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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-05 |
Single cell RNA sequencing reveals the reshaping effect of perfluorooctanoic acid on the intestinal microenvironment of mice
2025-Sep-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118540
PMID:40570792
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了全氟辛酸对小鼠肠道微环境的重塑效应 | 首次在单细胞分辨率下系统分析PFOA诱导的肠道微环境重塑,发现Ada肠上皮细胞异常增殖和CCR1-CCL5轴介导的巨噬细胞-CD8 T细胞通讯增强 | 研究主要聚焦雌性小鼠,样本量相对有限,需要进一步验证在雄性小鼠中的一致性 | 探究全氟辛酸诱导的肠道微环境改变及其病理生理机制 | C57BL/6小鼠的肠道组织 | 单细胞生物学 | 胃肠道疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 雌性C57BL/6小鼠肠道组织,设置0、1、5、10 mg/kg/day四个剂量组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 622 | 2025-10-05 |
Resolving the spatial and cellular architecture of intra-tumor heterogeneity by multi-region dissection of lung adenocarcinoma
2025-Sep, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.02.006
PMID:39993622
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研究论文 | 通过多区域肺腺癌活检样本的空间转录组学和单细胞RNA测序分析,揭示肿瘤内异质性的空间和细胞结构 | 首次系统描绘肺腺癌不同区域(核心、边缘、正常区域)中癌细胞亚群的空间分布特征及其与免疫细胞的共定位关系 | 研究样本数量有限,仅基于活检样本分析,未进行功能验证实验 | 解析肺腺癌肿瘤内异质性的空间结构和细胞组成 | 肺腺癌患者的多区域活检样本(肿瘤核心、肿瘤边缘、正常区域) | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多区域肺腺癌活检样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 623 | 2025-10-05 |
Dissecting key contributions of TH2 and TH17 cytokines to atopic dermatitis pathophysiology
2025-Sep, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.05.007
PMID:40409379
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研究论文 | 本研究通过细胞模型揭示TH2和IL-22细胞因子在特应性皮炎病理机制中的关键作用 | 首次系统比较TH2、TH17和TH22细胞因子对表皮表型的特异性影响,并发现TH2+IL-22组合最能模拟AD病理特征 | 研究基于体外细胞模型,可能与体内真实环境存在差异 | 解析特应性皮炎相关细胞因子如何驱动特异性表皮疾病标志 | 原代和永生化角质形成细胞来源的人表皮等效物 | 皮肤生物学 | 特应性皮炎 | 单细胞空间转录组学,转录组分析 | 细胞刺激模型 | 转录组数据,形态学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 624 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Profiling of Penile Squamous Cell Carcinoma Reveals Dynamics of Tumor Differentiation and Immune Microenvironment
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500216
PMID:40470730
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组技术揭示阴茎鳞状细胞癌的肿瘤分化动态和免疫微环境特征 | 首次结合单核RNA测序和高分辨率空间转录组学解析PSCC的发育轨迹和肿瘤微环境,发现独立于HPV感染状态的肿瘤分化模式及具有干细胞特征的Tum_1亚型 | 研究样本量有限,主要聚焦于PSCC,部分结论需要其他鳞状细胞癌类型的进一步验证 | 探究阴茎鳞状细胞癌的发育轨迹和肿瘤微环境特征 | 阴茎鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 625 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Delineates Renal Anti-Fibrotic Mechanisms Mediated by TRPC6 Inhibition
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501175
PMID:40525246
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示TRPC6抑制介导的肾脏抗纤维化机制 | 首次通过单细胞RNA测序定义了TRPC6抑制剂SH045处理的肾脏保护性细胞组成和细胞类型特异性转录程序,并发现新型内皮细胞亚群ECRIN | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,临床转化需要进一步验证 | 探究TRPC6抑制在慢性肾脏病中的抗纤维化机制 | 小鼠单侧输尿管梗阻模型、慢性缺血再灌注损伤模型及慢性肾脏病患者肾脏样本 | 单细胞组学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | 小鼠疾病模型和慢性肾脏病患者肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 626 | 2025-10-05 |
NDRG1-Driven Lactate Accumulation Promotes Lung Adenocarcinoma Progression Through the Induction of an Immunosuppressive Microenvironment
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501238
PMID:40539245
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研究论文 | 本研究揭示了NDRG1通过稳定LDHA促进乳酸积累,诱导免疫抑制微环境从而推动肺腺癌进展的机制 | 首次发现NDRG1通过抑制LDHA泛素化稳定其表达,促进乳酸积累和组蛋白H3K18乳酸化,驱动免疫抑制微环境形成 | 样本量相对有限,需要更多临床验证 | 探究NDRG1在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 肺腺癌患者样本和临床数据 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 临床数据分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 测序数据 | 30个LUAD样本(单细胞RNA测序),29,863例患者和55,586例对照(GWAS),220例LUAD患者(临床数据) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 627 | 2025-10-05 |
Metabolic Stress-Induced Choline Kinase α (CHKA) Activation in Endothelial Subpopulation Contributes to Diabetes-Associated Microvascular Dysfunction
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417045
PMID:40548950
|
研究论文 | 本研究探讨代谢应激诱导的胆碱激酶α在特定内皮细胞亚群中的激活对糖尿病相关微血管功能障碍的贡献机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定视网膜血管中三个不同的内皮细胞亚群,发现CHKA高表达亚群与血管生成活性增强相关,并揭示CHKA通过NAD-SIRT1-Notch信号通路调控内皮功能障碍的新机制 | NA | 阐明糖尿病微血管功能障碍的分子机制 | 内皮细胞亚群、糖尿病小鼠模型、临床样本 | 单细胞生物学 | 糖尿病微血管并发症 | 单细胞RNA测序、基因沉默、孟德尔随机化研究 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2025-10-05 |
Spatial colocalization and molecular crosstalk of myofibroblastic CAFs and tumor cells shape lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011791
PMID:40906645
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了肌成纤维性癌症相关成纤维细胞与口腔鳞癌细胞的共定位及分子互作在淋巴结转移中的关键作用 | 首次发现myCAFs与OSCC细胞在侵袭前沿的空间共定位形成促进淋巴结转移的微环境,并鉴定出由ECM-CD44轴介导的分子互作机制 | 研究样本量相对有限,机制验证主要依赖体外实验和公共数据 | 探究口腔鳞癌淋巴结转移的分子机制 | 口腔鳞癌患者组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 口腔鳞癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 体外共培养 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 90例侵袭前沿样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 629 | 2025-10-05 |
DISCO: A DIFFUSION MODEL FOR SPATIAL TRANSCRIPTOMICS DATA COMPLETION
2025-Sep, Proceedings. International Conference on Image Processing
DOI:10.1109/icip55913.2025.11084277
PMID:40909878
|
研究论文 | 提出一种基于扩散模型的空间转录组数据补全框架DISCO | 首次将扩散模型应用于空间转录组数据补全,结合图神经网络编码器和双重扩散模块 | 未明确说明模型在极端数据缺失情况下的性能限制 | 解决空间转录组数据中大规模缺失区域的问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 扩散模型, 图神经网络 | 扩散模型, GNN | 空间基因表达数据 | 多个测序平台、物种和数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 630 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics and Single Cell-RNASeq Reveals Cellular Heterogeneity of SARS-CoV-2 in Lung Tissues and Global Mutational Patterns in COVID-19 Patients
2025-Sep, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70586
PMID:40910395
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了COVID-19患者肺组织中SARS-CoV-2的细胞异质性及全球突变模式 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在空间维度上定位SARS-CoV-2病毒基因表达热点区域,并关联免疫细胞浸润模式 | 研究样本来源地域有限,突变分析主要基于GISAID数据库的公开数据 | 解析COVID-19患者肺组织中SARS-CoV-2的细胞异质性特征和病毒突变模式 | COVID-19患者的肺组织样本和GISAID数据库中的SARS-CoV-2序列数据 | 空间转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | Seurat, Pseudotime分析, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 基因组序列数据 | 未明确样本数量,包含轻度和重度COVID-19患者肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 631 | 2025-10-05 |
Identification of Core gene expression alterations regulated by gut microbiota in tumor progression and immunotherapy resistance through integrative pan-cancer analysis
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146911
PMID:40819753
|
研究论文 | 通过整合性泛癌分析识别肠道微生物在肿瘤进展和免疫治疗耐药中调控的核心基因表达变化 | 开发了微生物相关特征评分方法,首次在33种癌症类型和29种正常组织中系统性量化肠道微生物驱动的转录改变 | 研究主要基于计算分析方法,实验验证相对有限 | 阐明肠道微生物在肝细胞癌进展中的具体作用机制及其下游靶点 | 33种癌症类型和29种正常组织,重点研究肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞分析,空间转录组学,机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 33种癌症类型和29种正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 632 | 2025-10-05 |
Integrative spatial multi-omics identifies the TEK receptor tyrosine kinase as a central biomacromolecule of endothelial-immune interactions in glioblastoma
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146964
PMID:40834945
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学分析发现TEK受体酪氨酸激酶是胶质母细胞瘤中内皮-免疫相互作用的核心生物大分子 | 首次通过整合空间多组学方法系统揭示TEK在胶质母细胞瘤微环境中的核心作用,并发现其作为可药物化靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和计算模拟,需要进一步的体内实验验证 | 探索胶质母细胞瘤微环境中血管-免疫轴的关键调控分子 | 胶质母细胞瘤微环境中的内皮细胞、恶性细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,全基因组关联研究,结构基药物筛选,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间转录组数据,蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2025-10-06 |
Systemic comparison of molecular characteristics in different skin fibroblast senescent models
2025-Sep-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003312
PMID:39329281
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研究论文 | 系统比较不同皮肤成纤维细胞衰老模型的分子特征 | 首次系统比较四种不同诱导方式(UVB照射、D-半乳糖刺激、阿扎那韦处理、复制衰竭诱导)产生的皮肤成纤维细胞衰老模型与天然衰老细胞的转录组特征差异 | 研究仅关注转录组水平特征,未涉及蛋白质组或表观遗传学层面的验证 | 比较不同衰老模型与天然衰老皮肤成纤维细胞的分子特征差异 | 人类皮肤原代成纤维细胞(来自儿童和老年人)及四种衰老模型细胞 | 细胞生物学 | 皮肤衰老相关疾病 | 流式细胞术、免疫荧光染色、实时定量PCR、免疫细胞共培养、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 儿童和老年人皮肤成纤维细胞样本及四种衰老模型 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2025-10-06 |
What makes the human brain special - from cellular function to clinical translation
2025-Sep-05, Journal of neurophysiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1152/jn.00120.2025
PMID:40912899
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综述 | 本文综述了人类大脑在神经元、胶质细胞和皮层回路方面的物种特异性差异及其临床转化研究 | 整合多模态研究方法系统阐述人类大脑从分子表达到系统水平的独特性,并关注动物研究向临床转化的挑战 | NA | 探索人类大脑相较于其他物种的特殊性及其临床转化潜力 | 人类脑组织样本中的神经元、胶质细胞和皮层回路 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞记录、网络记录、单细胞转录组学、形态学分析 | NA | 转录组数据、形态学数据、电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 635 | 2025-10-06 |
Combination antiretroviral therapy and MCL-1 inhibition mitigate HTLV-1 infection in vivo
2025-Sep-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.06.023
PMID:40645177
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研究论文 | 本研究通过建立人源化小鼠模型,评估联合抗逆转录病毒疗法与MCL-1抑制剂对HTLV-1c感染的预防和治疗效果 | 首次发现HTLV-1c感染导致细胞内在凋亡失调,并证明MCL-1特异性抑制剂(而非其他BCL-2家族蛋白抑制剂)能有效清除HTLV-1c感染细胞 | 研究基于人源化小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发针对HTLV-1c感染的有效预防和治疗策略 | 人源化小鼠模型和HTLV-1c感染细胞 | 传染病学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 细胞内流式细胞术 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2025-10-06 |
Bone marrow immune remodeling in depression: TNF/NF-κB mediated leukocyte redistribution and construction of an interpretable predictive model
2025-Sep-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115487
PMID:40911995
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研究论文 | 本研究通过建立心理应激小鼠模型,系统研究了应激诱导的免疫失调机制,并构建了基于外周血参数的抑郁症预测模型 | 揭示了TNF/NF-κB通路介导的骨髓免疫重塑在应激诱导抑郁症中的调控作用,并构建了可解释的机器学习预测模型 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需要进一步验证 | 探索抑郁症的神经免疫相互作用机制并开发临床诊断生物标志物 | 心理应激小鼠模型 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,蛋白质相互作用网络,机器学习,SHAP分析 | 随机森林(RF) | 血液细胞参数,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 心理应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 637 | 2025-10-06 |
Essential role of CD56dimNKG2C+ NK cells trained by SARS-CoV-2 vaccines in protecting against COVID-19
2025-Sep-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.05.031
PMID:40450518
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研究论文 | 本研究揭示了SARS-CoV-2灭活疫苗通过训练CD56dimNKG2C+ NK细胞与巨噬细胞协同作用在预防COVID-19中的关键机制 | 首次发现疫苗训练的特定NK细胞亚群(CD56dimNKG2C+)与M2样巨噬细胞在肺部保护中的协同作用,并揭示老年人群接种后这些适应性细胞缺失的现象 | 研究主要使用恒河猴模型,人类样本验证有限;老年人群样本特征需进一步扩大验证 | 评估SARS-CoV-2疫苗在先天免疫层面的保护机制 | 恒河猴模型和人类外周血单个核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,飞行时间质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 恒河猴模型和人类参与者(包括年轻和老年群体) | NA | 单细胞RNA-seq,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 638 | 2025-10-06 |
Recognition of molecular clusters and a novel prognostic signature based on natural killer cell-related genes in skin cutaneous melanoma
2025-Sep-03, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-03975-z
PMID:40903770
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研究论文 | 基于自然杀伤细胞相关基因识别皮肤黑色素瘤的分子亚型并构建新型预后特征 | 首次基于NK细胞相关基因对皮肤黑色素瘤进行分子分型,并构建了12基因预后特征 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发皮肤黑色素瘤的预后预测模型和治疗靶点 | 皮肤黑色素瘤患者样本 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 体细胞突变分析 | 多机器学习算法组合, Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自TCGA、GEO、GTEx等公共数据库的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 639 | 2025-10-06 |
NUTM2A-AS1 as a potential key regulator in cancer: unraveling its ceRNA networks and impact on tumor biology
2025-Sep-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03019-y
PMID:40903777
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综述 | 本文全面综述了长链非编码RNA NUTM2A-AS1在多种癌症中的ceRNA调控网络及其对肿瘤生物学的影响 | 系统揭示了NUTM2A-AS1作为ceRNA通过不同miRNA-mRNA轴在多种癌症中的调控机制,并首次整合其在八种不同癌症类型中的功能 | 主要基于现有文献综述,缺乏原创性实验验证和临床数据支持 | 阐明NUTM2A-AS1在癌症发生发展中的调控机制及其临床转化潜力 | NUTM2A-AS1长链非编码RNA及其在多种癌症中的ceRNA网络 | 生物信息学 | 多种癌症 | 生物信息学分析,CRISPR,单细胞RNA测序 | NA | 文献数据,表达谱数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 640 | 2025-10-06 |
Establishment of Drosophila intestinal cell lines as tools for multiomic screening and deciphering intestinal biology
2025-Sep-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17336-z
PMID:40897748
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研究论文 | 本研究首次建立了果蝇肠道细胞系,为肠道生物学研究提供了新工具 | 首次成功建立果蝇肠道来源的细胞系,填补了该领域长期缺乏细胞系资源的空白 | NA | 建立果蝇肠道细胞系作为多组学筛选工具并解析肠道生物学 | 果蝇肠道细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |