单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 857 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-05 |
Validation of single-cell transcriptomic profiles from Illumina and MGI Tech sequencing platforms
2025-Sep, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70087
PMID:40490970
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研究论文 | 本研究验证了Illumina和MGI Tech两个测序平台在单细胞转录组分析中的性能比较 | 首次系统比较Illumina和MGI Tech在单细胞RNA测序中的表现，特别是在异质性样本中的影响 | 仅使用三个人类癌症样本，样本量有限 | 评估不同测序平台对单细胞转录组分析结果的影响 | 人类癌症样本 | 单细胞测序 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个人类癌症样本 | Illumina, MGI Tech | 单细胞RNA-seq | NA | 高通量短读长测序平台 |
| 622 | 2025-10-05 |
Genetics of Congenital Heart Disease: A Narrative Review of Challenges and Strategies in Identifying Novel Genes
2025-Sep, Cureus
DOI:10.7759/cureus.91674
PMID:40917916
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综述 | 本文综述了先天性心脏病遗传学研究面临的挑战与识别新基因的策略 | 系统总结了新一代测序技术在发现表观遗传修饰、体细胞嵌合和非编码调控变异等新型遗传因素方面的最新进展 | 将基因组数据转化为临床风险预测和治疗指导仍面临挑战 | 通过基因组技术进展更好理解心脏发育遗传学与CHD发病机制的关联 | 先天性心脏病患者及其遗传因素 | 基因组学 | 先天性心脏病 | 新一代测序，单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 623 | 2025-10-05 |
Inherent single-cell heterogeneity of the transcriptional response to hypoxia in cancer cells
2025-Sep, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcaf021
PMID:40918648
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了癌细胞在缺氧条件下HIF反应的内在异质性 | 首次在相同培养条件下证明癌细胞对缺氧的转录反应存在显著的单细胞异质性，特别是HIF-2靶基因的异质性远超预期 | 研究主要基于体外细胞系模型，未涉及完整的肿瘤微环境 | 探究癌细胞在缺氧条件下转录反应的单个细胞水平异质性 | 非克隆细胞系和多个克隆衍生物，包括HIF-1α或HIF-2α敲除细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个非克隆细胞系和克隆衍生物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2025-10-05 |
Less is more: improving cell-type identification with augmentation-free single-cell RNA-Seq contrastive learning
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf437
PMID:40794574
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研究论文 | 提出一种无需数据增强的单细胞RNA测序对比学习算法AF-RCL，用于改进细胞类型识别 | 简化传统数据增强操作并采用新的对比学习损失函数，在细胞类型识别任务中实现最先进的预测性能 | NA | 改进单细胞RNA测序分析中的细胞类型识别任务 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2025-10-05 |
Mitigation of multi-scale biases in cell-type deconvolution for spatially resolved transcriptomics using HarmoDecon
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf451
PMID:40796171
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研究论文 | 提出HarmoDecon模型用于缓解空间转录组学中细胞类型反卷积的多尺度偏差问题 | 首次解决了空间转录组学中三个尺度的偏差问题：单个点、整个组织样本以及不同平台间的数据分布差异 | NA | 开发能够减少空间转录组学细胞类型反卷积偏差的新方法 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 半监督深度学习，高斯混合图卷积网络 | 基因表达空间数据 | STARmap和osmFISH数据集，10x Visium数据集，人类乳腺癌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Visium | NA |
| 626 | 2025-10-05 |
Unveiling the role of STAT1-activated macrophages in abdominal aortic aneurysm: Insights from scRNA-seq and prognostic signature development
2025-Sep, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2025.107528
PMID:40803394
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示STAT1激活的巨噬细胞在腹主动脉瘤中的作用并开发预后特征 | 首次通过单细胞RNA测序发现STAT1通路介导M1/M2巨噬细胞间通讯，并构建了十基因炎症特征预测AAA预后 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明腹主动脉瘤发病机制中巨噬细胞极化的分子机制 | 腹主动脉瘤小鼠模型和健康对照小鼠 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，Western blotting，实时PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 3个AAA小鼠模型和2个健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 627 | 2025-10-05 |
Maternal-Fetal Interface Cell Dysfunction in Patients With Preeclampsia Revealed via Single-Cell RNA Sequencing
2025-Sep, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70101
PMID:40924867
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示先兆子痫患者母胎界面细胞功能障碍 | 首次在单细胞水平揭示先兆子痫患者绒毛滋养层细胞向合体滋养层细胞异常分化的趋势，并发现TMEM200A基因表达下降导致绒毛外滋养细胞侵袭能力减弱 | 样本量较小（PE组3例，正常妊娠组3例），需要更大规模研究验证 | 探究先兆子痫发病机制中胎盘和蜕膜组织细胞类型的异质性变化 | 剖宫产获取的胎盘和蜕膜组织细胞 | 单细胞测序 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序 | 基因集变异分析(GSVA)，伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 6例患者（3例先兆子痫，3例正常妊娠），共32,279个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2025-10-05 |
Testis-specific protein HSF5 is essential for proper chromatin organization and transcriptional reprogramming to drive pachynema progression
2025-Sep-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了睾丸特异性蛋白HSF5在调控粗线期染色质组织和转录重编程中的关键作用 | 首次发现HSF5通过形成HSF5-USP7复合物抑制减数分裂性染色体上的H2AK119ub修饰，并揭示其在XY小体形成和精子蛋白酶体活性调控中的新功能 | HSF5调控转录调控网络的具体分子机制尚未完全阐明 | 阐明HSF5在哺乳动物减数分裂前期I粗线期进展中的分子调控机制 | 小鼠精母细胞 | 生殖生物学 | 男性不育症 | ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 629 | 2025-10-05 |
Acrylamide-induced noradrenergic axon degeneration is promoted via a non-cell autonomous mechanism, involving microglial Tnfaip2/TNF-α and oxidative stress pathways
2025-Sep-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139125
PMID:40664071
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研究论文 | 本研究揭示了丙烯酰胺通过非细胞自主机制促进去甲肾上腺素能轴突退化的分子机制 | 首次发现丙烯酰胺通过小胶质细胞TNF-α和氧化应激通路以非细胞自主方式促进轴突退化 | 研究主要基于小鼠和细胞模型，人类相关性需进一步验证 | 探究环境毒物诱导认知功能障碍的神经退行性机制 | 小鼠脑组织、小胶质细胞BV2系、1C11神经元细胞系 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2025-10-05 |
Mitoribosome-Targeting Antibiotics Suppress Osteoclastogenesis and Periodontitis-Induced Bone Loss by Blocking Mitochondrial Protein Synthesis
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501619R
PMID:40923938
|
研究论文 | 本研究探讨靶向线粒体核糖体的抗生素雷德唑胺通过抑制线粒体蛋白质合成来抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失 | 首次发现雷德唑胺通过靶向线粒体功能抑制破骨细胞分化，为牙周炎治疗提供新策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 研究雷德唑胺抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失的机制 | RAW264.7细胞、骨髓来源巨噬细胞(BMM)和牙周炎大鼠模型 | 单细胞测序分析 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、电子显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | 健康个体和重度慢性牙周炎患者的牙周组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 631 | 2025-10-05 |
Identifying potential therapeutic targets in periodontitis: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2025-Sep-09, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04580-3
PMID:40921808
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析，识别与牙周炎相关的关键基因特征 | 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合，识别出牙周炎的四个枢纽基因(CXCR4, ARHGDIB, PLAT, C19orf10) | 仅分析了GEO数据库中的三个独立数据集，样本来源有限 | 识别牙周炎的潜在治疗靶点和分子机制 | 牙周炎相关基因表达数据和细胞类型 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 转录组学分析, GO/KEGG富集分析 | LASSO, 随机森林 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 三个独立数据集(来自GEO数据库) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 632 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover the prognostic, epigenetic, and immunological roles of FANCC in low-grade glioma
2025-Sep-09, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2556255
PMID:40923898
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了FANCC在低级别胶质瘤中的预后、表观遗传和免疫调控作用 | 首次报道FANCC作为低级别胶质瘤的致癌驱动因子，通过免疫微环境重编程和DNA修复失调协同促进肿瘤进展 | NA | 全面研究FANCC在低级别胶质瘤中的临床意义、预后价值和分子机制，以确定新的治疗靶点 | 低级别胶质瘤患者样本 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, GSEA分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 633 | 2025-10-05 |
NOTCH3 drives fatty acid oxidation and ferroptosis resistance in aggressive meningiomas
2025-Sep-09, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-05208-5
PMID:40924320
|
研究论文 | 本研究揭示了NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中通过驱动脂肪酸氧化代谢重编程赋予铁死亡抵抗性的新机制 | 首次发现NOTCH3通过促进脂肪酸氧化代谢重编程导致脂质耗竭，从而赋予脑膜瘤细胞铁死亡抵抗性 | 研究主要基于细胞系模型，需要进一步在体内验证 | 探究NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中的代谢调控机制及其与治疗抵抗的关系 | 人类脑膜瘤细胞系和患者来源的原代脑膜瘤细胞 | 癌症代谢 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 脂质组学, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 脂质数据 | 人类脑膜瘤细胞系和患者来源的原代脑膜瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2025-10-05 |
Protective Role of Apelin in a Mouse Model of Post-Intensive Care Syndrome
2025-Sep-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0028OC
PMID:40920972
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型发现Apelin-APJ信号通路在重症监护后综合征(PICS)中的保护作用 | 首次揭示Apelin-APJ信号通路受损通过破坏器官间稳态参与PICS发病机制 | 需要进一步研究明确组织特异性作用 | 探讨PICS的分子机制及潜在治疗策略 | 小鼠模型和ARDS/严重COVID-19幸存者 | NA | 重症监护后综合征 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 基因表达数据,血液样本 | 小鼠模型和ARDS/COVID-19患者(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | NA |
| 635 | 2025-10-05 |
Extracellular Matrix and Fibroblast Activation in Lymphangioleiomyomatosis
2025-Sep-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0237OC
PMID:40920984
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析淋巴管平滑肌瘤病中细胞外基质和成纤维细胞激活的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术将LAM细胞按癌症干细胞基因表达分为三个亚群，并发现mTORC1驱动的4E-BP1/eIF4E翻译控制机制 | 研究针对罕见疾病样本量有限，机制研究主要基于体外实验 | 探究淋巴管平滑肌瘤病中细胞外基质和成纤维细胞激活的分子机制 | 淋巴管平滑肌瘤病细胞和LAM相关成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 636 | 2025-10-05 |
Standardizing single-cell approaches to osteoarthritis: Toward a comprehensive cellular atlas
2025-Sep-04, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.016
PMID:40914548
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评论 | 本文探讨了单细胞RNA测序在骨关节炎研究中的应用现状与未来发展方向 | 提出标准化细胞类型注释和整合新旧数据集的需求，以构建完整的骨关节炎单细胞图谱 | NA | 推动骨关节炎单细胞研究的标准化进程 | 骨关节炎关节组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 637 | 2025-10-05 |
Longitudinal single-cell RNA model aids prediction of EGFR-TKI resistance
2025-Sep-04, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgaf038
PMID:40739818
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研究论文 | 本研究利用纵向单细胞RNA测序数据探索肺腺癌EGFR-TKI耐药机制 | 首次在单细胞水平建立EGFR耐药评分系统并揭示代谢重编程在耐药中的作用 | 样本量有限，需要更大规模验证 | 研究肺腺癌EGFR-TKI耐药机制 | 肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 638 | 2025-10-05 |
Benchmarking sketching methods on spatial transcriptomics data
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672376
PMID:40909701
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研究论文 | 系统评估不同采样方法在空间转录组数据上的表现 | 首次系统评估空间转录组数据的采样方法，提出空间平滑杠杆评分方法能平衡转录组异质性和组织结构保持 | 研究仅基于有限的数据集进行验证，需要更多样化的数据集进一步确认 | 评估和优化空间转录组数据的采样方法以减少计算负担 | 空间转录组数据集（小鼠卵巢、MERFISH大脑、人类乳腺癌、肺组织）和模拟数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | PCA, 随机SVD, 空间权重矩阵 | 空间转录组数据, 基因表达数据, 空间坐标 | 多个真实ST数据集和模拟数据 | NA | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
| 639 | 2025-10-05 |
Exploration of potential therapeutic target genes for preeclampsia through genetic analysis
2025-Sep, Journal of human hypertension
IF:2.7Q2
DOI:10.1038/s41371-025-01054-0
PMID:40715499
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研究论文 | 通过遗传分析探索先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 首次通过整合cis-eQTL、孟德尔随机化、SMR和共定位分析系统筛选先兆子痫的潜在药物靶基因 | 研究主要基于血液样本的eQTL数据，未直接使用胎盘组织数据 | 识别先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 先兆子痫相关基因 | 生物信息学 | 先兆子痫 | cis-eQTL分析，孟德尔随机化，功能富集分析，SMR分析，共定位分析，单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据，遗传数据 | eQTLGen联盟提供的血液样本数据 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2025-10-05 |
Isotope-encoded spatial biology identifies plaque-age-dependent maturation and synaptic loss in an Alzheimer's disease mouse model
2025-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63328-y
PMID:40890115
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研究论文 | 本研究通过同位素编码的空间生物学技术追踪阿尔茨海默病小鼠模型中Aβ斑块的年龄依赖性成熟过程及其与突触丧失的关联 | 结合质谱成像与稳定同位素标记技术对Aβ斑块进行时间标记，实现从初始沉积开始的斑块老化空间追踪 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化的适用性需要进一步验证 | 探究Aβ斑块演化过程如何影响周围组织及其与神经毒性的关系 | App基因敲入Aβ小鼠模型 | 空间生物学 | 阿尔茨海默病 | 质谱成像, 稳定同位素标记, 空间转录组学 | NA | 质谱成像数据, 基因表达数据, 结构染色数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |