单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 857 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-10-05 |
NDRG1-Driven Lactate Accumulation Promotes Lung Adenocarcinoma Progression Through the Induction of an Immunosuppressive Microenvironment
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501238
PMID:40539245
|
研究论文 | 本研究揭示了NDRG1通过稳定LDHA促进乳酸积累，诱导免疫抑制微环境从而推动肺腺癌进展的机制 | 首次发现NDRG1通过抑制LDHA泛素化稳定其表达，促进乳酸积累和组蛋白H3K18乳酸化，驱动免疫抑制微环境形成 | 样本量相对有限，需要更多临床验证 | 探究NDRG1在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 肺腺癌患者样本和临床数据 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 临床数据分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 测序数据 | 30个LUAD样本（单细胞RNA测序），29,863例患者和55,586例对照（GWAS），220例LUAD患者（临床数据） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 662 | 2025-10-05 |
Metabolic Stress-Induced Choline Kinase α (CHKA) Activation in Endothelial Subpopulation Contributes to Diabetes-Associated Microvascular Dysfunction
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417045
PMID:40548950
|
研究论文 | 本研究探讨代谢应激诱导的胆碱激酶α在特定内皮细胞亚群中的激活对糖尿病相关微血管功能障碍的贡献机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定视网膜血管中三个不同的内皮细胞亚群，发现CHKA高表达亚群与血管生成活性增强相关，并揭示CHKA通过NAD-SIRT1-Notch信号通路调控内皮功能障碍的新机制 | NA | 阐明糖尿病微血管功能障碍的分子机制 | 内皮细胞亚群、糖尿病小鼠模型、临床样本 | 单细胞生物学 | 糖尿病微血管并发症 | 单细胞RNA测序、基因沉默、孟德尔随机化研究 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 663 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Deciphering Normal and Diseased Aortic Valve Biology Using Transcriptomic Technologies
2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70835
PMID:40903834
|
综述 | 本文总结了利用转录组学技术解析正常和病变主动脉瓣生物学机制的最新进展 | 整合最新转录组学发现，识别关键分子靶点并优先排序用于湿实验验证 | NA | 深入理解主动脉瓣疾病机制，为开发有效疗法提供依据 | 主动脉瓣在正常和病变状态下的生物学特征 | 转录组学 | 钙化性主动脉瓣疾病 | RNA测序，单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 664 | 2025-10-05 |
Spatial colocalization and molecular crosstalk of myofibroblastic CAFs and tumor cells shape lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011791
PMID:40906645
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了肌成纤维性癌症相关成纤维细胞与口腔鳞癌细胞的共定位及分子互作在淋巴结转移中的关键作用 | 首次发现myCAFs与OSCC细胞在侵袭前沿的空间共定位形成促进淋巴结转移的微环境，并鉴定出由ECM-CD44轴介导的分子互作机制 | 研究样本量相对有限，机制验证主要依赖体外实验和公共数据 | 探究口腔鳞癌淋巴结转移的分子机制 | 口腔鳞癌患者组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 口腔鳞癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 体外共培养 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 90例侵袭前沿样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 665 | 2025-10-05 |
DISCO: A DIFFUSION MODEL FOR SPATIAL TRANSCRIPTOMICS DATA COMPLETION
2025-Sep, Proceedings. International Conference on Image Processing
DOI:10.1109/icip55913.2025.11084277
PMID:40909878
|
研究论文 | 提出一种基于扩散模型的空间转录组数据补全框架DISCO | 首次将扩散模型应用于空间转录组数据补全，结合图神经网络编码器和双重扩散模块 | 未明确说明模型在极端数据缺失情况下的性能限制 | 解决空间转录组数据中大规模缺失区域的问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 扩散模型, 图神经网络 | 扩散模型, GNN | 空间基因表达数据 | 多个测序平台、物种和数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 666 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics and Single Cell-RNASeq Reveals Cellular Heterogeneity of SARS-CoV-2 in Lung Tissues and Global Mutational Patterns in COVID-19 Patients
2025-Sep, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70586
PMID:40910395
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了COVID-19患者肺组织中SARS-CoV-2的细胞异质性及全球突变模式 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，在空间维度上定位SARS-CoV-2病毒基因表达热点区域，并关联免疫细胞浸润模式 | 研究样本来源地域有限，突变分析主要基于GISAID数据库的公开数据 | 解析COVID-19患者肺组织中SARS-CoV-2的细胞异质性特征和病毒突变模式 | COVID-19患者的肺组织样本和GISAID数据库中的SARS-CoV-2序列数据 | 空间转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | Seurat, Pseudotime分析, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 基因组序列数据 | 未明确样本数量，包含轻度和重度COVID-19患者肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 667 | 2025-10-05 |
Identification of Core gene expression alterations regulated by gut microbiota in tumor progression and immunotherapy resistance through integrative pan-cancer analysis
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146911
PMID:40819753
|
研究论文 | 通过整合性泛癌分析识别肠道微生物在肿瘤进展和免疫治疗耐药中调控的核心基因表达变化 | 开发了微生物相关特征评分方法，首次在33种癌症类型和29种正常组织中系统性量化肠道微生物驱动的转录改变 | 研究主要基于计算分析方法，实验验证相对有限 | 阐明肠道微生物在肝细胞癌进展中的具体作用机制及其下游靶点 | 33种癌症类型和29种正常组织，重点研究肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞分析，空间转录组学，机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据，单细胞数据，空间转录组数据 | 33种癌症类型和29种正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 668 | 2025-10-05 |
Integrative spatial multi-omics identifies the TEK receptor tyrosine kinase as a central biomacromolecule of endothelial-immune interactions in glioblastoma
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146964
PMID:40834945
|
研究论文 | 本研究通过整合空间多组学分析发现TEK受体酪氨酸激酶是胶质母细胞瘤中内皮-免疫相互作用的核心生物大分子 | 首次通过整合空间多组学方法系统揭示TEK在胶质母细胞瘤微环境中的核心作用，并发现其作为可药物化靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和计算模拟，需要进一步的体内实验验证 | 探索胶质母细胞瘤微环境中血管-免疫轴的关键调控分子 | 胶质母细胞瘤微环境中的内皮细胞、恶性细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,全基因组关联研究,结构基药物筛选,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间转录组数据,蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2025-09-07 |
Comment on "Unraveling the role of gut microbiota on the formation of nephrolithiasis: insights from integrated analysis of GWAS, single-cell transcriptomics, bulk RNA sequencing and network pharmacology"
2025-Sep-06, Urolithiasis
IF:2.0Q2
DOI:10.1007/s00240-025-01839-5
PMID:40913665
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 670 | 2025-10-06 |
Systemic comparison of molecular characteristics in different skin fibroblast senescent models
2025-Sep-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003312
PMID:39329281
|
研究论文 | 系统比较不同皮肤成纤维细胞衰老模型的分子特征 | 首次系统比较四种不同诱导方式（UVB照射、D-半乳糖刺激、阿扎那韦处理、复制衰竭诱导）产生的皮肤成纤维细胞衰老模型与天然衰老细胞的转录组特征差异 | 研究仅关注转录组水平特征，未涉及蛋白质组或表观遗传学层面的验证 | 比较不同衰老模型与天然衰老皮肤成纤维细胞的分子特征差异 | 人类皮肤原代成纤维细胞（来自儿童和老年人）及四种衰老模型细胞 | 细胞生物学 | 皮肤衰老相关疾病 | 流式细胞术、免疫荧光染色、实时定量PCR、免疫细胞共培养、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 儿童和老年人皮肤成纤维细胞样本及四种衰老模型 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 671 | 2025-10-06 |
What makes the human brain special - from cellular function to clinical translation
2025-Sep-05, Journal of neurophysiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1152/jn.00120.2025
PMID:40912899
|
综述 | 本文综述了人类大脑在神经元、胶质细胞和皮层回路方面的物种特异性差异及其临床转化研究 | 整合多模态研究方法系统阐述人类大脑从分子表达到系统水平的独特性，并关注动物研究向临床转化的挑战 | NA | 探索人类大脑相较于其他物种的特殊性及其临床转化潜力 | 人类脑组织样本中的神经元、胶质细胞和皮层回路 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞记录、网络记录、单细胞转录组学、形态学分析 | NA | 转录组数据、形态学数据、电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 672 | 2025-10-06 |
Combination antiretroviral therapy and MCL-1 inhibition mitigate HTLV-1 infection in vivo
2025-Sep-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.06.023
PMID:40645177
|
研究论文 | 本研究通过建立人源化小鼠模型，评估联合抗逆转录病毒疗法与MCL-1抑制剂对HTLV-1c感染的预防和治疗效果 | 首次发现HTLV-1c感染导致细胞内在凋亡失调，并证明MCL-1特异性抑制剂（而非其他BCL-2家族蛋白抑制剂）能有效清除HTLV-1c感染细胞 | 研究基于人源化小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 开发针对HTLV-1c感染的有效预防和治疗策略 | 人源化小鼠模型和HTLV-1c感染细胞 | 传染病学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 细胞内流式细胞术 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 673 | 2025-10-06 |
Bone marrow immune remodeling in depression: TNF/NF-κB mediated leukocyte redistribution and construction of an interpretable predictive model
2025-Sep-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115487
PMID:40911995
|
研究论文 | 本研究通过建立心理应激小鼠模型，系统研究了应激诱导的免疫失调机制，并构建了基于外周血参数的抑郁症预测模型 | 揭示了TNF/NF-κB通路介导的骨髓免疫重塑在应激诱导抑郁症中的调控作用，并构建了可解释的机器学习预测模型 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需要进一步验证 | 探索抑郁症的神经免疫相互作用机制并开发临床诊断生物标志物 | 心理应激小鼠模型 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,蛋白质相互作用网络,机器学习,SHAP分析 | 随机森林(RF) | 血液细胞参数,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 心理应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 674 | 2025-10-06 |
Essential role of CD56dimNKG2C+ NK cells trained by SARS-CoV-2 vaccines in protecting against COVID-19
2025-Sep-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.05.031
PMID:40450518
|
研究论文 | 本研究揭示了SARS-CoV-2灭活疫苗通过训练CD56dimNKG2C+ NK细胞与巨噬细胞协同作用在预防COVID-19中的关键机制 | 首次发现疫苗训练的特定NK细胞亚群（CD56dimNKG2C+）与M2样巨噬细胞在肺部保护中的协同作用，并揭示老年人群接种后这些适应性细胞缺失的现象 | 研究主要使用恒河猴模型，人类样本验证有限；老年人群样本特征需进一步扩大验证 | 评估SARS-CoV-2疫苗在先天免疫层面的保护机制 | 恒河猴模型和人类外周血单个核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,飞行时间质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 恒河猴模型和人类参与者（包括年轻和老年群体） | NA | 单细胞RNA-seq,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 675 | 2025-10-06 |
Recognition of molecular clusters and a novel prognostic signature based on natural killer cell-related genes in skin cutaneous melanoma
2025-Sep-03, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-03975-z
PMID:40903770
|
研究论文 | 基于自然杀伤细胞相关基因识别皮肤黑色素瘤的分子亚型并构建新型预后特征 | 首次基于NK细胞相关基因对皮肤黑色素瘤进行分子分型，并构建了12基因预后特征 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发皮肤黑色素瘤的预后预测模型和治疗靶点 | 皮肤黑色素瘤患者样本 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 体细胞突变分析 | 多机器学习算法组合, Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自TCGA、GEO、GTEx等公共数据库的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 676 | 2025-10-06 |
NUTM2A-AS1 as a potential key regulator in cancer: unraveling its ceRNA networks and impact on tumor biology
2025-Sep-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03019-y
PMID:40903777
|
综述 | 本文全面综述了长链非编码RNA NUTM2A-AS1在多种癌症中的ceRNA调控网络及其对肿瘤生物学的影响 | 系统揭示了NUTM2A-AS1作为ceRNA通过不同miRNA-mRNA轴在多种癌症中的调控机制，并首次整合其在八种不同癌症类型中的功能 | 主要基于现有文献综述，缺乏原创性实验验证和临床数据支持 | 阐明NUTM2A-AS1在癌症发生发展中的调控机制及其临床转化潜力 | NUTM2A-AS1长链非编码RNA及其在多种癌症中的ceRNA网络 | 生物信息学 | 多种癌症 | 生物信息学分析，CRISPR，单细胞RNA测序 | NA | 文献数据，表达谱数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 677 | 2025-10-06 |
Establishment of Drosophila intestinal cell lines as tools for multiomic screening and deciphering intestinal biology
2025-Sep-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17336-z
PMID:40897748
|
研究论文 | 本研究首次建立了果蝇肠道细胞系，为肠道生物学研究提供了新工具 | 首次成功建立果蝇肠道来源的细胞系，填补了该领域长期缺乏细胞系资源的空白 | NA | 建立果蝇肠道细胞系作为多组学筛选工具并解析肠道生物学 | 果蝇肠道细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 678 | 2025-10-06 |
Single cell RNA seq reveals the pro-regenerative phenotype of thrombospondin-2 deficient dermal fibroblasts
2025-Sep-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15839-3
PMID:40897801
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示血小板反应蛋白-2缺陷型真皮成纤维细胞具有促再生表型 | 首次在单细胞水平揭示TSP2缺陷导致真皮成纤维细胞异质性改变，发现Sox10+多能祖细胞富集和纤维化亚群减少 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需验证 | 探究TSP2缺陷对真皮成纤维细胞异质性和组织修复能力的影响 | 野生型和TSP2敲除小鼠皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 组织修复与再生 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 计算机模拟分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | WT和TSP2 KO小鼠皮肤成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 679 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of retinoblastoma: a visual window on intra-patient heterogeneity
2025-Sep-02, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14814-5
PMID:40898088
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析视网膜母细胞瘤的组织学异质性，首次实现相邻分子亚型的空间定位 | 首次在视网膜母细胞瘤中实现分子亚型1和2的相邻空间定位，揭示组织学特征与分子谱的强相关性 | 仅分析单个病例样本，样本量有限，需要更多病例验证 | 探索视网膜母细胞瘤的组织学异质性与分子亚型的关系 | 视网膜母细胞瘤患者眼球切除标本中的不同分化区域 | 空间转录组学 | 视网膜母细胞瘤 | 空间转录组学，免疫组织化学 | 聚类分析 | 空间转录组数据，组织图像 | 1例原发性视网膜母细胞瘤病例，16个感兴趣区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 680 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptome atlas of pig skin reveals cellular heterogeneity from embryonic development to postnatal aging
2025-Sep-02, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02390-w
PMID:40898171
|
研究论文 | 构建了涵盖10个发育阶段的猪皮肤单细胞转录组图谱，揭示了从胚胎发育到出生后衰老的细胞异质性变化 | 首次在猪皮肤中构建从胚胎期到老年期的完整单细胞图谱，发现新型AUTS2⁺成纤维细胞亚型及其神经调节功能 | 研究主要基于猪模型，人类直接适用性需要进一步验证 | 解析皮肤从胚胎发育到衰老过程中的细胞动态变化和分子机制 | 荣昌猪皮肤组织 | 单细胞组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析，跨物种比较分析 | 单细胞转录组数据 | 443,529个细胞，涵盖胚胎第56天至出生后7年共10个发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |