肉瘤临床预后及免疫浸润特征的关联 | 首次报道线粒体自噬在骨肉瘤中的作用，建立了基于线粒体自噬相关基因的新型预后评分系统，并通过单细胞测序探索了其在骨肉瘤细胞亚型中的分布特征 | 样本量相对有限（基于公共数据库），需要进一步实验验证 | 探索线粒体自噬相关基因在骨肉瘤预后预测和免疫浸润中的作用 | 骨肉瘤患者和骨肉瘤细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序，多组学分析，LASSO-多变量Cox回归算法，体外实验 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据，临床预后数据，单细胞测序数据 | 基于TARGET和GEO数据库的骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 695 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts are associated with neo-adjuvant treatment response in oesophageal adenocarcinoma
2025-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03080-8
PMID:40640495
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研究论文 | 本研究探讨癌症相关成纤维细胞在食管腺癌新辅助治疗反应中的作用 | 首次在食管腺癌中系统分析新辅助治疗对肿瘤微环境中成纤维细胞的影响，并鉴定出三种肌成纤维细胞表型 | 样本量相对有限（26例患者），体外模型仅能部分重现体内观察到的表型 | 研究肿瘤微环境成分特别是癌症相关成纤维细胞在新辅助治疗反应中的作用机制 | 食管腺癌患者肿瘤组织和患者来源的细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 组织病理学分析 | 预后模型, 体外共培养模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 组织病理图像 | 26例食管腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 696 | 2025-09-06 |
Pan-cancer analysis implicates novel insights of cholesterol biosynthesis into immunotherapy response prediction and survival prognostication
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110859
PMID:40816003
|
研究论文 | 通过泛癌分析揭示胆固醇生物合成与免疫治疗反应预测及生存预后的新关联 | 首次构建并验证了胆固醇生物合成相关特征（CB.SIG），并发现TNFRSF10B作为预测免疫治疗反应的泛癌生物标志物 | 基于公开数据集的分析，需进一步实验验证 | 探究胆固醇生物合成与免疫检查点抑制剂反应性的关系并开发预测模型 | 泛癌患者样本（包括非小细胞肺癌和乳腺癌细胞系） | 计算生物学 | 泛癌（多种癌症类型） | scRNA-seq, CRISPR筛选, 空间转录组学, 免疫组化 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 40个scRNA-seq数据集、30个TCGA泛癌队列、9个ICI转录组队列、17个CRISPR数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 697 | 2025-09-06 |
SynchDP: A correlation based sequence alignment algorithm for synchronizing longitudinal clinical data
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110853
PMID:40825256
|
研究论文 | 提出一种基于相关性的动态规划算法SynchDP，用于对齐和同步不规则采样的临床时间序列数据 | 开发了能够处理不同长度和采样率的临床时间序列的新型对齐算法，并能从头组装代表性模式 | NA | 解决临床时间序列数据的对齐问题，以量化疾病进展相似性并发现生物标志物 | COVID-19患者的纵向严重程度数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 动态规划算法，单细胞转录组分析 | 动态规划 | 临床时间序列数据，基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 698 | 2025-09-06 |
Applications and prospects of spatial transcriptomics in prostate cancer research: A narrative review
2025-Sep, Current urology
IF:0.9Q4
DOI:10.1097/CU9.0000000000000288
PMID:40894285
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在前列腺癌研究中的应用与前景，重点探讨其在肿瘤微环境、异质性和临床意义方面的价值 | 系统总结了空间转录组学在前列腺癌这一相对研究较少领域的应用潜力，并提出了未来研究方向 | 现有研究仍较为有限，需要更多实证数据支持 | 概述空间转录组学技术原理及其在前列腺癌研究中的应用现状和发展前景 | 前列腺癌肿瘤组织 | 数字病理 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 699 | 2025-09-06 |
PDPN+ cancer-associated fibroblasts correlate with the neoadjuvant immunotherapy response in gastric cancer
2025-Sep, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0250475
PMID:40895767
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研究论文 | 本研究探讨PDPN+癌症相关成纤维细胞（CAFs）与胃癌新辅助免疫治疗反应的相关性 | 首次鉴定PDPN作为CAFs亚群的标志物，并验证其与免疫治疗疗效的负相关性 | 样本来源限于特定临床试验和公共数据库，需进一步扩大验证 | 预测胃癌患者对新辅助免疫治疗的反应 | 胃癌患者组织样本和类器官模型 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq, Western blot, 多重免疫组化/免疫荧光 | GC-PDOs（胃癌患者来源类器官） | 基因表达数据、蛋白质表达数据、影像数据 | 多个公共数据库（TCGA-STAD等）及临床试验NCT04208347的胃癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 700 | 2025-10-06 |
MIG-6 Plays a Critical Role as a PGR Mediator in Maintaining Epithelial and Stromal Cells for Uterine Receptivity
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501455R
PMID:40905903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了MIG-6作为孕酮受体关键介质在维持子宫容受性中的细胞特异性作用机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示MIG-6缺陷对子宫内膜上皮和基质细胞基因表达的特异性影响，并发现LRP2在子宫内膜异位症不孕患者中的表达异常 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究MIG-6缺陷如何破坏子宫细胞群体特异性功能从而导致子宫内膜容受性异常 | 子宫特异性Mig-6基因敲除小鼠的子宫内膜细胞 | 单细胞基因组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mig-6基因敲除小鼠和对照小鼠的子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |