单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 959 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover distinct cellular subtypes involved in neural invasion in pancreatic cancer
2025-Sep-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.020
PMID:40680743
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示胰腺癌神经侵袭中涉及的独特细胞亚型 | 首次系统描绘胰腺癌神经侵袭的细胞组成、谱系动态和空间组织特征，发现新的神经周围成纤维细胞群体和施万细胞亚群 | 样本量相对有限（25例患者），需要进一步验证这些发现在更大队列中的普适性 | 探索胰腺癌神经侵袭的细胞机制和微环境特征 | 25例胰腺导管腺癌患者的62个样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞/单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 25例患者的62个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 682 | 2025-10-05 |
Gene context drift identifies drug targets to mitigate cancer treatment resistance
2025-Sep-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.005
PMID:40578362
|
研究论文 | 开发了一种名为RECODR的计算流程，通过分析单细胞RNA测序数据中基因共表达网络的变化来识别癌症治疗耐药机制 | 首次将基因共表达网络与图嵌入方法相结合，通过检测基因共表达背景的漂移变化来揭示传统方法无法发现的耐药机制 | NA | 识别癌症治疗耐药机制并发现新的药物靶点 | 脉络丛癌、髓母细胞瘤和三阴性乳腺癌 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 图嵌入 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2025-10-05 |
S100A4 facilitates radiation-induced tumor repopulation by driving polyploid giant cancer cells budding
2025-Sep-04, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218017
PMID:40914345
|
研究论文 | 本研究揭示了S100A4通过驱动多倍体巨癌细胞出芽促进放射治疗后肿瘤再生的分子机制 | 首次发现S100A4-ISG15轴通过调控IRF3介导的干扰素-I信号通路促进PGCCs出芽过程 | 研究主要聚焦结直肠癌，其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 阐明放射治疗后多倍体巨癌细胞驱动肿瘤再生的分子机制 | 结直肠癌中的多倍体巨癌细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学，功能基因组学 | 纵向模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 684 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic and genomic changes in the ageing human brain
2025-Sep-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09435-8
PMID:40903571
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究人类前额叶皮层从婴儿期到百岁老人的基因表达和基因组变化 | 首次结合单核RNA测序、单细胞全基因组测序和空间转录组学技术，系统揭示人类大脑发育和衰老过程中的转录组和基因组动态变化 | 研究主要聚焦于前额叶皮层，未涵盖其他脑区；样本年龄跨度大但具体样本数量未明确说明 | 探索人类大脑衰老过程中的细胞分子机制 | 人类前额叶皮层细胞 | 单细胞生物学 | 老年疾病 | 单核RNA测序, 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 空间基因表达数据 | 从婴儿到百岁老人的年龄跨度样本（具体数量未说明） | NA | 单核RNA-seq, 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 685 | 2025-10-05 |
Spatial and functional characterization of IL1RL1+ mast cells reveals immune regulatory roles in renal cancer
2025-Sep-03, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2025.102049
PMID:40912479
|
研究论文 | 本研究通过空间和功能分析揭示了IL1RL1+肥大细胞在肾癌中的免疫调节作用 | 首次系统揭示了IL1RL1+肥大细胞在肾透明细胞癌中的空间分布特征及其通过MHC-I信号通路调控CD8+ T细胞活化的新机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内功能验证 | 阐明IL1RL1在肾透明细胞癌肿瘤微环境中的表达特征和免疫功能 | 肾透明细胞癌患者组织和细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 图像数据 | TCGA和GEO数据库中的肾癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 686 | 2025-10-05 |
Sensitive dissection of a genomic regulatory landscape using bulk and targeted single-cell activation
2025-Sep-03, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100984
PMID:40930101
|
研究论文 | 开发TESLA-seq技术结合CRISPR激活筛选与靶向单细胞RNA测序，用于精确解析基因组调控景观 | 开发了TESLA-seq新技术，能够并行读取数百个增强子对基因座内所有基因的影响 | 研究主要聚焦于PHOX2B基因座，可能不适用于所有基因组区域 | 识别和功能扰动内源性增强子及其靶基因 | PHOX2B基因座周围的基因组调控元件 | 基因组学 | 神经母细胞瘤 | CRISPR激活筛选, 靶向单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 687 | 2025-10-05 |
Cellular cartography reveals mouse prostate organization and determinants of castration resistance
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2427116122
PMID:40854129
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、单细胞多组学和空间转录组学技术，构建小鼠前列腺细胞图谱并揭示去势抵抗的关键决定因素 | 首次系统整合多组学数据揭示小鼠前列腺叶特异性细胞类型及其在去势治疗响应中的转录和表观遗传基础 | 研究主要基于小鼠模型，人类前列腺癌的验证仍需进一步研究 | 解析前列腺癌对雄激素剥夺疗法(ADT)抵抗的细胞机制 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学, 荟萃分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌荟萃分析数据 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 688 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA Sequencing In Pediatric Sepsis: γδ T Cell Exhibits A Differentiation To γδT17 Subtype Along With Significantly Enhanced Cell Communication With Neutrophils
2025-Sep-02, Journal of innate immunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1159/000547934
PMID:40931501
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿科脓毒症患者γδ T细胞的免疫特征和分化机制 | 首次在儿科脓毒症中发现γδ T细胞向γδT17亚型分化，并揭示中性粒细胞通过RETN-CAP1结合增强与γδ T细胞的通讯 | 研究样本量有限，机制验证仍需进一步实验 | 阐明儿科脓毒症中γδ T细胞的免疫特征和分化机制 | 儿科脓毒症患者外周血单个核细胞中的γδ T细胞 | 单细胞测序分析 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | 伪时序分析，细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 儿科脓毒症患者PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 689 | 2025-10-05 |
An Organ-on-Chip Platform for Strain-Controlled, Tissue-Specific Compression of Cartilage and Mineralized Osteochondral Interface to Study Mechanical Overloading in Osteoarthritis
2025-Sep, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501588
PMID:40556597
|
研究论文 | 开发了一种用于研究骨关节炎机械过载的骨软骨单元芯片平台 | 首次在芯片上实现应变控制、组织特异性压缩的骨软骨界面模型，模拟体内应变梯度 | 该模型仍为体外微组织系统，无法完全模拟完整关节的复杂生物力学环境 | 研究机械过载在骨关节炎发生发展中的分子机制 | 人源复合透明软骨-矿化软骨下骨微组织 | 组织工程 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 器官芯片模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 690 | 2025-10-05 |
Senescent Microglia Mediate Neuroinflammation-Induced Cognitive Dysfunction by Selective Elimination of Excitatory Synapses in the Hippocampal CA1
2025-Sep, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70167
PMID:40624910
|
研究论文 | 本研究揭示了衰老小胶质细胞通过选择性清除海马CA1区兴奋性突触介导神经炎症诱导的认知功能障碍的机制 | 首次发现衰老小胶质细胞通过过度吞噬兴奋性突触导致神经炎症相关认知功能障碍，并证明使用senolytic药物ABT-737可逆转这一过程 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类中验证；观察期较短，长期效果未知 | 阐明衰老小胶质细胞在神经炎症诱导认知功能障碍中的具体作用机制 | C57BL/6J小鼠的海马CA1区小胶质细胞和锥体神经元 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，高尔基染色，全细胞膜片钳记录，Western blotting，免疫荧光 | 小鼠神经炎症模型 | 基因表达数据，电生理记录，行为学数据，蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量，使用C57BL/6J小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 691 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics to reveal the Glycolysis-related gene GPRC5A as a potential biomarker for gastric cancer by machine learning
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147059
PMID:40865843
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学，通过机器学习识别糖酵解相关基因GPRC5A作为胃癌潜在生物标志物 | 开发了基于四分位距的糖酵解活性评估新方法，解决了以往评分方法分辨率不足和稳健性有限的问题 | NA | 识别胃癌糖酵解代谢相关生物标志物，为早期诊断和靶向治疗提供支持 | 胃癌细胞和组织 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 692 | 2025-10-05 |
Integrated 'omics analysis reveals human milk oligosaccharide biosynthesis programs in human lactocytes
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113269
PMID:40894860
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和HMO浓度测量，揭示人类乳腺细胞中母乳寡糖的生物合成程序 | 首次在单细胞水平识别HMO合成基因的差异表达模式，发现新的候选基因和转录因子，提出HMO合成可能通过乳腺细胞亚型特化实现 | HMO生物合成通路在哺乳期乳腺中的复杂机制仍未被完全阐明 | 解析人类母乳寡糖在乳腺细胞中的生物合成机制 | 人类乳腺上皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，HMO浓度测量数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 693 | 2025-10-05 |
Adaptive individualized gene pair signatures distinguishing melanoma and predicting response to immune checkpoint blockade
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113329
PMID:40917881
|
研究论文 | 提出自适应个体化基因对特征方法，用于区分黑色素瘤亚型并预测免疫检查点阻断治疗反应 | 开发基于基因对逆转的自适应特征选择方法，相比现有方法提高分类准确率5%以上，预测性能提升6% | 研究样本量相对有限（850个样本用于分类，252个样本用于预测），需要更多独立队列验证 | 开发稳健的基因特征方法以区分相似癌症亚型并预测免疫治疗反应 | 黑色素瘤患者样本 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 850个样本来自24个队列用于分类，252个样本来自7个队列用于预测 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 694 | 2025-10-05 |
TREM-1 as a novel immunotherapeutic target to treat pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Sep-18, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2025.201034
PMID:40917508
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研究论文 | 本研究探讨TREM-1激活在胰腺导管腺癌中改变肿瘤微环境和增强肿瘤免疫的潜力 | 首次发现TREM-1激活能通过重编程免疫抑制性肿瘤微环境来治疗胰腺导管腺癌 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚不充分 | 探索TREM-1作为胰腺导管腺癌免疫治疗新靶点的潜力 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | Pan02小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类PDAC组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 695 | 2025-10-05 |
Integrative analysis identifies FERMT3 as a key regulator of metabolic reprogramming in keloid scarring and metabolic syndrome
2025-Sep-10, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01705-y
PMID:40928556
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研究论文 | 通过整合分析识别FERMT3作为瘢痕疙瘩和代谢综合征中代谢重编程的关键调控因子 | 首次发现瘢痕疙瘩和代谢综合征之间的共享转录组特征，并确定FERMT3作为调控代谢和炎症表型的关键基因 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证FERMT3的调控机制 | 识别瘢痕疙瘩和代谢综合征之间的共同调控基因，探索新的治疗靶点 | 瘢痕疙瘩组织、代谢综合征组织及相应健康对照组织 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩, 代谢综合征 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, LASSO回归, 机器学习, 体外实验 | WGCNA, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自公共数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 696 | 2025-10-05 |
Bcl6 reactivity is associated with a distinct immune landscape and spatial transcriptome in COVID-19
2025-Sep-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189134
PMID:40924502
|
研究论文 | 本研究通过多重成像和空间转录组学分析COVID-19患者肺引流淋巴结，揭示了Bcl6反应性与免疫景观和空间转录组的关联 | 首次在COVID-19背景下基于Bcl6表达水平对反应性滤泡进行分类，并发现不同Bcl6表达水平对应不同的免疫细胞组成和空间转录组特征 | 研究样本来源于尸检组织，可能无法完全反映活体免疫反应动态；样本量有限 | 探索人类淋巴结中滤泡和生发中心免疫反应性的调控机制，特别是在急性病毒感染期间 | COVID-19患者的肺引流淋巴结和膈下淋巴结 | 空间转录组学 | COVID-19 | 多重成像，空间转录组学 | NA | 图像，空间转录组数据 | COVID-19尸检淋巴结样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 697 | 2025-10-05 |
ZEB1 promotes chemo-immune resistance in pancreatic cancer models by downregulating chromatin acetylation of CXCL16
2025-Sep-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195970
PMID:40924501
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研究论文 | 本研究揭示转录因子ZEB1通过下调CXCL16染色质乙酰化驱动胰腺癌化疗免疫抵抗的新机制 | 首次发现ZEB1通过表观遗传调控CXCL16促进胰腺癌化疗免疫抵抗，并证实靶向ZEB1可增强多种免疫疗法疗效 | 研究主要基于临床前模型，需进一步临床验证 | 探索胰腺癌化疗免疫抵抗的表观遗传机制 | 胰腺癌模型（患者来源类器官、异种移植模型、原位模型） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | 动物模型、类器官模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 698 | 2025-10-05 |
Tumor microenvironment differences between diagnostic and relapsed classic Hodgkin lymphoma revealed by scRNA-seq
2025-Sep-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017107
PMID:40924921
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示经典霍奇金淋巴瘤诊断期与复发期肿瘤微环境的差异 | 首次发现早期复发CHL中LGALS9+幼稚B细胞与HAVCR2+调节性T细胞的免疫抑制性相互作用 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探究经典霍奇金淋巴瘤复发过程中肿瘤微环境的变化 | 配对的诊断期和复发期经典霍奇金淋巴瘤样本 | 单细胞基因组学 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，成像质谱流式细胞术，免疫组织化学 | 细胞-细胞相互作用分析，空间分析 | 单细胞转录组数据，空间蛋白质数据 | 配对诊断和复发CHL样本及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 699 | 2025-10-05 |
Type 1 regulatory cells suppress T-cell cytotoxicity to alleviate liver injury during acute hepatitis B virus infection in mice
2025-Sep-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf229
PMID:40925590
|
研究论文 | 本研究揭示了1型调节性T细胞通过调节T细胞毒性在急性乙肝病毒感染中保护肝脏免受免疫病理损伤的机制 | 首次发现Tr1细胞通过IL-10依赖的方式抑制T细胞毒性反应，在清除病毒的同时保护肝脏免受免疫损伤 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索急性HBV感染期间调节T细胞反应以避免免疫病理损伤的机制 | 小鼠急性乙肝病毒感染模型中的HBsAg特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，细胞因子中和实验 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 700 | 2025-10-05 |
Cancer-associated fibroblast marker signatures and stromal composition in usual interstitial pneumonia-associated lung adenocarcinoma: an analysis using a proteomic-immunohistochemical approach
2025-Sep-09, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04254-8
PMID:40926109
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和免疫组织化学方法分析普通型间质性肺炎相关肺腺癌中癌症相关成纤维细胞标志物特征和基质组成 | 首次结合激光显微切割蛋白质组分析和公开单细胞RNA测序数据，揭示UIP相关LUAD中ACAN和HAPLN1等新型基质蛋白的表达特征 | 样本量较小（仅32例），且为回顾性研究 | 表征普通型间质性肺炎相关肺腺癌的肿瘤微环境特征 | 肺腺癌患者组织样本（16例伴UIP，16例不伴UIP） | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学, 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 组织图像, 蛋白质组数据, 基因表达数据 | 32例肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 激光显微切割技术 |