本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover the prognostic, epigenetic, and immunological roles of FANCC in low-grade glioma
2025-Sep-09, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2556255
PMID:40923898
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了FANCC在低级别胶质瘤中的预后、表观遗传和免疫调控作用 | 首次报道FANCC作为低级别胶质瘤的致癌驱动因子,通过免疫微环境重编程和DNA修复失调协同促进肿瘤进展 | NA | 全面研究FANCC在低级别胶质瘤中的临床意义、预后价值和分子机制,以确定新的治疗靶点 | 低级别胶质瘤患者样本 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, GSEA分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 622 | 2025-10-05 |
Longitudinal single-cell RNA model aids prediction of EGFR-TKI resistance
2025-Sep-04, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgaf038
PMID:40739818
|
研究论文 | 本研究利用纵向单细胞RNA测序数据探索肺腺癌EGFR-TKI耐药机制 | 首次在单细胞水平建立EGFR耐药评分系统并揭示代谢重编程在耐药中的作用 | 样本量有限,需要更大规模验证 | 研究肺腺癌EGFR-TKI耐药机制 | 肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 623 | 2025-10-05 |
Exploration of potential therapeutic target genes for preeclampsia through genetic analysis
2025-Sep, Journal of human hypertension
IF:2.7Q2
DOI:10.1038/s41371-025-01054-0
PMID:40715499
|
研究论文 | 通过遗传分析探索先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 首次通过整合cis-eQTL、孟德尔随机化、SMR和共定位分析系统筛选先兆子痫的潜在药物靶基因 | 研究主要基于血液样本的eQTL数据,未直接使用胎盘组织数据 | 识别先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 先兆子痫相关基因 | 生物信息学 | 先兆子痫 | cis-eQTL分析,孟德尔随机化,功能富集分析,SMR分析,共定位分析,单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据,遗传数据 | eQTLGen联盟提供的血液样本数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2025-10-05 |
Reactive Oxygen Species-Responsive Hydrogel Microspheres Loaded with Epigallocatechin Gallate for Effective Osteoarthritis Therapy
2025-Sep-08, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.5c00564
PMID:40813306
|
研究论文 | 开发了一种活性氧响应的水凝胶微球系统用于靶向递送表没食子儿茶素没食子酸酯治疗骨关节炎 | 首次构建WYRGRL肽修饰的ROS响应型水凝胶微球递送系统,并通过单细胞转录组学和代谢组学联合分析揭示了Tomm70基因在治疗机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发智能递送系统治疗骨关节炎 | 软骨细胞和OA小鼠模型 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | OA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2025-10-05 |
IGHA1 and IGHG1 Expression Panel Predicts Anti-PD-L1 Response in Muscle-Invasive Bladder Cancer
2025-Sep-08, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70033
PMID:40919684
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组分析,发现IGHA1和IGHG1表达模式可预测肌层浸润性膀胱癌对PD-L1抑制剂的治疗反应 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术揭示三级淋巴结构中B细胞克隆与免疫治疗反应的关系,并建立IGHA1/IGHG1预测模型 | 样本量相对有限,单细胞测序仅9个样本,空间转录组仅5个样本 | 探究肌层浸润性膀胱癌中三级淋巴结构与免疫球蛋白库的关系及其对免疫治疗反应的预测价值 | 肌层浸润性膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序, 空间转录组 | 表达特征预测模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 单细胞测序9例(5例来自本中心,4例来自PRJNA662018),空间转录组5例(1例来自本中心,4例来自GSE169379),TCGA数据库405例,IMvigor210试验348例 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 626 | 2025-10-05 |
Cutting-edge technologies in neural regeneration
2025-Sep-05, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00260-y
PMID:40911279
|
综述 | 本文综述了推动神经再生领域发展的前沿技术及其应用前景 | 系统整合了光遗传学、化学遗传学、3D培养模型、基因编辑、单细胞测序和3D成像等多项前沿技术,并展望了人工智能、高通量体内筛选和脑机接口技术的未来潜力 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据和原始研究发现 | 探讨神经再生领域的最新技术进展和治疗策略开发 | 中枢神经系统损伤和神经功能障碍 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 光遗传学、化学遗传学、3D培养、基因编辑、单细胞测序、3D成像、人工智能、高通量筛选、脑机接口 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 627 | 2025-10-05 |
Integrated machine learning-based RNA sequencing and single-cell analysis reveal RNA methylation regulation patterns in the immune microenvironment of Alzheimer's disease
2025-Sep-03, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01650
PMID:40903964
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习、RNA测序和单细胞分析,揭示了阿尔茨海默病免疫微环境中RNA甲基化的调控模式 | 首次将机器学习与单细胞RNA测序相结合,系统分析阿尔茨海默病中RNA甲基化对免疫微环境的调控作用,并建立了风险预测模型 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,需要进一步的体内实验验证 | 探索RNA甲基化在阿尔茨海默病免疫微环境中的调控机制及其与疾病进展的关系 | 阿尔茨海默病患者样本、神经元细胞、T细胞、B细胞和NK细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot, 机器学习 | 机器学习算法, 风险预测模型, 列线图 | 转录组数据, 单细胞数据, 分子生物学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 628 | 2025-10-05 |
Lhx2 specifically expressed in HSCs promotes liver regeneration and inhibits liver fibrosis
2025-Sep-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001201
PMID:39693275
|
研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞特异性转录因子Lhx2在促进肝脏再生和抑制肝纤维化中的双重功能 | 首次发现Lhx2在肝星状细胞中特异性表达,并同时具备促进肝脏再生和抑制纤维化的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 鉴定肝星状细胞中同时促进再生和抑制纤维化的特异性靶点及其分子机制 | 小鼠和人类肝星状细胞,急慢性肝损伤模型 | 分子生物学 | 肝病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 急性和慢性肝损伤小鼠模型,人类肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2025-10-05 |
Sour neuronal signalling attenuates macrophage-mediated liver injury
2025-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.02.026
PMID:40058705
|
研究论文 | 本研究揭示了酸味刺激通过神经信号通路减轻巨噬细胞介导的肝脏缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现神经元来源的TAFA2蛋白通过CCR2受体招募和激活巨噬细胞导致肝损伤,而酸味刺激可减少TAFA2产生并减轻肝损伤 | 酸味刺激减轻肝损伤的具体分子通路尚未完全阐明 | 探究神经免疫相互作用在肝脏缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗策略 | 小鼠动物模型、神经元、巨噬细胞、肝切除手术患者 | 神经免疫学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序、RNA测序、基因敲除、临床实验 | 动物模型 | 基因表达数据、临床数据 | 小鼠模型和临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 630 | 2025-10-05 |
Tacrolimus prolongs corneal allograft survival and prevents dendritic cell infiltration in a myeloid-derived suppressor cell-dependent manner
2025-Sep, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2025.05.018
PMID:40398562
|
研究论文 | 本研究通过小鼠角膜移植模型揭示了FK506通过诱导髓源性抑制细胞来抑制树突状细胞活化并延长角膜移植物存活的机制 | 首次阐明FK506通过MDSC依赖性方式抑制树突状细胞活化的具体时间依赖性机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究FK506延长角膜移植物存活的具体免疫抑制机制 | 小鼠角膜移植模型和相关的免疫细胞 | 免疫学 | 角膜移植排斥 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 631 | 2025-10-05 |
CD300A+ CD8+ T Cells as Predictive Biomarkers for Achieving Functional Cure in Chronic Hepatitis B Patients Undergoing Pegylated Interferon-Alpha Therapy
2025-Sep, Alimentary pharmacology & therapeutics
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/apt.70214
PMID:40454546
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术发现CD300A+ CD8+ T细胞可作为预测慢性乙型肝炎患者接受聚乙二醇干扰素-α治疗后获得功能性治愈的生物标志物 | 首次发现CD300A+ CD8+ T细胞在功能性治愈患者中显著富集,具有强大的克隆扩增能力和HBV抗原特异性 | 研究样本量有限,需要在更大规模队列中验证 | 鉴定预测慢性乙型肝炎患者接受聚乙二醇干扰素-α治疗获得功能性治愈的生物标志物 | 慢性乙型肝炎患者 | 免疫学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞转录组测序, T细胞受体测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 发现队列和独立验证队列的慢性乙型肝炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq, TCR测序 | NA | NA |
| 632 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-sequencing as a potential approach for studying intratumor heterogeneity in pleural mesothelioma
2025-Sep, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108679
PMID:40782703
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索胸膜间皮瘤的肿瘤内异质性 | 首次应用单细胞RNA测序技术分析胸膜间皮瘤多部位肿瘤样本的肿瘤内异质性 | NA | 表征胸膜间皮瘤的肿瘤内异质性特征 | 胸膜间皮瘤多部位肿瘤样本 | 单细胞组学 | 胸膜间皮瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2025-10-05 |
Single cell RNA sequencing reveals the reshaping effect of perfluorooctanoic acid on the intestinal microenvironment of mice
2025-Sep-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118540
PMID:40570792
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了全氟辛酸对小鼠肠道微环境的重塑效应 | 首次在单细胞分辨率下系统分析PFOA诱导的肠道微环境重塑,发现Ada肠上皮细胞异常增殖和CCR1-CCL5轴介导的巨噬细胞-CD8 T细胞通讯增强 | 研究主要聚焦雌性小鼠,样本量相对有限,需要进一步验证在雄性小鼠中的一致性 | 探究全氟辛酸诱导的肠道微环境改变及其病理生理机制 | C57BL/6小鼠的肠道组织 | 单细胞生物学 | 胃肠道疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 雌性C57BL/6小鼠肠道组织,设置0、1、5、10 mg/kg/day四个剂量组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2025-10-05 |
Resolving the spatial and cellular architecture of intra-tumor heterogeneity by multi-region dissection of lung adenocarcinoma
2025-Sep, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.02.006
PMID:39993622
|
研究论文 | 通过多区域肺腺癌活检样本的空间转录组学和单细胞RNA测序分析,揭示肿瘤内异质性的空间和细胞结构 | 首次系统描绘肺腺癌不同区域(核心、边缘、正常区域)中癌细胞亚群的空间分布特征及其与免疫细胞的共定位关系 | 研究样本数量有限,仅基于活检样本分析,未进行功能验证实验 | 解析肺腺癌肿瘤内异质性的空间结构和细胞组成 | 肺腺癌患者的多区域活检样本(肿瘤核心、肿瘤边缘、正常区域) | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多区域肺腺癌活检样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 635 | 2025-10-05 |
Dissecting key contributions of TH2 and TH17 cytokines to atopic dermatitis pathophysiology
2025-Sep, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.05.007
PMID:40409379
|
研究论文 | 本研究通过细胞模型揭示TH2和IL-22细胞因子在特应性皮炎病理机制中的关键作用 | 首次系统比较TH2、TH17和TH22细胞因子对表皮表型的特异性影响,并发现TH2+IL-22组合最能模拟AD病理特征 | 研究基于体外细胞模型,可能与体内真实环境存在差异 | 解析特应性皮炎相关细胞因子如何驱动特异性表皮疾病标志 | 原代和永生化角质形成细胞来源的人表皮等效物 | 皮肤生物学 | 特应性皮炎 | 单细胞空间转录组学,转录组分析 | 细胞刺激模型 | 转录组数据,形态学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 636 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Profiling of Penile Squamous Cell Carcinoma Reveals Dynamics of Tumor Differentiation and Immune Microenvironment
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500216
PMID:40470730
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组技术揭示阴茎鳞状细胞癌的肿瘤分化动态和免疫微环境特征 | 首次结合单核RNA测序和高分辨率空间转录组学解析PSCC的发育轨迹和肿瘤微环境,发现独立于HPV感染状态的肿瘤分化模式及具有干细胞特征的Tum_1亚型 | 研究样本量有限,主要聚焦于PSCC,部分结论需要其他鳞状细胞癌类型的进一步验证 | 探究阴茎鳞状细胞癌的发育轨迹和肿瘤微环境特征 | 阴茎鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 637 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Delineates Renal Anti-Fibrotic Mechanisms Mediated by TRPC6 Inhibition
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501175
PMID:40525246
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示TRPC6抑制介导的肾脏抗纤维化机制 | 首次通过单细胞RNA测序定义了TRPC6抑制剂SH045处理的肾脏保护性细胞组成和细胞类型特异性转录程序,并发现新型内皮细胞亚群ECRIN | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,临床转化需要进一步验证 | 探究TRPC6抑制在慢性肾脏病中的抗纤维化机制 | 小鼠单侧输尿管梗阻模型、慢性缺血再灌注损伤模型及慢性肾脏病患者肾脏样本 | 单细胞组学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | 小鼠疾病模型和慢性肾脏病患者肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 638 | 2025-10-05 |
NDRG1-Driven Lactate Accumulation Promotes Lung Adenocarcinoma Progression Through the Induction of an Immunosuppressive Microenvironment
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501238
PMID:40539245
|
研究论文 | 本研究揭示了NDRG1通过稳定LDHA促进乳酸积累,诱导免疫抑制微环境从而推动肺腺癌进展的机制 | 首次发现NDRG1通过抑制LDHA泛素化稳定其表达,促进乳酸积累和组蛋白H3K18乳酸化,驱动免疫抑制微环境形成 | 样本量相对有限,需要更多临床验证 | 探究NDRG1在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 肺腺癌患者样本和临床数据 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 临床数据分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 测序数据 | 30个LUAD样本(单细胞RNA测序),29,863例患者和55,586例对照(GWAS),220例LUAD患者(临床数据) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 639 | 2025-10-05 |
Metabolic Stress-Induced Choline Kinase α (CHKA) Activation in Endothelial Subpopulation Contributes to Diabetes-Associated Microvascular Dysfunction
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417045
PMID:40548950
|
研究论文 | 本研究探讨代谢应激诱导的胆碱激酶α在特定内皮细胞亚群中的激活对糖尿病相关微血管功能障碍的贡献机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定视网膜血管中三个不同的内皮细胞亚群,发现CHKA高表达亚群与血管生成活性增强相关,并揭示CHKA通过NAD-SIRT1-Notch信号通路调控内皮功能障碍的新机制 | NA | 阐明糖尿病微血管功能障碍的分子机制 | 内皮细胞亚群、糖尿病小鼠模型、临床样本 | 单细胞生物学 | 糖尿病微血管并发症 | 单细胞RNA测序、基因沉默、孟德尔随机化研究 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 640 | 2025-10-05 |
Spatial colocalization and molecular crosstalk of myofibroblastic CAFs and tumor cells shape lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011791
PMID:40906645
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了肌成纤维性癌症相关成纤维细胞与口腔鳞癌细胞的共定位及分子互作在淋巴结转移中的关键作用 | 首次发现myCAFs与OSCC细胞在侵袭前沿的空间共定位形成促进淋巴结转移的微环境,并鉴定出由ECM-CD44轴介导的分子互作机制 | 研究样本量相对有限,机制验证主要依赖体外实验和公共数据 | 探究口腔鳞癌淋巴结转移的分子机制 | 口腔鳞癌患者组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 口腔鳞癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 体外共培养 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 90例侵袭前沿样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |