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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-10-05 |
Less is more: improving cell-type identification with augmentation-free single-cell RNA-Seq contrastive learning
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf437
PMID:40794574
|
研究论文 | 提出一种无需数据增强的单细胞RNA测序对比学习算法AF-RCL,用于改进细胞类型识别 | 简化传统数据增强操作并采用新的对比学习损失函数,在细胞类型识别任务中实现最先进的预测性能 | NA | 改进单细胞RNA测序分析中的细胞类型识别任务 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 602 | 2025-10-05 |
Mitigation of multi-scale biases in cell-type deconvolution for spatially resolved transcriptomics using HarmoDecon
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf451
PMID:40796171
|
研究论文 | 提出HarmoDecon模型用于缓解空间转录组学中细胞类型反卷积的多尺度偏差问题 | 首次解决了空间转录组学中三个尺度的偏差问题:单个点、整个组织样本以及不同平台间的数据分布差异 | NA | 开发能够减少空间转录组学细胞类型反卷积偏差的新方法 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 半监督深度学习,高斯混合图卷积网络 | 基因表达空间数据 | STARmap和osmFISH数据集,10x Visium数据集,人类乳腺癌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium | NA |
| 603 | 2025-10-05 |
Unveiling the role of STAT1-activated macrophages in abdominal aortic aneurysm: Insights from scRNA-seq and prognostic signature development
2025-Sep, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2025.107528
PMID:40803394
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示STAT1激活的巨噬细胞在腹主动脉瘤中的作用并开发预后特征 | 首次通过单细胞RNA测序发现STAT1通路介导M1/M2巨噬细胞间通讯,并构建了十基因炎症特征预测AAA预后 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明腹主动脉瘤发病机制中巨噬细胞极化的分子机制 | 腹主动脉瘤小鼠模型和健康对照小鼠 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,Western blotting,实时PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 3个AAA小鼠模型和2个健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 604 | 2025-10-05 |
Maternal-Fetal Interface Cell Dysfunction in Patients With Preeclampsia Revealed via Single-Cell RNA Sequencing
2025-Sep, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70101
PMID:40924867
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示先兆子痫患者母胎界面细胞功能障碍 | 首次在单细胞水平揭示先兆子痫患者绒毛滋养层细胞向合体滋养层细胞异常分化的趋势,并发现TMEM200A基因表达下降导致绒毛外滋养细胞侵袭能力减弱 | 样本量较小(PE组3例,正常妊娠组3例),需要更大规模研究验证 | 探究先兆子痫发病机制中胎盘和蜕膜组织细胞类型的异质性变化 | 剖宫产获取的胎盘和蜕膜组织细胞 | 单细胞测序 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序 | 基因集变异分析(GSVA),伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 6例患者(3例先兆子痫,3例正常妊娠),共32,279个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 605 | 2025-10-05 |
Acrylamide-induced noradrenergic axon degeneration is promoted via a non-cell autonomous mechanism, involving microglial Tnfaip2/TNF-α and oxidative stress pathways
2025-Sep-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139125
PMID:40664071
|
研究论文 | 本研究揭示了丙烯酰胺通过非细胞自主机制促进去甲肾上腺素能轴突退化的分子机制 | 首次发现丙烯酰胺通过小胶质细胞TNF-α和氧化应激通路以非细胞自主方式促进轴突退化 | 研究主要基于小鼠和细胞模型,人类相关性需进一步验证 | 探究环境毒物诱导认知功能障碍的神经退行性机制 | 小鼠脑组织、小胶质细胞BV2系、1C11神经元细胞系 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 606 | 2025-10-05 |
Mitoribosome-Targeting Antibiotics Suppress Osteoclastogenesis and Periodontitis-Induced Bone Loss by Blocking Mitochondrial Protein Synthesis
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501619R
PMID:40923938
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研究论文 | 本研究探讨靶向线粒体核糖体的抗生素雷德唑胺通过抑制线粒体蛋白质合成来抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失 | 首次发现雷德唑胺通过靶向线粒体功能抑制破骨细胞分化,为牙周炎治疗提供新策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 研究雷德唑胺抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失的机制 | RAW264.7细胞、骨髓来源巨噬细胞(BMM)和牙周炎大鼠模型 | 单细胞测序分析 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、电子显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | 健康个体和重度慢性牙周炎患者的牙周组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 607 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover the prognostic, epigenetic, and immunological roles of FANCC in low-grade glioma
2025-Sep-09, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2556255
PMID:40923898
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了FANCC在低级别胶质瘤中的预后、表观遗传和免疫调控作用 | 首次报道FANCC作为低级别胶质瘤的致癌驱动因子,通过免疫微环境重编程和DNA修复失调协同促进肿瘤进展 | NA | 全面研究FANCC在低级别胶质瘤中的临床意义、预后价值和分子机制,以确定新的治疗靶点 | 低级别胶质瘤患者样本 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, GSEA分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 608 | 2025-10-05 |
Longitudinal single-cell RNA model aids prediction of EGFR-TKI resistance
2025-Sep-04, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgaf038
PMID:40739818
|
研究论文 | 本研究利用纵向单细胞RNA测序数据探索肺腺癌EGFR-TKI耐药机制 | 首次在单细胞水平建立EGFR耐药评分系统并揭示代谢重编程在耐药中的作用 | 样本量有限,需要更大规模验证 | 研究肺腺癌EGFR-TKI耐药机制 | 肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 609 | 2025-10-05 |
Benchmarking sketching methods on spatial transcriptomics data
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672376
PMID:40909701
|
研究论文 | 系统评估不同采样方法在空间转录组数据上的表现 | 首次系统评估空间转录组数据的采样方法,提出空间平滑杠杆评分方法能平衡转录组异质性和组织结构保持 | 研究仅基于有限的数据集进行验证,需要更多样化的数据集进一步确认 | 评估和优化空间转录组数据的采样方法以减少计算负担 | 空间转录组数据集(小鼠卵巢、MERFISH大脑、人类乳腺癌、肺组织)和模拟数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | PCA, 随机SVD, 空间权重矩阵 | 空间转录组数据, 基因表达数据, 空间坐标 | 多个真实ST数据集和模拟数据 | NA | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
| 610 | 2025-10-05 |
Exploration of potential therapeutic target genes for preeclampsia through genetic analysis
2025-Sep, Journal of human hypertension
IF:2.7Q2
DOI:10.1038/s41371-025-01054-0
PMID:40715499
|
研究论文 | 通过遗传分析探索先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 首次通过整合cis-eQTL、孟德尔随机化、SMR和共定位分析系统筛选先兆子痫的潜在药物靶基因 | 研究主要基于血液样本的eQTL数据,未直接使用胎盘组织数据 | 识别先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 先兆子痫相关基因 | 生物信息学 | 先兆子痫 | cis-eQTL分析,孟德尔随机化,功能富集分析,SMR分析,共定位分析,单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据,遗传数据 | eQTLGen联盟提供的血液样本数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 611 | 2025-10-05 |
Reactive Oxygen Species-Responsive Hydrogel Microspheres Loaded with Epigallocatechin Gallate for Effective Osteoarthritis Therapy
2025-Sep-08, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.5c00564
PMID:40813306
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研究论文 | 开发了一种活性氧响应的水凝胶微球系统用于靶向递送表没食子儿茶素没食子酸酯治疗骨关节炎 | 首次构建WYRGRL肽修饰的ROS响应型水凝胶微球递送系统,并通过单细胞转录组学和代谢组学联合分析揭示了Tomm70基因在治疗机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发智能递送系统治疗骨关节炎 | 软骨细胞和OA小鼠模型 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | OA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 612 | 2025-10-05 |
IGHA1 and IGHG1 Expression Panel Predicts Anti-PD-L1 Response in Muscle-Invasive Bladder Cancer
2025-Sep-08, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70033
PMID:40919684
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组分析,发现IGHA1和IGHG1表达模式可预测肌层浸润性膀胱癌对PD-L1抑制剂的治疗反应 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术揭示三级淋巴结构中B细胞克隆与免疫治疗反应的关系,并建立IGHA1/IGHG1预测模型 | 样本量相对有限,单细胞测序仅9个样本,空间转录组仅5个样本 | 探究肌层浸润性膀胱癌中三级淋巴结构与免疫球蛋白库的关系及其对免疫治疗反应的预测价值 | 肌层浸润性膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序, 空间转录组 | 表达特征预测模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 单细胞测序9例(5例来自本中心,4例来自PRJNA662018),空间转录组5例(1例来自本中心,4例来自GSE169379),TCGA数据库405例,IMvigor210试验348例 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 613 | 2025-10-05 |
Cutting-edge technologies in neural regeneration
2025-Sep-05, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00260-y
PMID:40911279
|
综述 | 本文综述了推动神经再生领域发展的前沿技术及其应用前景 | 系统整合了光遗传学、化学遗传学、3D培养模型、基因编辑、单细胞测序和3D成像等多项前沿技术,并展望了人工智能、高通量体内筛选和脑机接口技术的未来潜力 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据和原始研究发现 | 探讨神经再生领域的最新技术进展和治疗策略开发 | 中枢神经系统损伤和神经功能障碍 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 光遗传学、化学遗传学、3D培养、基因编辑、单细胞测序、3D成像、人工智能、高通量筛选、脑机接口 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 614 | 2025-10-05 |
Integrated machine learning-based RNA sequencing and single-cell analysis reveal RNA methylation regulation patterns in the immune microenvironment of Alzheimer's disease
2025-Sep-03, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01650
PMID:40903964
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习、RNA测序和单细胞分析,揭示了阿尔茨海默病免疫微环境中RNA甲基化的调控模式 | 首次将机器学习与单细胞RNA测序相结合,系统分析阿尔茨海默病中RNA甲基化对免疫微环境的调控作用,并建立了风险预测模型 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,需要进一步的体内实验验证 | 探索RNA甲基化在阿尔茨海默病免疫微环境中的调控机制及其与疾病进展的关系 | 阿尔茨海默病患者样本、神经元细胞、T细胞、B细胞和NK细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot, 机器学习 | 机器学习算法, 风险预测模型, 列线图 | 转录组数据, 单细胞数据, 分子生物学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 615 | 2025-10-05 |
Lhx2 specifically expressed in HSCs promotes liver regeneration and inhibits liver fibrosis
2025-Sep-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001201
PMID:39693275
|
研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞特异性转录因子Lhx2在促进肝脏再生和抑制肝纤维化中的双重功能 | 首次发现Lhx2在肝星状细胞中特异性表达,并同时具备促进肝脏再生和抑制纤维化的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 鉴定肝星状细胞中同时促进再生和抑制纤维化的特异性靶点及其分子机制 | 小鼠和人类肝星状细胞,急慢性肝损伤模型 | 分子生物学 | 肝病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 急性和慢性肝损伤小鼠模型,人类肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 616 | 2025-10-05 |
Sour neuronal signalling attenuates macrophage-mediated liver injury
2025-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.02.026
PMID:40058705
|
研究论文 | 本研究揭示了酸味刺激通过神经信号通路减轻巨噬细胞介导的肝脏缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现神经元来源的TAFA2蛋白通过CCR2受体招募和激活巨噬细胞导致肝损伤,而酸味刺激可减少TAFA2产生并减轻肝损伤 | 酸味刺激减轻肝损伤的具体分子通路尚未完全阐明 | 探究神经免疫相互作用在肝脏缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗策略 | 小鼠动物模型、神经元、巨噬细胞、肝切除手术患者 | 神经免疫学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序、RNA测序、基因敲除、临床实验 | 动物模型 | 基因表达数据、临床数据 | 小鼠模型和临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 617 | 2025-10-05 |
Tacrolimus prolongs corneal allograft survival and prevents dendritic cell infiltration in a myeloid-derived suppressor cell-dependent manner
2025-Sep, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2025.05.018
PMID:40398562
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研究论文 | 本研究通过小鼠角膜移植模型揭示了FK506通过诱导髓源性抑制细胞来抑制树突状细胞活化并延长角膜移植物存活的机制 | 首次阐明FK506通过MDSC依赖性方式抑制树突状细胞活化的具体时间依赖性机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究FK506延长角膜移植物存活的具体免疫抑制机制 | 小鼠角膜移植模型和相关的免疫细胞 | 免疫学 | 角膜移植排斥 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 618 | 2025-10-05 |
Transcription factors that define the epigenome structures and transcriptomes in microglia
2025-Sep, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104814
PMID:40425139
|
研究论文 | 本研究通过基因组学分析鉴定出定义小胶质细胞转录组程序的关键转录因子 | 首次发现PU.1、Irf8、Sall1和Smad4四个转录因子形成增强子复合物,作为谱系决定因子塑造小胶质细胞身份 | NA | 探索定义小胶质细胞表观基因组结构和转录组的转录因子 | 小胶质细胞 | 表观基因组学 | 神经炎症性疾病,神经退行性疾病 | ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN, single-cell RNA-seq | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,表观基因组测序 | NA | NA |
| 619 | 2025-10-05 |
CD300A+ CD8+ T Cells as Predictive Biomarkers for Achieving Functional Cure in Chronic Hepatitis B Patients Undergoing Pegylated Interferon-Alpha Therapy
2025-Sep, Alimentary pharmacology & therapeutics
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/apt.70214
PMID:40454546
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术发现CD300A+ CD8+ T细胞可作为预测慢性乙型肝炎患者接受聚乙二醇干扰素-α治疗后获得功能性治愈的生物标志物 | 首次发现CD300A+ CD8+ T细胞在功能性治愈患者中显著富集,具有强大的克隆扩增能力和HBV抗原特异性 | 研究样本量有限,需要在更大规模队列中验证 | 鉴定预测慢性乙型肝炎患者接受聚乙二醇干扰素-α治疗获得功能性治愈的生物标志物 | 慢性乙型肝炎患者 | 免疫学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞转录组测序, T细胞受体测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 发现队列和独立验证队列的慢性乙型肝炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq, TCR测序 | NA | NA |
| 620 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-sequencing as a potential approach for studying intratumor heterogeneity in pleural mesothelioma
2025-Sep, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108679
PMID:40782703
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索胸膜间皮瘤的肿瘤内异质性 | 首次应用单细胞RNA测序技术分析胸膜间皮瘤多部位肿瘤样本的肿瘤内异质性 | NA | 表征胸膜间皮瘤的肿瘤内异质性特征 | 胸膜间皮瘤多部位肿瘤样本 | 单细胞组学 | 胸膜间皮瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |